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El puente de hidrgeno es un enlace que se establece entre molculas capaces de generar cargas parciales.
Cuando
un tomo de Hidrgeno est unido covalentemente a un tomo electronegativo. ej. O o N, asume una densidad () de carga positiva, debido a la elevada electronegatividad del tomo vecino.
tomos de H susceptibles de atraccin por los electrones no compartidos en los tomos de O o N. Obsrvese la configuracin electrnica del Oxgeno:
N H H
:O
2 2s2 2px py pz O 1s 8
O H
:O
N H H O H
:N
:N
El p de H es
de ah que :
La molcula de agua est formada por dos tomos de H unidos a un tomo de O por medio de dos enlaces covalentes. La disposicin tetradrica de los orbitales sp3 del O determina un ngulo entre los enlaces H-O-H
Aproximadamente de 104.5, adems el O es ms electronegativo que el H y atrae con ms fuerza a los electrones de cada enlace.
La molcula de agua presenta una distribucin asimtrica de sus electrones, lo que la convierte en una molcula polar
alrededor del O se concentra una densidad de carga negativa , mientras que los ncleos de hidrgeno quedan desnudos, desprovistos parcialmente de sus electrones y manifiestan, por tanto, una densidad de carga positiva.
Se establecen interacciones dipolo-dipolo entre las molculas de agua, formndose enlaces o puentes de hidrgeno
O H O H O
O H
O H
El
arreglo siempre es perpendicular entre las molculas participantes, adems, es favorecido porque cada protn unido a un O muy electronegativo encuentra un electrn no compartido con el que interacta uno a uno.
en el agua interacciona con 4 protones, dos de ellos unidos covalentemente y dos a travs de puentes de Hidrgeno.
entre los tomos de O que intervienen en el p de H, estn separados por 0.28 nm lo que indica un arreglo tetradrico de las molculas de agua
TETRAEDRO
La colinealidad de los puentes es muy importante, un alejamiento de 10 ocasiona que el puente se rompa.
Calores de vaporizacin, DHvap (cal/g) Agua Metanol Etanol n-Propanol Acetona Hexano Benceno Cloroformo 540 263 204 164 125 101 94 59
Constante dielctrica a 20C, D Agua Metanol Etanol Acetona Benceno Hexano 80 33 24 21.4 2.3 1.9
Punto de fusin, C Agua Metanol Etanol n-Propanol Acetona Hexano Benceno Cloroformo 0 -98 -117 -127 -95 -98 6 -63
Punto fusin, C
Punto ebullicin, C
HCl
H2O H3N
-114.24
0 -77.73
-85.06
100 -33.34
H4C
-182.47
-161.45
-hlice
Lamina plegada
porque todas las formas vivas requieren ambientes acuosos. Los p de H, son la causa de las propiedades fsicas exclusivas del agua y hacen que se comporte como un lquido. Son la causa de la estabilidad de la arquitectura tridimensional de las protenas y de la formacin de pares de bases estables entre las dos hebras de ADN.
tomos de N
Bases pricas
Adenina Guanina
Bases pirimidnicas
Citosina Timina
Adenina
Timina
Guanina Citocina
Algunas tienen nombres comunes, como hipoxantina, xantina o pseudouridina. Cuando surgen por la modificacin de un tomo del anillo de purina o pirimidina, por convenio se indica la posicin del anillo en la que se encuentra la sustitucin pero no se especifica el elemento (N o C) sobre el que se produce la sustitucin, y luego se coloca la naturaleza del sustituyente. Por ejemplo: 5-metilcitosina, 4-tiouracilo o 7metilguanina. Cuando surgen por la modificacin de un tomo extraclico, se especifica un tomo en cursiva (N o C) y se le coloca un superndice a la derecha con la posicin. Por ejemplo: N6-metiladenosina o N2metilguanosina.
coplanar de los enlaces El carcter hidrfobo viene dado por la naturaleza aromtica de los anillos purnicos y pirimidnicos. Por tanto, son insolubles en agua a pH fisiolgico. Son planas porque los C tienen orbitales moleculares sp2 (tres orbitales moleculares en un plano y uno p perpendicular que sirve para formar el doble enlace). Lgicamente, es una estructura resonante.
2.- Dipolos
muy electronegativos (N y O) dentro y fuera del anillo aromtico, por lo que existe una atraccin asimtrica de los electrones de la molcula y, por tanto, se forman dipolos que permiten formar puentes de hidrgeno.
explicar que se puedan aparear de manera distinta a la que ellos proponan y generar mutaciones espontneas. dichas formas existen debido a la migracin de los electrones por los dobles enlaces conjugados. Hay dos tipos Tautomera ceto-enlica (lactama-lactima) Interconvierte un grupo ceto (=O) y enol (OH) extracclicos cerca de un N cclico. Se puede producir en la G, C, T y U. Las lactimas imprimen un fuerte carcter cido a las bases. Tautomera imina-amina Interconvierte un amino (NH2) extracclico
Son el producto de la
unin de una base nitrogenada y una pentosa mediante un enlace -N-glucosdico. Para evitar la ambigedad de la numeracin de la pentosa y la base, los tomos de la pentosa se nombrarn aadiendo una ' adicional.
Surgen de la unin de un
nuclesido y un fosfato, lo que les confiere un carcter muy cido, por lo que forman sales, se pueden cristalizar y son muy solubles en agua. Presentan afinidad por los cationes divalentes como Mg, Mn y Ca, con los que forma enlaces coordinados. En el caso de los NDP, el quelato slo se puede establecer con los fosfatos y . Sin embargo, en los NTP hay otra posibilidad ms, que es la formacin de enlaces coordinados con los fosfatos y .