TÉCNICAS EN BIOLOGÍA MOLECULAR, APLICACIÓN EN MEDICINA INTRODUCCIÓN • El diagnóstico es una etapa crítica en el manejo de un paciente, que implica decisiones médicas que definirán el progreso del cuidado de un individuo. Es una área dinámica en constante desarrollo que ha revolucionado el diagnóstico clínico. La detección y cuantificación específica de material genético en una muestra biológica ha mostrado un significativo impacto en todas las áreas de la salud, sobre todo en las áreas de las enfermedades infecciosas y el cáncer. El desarrollo de nuevas tecnologías, más rápidas y precisas, ha transformado al diagnóstico molecular en una herramienta clave para el equipo clínico en directo beneficio del paciente. • Hoy en día, el laboratorio de biología molecular es el área diagnóstica de mayor dinamismo y crecimiento dentro los laboratorios clínicos, revolucionando el sistema de salud, liderando la investigación biomédica y optimizando los tratamientos médicos. Estructura del ADN • El ADN está constituido por una doble cadena de ácido desoxirribonucleico, enrollada sobre sí misma en forma de doble hélice. • Cada hebra de ADN está compuesta por la secuencia variable de cuatro nucleótidos distintos (adenina [A], timina [T], guanina [GJ y citosina [C]). La secuencia de nucleótidos de una hebra determina la de la otra, ya que cada una de estas cuatro bases nitrogenadas se une de forma específica sólo con otra base nitrogenada determinada (pares de bases). Así, las adeninas de una cadena se unen (mediante enlaces puentes de hidrógeno) sólo con las timinas de la otra cadena (y las guaninas de una cadena sólo con las citosinas de la otra). Este apareamiento específico de los nucleótidos se denomina complementariedad. ¿Qué es un gen ? Un gen es una secuencia (trozo) de ADN que codifica una proteína determinada. Todas nuestras células somáticas poseen los mismos cromosomas y, por tanto, la misma secuencia de ADN (genes). Es decir, todas nuestras células poseen el mismo potencial genético. Sin embargo, no todos estos genes están activados (expresados) simultáneamente en todas las células. La expresión de diferentes genes en diferentes células y, en la misma célula, la expresión de diferentes genes a lo largo del tiempo, concede a nuestro organismo una plasticidad extraordinaria y una gran capacidad de adaptación. Al mismo tiempo, sin embargo, esta extraordinaria complejidad genética nos hace muy vulnerables al error. De hecho, se producen errores constantemente. Gracias a un complejo sistema de reparación genética, generalmente estos errores no tienen mayores consecuencias. Sin embargo, cuando el número de errores es muy elevado y/o los sistemas de reparación fallan, se produce la enfermedad (por ej., cáncer) transcripción • https://youtu.be/qOA25GbUkdA Traducción y síntesis de proteínas • https://www.youtube.com/watch?v=YoyFpumWtHo TECNICAS 1.ENZIMAS DE RESTRICCION • O endonucleasa de restricción • Es aquella que puede reconocer una secuencia característica de nucleótidos dentro de una molécula de ADN y cortar el ADN en ese punto en concreto, llamado sitio o diana de restricción. • Los sitios de restricción cuentan con entre cuatro y seis pares de bases, con las que son reconocidos. • Restricción: Este sistema le permite a la bacteria protegerse de DNA exógenos para evitar la “promiscuidad” en los intercambios genéticos.
Existen, en general, 3 sistemas de enzimas de restricción:
• Tipo 1: Una sola enzima (con 3 subunidades) tiene actividad de restricción (corta) y modificación (metila). • Tipo 2: Solo tienen actividad de restricción. Otras enzimas llevan a cabo la metilación. • Tipo 3: Se utiliza una enzima oligomérica que realiza todas las actividades enzimáticas. Tienen función de restricción y modificación. Cortan de 25 a 27 pares de bases lejos del sitio de reconocimiento, dejando extremos cohesivos. • Hay otros sistemas de restricción descubiertos actualmente, como el sistema tipo 4 de E. coli (Eco571) 2. HIBRIDACION SOUTHERN Y NORTHEN BLOT • Las técnicas Southern blot y Northern blot se utilizan para separar y caracterizar ADN y ARN respectivamente. • La técnica de Southern fue desarrollada por Edwin Southern para separar ADN • la separación de ARN se denominó Northern . • El Southern Blot, que detecta la presencia de ciertas secuencias en el ADN, se usa, por ejemplo, para estudiar mutaciones en el genoma. • El Northern, en cambio, permite detectar qué genes son transcriptos en determinadas condiciones. SOUTHERN BLOT • Permite detectar la presencia de una secuencia de ADN en una mezcla compleja de este ácido nucleico. Para ello, emplea la técnica de electroforesis en gel de agarosa con el fin de separar los fragmentos de ADN de acuerdo a su longitud y, después, una transferencia a una membrana en la cual se efectúa la hibridación de la sonda. • Su nombre procede del apellido de su inventor, un biólogo inglés llamado Edwin Southern.
• Los pasos para Southern blot:
• 1. Extracción del ADN:.
• 2. Digestión del ADN con una endonucleasa de restricción. • 3. Electroforesis en gel de agarosa • 4. Preparación de un ensayo de Southern ("Southern blot") • 5. Hibridación con sonda radioactiva • 6. Detección de los RFLPs mediante autorradiografía. • 7. Reensayar el resultado del Southern con sondas adicionales. NORTHERN BLOT • Permite detectar RNA en vez de DNA (Innis y Gelfand, 1990).
• Consiste en extraer el RNA de las células pertinentes y su
posterior separación por tamaño mediante electroforesis en gel.
• Permite conocer el tamaño preciso de un mRNA, luego del
empalme transcripcional. Además, sirve para identificar diferentes tipos de mRNA codificados por un mismo gen y para determinar la cantidad y el tejido específico (o tipo de células) en que se encuentra un mRNA específico.
• Así, será posible determinar los niveles de actividad génica,
por ejemplo durante el desarrollo, o bien en distintos tejidos (o tipos celulares) durante un período definido dela vida, o después de haber sido sometido a los organismos a diferentes estímulos fisiológicos 3.HIBRIDACION IN SITU • La técnica consiste en preparar cortas secuencias de DNA de una sola hebra, llamadas sondas, que son complementarias de las secuencias de DNA que se quieren marcar y examinar. • Es muy utilizada en la detección de anomalías cromosómicas. • alta sensibilidad y especificidad • Detecta anomalías: Aneuploidía, la pérdida de una región cromosómica, un cromosoma entero o para monitorizar la progresión de una aberración. • En el diagnóstico de una enfermedad genética. • FISH se puede aplicar a la investigación como: el mapeo de genes, identificación de nuevos oncogenes que contribuyen a diversos tipos de cáncer. 4. WESTERN BLOT • O inmunoblot, es una técnica analítica usada para detectar proteínas específicas en una muestra determinada (una mezcla compleja de proteínas, como un extracto tisular). • Se utiliza para determinar la presencia y cantidad de antígenos y de anticuerpos específicos. • En la actualidad el Western blot es el estudio confirmatorio más empleado para el diagnóstico del SIDA. Se emplean antígenos virales obtenidos por cultivo celular. CUESTIONARIO 3 Explique la técnica de ELISA (Enzyme- LinkedInmunoSorbentAssay) indirecto y sus aplicaciones en medicina.
• Las placas ELISA se preparan de una forma idéntica a la
anterior. Los controles positivos y negativos son los mismos. El sistema de detección emplea dos anticuerpos : uno primario contra el antígeno, y uno secundario marcado contra el primario. La detección tiene mayor sensibilidad por presentar una amplificación de señal debida a la unión de dos o más anticuerpo secundarios por cada primario. Es el ensayo más popular, como lo es la inmunofluorescencia indirecta, pues un mismo secundario marcado y un mismo sistema enzimático permite cuantificar una gran cantidad de antígenos. Etapas de ELISA • Fijación al soporte insoluble de antígenos específicos para los anticuerpos objeto de estudio. Lavado para eliminar los antígenos fijados deficientemente o no fijados. • Adición del suero problema, de tal forma que sus anticuerpos reaccionarán específicamente con los antígenos fijados al soporte. Lavado para eliminar los anticuerpos marcados que no hayan reaccionado. • Adición de anti-anticuerpos conjugados con una enzima, los cuales reaccionan con los anticuerpos específicos añadidos en el paso anterior y que se encuentran fijados a los antígenos. Lavado para eliminar los anti-anticuerpos marcados que no hayan reaccionado. • Adición de un substrato sobre el que sea capaz de actuar la enzima marcadora. Se puede parar la reacción si se desea. • Lectura visual o colorimétrica del producto final coloreado. APLICACIONES CLINICAS • Diagnósticos de infecciones por microorganismos: al detectar la presencia de antígenos del agente infeccioso. • Confirmación de la presencia de anticuerpos: pueden ser anticuerpos contra cualquier microorganismo, inclusive vacunas, auto anticuerpos, etc. • Cuantificación de metabolitos: hormonas., medicamentos, etc. 4.Explique la técnica de microarrays y sus aplicaciones en medicina. ¿Qué es el microrrays? • Los microarrays de ADN, también denominados chips de ADN, son una técnica que se emplea para comparar la expresión génica diferencial bajo dos condiciones distintas, como puede ser comparar la expresión génica en células normales con células cancerígenas. Se basa en la capacidad de hibridación entre moléculas de ADN complementarias entre sí.