Biologie cellulaire

Introduction
1 Origine et volution des cellules On estime lapparition de la vie 3,5 - 3,8 Ga soit environ 1Ga aprs la formation de la Terre. Cette vie aurait commenc avec LUCA

Il sagit de la cellule qui a donn lensemble des organismes vivants Eucaryotes Eubactries Archobactries On suggre que des composes simples comme le CO2, le diazote (N2) en prsence de gaz comme lhydrogne (H), ou le H2S, ou le monoxyde de carbone (CO) auraient form des molcules organiques simples et plus particulirement des acides (aspartate, alanine, actate ) dans des conditions extrmes (Temprature leve, pression leve et pH acide ou basique). Grce ses conditions, les molcules simples se sont associes, polymrises pour former des macros molcules (complexe et de grande taille) : les acides nucliques (ADN, ARN, protines, phospholipides) formation de LUCA

On pense que la cellule primordiale est ne de lemprisonnement dun acide nuclique et dune macromolcule dans un espace clos form dune membrane compose de phospholipides. On estime que le 1er acide nuclique est un ARN qui sest retrouv prisonnier dans cette structure. Cette cellule une fois constitue va tre capable de mettre en place un systme de stockage de sa mmoire sous forme dADN. Elle va aussi mettre en place toute une machinerie lui permettant dlaborer ses propres molcules et en particulier les protines. A ce stade, ces cellules ne peuvent pas produire leur propre nergie. Elles puisent lnergie dont elles ont besoin dans le milieu extrieur. Au cours de lvolution, il y a lapparition de mcanisme de production de lnergie :

Glycolyse : correspond la dgradation de molcules organiques formation dATP Photosynthse : permet la production dnergie (capture de lnergie solaire et utilisation de cette nergie pour produire des molcules organiques.) Mtabolisme oxydant : dgradation de molcules organiques. Elle se fait en prsence doxygne production dATP

Au cours du temps, cette production dATP est de plus en plus efficace avec lapparition de la respiration cellulaire grce aux mitochondries. Il y a 2 Ga apparaissent les 1ers organismes eucaryotes Association au cours de lvolution de ces organismes pour former les organismes pluri cellulaires (plantes, insectes, animaux)

2 La thorie cellulaire

En 1665, par hasard, Robert Hooke annonce pour la 1re fois la thorie cellulaire. Au microscope il observe une structure cloisonn sur une mince couche de lige. Il invente alors le mot cellule (petit espace clos) En 1938 le cellule revient et est dfinitivement adopt avec les travaux de Thodore Schwann. Il dmontre que tous les organismes vgtaux et animaux sont constitus de cellules et de produits de ces cellules.

La thorie cellulaire
La cellule est une unit vivante, c'est l'unit de base du vivant. Individualit cellulaire grce une membrane plasmique qui rgle les changes entre la cellule et lenvironnement. Tous les tres vivants sont faits de cellules (au moins une cellule). Toute cellule provient d'une autre cellule. La cellule renferme l'information (ADN) ncessaire son fonctionnement et sa reproduction. L'ADN est libre ou stock dans un noyau. Cellules avec noyau = Eucaryotes (1,5 milliards d'annes). Cellules sans noyau = Procaryotes (3,5 milliards d'annes).

Chaque type de cellules remplit une fonction prcise. Elles sorganisent en tissus : lpithlium pour les animaux

le parenchyme pour les vgtaux

On reconnait 2 grands types de cellules : Cellules procaryotes : - archobactrie (bactries les plus primitives, on les trouve dans des milieux hostiles) - eubactries (forme commune de bactries actuelles)

Cellules eucaryotes :

Cytosol : Liquide intracellulaire Cytoplasme : liquide intracellulaire + tous les organites sauf le noyau.

3 Les molcules de la vie Elments essentiels la vie : Pour chafauder une structure cellulaire, la vie utilise 25 des 92 lments chimiques prsents ltat naturel. Parmi ces 25, 4 sont trs important : Carbone (C) : peut former 4 liaisons chimiques Hydrogne (H) : ne forme quune liaison Oxygne (O) : peut former 2 liaisons Azote (N) : peut former 3 liaisons Ils correspondent aux lments majoritairement utiliss. Avec ces lments on peut former un nombre trs important de molcules diffrentes, des plus simples aux plus complexes.

Presque toutes les molcules des tres vivants contiennent des atomes de carbone relis les uns aux autres.

Lensemble de ces formes gnrent des acides amins, des acides nucliques, des protines, des glucides et des lipides.

4 Membrane plasmique et compartimentation

La membrane plasmique est une frontire entre lintrieur et lextrieur. Elle permet lunion des cellules entre elles surtout dans le cas des cellules animales. Elle permet aussi lchange entre le cytosol et le liquide interstitiel (liquide se trouvant entre 2 cellules).

Compartimentation interne de la cellule dlimitant les organites qui ont chacune des fonctions spcifiques.

5 Membrane et compartimentation cellulaire

Une membrane est constitue de 2 couches lipidiques appeles bicouche ainsi que de protines. Chaque couche est constitue de molcules lipidiques. Ces molcules lipidiques sont des phospholipides. On distingue 2 rgions :

En raison de la partie hydrophobe, la membrane est impermable aux macromolcules. Elle prsente une permabilit slective aux ions. Il sagit donc dune barrire entre les composants. Malgr cette impermabilit, les molcules peuvent traverser la membrane en empruntant les protines transmembranaires (canaux ioniques, pont, )

6 La compartimentation cellulaire : un avantage ?

La compartimentation confre plusieurs avantages : Les membranes constituent une barrire qui permet chaque organite de conserver un milieu ionique et enzymatique particulier. Chacun de ses milieux favorise alors un sous type de raction biochimique vital. Exemple : Les mitochondries permettent de produire de lATP. Cette production se fera de faon optimise grce cette sparation. Dans les lysosomes on trouve des enzymes de digestions et un pH acide. La compartimentation optimise la digestion et vite une dgradation du reste de la cellule.

Conclusion : Quest-ce qui dfinie une cellule ? Quelle est la cellule dorigine ? Rle de la membrane ? Compartimentation chez les eucaryotes ?

Chapitre 1

Le mtabolisme bionergtique : les structures cellulaires impliques

Les mitochondries et les chloroplastes produisent de lATP. Mitochondrie : produit de lATP en arobie partir de la dgradation de compos nutritifs (lipide, glucide, acide amine). On parle de catabolisme oxydatif (dgradation de molcules organique). Plus globalement, cest le mtabolisme respiratoire. Chloroplaste : une partie de lATP est produit par les chloroplastes qui ont la capacit de convertir lnergie lumineuse en ATP. Cest la Photochimie (processus de la photosynthse). On parle danabolisme (production dnergie et synthse de molcule organique). Cet ATP est utile la croissance cellulaire, la biosynthse de nombreux autres composs et cest un transporteur actif de molcules. Les peroxysomes ne sont pas impliqus directement dans la production dATP, cependant ils cooprent avec les mitochondries et les chloroplastes pour permettre la production dATP.

Structure molculaire de lATP

-D-ribose (sucre 5 carbones) Adnine (base purique) Hydrolisation

ATP

ADP + Pi

libre dans les organites une nergie de 30 kJ mol-1

Phosphorylation LATP est donc une molcule riche en nergie Une raction qui libre de lnergie est dite exerbonique et une raction qui prend de lnergie est dite enderbonique

I Les mitochondries
1 Analyse en Microscopie Photonique (MP) : structure et proprit A) Polymorphisme et mobilit du chondriome (ensemble des mitochondries prsent dans le cytosol) Les mitochondries sont des organites prsents en suspension dans le cytosol de toutes les cellules arobie. Elles peuvent tres observs en MP grce plusieurs techniques

On distingue 3 types de mitochondries qui peuvent tre prsentes en mme temps dans la mme cellule.

Granulaire (0,5 1 m)

Ovalaire (plus courante) (2 4 m)

filamenteuse (0,2 0,5/7 m)

Cas extrme : Les cellules intestinales (anthrocytes) descargot prsentent des mitochondries filamenteuses de 20 m. Cependant, la forme des mitochondries dpend des proprits physico-chimiques du cytosol (pH, Posm, ). Ces facteurs influent sur la forme des mitochondries qui sont donc des organites dont la forme change constamment. Mais le polymorphisme chondrial est relativement restreint. Les mitochondries sont immobiles dans certaines cellules pour demeurer dans des rgions du cytosol o elles rpondent une demande local en nergie. Dans dautres cellules, elles peuvent tre trs mobiles. Elles ne sont pas doues dune mobilit propre mais elles suivent un courant cytosolique gnr par le cytosquelette. La mobilit du chondriome sobserve au cours de la mitose (division cellulaire) Il y aura donc un partage gal du nombre de mitochondries dans chaque cellule fille. Ces mitochondries vont se mettre de part et dautre du fuseau mitotique.

B) Distribution intracellulaire des mitochondries Cette distribution est le plus souvent uniforme dans le cytoplasme, mais il existe des exceptions. Cas dune cellule intestinale (anthrocytes : cellules qui tapissent la cavit intestinale et qui rcuprent les nutriments)

Microvillosit apicale Lot apicale de mitochondries filamenteuses Noyau Lot basal de mitochondries vasculaires Lame basale

Le lot apicale de mitochondries filamenteuses absorbe les nutriments au travers de la microvillosit apicale ce qui demande beaucoup dnergie. Le lot basal de mitochondries vasculaires produit lnergie pour restituer les nutriments lorganisme. Cas du spermatozode

Les mitochondries se trouvent l o il y a besoin dnergie.

2 Ultrastructure du chondriome On observe une constance ultrastructurale, c'est--dire que quelque soit la forme, la structure interne est semblable

La mitochondrie est compose de 2 membranes avec un espace intermembranaire appel chambre externe. Crtes mitochondriales : Soit courtes, soit allonges Longitudinales ou transversales De type tubulaire, triangulaire ou prismatique Lieu de synthse de lATP. Elles sont 3 fois plus nombreuses dans les mitochondries de cellules cardiaques que dans les mitochondries de cellules hpatiques (du foie) Matrice : elle prsente un pH alcalin (basique) caractristique o lon trouve en suspension des granules de 30 50 nm de diamtre. Ces granules correspondent une accumulation de cations (Ca2+, Mg2+, ). Ribosomes : Ils sont en charge de la synthse des protines. ADN : ADN circulaire de petite taille (5 10 copies par mitochondries). On ne peut pas lobserver car il est trop petit.

3 Composition chimique et organique de lenveloppe mitochondriale

Membrane externe : 60% de protines, 40% de phospholipides Bicouche phospholipidique renfermant des protines intgres (3500/m2) Permable en raison du nombre important de protines qui correspondent des transporteurs intervenants dans lchange de molcules entre le cytosol et lespace intermembranaire. Protines : Porines : pores aqueux au travers de la membrane lipidique et permettant le transport passif de molcules de taille infrieur 5 kDa (pyruvate, AG, H+). Ces mtabolites sont impliqus dans la formation dATP. Pour produire cet ATP, il faut de nombreuses protines qui empruntent des complexes spcifiques de transfert afin dtre vhicules du cytosol la matrice. Complexe spcifique de transfert : vhicule les grosses protines du cytosol vers la matrice. Espace intermembranaire : Lieu de transit de toutes les molcules de tailles infrieur 5 kDa. Sa concentration en H+ est leve ce qui confer un pH acide caractristique de lespace intermembranaire. On retrouve en solution une hmoprotine appele cytochrome C dont la participation au mtabolisme respiratoire est essentielle. Membrane interne : 70% de protines, 30% de phospholipides Prsence de cardiolipides qui sopposent tous passages dions au travers de cette membrane. Leurs prsences fait que cette membrane est impermable aux H+.

La membrane interne est qualifie dimpermable malgr la prsence de nombreuses protines. Cest la barrire entre le cytosol et la matrice. Prsence de 4 complexes mtalloprotiques (chaque complexe est compos de plusieurs protines) associs des atomes mtalliques (fer ou cuivre). Ces 4 complexes cooprent pour catalyser une cascade de ractions doxydorductions. On les appelle la chaine de transporteurs des lectrons respiratoires qui vont tre impliqus dans la synthse dATP. Cest la chaine respiratoire. ATP synthase : complexe enzymatique responsable de la production dATP dans la matrice mitochondriale. Ils se concentrent sur les crtes mitochondriales. On distingue une particule sphrique appele F1 qui baigne dans la matrice et qui est rattache la membrane interne par un pdoncule appel F0 intgr dans la membrane. Le fonctionnement des ATP synthase est coupl celui de la chaine respiratoire. 4 Le mtabolisme intramitochondriale A) La respiration cellulaire La mitochondrie est la principale source dnergie des cellules eucaryotes animales. Il sagit dun catabolisme arobie se dfinissant comme tant loxydation de molcules (glucides, lipides, acides amins). Cette oxydation lieu en prsence dO2 conduisant la production de gaz carboniques et deau. LATP est produite dans la matrice grce aux ATP synthase. Cette synthse DATP est appel phosphorylation.

Production dactyle coenzyme A. Loxygne nintervient pas. Cycle de Krebs : lors de cycle, il y a production de pouvoir rducteur (molcule sous forme rduite qui porte des lectrons de haute nergie. Pouvoir rducteur : NAD (Nicotinamide Adnine Dinuclotide) 2 2 FAD (Flavine Dnine Dinuclotide) 2 2 Le pouvoir rducteur va etre oxyder et librera les lectrons haute nergie. Transfert dlectrons lorigine de la production dATP au travers des ATP synthases. La respiration des cellules eucaryotes animales tapes 1 et 2 :

L actyle coenzyme A est produit dans la matrice. Il existe 2 grandes voies mtaboliques de production dactyle : A partir du pyruvate : cette convertion du pyruvate en actyle produit du NADH et du CO2. A partir dAG courte chaine carbone : cette convertion consiste en une oxydation s des acides gras en prsence dO2. On parle de -oxydation (=hlice de lynen). Cette convertion gnre du FADH et du NADH. Le pyruvate provient du cytosol, il transite par la membrane externe grce aux porines. Il provient de la convertion du glucose via la glycolise. Les AG courte chaine carbone sont produits par les peroxysomes. Cycle de Krebs : mtabolisme oxydatif propre aux mitochondries. Il libre du pouvoir rducteur (FADH2, NADH) et du CO2.

La respiration des cellules eucaryotes animales tapes 3 et 4 :

Dans la matrice lors des tapes 3 et 4, il y a production de pouvoir rducteur qui va tre oxyd. Suite cette oxydation, le pouvoir rducteur va cder ses 2 lectrons haute nergie lubiquinone. Ceci se fait grce lintervention des complexes enzymatique I et II. Les formes oxydes vont tre rutilises dans la matrice pour produire nouveau du pouvoir rducteur.

Ces diffrents complexes vont catalyser des ractions doxydorduction qui engendrent un transfert dlectron qui jusqu lO2 sous forme soluble qui se trouve dans la matrice mitochondriale. On dit que lO2 intervient en tant quaccepteur final dlectrons de la chaine respiratoire. Cette O2 va etre rduit en molcule deau que lon voit dans la raction globale. Au cours de ces diffrentes ractions doxydorductions sur la membrane interne dun complexe lautre,les lectrons perdent une partie de leur nergie au niveau des complexes II, III et IV. Ces complexes utilisent cette nergie pour transfrer des protons de la matrice vers lespace intermembranaire. Il se met alors en place un gradient de protons (dsquilibre des concentrations de part et dautre de la membrane interne. Ce gradient de protons est une condition indispensable au fonctionnement des complexes ATP synthase. Une partie des protons de lespace intermembanaire retourne dans la matrice en empruntant les complexes ATP synthase et une partie de lnergie de ces protons est capte par ces complexes ce qui permet ltablissement dune liaison de forte nergie entre lADP et le phosphate inorganique afin de produire la molcule dATP dans la matrice. LATP est ensuite transfr dans le cytosol pour servir au mtabolisme cellulaire gnral. 5 Origine, multiplication et mort des mitochondries. Origine : Thorie endosymbiotique (Merechkovski 1905 les mitochondries sont des organites procaryotes vivants en symbiose dans les cellules eucaryotes) En ralit, les mitochondries drivent lorigne d-protobactries arobie. Cette bactrie est entr dans une autre cellule et au cours de lvolution, ces bactries se sont transformes en mitochondries. Preuve : ADN circulaire double brins semblable celui dune bactrie. Expression de linformation gntique de faon indpendant celle du noyau. Multiplication de faon indpendante du noyau. Double membrane :

Processus dendosymbiose Organite semi autonome. Multiplication : Division de mitochondries existantes Mort : Autophagie grce aux lysosome. Turn over : renouvellement cytoplasmique. Lorsquune mitochondrie fonctionne mal ou est endommage,elle entraine la mort cellulaire.