Professional Documents
Culture Documents
CAPITULO 2
AMINOCIDOS
AMINOCIDOS
En los microorganismos, plantas y animales se
encuentran unos 300 aminocidos.
En la mayora de los seres vivos solamente 20
aminocidos son codicados por el DNA para formar las
protenas (proteinognicos). Adems existen
selenocistena y pirrolisina (arqueobacterias).
Muchas protenas contienen aminocidos modicados y
partes no proteicas (grupos prostticos).
AMINOCIDOS
Cadena
lateral
Carbono-
Grupo amino
Grupo carboxilo
Modelo de bolas
Aminocido
Los aminocidos son los monmeros de las protenas.
En los aminocidos naturales, el grupo amino y el
grupo carboxil se unen al mismo carbono que recibe el
nombre de alfa asimtrico.
Existen unos 20 aminocidos distintos componiendo
las protenas.
Tcnicamente hablando, se les denomina alfaaminocidos, debido a que el grupo amino (NH2) se
encuentra a un tomo de distancia del grupo carboxilo
(COOH).
Aminocidos
Todos Los Aminocidos
que forman parte de las
protenas son
L-aminocidos
La unin qumica entre
aminocidos en las
protenas se produce
mediante un enlace
peptdico
Frmula general
L-Alanina
D-Alanina
Alanina
Acido Asprtico
Arginina
Aminocidos estndar.
Aminocidos
estndar.
Los
aminocidos
estndar
difieren unos
de otros en la
estructura de
las cadenas
laterales
enlazadas a
los tomos de
carbono .
Configuracin:
Hay dos tipos L y D
La mayoria de los aminoacidos con actividad biolgica son los del
tipo L (forman parte de las protenas).
Existen algunos casos de AA del tipo D con actividad biolgica, los
cuales se han encontrado en vertebrados superiores, invertebrados y
bacterias.
Clasificacin de AA
SEGN LA CADENA
NO POLARES
AROMTICOS
POLARES SIN CARGA
CON GRUPOS CIDOS
aa
POLARES CON CARGA
CON N BSICO
NO POLARES ALIFTICOS
O
H2N
CH
OH
H2N
CH
CH2
CH
H2N
ALANINA Ala
CH3
CH3
LEUCINA
Leu
OH
H2N
CH
CH
CH3
CH
CH
CH3
CH3
OH
VALINA
Val
O
CH
OH
CH3
GLICINA
Gli
H2N
OH
CH2
OH
HN
CH3
ISOLEUCINA
Ile
PROLINA
Pro
NO POLARES AROMTICOS
O
H2N
CH
O
OH
CH2
H2N
CH
O
OH
H2N
CH
CH2
OH
CH2
HN
FENILALANINA
Phe
OH
TIROSINA
Tyr
TRIPTOFANO
Trp
CH
OH
CH2
OH
SERINA
Ser
H2N
CH
CH
OH
CH2
CH3
TREONINA
Tre
SH
O
OH
H2N
CH
CH2
CH2
CH2
CH3
OH
CH
CH2
H2N
CH
O
H2N
METIONINA
Met
OH
CISTENA
Cys
O
OH
H2N
CH
OH
CH2
C
NH2
GLUTAMINA
Gln
NH2
ASPARRAGINA
Asn
Con carga
CH C
O
OH
H2N
CH C
CH2
CH2
CH2
CH2
CH2
CH2
OH
H2N
CH C
CH2
O
OH
H2N
CH
OH
CH
OH
CH2
CH2
N
H2N
CH2
NH
CH2
NH
NH2
LISINA
Lis
OH
NH
NH2
ARGININA
Arg
HISTIDINA
Hys
ACIDO GLUTMICO
Glu
OH
CIDO ASPRTICO
Asp
Segn su obtencin
A los aminocidos que necesitan ser ingeridos por el
cuerpo para obtenerlos se les llama esenciales.
Para humanos, los aminocidos esenciales son:
1. Valina (Val)
2. Leucina (Leu)
3. Treonina (Thr)
4. Lisina (Lys)
5. Triptfano (Trp)
6. Histidina (His)
7. Fenilalanina (Phe)
8. Isoleucina (Ile)
9. Metionina (Met)
10.Arginina (Arg) (Requerida en nios y tal vez ancianos)
AMINOCIDOS ESENCIALES
Son diferentes en cada especie, en la especie humana
son diez:
Valina
Leucina
Isoleucina
Fenilalanina
Triptfano
Metionina
Treonina
Lisina
Arginina
HisHdina
Apolares
Polar
Bsicos
PROPIEDADES FSICO-QUMICAS
DE LOS AMINOCIDOS
Polaridad.
Acidez, basicidad.
Aromaticidad.
Tamao, exibilidad de conformacin.
Capacidad de formar enlaces cruzados.
Reactividad qumica. Capacidad de unin a
hidrgeno.
Propiedades
cido-bsicas.
Cualquier aminocido puede comportarse como cido y
como base,( sustancias anfteras)
Cuando una molcula presenta carga neta cero est en su
punto isoelctrico.
Se comportan como sustancias tampn.
pticas.
Todos los aminocidos excepto la glicina, tienen el
carbono alfa asimtrico lo que les confiere actividad
ptica.
Qumicas.
Las que afectan al grupo carboxilo (descarboxilacin).
Las que afectan al grupo amino (desaminacin).
Las que afectan al grupo R.
AMINOCIDOS MODIFICADOS
POSTRADUCCIONALMENTE EN PROTENAS
Fosfo-serina
Fosfo-treonina
5-Hidroxi-lisina
Fosfo-tirosina
4-hidroxi-prolina
N-metil-arginina
N-acetil-lisina
N-metil-lisina
Ornitina
Gamma-aminobutirato
(GABA) NEUROTRANSMISOR
Citrulina
INTERMEDIARIOS
CICLO DE LA UREA
HORMONA
TIROIDEA
DERIVADOS DE AMINOACIDOS
ADRENALINA
MEDIADOR CELULAR
HISTAMINA
MEDIADOR
R. INMUNE
SEROTONINA
NEUROTRANSMISOR
Curvas de titulacin
Para un
aminocido mono
amnico y mono
carboxilo
PI = (pK1 + 2)/2
Ejemplo, la valina:
a pH 1: carboxilo como -COOH y amino como
-NH3+. El aminocido tiene carga positiva neta.
A pH 7, el carboxilo se disocia (-COO-) y el amino
sigue protonado (-NH3+); (zwitterion).
A pH 13, el carboxilo sigue disociado (-COO-) y el
amino pierde el protn ( -NH2); el aminocido
queda con una carga
negativa.
pKa
Es una forma simplificada de observar la constante de
equilibrio K
La ecuacin de Henderson-Hasselbach rige la disociacin de
cualquier cido o base dbil a un pH determinado.
La ecuacin implica el uso de las concentraciones de
equilibrio del cido y su base conjugada. Para el clculo del
pH en soluciones buffer.
Donde,
HA
H +A
+
Ka = [ H+][A-]
[HA]
pH = -log [ H+]
Punto isoelectrico
pH en el cual un aminocido tiende a adoptar una forma
dipolar neutra.
La solubilidad en agua de un aminocido es mnima
en su punto isoelctrico.
PROPIEDADES QUMICAS
Formacin de enlaces PEPTDICOS:
35
Eliminacin de una
molcula de agua
Enlace peptidico
Extremo carboxilo
PROPIEDADES QUIMICAS
Reaccin de la ninhidrina
Es una de la reacciones ms importantes, la cual se ha
utilizado durante muchos aos para detectar y
cuantificar a.a. en cantidades del orden del microgramo.
La ninhidrina descarboxila por oxidacin los -a.a. a CO2
y un aldehdo, formndose un complejo de color azulprpura (l : 570 nm).
Los a.a. como la, prolina e hidroxiprolina, producen un
color amarillo con ninhidrina.
Otras reacciones
Prolina e hidroxiprolina, producen color amarillo con
ninhidrina.
REACCION CON DINITROFLUOROBENCENO.
Principal aplicacin: determinacin del residuo N-terminal
de cadenas peptidicas.
El complejo formado es el dinitrofenil (DNP) de color
amarillo.
REACCION CON FENILISOTIOCIANATO.
Reaccin de Edman. Con cloruro de dansilo.
Aplicacin principal: determinar la secuencia de cadenas
peptdicas desde el extremo N-terminal.
Estereoismerismo de aminoacidos
Ismeros: dos o mas compuestos que tienen el
mismo numero, clase de tomos y PM.
Isomera estructural.
Estereoisomera.
Ismeros geomtricos. Cis- trans.
Enantiomeros. Ismeros pticos. L. D
Enantiomeros
PROPIEDADES OPTICAS
Cromforo: Molcula capaz de absorber luz a cierta longitud de onda
SEPARACION DE AMINOACIDOS
Los a.a. son liberados de las protenas mediante una
hidrlisis. Un hidrolizado proteico, obtenido por coccin
con HCl 6N, presenta una mezcla de a.a.
Tcnica de Cromatografa:
En todas las separaciones cromatogrficas, las molculas
son separadas dentro de una fase estacionaria y una
mvil.
Dependiendo del tipo de fase estacionaria podemos
distinguir: cromatografa en papel, cromatografa en
capa fina, o cromatografa en columna, en gases,
HPLC, etc.
La separacin depende de la tendencia relativa de las
molculas en la mezcla de asociarse con ms fuerza a una
o a otra fase.
Cromatografa en papel
Las muestras se aplican en un punto marcado aprox. A 5
cm del extremo de una tira de papel filtro, y sta se
suspende en un recipiente sellado que contiene el
solvente cromatogrfico (para a.a. son mezclas de agua,
alcoholes y cidos o bases, constituyendo la fase mvil).
La fase movil asciende por capilaridad. Cuando ha
avanzado hasta el otro extremo, la tira se seca y se trata
para permitir la visualizacin de las molculas de inters
(ej.: para a.a. se trata con ninhidrina al 0.5% en acetona,
seguida de calentamiento de 90-100 C durante unos
minutos).
Cromatografa en papel
La relacin entre la
distancia recorrida por un
a.a. con la distancia que
viaja el solvente, medidas
ambas desde el sitio
marcado para la aplicacin
de la mezcla de a.a., se
asigna como valor Rf
(movilidad relativa con el
sustrato) de ese a.a.
La movilidad puede
expresarse en relacin a la
de un estandar
Rf:
Fundamento
Los a.a. con grandes cadenas laterales no polares (Leu, Ileu, Fen, Trip, Val,
Met, Tir) migran ms que que aquellos con cadenas laterales mas cortas no
polares (Pro, Ala, Gli) o con cadenas laterales polares (Thr, Glu, Ser, Arg, Asp,
His, Lis, Cis).
Esto refleja la mayor solubilidad relativa de las molculas polares en la fase
estacionaria hidroflica, y de las molculas no polares en solventes orgnicos.
Fundamento de Electroforesis
Cuando una mezcla de molculas
ionizadas y con carga neta son
colocadas en un campo elctrico,
estas experimentan una fuerza de
atraccin hacia el polo que posee carga
opuesta, dejando transcurrir cierto
tiempo las molculas cargadas
positivamente se desplazaran hacia el
ctodo (el polo negativo) y aquellas
cargadas positivamente se desplazaran
hacia el nodo (el polo positivo).
Separacin electrofortica.
Representacin
simplificada de la
separacin
electrofortica de la
alanina, lisina y cido
asprtico a pH = 6.
La lisina catinica es
atrada hacia el
ctodo, el cido
asprtico aninico es
atrado hacia el
nodo y la alanina se
encuentra en su
punto isoelctrico,
por lo que no se
mueve
Electroforesis vertical