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DNA - historia
1866 Gregor Mendel Publico sus resultados sobre los factores de la herencia.
1902 Walter Sutton Interrelaciona la citologa y el Mendelismo (morfologa & herencia). Cromosomas son unidades hereditarias. Esta teora tambin fue desarrollada por Theodor Boveri
1928 Fred Griffith Propuso la existencia de un principio transformante en sus ensayos con diplococos.
1944 Oswald Avery,Colin MacLeod,Maclyn McCarty. Reportaron que el principio transformante de Griffith era el DNA.
Neumococos R vivos inoculados junto con neumococos S inactivados por calor producan la muerte del ratn
Maclyn McCarty
live S strain
1950 Erwin Chargaff Determino que los organismos vivos presentan una razon constante entre Adeninas con Timinas y Guaninas con Citocinas.
1951 Rosalind Franklin Obtuvo las fotografias de difraccion de rayos X del DNA
Rosalind Franklin
Maurice Wilkins
1952 Martha Chase y Alfred Hershey empleando bacteriofagos marcados con 35S y 32P demostraron que el DNA es una molcula hereditaria
1953 Francis Crick y James Watson resolvieron la estructura tridimensional del DNA.
1958 Matthew Meselson y Frank Stahl empleando isotopos demostraron la propiedad semiconservativa de la replicacin del DNA.
1958 Arthur Kornberg Purifico la DNA polimerasa I de E. coli, La primera enzima que sintetisa DNA en un tubo de ensayo 1966 Marshall Nirenberg, H. Gobind Khorana Led descifran el cdigo gentico determinan que los codones (tripletes de nucleotidos de mRNA) son especficos para un aminocido. 1970 Hamilton Smith Kent Wilcox Aislo la primera enzima de restriccin, HindII: que corta el DNA en un sitio de reconocimiento especifico. 1977 Fred Sanger Desarrolla el mtodo del nucleotido terminador para el secuenciamiento de DNA. 1978 Somatostatin es la primera hormona humana en producirse por la tecnologia del DNA recombinante. 1983 Kary B. Mullis Propuso el mtodo de Reaccin en Cadena de la Polimerasa (PCR) para amplificar DNA 1988 - 2003 Se desarrolla el proyecto genoma Humano 2007 DNA de J Watson secuenciado en 2 meses 454 Life sciences (ROCHE)
DNA
.
Replicacin
CCTGAGCCAACTATTGATGAA
PEPTIDE
Componentes de un nucletido:
base N + pentosa + fosfato
Componentes de un nuclesido:
base N + pentosa
DNA
Bases nitrogenadas de los cidos nuclicos
RNA
(DNA)
(RNA)
Nomenclatura de nucletidos y nuclesidos BASE Purinas Adenina Adenosina Desoxiadenosina Guanina Guanosina Desoxiguanosina Adenilato RNA Nuclesido Nucletido Acido nucleico
Desoxiguanilato DNA
Pirimidinas
Citocina Timina Uracilo Citidina Deoxicitidina Timidina o deoxitimidina Uridina Citidilato Deoxicitidilato Timidilato o deoxitimidilato Uridilato DNA DNA DNA RNA
A
C
T
G
A Vista del enlace de las bases B Vista de inicio a fin de las cadenas
Formas de DNA
Forma A
Forma B
Forma Z
La forma B es referida a la de Watson Crick Z alternancia de G y C, presente como segmentos en eucariotes y procariotes, con funcion quizas regulatoria de expresin
El DNA puede disociarse o asociarse por la complementaridad de su secuencia nucleotidica: Denaturacin reversible del DNA
La renaturacin permite hacer anlisis de hibridacin cuando se mezclan dos hebras de DNA que comparten cierto grado de similaridad en su secuencia
Una secuencia con mayor % de GC presentara un tm mayor que una secuencia con alto contenido de AT (El tm es la Temperatura media de Melting o de disociacin en el que la denaturacion de las hebras de ADN es del 50%)
Debido a las bases nitrogenadas el DNA absorbe luz ultravioleta. El efecto denominado hipercromicidad se da al denaturar el DNA, as las bases estn expuestas y puede absorber mayor cantidad de luz ultravioleta
Replicacin de DNA
La replicacin
a 3
La sntesis de DNA en E. coli, Empieza con la unin de protenas dnaA a la secuencia de origen (ori)
Secuencia Ori 5 3
3 5
La regin rica en A T es denaturada y hexameros de DnaB (helicasa) se unen al DNA en colaboracin con DnaA
A A
3 5
A A
A
A
A A
A
A
B C
A
A A
B C
A
A
A A
A
A A
B C
RNA primer
G B C
Telomeros y edad
Metaphase chromosome
Telomeros son capuchones protectivoscaps sobre el extremo de los cromosomas y consisten de repeticiones cortas en tandem de 5-8 bp de una secuencia rica en GC, Previenen desde fusiones Cromosomas y rearreglos del kariotipo.
telomero
centromero
telomero estructura
(TTAGGG)poco
Edad senil
telomerasa (una enzima) requerida para mantener la longitud de las clulas germinales La mayora de las clulas somaticas disminuye el nivel de la actividad de la telomerasaevels of telomerase y asi sus cromosomas se acortan en cada divisin
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El mecanismo involucra iones Mg que coordinan con el grupo fosfato y tres residuos Asp de La enzima DNA polimerasa
Las enzimas polimeras tienen un mecanismo de relectura o de proofreading (actividad exonucleasa 3 a 5) Evita la mala incorporacin de un nucleotido La DNA polimerasa controla la fidelidad de la replicacin
El sistema de excision de nucleotido NER repara los daos provocados por radiacin ultravioleta: Puede ocurrir la reparacin en forma global o acoplada a la transcripcin
El sistema de reparacin excision de base BER, repara daos de deaminacion o rupturas en una sola cadena
El sistema de reparacin por recombinacin homologa HR y de unin de extremos EJ, reparan la ruptura de las cadenas de DNA
Cromosomas
En el bacteriofago
En bacterias
En mamiferos
Los cromosomas estn divididos en distintas regiones. Un bandeo caracterstico se da por facilidad de coloracin de algunas regiones, se desconoce el porque solo se conoce que las regiones decoloradas contienen mas cantidad de GC
En eucariotas, el DNA se encuentra empaquetado con proteinas histonas dentro de la cromatina. Las unidades bsicas de la cromatina son los nucleosomas.
HISTONAS
Acetilacin de histonas
Se produce en residuos de lisina y es reversible. Las histonas acetiladas estn asociadas a la cromatina transcripcionalmente activa y las histonas desacetiladas a la cromatina inactiva. La acetilacin neutraliza la carga positiva de las lisinas.
HATs
Histona acetiltransferasas. Estas modificaciones ocurren en el extremo amino terminal de las histonas. La primera familia de las HATs es la superfamilia GNAT, que incluye las protenas que envuelven, unen e inician la transcripcin como la Gcn5 y PCAF, elongacin como Elp3.
HDACs
Estn asociados a complejos proteicos. Se han encontrado deacetilasas en subunidades de complejos polipeptdicos que actan como correpresores y silenciadores de genes. La Rpd3 y Hda1eliminan grupos acetil crticos de las histonas, empaquetando la cromatina en una forma inactiva (heterocromatina).
La formacin de la heterocromatina es mediado por protenas Sir2, Sir3 y Sir4, estudios recientes han encontrado que Sir2 presentan un Nad dependiente de la actividad HDAC. Tambin se ha visto que la desacetilacin de la lisina 16 de H4 es importante para la interaccin de Sir3 y Sir4.
Metilacion de Histonas
Es uno de los mecanismos de regulacin que pta diversas funciones asociadas a la activacin o a la represin de un gen.
HMTs