LA MATRIZ DE LA VIDA:

Interacciones dbiles en un medio

acuoso
BIOQUIMICA

TUTORA:
Ing. Bioq. En Alimentos y MC. En Nutricin Animal
Fanny Olivia Reveles Saucedo

Bibliografa

Qumica Orgnica
6a. Edicin Cap. II

Bioqumica
Mathews-Van Holde-Ahern
3a Edicin Cap. II-III
 Enlaces Covalentes Polares
cidos y Bases
Enlace Inico: NaCl
El sodio ha transferido su electrn al cloro y se producen iones Na Cl-
los cuales se mantienen unidos en el solido por atraccion electrostatica.

Enlace Covalente: C-C

Los dos tomos equivalentes de carbono comparten por igual los dos
electrones del enlace dando una distribucin electrnica simtrica en el
enlace.

Enlace Covalente Polar:

Los electrones de enlace son atrados con mas fuerza por un tomo que
por otro, dando una distribucin no simtrica de los electrones entre los
tomos.
 Enlaces Covalentes Polares
cidos y Bases

LA POLARIDAD DEL ENLACE SE DEBE A DIFERENCIAS DE

ELECTRONEGATIVIDAD

ELECTRONEGATIVIDAD (EN)
Es la capacidad intrnseca de un tomo para atraer los electores compartidos en un
enlace covalente.

Por lo general, los enlaces entre los tomos con electronegatividades parecidas
son covalentes no polares.

Los enlaces entre tomo cuyas electronegatividades difieren en menos de 2

unidades son covalentes polares.

En tomos que difieren en mas de 2 unidades, son mas bien inicos.

Ej. EL C-H son relativamente no polares

El O-Cl son polares

El hecho de que los electrones sean atrados por el tomo mas electronegativo
genera una carga parcial negativa en este tomo, y una carga parcial
positiva en el tomo con menor electronegatividad.
 Enlaces Covalentes Polares
cidos y Bases

AS COMO LOS ENLACES COVALENTES SON POLARES, LAS MOLECULAS EN SU

CONJUNTO TAMBIN LO SON.

La polaridad molecular general es el resultado de sumar las polaridades de los

enlaces individuales, mas las contribuciones del para de electrones sin compartir
en la molcula.

Las sustancias fuertemente polares suelen ser solubles en disolventes polares

como el agua, mientras que las sustancias no polares son insolubles en
agua.

. .

H H

La medida de la polaridad molecular neta es una cantidad denominada

MOMENTO DIPOLAR
 Enlaces Covalentes Polares
cidos y Bases

MOMENTO DIPOLAR

El momento dipolar se puede concebir de la siguiente manera: supongamos

que hay un centro de masa de todas las cargas positivas (ncleos) en
una molcula al igual que un centro de masa de todas las cargas
negativas (electrones). Si no coinciden los dos centros de masa, la
molcula tiene una polaridad neta.

El momento dipolar , se define como la magnitud de la carga Q en

cualquier extremo del dipolo molecular, multiplicada por la distancia r
entre las cargas,

= Q X r. Su unidad es expresada en Debyes D

Un D= 3.336X10 a la menos 30 Coulomb metro

El momento dipolar del amoniaco =1.47 D

 Enlaces Covalentes Polares
cidos y Bases

ACIDOS Y BASES

UN ACIDO (segn Bronsted-Lowry) es un sustancia que CEDE un ion hidrogeno (H)

UNA BASE (segn Bronsted-Lowry) es un sustancia que RECIBE un ion hidrogeno (H)

Nota: Con frecuencia, se usa el nombre PROTON como sinnimo de H PORQUE AL

PERDER SU ELECTRON DE VALENCIA, SOLO QUEDA EL NUCLEO DEL ATOMO DE
HIDROGENO, QUE ES UN PROTON.

Por Ej. Una molecula polar de HCl dona un proton y una molcula de agua lo acepta, con lo que
se forman los iones Hidronio H30 , y cloruro Cl-
 Enlaces Covalentes Polares
cidos y Bases

ACIDOS Y BASES

UN ACIDO (segn Lewis) es un sustancia que ACEPTA UN PAR DE ELECTRONES

UNA BASE (segn Lewis) es un sustancia que DONA UN PAR DE ELECTRONES

El hecho de que un cido de Lewis acepta un par de electrones significa que tiene un
orbital vacio, de baja energa, o un enlace polar con un hidrogeno, capaz de donar H .
Por ej., varios cationes metlicos, como el Mg
 Enlaces Covalentes Polares
cidos y Bases

ACIDOS Y BASES

UN ACIDO (segn Bronsted-Lowry) es un sustancia que CEDE un ion hidrogeno (H)

UNA BASE (segn Bronsted-Lowry) es un sustancia que RECIBE un ion hidrogeno (H)

Nota: Con frecuencia, se usa el nombre PROTON como sinnimo de H PORQUE AL

PERDER SU ELECTRON DE VALENCIA, SOLO QUEDA EL NUCLEO DEL ATOMO DE
HIDROGENO, QUE ES UN PROTON.

Por Ej. Una molecula polar de HCl dona un protn y una molcula de agua lo acepta, con lo que
se forman los iones Hidronio H30 , y cloruro Cl-
 LA MATRIZ DE LA VIDA
Interacciones dbiles en un medio acuoso

LAS MACROMOLECULAS QUE PARTICIPAN EN LA MATRIZ ESTRUCTURAL Y

FUNCIONAL DE LA VIDA SON ESTRUCTURAS INMENSAS
QUE SE MANTIENEN UNIDAS
MEDIANTE ENLACES COVALENTES FUERTES

Sin embargo, el enlace covalente por si solo no puede describir la complejidad de

la estructura molecular en biologa.

LAS INTERACCIONES MUCHO MAS DEBILES SON RESPONSABLES DE LA MAYOR

PARTE DE LA ARQUITECTURA CELULAR
SON DEBIDAS A LAS INTERACCIONES NO COVALENTES

(tambin conocidas como fuerzas no covalentes o enlaces no covalentes que se producen

entre iones, molculas y partes de las molculas)
 LA MATRIZ DE LA VIDA
Interacciones dbiles en un medio acuoso

Por ejemplo
el DNA esta conformado por una
secuencia lineal de residuos de
nucletidos que se mantiene
por enlaces covalentes. Y su
estructura tridimensional muy
especifica esta estabilizada por
interacciones no covalentes
entre diferentes partes de la
molcula.
 LA MATRIZ DE LA VIDA
Interacciones dbiles en un medio acuoso

SI QUEREMOS ENTENDER LA VIDA DEBEMOS CONOCER:

LAS INTERACCIONES NO COVALENTES

El como se comportan estas interacciones en un medio

acuoso, puesto que todas las clulas de todos los
organismos de la tierra estn baadas e impregnadas de
agua.
 LA MATRIZ DE LA VIDA
Interacciones dbiles en un medio acuoso

Las molculas y los

iones pueden
interactuar de forma
no covalente de varios
modos como se
observa en la siguiente
figura. Estas
interacciones no
covalentes son
fundamentalmente de
naturaleza
electrosttica, es decir,
dependen de las
fuerzas que las cargas
elctricas ejercen
entre ellas.
 LA MATRIZ DE LA VIDA
Interacciones dbiles en un medio acuoso

INTERACCIONES CARGA-CARGA

La interaccin no covalente mas sencilla es la interaccin electrosttica

entre un par de partculas cargadas. Muchas de las molculas que se

encuentran en las clulas, entre ellas las macromolculas como el DNA y las

protenas, tienen una carga elctrica neta. Adems de estas molculas, la clula

contiene abundantes iones pequeos, tanto cationes como aniones. Todas

estas entidades con carga ejercen fuerzas sobre las dems. La fuerza entre un

par de cargas q1 y q2 separadas en el vacio por una distancia r, viene

determinada por la LEY DE COULOMB:

F= K (Q1Q2/R R)
 LA MATRIZ DE LA VIDA
Interacciones dbiles en un medio acuoso

INTERACCIONES CARGA-CARGA

LEY DE COULOMB: F= K (Q1Q2/R R)

K es una constante

Si q1 y q2 tienen el mismo signo, F es positiva, lo que significa repulsin.

Si una carga es + y otro - , F es negativa, lo que representa atraccin. Son estas

interacciones carga-carga las que estabilizan un cristal de una sal

En una clula, las cargas siempre estn separadas por agua o por otras
molculas o partes de molculas. La existencia de este medio dielctrico
entre las cargas tiene el efecto de apantallarlas d las otras. Este efecto
apantallador se expresa aadiendo a la ecuacin un numero sin
dimensin: la constante dielctrica ()
F= K (Q1Q2/R R )
 LA MATRIZ DE LA VIDA
Interacciones dbiles en un medio acuoso

INTERACCIONES DE DIPOLOS PERMANENTES E INDUCIDOS

Ej. La distribucin electrnica de la

molcula de monxido de carbono
sin

carga es tal que el extremo del oxigeno es

ligeramente mas negativo que el

extremo del carbono. Una molcula as se

denomina polar o dipolo
permanente,

y se dice que tienen un momento dipolar

permanente .

El momento dipolar expresa la magnitud

de la polaridad de una molecula.
 LA MATRIZ DE LA VIDA
Interacciones dbiles en un medio acuoso

INTERACCIONES DE DIPOLOS PERMANENTES E INDUCIDOS

Dipolos Inducidos y fuerzas de

dispersin.

a) El benceno no tiene carga neta ni

momento dipolar permanente, pero
una carga cercana puede
inducir una redistribucin de
los electrones dentro del anillo
de benceno, produciendo un
momento inducido.

b) Las molculas planas como el

benceno tienen una fuerte
tendencia a apilarse, porque las
fluctuaciones de las nubes
electrnicas de los anillos apilados
interactan entre ellas,
produciendo una fuerza de
dispersin.

c) Aunque las molculas se aproximen

mucho, no entran unas dentro de
las otras.
 LA MATRIZ DE LA VIDA
Interacciones dbiles en un medio acuoso

REPULSION MOLECULAR EN DISTANCIAS MUY REDUCIDAS: RADIO DE VAN DER WAALS

Energa de interaccin no covalente de

dos partculas que se aproximan.

Se representa grficamente la energa de

interaccin de dos tomos, molculas o
iones frente a la distancia entre sus
centros r. La energa total de interaccin
(U) a cualquier distancia es la suma de la
energa de atraccin y de la energa de
repulsin. A medida que disminuye la
distancia entre las partculas (de derecha
a izquierda a lo largo del eje x), aumenta
tanto la energa de atraccin (-) como la
de repulsin (+), pero a velocidades
diferentes. En un principio predomina la
atraccin de largo alcance, pero luego la
energa de repulsin aumenta tan
rpidamente que acta como una barrera,
definiendo la distancia de mximo
acercamiento rv y los radios de van der
Waals R. La posicin de energa mnima
ro normalmente esta muy cercana a rv.
 LA MATRIZ DE LA VIDA
Interacciones dbiles en un medio acuoso

ENLACES DE HIDROGENO

La estructura y las propiedades de muchas molculas

biolgicas as como las del agua, el disolvente biolgico
universal, estn determinadas en gran medida por este tipo de
enlace.

Un enlace de hidrogeno es UNA INTERACCION ENTRE UN ATOMO DE

HIDROGENO UNIDO COVALENTEMENTE A UN GRUPO
DONADOR como O H N-H y un par de electrones libres
perteneciente a un grupo aceptor comoO=C- O N=-.

El tomo al que el hidrogeno esta unido covalentemente se denomina

DONADOR DE ENLACE DE HIDROGENO, y el tomo con el par
de electrones libres se denomina ACEPTOR DE ENLACE DE
HIDROGENO.

La longitud del enlace de hidrogeno es la distancia centro-centro

entre los tomos donador y aceptor.
 LA MATRIZ DE LA VIDA
Interacciones dbiles en un medio acuoso

ENLACES DE HIDROGENO

EL ENLACE DE HIDROGENO. Esta figura muestra un enlace de

H ideal que podra existir, por ej. , en O-H O=. Aunque el
enlace de H es entre H y el aceptor, la longitud del enlace de H
se define como la distancia eentre el donador y el aceptor.
 LA MATRIZ DE LA VIDA
Interacciones dbiles en un medio acuoso

ENLACES DE HIDROGENO

LOS ENLACES DE HIDROGENO EN LA

ESTRUCTURA BIOLOGICA.

Este ej. Es una parte de una protena con

una conformacin de hlice alfa. La hlice

alfa, un elemento estructural corriente en

las protenas, se mantiene mediante enlaces

de hidrogeno =N-H O=C= entre grupos en

la cadena de proteina.
MISION DEL AGUA EN LOS PROCESOS BIOLOGICOS

Los procesos qumicos y fsicos de la vida requieren que las

molculas puedan desplazarse, encontrarse e intercambiar parejas
continuamente en los procesos complicados del metabolismo y de
la sntesis

Un entorno liquido permite una movilidad molecular

El agua no es solo el liquido mas abundante de la tierra, sino que,

adems, esta admirablemente adecuado para esta finalidad.
 MISION DEL AGUA EN LOS PROCESOS BIOLOGICOS

Principales clases de enlaces de hidrogeno en molculas con importancia biolgica