Bactriophages

CES BactriologieBactriologie-Virologie Professeur Moussa Fafa Ciss Mdecin Biologiste Facult de Mdecine de Dakar
05/02/2012 1

Introduction

05/02/2012

Dfinition
Virus spcifiques des Bactries Synonyme : phages

  

05/02/2012

Dcouverte

Auteurs  Twort en 1915  DHrelle en 1917 Nombre > 5.000 phages diffrents

05/02/2012

Critres de classification

  

Nature acide nuclique Morphologie de la particule Enveloppe virale

05/02/2012

Classification des phages

05/02/2012

Phages gnome ADN

05/02/2012

Phages ADN bicatnaire

05/02/2012

Trois groupes


05/02/2012

Phages nus symtrie binaire  Siphoviridae  Myoviridae  Podoviridae Phages nus symtrie cubique  Corticoviridae  Tectiviridae Phages envelopps  Plasmaviridae

Phages nus symtrie binaire

05/02/2012

10

Phages nus symtrie binaire



Sont les plus nombreux  95% des phages dcrits  Sont dits cauds Morphologie  Tte cubique (renferme ADN)  Queue hlicodale  Contractile ou non  Taille: 20 190 nm
11

05/02/2012

Principaux phages cauds



Siphoviridae (60%)  Enterobacteria phage P, T1, T5  Mycobactries, Lactococcus Myoviridae (25%)  Enterobacteria phage T4,  Enterobacteria P1, P2 Podoviridae (15%)  EB phage T7  Bacillus phage J 29
05/02/2012

12

Deux autres groupes

05/02/2012

13

Phages nus symtrie cubique



Corticoviridae  Alteromonas phage PM2 Tectiviridae  Enterobacteria phage PRD1  Bacillus phage

05/02/2012

14

Phages envelopps


Plasmaviridae  Acholeplasma phage L2 Constitution  Enveloppe  Nucloprotine  Absence de capside

15

05/02/2012

Phages ADN monocatnaire

05/02/2012

16

Deux groupes
Phages nus symtrie hlicodale  Inoviridae Phages nus symtrie cubique  Microviridae

05/02/2012

17

Microviridae


Morphologie  Capside cubique  ADN simple brin Diffrents phages  Enterobacteria phage J x 174  Bdellovibrio phage MACI  Chlamydia phage 1
18

05/02/2012

Inoviridae

Morphologie  Long filaments  Flexibles Enterobacteria phage fd

05/02/2012

19

Phages nus gnomes ARN

05/02/2012

20

Leviviridae

Morphologie  Capside cubique  ARN monocatnaire Enterobacteria phage MS2

05/02/2012

21

Cystoviridae

Morphologie  Capside cubique  ARN bicatnaire, segment Pseudomonas phage J 6

05/02/2012

22

Multiplication des phages

05/02/2012

23

Cycle lytique des phages

05/02/2012

24

Phage ADN

05/02/2012

25

Exemple des Myoviridae T

   

Adsorption et injection du gnome Rplication et synthse des constituants Assemblage des virus Libration des virus Dure cycle = 22 minutes

05/02/2012

26

Adsorption et injection du gnome

05/02/2012

27

Sites de fixation bactriens

    

Lipopolysaccharide Protines de paroi Acides teichoques Flagelles Fimbriae

05/02/2012

28

Sites de fixation phagiques

  

Plaque terminale de la queue Fibres caudales Capside

05/02/2012

29

Fixation du phage


Contact alatoire phage-bactrie phage Par une fibre de la queue  Reste des fibres se fixe rapidement Phage bien arrim sur bactrie

05/02/2012

30

Injection de lADN phagique



Enzymes prsentes au n plaque n  Perforent paroi bactrienne  Contraction de la queue  Canal central pntre dans bactrie Gnome phagique est inject

05/02/2012

31

Aprs injection du gnome



Colmatage brche dinjection  Par des composants  Synthtiss par enzymes virales Devenir phage dpourvu de son gnome  Soit reste fix sur la bactrie  Soit est dcroch
05/02/2012 32

Rplication et synthse constituants

05/02/2012

33

Phase prcoce


Synthse des enzymes virales prcoces  Certains gnes sont transcrits en ARNm  ARNm sont traduits en enzymes virales vnement cellulaires  ADN bactrien dgrad en nuclotides  Inhibition synthse macromolcules  Synthse hydroxymthylcytosine qui remplace la cytosine dans le phage
05/02/2012 34

Phase tardive


Rplication ADN phagique  Commence ds phase prcoce  Formation copies gnomes du phage Gnes tardifs sont transcrits et traduits  Protines virales constitutives  Protines virales non structurales  Protines de la lyse cellulaire
05/02/2012 35

Assemblage des virus

05/02/2012

36

Quatre phases
Construction de la tte Construction de la queue Construction des fibres Assemblage final du phage complet

   

05/02/2012

37

Droulement
 

 

Encapsidation de lADN dans la tte Tte associe la queue  Dj porteuse de la plaque terminale  Grce au collier Fibres se fixent enfin la queue Accumulation phages dans cytoplasme
05/02/2012 38

Libration des phages

05/02/2012

39

Lyse brutale de la bactrie



Intervention de 2 gnes phagiques  Lun code le lysozyme  Lautre code une protine entranant le lysozyme vers la paroi Libration de 300 phages environ

05/02/2012

40

Phage ARN

05/02/2012

41

Exemple des Leviviridae



Petits phages  ARN (+), monocatnaire  Sans queue  Capside cubique Site fixation = pilus F et fimbriae Similitudes avec Enterovirus, HAV
05/02/2012 42

tapes


FixationFixation-pntration  Reconnaissance/fixation sur pilus F  Pntration : modalit mal dfinie ARN phagique est directement traduit  Protine A fixation  Protine de capside  Rplicase  Protine de lyse bactrienne
43

05/02/2012

Rplication
 

Formation intermdiaire de rplication Brin (-) sert de matrice ( ARNm protines virales  ARNv (+) gnomes phages fils Dure du cycle 20 30 minutes

05/02/2012

44

Cycle lysognique des phages

05/02/2012

45

Phages temprs


Phages  Phage P  Phages P2 P22  Phage Mu-1 MuADNv intgr dans gnome bactrie  Directement de faon covalente  Ou comme plasmide On obtient un prophage
46

05/02/2012

tapes


FixationFixation-pntration  Injection ADN phagique  Circularisation de lADN phagique  Transcription des ARNm 2 voies selon expression du rpresseur CI  Cycle lytique  Cycle lysognique
05/02/2012 47

Modalits de la lysognie


Synthse de protines prcoces  CII et CIII  CII se fixe sur promoteur PRE  Activation synthse du rpresseur CI Rpresseur CI : est auto-activable auto Inhibe transcription des ARNm  Stimule un autre promoteur qui augmente la synthse de CI
05/02/2012 48

Intgration du gnome phage



Mcanisme  CII active expression dun intgrase int  CI rprime transcription Enzyme int  Intgre gnome du phage  Dans un site prcis du gnome bactrie  Grce au site att du gnome du phage
05/02/2012 49

Induction du cycle lytique



Agents inducteurs  Ultras violets  Agents chimiques mutagnes Mcanisme de linduction  Diminution quantit rpresseur CI  CI dgrad par enzymes bactriennes  Gne xis excisionase qui sassocie int dont elle inverse le processus
05/02/2012 50

Rle et utilisation des phages

05/02/2012

51

Outils gntique molculaire

05/02/2012

52

Phages usuels


Phages filamenteux (Inoviridae)  Phage M13  Phage fl  Phage fd Phage P

05/02/2012

53

Utilisation des phages



Modalits dutilisation  Vecteurs de gnes  Amplificateurs de gnes Buts  Thrapie gnique  Vaccination  Production de protines
54

05/02/2012

Prparation des phages

 

Insertion simple de lADN tranger DltionDltion-remplacement Il faut conserver  Squences cos  Gnes de structure du phage

05/02/2012

55

Autres vecteurs drivs



Vecteurs drivs  Cosmide: plasmide + squences cos  Phagemide: plasmide + phage filamenteux Intrt  Encapsids in vitro  Capacit dinsertion gnomique +++

05/02/2012

56

Rle dans lenvironnement

05/02/2012

57

Rles bnfiques


Contrle densit bactries et biomasse  1010 UFP litre deau propre  108 UFP litre deau use Tmoins de contamination fcale

05/02/2012

58

Problmes pour industrie

 

Phages dtruisent bactries fermentaires Utilises pour production lait, protines

05/02/2012

59

Utilisation en bactriologie

05/02/2012

60

Facteurs de virulence


Production de toxines bactriennes  Corynebacterium diphtheriae  Streptococcus pyogenes Acquisition rsistance aux antibiotiques  Staphylococcus aureus  Streptococcus spp.
05/02/2012 61

Lysotypie bactrienne


Bactries souvent types  Listeria monocytogenes  Salmonella  Staphylococcus aureus Indications de la lysotypie  tudes pidmiologiques (pidmies)  Dtection de Listeria dans aliments
05/02/2012 62

Autres organismes virus like

05/02/2012

63

Virodes

05/02/2012

64

Classification


05/02/2012

Critres de classification  Homologie de squences  Rgion centrale conserve ou non Deux familles  Avsunviridae  Virode brlure de lavocatier  Rgion centrale non conserve  Pospiviridae  Rgion centrale conserve

65

Structure des virodes



ARN (+)  Monocatnaire  Circulaire  Sans rgion codant pour des protines  240 400 nuclotides Absence de capside

05/02/2012

66

Infectent les plantes



Agents pathognes parasites des plantes  Tubercules  Pomme de terre Mcanisme daction  Parasitent appareil transcription hte  Utilisent ARN pol II nuclaire de lhte
05/02/2012 67

Virusodes ou ARN satellites

05/02/2012

68

Composition
ARN satellites Encapsids avec des virus des plantes Ont besoin de virus auxiliaire Car ne peuvent pas se rpliquer seuls

   

05/02/2012

69

Merci
05/02/2012 70