IRRI’s Mission Statement

 
Mission
To reduce poverty and hunger, improve the health of rice farmers and consumers, and ensure 
environmental sustainability through collaborative research, partnerships, and strengthening of 
national agricultural research and extension systems. 

Goals
1.  Reduce poverty through improved and diversified rice‐based systems 
2.  Ensure that rice production is sustainable and stable, has minimal negative  
environmental impact, and can cope with climate change 
3.  Improve the nutrition and health of poor rice consumers and rice farmers 
4.  Provide equitable access to information and knowledge on rice and help develop the next 
generation of rice scientists 
5.  Provide rice scientists and producers with the genetic information and material they need 
to develop improved technologies and enhance rice production 
 
Strategy
IRRI pursues its mission and goals through 
• interdisciplinary thematic and system‐based programs 
• scientific strength in major disciplines for rice research 
• anticipatory research initiatives exploring new scientific opportunities 
• conservation and responsible use of natural resources, including rice genetic resources 
• sharing of germplasm, technologies, and knowledge 
• participation of women in research and development 
• partnership with farming communities, research institutions, and other organizations that 
share IRRI’s mission 
• continued efforts in improving staff development and welfare 
 
Values
IRRI’s actions are guided by a commitment to 
• excellence 
• scientific integrity and accountability 
• innovation and creativity 
• gender consciousness 
• diversity of opinion and approach 
• teamwork and partnership 
• service to clients 
• cultural diversity 
• indigenous knowledge 
• environmental protection 
 
 Table of Contents
 
MTP OVERVIEW  1
Introduction 3
Achievement highlights in 2005 4
Update on the IRRI 6th EPMR 8
Highlights of the 2007 program portfolio—IRRI’s new role 17
IRRI’s new programs  18
Frontier Projects  19
Research divisions and centers for scientific excellence  19
Capacity building  20
Partnerships  20
IRRI‐CIMMYT Alliance  21
IRRI‐WARDA collaboration  22
IRRI‐CIAT collaboration  23
Challenge Programs  23
IRRI financial indicators 23
 
2007 PROGRAM PORTFOLIO  27
1. Raising productivity in rainfed environments: attacking 29
the roots of poverty.
2. Sustaining productivity in intensive rice-based systems: 42
rice and the environment.
3. East and southern Africa: rice for rural incomes and an 55
affordable urban staple.
4. Rice and human health: overcoming the consequences of 61
poverty.
5. Rice genetic diversity and discovery: meeting the needs 68
of future generations for rice genetic resources.
6. Information and communication: convening a global rice 80
research community.
7. Rice policy support and impact assessment for rice 89
research.
 
FINANCIAL PLAN  99
 
Annex1. IRRI’s key collaborators and partners 143
 
 
  

IRRI MTP OVERVIEW

1
  
 
 
 
 
 
MTP OVERVIEW 
Introduction
Achievement highlights in 2005
Update on the IRRI 6th EPMR
Highlights of the 2007 program portfolio—IRRI’s new role
IRRI’s new programs 
Frontier Projects 
Research divisions and centers for scientific excellence 
Capacity building 
Partnerships 
IRRI‐CIMMYT Alliance 
IRRI‐WARDA collaboration 
IRRI‐CIAT collaboration 
Challenge Programs 
IRRI financial indicators
 

2
  

INTERNATIONAL RICE RESEARCH INSTITUTE 
Medium‐Term Plan 2007‐2009 
Bringing hope, improving lives 
Introduction
Over the last decade, the world has experienced three interlinked scientific and technological 
revolutions unlike any other in such a short time span. First, the revolution in molecular biology 
and genetics is yielding insights, only dreamed of a decade ago, into the functioning and nature 
of organisms. Second is the revolution in data storage and computational power to handle the 
vast amounts of data these discoveries entail. Third, the communications revolution allows 
exchange of, access to, and distributed analysis of nearly unimaginably large and complex data 
sets. These rapid advances are revolutionizing all aspects of rice science. How well the fruits of 
technology are used will determine to a large extent the fate of rice production—the main global 
agricultural undertaking. 
 
Meanwhile, the physical environment—including the agroecosystems in which IRRI works—is 
changing. It is now realized that climate change is not some vague future problem. It is already 
damaging the planet at an alarming pace. Further, the institutional environment (IRRI’s partners 
in advanced and national research institutions) and population concerns (the demography of 
poverty and hunger) are changing also. 
 
Under that changing situation, agricultural policymakers in developing countries are facing three 
challenges simultaneously 
• to reduce poverty and increase farm income, 
• to assure household food security, and  
• to rehabilitate and conserve the countries’ natural resources.  
 
IRRI’s new strategic plan for the period 2007–2015, Bringing Hope, Improving Lives, looks at the 
implications for rice production of these changing environments, in the context of the Millennium 
Development Goals (MDGs). It embraces the scientific and technological revolutions that have 
made available opportunities that were unimaginable a decade ago when IRRI developed its 
strategic plan IRRI Toward 2020. It also recognizes that advances in these areas alone are 
necessary but insufficient to solve the enormous problems and challenges that face the world 
today. Solving these problems requires not only creative applications of science and technology 
but also appropriate policies and social interventions. 
 
Based on the careful analyses of the changes in the external environments, challenges and 
opportunities, the CGIAR System Priorities, and IRRI’s comparative advantage and the resource 
base, the new strategic plan elaborates five goals:  
Goal 1.  Reduce poverty through improved and diversified rice‐based systems. 
Goal 2.  Ensure that rice production is sustainable and stable, has minimal environmental impact, and 
can cope with climate change. 
Goal 3.  Improve the nutrition and health of poor rice consumers and rice farmers. 
Goal 4.  Provide equitable access to information and knowledge on rice and help develop the next 
generation of rice scientists. 

IRRI Overview  3
  

Goal 5.  Provide rice scientists and producers with the genetic information and material they need to 
develop improved technologies and enhance rice production. 
 
IRRI’s special role in linking advances in science with the real‐world problems of poor rice 
farmers and consumers means that scientists doing cutting‐edge research in advanced 
laboratories look to IRRI as the link for translating and applying their technologies to achieve 
development impact, while scientists and development experts in the NARES look to IRRI as a 
provider of appropriate technology for solving intractable agricultural problems. IRRI benefits 
from a dynamic balance among disciplines and from strength in both upstream and downstream 
research. IRRI’s new programs are described on page 16 of this Medium‐Term Plan, and they 
represent a major restructuring from the current (2006) research portfolio. 
 
 
Achievement highlights in 2005
IRRI made strong progress in 2005 in a broad range of research that has contributed—and will 
contribute further—to achieving the Millennium Development Goals, especially Goal 1, the 
eradication of extreme poverty and hunger, and Goal 7, achieving environmental sustainability. 
IRRI’s role in these challenges has been further boosted by the Institute stepping up its research 
on rice grain quality and nutrition and so advancing the fight against the hidden hunger of 
nutrient deficiency that plagues much of the rice‐eating world. 
 
IRRI consolidated its research and related activities into 11 projects under its four programs—(1) 
Genetic resources conservation, evaluation, and gene discovery; (2) Enhancing productivity and 
sustainability of favorable environments; (3) Improving productivity and livelihood for fragile 
environments; and (4) Strengthening linkages between research and development. The work was guided 
by and implemented through two research consortia—the Irrigated Rice Research Consortium 
and the Consortium for Unfavorable Rice Environments—that bring together IRRI scientists and 
their colleagues from the Institute’s partner NARES. 
 
Discovering and preserving the secrets of the rice genome. At the end of 2005, IRRI’s International Rice 
Genebank held almost 109,000 accessions following the addition of some 2,500 new samples 
throughout the year. Three thousand cultivated and 550 wild accessions underwent seed 
replenishment and we tested the viability of more than 19,000 accessions in the active collection. 
In line with IRRI’s growing focus on nutritionally enriched rice, work began on the identification 
of micronutrient‐dense rice varieties, and we are currently examining some 1,400 accessions 
whose micronutrient content will be measured. Three hundred nursery sets were assembled and 
distributed to 30 countries through the International Network for Genetic Evaluation of Rice. 
Work also continued on pinpointing genes that influence important traits, such as tolerance of 
drought stress. The International Rice Information System, which facilitates management of data 
and information on genetic resources and rice cultivars, was further developed.  
 
IRRI’s development of genetic resources for rice research fared well in 2005, boosted by the 
publication by the International Rice Genome Sequencing Project of the finalized sequence of the 
rice genome. We identified several segments of the rice genome that significantly contribute to 
disease resistance, and used these to produce good parents for breeding varieties resistant to rice 
blast. With Chinese collaborators, this has already led to the development of a commercial hybrid 
variety in China. With Japanese partners, we identified a small region of the rice genome that 
may harbor candidate tungro resistance genes, as well as candidate genes for resistance to rice 

4 IRRI Overview 
  

stripe virus. Good progress was made in identifying genes that confer tolerance of phosphorus‐
deficient soil, submergence, and salt, taking us closer to the ultimate goal of developing high‐
yielding varieties that do well under these stresses.  
 
Making rice production even better. In 2005, we identified and used in breeding programs many 
genetic lines suitable for direct seeding and for growing under alternate wetting‐and‐drying 
irrigation conditions. These will allow us to develop elite lines suitable for these water‐saving 
crop management strategies. Work progressed toward the development of breeding lines and 
varieties resistant to pests and diseases, including stem borer, sheath blight, brown planthopper, 
bacterial blight, and tungro. We identified lines for high iron and zinc content in polished rice 
grains, and a breeding program has begun. Several elite hybrid rice lines with good grain quality 
were developed and shared with NARES. We also developed and improved on crop and nursery 
management strategies for hybrid varieties. 
 
Realizing the importance of japonica rice in temperate as well as high altitude regions of some 
tropical countries, in 2005 we identified a new resistance gene Bph18 for brown planthopper 
(BPH). We made progress toward developing advanced breeding lines possessing this gene using 
molecular and conventional breeding technologies with the intention of sharing them with 
China, Japan, Korea, and Vietnam where serious BPH outbreaks occurred in 2005. We also 
identified new genes and gene combinations to provide resistance against virulent pathotypes of 
blast and bacterial blight diseases and tolerance to low temperature. Work progressed well for 
the development of elite lines for these stresses. 
 
IRRI has developed a framework for the integrated management of nutrients, the crop, and 
water, which is aimed at increasing input‐use efficiency in intensive rice systems. Work 
continued on site‐specific nutrient management—the practice of tailoring fertilizer use for 
individual fields and seasons—which is now well developed for rice. As part of an effort to offer 
alternatives to burning crop residue (which destroys vegetative matter that could benefit the soil 
and the succeeding crop), we evaluated alternative residue management practices and their 
effects on soil fertility and crop production. 
 
The entertainment education approach to motivating farmers to improve their crop management 
practices saw continued success with the ongoing campaign to reduce insecticide use in the 
Mekong Basin. Following the launch of the Environmental Soap Opera for Rural Vietnam, 
farmers in Vietnam’s Vinh Long Province reduced their insecticide applications by 38%. Research 
also continued on the effectiveness of interplanting rows of traditional and modern rice varieties 
as a protection against pests and diseases, with promising results, including an option that can 
improve yield and increase production of a Philippine traditional variety. We characterized pest 
ecology in a range of ecosystems to help determine how plant resistance and natural enemies 
may interact in controlling pest populations. In 2005, we assessed different cultivars’ natural 
ability to suppress weeds, identifying differences in early vigor and competitiveness. The 
information will be used to develop decision tools for farmers and to guide the application of 
crop management options. 
 
IRRI’s investigation of ways to improve yields and sustainability of the important rice‐wheat 
cropping system in the Indo‐Gangetic Plains of South Asia focused in 2005 on an integrated 
system incorporating tillage, nutrients, weed management, and water use in the rice crop. New 
options and technologies, such as direct seeding using a drum seeder, can in some areas reduce 

IRRI Overview  5
  

the cost of cultivation and save water. Several resource‐saving technologies and strategies, 
including zero‐tillage, laser leveling, dry direct seeding, bed planting, residue management, and 
weed management, led to an increase in farmers’ income and showed good potential for 
widespread adoption. In India, we evaluated the effects of direct‐seeding practices on weed 
species composition and weed management and will use the information to help guide weed 
management options.  
 
Research continued on the development of several water‐saving technologies, including aerobic 
rice, which can grow in conditions too dry for commonly grown modern varieties and which is 
useful when rice fields cannot be flooded at all. In some water‐scarce conditions, alternate 
wetting and drying can reduce water use by up to 20% without affecting yield. 
 
Helping the neediest. IRRI distributed several improved drought‐tolerant materials to NARES 
scientists in 2005, including breeding lines for the rainfed lowlands and varieties for upland rice 
farming. Five varieties confirmed to have tolerance of moderate lowland stress at the 
reproductive stage outyielded two popular modern varieties (IR64 and IR72) by more than 50% 
under drought conditions. These drought‐tolerant varieties have the potential to improve yield 
stability and overall productivity in drought‐prone upper fields.  
 
We developed high‐yielding aerobic rice varieties with yield potential of over 5 t ha‐1 under 
moderate drought stress. Improved aerobic rice varieties were demonstrated to be more weed‐
competitive than traditional upland varieties in northern Lao PDR. We are developing cultivars 
that require only one hand‐weeding to produce acceptable yields.  
 
We also observed that hybrid rice varieties can be more drought tolerant, on average, than 
related inbred varieties, raising the possibility that hybrids can make an important contribution 
to productivity in drought‐prone environments. Progress was made toward introducing the 
newly identified submergence tolerance sub1 gene into the popular Swarna variety, with the aim 
of developing a high‐quality cultivar that can withstand excessive flooding. Hybrids, which 
perform well under low‐input management and tend to be more effective at using available soil 
nitrogen, could provide rainfed lowland farmers with improved yields.  
 
We introduced wild rice genes for tolerance of soil acidity and iron toxicity into five breeding 
lines, which will be used to breed varieties that grow well in toxic soils. One line, bred for 
tolerance of acid sulfate conditions, is already performing well in farmers’ fields in the Mekong 
Delta. Several genes that help defend against rice blast were identified and advanced lines 
carrying favorable combinations of these genes showed around 90% disease reduction in blast 
nursery trials in the Philippines. 
 
IRRI continues to integrate effective, low‐cost methods of plant varietal selection into breeding 
programs, which allow farmers to select the best genotypes under their own management 
practices and provide feedback to researchers on farmers’ varietal preferences and experiences. 
 
We analyzed the drought‐coping mechanisms of rice farmers and investigated the implications 
for research and policy. One study indicated that, in three states in eastern India alone, nearly 13 
million people are pushed into poverty during drought years and economic losses are around 
US$400 million per year. Improved rice technologies and policies for promoting income 
diversification are vital if the poverty impact of drought is to be reduced. Research on increasing 

6 IRRI Overview 
  

cropping intensity by growing nonrice crops that use less water in rice‐based agricultural 
systems will allow dry‐season cultivation of more areas with limited water availability. 
 
Crop intensification strategies were developed for coastal and inland salt‐affected areas. One 
strategy, double cropping of rice using water stored in the canals used to irrigate crops in the dry 
season, shows promise in Bangladesh. We examined integrated crop and resource management 
strategies designed to stabilize rice yields and intensify cropping in salt‐affected areas. Modern 
salt‐tolerant rice varieties were successfully tested in the rainy season and accepted by farmers in 
Bangladesh.  
 
Improved strategies were developed for shrimp and fish cultivation in rice‐shrimp and rice‐fish 
systems in Vietnam and Bangladesh, resulting in increased water‐use efficiency and use of land 
that was either underused or left barren in the past.  
 
In eastern India, we tested a flexible integrated cropping system that allows farmers to select 
management options suitable for the biophysical constraints of their land and their household’s 
socioeconomic conditions. Adopting the best site‐specific solutions has the potential to increase 
yields by 0.5–1.5 t ha‐1 over existing practices, while at the same time increasing the possibility of 
a postrice crop of chickpea.  
 
An economic analysis was made of farmers’ cropping practices and livelihood strategies, along 
with the socioeconomics of improved cropping system technologies, for sloping upland systems 
of Lao PDR. Several economically viable cropping systems are now being validated under 
farmers’ field conditions. Improved cropping systems developed and tested in Cambodia 
resulted in improved rice yields and profits.  
 
Reaching out, having impact. Assessments of food security for Indonesia, Thailand, and Bangladesh 
have given us a good understanding of the factors affecting food production, trade, and 
consumption, and the consequent impact on household‐level food security as well as what is 
required to improve income‐earning capacity.  
 
Research on gender roles on rice farms in the face of the migration of males to urban areas 
emphasized the need for labor‐saving technologies that help women better manage the farm and 
the need for technology, information, and training targeted toward women.  
 
Biophysical factors of farm households, such as field hydrology, appear to be more important 
than socioeconomic factors in farmers’ choices of rice technologies. This finding will guide the 
development of useful technologies that have the best chance of being adopted. A package of 
improved technologies that allow farmers to relay‐crop sugarcane and rice will help Bangladeshi 
farmers increase the productivity of their land. 
 
Analysis of the impact of rice varieties biofortified with iron and zinc indicated that this approach 
is a cost‐effective and sustainable way to improve the nutritional status of iron‐ and zinc‐deficient 
people. 
 
Field testing of hermetic storage systems contributed to better postharvest management, which 
can help prevent spoilage and pest infestation. This system is being adapted to local conditions in 

IRRI Overview  7
  

several countries. The hermetically sealed bags can also be used for maize, coffee, pulses, and 
peanuts. Local manufacture is already under way in Indonesia.  
 
IRRI continued its strong training program, presenting courses on a wide range of topics, 
including site‐specific nutrient management, participatory research and extension, rice 
production, and scientific writing. Postharvest training modules, including fact sheets, reference 
manuals, and teaching plans, were developed and posted on IRRI’s Rice Knowledge Bank and 
made available on CD. A local language training and up‐scaling manual on integrated crop 
management is now available for extension workers and crop production officers in Timor‐Leste, 
who can use the manual for training and supporting Timorese farmers.  
 
 
Update on the IRRI 6th EPMR
1. The Panel recommends that IRRI stimulate the global community to establish gene‐trait linkages in 
carefully selected germplasm in a targeted way, as rapidly as possible, for purposes of plant 
improvement, making results available to all. IRRI should report to the Board of Trustees by April 
2005 on its progress in implementing this initiative with its partners. 
 
  April 2005 update:  April 2006 update: 
Milestone:  An international consortium established to   
provide a public resource platform and 
broaden access to genetic resources and 
genomic technologies. 
Progress:  The IRFGC was formed in 2003  Ongoing 
(www.iris.irri.org/IRFGC) with IRRI as the 
coordinator. The first collective paper on rice 
mutant resource involving 12 laboratories 
around the world was published (Hirochika 
et al. 2004. Plant Mol. Biol. 54:325‐334). 
Completion:  2010   Ongoing 
Progress:  The Consortium is implemented through a  The first phase of the IRRI‐USAID Linkage 
“federal” system of coordination and  Program (2 years) has produced results that 
collaboration. As of 2004, at least 14 projects  enable IRRI and its partners to expand their 
subscribe and contribute to the objectives of  research scope by linking basic research to 
IRFGC. These projects include seven funded  practical applications. Key results include i) 
by the IRRI‐USAID Linkage Program, two  functional validation of genes for 
(Mutant Characterization and SNP Initiative)  submergence tolerance, ii) identification of 
by the Generation Challenge Program, and  genes in ubiquitination pathway for disease 
four (TILLING, Disease Mutant Gene  resistance, iii) new candidate genes for 
Expression, Microarray‐based Mapping,  salinity tolerance, and iv) understanding of 
Small RNA) by the USDA NRI competitive  the antagonistic relationship between biotic 
grant program.   and abiotic stress tolerance. It is 
noteworthy that the USDA‐funded project 
on Microarray‐based mapping has developed 
genome‐wide, low‐cost genotyping 
technique that can be implemented at IRRI 
and potentially at other NARES research 
centers as well.  
Completion:  2006–08 (most projects have 2–3 years  Ongoing 
duration) 

8 IRRI Overview 
  

Progress:  In addition, under the umbrella of IRFGC,  Two national workshops were conducted 

IRRI facilitated the formation of a national  in Indonesia to consider possible models of 
rice functional genomics program in India  initiating a national network to apply 
with support from the Department of  functional genomics. This consultation 
Biotechnology and the Indian Council of  process will be continued in the latter part 
Agricultural Research. Similar effort of  of 2006. A similar effort will be pursued in 
facilitation is being pursued in Indonesia.  Vietnam in late 2006. 
Completion:  2006  Ongoing 
Progress:  IRRI initiated a SNP discovery project with  This initiative has leveraged support from 
Perlegen Sciences to conduct comprehensive  the USDA competitive grant program to 
SNP analysis of multiple rice varieties. IRRI  support the SNP discovery component (in 
invested strategic research funds and  part) and phenotyping of selected traits. As 
leveraged support from the Generation  of May 2006, Perlegen Sciences has 
Challenge Program to re‐sequence 15 to 20  evaluated pilot DNA samples provided by 
diverse accessions to create a public SNP  IRRI, whereas IRRI has prepared the 
database. The SNP initiative has mobilized  sequence assembly (masking repetitive 
the rice research community to contribute  elements) for chip preparation by Perlegen. 
funds (through proposal development) and  IRRI will send DNA of varieties by mid‐
expertise to expand the project.  May to Perlegen Sciences for hybridization 
analysis.  
 
To mobilize the research community to 
participate in this initiative, a commentary 
on Sequencing multiple and diverse rice 
varieties: connecting whole‐genome variation 
with phenotypes will be published in Plant 
Physiology, Vol. 141 (May issue, 2006). 
Completion:  2006  We expect the first set of SNP data by the 
end of 2006.  
Milestone:  Fifth International Rice Genetics Symposium  Fourth International Rice Functional 
and Third International Rice Functional  Genomics Symposium to be held October 
Genomics Symposium.  9–11 in Montpellier. 
Progress:  IRRI will host both symposia in Manila  IRRI representatives participated in 
during November 19–23, where we expect  program planning. More than 700 attended. 
over 500 of the world’s prominent rice and 
plant geneticists to assemble to discuss 
international collaboration following the 
complete sequencing of the rice genome 
(http://www.irri.org/rg5/). 
Completion:  2005  2006 

2. The Panel recommends that IRRI link the work currently carried out in Project 5 with the challenge of 
achieving higher yields in the most intensive production systems in the context of diminishing water 
supplies. Further, IRRI should extend its modeling and GIS research to optimize water‐saving 
technologies at the irrigation scheme level to provide options for water allocation. 
 
  April 2005 update:  April 2006 update: 
Milestone:  Physiology of and breeding/selection of   
cultivars that have high yield potentials and 
do well under water‐limited conditions. 

IRRI Overview  9
  

Progress:  We have identified three varieties (Apo,  Aerobic rice. Elite aerobic rice breeding lines 

Magat, and UPLRI‐5.7) that yield 6 t ha‐1 for  and cultivars with a high level of tolerance 
aerobic conditions in the Philippines.  of soil health problems in light‐textured 
Variety PBRc80 yields as high as IR72 (a  soils (IR78877‐208 and CT6510‐24‐1‐2) were 
high‐yield lowland rice variety) in flooded  selected. Many lines with aerobic yield 
conditions and has stable yield under  potential equivalent to that of elite aerobic 
aerobic conditions or under alternate  rice variety Apo but 7–10 days shorter in 
wetting‐and‐drying irrigation. Studies on  duration have been developed and 
the physiology of this high‐performance  disseminated to NARES in India, Laos, and 
germplasm are being undertaken.  the Philippines. 
 
Alternate wetting and drying. Hybrid 
cultivars, notably IR80228H and IR77843H, 
were shown to consistently outyield pure 
lines, on average, in irrigation regimes in 
which paddies were drained at flowering, 
combining high yield potential with 
superior performance under restricted 
irrigation. Hybrids appear to be a very 
promising approach to increasing rice 
water‐use efficiency. Several pure lines 
performed relatively well under the AWD 
regime, including IR77080‐B‐34‐1‐1 and 
IR77080‐B‐34‐1‐3, but yielded about 20% less 
than the best hybrids under both stress and 
nonstress conditions. 
Completion:  2007   
Milestone:  Methodology for modeling and GIS to   
analyze water‐saving scenarios and their 
effect on system‐level hydrology and water 
allocation. 
Progress:  We have used ORYZA2000 to explore  Together with CSIRO (Australia) and IWMI, 
different water‐saving options for rice  we presented several papers describing the 
cultivation in two irrigation systems in  methodology for modeling and GIS to 
China. The outputs from ORYZA2000 were  analyze water‐saving scenarios and their 
linked to a GIS‐based regional hydrology  effect on system‐level hydrology and water 
model (from CSIRO, Australia) of the whole  allocation at the International Commission 
irrigation systems to identify the impact of  on Irrigation and Drainage (ICID) congress 
water savings on system water balance  in September 2005 in Beijing. Using the 
components. We are in the process of using  outputs of the models for two irrigation 
the models to have dialogues with system  systems, we organized a high‐level dialogue 
managers and water resource policymakers  with national water resource policymakers 
in the two systems to study different  and system managers to recommend water‐
scenarios of water allocation.  saving options and policies of water 
allocation. We highlighted that the on‐farm 
water savings (such as alternate wetting‐
and‐drying irrigation, AWD) must be 
integrated with subsystem‐ or system‐level 
intervention. For example, in the Zhanghe 
Irrigation System, ZIS, management of local 
storages (ponds) will provide an essential 
support for AWD. In the Liuyuankou 

10 IRRI Overview 
  

Irrigation System, AWD helps reduce the 
recharge to the groundwater and 
conjunctive use of groundwater and surface 
water is essential in reducing nonbeneficial 
evaporation from shallow groundwater.  
 
A recent report from the Ministry of Water 
Resources in China showed that AWD has 
been adopted more widely in China. Our 
recommendations have been adopted in the 
11th‐five‐year planning for modernization 
and rehabilitation of irrigation systems in 
Henan, aiming at integrated surfacewater 
and groundwater management, so that 
surface water from the Yellow River can be 
sent downstream of the systems. 
Completion:  2006   
 
3. The Panel recommends that IRRI include the results of ex ante impact studies in unfavorable 
environments in its priority‐setting exercises. The existing evidence indicates that less emphasis 
should be placed on uplands with low production potential and more emphasis is needed on rice‐based 
cropping systems along the toposequence and favorable nonflooded rice systems. 
 
  April 2005 update:  April 2006 update: 
Milestone:  Ex ante analysis of impact of research   
investments in uplands and lowlands. 
Progress:  This analysis is included in the agenda of  An initial analysis of the potential for 
IRRI’s strategic planning to be held in 2005.  impact in uplands was conducted and 
reported in the IRRI upland strategy paper 
prepared in 2005. The paper analyzed the 
extent of poverty and household food 
insecurity in the uplands, the total area 
under upland rice‐based systems and the 
number of people dependent on uplands for 
their livelihoods, the technologies currently 
available and those in the pipeline, and the 
importance of rice productivity growth in 
uplands in facilitating the process of income 
and environmental protection. It was 
concluded that investment in rice research 
in uplands undertaken within the concept of 
landscape management could generate 
substantial impact on poverty reduction and 
environmental protection.  
 
An independent external review of IRRI’s 
upland research commissioned by the 
Science Council in late 2005 conducted 
further analysis and concluded that rice 
research in uplands has good potential for 
making considerable impact on poverty 
reduction and environmental protection. 

IRRI Overview  11
  

The review recommended that IRRI should 
stay involved in rice research in uplands. 
 
We plan to undertake in 2007 an ex ante 
impact assessment for estimating returns 
from investments in rice research in uplands 
vis‐à‐vis drought‐prone and submergence‐
prone lowlands, taking into account 
investments made, technologies in the 
pipeline, extrapolation domains of the 
technologies, expected time pattern of 
adoption, and their effect on reducing the 
unit cost of production. 
Completion:  April 2006  2007 
 
4. The Panel recommends that activities on ‘Constraints to adoption of improved rice technologies 
assessed’ in Project 10 and the entire Project 11 be transferred to Programs 2 and 3, while the rest of 
the activities in Project 10 be done in a new stand‐alone Project, with Program 4 being dissolved. 
 
  April 2005 update:  April 2006 update: 
Milestone:  Transfer of Project 11 to Program 3.   
Progress:  Project 11 was amalgamated with Project 8  Accomplished, no update needed. 
of Program 3 at the start of 2005. 
Completion:  Accomplished.   
Milestone:  Relocation of Projects 10 and 12, and   
determination of the need/dissolution of 
Program 4. 
Progress:  Analysis of this is included in the agenda of  In the MTP 2007–2009, activities related to 
IRRI’s strategic planning to be held in 2005  Project 10 will be included in a new 
and the subsequent development of a new  Program 7, Rice policy support and impact 
MTP.  assessment for rice research. This program 
includes the analysis of broader trends in 
the rice sector to serve as the basis for 
research prioritization. It also includes the 
analysis of farmer livelihoods for 
underpinning technology development and 
impact assessment. In addition, broader 
methodology development for facilitating 
rapid diffusion and dissemination of 
improved technologies is included in the 
program. Analyses of constraints to 
adoption have been moved to new 
Programs 1 and 2. Activities related to 
information dissemination (part of the 
current Project 12) have been moved to new 
Program 6 (Information and communication: 
convening a global rice research community). 
Completion:  April 2006  For implementation in January 2007 
 

12 IRRI Overview 
  

5. The Panel recommends that IRRI establish a forum of rice‐growing countries with the purpose of 
financing and revitalizing INGER. 
 
  April 2005 update:  April 2006 update: 
Milestone:  IPR training‐workshop and Technical   
Advisory Committee (TAC) meeting 
conducted. 
Progress:  IPR training‐workshop conducted jointly  IPR training‐workshop using the IRRI‐
with UPOV. Regional cooperation on DUST  INGER edition of the IPGRI‐ISNAR training 
established. New mode of sharing  module conducted in 2005. International 
germplasm and linking with other projects  Nursery of Example Varieties for DUST 
discussed in the TAC meeting.  organized for distribution in 2006. 
Completion:  2004  Ongoing 
Milestone:  Formation of regional INGER clusters.   
Progress:  For discussion in the CORRA meeting in  CORRA endorsed i) the formation of 
2005.  INGER clusters, ii) the use of the 
International Treaty on Plant Genetic 
Resources for Food and Agriculture’s 
Standard MTA when it becomes available 
for all INGER distributed germplasm, and 
iii) the conservation of highlighted INGER 
materials in the International Rice 
Genebank at IRRI. 
Completion:  CORRA monitoring/review of INGER is a  CORRA monitoring/review of INGER is a 
continuing activity.  continuing activity. 
Milestone:  Regional meetings and training—INGER   
East Asia, INGER Southeast Asia, INGER 
South Asia, INGER Central Asia. 
Progress:  INGER East Asia Exploratory meeting  Germplasm for INGER East Asia sent to 
conducted in 2005. Other INGER regional  northern China and a group meeting to be 
clusters discussed in 2005 TAC meeting.  held in August 2006. Formation of INGER 
Central Asia to be explored in 2006. 
Completion:  To be started in 2006 (will be a continuing  Continuing 
activity). 
 
6. The Panel recommends that IRRI commission a study, based on the vision of IRRI’s role in 5–15 years, 
to assess the relative merits of the current model with some outreach activities, and the majority of 
scientists in headquarters, as compared with a model with increased outreach research staff in all those 
rice‐producing countries where close proximity and visible presence are deemed necessary. 
 
  April 2005 update:  April 2006 update: 
Milestones:  1. TOR developed and approved   
2. Committee members identified 
3. Review implemented and published 
4. Responses developed and presented to 
IRRI Management and Board 
5. Responses implemented 
Progress:  IRRI has moved quickly on this achieving  A plan has been developed to establish 
full completion of steps 1, 2, 3 and 4 and  three IRRI Regional Offices with IRS and 
partial completion of 5.  NRS staff. These will be Regional Offices for 
(1) the Greater Mekong Subregion to cover 

IRRI Overview  13
  

Vietnam, Cambodia, Laos, Thailand, 
Myanmar, and the Yunnan and Guangxi 
provinces of China; (2) South Asia, covering 
India, Bangladesh, Pakistan, Nepal, Sri 
Lanka, and Bhutan; and (3) East and 
southern Africa with priorities on Tanzania, 
Mozambique, Madagascar, Uganda, and 
Kenya. 
 
Dr. Gary Jahn was appointed as the 
Regional Representative for the GMS 
Regional Office and has been posted to 
Vientiane since July 2005. An IRS 
agronomist has been appointed and will be 
posted to Luang Prabang (Laos) in May 
2006. 
 
Dr. Glenn Gregorio, plant breeder, was 
posted to the WARDA research station at 
Ibadan, Nigeria, in January 2006. 
 
Mr. Joe Rickman, senior agricultural 
engineer and rice production specialist, will 
be posted to Dar es Salaam, Tanzania as the 
IRRI Regional Representative for the ESA 
region in September 2006.  
 
There will be 8 IRS researchers and/or 
regional representatives and 5 liaison 
scientists posted in the countries, 
representing 11% of the total IRS (122) of the 
Institute in April 2006.  
Completion:  December 2006   
 
7. The Panel recommends that, annually, the Nominating Committee develop a List of Trustee 
Competencies required by IRRI over the next 5 years and, on approval by the Board, develop its list of 
potential candidates accordingly. This list should also be a key input in the Board’s decision as to 
whether a second term should be offered to current trustees up for re‐election. Automatic second‐term 
election, even when there are no adverse circumstances suggesting otherwise, should not be the norm. 
 
  April 2005 update:  April 2006 update: 
Milestone:  Nominating Committee draft paper on   
trustee competencies for the next five years 
submitted for approval in September 2005 
Board meeting. 
Progress:  Nominating Committee draft paper was  A review of the profile of the IRRI Board of 
discussed in the Sept 2004 meeting of the  Trustees for the last five years was 
board. Refinements are being considered by  undertaken. In view of IRRI’s new strategic 
the committee.  plan, the trustee competencies should 
include bioinformatics, ICT, genetics/plant 
breeding, crop and soil science, crop 
protection, water/environmental science, 

14 IRRI Overview 
  

social science, governance, 
finance/management, and other related 
fields. Balance in geographical 
representation and gender will be 
considered. 
Completion:  April 2006   
 
8. The Panel recommends that IRRI provide all members of the Finance and Audit Committee with 
i. a monthly cash flow forecast for the ensuing 6 months; 
ii. monthly income and expenditure statements (with actual‐vs.‐budget comparisons and 
commentary); 
iii. quarterly reports on project costs and revenue— highlighting those where cost under‐/overruns 
exceed 10% and articulating what management is doing to resolve the issues; and  
iv. monthly reports on investment income compared to budgeted income.  
 
All Board members should receive this same information on a quarterly basis, and all these reports should 
be available to Board members within 20 days of the end of the reporting period. 
 
  April 2005 update:  April 2006 update: 
Progress:  As stated in IRRI’s response to this  Quarterly reports are still being issued to 
recommendation, the quarterly financial  the Board. 
report to the Board has been enhanced to 
include the additional items recommended 
by the Panel. The enhanced report is being 
issued as planned, four times a year. 
Completion:  Ongoing  Ongoing 
 
9. The  Panel  recommends  that  IRRI  develop  updated  Investment  Portfolio  Guidelines  that  cover  the 
broad spectrum of portfolio management guidelines typically addressed, including maturities; types of 
instruments; risk assessment, risk management, and reporting; benchmarking arrangements; currency 
hedging arrangements; and the risk and portfolio reporting procedures for the FAC and the Board, for 
the external and internal auditors, and for management.  
 
  April 2005 update:  April 2006 update: 
Progress:  A new investment policy has been  The policy guideline continues to be in use. 
approved by the Board after wide 
consultation. 
The final document was approved on April 
15, 2005. 
Completion:  Document is completed and is now in use.   
 
10. The Panel recommends that Programs 2 and 3 become the flagships of IRRI’s research effort, with 
strong and articulate leaders, who should prioritize and implement integrated research within their 
assigned ecosystems. They will be IRRI’s representatives in the Programs’ research consortia and will 
be the spokespersons for their respective Programs. The leaders have the following tasks:  
i. When setting priorities, they should evaluate alternative approaches to alleviating poverty 
problems in their ecosystems, and recommend changes to project structure as needed. 
ii. In implementing the research, they should control the GOC and FTE inputs, and thus may 
negotiate for human resources from all divisions as needed. 

IRRI Overview  15
  

iii. At particular milestones during or at the close of their research, they should sponsor studies of 
the impact of their work. 
 
  April 2005 update:  April 2006 update: 
Milestones:  1. Support and active participation by the   
member‐country NARES, indicated by 
new projects or initiatives funded by the 
NARES or contributions in kind. 
2. Continued or new support by donors to 
the consortia. 
3. Project review or impact assessment on the 
consortia as a whole or the component 
technologies or activities in the target 
countries. 
4. Clearly stated functions and 
responsibilities of the program leaders or 
the consortia coordinators in the context of 
IRRI’s new strategic plan and the new 
MTP, to be developed in early 2006. 
Progress:  Strong support and commitment received from  IRRI is implementing essentially the 
the member country NARES to the two  recommendation of the EPMR and establishing 
consortia in Programs 2 and 3 indicated  two Flagship programs under the new IRRI 
through the project development meetings and  strategic plan, which was endorsed by the IRRI 
the new proposals submitted to donors.  Board at its April 2006 meeting. The MTP 2007‐
  2009 under the new strategic plan will have 7 
New funding from SDC for IRRC under  Programs. Program 1, Raising productivity in 
Program 2 and from ADB for CURE under  rainfed environments: attacking the roots of 
Program 3 successfully achieved for four more  poverty, and Program 2, Sustaining productivity 
years (2005–08).  in intensive rice‐based systems: rice and the 
  environment, evolved from the earlier MTP 
The new strategic planning exercise is under  Programs 2 and 3, and will be the two Flagship 
way, which is expected to lead to a new  programs.  
Institute strategic plan and a new MTP.    
Under the revised IRRI research management 
matrix system to achieve the new strategic 
plan, the program leaders will be accountable 
for achieving the outputs and product delivery. 
They will be responsible for research planning, 
priority setting, budgeting, resource 
mobilization, project monitoring and 
evaluation, as well as team building and staff 
evaluation and motivation. This will be 
congruent to the EPMR recommendation.  
 
1. IRRI new strategic plan developed and 
endorsed by the IRRI Board. 
2. A revised and improved research 
management matrix system put in place 
with corresponding administrative and 
staff management policies and regulations 
developed at the Institute. 

16 IRRI Overview 
  

Completion:  IRRI new strategic plan and a new MTP will be  For 1 above, June 15, 2006 

developed by April 2006. Review and impact  For 2, December 2006 to March 2007 
assessment of the programs will occur in 2008. 
 
 
Highlights of the 2007 program portfolio—IRRI’s new role
The remaining problems facing poor rice farmers and consumers are becoming even more 
complex and less tractable. Solutions require more extensive and multidisciplinary research; 
more access to genetic resources; more and stronger partnerships with national systems, 
advanced research institutions, nongovernment organizations, and private industry; and more 
information about both farmers and consumers.  
 
IRRI must change markedly to meet these challenges and, to do so effectively, it will need new 
expertise. Given its limited resources, far less in real terms than in preceding decades, the 
Institute will have to sharpen the focus of its research lens to make a strong contribution to 
attaining the Millennium Development Goals. Some areas in which IRRI has invested heavily in 
the past such as conventional breeding for irrigated rice, site‐specific nutrient management, 
integrated pest management, and small‐scale agricultural machinery are now mature 
technologies in which NARES have significant expertise. IRRI will reduce its investments in these 
areas as suggested by the stakeholder survey. However, this shift in resource allocation will be 
carried out over a transition period so as not to jeopardize the advances made. 
 
A sharp focus on poverty reduction takes the Institute beyond its “historical” focal areas in rice 
production (increasing productivity or “filling the rice bowl”), which required a major focus on 
favorable irrigated areas, to “filling the purse,” a major effort to improve farmers’ incomes in 
unfavorable rainfed areas. This also means relatively less research emphasis in irrigated areas, 
while acknowledging that they must continue to receive research attention in order to protect the 
yield gains already made. 
 
The new needs and research opportunities to increase rice production in sub‐Saharan Africa are 
compelling reasons for IRRI to form partnerships there to make use of its accumulated experience 
in increasing farm productivity; yet, the Institute cannot afford to lessen its overall work in Asia, 
where most rice is grown and eaten.  
 
The reality of global climate change demands attention from IRRI because rice farming itself is 
changing, as well as being a potential agent of change. Managing these changes can also mitigate 
the effects of climate change. IRRI will have to shift its focus from general farming system and 
environmental concerns to those most closely associated with rice diversification and climate 
change in order to maintain the sustainability of rice‐based systems.  
 
New concerns and knowledge about health and nutrition have also now given IRRI the 
imperative to help make rice more nutritious and to minimize health problems in some areas 
associated with consuming and growing rice. 
 
The research opportunities for IRRI to meet these new challenges could hardly be more 
compelling. Increasing farmers’ incomes and consumers’ food security by improving and 
stabilizing crop yields in rainfed areas and bringing Asian rice research experience to bear in sub‐
Saharan Africa amount to spawning new green revolutions in these vast areas. IRRI can now 

IRRI Overview  17
  

accelerate the development of new varieties and cropping systems—both to maximize 
opportunities for diversification to stimulate the rural economy and to adapt to changing 
physical environments—by drawing on the new scientific and technological advances. At the 
same time, these advances can be used to find ways to mitigate the effects of rice farming on the 
environment. 
 
The Millennium Development Goals (MDGs) related to hunger, poverty, environmental 
sustainability, and nutrition and health form a sound basis and direction for IRRI’s future 
activities. Among the research and delivery themes in the Institute’s research agenda, guided by 
the Consultative Group on International Agricultural Research (CGIAR) system priorities, IRRI 
will give particular attention to addressing these MDGs by  
• contributing to poverty reduction of poor farmers, particularly women, in rainfed areas, 
through development of stress‐tolerant rice varieties for unfavorable conditions, and 
through improvement of rice varieties and rice‐based diversified cropping systems in 
Asia and sub‐Saharan Africa that generate additional on‐farm income while maintaining 
low production costs and prices for the urban and landless rural poor; 
• contributing to maintaining the sustainability of rice‐based systems, especially intensive 
irrigated systems, in the face of growing land and water shortages, a dynamic labor 
profile, and changing environmental conditions; and 
• improving the nutrition and health status of rice consumers and producers, especially 
women and children, by improving the nutrient content of rice, minimizing harmful 
contaminants, and reducing the incidence of water‐related diseases on rice farms.  
 
To assist it in these efforts, IRRI will 
• exploit the new information and communication technology to create a global, equitable 
forum for knowledge creation and sharing, and capacity building; and  
• enhance its capacity to respond to germplasm needs arising from changing and 
uncertain future environments.  
 
IRRI’s new programs. Today, IRRI conceptualizes its activities being conducted in programs with 
clear delivery mechanisms built upon a firm foundation of governance, management, support 
services, and scientific disciplines. This integration of support services, research programs, and 
delivery mechanisms is graphically illustrated in the conceptual framework in Figure 4.1 on page 
43 in the Strategic Plan 2007–2015. 
 
IRRI will implement its strategic plan through seven programs (“MTP Projects”) that will take 
effect in this Medium‐Term Plan 2007–2009: 
1. Raising productivity in rainfed environments: attacking the roots of poverty. 
2. Sustaining productivity in intensive rice‐based systems: rice and the environment. 
3. East and southern Africa: rice for rural incomes and an affordable urban staple. 
4. Rice and human health: overcoming the consequences of poverty. 
5. Rice genetic diversity and discovery: meeting the needs of future generations for rice genetic 
resources. 
6. Information and communication: convening a global rice research community. 
7. Rice policy support and impact assessment for rice research. 
 
The objectives and outputs of the programs are based on the five goals described in Chapter 3 
(pages 25–39) of the strategic plan, and a program may contribute to one or a number of goals. 

18 IRRI Overview 
  

These programs are product and impact oriented with clearly defined activity domains and time‐
bound targets and outputs. Each program may have a number of working teams to achieve one 
or a set of outputs. The programs will draw expertise and supporting staff from IRRI’s discipline‐
based research divisions and/or centers, and will ensure collaboration with advanced research 
institutes (ARIs) and NARES. The mechanisms for delivery and impact (the consortia and 
networks) are managed within the programs. 
 
Frontier Projects. Recent rapid advances in science and technology present a myriad of exciting 
possibilities in different scientific disciplines that could revolutionize rice farming. Some 
challenges with high potential payoffs also carry a degree of risk, and thus are not necessarily 
attainable, especially within the term of a strategic plan. So they will almost certainly continue 
beyond the life of the plan. IRRI has identified such research activities, with probability of 
development impact and where good science and collaboration can make a difference, in three 
areas—improving the photosynthetic efficiency of the rice plant, identifying and deploying 
drought tolerance genes, and designing rice farming management systems that do not contribute 
excessively to climate change, based on new rice varieties bred to withstand expected future 
environments. Each of the Frontier Projects will be carefully planned by teams of experts, and be 
evaluated periodically for acceptable progress. These projects will be undertaken by multi‐
institutional, international research teams. A significant part of the agenda is expected to be 
conducted at collaborating institutions in both developed and developing countries. 
 
Research divisions and centers for scientific excellence. Under the research management matrix 
per se, research outputs are achieved through implementation of the programs, while the 
discipline‐based research divisions and centers provide the technical infrastructure, 
administrative support, and coordination for professional growth and evaluation of the scientists. 
Scientists are housed in a division or center, and their time is allocated among different working 
teams according to the needs of the programs. Each scientist will participate in up to two 
programs. The divisions and centers also serve as a longer‐term platform for knowledge 
management, curation, and sharing, a focal point to establish and maintain links with other 
research institutions—particularly those conducting basic research—and a mechanism to 
facilitate efficient use and management of supporting staff with similar skills. To implement this 
plan, IRRI has restructured its research divisions and centers (from June 1, 2006) as follows: 
• Plant Breeding, Genetics, and Biotechnology Division (PBGB): rice genetics and plant 
breeding, hybrid rice, molecular biology, proteomics, rice genomics, wide hybridization, 
development and use of molecular markers, rice transformation and genetic engineering, 
plant pathology, and host‐plant disease resistance.  
• Crop and Environmental Sciences Division (CES): agronomy, crop ecology and modeling, 
soil science, water science and engineering, plant/crop physiology, weed science, insect 
and plant ecology, nematology, rodent research, and ecological pest management.  
• Social Sciences Division (SSD): agricultural economics, economics, policy analysis, 
sociology, gender analysis, impact assessment, and geographic information systems.  
• T.T. Chang Genetic Resources Center (GRC): plant genetics and molecular genetics, ex situ 
conservation of plant genetic resources, evolution ecology, rice taxonomy, international 
policy and legislation on genetic resources, and information and database management.  
• IRRI‐CIMMYT Crop Research Informatics Laboratory (CRIL): biometrics, bioinformatics, 
experimental design and data analysis, methodology development for statistical analysis 
and data management, molecular research data annotation, germplasm data curation, 
and database development. 

IRRI Overview  19
  

• Grain Quality, Nutrition, and Postharvest Center (GQNPC): cereal chemistry, analysis of 
physical quality of grain, grain sensory chemistry, micronutrient analysis, postharvest 
handling and processing, and rice grain value addition for enhanced marketing.  
 
To support IRRI’s global mandate, the Institute currently has offices in 14 countries and an 
International Programs Management Office (see Fig. 4.2 on page 45 of the strategic plan). 
Country offices and outpost staff play an indispensable role in representing IRRI’s interests by 
facilitating IRRI activities in the country, providing support to IRRI‐coordinated networks and 
consortia, communicating and promoting rice research and IRRI’s mission, identifying emerging 
issues and opportunities as well as NARES’ needs for training and information, and contributing 
directly to the research planning and initiatives of NARES. In January 2006, IRRI based a plant 
breeder with the Africa Rice Center (WARDA) at its Ibadan, Nigeria, location. During 2006, IRRI 
will establish a regional office for East and southern Africa, most likely in Tanzania. 
 
Capacity building. IRRI’s mandate includes strengthening the research capacity of the NARES. 
IRRI will promote and contribute to national and international efforts to develop the next 
generation of rice scientists and will endeavor to increase its capacity‐building activities for the 
NARES. In addition to the conventional degree programs and training courses, initiatives and 
tools will be developed and used, including 
• the Rice Knowledge Bank with country sites in local languages, and Web‐based self‐
learning, housed in Program 6; 
• a “shuttle scientist” program to enable mid‐career scientists to work with leading 
scientists during a critical period of their careers; and 
• focused hands‐on training for entry‐level students, particularly in the areas of rice 
genomics, molecular marker technologies, bioinformatics, plant physiology, modeling, 
and climate change. 
All future training activities at IRRI will be embedded in the programs and supported by the 
Training Center. 
 
Partnerships. Throughout the years, IRRI has developed close and strong partnerships with ARIs 
and Asian NARES. Collaboration and networks with the NARES in sub‐Saharan Africa will be 
revived through regional/subregional networks as well as the Future Harvest Alliance. Also, IRRI 
is developing increasingly sophisticated relationships with the private sector. Recognizing the 
continuing evolution of NARES and the variation in their research capacities and needs, IRRI will 
endeavor to develop and adapt modes of collaboration with these partners, for example, by 
• focusing on the mandate of developing international public goods to support the NARES 
to develop locally adapted technologies and solutions;  
• engaging in more equal‐role research projects with NARES; 
• fostering participation in IRRI programs by scientists from ARIs through staff 
secondment, scientific sabbaticals, a “shuttle scientist” program, and graduate student 
internships;  
• engaging farmers in germplasm improvement, crop and natural resource management, 
and gender research, particularly in rainfed environments; and 
• building global or regional platforms to increase information exchange and dialogue 
among NARES, ARIs, and the private sector, with an emphasis on enhancing NARES’ 
access to modern technologies.  
 

20 IRRI Overview 
  

IRRI‐CIMMYT Alliance. In January 2005, the Boards of Trustees of the two centers held a joint 
meeting in Shanghai and announced the establishment of the IRRI‐CIMMYT Alliance and a Joint 
Board Committee for the Alliance. The Joint Board Committee met in Amsterdam in July 2005 
and further defined the governance and the management mechanisms for the Alliance. Extensive 
discussions among the centers’ staff and consultation with partners and stakeholders resulted in 
an alliance program that facilitates close interaction in three thematic areas: intensive cropping 
systems in Asia, research informatics, and knowledge management and sharing for cereals 
production systems. The two centers will jointly develop and implement an Alliance project for 
each of these areas. Each project will have a unified budget and a project leader. Developing and 
strengthening this Alliance is an important element of IRRI’s strategy to enhance its value as a 
partner for science and development in Asia. The centers’ complementary scientific skills, capital 
resources, and networks are being focused jointly to address the three areas described below. 
Further synergies will be pursued once these projects become fully operational. 
 
Intensive cropping systems in Asia. There are over 30 million hectares of cereal crops in intensively 
cultivated farm lands across Asia that supply 80–90% of the cereals for Asia’s food needs. Asian 
farmers are rapidly adapting intensive, lowland, rice‐based agroecosystems to constraints, such 
as shrinking irrigation water supplies, but also to market opportunities, through diversification 
to crops such as maize. Traditional, commodity‐based research falls short of addressing emerging 
sustainability and socioeconomic concerns in this setting. This IRRI‐CIMMYT Alliance will apply 
new approaches and foster partnerships among international centers and NARES to address 
these concerns. IRRI’s Program 2 will be the core contributor to this work. Given the well‐
established activities for rice‐wheat systems within the Rice‐Wheat Consortium for the Indo‐
Gangetic Plains, efforts will focus initially on rice‐maize systems, to 
• assess the biophysical potential and feasibility of rice‐maize systems across the Asia 
region, and impact of introducing maize into intensive rice‐based systems on the 
environment and sustainability of the production systems; 
• develop and deploy resource management technologies for sustainably optimizing 
system productivity (and profitability) for rice‐maize and rice‐wheat—including value‐
adding options;  
• gain understanding of the characteristics of intensive rice‐maize systems—including 
drivers and modifiers of system change, livelihoods, and impact monitoring and 
forecasting; and 
• develop and deploy system‐tailored rice, wheat, and maize germplasm with value‐
adding traits. 
 
Crop Research Informatics Laboratory (CRIL). Responding to the increasing importance of 
informatics in crop research and breeding and the opportunities for synergy from comparative 
studies between crops, IRRI and CIMMYT have jointly established a unified Crop Research 
Informatics Laboratory (CRIL). The laboratory will increase the capacity, efficiency, and efficacy 
of scientific informatics support for crop research, breeding, and training. The primary pillar of 
the CRIL vision is the integration and comparative analysis of data across disciplines (within the 
germplasm enhancement value chain) and across species (within the well‐studied cereal crops). 
IRRI and CIMMYT have established state‐of‐the‐art facilities in the Philippines and Mexico to 
serve this vision, with regional facilities in India and China. The centers see several areas where 
this unified facility will help build sufficient critical mass to accomplish previously unattainable 
goals and help establish a more powerful platform for synergizing progress across cereal species. 
The development of informatics tools, methodologies, and systems by CRIL will lead to more 

IRRI Overview  21
  

targeted, efficient, and rapid access to desirable genetic variation in global rice, wheat, and maize 
biodiversity for IRRI, CIMMYT, NARES, and small and medium enterprise breeding programs, 
as well as facilitating use of genetic materials.  
 
Currently, CRIL has a total staff of 35, including seven senior IRS, two postdoctoral fellows, and 
26 NRS, working in five broad thematic areas:  
1. Research support and quality assurance, where differentiation of activities within a 
unified group offers considerable efficiency gains. 
2. Institutional research data management, a critical Institute‐wide activity that has long 
been on the agendas of both institutions. CRIL now offers sufficient critical mass to 
facilitate rapid progress. 
3. Crop information systems for rice, wheat, and maize. With both institutions now 
committed to the same informatics platform, there are tremendous opportunities for 
bringing diverse datasets together. 
4. Computational biology and bioinformatics. Comparative genomics between rice, maize, 
and wheat will drive rapid progress in trait dissection and mining of genetic resources. 
5. Decision‐support tools for crop improvement. The CRIL critical mass provides dramatic 
opportunities for developing new tools to facilitate the effective and efficient use of 
biotechnologies in plant breeding programs. 
 
Knowledge management. We are jointly developing an open knowledge‐sharing platform focused 
on international public goods, notably knowledge with value across many countries, to be made 
accessible online using CGIAR ICT/KM‐developed portal technology (such as CGXchange). This 
platform will align knowledge on rice, wheat, and maize production systems covering topics 
such as cultivars, production, diseases, and pests, with relevant production systems information 
(including conservation agriculture) in the form of manuals, tools (rice/wheat/maize “doctor” 
applications and simulators), multimedia presentations, research findings, best practices and 
ideas, case studies, interactive tests, and fact sheets. 
 
IRRI‐WARDA collaboration. Rice production and consumption are increasing rapidly in sub‐
Saharan Africa. IRRI and the Africa Rice Center (WARDA) have many decades of combined rice 
research and development experience that can benefit the poor rice farmers and consumers on 
this continent. In 2005, under the guidance of their Boards, the two centers reviewed their 
collaboration since the signing of a Memorandum of Understanding (MOU) in 1997, and 
developed a new one to foster joint planning, collaborative research, posting of scientists at each 
other’s stations, joint project development and implementation, and joint training for African 
NARES. The two centers agreed that future collaboration would be conducted on an equal 
partner basis and have taken several concrete steps to put the collaboration in action:  
• In November 2005, scientists from IRRI, ARC (WARDA), CIAT, CIRAD, and IRD 
participated in research planning workshop at IRRI for inter‐center collaboration and 
development of a joint program and projects for Africa. 
• In December 2005, the board chairs, directors general, and deputy directors general of 
IRRI and ARC (WARDA) met at AGM05 in Marrakech and affirmed their commitment to 
joint activities in support of rice farmers in sub‐Saharan Africa. 
• Since January 2006, an IRRI plant breeder has been posted at the ARC (WARDA) 
Substation at IITA, Ibadan, Nigeria.  
• During 2006, IRRI will establish a regional office for East and southern Africa (to be co‐
located with the ARC (WARDA)‐coordinated East and Central Africa Rice Research 

22 IRRI Overview 
  

Network at Dar es Salaam, Tanzania) headed by a senior rice production and post‐
harvest management specialist.  
• In 2005, the two centers jointly submitted a project proposal to IFAD aimed at alleviating 
rural poverty through improving rice production in East and southern Africa. 
 
Through this collaboration with ARC (WARDA), IRRI will bring its formidable capacities in 
germplasm improvement and expertise in genomics and biotechnology, and the elite breeding 
materials developed and adapted to irrigated, rainfed, and upland ecosystems in rice‐growing 
countries of Asia, for evaluation and adaptation under African conditions. These materials will 
include germplasm identified under INGER and a large number of interspecific progenies 
generated from crosses of Asian (O. sativa) × African (O. glaberrima) species (>5,000 introgression 
lines). Biotechnology tools such as anther culture, embryo rescue, and molecular markers, 
including advanced genomics tools, can be further used to accelerate the development of new 
NERICA varieties for a range of different environmental challenges.  
 
The IRRI plant breeder at Ibadan has contributed to the development of a regional MTP for West 
and Central Africa, on such research topics as 
• molecular profiling of NERICAs and popular rice varieties of sub‐Saharan Africa, 
• nutritional profiling of sub‐Saharan Africa rice germplasm, 
• Asian rice germplasm exchange and evaluation for West African lowland conditions, 
• evaluation for Rice Yellow Mottle Virus (RYMV) tolerance of interspecific cross 
derivatives, and  
• generation advancement and evaluation of breeding populations for lowland conditions 
in sub‐Saharan Africa. 
 
IRRI‐CIAT collaboration. Following the joint work plan meeting on rice research referred to  
above, IRRI and CIAT will develop a Spanish version of the Rice Knowledge Bank, revive IRRI’s 
participation and collaboration with INGER‐LAC, undertake research on marker aided selection, 
and use the IRRI database format for HarvestPlus rice collections at CIAT.  
 
Challenge Programs. IRRI participates actively in three Challenge Programs: in Generation as 
Subprogram 2 leader, in HarvestPlus as the rice leader, and in Water and Food as the managing 
center and theme leader for Theme 1. Research at IRRI supported by the Challenge Programs is 
embedded within the seven programs, their outputs, and output targets. 
 
 
IRRI financial indicators
Change in project cost structure and portfolio. The research agenda cost allocation for this MTP 
2007‐09 represents a significant change from that presented in the current MTP (2006) projects. 
Unlike the current MTP—which is based on 11 projects—the plan for 2007‐09 will be based on 
seven programs. The change in structure is a result of the adoption of a new strategic plan for 
IRRI. 
 
The project cost allocation Tables 2, 3, 5, and 8 are shown in two sets in the Financing Plan. One 
set is based on the 11 projects for 2005 and 2006, while the second set is based on the seven 
programs for the plan period 2007‐09. 
 

IRRI Overview  23
  

Program Cost Allocation US$ million

      2005  2006  2007  2008  2009 
      Actual  Estimated  Plan  Forecast  Forecast 
1.  Raising productivity in rainfed environments: attacking 
the roots of poverty          10.434  10.500  10.600 
2.  Sustaining productivity in intensive rice‐based systems: 
rice and the environment          9.470  9.500  9.600 
3.  East and southern Africa: rice for rural incomes and an 
affordable urban staple          2.103  2.100  2.100 
4.  Rice and human health: overcoming the consequences of 
poverty          1.981  2.000  2.000 
5.  Rice genetic diversity and discovery: meeting the needs 
of future generations for rice genetic resources          6.198  6.200  6.200 
6.  Information and communication: convening a global rice 
research community          3.608  3.600  3.600 
7.  Rice policy support and impact assessment for rice 
research          4.236  4.200  4.200 

   Total Expenditure    33.885  37.230  38.030  38.100  38.300 

   
Grants. Total estimated donor grants expected in 2007 are $31.14 million. Unrestricted and 
attributed funding is projected at $15.81 million, that is, 50% of the total, and is based on known 
or highly probable funding levels from individual donors in 2006. Unrestricted and attributed 
grants are expected to be almost equal to the forecast for 2006, but slightly lower than in 2005. We 
take a conservative approach with respect to exchange rate assumptions for several of the large 
CG member grants, given the significant impact this can have on the dollar totals. 
 
Restricted and Challenge Program funding is estimated at $15.33 million. These estimates are 
based on ongoing projects supported by contracts, as well as the anticipated new restricted 
projects coming on line during the year and expected funds from the Challenge Programs. 
 
IRRI is projecting the same level in external funding in 2008 and 2009 but, if funding does not 
materialize, there will be some revisions in program costs for these years. To balance the budget 
in 2008 and 2009, based on the projected expenditure levels, the MTP requires revenue levels of 
$38.10 million in 2008 and $38.30 million in 2009. This target is considered achievable and IRRI 
will identify sources for the additional requirements in the coming years. 
 
Earned income. Earned income will continue to be an important element of our revenue sources. 
This category of revenue is expected to remain flat at 2005 levels during the entire plan period. 
Earned income from bank interest, investment income, and sale of obsolete assets, among others, 
and drawdown on net assets are expected to be $1.80 million in 2007—the same level as in 2006. 
Various unpredictable factors such as interest rates make this difficult to estimate accurately. 
 
Drawdown on reserves. Based on the current revenue and expenditure plan, IRRI will drawdown 
its reserves by about $1.282 million in 2006 and $1.757 million in 2007. Even so, IRRI will have to 
seek additional funding to meet the planned expenditure for 2007 onwards, as indicated in the 
next table. 
 

24 IRRI Overview 
  

Summary of Funding Sources US$ million 

  2005      2006  2007        2008  2009 
   Actual  Estimated  Plan  Forecast  Forecast 
                      
   Unrestricted     12.861  12.347  12.464  12.464  12.464 
   Attributed     3.141  3.366  3.347  3.347  3.347 
   Restricted     8.044  10.447  10.334  10.334  10.334 
   Challenge Programs     4.891  5.704  4.994  4.994  4.994 
   Total Grants     28.937  31.864  31.139  31.139  31.139 
                       
   Earned income     1.858  1.800  1.800  1.800  1.800 
   Planned drawdown on reserves     3.090  1.282  1.757  1.638  1.000 
   TOTAL AVAILABLE     33.885  34.946  34.696  34.577  33.939 
   Additional funding required        2.284  3.334  3.523  4.361 

   TOTAL REQUIRED     33.385  37.224  38.030  38.100  38.300 

   
Indirect cost recovery. Currently, IRRI’s audited indirect cost rate is 21%. The Institute’s indirect 
cost recovery from restricted grants is expected to be around $1.6 million in 2007, compared with 
$1.3 million in 2006. This has been incorporated into the program costs shown above. The full 
recovery from restricted grants and Challenge Programs has always proved challenging for IRRI. 
A two‐pronged approach will be adopted during this MTP period. While aggressively lobbying 
donors for the payment of the full audited indirect cost rate, IRRI will also push to reduce the 
quantum of indirect costs by ensuring, as far as possible, the direct allocation of expenses to 
programs. 
 
Expenditure by regions. In terms of regional distribution of effort, IRRI continues to invest mainly 
in Asia, where the bulk of the world’s rice is produced and consumed. Nevertheless, IRRI 
continues to assess how to further extend its research investments to examine the urgent poverty 
problems elsewhere, particularly in sub‐Saharan Africa. During the MTP period, it is expected 
that investments in Africa are expected to climb from the current $1.872 million to about $4.300 
million by the end of 2009. 
 
Capital expenditure. IRRI’s approved 3‐year capital budget of $8.557 million is expected to be 
fully used by the end of 2006. The major components are the Grain Quality, Nutrition, and 
Postharvest Center ($1.0m), the rice transformation laboratory ($1.700m), enhanced data storage 
($0.389m), and the rainout shelter on the Experiment Station ($0.300m). A new 3‐year budget for 
2007‐09 will be developed and presented to the Board for approval in September 2006. 
Management believes that the funds designated for fixed asset acquisition is adequate to fund 
IRRI’s short‐ and medium‐term fixed assets and ensures that the capital spending forecast is firm, 
adequately funded, and well within the limits of the level of activities and cash management 
practices. 
 
Financial health indicators. The financial health indicator benchmarks for IRRI at the end of 2005 
were above the CGIAR recommended ranges. 

IRRI Overview  25
  

 
  Recommended 
IRRI  range 
1. Working capital—liquidity  422 days  90‐120 days 
2. Adequacy of reserves  422 days  75‐90 days 
3. Cash management on restricted grants  0.74  ‐ 
4. Indirect cost ratio  21%  ‐ 
 
In response to the Executive Committee of the CGIAR, IRRI has drawn up a plan to reduce the 
levels of reserves over an 8‐year period. If the expected grant levels do not materialize—and IRRI 
is not able to make quick reductions in expenditure—then the rate of drawing down on reserves 
could accelerate, and this could affect the financial health indicators. 
 
Challenges. The current financial position is strong; however, very significant challenges lie 
ahead regarding the stability and certainty of funding. 
 
• Uncertainty of grants 
For 2005, based on grants alone, IRRI’s expenditure still exceeded its grants, resulting in a 
deficit of $4.948 million. There is a real risk of sudden reductions in unrestricted grants. 
The need to keep our key donors engaged cannot be understated. A Risk Management 
Reserve has been set up by the Board and management to provide some measure of 
buffer in any eventuality. 
 
• Vulnerability of earned income 
In view of the above, the level of earned income has become critical, since it is only with 
this that IRRI has been able to balance the budget. The current levels of earned income 
must therefore be enhanced or sustained. The risk to this is any possible fall in interest 
rates or loss of corpus of investment. For the present, the former does not look likely and 
the latter is covered by IRRI investing only in principal‐protected instruments with a 
minimal amount of equity exposure. 
 
• Forex rates  
The rate of the US dollar to major world currencies has a great impact (negative or 
positive) on the level of resources available to IRRI, and careful management of foreign 
exchange will therefore be an area that IRRI must focus on during the MTP period, even 
though our scope for maneuvering is limited. 
 
Resource mobilization. In view of the apparent gap between needed resources and planned 
expenditure, IRRI has put in place a resource mobilization strategy to enhance and protect 
financial resources during the MTP period, explained in more detail in the strategic plan (Chapter 
5, page 47). 
 
Conclusions. In three years’ time, that is, at the end of 2009, it is envisaged that the finances of 
IRRI will be reasonably strong for an institute of its size and all the financial indicators required 
by the CGIAR will be at the recommended levels. 

26 IRRI Overview 
  

IRRI PROGRAM PORTFOLIO 2007

27
  
 
 
 
 
 
2007 PROGRAM PORTFOLIO 
1. Raising productivity in rainfed environments: attacking
the roots of poverty.
2. Sustaining productivity in intensive rice-based systems:
rice and the environment.
3. East and southern Africa: rice for rural incomes and an
affordable urban staple.
4. Rice and human health: overcoming the consequences of
poverty.
5. Rice genetic diversity and discovery: meeting the needs
of future generations for rice genetic resources.
6. Information and communication: convening a global rice
research community.
7. Rice policy support and impact assessment for rice
research.
 

28
Program 1
Raising productivity in rainfed environments: attacking the roots of poverty
 
Rationale
Today, most of the regions with extensive poverty in Asia are dominated by rainfed ecologies 
where rice is the principal source of staple food, employment, and income for the rural 
population. Success has been limited in increasing productivity in rainfed rice systems. Rice 
yields in these ecosystems—home to 80 million farmers who farm a total of 60 million ha—
remain low at 1.0 to 2.5 t ha‐1, and tend to be variable due to erratic monsoons. Excessive soil 
moisture in the wet season and lack of it in the dry season limit opportunities for crop 
diversification out of rice. Poor people in these ecosystems lack the capacity to acquire food, even 
at lower prices, because of low productivity in food production and limited employment 
opportunities elsewhere. Many of the people living in rainfed areas belong to ethnic minorities 
and, as such, their plight is often compounded through social and political marginalization. 
 
The rainfed systems confront droughts, submergence, problem soils, and other abiotic stresses. 
Over the last three decades, potential solutions to many of these problems have been discovered 
in cultivated and wild rice germplasm, making genetic enhancement a viable strategy for 
improving the livelihood of the rural poor. Thanks to a number of scientific advances in recent 
years, researchers have already identified promising genetic materials and clear breeding 
strategies for the development of varieties with several important traits that were difficult to 
address with conventional methods. Prospects are now good for breeding into high‐yielding rice 
varieties several important traits such as tolerance of drought, submergence, phosphorus 
deficiency, and saline soils. Aiding our progress in this field is IRRI’s unique ability to bring 
together the research performed in advanced research institutes (ARIs) and the private sector in 
the industrialized countries with that of the NARES in developing countries. The efficiency of 
breeding activities is enhanced through allele mining and gene discovery using functional 
genomics (which will be undertaken in Program 5). 
 
Poverty, the small size of farms, insecure tenure, and high risks in rainfed rice farming make 
farmers unwilling to invest in improved rice production and resource management techniques, 
thereby entrenching inappropriate farm practices that degrade natural resources. Soil conditions 
and the crop establishment method have enormous consequences for nutrient availability and 
management, weed competition, extraction of soil water, and adaptive strategies required by the 
rice plant for successful performance. Water stress is frequently the main limitation to rice 
productivity and yield stability in rainfed systems. The development and transfer of improved 
farm‐level resource management strategies require deeper understanding of the interactions of 
soil, water, and pests; the integration of knowledge into the development of improved crop 
management options; and the evaluation and refinement of options with farmer participatory 
research. Reduction in risk in rice cultivation requires enhanced seedling vigor, improved crop 
establishment methods to avoid drought and submergence, and better tolerance of sodium, iron, 
and aluminum toxicity and phosphorus and zinc deficiency, combined with resistance to biotic 
stresses, especially the blast fungus. Women, who are more heavily involved than men in rice 
farming in poverty‐stricken areas, need to be involved in farmer participatory research for 
screening improved varieties and validating improved crop management options for the 
technologies to be widely adopted. 
 

IRRI Program 1  29
 In rainfed areas, scope is limited for increasing income through rice cultivation alone because of 
(1) the small size of farms in rice‐based systems and (2) the policy of keeping the price of rice 
affordable for the poor. An increase in the productivity of rice, however, can release resources for 
expanding the area for the production of nonrice crops and for other farm enterprises. 
Diversification of the system can generate additional employment for landless households in 
processing, storage, and marketing activities since their products are perishable and more 
commercial in nature than rice. The use of shorter‐duration rice varieties, improved crop and 
resource management options, changes in timing of crop establishment, etc., can facilitate 
intensification and diversification of low‐productivity rice‐based systems to optimize system 
productivity and improve the livelihoods of marginal and small farmers. 
 
This program seeks to develop superior germplasm and improved crop and natural resource 
management practices that facilitate intensification and diversification of rainfed systems. The 
program also seeks to find innovative and effective ways to communicate these practices to 
facilitate adoption by resource‐poor farmers. IRRI, in partnership with NARES and ARIs in 
industrialized countries, will integrate upstream research in genomics, genetics, and physiology 
with applied and adaptive research on crop improvement and management to develop elite 
germplasm and best management options that would substantially increase and stabilize yield 
under stress conditions compared to currently grown varieties, and share this germplasm with 
NARES partners through the International Network for Genetic Evaluation of Rice (INGER). IRRI 
will also facilitate and use the Consortium for Unfavorable Rice Environments (CURE), 
established in 2002, to understand the site specificity of problems, validate and adapt new 
technologies with farmer participatory research involving both men and women farmers, and 
fast‐track the diffusion of knowledge‐intensive technologies by facilitating linkages among 
research, extension, and development. While raising productivity in rainfed systems, IRRI and its 
partners shall ensure that the quantity and quality of natural resources—soil, water, and biotic 
resources—are maintained so that the capacity of our future generations to meet their food needs 
from these limited resources is not compromised.  
 
Alignment with CGIAR System Priorities
Research for developing superior rice germplasm tolerant of drought, submergence, and problem 
soils aligns perfectly with the CGIAR priority of enhancing tolerance of selected abiotic stresses 
(System Priority 2B). The program also addresses, through INGER and CURE, the CGIAR 
concern on developing long‐ and short‐term research strategies and policies to share germplasm 
and technologies with partner NARES and capable regions (Priority 2A, specific goal 3). CURE 
provides a platform for conducting research on the changing roles of producers, consumers, and 
civil society organizations in technical innovation processes to identify the ways in which their 
roles may enhance the impacts of R&D on poor people (System Priority 5C). Integrated land, 
water, and forest management issues at the landscape level for the uplands in Output 4 relate to 
System Priority 4A, whereas issues of intensification and diversification of rainfed systems in 
Output 5 relate to System Priority 4B on agroecological intensification in areas with low potential. 
 
Impact Pathways
The intermediate outputs of the program are standard phenotyping capacity for crop 
improvement research on drought and submergence tolerance, the genetic basis of traits (QTLs) 
from genotypes tolerant of abiotic stresses, markers for introgressing the traits into widely grown 
improved varieties, and improved knowledge of the physiology of stress tolerance. Breeders in 
NARES will use these outputs to develop improved varieties. Elite lines with high yields, 

30 IRRI Program 1 
resistance to key pests, superior grain quality, and tolerance of abiotic stresses developed under 
NARES‐IRRI breeding networks and shuttle breeding programs will be shared among NARES 
through INGER to evaluate their suitability under specific agroecological conditions. NARES will 
use the knowledge and elite lines in their crop improvement programs and will eventually 
release superior germplasm as varieties to farmers through national extension systems. IRRI and 
NARES will jointly use the CURE platform to validate and adapt new technologies and improved 
crop and resource management practices with community‐based farmer participatory 
experiments that recognize the central role of women to optimize the yield of improved varieties 
and fast‐track technology dissemination. Geographic information systems (GIS) and systems 
modeling will be used to map areas suitable for extension of the improved technologies. Impact 
assessment activities will be undertaken to assess constraints to the adoption of technologies by 
the intended users, and the economic, social, and environmental impact of the diffusion of 
technologies (link with Program 7). 
 
Research Approach to Develop International Public Goods
In most cases, research activities will be conducted on a specific problem that affects several 
countries. Applied and adaptive research will be conducted at key sites that represent specific 
subecosystems for several countries and working groups will be organized for collaborative 
research between IRRI and participating NARES. Annual review and planning meetings will be 
held to plan research activities, review work progress, and learn from each other’s experience in 
conducting research and share research outputs. Research on a single country will be undertaken 
only if the product or knowledge has generic value that can benefit several countries facing the 
same problem. 
 
Elaboration of Partners’ Roles
Program 1 has a large range of partners in the NARES, universities, and ARIs, as well as other 
CG centers and Challenge Programs. These are listed in Annex 1.  
 
The main vehicle for research partnership under this program is the Consortium for Unfavorable 
Rice Environments (CURE), a NARES‐constituted network established in mid‐2002 to tackle 
high‐priority problems facing resource‐poor farmers in monsoon Asia. CURE is governed by a 
steering committee (SC), composed of key NARES representatives from seven countries and the 
IRRI deputy director general for research. The SC provides overall guidance to the research 
agenda of the consortium; approves funding proposals, budgetary allocations, and work plans; 
and facilitates all research activities and dissemination of research outputs within participating 
countries. The consortium coordinating unit (CCU), which serves as the secretariat of CURE, 
facilitates the initiation and establishment of the working groups (WGs), which are 
interdisciplinary teams of researchers from NARES and IRRI and may also include other 
international agricultural research centers (IARCs), ARIs, and NGOs. In consultation with the SC, 
the CCU coordinates fund raising, provides administrative support, and facilitates 
communication among the WGs. Working groups hold at least one review and planning 
workshop each year. They also report on their progress at the annual CURE steering committee 
meeting when the next year’s work plans are put on the table for approval. The participatory 
mode with which the working groups operate ensures that NARES and other in‐country partners 
have ownership of all project outcomes and the ability to deploy them beyond the project period. 
 

IRRI Program 1  31
 Program Outputs
This program has the following five outputs: 
 
1. Superior drought‐tolerant and aerobic rice germplasm and management options developed for water‐
short rainfed environments by 2012. 
Almost half of the 60 million ha of rainfed lowlands and plateau uplands in Asia are 
drought‐prone and/or have a short monsoon season. Variation in rice production is closely 
related to total annual rainfall, but, even when total rainfall is adequate, shortages at critical 
periods greatly reduce productivity. The inherent risk in rice cultivation in the drought‐prone 
ecosystem reduces productivity even in favorable years because farmers avoid using inputs 
in optimal amounts when they fear crop loss. Risk‐reducing technologies can therefore 
encourage higher investment in inputs, and adoption of high‐yielding varieties, thereby 
increasing productivity and reducing poverty.  
 
Previous research at IRRI and advanced research institutes has shown that conventional 
breeding for reproductive‐stage tolerance is complicated by the strong relationship between 
plant phenology and sensitivity to stress. The difficulty of selecting for improved yield under 
drought stress has led to efforts in recent years to identify alleles for quantitative trait loci 
(QTLs) affecting drought response, and introgressing them into popular high‐yielding 
varieties through marker‐assisted backcrossing. QTLs with large enough effects on grain 
yield to be useful in marker‐assisted breeding are yet to be identified. 
 
2. Superior germplasm and management options to overcome submergence stress developed by 2012. 
More than 40 million ha of rice lands (including land using supplementary irrigation during 
the rainy season) in South and Southeast Asia are annually affected by flash flooding from 
heavy rains and runoff from higher elevations, causing temporary submergence of the rice 
plant. Complete submergence for 10 days or more can occur at any time during the growing 
season, resulting in re‐planting of seedlings, or partial to total crop failure. Previous research 
has succeeded in fine‐mapping a major gene (Sub1) that accounts for most of the variation in 
tolerance of submergence in rice varieties. A marker linked to this gene can facilitate its 
transfer into new or existing high‐yielding varieties that are locally adapted and possess the 
quality aspects preferred by local consumers. Sources of tolerance of submergence during 
germination have also been identified and this trait needs to be transferred into high‐yielding 
varieties.  
 
Combining superior germplasm with suitable management strategies such as nursery, 
seedling, and nutrient management can substantially reduce losses from submergence. 
Agronomic and physiological studies will be conducted on existing varieties and improved 
lines to assess the effect of the Sub1 gene on yield, grain quality, seedling vigor, and other 
agronomic traits. New and existing management options, including nursery and nutrient 
management options to produce robust seedlings and enhance plant recovery after 
submergence, will be developed and validated in farmers’ fields. Studies on farmers’ 
indigenous knowledge and practices, and criteria for the selection of technologies, will be 
conducted to understand the constraints to technology uptake and devise policy options for 
fast‐tracking technology diffusion. 
 

32 IRRI Program 1 
3. Superior germplasm with tolerance of salinity and other soil problems, together with suitable 
management options, developed by 2012.  
In South and Southeast Asia, problem soils (excess salt, nutrient deficiencies/toxicities) limit 
rice productivity on more than 30 million hectares. A major problem in coastal areas of India, 
Bangladesh, Vietnam, and Indonesia is salinity from salt intrusion that renders the soil 
unproductive and/or unsuitable for rice farming. In inlands, salinity and alkalinity from 
groundwater irrigation have been expanding in northwestern India, Pakistan, and central 
Myanmar. Salinity is also associated with additional abiotic stresses such as phosphorus (P) 
and zinc (Zn) deficiency and iron deficiency/toxicity. Most rice soils are characterized by high 
P‐ and Zn‐fixing ability and currently about 50% of rice lands are P‐deficient. In these areas, 
rice yields are low because suitable tolerant high‐yielding rice varieties are not available. In 
coastal areas, farmers often grow only one crop during the monsoon season when fresh water 
is available and/or rainfall helps flush salinity from the soil. Poverty is extensive because of 
the low productivity of land, and, in some areas, farmers have resorted to traditional shrimp 
farming using brackish water to improve livelihoods, which has had harmful effects on the 
environment.  
 
Previous studies revealed considerable potential for increasing rice productivity in salt‐
affected and other problem soil areas. Physiological and biochemical studies highlighted a 
few useful traits that underlie tolerance of these stresses in rice. Two major QTLs, one for 
seedling‐stage salt tolerance (Saltol) and one for P‐deficiency tolerance (Pup1), together with a 
few other QTLs, are being tagged for marker‐assisted breeding. Discovery of candidate genes 
is currently within reach and could help combine superior alleles for tolerance of salt and 
other abiotic stresses associated with problem soils. Nursery and nutrient management 
options together with proper handling of seedlings during transplanting could reduce 
seedling mortality and improve crop stand. Various soil reclamation methods and water 
management techniques could be effective in mitigating harmful effects of excess salts and 
nutritional problems during the most sensitive stages of plant growth. Further research to 
build on past achievements could contribute to higher levels of tolerance in high‐yielding 
varieties beyond the levels observed in any of the tolerant but low‐yielding landraces that 
farmers currently grow in affected areas. The new varieties could bring additional land and 
water resources into use for rice cultivation. 
 
4. Superior germplasm and improved management options for uplands developed by 2012. 
The area under the upland rice‐based system in Asia is estimated to be around 15 million ha, 
including both the area sown and land used as a part of the rice‐based rotation. Sloping and 
plateau uplands account for a substantial rice area in Laos, Vietnam, Myanmar, northeastern 
and eastern India, and Nepal. Much of the Asian upland is characterized by high incidence of 
poverty, poor physical access to markets, ill‐functioning markets, and subsistence‐oriented 
agriculture with low productivity. Many households belong to minority ethnic and tribal 
groups that are economically and socially marginalized and are the poorest of the poor. 
Rising population pressure and the consequent intensification of marginal areas for food 
production have contributed to environmental degradation and a further reduction in 
agricultural productivity.  
 
IRRI’s approach to upland research has undergone a major paradigm shift in recent years 
from a focus on “upland rice” to “rice in the uplands.” This new approach calls for 
intensification of favorable pockets in uplands for food production so that pressure to 

IRRI Program 1  33
 intensify food production in less favorable and more fragile areas can be reduced. It involves 
integrated land, water, and forest management at the landscape level for uplands. 
 
The major biophysical constraints to productivity growth of rice in uplands are low soil 
fertility, soil erosion in sloping areas, severe weed infestation, rodents, blast fungus, 
nematodes, and root aphids. Over the past decade, important scientific progress has been 
made in addressing this seemingly intractable set of constraints, thus substantially improving 
the likelihood of reducing poverty and protecting the environment. These scientific gains 
need to be further consolidated and translated into specific technologies suited to major 
production systems in the uplands.  
 
5. Resource management options and strategies for intensification and diversification of rainfed systems 
developed by 2012. 
For areas with short and erratic monsoons, such as the plateau uplands in eastern India and 
Bangladesh, system productivity and farmers’ livelihoods could be improved through the 
development and deployment of shorter‐maturity rice varieties so that residual moisture 
could be used for growing pulses, oilseeds, and vegetables in the seasonally fallow land after 
rice. In coastal areas with brackish water, the expansion of highly profitable shrimp farming 
has affected the long‐term sustainability of the resource base, and created social tension 
between resource‐rich and resource‐poor households. Opportunities exist for developing a 
more harmonious and sustainable rice‐aquaculture system that would optimize the 
productivity of fresh and brackish waters in coastal areas. There is also a need to develop 
sustainability indicators to monitor ecosystem health and thereby minimize the adverse 
environmental effects that may be associated with rice intensification. IRRI will work with 
NARES and other CGIAR centers at the systems level to match shorter‐duration rice varieties 
with suitable varieties of nonrice crops and aquaculture species, and to develop optimal 
resource management practices for improving system productivity and farmers’ livelihoods 
while sustaining the natural resource base for future generations. 

34 IRRI Program 1 
  
MTP Project Logframe 
Program 1. Raising productivity in rainfed environments: attacking the roots of poverty 
  Outputs  Intended Users  Outcome  Impact 
Output 1   Superior drought‐tolerant and  NARES scientists and farmers in  NARES scientists through  There will be a reduction of risk of 
  aerobic rice germplasm and  rainfed and water‐limited  mechanisms such as CURE will  crop loss due to drought, a 20% 
management options developed  environments  adapt and validate improved  increase in rice production and 
for water‐short rainfed  germplasm and management  water productivity, and 30% 
environments by 2012.  practices suitable for the local  increase in incomes from rice 
environments with farmer  farming in water scarce areas in 
participatory research. Improved  Eastern India, Nepal, Bangladesh, 
germplasm and NRM packages  Pakistan, Thailand, and the 
adopted by 25% of the farmers in  Philippines. 
pilot projects in drought‐prone 
areas. 
Output targets  • Six diverse donors of drought‐tolerance traits as potential parents for breeding. 
2007  • Analysis of the performance of ten validated elite lines and hybrids with improved drought tolerance, superior grain quality and yield potential of 
over 5 t/ha with NARES breeding programs in South and Southeast Asia.  
• Validated elite aerobic lines with potential grain yield of over 5 t/ha in farmer participatory experiments in India, Nepal, Bangladesh and Philippines.  
• Two major QTLs for drought‐tolerance and aerobic adaptation. 
Output targets  • Knowledge of the severity, timing and spatial coverage of drought at the district level in key sites in Eastern India, Nepal, Thailand, Laos. 
2008  • Increased understanding of the physiology of drought tolerance donors, candidate genes (DREB), and QTLs.  
• Validated decision support systems for nutrient management for the rainfed lowlands of Laos and Chhattisgarh, India. 
• Proven options for improved soil health management for sustainable rainfed aerobic rice systems of Eastern India, Nepal, the Philippines, and 
Indonesia. 
Output targets  • Fine‐mapped QTLs and markers for breeding varieties with improved drought tolerance and aerobic adaptation. 
2009  • Elite hybrids from crosses involving drought‐tolerant inbred parents that out yield the current IRRI tolerant check, PSBRC 80, by at least 1 t/ha under 
moderate lowland drought stress. 
• Transgenic plants (developed using DREB technology). 
• A decision support system for direct seeding and improved weed management in Bangladesh and Eastern India. 
• Systems for screening for drought‐avoidance and water‐use efficiency traits in breeding and management research. 
• Aerobic rice varieties with pest and disease resistance, and grain quality traits for India, Bangladesh, Nepal, and Pakistan. 

IRRI Program 1 

35
36
  Outputs  Intended Users  Outcome  Impact 
Output 2  Superior germplasm and  NARES rice research programs  NARES in Eastern India (Eastern  Yield of monsoon season rice will 
management options to overcome  Extension agencies  Uttar Pradesh, North Bihar, West  increase by 20%, the cost of rice 
submergence stress developed by  Farmers  Bengal, Orissa and Assam),  production will be reduced by 20% 
2012.  Bangladesh, Myanmar and  (from avoidance of replanting and 
Cambodia validate elite lines and  yield losses from submergence), 
associated crop and resource  and temporal fluctuations in yield 
management options to develop  will be reduced by 25%.  
locally‐suitable submergence‐  
tolerant and high yielding varieties  Adoption of the new variety‐
for the monsoon season crop for  management package will lead to a 
release to extension workers and  20% increase in crop productivity 
ultimately farmers.  across 10 million ha of 
submergence‐prone areas of South 
and Southeast Asia, resulting in 
reduced poverty among rice 
producers and consumers in that 
region. 
Output targets  • Improved nursery management options for tolerant varieties in Eastern UP, India and Bangladesh. 
2007  • Seed management options for improved germination and enhanced early seedling growth of tolerant lines under flooding in at least two sites. 
• Six mega‐varieties with the Sub1 gene for submergence tolerance and agronomic and quality traits from farmer‐participatory experiments at three 
sites. 
Output targets  • Analysis of farmers’ current CNRM practices, coping mechanisms to submergence, and livelihood systems in the flood‐prone ecosystem for 
2008  Bangladesh and Eastern Uttar Pradesh, Thailand and Myanmar. 
• Understanding of the spatial and temporal distribution of flooding in farmers’ fields at three sites for selected regions. 
• MAS system to incorporate QTLs for tolerance to flooding during germination into mega varieties. 
• Advanced knowledge of the physiology of tolerance to water stagnation. 
• Breeding lines combining good agronomic and quality traits with tolerance of submergence during germination. 
• Improved submergence‐related seed and nutrient management options from farmer participatory research in at least three sites. 
Output targets  • Marker‐assisted breeding system to combine Sub1 with tolerance to flooding during germination. 
2009  • At least one additional fine‐mapped alternate QTL/gene for submergence tolerance non‐allelic to Sub1. 
• Breeding lines combining tolerance to flooding during germination and vegetative growth. 
• Five breeding lines combining submergence tolerance (with the Sub1 gene) and adaptation to stagnant flooding for NARES. 
• Understanding of the impact of submergence tolerance technologies at three CURE sites. 

IRRI Program 1 
   Outputs  Intended Users  Outcome  Impact 
Output 3  Superior germplasm with tolerance  NARES and farmers in problem  NARES in salt‐affected and  Adoption of the superior 
of salinity and other soil problems,  soil areas.  problem soil areas in South and  germplasm across 2 million ha of 
together with suitable  Southeast Asia validate and adapt  salt‐affected and other problem 
management options, developed  superior germplasm and suitable  soils in India, Bangladesh, 
by 2012.  CNRM options for release to  Myanmar, Philippines, Cambodia, 
farmers.  Indonesia and Vietnam. 
 
In salt‐affected areas, the average 
rice yield will increase from 1.5 
t/ha in 2005 to 3.0 t/ha. 
 
In other problem soil areas, rice 
production will increase by 30%. 
 
Overall, increased rice production 
will result in reduced poverty and 
improve the livelihoods of poor 
rice producers and consumers in 
target areas. 
Output targets  • Increased understanding of CNRM practices and livelihood strategies in representative salt‐affected rice areas in India, Bangladesh, and Vietnam. 
2007  • New information on closely flanking markers at the Saltol and Pup1 loci. 
• Enhanced knowledge of the physiological bases of tolerance to salt stress during reproduction. 
Output targets  • High throughput phenotyping techniques for screening for Zn deficiency and Fe toxicity and knowledge of physiological bases of tolerance. 
2008  • Validated improved CNRM practices (integrated with salt tolerant rice germplasm) for efficient use of inputs and stabilized productivity for 
saline/alkaline regions for India, Bangladesh, and Vietnam. 
• One mega variety into which the Saltol locus for salinity tolerance has been introgressed using markers. 
• Recommended technologies (integrated use of improved germplasm, CNRM, and amendments) to reclaim saline/alkaline soils. 

IRRI Program 1 

37
38
Output targets  • Two fine‐mapped QTLs associated with salinity tolerance (other than Saltol ) and markers for their introgression with Saltol into mega varieties. 
2009  • One widely adopted variety with Pup1 for phosphorous uptake. 
• Fine‐mapped QTLs and closely linked markers associated with Zn deficiency and Fe toxicity for introgression into widely adopted varieties. 
• Fifteen improved multiple abiotic stress tolerant breeding lines, hybrids, and alien introgression lines with improved grain quality for India, 
Bangladesh, Philippines, Cambodia, Vietnam, Myanmar and Indonesia. 
• Validated decision support tools and training materials for four improved crop management technologies at three sites. 
• Increased understanding about the constraints to adoption of salt‐tolerant varieties and management practices and their economic and social impact. 

IRRI Program 1 
   Outputs  Intended Users  Outcome  Impact 
Output 4  Superior germplasm and improved  NARES scientists and research  NARES evaluate improved  Rice yields in uplands are 
management options for uplands  leaders   germplasm for inclusion in their  increased by at least 30%. 
developed by 2012.  National and international  breeding programs. NARES make  Improved management of rice 
development agencies   improved technologies available to  landscapes reduces land 
farmers who adopt these across at  degradation in sloping uplands. 
least 20% of the upland areas.  Farmers’ incomes increase by at 
least 20% due to incorporation of 
remunerative cash crops in rice‐
based systems. Furthermore, policy 
makers and development agencies 
will have better information and 
knowledge of the food security 
problems of ethnic minorities in 
the uplands. 
Output targets  • Evidence from farmers’ fields in Laos and Vietnam of the yield advantage of new upland rice varieties. 
2007  • Evidence from Laos that improved fallow management (fallow enrichment) technologies generate better economic returns to farmers, improve soil 
fertility, and reduce soil‐borne pests. 
Output targets  • Rice varieties with improved drought tolerance and disease resistance for plateau uplands of eastern India. 
2008  • Knowledge of the potential for mixed‐cropping systems consisting of rice interplanted with other crops, rice‐non rice rotations, and mulch/green 
manure for fertility enhancement and pest management. 
• Improved knowledge of interactions and resource flows between sloping uplands and upland paddies in Laos and Vietnam. 
Output targets  • Improved glutinous upland rice varieties for Laos and Vietnam. 
2009  • Upland rice varieties combining improved yield potential with drought tolerance, weed competitiveness and disease resistance for NARES. 
• Knowledge of the yield decline in short fallow systems in Laos, and strategies for its prevention. 
• Validated crop mixtures, management options, and rotations to improve the productivity and sustainability of upland rice systems. 

IRRI Program 1 

39
40
  Outputs  Intended Users  Outcome  Impact 
Output 5  Resource management options and  Scientists   NARES use sustainability  Cropping intensity increases by 
strategies for intensification and  NARES natural resource managers   indicators to monitor ecosystem  50% in areas characterized by short 
diversification of rainfed systems  NARES researchers  health in rainfed environments.  and erratic monsoons. Land and 
developed by 2012.  Extension workers   NARES researchers test and refine  water productivity is increased by 
Development agencies  landscape management and  50% across 2 million ha of salt 
Farmers’ organizations   cropping systems strategies and  affected coastal areas in Vietnam 
develop technology advisory notes  and Bangladesh. 
and extension materials. NARES   
use this information to train 
extension workers and 
development agencies on 
improved farming systems and 
ecosystem management. Farmers 
adopt new land management and 
cropping systems strategies across 
5 million ha. 
Output targets  • Analysis of environmental sustainability of rice based systems. 
2007  • New knowledge of emerging patterns and drivers of intensification and diversification of agriculture in rainfed systems. 
• Germplasm and resource management options for double cropping of rice for salt‐affected coastal areas of Bangladesh.  
• Knowledge of farmers’ use of crop varieties and CNRM practices for rice‐legume cropping system from three sites in the drought‐prone rainfed area 
of Eastern Gangetic plains. 
• A new database on water quality for the coastal zone of the Mekong Delta and tools (hydraulic model) to support decision making on water 
management for Bac Lieu Province, Mekong Delta, Vietnam. 
Output targets  • Validated methodology for monitoring environmental sustainability and system productivity from four representative rainfed sites. 
2008  • Effective germplasm and resource management options for double cropping of rice for the salt‐affected coastal region of Bangladesh. 
• Improved rice‐aquaculture systems for salt‐affected coastal areas of the Mekong delta, Vietnam and in Bangladesh. 
• Integrated germplasm and CNRM technologies for rice‐legume systems from farmer‐participatory research in three rainfed regions of eastern India 
and Bangladesh. 
• Maps of resource management domains to facilitate land use planning in Bac Lieu Province, Mekong Delta, Vietnam. 

IRRI Program 1 
 Output targets  • Database on environmental sustainability for four representative rainfed sites. 
2009  • Knowledge on constraints to adoption of improved germplasm and resource management options for double cropping of rice in coastal area of 
Bangladesh. 
• Decision support tools to facilitate technology development and uptake for rice‐aquaculture and rice‐legume systems. 
• Effective options for germplasm (rice and non‐rice) and cropping sequences in saline/alkaline areas of India, Bangladesh, Vietnam, and Iran. 
• Crop and NRM strategies for intensified, drought‐prone, rice‐based systems from three research sites in Eastern India and the Greater Mekong region. 

IRRI Program 1 

41
 Program 2
Sustaining productivity in intensive rice-based systems: rice and the
environment
 
Rationale
Asian urban centers have the majority of the world’s urban poor and within the next 25 years 
nearly 55% of the population of Asia will be located in these areas. The urban poor require food 
at affordable prices and this must come from increased productivity in intensive rice systems, 
which now account for over 70% of total rice production. Rice‐growing areas are among the 
world’s most enduring, environmentally sound, and productive agroecosystems, and increased 
rice production in recent decades has had a significant impact on poverty reduction. Rice 
ecosystems provide basic commodities and regulatory services, including nutrient and water 
cycling, and biological control. Poor people depend on these “ecosystem services” to provide 
their needs as they are often without infrastructure to obtain clean water, food, and fuel. 
Environmental sustainability and ecosystem services are threatened, however, by the loss of 
biodiversity, climate change, and inappropriate management systems often caused by land, 
water, or labor shortages. 
 
In some areas of Asia, a rice crop is being replaced by another crop such as maize in response to 
limitations in irrigation water and high demand for the crop. Crop diversification and 
intensification may jeopardize sustainability due to deterioration in soil health and pest buildup, 
and crop management approaches will be required to avert this. IRRI and CIMMYT will work 
together in an Alliance project for Intensive Production Systems in Asia to understand the effects of 
diversification on the ecosystem and the environment and to develop sustainable management 
practices for evolving production systems. The misuse of agricultural chemicals can interfere 
with the regulating services of the ecosystem, such as biological control and air and water 
quality, yet farm‐level practices can optimize their use in order to maintain yields while 
minimizing environmental impact. 
 
Increasing water scarcity threatens agriculture and livelihoods, and this will be pronounced in 
many areas. In many areas in South Asia, heavy pumping of groundwater is lowering water 
tables. In many monsoon areas, such as in the delta areas of South and Southeast Asia, 
competition is heavy for water, particularly in the dry season. Water supplies are further 
threatened by contamination from industrial and urban sources. Agriculture may also contribute 
in the form of agricultural chemicals, nitrates, and salt in the subsoil, which may affect human 
health and also threaten aquatic biodiversity and ecosystem services. 
 
Labor availability is a major driver of change in many of the rice production systems in Asia and 
is leading to changes such as in the shift from transplanting to direct seeding. In the Indo‐
Gangetic Plains, for example, the desire to reduce costs has motivated the development of 
“conservation agriculture” to reduce the tillage required for crop establishment and conserve the 
resource base. The changing production environment has significant implications for resource 
management and productivity, and appropriate land management is required to ensure the 
sustainability of rice ecosystems. Cropping practices, rotations, fertilizer management, pesticide 
use, tillage, fallow and field margin management, and flooding regimes may all play important 
roles in conserving biodiversity, and indigenous knowledge of landscape management is a key 
resource. Biodiversity plays a vital role in maintaining the resilience of agroecosystems to 
drought, pest outbreaks, and floods, and in the provision of ecosystem services. Rice germplasm 

42 IRRI Program 2 
and species diversity is essential for sustaining effective host‐plant resistance and minimizing the 
risk of widespread and severe pest outbreaks. 
 
Global climate change is one of humankind’s most important challenges. There is a growing 
consensus that Earth’s temperature is increasing, largely as a result of carbon dioxide and other 
greenhouse gas (GHG) emissions. Rice production will suffer as a consequence of climate change 
unless measures to mitigate it are introduced. 
 
IRRI will meet the above challenges by exploiting genetic resources with conventional and 
biotechnological approaches to produce highly productive and well‐adapted varieties. Molecular 
breeding will be used to incorporate yield‐enhancing genes from exotic and wild species into 
improved cultivars and parents for superior hybrids. Germplasm generated will be combined 
with crop and land management alternatives to optimize resource use, maintain the natural 
resource base, and together with postharvest options, improve productivity. Ecological 
approaches at the field and landscape level will be used to gain a better understanding of the role 
of biodiversity and to maximize the effectiveness of cultural control options for pests. To mitigate 
the threats to productivity posed by intensification, diversification, water shortages, and climate 
change will require innovative approaches to develop resource management and germplasm 
options. Options will be developed and deployed through a range of partnerships. Improved 
germplasm will be made available through INGER and technology options will be extended and 
adaptive research undertaken with NARES through two consortia, the Irrigated Rice Research 
Consortium (IRRC) and the Rice‐Wheat Consortium (RWC), and also through the IRRI‐CIMMYT 
Alliance (ICA). To address the challenge of water shortages, close links will be fostered with the 
Challenge Program on Water and Food. To meet the threats posed by climate change, IRRI will 
lead the consortium Rice and Climate Change. 
 
Alignment with CGIAR System Priorities
Enhancement of rice germplasm to increase productivity in intensive rice‐based systems is 
closely aligned with System Priorities 2A and 2B. Landscape approaches to identify improved 
landuse practices and the development of options to increase the productivity of irrigation water, 
improve soil health, and reduce vulnerability through integrated pest management are essential 
elements of System Priorities 4A, 4C, and 4D. Outputs related to partnerships with national 
institutions will aim at enhancing the impact of agricultural research and are congruent with 
System Priority 5D. 
 
Impact Pathways
Integrating the development of more productive germplasm with improved landuse practices 
and management will provide the greatest opportunities to develop options suitable for adoption 
by NARES researchers, development workers, and ultimately farmers. The main outputs 
available to NARES will be knowledge of desirable germplasm traits and understanding of the 
factors influencing the sustainability of the natural resource base, and improved germplasm as 
developed lines and parent materials, appropriate management options for ricebased systems, 
and policy options. Outputs will be developed with national institutions through consortia and 
other partnerships and activities will comprise the identification of constraints and development 
of management options and germplasm, through to validation in farmers’ fields. Consortia in 
particular will provide broad access to improved germplasm and management options, and 
facilitate greater impact within rural communities. Evaluation and adaptation of options will also 
occur independently of either the consortia or IRRI as part of NARES initiatives. Outputs are 

IRRI Program 2  43
 expected to be used by breeders, researchers, development workers, and policymakers in natural 
resource management and it is envisaged that these will improve the effectiveness of NARES and 
ARI partners through increased availability of development alternatives and strengthened 
capacity. Partnerships with NGOs and the private sector will be encouraged where appropriate. 
 
Research Approach to Develop International Public Goods
This program will meet the needs for germplasm and options to improve the productivity, and 
provide a platform and knowledge base to improve sustainability, of intensive rice‐based 
systems in the long term. In achieving this, the program will generate new knowledge and broad 
understanding that will be made available in the form of IPGs. Research will use advances in rice 
breeding and greater understanding of the factors affecting the sustainability of rice systems to 
develop higher‐yielding cultivars and hybrids and suitable management options and strategies. 
Through the consortia, research activities will draw on multiple sites to derive broad 
understanding and knowledge to support extrapolation and wider application of the output 
targets. An example of this is the four working groups of the IRRC. Each has activities across a 
range of countries and aims to develop options and understanding of component technologies. 
Where it is appropriate, through the consortia and other partnerships, Program 2 will participate 
in policy dialogues and roles of advocacy in order to contribute to IPGs. 
 
Elaboration of Partners’ Roles
Many key partners will contribute to the outputs of this program, and they are listed in Annex 1. 
 
For Output 1, the major partners in germplasm development will be NARES, NGOs, and the 
private sector, and their roles are evaluation, identification, and use of breeding materials/elite 
lines with high yield potential, improved grain quality, enhanced micronutrient content, multiple 
resistance to diseases and insects, and cold tolerance. With partners in China and Korea, studies 
will be conducted on stem borer ecology, the population genetics of brown planthopper, and 
gene flow. Marker‐assisted selection (MAS) and other genomics tools in germplasm 
improvement will be applied in collaboration with ARIs and NARES. A wide range of NARES 
partners will collaborate on the integration of canopy characteristics with germplasm and 
management, strategies to optimize macro‐ and micronutrient applications, crop establishment, 
and pre‐ and postharvest management practices and crop diversification for increased 
productivity, reduced crop losses, and sustained production. 
 
Through Output 2, research activities involving constraint identification, evaluation of 
technology, and policy options will be largely undertaken with NARES partners, either through 
bilateral partnerships or through the IRRC, RWC, and ICA. Activities on soil fertility and related 
management will be undertaken in collaboration with the Southeast Asia Program of PPI/PPIC 
and IPI, which will provide support and linkage to related activities in Asia. In the case of water 
use and availability, activities will be undertaken with the Challenge Program on Water and 
Food (CPWF) and the Comprehensive Assessment (CA), which will in turn provide linkages to 
other international centers such as IMWI and ICARDA, universities in Germany and the 
Netherlands, and multilateral organizations, including FAO. 
 
Partnerships are yet to be fully developed for Output 3, but, in addition to others, these may 
include NARES partners in Vietnam, China, and the Philippines that will collaborate on issues 
related to biodiversity, and in Malaysia on water quality and the movement of pesticides. Greater 

44 IRRI Program 2 
understanding of the hydrological cycle will derive from partnerships involving the CPWF, 
CSIRO, and Charles Sturt University in Australia and these will be linked to NARES activities. 
 
Collaborative activities are not expected to be established until 2007 for Output 4 but, in addition 
to others, these may include the University of Hamburg in Germany and the Atmospheric 
Pollution Institute, National Center for Research, Rome, Italy for plant gas exchange analysis; the 
National Institute for Agro‐Environmental Sciences (NIAES), Tsukuba, Japan, for plant response 
to interaction between temperature and CO2; and CIRAD, France, and the University of Reading, 
UK, for development of empirical crop models and simulation of crop performance within 
differing climatic scenarios. Collaborative arrangements will be established with NARES partners 
and with the RWC and ICA in order to create study sites and for data collection, identify 
management alternatives, undertake adaptive research, and evaluate technology and policy 
options. 
 
The IRRC, RWC, and ICA will provide important, but not exclusive, pathways for the scaling‐out 
of research findings, technologies, and policy options in Output 5. These consortia and bilateral 
partnerships, such as the Environmental Radio in Vietnam, will link with NARES institutions in 
India, Bangladesh, Cambodia, Myanmar, Sri Lanka, Thailand, Vietnam, China, the Philippines, 
Indonesia, Malaysia, and Laos, NGOs, and private industry in order to scale out and achieve 
impact. The nature of partnerships will depend greatly on the capacities and organization of the 
NARES and also how research organizations are related to extension and development services. 
Within some NARES, the partnerships listed above and established in the research and 
evaluation phase would be appropriate for scaling out, while, in others, additional partnerships 
will be sought. 
 
Program Outputs
The program has five outputs. Output 1 will generate germplasm that will improve productivity 
and be less affected by biotic and abiotic constraints. Outputs 2 and 3 will focus on alleviating 
constraints, including water availability and quality, contamination by heavy metals, 
deteriorating soil quality, and increased pest buildup, and will identify options to improve 
sustainability through studies at the field to landscape level. Output 4 will develop germplasm 
and management options to mitigate the expected effects of climate change and sea‐level rise, 
and Output 5 will develop and strengthen NARES consortia to facilitate the development of 
appropriate technologies and facilitate greater impact.  
 
1. Improved rice germplasm and management practices to enhance yield potential and achieve sustainable 
productivity developed by 2012. 
An improved understanding of the genetic basis and physiological mechanisms of yield 
potential, pest resistance, and grain quality will allow the development of elite inbred and 
hybrid germplasm with higher yield potential, multiple resistance to insects and diseases, 
and superior grain quality. Management and ecological approaches to crop performance will 
identify yield gaps and pathways to reduce crop losses. Integrated germplasm and pre‐ and 
postharvest management options will enable yield gaps to be closed, productivity increased, 
production costs minimized, and farmers’ profitability increased. 
 
2. Integrated resource management options and germplasm to address threats to sustainability related to 
trends of increasing intensification and diversification and decreasing freshwater resources developed 
by 2012. 

IRRI Program 2  45
 Greater understanding and knowledge of the impact of intensification and diversification, 
and associated management practices, will be developed through partnerships and through 
collaborative arrangements such as the ICA and RWC. In particular, the second‐generation 
problems associated with salinity, soil health, water quality, and pest/weed buildup with 
emerging crop management and land‐use patterns will be elucidated, and integrated options 
developed to mitigate these. Natural resource management options and germplasm will be 
developed to combat water scarcity, including innovative management practices such as 
alternate wetting‐and‐drying and aerobic rice, to use low quality water (affected by salt and 
chemicals), and to minimize uptake of toxic metals (including arsenic, cadmium, and others) 
into rice plants. 
 
3. Integrated management options for improved environmental sustainability in rice‐based landscapes by 
2014. 
The ecological components of ecosystem resilience will be determined and practices and 
policy options identified to enhance biodiversity and improve sustainability. The role of rice 
paddies in the hydrological cycle will be elucidated since the relationship between paddies 
and maintenance of ecosystem services—though critical—is poorly understood. Greater 
knowledge will be developed of the material flows (water, pollutants, and air pollution—
burning) that occur in intensive rice systems and spatial interactions between rice and the 
surrounding environment. Integrated resource management options will be developed in 
order to improve sustainability and optimize productivity and ecosystem services at the 
subbasin level. 
 
4. Options to adapt rice systems to climate change, particularly higher temperatures and raised sea levels, 
and to minimize greenhouse gas (GHG) emissions by 2014. 
The nature and extent of climate change and the threats posed to the major rice production 
areas will be determined through climate and crop modeling, undertaken in partnership with 
existing research groups and by using established databases. Germplasm will be adapted to 
the predicted climates, with tolerance of heat and salinity for the coastal areas, and crop 
management options will be developed to address the changed environment and crop‐pest 
relationships. Crop management options will also be generated to minimize GHG emissions 
and the contribution of rice production to climate change. 
 
5. Strategies for uptake and impact of research results in place by 2010. 
While each of the outputs under Program 2 will aim at uptake and impact at the NARES 
level, Output 5 will have specific research activities directed at facilitating the delivery, 
promotion, and uptake of technologies and knowledge. These activities will be conducted 
within the Irrigated Rice Research Consortium (IRRC) that has activities in 10 countries in 
Asia, the Rice‐Wheat Consortium (RWC) that has activities in four countries in South Asia, 
and the Environmental Radio programs to raise awareness of Southeast Asian farmers of 
environmental issues associated with farming practices. IRRI and NARES partners will 
collaborate with expanded activities for validation, integration, and scaling out of the 
principles, approaches, and technologies developed for intensive rice‐based farming systems. 
IRRI social and natural resource scientists will provide a scientific platform for developing 
and assessing pathways of adoption. Collaborative research will examine how farmers 
respond to different pathways of information transfer and to policy changes, and scaling out 
of the technologies will be led by the NARES of the respective countries. A common focus 
will be on the delivery and measurement of the impact of new technologies and crop 

46 IRRI Program 2 
management options on smallholder farmers and consumers, many of whom are urban poor 
and landless in rural areas of the participating Asian developing countries. 

IRRI Program 2  47
48
 
 
 
MTP Project Logframe 
Program 2. Sustaining productivity in intensive rice‐based systems: rice and the environment 
  Outputs  Intended Users  Outcome  Impact 
Output 1  Improved rice germplasm and  Researchers and breeders at IRRI  NARES in 8 countries and other  The gap between farm‐level yield 
management practices to enhance  and in NARES  intended users use the improved  and the potential of improved 
yield potential and achieve  NGOs  germplasm and management  varieties will be reduced by 25% in 
sustainable productivity  Extension agencies  practices in research, breeding  selected regions and over 10 
developed by 2012.  Private sector and farmers in south  and/or extension programs.  million ha, and technology options 
and south‐east Asia, and East and  Germplasm will be made widely  will lead to a reduction in the unit 
southern Africa  available through INGER.  cost of production by 20% over a 
ARIs.  Consortia (IRRC, RWC, ICA) will  similar area. In areas where 
play an important role in  commonly used varieties were 
disseminating and facilitating the  yielding below 5 t ha‐1 in 2004, by 
uptake by farmers It is expected  2009 yields will be increased by 
that technologies will be  15%. 
transferred to NARES institutions 
that serve one third of the annual 
irrigated rice area in Asia (c. 25 
million ha). 
Output targets  • Twenty high yielding inbreds and ten parental lines for hybrids with pest resistance and improved grain quality, and near isogenic lines (NILs) for 
2007  blast resistance in japonica and indica backgrounds. 
  • Management strategies for healthy canopy and optimization of macro‐ and micro‐nutrients. 
• Advanced knowledge of the components of grain quality and consumers’ preferred quality traits for Cambodia, Laos and Vietnam. 
• Appropriate post harvest management technologies to minimize losses.  
Output targets  • Four promising IRRI inbreds and three hybrids for evaluation in collaboration with Asian NARES. 
2008  • Marker aided selection (MAS) protocols for BPH, tungro, cold tolerance, amylose content and gelatinization temperature. 
  • Germplasm resistant to stem borer and sheath blight from transgenic and other breeding approaches. 
• Validated options for integrated water and sheath blight management. 
• Host resistance and genetic diversification strategies for blast and bacterial blight. 
• Analysis of the factors influencing labor availability in the intensive rice based systems in SE Asia. 
• Validated options for rice market information sources and post harvest management for Cambodia, Laos and Vietnam. 

IRRI Program 2 
 Output targets  • Superior IRRI bred inbred lines, one hybrid and five hybrids from IRRI CMS lines. 
2009  • IR64 NILs for yield related traits. 
• High throughput protocols for grain quality and nutritional traits. 
• Tagged genes/QTLs for iron and zinc contents in the rice grain and for resistance to sheath blight and stem borer. 
• Knowledge of plant traits for high yield and validated management strategies for healthy canopy in China, South and Southeast Asia. 
• Understanding of the genetic structure and virulence of BPH and gene deployment and management strategies to minimize yield loss.  

IRRI Program 2 

49
50
 
 
 
  Outputs  Intended Users  Outcome  Impact 
Output 2  Integrated resource management  Researchers, and extension staff of  Modified agricultural practices  Sustainability, and improved or 
options and germplasm to address  NARES   validated and promoted by  maintained productivity of the rice 
threats to sustainability related to  Farmers in South and Southeast  NARES and adopted by farmers to  production systems will enable 
trends of increasing intensification  Asia, China, and also in east and  improve the sustainability and  incomes to be diversified, and 
and diversification and decreasing  southern Africa  maintain or improve yields despite  income and nutrition improved for 
freshwater resources developed by  ARIs   intensification, diversification and  millions families in south Asia, SE 
2012.  NGO  declining water availability.  Asia and China. Reducing the 
Policy makers.    uptake of toxic metals will ease 
Specifically, knowledge and  this threat to human health in 
practices will be adopted within  south Asia. 
partner NARES and consortia and 
these will be applicable to areas 
exceeding 5 million ha in South 
Asia, SE Asia and China. 
 
Furthermore, options to reduce the 
effects of salinity on productivity 
will be adopted by farmers in 
India and Bangladesh on upwards 
of 1 million ha, and those to reduce 
the risk of uptake of toxic metals 
in rice adopted over 0.75 million 
ha in south Asia and those to 
respond to water scarcity in 
northern China, Philippines, India, 
and Myanmar on around 1 million 
ha. 
Output targets  • Crop residue and weed management options for minimum‐till and direct seeded systems, following principles of conservation agriculture. 
2007  • Promising options to overcome the yield stagnation/decline in the rice‐wheat system in the Indo Gangetic Plains. 
• Knowledge on the biophysical yield potential and feasibility of rice‐maize systems across at least four Asian countries using crop models to guide 
research (IRRI‐CIMMYT Alliance). 
• Knowledge of the interactions between water and cropping patterns on residue decomposition and supply of nutrients to identify management 
practices as an alternative to residue burning in India and China. 

IRRI Program 2 
 Output targets  • Concepts for integrated crop management (water, nutrients, weeds and land leveling) under water‐scarce conditions in lowland rice in the 
2008  Philippines, Vietnam, India, Bangladesh and Myanmar. 
• Knowledge of current and future water availability in Asian irrigation systems, and GIS database. 
• Understanding of the weeds shifts in the Indo‐Gangetic Plains due changes to direct seeding, and validated weed management options and decision 
tools for farmers in India and Bangladesh. 
• Understanding of the causal factors of yield decline in aerobic rice and prototype management interventions to reduce the yield decline.  
Output targets  • Assays for rice affected by arsenic and other toxic metals, and promising management options for identified target areas and cropping systems in 
2009  West Bengal and Bangladesh affected by the uptake of arsenic or other toxic metals. 
• Suitable management options and germplasm (rice, non‐rice) for dry season rice based cropping systems in salt affected areas in Bangladesh, India. 
• Analysis of the effects of fertilizer, crop, and soil management in rice‐maize systems on nutrient losses for the management of intensive rice‐upland 
crop systems (IRRI‐CIMMYT alliance). 
• Recommended technologies for minimum‐till and direct seeded rice production systems and policy options for South Asia. 
• Prototype integrated crop management systems and germplasm for water scarce conditions in the Philippines, India, China and Myanmar. 

IRRI Program 2 

51
52
 
 
 
 
 
  Outputs  Intended Users  Outcome  Impact 
Output 3  Integrated management options  Researchers at IRRI, in NARES in  Scientists of NARES and other  Improved environmental 
for improved environmental  south and south‐east Asia, China  institutions will use the new  sustainability and quality while 
sustainability in rice‐based  and in east and southern Africa  knowledge on ecosystem  increasing productivity of the rice 
landscapes developed by 2014.  ARIs  resilience, material flows and the  systems for farming families in 
Policy makers  hydrological cycles to develop  Asia.  
improved technologies and policy 
options. 
Output targets  • Comprehensive assessment of the present knowledge on the role of paddies in the hydrological cycle of watersheds. 
2007  • Methodologies to identify indicators of environmental sustainability at the landscape level in Malaysia.  
Output targets  • Methodologies and partnerships to study hydrological ecosystem services of paddies and monitoring systems at two rice based landscapes in Asia. 
2008  • Assessment of the role of surrounding habitats in pest management (insects, diseases, rodents and weeds) and novel ecologically based pest 
management options. 
Output targets  • Comprehensive assessment of the relations between ecological based pest management options, biodiversity and sustainability. 
2009  • Component understanding of the role of paddies in the hydrological cycle, the impact of water scarcity, and maintenance of ecosystem services at 
two pilot sites in Asia. 
• Options for managing water, crop residues (chemical, mechanical and biological), fertilizer and pesticides to reduce pollution in the environment 
(contamination of ground water; air quality). 

IRRI Program 2 
  
 
 
 
 
  Outputs  Intended Users  Outcome  Impact 
Output 4  Options to adapt rice systems to  Researchers and extension staff  NARES and ARIs use the  The widespread adoption of 
climate change, particularly higher  and farmers worldwide  knowledge of the likely effects of  germplasm and management 
temperatures and raised sea levels,  ARIs  climate change to develop and  options to address climate change 
and to minimize greenhouse gas  Policy makers  adapt strategies, germplasm, and  will help assure future harvests 
(GHG) emissions developed by  crop management options that  and well‐being of rice farmers and 
2014.  cope with climate change and  consumers worldwide. 
address challenges to food 
production. 
Output targets  • Rice and Climate Change Consortium with experimental sites in two countries. 
2007 
Output targets  • Climate change scenarios for the prediction of impact on major rice production areas. 
2008  • Assessment of soils, and water and nutrient management on GHG emissions and formulated options to increase carbon sequestration. 
• Germplasm for tolerance/avoidance of high temperatures, salinity and adaptation to future climates and target areas. 
Output targets  • Analysis of crop and pest responses to future climates. 
2009  • Management and policy options to reduce GHG emissions in water scarce rice production systems, including the rice‐wheat system. 
• Germplasm tolerant to high temperature, salinity and future climates, with tolerance mechanisms defined. 

IRRI Program 2 

53
54
 
 
 
 
 
  Outputs  Intended Users  Outcome  Impact 
Output 5  Strategies for uptake and impact of  NARES and NGOs in south and  NARES partners and other  The livelihoods of millions of rice 
research results in place by 2010.  south‐east Asia, China  institutions will use these  farming families in South Asia, SE 
Farmers  strategies to deliver improved  Asia and China will be enhanced 
Policy makers  technologies.  because of greater and faster 
ARIs    uptake of appropriate technologies 
Governments adopt policy options  to improve the sustainability of 
to facilitate the efficient delivery  rice‐based cropping systems. 
of improved technologies and 
management strategies for 
intensive rice‐based farming 
systems. 
 
Effective delivery of research 
results to farmers in 4 countries 
leads to uptake of technologies 
and integrated management 
strategies.  
Output targets  • Improved management practices and demonstration sites for intensive rice‐based farming systems, including rice‐wheat systems, in India, 
2007  Philippines and Vietnam. 
• Policy options for China and the Philippines on improved management for intensive rice‐based farming systems. 
Output targets  • Two integrated technologies and principles for sustainable, intensive, rice‐based production in Myanmar and Indonesia. 
2008  • Improved capacity of consortium NARES partners to conduct participatory research. 
• Scientific platform for developing and assessing adoption pathways. 
Output targets  • Improved management practices for intensive rice‐based farming systems, including improved productivity and sustainability of rice‐wheat systems, 
2009  in India, Indonesia, Philippines and Vietnam. 
• Improved knowledge on impacts of integrated technologies and management strategies at farmer and government levels in Indonesia, Philippines, 
and Vietnam. 
• Two integrated technologies and principles for sustainable production of rice‐maize systems for China and Vietnam (IRRI‐CIMMYT Alliance). 
 

IRRI Program 2 
Program 3
East and southern Africa: rice for rural incomes and an affordable urban
staple
 
Rationale
Sub‐Saharan Africa is now one of the world’s major “poverty islands.” About 130 million people 
in East and southern Africa (ESA) alone live in extreme poverty and more than 85% of these 
depend on agriculture. A large number of these people are rice consumers and many are small 
rice producers. A significant investment in agriculture is critical to eradicate hunger and poverty 
in ESA. Rural poverty in the ESA region could be significantly reduced if the efficiency of local 
rice production were improved in the key rice‐growing areas of Kenya, Mozambique, Tanzania, 
and Uganda.  
 
The demand for rice is increasing at more than 6% per annum from urban consumers of ESA who 
prefer imported rice from Asia because it is cheaper and of better quality. This shift in consumer 
preference has been driven by rapid urbanization, women’s growing participation in the formal 
labor force, and population growth resulting in a shift away from cassava, sorghum, millet, and 
maize. Presently, more than 500,000 tons of rice is imported into the ESA region annually and this 
costs more than US$100 million in foreign exchange. More than half a million very poor rice 
farmers in these countries could reduce their poverty by growing and selling rice to local urban 
markets and thereby replacing imported rice.  
 
Substantial potential exists for increasing crop yields. Although rice production has grown at 
over 2.5% per annum since 1990, this is mostly due to expansion of the rice‐growing area. Rice 
yields have remained low and stagnant at 1–2 t ha‐1 due to unfavorable rice environments and 
poor management. The lessons learnt from research in Asia have significant relevance to food 
security, poverty, and health.  
 
Initial investigations suggest that constraints to production include the limited range of available 
rice varieties, the lack of inputs such as reliable water, affordable fertilizer, and labor, as well as 
high postproduction losses and an inability to effectively access markets. While options to 
overcome many of these constraints already exist, an integrated, research‐ based approach is 
required to improve the quality and quantity of rice and to link farmers to local and regional 
markets. 
 
Current rice yields in the ESA region are generally low and investigations suggest considerable 
scope for the use of science to produce rapid improvement in productivity. The considerable 
research knowledge and expertise of IRRI can form a sound basis for a targeted, systematic 
research agenda that will meet the needs of the ESA countries. This research agenda will be 
developed in close cooperation with national programs and ARIs to capitalize upon both the 
existing knowledge within the countries and the available international expertise. 
 
Alignment with CGIAR System Priorities
The research for development program in East and southern Africa aligns with System Priorities 
2 and 5. The program will enhance the yield of rice (2A) and develop varieties with tolerance of 
abiotic stresses (2B) and enhanced nutritional quality (2C).The program will also address the 
reduction of rural poverty (5D) and make domestic markets work for the poor (5B).  

IRRI Program 3  55
 Impact Pathways
This program will target rice farmers in Kenya, Mozambique, Tanzania, and Uganda. These 
farmers will be encouraged and helped to grow new high‐yielding varieties that have good grain 
quality, using optimal production practices. Along with production changes, farmers will also be 
able to access improved postproduction management and benefit from market knowledge and 
linkages. 
 
A second target group is local scientists, technicians, and extension staff (including those from 
the private sector) who will be part of a broad‐based training program. The development of local 
capacity in rice‐growing and postharvest operations will increase the sustainability of an efficient 
rice‐growing sector in the target areas.  
 
Local applicability must be the fundamental criterion in choosing technologies. An 
understanding of existing farming systems and markets will guide research and determine the 
technologies best suited for adoption and sustainability. Institutional change can be catalyzed 
only through the participation of the major stakeholders in any project design and 
implementation. Participation of the national agricultural departments, universities, and 
agricultural colleges in research and training activities will increase national capacity. 
 
Research Approach to Develop International Public Goods
The goals of this research for development program are 
• to improve the efficiency of rice production and postharvest operations in key rice‐
growing areas in the target ESA countries by 30% within 10 years, and 
• to strengthen the capacity of local rice scientists, technicians, and extension staff in 
germplasm selection and adaptation, farm‐level production, postharvest methods, and 
marketing. 
 
Therefore, knowledge and products, such as germplasm and equipment, are the principal 
international public goods. The approach to be deployed in the program will help produce an 
overview of the African rice industry and impact that can be extended across a range of 
conditions. In addition, the research for development strategies used in the program are expected 
to have wider application across other regions in Africa.  
 
The first major challenge is to make available high‐yielding rice varieties with acceptable grain 
quality and resistance to major diseases and insects, and tolerance of abiotic stresses. There is a 
need to breed and disseminate improved rice germplasm adapted to local conditions. NERICA 
lines (derived from crosses between African Oryza glaberrima and Asian O. sativa) and lowland 
sativa rice varieties that are tolerant of major pests are now showing promise in some countries. 
However, selecting rice varieties with grain quality acceptable to local consumers is critical to 
move farmers from subsistence to commercial rice farming. 
 
Increasing rice yields and improving postharvest management are critical to producing quality 
rice at competitive prices. Although many of the technologies for production and postproduction 
have been developed and validated in a wide range of Asian countries, selecting the appropriate 
technologies, validating them in local environments, and then disseminating them to farmers will 
be the second major challenge.  
 

56 IRRI Program 3 
Another critical challenge is the lack of trained rice scientists and technicians who are able to 
develop germplasm and validate farming technologies. Therefore, a program of locally adapted 
capacity building is also urgently needed. 
 
Elaboration of Partners’ Roles
Through the East and southern Africa Program, IRRI will work with local collaborators, 
including the NARES, ARIs, NGOs, universities, and the private sector: 
• The East and Central African Rice Research Network (ECARRN), Kenyan Agricultural 
Research Institute (KARI), Mozambique Ministry of Agriculture and Rural Development 
(MADER), Tanzanian Ministry of Agriculture, Food, and Cooperatives (MAFC), and 
Uganda Ministry of Agriculture, Animal Industry, and Fisheries (MAAIF) to develop 
research priorities and formulate policy options by 2009 through characterization of the 
rice production environment and markets with regard to productivity potential and 
environmental stress, and their interface with poverty in the four target countries. 
• The Africa Rice Center (WARDA), KARI, and National Institute for Agronomic Research 
in Mozambique (INIA) to develop elite lines with genes for stress tolerance and the 
program will use the existing skills from both African and Asian partners. 
• The Sasakawa Global 2000 Mozambique (SG2000), MAFC, MAAIF, KARI, Aquifer LTD 
and the private sector to enhance sustainable production and postharvest rice‐based 
technologies by validating and delivering new technologies to farmers. The new 
technologies will draw upon the extensive work done in Asia by IRRI, its consortia, and 
its partner NARES. IRRI will collaborate with SG2000, ECARRN, Japanese International 
Cooperative Agency (JICA), local universities such as Sokoine University of Agriculture, 
Tanzania, and international universities to enhance the capacity of key rice scientists, 
technicians, and extension staff drawing upon the facilities and expertise of other CG 
centers as appropriate. 

Program Outputs
The ESA program will draw on the considerable research that has been conducted by IRRI across 
Asia. The results of genetic resource development and farming systems research in Asia will be 
carefully evaluated for integration into the African environment. This program for East and 
southern Africa will concentrate on the following priority outputs: 
 
1. Research priorities and policy options formulated by 2009 through characterization of the rice 
production environment and markets with regard to productivity potential and environmental stress 
and their interface with poverty. 
An assessment of the rice production environment will gather socioeconomic, production, 
and market information to enable a better understanding of rice production with regard to 
the whole farm enterprise and food security. Changes in resource availability, and evidence 
of threats to sustainability (including farmer practices and habits) will also be researched. 
Although a market exists for imported rice in the ESA countries, the market and demand for 
domestic rice is not yet developed. This initiative will strive to develop and promote markets 
for domestic rice. 
 
2. Elite lines including O. glaberrima derivatives with genes for stress tolerance validated by 2010. 
It is necessary to assess the currently used germplasm and test new cultivars with improved 
resistance to pests and diseases that also have desirable quality traits. The rice varieties being 

IRRI Program 3  57
 grown in the rainfed areas of ESA are susceptible to indigenous pests and diseases such as 
rice yellow mottle virus, African gall midge, blast, and Striga.  
 
3. Sustainable production and postharvest rice‐based technologies for both seed and grain farms validated 
by 2010. 
These technologies will aim at solving problems of water management, nutrition, and pest 
management, as well as postharvest problems in harvesting, drying, storage, and milling 
facilities. 
 
4. Capacity of key rice scientists, technicians, and extension staff to conduct research and to validate and 
disseminate technologies strengthened by 2010. 
Well‐trained staff are needed to ensure that relevant research is implemented, that systems 
are sustainable, and that technologies are communicated effectively to farmers.

58 IRRI Program 3 
  
 
 
 
 
MTP Project Logframe 
Program 3. East and southern Africa: rice for rural incomes and an affordable urban staple 
  Outputs  Intended Users  Outcome  Impact 
Output 1  Research priorities and policy  IRRI   A network of key policy makers  The increased productivity of 
options formulated by 2009  ARIs   and researchers use a validated and  sustainable rice‐based systems in 
through characterization of the rice  NARES including private sector  approved regional rice research  ESA derives from the targeted and 
production environment and  and development plan.  efficient regional rice research and 
markets with regard to  development program. 
productivity potential and   
environmental stress and their 
interface with poverty. 
Output targets  • A network of key policy makers and researchers in the four target countries. 
2007  • Understanding of the rice environment in the four target countries for research, production, and marketing.  
   • Analysis of the capacity of regional scientists and extension officers to conduct research and extension in the four target countries.  
Output targets  • ESA regional plan for research on rice production systems, development initiatives, and capacity building. 
2008 

Output 2  Elite lines including O. glaberrima  IRRI   NARES develop and use elite  New varieties increase profits for 

derivatives with genes for stress  WARDA   varietal lines appropriate to ESA  farmers and availability of higher 
tolerance validated by 2010.  ARIs   rice environments in their research  quality rice for consumers.  
NARES  and breeding programs. 
Output targets  • A network of rice breeders from key institutes across the four target countries. 
2007 
Output targets  • A coordinated breeding program across at least two ESA target countries. 
2008 
Output targets  • A coordinated breeding and seed multiplication program across all ESA target countries. 
2009 

IRRI Program 3 

59
60
  Outputs  Intended Users  Outcome  Impact 
Output 3  Sustainable production and  Farmers   NARES and other users promote  Improved quality and quantity of 
postharvest rice‐based  Post harvest commercial sector  efficient production and post‐ rice produced and stored by 
technologies for both seed and  NARES researchers and extension  production technologies for ESA.  farmers and the commercial sector 
grain farms validated by 2010.  agents,  increases their profits and 
NGOs  enhances the availability of higher 
quality rice for consumers. 
Output targets  • Understanding of existing crop production and post‐harvest management systems and opportunities for change. 
2008 
Output targets  • Strategies to improve relevant crop production and post‐harvest management systems. 
2009 

Output 4  Capacity of key rice scientists,  CG Centers  Scientists and extension officers  The products of rice research in 

technicians, and extension staff to  ARIs   use their improved skills in  ESA are delivered to farmers more 
conduct research and to validate  NARES  research, breeding and extension  efficiently and effectively.  
and disseminate technologies  activities. 
strengthened by 2010. 
Output targets  • Enhanced capacity of scientists from ESA through targeted in‐country and regional training courses and international training opportunities.  
2008 
Output targets  • An expanded cadre of rice scientists in ESA. 
2009 
 

IRRI Program 3 
Program 4
Rice and human health: overcoming the consequences of poverty
 
Rationale
The new IRRI Program 4, Rice and human health: overcoming the consequences of poverty, is both an 
outcome of the development of Goal 3 in IRRI’s new strategic plan and a mechanism to bring 
together the multiple rice biofortification projects (including the HarvestPlus Challenge Program) 
and other health‐related efforts that already investigate germplasm, farm practices, and policy 
options.  
 
Underpinning maximum success in meeting many of the Millennium Development Goals is the 
need to solve the widespread problems of health and nutrition that debilitate people and hinder 
economic growth. Some 1.2 billion people in Asia and sub‐Saharan Africa live in extreme 
poverty. Many of these do not have access to a diverse diet that provides the requisite suite of 
minerals and vitamins for healthy growth and development. Poor nutrition is manifested in 
invisible nutritional deficiencies (hidden hunger) and in malnutrition (visible hunger). The 
accumulation of noxious compounds in the rice grain during cultivation and storage can lead to 
serious health concerns for rice consumers. In addition, poor health in the context of rice 
cultivation may be related to chronic and infectious diseases from water and from vectors such as 
rodents and mosquitoes, as well as illness resulting from improper use of chemicals.  
 
Alignment with CGIAR System Priorities
Outputs 1 and 2 address System Priority 2C that deals with the development of biofortified crops 
and the validation of this approach to enhance the diets of disadvantaged populations in 
developing countries, respectively. The successful deployment of such improved crops is 
anticipated to require appropriate communication activities also. 
 
Output 3, focusing on the caloric efficiency of rice grains, also contributes to Priority 2C. 
 
Specific reference is also made in Priority 2C to aflatoxin (mycotoxin) contamination of food, as a 
result of microbial contamination and growth, and in the context of factors that further limit the 
potential use (and value) of staples by the poor. Output 4 seeks to address the problem of 
cadmium and other undesired components of rice that are consistent with this. A related 
connection can be made through Priority 5B, which requires participation in research and 
communication to enable poor producers to supply markets effectively and to comply with 
current and emerging food safety requirements, especially as related to mycotoxin 
contamination. In the broader context of Priority 5, of reducing vulnerability of the poor, and 
especially in the context of the biophysical environment, efforts to reduce the incidence of human 
diseases associated with the cultivation practices of rice would be appropriate. 
 
Impact Pathways
The initial target populations for impact are women and young children in the major poverty 
areas of Asia, but also soon after in Africa. For Golden Rice output targets, the partners in India 
are coordinated through the Golden Rice Network Coordinator‐India of the Department of 
Biotechnology of the Government of India. For the Philippines, the partners include PhilRice and 
will also include the leading nutrition institutions in the country, such as the University of the 
Philippines‐Los Baños and the Food and Nutrition Research Institute. For Bangladesh and 
Vietnam, the lead partners are the Bangladesh Rice Research Institute and the Cuu Long Delta 

IRRI Program 4  61
 Rice Research Institute, respectively, and the national nutrition and other partners that they will 
nominate.

Elaboration of Partners’ Roles

For many of the outputs in Program 4, the delivery chain includes the NARES partners for the co‐
development and expansion of germplasm and agricultural practices. However, the Institute 
must greatly expand its interactions with the public health sector in developing countries, both 
for policy and for deployment effectiveness. This process has already begun in the Golden Rice 
Network for India and the Philippines and these will serve as models for other products. The 
existing structures in the Golden Rice Network and in HarvestPlus have already brought 
together many of the relevant national and regional institutions for impact. In addition, the role 
of the private sector (seed and food processing) must be further explored to maximize the 
complementary values for biofortification and other food‐based approaches to reducing the 
burden of micronutrient deficiencies, and especially for the roles of the food sector in adopting 
and promoting consumption of the new materials. Certainly for Golden Rice and a number of the 
other biofortified products, a transgenic approach is the only viable option. To date, no such 
transgenic rice has been adopted, and this challenge must be met. IRRI’s capacity and track 
record in social sciences and its participation in a number of ongoing international consortia and 
initiatives suggest that IRRI is well placed as an organization to assist in the assembly of consortia 
to support the widespread adoption of nutritionally enhanced and transgenic rice.  
The increased understanding that will be gained in Output 3 and the strategies developed in 
Output 4 will also include the value of these traits to partners and will thereby also define the 
partners and their roles. 
 
Research Approach to Develop International Public Goods
Certain products of the research for development activities of IRRI’s Program 4, especially 
publications and other communications, can be provided as international public goods. However, 
in other aspects of developing its products and services, IRRI is guided by its obligations and 
opportunities under bi‐ and multilateral agreements that largely govern its use of germplasm, for 
example. In addition, especially in the area of transgenics, IRRI is the recipient of advanced 
technologies provided under specific Material Transfer Agreements. In all of these transactions, 
IRRI strives to ensure that it receives materials and technologies under terms that permit it to 
share the subsequent products of its research as broadly as possible. 
 
Program Outputs
1. Nutritionally enhanced rice germplasm developed by 2009. 
2. Strategies for the development, promotion, and delivery of biofortified rice, including transgenic rice, 
by 2010 for India and the Philippines, and then for Bangladesh, China, and Vietnam. 
These two outputs bring together the ongoing and planned efforts on the development and 
deployment of rice germplasm with increased content and/or bioavailability of pro‐vitamin A, 
iron, zinc, and vitamin E, and with improved protein quality (higher lysine content). These 
outputs build on existing commitments of the Institute under HarvestPlus, the Golden Rice 
Network, and the Bill and Melinda Gates Foundation Grand Challenge #9 project (through 
the University of Freiburg). Output 1 will also move IRRI to evaluate the need for and 
development of solutions to additional micronutrient deficiencies (e.g., vitamin B1).  
 
 
 

62 IRRI Program 4 
3. Increased understanding of the roles of macromolecules in rice grains for caloric efficiency by 2010. 
This represents an opportunity for IRRI to explore additional benefits from its grain quality 
research and to define a research agenda that will guide any expansion of its work on the 
understanding of digestibility and food (caloric) value of different rice varieties. This output 
could lead to improved varieties with greater digestibility and with greater storability of 
cooked rice. The increased understanding will also include the value of these traits to 
partners and will thereby also define the partners. 
 
4. Strategies to reduce contamination of rice grains and to improve practices that decrease risks to human 
health developed by 2012. 
The IRRI strategic plan Goal #3 also anticipates new or expanded research that serves to 
understand better the sources of contamination of rice grain that pose a risk to human health 
and to the development of germplasm or cultivation practices that reduce the accumulation 
of such toxic contaminants in the grain. IRRI will address the consequences of rice cultivation 
and handling and of the poor quality of soil and irrigation water in a number of 
environments. The health of rice consumers is threatened when the rice they eat is 
contaminated.  
 
Currently, the two most important types of contamination are toxins, such as arsenic and 
cadmium, and microbial toxins such as mycotoxins. Arsenic accumulates in the maternal 
tissue of the rice, such as bran, when contaminated water is used to irrigate plants, but the 
amount that accumulates in milled rice is likely to be smaller. The risks to consumers’ health 
occur from consumption of (i) unpolished or undermilled rice from plants irrigated with 
arsenic‐containing water and (ii) rice cooked in arsenic‐containing water. Mycotoxins, which 
are introduced by contaminating pathogens, can occur in the grain if the crop is incorrectly 
handled during grain‐filling, harvest, or storage. Mycotoxin contamination can be decreased 
by changing postharvest handling and processing practices. The sources of contamination of 
rice with arsenicals, cadmium, and other toxic metals and metalloids will need to be 
understood—severity and health consequences—and both germplasm and crop management 
options developed. This work builds on ongoing work in Bangladesh and India on 
addressing the severe arsenic contamination issues associated with tube‐wells and 
contaminated farm land. The accumulation of mycotoxins in the rice grain may be an 
emerging issue both directly for rice consumers and for its implications for the restriction of 
trade. A greater understanding of the prevalence and implications of this problem needs to 
be gained and germplasm and management options prioritized. Awareness by NARES and 
the relevance of the problem to national policy will be important components in the 
prioritization of the activities for this output. This expanded interest builds on the 
postharvest storage research of the Institute. 
 
Building on a long‐standing commitment of the Institute to improve the rice farm 
environment by addressing the overuse of pesticides in rice farming, IRRI will also seek to 
understand and reduce the incidences of on‐farm occupational and accidental poisonings 
due to pesticides. With a concern about the appropriate use of pesticides in rice cultivation, 
and building on existing work on helping farmers understand when pesticides are needed, 
IRRI will need to understand the implications of on‐farm pesticide handling and storage and 
develop protocols to minimize occupational and accidental poisoning. Similarly, policies may 
be developed and communicated for the safer use of farm machinery and equipment. 
 

IRRI Program 4  63
 IRRI needs to assess more fully the impact of rice cultivation on the prevalence of water‐
borne and related diseases for human and farm animal health. The health of rice farmers, 
their families, and the rural landless who work on rice farms is threatened by a number of 
water‐borne and zoonotic diseases, such as schistosomiasis, leptospirosis, malaria, dengue, 
and even bird flu. These are both chronic and acute diseases. If a rice farmer or laborer is 
disabled by a chronic disease during rice production, the family risks losing its sole or main 
source of income. Moreover, the commonly known and emerging diseases provide a 
potential barrier to innovative rice‐based cropping systems being developed by IRRI. Strong 
trans‐disciplinary expertise in farming systems, animal ecology, resource economics, and 
agricultural anthropology places IRRI in a unique position to instigate innovative 
partnerships to develop simple and practical options to reduce the impact of these diseases 
on farmers’ livelihoods and the barriers they may create in specific ecosystems for the 
delivery of impact from IRRI’s current and future research.  
 
An outcome of this concern and assessment would be the development and promotion of 
cultivation practices to reduce the prevalence of water‐borne and other diseases. IRRI needs a 
more comprehensive understanding of the implications of current practices on water‐borne 
and zoonotic diseases and needs to look to expand beyond its historical work in this area. 
Critically, IRRI must understand the implications of its recommendations and practices for 
rice cultivation in Africa, where this problem may be more acute. The strategies that will be 
developed under Output 4 will also determine their value to partners and will thereby also 
define the partners, as well as the scope of the Institute’s direct involvement in research 
activities. 

64 IRRI Program 4 
  
 
MTP Project Logframe 
Program 4. Rice and human health: overcoming the consequences of poverty 
  Outputs  Intended Users  Outcome  Impact 
Output 1  Nutritionally enhanced rice  IRRI researchers and breeders  The intended users will exploit the  Rice consumers will benefit from 
germplasm developed by 2009  NARES scientists   germplasm lines in their research  the increased availability of rice 
Private sector (subject to licenses)  and breeding programs.   with a better nutritional content. 
Public health sector   
Farmers  Public and private seed companies 
will deliver seed to farmers.  
 
NARES and the public health and 
food sectors will promote 
nutritionally‐enhanced grain to 
consumers. 
Output targets  • The lead Golden Rice ‘transgenic event’ ready for final development. 
2007 
Output targets  • The leading two high iron germplasm lines from conventional breeding for NARES. 
2008 
Output targets  • Understanding of the bioavailability of zinc in high zinc rice. 
2009 

IRRI Program 4 

65
66
  Outputs  Intended Users  Outcome  Impact 
Output 2  Strategies for the development,  Public health policy makers  The strategies are used to Integrate  The consumption of biofortified 
promotion, and delivery of  NARES scientists   biofortified rice into the  rice will reduce morbidity and 
biofortified rice, including  NGOs  complementary, food‐based  mortality, especially in women and 
transgenic rice, by 2010 for India  intervention approaches that  children, caused by those diseases 
and the Philippines, and then for  address nutritional deficiencies.  exacerbated by micronutrient 
Bangladesh, China, and Vietnam.  These strategies will lead to  deficiencies. Furthermore, there 
Increased awareness of the  will be a decreased prevalence of 
benefits of transgenic, biofortified  mineral and vitamin deficiencies 
rice.  in poor rice‐consuming women 
and children (under 5). 
Output targets  • Communication plans to highlight the benefits of transgenic, biofortified rice for the Philippines and India. 
2007 
Output targets  • Health policy‐based deployment plan for Golden Rice for India. 
2008 
Output targets  • Health policy‐based deployment plan and seed production for Golden Rice in the Philippines. 
2009 

Output 3  Increased understanding of the  IRRI breeders and researchers  This knowledge is used to identify  Rice with a better starch profile 

roles of macromolecules in rice  NARES scientists   and breed rice germplasm with a  contributes to the health of 
grains for caloric efficiency by 2010    better starch profile.   undernourished people by 
delivering more calories per meal. 
Output targets  • Understanding of the target populations, product concepts, and lead technical approaches. 
2008 
Output targets  • Analysis of the link between starch structure and product concept. 
2009  • Assessment of the in vivo effectiveness of lead technical materials. 

IRRI Program 4 
   Outputs  Intended Users  Outcome  Impact 
Output 4  Strategies to reduce contamination  IRRI breeders and researchers  Researchers and breeders will  Reduction in occupational and 
of rice grains and to improve  NARES scientists   exploit the germplasm lines  accidental health consequences of 
practices that decrease risks to  Public and private industry    rice cultivation and consumption. 
human health developed by 2012  researchers  Public and private seed companies 
Agricultural and public health  will deliver seed to farmers.  
policy makers   
Farmers  NARES and policy makers will 
promote improved agricultural 
practices 
Output targets  • Germplasm resistant to accumulation of toxic contaminants in grains.  
2008  • Understanding and selection of targets regions and practices. 
Output targets  • Management options, technologies and strategies for minimized mycotoxin contamination. 
2009  • Increased capacity of NARES in target areas for the adoption and extension of strategies for reducing mycotoxins and heavy metals and other 
contaminants. 
 
 

IRRI Program 4 

67
 Program 5
Rice genetic diversity and discovery: meeting the needs of future
generations for rice genetic resources

Rationale
Genetic diversity is the foundation of the genetic improvement of crops. Knowledge of multiple 
facets of rice genetic diversity—from molecule to phenotype—is essential for effective 
conservation and use, for both current and future needs. Among all crop species, rice is 
exceptionally well endowed with genetic resources and advanced genetic tools that make it a 
model genetic system. The international rice genome sequencing efforts have generated complete 
genome information for indica and japonica rice varieties. This, together with expanding genomic 
information in other plant species, presents a new paradigm to understand, explore, and use rice 
genetic resources.   
 
IRRI is the custodian of the world’s largest ex situ collection of rice germplasm, covering 
traditional and improved varieties as well as wild relatives. Shared use of the germplasm 
collection has served rice breeding and research activities well. Yet, only a small fraction of the 
rice genetic resources has been used in breeding. We expect a greater demand for specific genetic 
resources to address production and environmental problems in the future. This will translate 
into a greater demand for the genetic knowledge and tools that are needed to identify and use 
resources that meet specific needs.   
 
Genetic knowledge can now be integrated across species through comparative genomics analysis, 
leading to accelerated discovery of gene functions. Furthermore, genome‐wide analysis has the 
potential of revealing new insights about genetic pathways, and creating new opportunities to 
meet both anticipated and unforeseen challenges. Abundant and accessible genetic diversity, 
either natural or induced, is a requisite for understanding biological processes. On the other hand, 
uncharacterized genetic diversity will remain unused. Thus, conservation, generation, and 
characterization of genetic diversity and discovery of gene functions are interdependent activities 
that need to be integrated to achieve desired outcomes.   
 
This program will have three components:   
• Genetic diversity characterization and creation, and gene function assignment. 
• Germplasm conservation and documentation. 
• Enabling access to and use of genetic diversity and associated tools.   
The program will house activities of an exploratory nature in the genetic components of the 
Frontier Projects. We will implement this program through extensive collaboration with NARES 
and ARIs in consortia and networks.   
 
Alignment with CGIAR System Priorities
The conservation and characterization of rice germplasm to meet the needs of future generations 
align exactly with System Priority 1A. The discovery of gene function component of this program 
provides the genetic knowledge to address a wide variety of agronomic traits, including yield 
stability, tolerance of stresses, and nutritional quality, which are essential elements of System 
Priorities 2A, 2B, and 2C.   

Impact Pathways
Bringing together germplasm conservation, diversity analysis, and gene discovery under a single 

68 IRRI Program 5 
program presents a unique opportunity to maximize the utility of conserved and customized 
germplasm. The main outputs of this program will be a comprehensive, well‐documented 
germplasm base, a public research platform to enable gene identification, and genetic knowledge 
for priority traits.   
 
Through the continuum of conservation‐discovery‐dissemination, we form the foundation for 
translating genetic diversity and genomic sciences into practical applications. Broadened access 
to genetic resources and genomic tools by breeders, researchers, and plant biologists is expected 
to improve the efficiency of rice breeding and gene discovery activities by NARES and ARI 
partners. The identification of genes controlling specific traits and dissemination of such 
knowledge and tools will enable precision breeding and accelerate the achievement of breeding 
targets. An essential condition to achieving program impact is an open environment in 
germplasm exchange and sharing. Another critical factor is the mobilization of the global 
research community to decipher functions of agriculturally important genes in rice through a 
consortium approach.   
 
Research Approach to Develop International Public Goods
This program is designed to address the needs for gene function identification in current 
germplasm improvement and to provide a platform and knowledge base by which genetic 
diversity can be effectively conserved and used for the long term. Building upon the investments 
and achievements made in the upgrading of the International Rice Genebank, germplasm 
characterization, functional genomics, and bioinformatics, IRRI is poised to play an important 
role at the interface of gene function discovery, applications of genetic knowledge, and 
conservation and sharing of genetic resources.   
 
Understanding all rice gene functions is clearly an enormous task beyond the capacity of 
individual institutions, but it is of long‐term importance, and a task in which IRRI will 
strategically engage based on its comparative advantages. We will contribute to the 
determination of the basic functions of all rice genes and the diversity of rice through a 
worldwide consortium of public‐ and private‐sector organizations. The immediate demands are 
exemplified by the need to apply genomic analysis, in this and other IRRI programs, toward (i) 
developing stress tolerance, (ii) enhancing the nutritional value of germplasm, and (iii) enhancing 
the market value of rice through predictable quality. Future needs are addressed by preparing a 
robust genetic platform of gene/allele identification resting upon a comprehensive collection of 
rice germplasm and specialized genetic stocks.   
 
Elaboration of Partners’ Roles
In building a public genetic research platform for rice, this program needs extensive partnerships 
with ARIs to tap into the upstream science while at the same time enhancing the capacity of 
NARES through adapting and disseminating new tools. IRRI forms a close alliance with 
universities and research institutions with excellence in genomic research and applies the tools 
and findings to address agronomic problems that are relevant to NARES. Key partnerships are 
embodied in the International Rice Functional Genomics Consortium that involves a “federally” 
coordinated network of collaborators from institutions and laboratories worldwide. IRRI’s role is 
to continue to sustain this collaborative network by mobilizing complementary genetic resources 
and expertise to examine relevant problems. This approach is exemplified by collaboration 
supported by the USAID Linkage Program and competitive grant programs in the U.S., where 
in‐depth studies in stress physiology (e.g., submergence) are conducted and new tools (e.g., 

IRRI Program 5  69
 genome‐wide genotyping) are developed using IRRI’s advanced genetic stocks. We will also seek 
new methodologies to help IRRI to accelerate the development of efficient systems for gene 
function verification (e.g., improved RNAi technologies from various research laboratories in 
Japan and the U.S., and the newly developed artificial micro‐RNA gene‐silencing technique at the 
Max Planck Institute in Germany).   
 
In the production of specialized genetic stocks and their phenotypic evaluation, collaboration 
includes many NARES partners with a wealth of knowledge on useful traits and germplasm and 
providing appropriate agronomic environments for phenotyping. For example, the China 
National Hybrid Rice Research and Development Center will provide parents of super 
high‐yielding hybrids to produce the mapping populations for the investigation of heterosis and 
genotype × environment interactions. In turn, the genetic materials produced at IRRI can be 
distributed to a wide range of users for phenotyping and gene identification.   
 
Partnership with the Generation Challenge Program is particularly important to Program 5 given 
the shared objective of building an efficient gene discovery platform. Rice as a genetic model has 
much to offer to the GCP whereas the comparative biology agenda and triangular partnerships 
among ARIs, NARES, and CGIAR centers advanced by the GCP have enabled IRRI to expand its 
partnership with institutions working on plant systems other than rice. In launching the Frontier 
Projects on C4 rice and drought, we expect more intensified collaboration involving world 
authorities on plant biochemistry and physiology across plant models. These types of 
collaboration will be central to the delivery of a public research platform (Outputs 1 and 2) and 
generating new knowledge on genetic pathways and functions (Output 3).   
 
For germplasm conservation (Output 4), a global network of genebanks and curators will be 
created under the auspices of the Global Crop Diversity Trust and will be the means to ensure 
coordinated conservation of rice genetic resources across the world without undue duplication. 
Projects funded by the World Bank, such as the Genebank Upgrading Project and the recently 
initiated system‐wide Global Public Goods II project, lay the groundwork for better coordination 
of efforts across not only CG partners but also the NARES and ARIs that hold rice genetic 
resources. Within the System‐wide Genetic Resources Program (SGRP), particular emphasis is 
given to collaboration with the Africa Rice Center (WARDA) and CIAT, to establish new 
approaches to jointly improve the efficiency of maintaining and delivering appropriate 
germplasm in Africa, Latin America, and Asia. 
 
For the dissemination of genomic resources and tools, our primary partners are NARES that are 
instrumental in testing and applying research products for germplasm enhancement. The Asian 
Rice Biotechnology Network involves both ARIs and NARES in training and assisting NARES 
partners in adopting new tools in their research and breeding programs. Our NARES partners 
also contribute to the collection and characterization of local germplasm for the development of 
useful genetic stocks.   

Program Outputs
The program has five outputs. Outputs 1 to 3 concern the generation of data and resources for 
gene discovery, hence providing a public research platform for exploring germplasm and 
extracting useful genes for traits of interest in the near and long term. Output 4 addresses 
expanding conservation and enhancing efficiency in handling conserved germplasm. Output 5 
deals with the dissemination of genomic tools and enhancing capacity of NARES. It is anticipated 

70 IRRI Program 5 
that the information products of the Program 5 outputs will be captured and analyzed in 
Program 6, Information and communication: convening a global rice research community. Elaboration 
on each of these outputs is given below.   
 
1. Genetic diversity platform for gene function identification in domestic and wild rice gene pool 
established by 2011. 
This output will be achieved by applying genome‐wide characterization of selected 
germplasm to associate molecular variation and phenotypes. Emphasis will be on the use of 
SNP and phenotypic data for association genetics. We will develop and implement forward 
and reverse genetic systems, which include high‐throughput gene validation, phenotypic 
screens, and the identification of functional alleles in mutants and germplasm pools. We will 
strive to adopt high‐throughput methodologies that are cost‐effective and broadly accessible. 
The knowledge of genetic and phenotypic diversity will contribute to gene function 
discovery through partnership with the International Rice Functional Genomics Consortium.   
 
2. Specialized genetic stocks for trait dissection produced by 2011. 
A prerequisite for assigning functions to genes is an array of customized genetic stocks that 
enable co‐segregation analysis between genetic and phenotypic variation. IRRI has already 
produced a large collection of chemical‐ and irradiation‐induced mutants and a variety of 
mapping populations from which traits of interest can be associated with small chromosomal 
segments. This output will concentrate on the generation of diversity panels that include 
mutants of specific genotypic backgrounds, recombinant inbred lines (RIL), chromosomal 
segment substitution lines (CSSL), and near‐isogenic lines (NIL). Some of the specialized 
stocks are already in place or to be consolidated, whereas new ones will be produced within 
five years. The production of these genetic stocks will be scalable and responsive to needs to 
enable gene function validation.   
 
3. Genetic pathways for selected traits determined using genome‐wide and comparative biology 
approaches with priorities on stress tolerance, nutrition and grain quality, and yield by 2015. 
Understanding the genetic regulation of a specific trait provides the knowledge for precise 
genetic manipulation. Building upon IRRI’s previous work and its capacity, the primary focus 
will be on pathways controlling biotic and abiotic tolerance, nutrition and quality, and yield 
potential, to provide a pipeline of genetic information for applications in germplasm 
improvement activities in other programs. Customized genetic stocks produced in Output 2 
and by the global research community will be used to dissect pathways and validate gene 
function. Genome‐wide experimental approaches will be used to reveal the genetic 
regulation and interactions of these pathways. In relation to Programs 1, 2, and 4—which 
have specific breeding targets—this output will concentrate on gene discovery and functional 
assessment of candidate genes in major QTLs. These activities can be directly applicable to 
specific environments or transcend environmental and ecosystem divisions. Detailed 
information on the functional roles of contributing loci will help to select the best possible 
alleles for gene pyramiding in breeding programs. 
 
Output 3 will contribute to the genetic components of the Frontier Projects on Drought 
Tolerant Rice and C4 Rice and the ongoing work on biological nitrogen fixation. Cross‐species 
comparative analyses will be used to identify genetic loci with a significant contribution to 
target traits. Comparative genomic analysis with C4 plants (maize, sorghum) will be 

IRRI Program 5  71
 particularly important in the exploration of C4‐like traits for frontier projects. Because of the 
exploratory nature of certain activities, the output targets are formulated based on the 
probability of success for individual traits over a 5‐ and 10‐year horizon. In the near term (3 
years), we expect concrete results from understanding the basis of broad‐spectrum disease 
resistance and tolerance of abiotic stresses such as salinity and problem soils. Based on the 
progress in drought research, we expect to identify key genetic factors conditioning drought 
tolerance within 5 years. For the Frontier Projects such as C4 rice and biological nitrogen 
fixation, long‐term (10 years) strategic exploration will be necessary.   
 
4. Ex situ conservation of rice germplasm expanded and enhanced through better understanding of the 
genetic diversity within and between collections in a global network by 2011 to contribute to long‐term 
conservation efforts, harmonized with genebanks in other CGIAR institutes through the SGRP. 
This output will be achieved by devising a rationalized system for the conservation of rice 
genetic resources in collections worldwide through a global network. Global conservation 
capacity will be improved by implementing a system for managing genetic overlaps among 
rice genebanks. We will work with genebanks worldwide to improve the economic efficiency 
and effectiveness of conservation. The expanded capacity will enable conservation of a wider 
range of genetic stocks, including breeding lines, mutants, mapping populations, and 
transgenic rice. We will also work with other genebanks in the CGIAR through the SGRP to 
develop and implement the highest standards of germplasm conservation and use, data 
management, and adherence to international policies. Secondly, a prerequisite to increasing 
the genetic diversity of conserved germplasm is an improved understanding of the diversity 
of Oryza, and a revised taxonomy and phylogeny and domestication history. Taxonomic and 
phylogenetic analysis will be conducted to determine the genetic relationship of the rice 
germplasm and its wild relatives. We will aim for a fully documented database of the genetic 
diversity of existing collections in the International Rice Genebank at IRRI.   
 
5. Long‐term broadened access to genomic resources and associated tools, particularly for NARES. 
Continuing upgrading of skills and capacity is essential for NARES to benefit from the new 
tools developed. This output emphasizes broadening access to genomic resources and newly 
developed tools by NARES partners. Through collaborative research, we will serve to link 
ARIs and NARES in the dissemination of new resources and tools. We will achieve this 
through a network mechanism that provides training and shuttle research opportunities. 
Because the capacity for uptake is different for different NARES, the time line for this output 
will vary among partners.   

72 IRRI Program 5 
  
 
 

MTP Project Logframe 
Program 5. Rice genetic diversity and discovery: meeting the needs of future generations for rice genetic resources 
  Outputs  Intended Users  Outcome  Impact 

Output 1  Genetic diversity platform for  IRRI  The genetic diversity platform  Efficient use of functional 

gene function identification in  NARES  will be used:  diversity in germplasm will 
domestic and wild rice gene pool  ARI scientists  • as a new paradigm in the use  accelerate the production of 
established by 2011.  Germplasm curators  of germplasm in NARES’  adaptive rice germplasm.   
breeding programs; 
• to facilitate better 
understanding of rice allelic 
diversity for improved 
utilization of rice germplasm; 
• to expand opportunities to 
identify useful genetic 
diversity in germplasm 
collections through the use of 
enabling genetic techniques 
and SNP data; and   
• to broaden access to 
favorable alleles associated 
with traits available for 
breeding. 

IRRI Program 5 

73
74
Output targets  • Genome‐wide SNP dataset for 20 rice lines as a foundation for developing haplotype tags in multiple rice lines 
2007  • 1500 indica/japonica SNPs described in 900 accessions.   
   • Reverse genetic systems (e.g. agarose gel TILLING) for extracting allelic variants from germplasm and mutant pools. 
• Descriptions of allelic diversity and phenotypes for a minimum of 10 genetic loci underlying stress tolerance, nutritional and grain quality traits. 
• Robust transformation protocols with efficiency increased by 5% and including a new set of vectors. 
Output targets  • Genome‐wide genotyping (using SNP tags or alternative sequencing tools) and phenotypes for target traits for 1000 multiple varieties, key 
2008  donors, and wild relatives samples. 
• 100 germplasm lines with contrasting phenotypes and detailed phenotyping on drought and disease responses. 
• High‐throughput rice genome engineering capacity to produce 10,000 transgenic plants. 
• A validated artificial micro‐RNA as a gene‐silencing tool in rice using three candidate genes. 
Output targets  • 100 chromosomal regions with candidate genes and phenotype association in OryzaSNP germplasm. 
2009  • Confirmed allelic series (average 5 per locus) in 50 candidate genes that confer improved tolerance to abiotic or biotic stresses (drought, salinity, 
cold, and diseases). 
• Characterized genetic variants of 5 promoters from different accessions in genebank. 

IRRI Program 5 
   Outputs  Intended Users  Outcome  Impact 

Output 2  Specialized genetic stocks for trait  Researchers  Research community uses the  Discovery of genes and gene 

dissection produced by 2011. 
Breeders  well‐characterized genetic stocks  combinations enables 
for gene function identification  development of adaptive 
  germplasm. 
ARI and NARES collaboration is 
promoted because of the 
availability of stocks. 
Output targets  • A panel of knock‐out mutants (~50) in IR64 and other genotypic backgrounds (FL478, SHZ‐2, Jinbubyeo) with characterized phenotypes 
2007  (response to drought, cold, salinity, diseases, and insect) available for cloning of target genes.   
• A set of drought tolerant pyramiding IR64 lines with specific QTL s for dissection of drought tolerance. 
Output targets  • Chromosome segmental substitution lines (CSSL) from one accession each of O. glaberrima, O. longistaminata and O. rufipogon in the background 
2008  of O. sativa and shared with NARES and ARIs. 
• A set of salinity tolerant pyramiding IR64 lines with specific QTLs for dissection of salinity tolerance. 
Output targets  • At least 10 RIL (F6) or BIL (BC2F3) populations involving crosses between donor and mega‐variety recipients, providing segregating materials to 
2009  validate association genetic studies.   
• A set of RILs with chromosomal segments associated with hybrid heterosis. 
• A series of near‐isogenic lines (NILs) for resistance genes against bacterial blight, blast, brown planthopper, tungro, and grain‐quality traits. 
• NILs with narrow chromosomal segments (at 0.5 Mb resolution) conferring tolerance to drought and salinity in mega‐variety backgrounds. 

IRRI Program 5 

75
76
  Outputs  Intended Users  Outcome  Impact 

Output 3  Genetic pathways for selected  Researchers and breeders at IRRI,  Users of this knowledge will  Acceleration of gene discovery on 

traits determined using  ARIs and NARES  contribute to the International  a genome‐wide scale will 
genome‐wide and comparative  Rice Functional Genomics  improve sustainability in 
biology approaches with  Consortium objective of  intensive‐production areas and 
priorities on stress tolerance,  understanding genes controlling  increase productivity in marginal 
nutrition and grain quality, and  target traits, enabling  areas. 
yield by 2015.  development of markers for 
breeding and leading to 
production of pre‐breeding lines. 
Output targets  • Twenty candidate defense genes, their interactions, and contributions to disease resistance identified by genome‐wide co‐segregation analysis. 
2007  • Understanding of the functional relationship between haplotypes (2) of the gene encoding starch synthase (SS11a) and gelatinization 
temperature.   
• Characterized alleles of the gene that synthesizes amylose, granule bound starch synthase.   
• Expanded tool kits for selection of eating and cooking quality. 
• Strategies, tactics, and a research consortium to construct a C4 rice based on substantial input from external experts. 
• Induction of 1‐2 secondary megaspore mother cells in the ovule of rice by RNAi of MSP1 gene. 
Output targets  • Validated functions and roles of Pup1 and Saltol candidate genes in tolerance mechanism against P‐deficiency and salinity. 
2008  • Candidate genes at two additional QTL regions associated with salinity tolerance based on evidence of mapping and gene expression. 
• Validated roles of Sub1 upstream regulators and downstream genes in tolerance to submergence and other stresses. 
• Candidate genes (~10) for drought tolerance from gene expression and mapping studies. 
• Validated function of 5 defense genes (oxalate oxidase, thaumatin, PBZ, dihydrofolate reductase, DHAP) conferring broad‐spectrum disease 
resistance through RNAi or virus‐induced gene silencing. 
• Established relationship between SNP and temperature tolerance of amylose content in high amylose rice. 
• Knowledge of the causal effects between intermediate amylose class and SNP variation.   
• A phenotyping system and technologies for identifying C4 attributes and C3‐C4 intermediate traits in rice plants. 
• Quantified contribution of endophytes to BNF in a set of wild species and traditional germplasm.   
• Over‐expressed Oscdc25 as a means of blocking meiosis in secondary megaspore mother cells of msp1 mutant. 

IRRI Program 5 
 Output targets  • Genes and mechanisms conferring salinity tolerance through the use of a set of NILs and loss‐ and gain‐of‐function mutants. 
2009  • Pathways and genes conferring tolerance to anaerobic conditions during germination. 
• Confirmed effects of three drought candidate genes via transformation and genetic analysis.   
• Validated networks of interacting genes for drought tolerance in selected genotypes. 
• Characterized physiological effects of alleles conferring improved drought tolerance. 
• Major QTL and candidate genes for cold tolerance using knockout mutants and fine‐mapped RIL populations. 
• A recessive gene conferring resistance to tungro virus (RTSV) isolated from the resistance donor variety Utri Merla.   
• Aposporous initials in rice ovule (important for apomixis) produced by silencing MSP1 gene. 
• Known genetic control of metabolites for fragrance and one vitamin in rice grains. 
• Quantified C4‐like components, including anatomical and biochemical features important for C4 metabolism, in wild rice species. 

IRRI Program 5 

77
78
  Outputs  Intended Users  Outcome  Impact 

Output 4  Ex situ conservation of rice  Researchers  Increased awareness of NARES  Permanent genetic resources are 

germplasm expanded and  Breeders  partners and policy makers  available for meeting current and 
enhanced through better  Genebank curators  concerning the importance of  future needs in rice improvement, 
understanding of the genetic  germplasm resources and the  and increased ability to develop 
diversity within and between  need for their preservation;  rice germplasm adaptive to 
collections in a global network by  Increased use of germplasm  unforeseen challenges.   
2011 to contribute to long‐term  collections due to expanded 
conservation efforts, harmonized  conservation and improved 
with genebanks in other CGIAR  management.   
institutes through the SGRP1 
Output targets  • Established global network of NARES, CGIAR, and ARIs holding rice genetic resources. 
2007  • Revised taxonomy for the non‐AA genome wild species of Oryza based on combined analysis of molecular, cytological, morphological and 
agronomic data. 
Output targets  • Phylogeny of the AA genome species and their domestication history. 
2008  • Identified gaps in coverage of traditional and wild species accessions across collections within the global network. 
• Additional genetic resources and 5000 specialized genetic stocks available in the International R ice Genebank. 
Output targets  • Knowledge of the level of duplicate accessions across centers through the analysis of genetic, molecular, morphological, agronomic, and 
2009  geographic/spatial data. 
• Reduced gaps in wild species accessions across global germplasm collections through collecting missions with partners. 
• Enhanced procedures to ensure long‐term conservation and maintenance of the genetic integrity of accessions. 

1
(SGRP) = Output / target is coordinated across CGIAR institutes through the Systemwide Genetic Resources Program, and is also reflected in the MTP of the
SGRP.

IRRI Program 5 
   Outputs  Intended Users  Outcome  Impact 

Output 5  Long‐term broadened access to  NARES partners in Asia and  NARES researchers and extension  Human resources developed with 

genomic resources and associated  Africa  agents equipped with better  proficiency in applying genomic 
tools, particularly for NARES.  Small and Medium Enterprises  options for the development and  knowledge and tools. 
(SMEs)  delivery of new varieties.   
 
Gene/marker selection 
technology implemented by 
NARES; integrated into NARES 
breeding programs. 
Output targets  • Low‐cost and simple assays for allele‐specific diagnosis of disease resistance genes, generalized to other genes in cereals. 
2007  • Shared gene‐based diagnostic techniques with ~20 NARES including SMEs. 
• A panel of gene‐based SNP markers for tolerance to disease, submergence, salinity, and P‐deficiency.   
Output targets  • A simplified microarray‐based technique for marker and SNP analysis. 
2008  • Allele‐indexed elite breeding lines with multiple stress tolerance (salinity with other soil stresses, e.g., Fe toxicity, Zn deficiency, sodicity). 
Output targets  • Colorimetric and fluorescence‐based allele detection techniques developed and transferred to NARES and SMEs.   
2009 

IRRI Program 5 

79
 Program 6
Information and communication: convening a global rice research
community
 
Rationale
The rapid development and global spread of modern information and communication 
technology allow and oblige IRRI and the CGIAR to change the way we conduct research and 
development with our clients and stakeholders. Information and tools vital to research and 
development must be shared equitably as global public goods. Communities with common 
interests in research or development should be able to converse, share knowledge, and 
collaborate.  
 
This program builds on many global investments in information and technology within and 
outside the CGIAR to enable IRRI research programs to provide equitable access to information 
and knowledge on rice and to help develop the next generation of rice scientists.  
 
Alignment with CGIAR System Priorities
Through its focus on the capture, analysis, integration, and publication of scientific information 
for crop genetic resources and genomics and breeding for higher‐yielding, stress‐tolerant, and 
more nutritious rice (Output 1), its focus on delivering this scientific knowledge to farmers via 
the NARES (Output 2), and its emphasis on building capacity in informatics and communication 
for rice science and extension (Output 4), this program contributes to System Priorities 1A, 1B, 
2A, 2B, 2C, and 4C. The focus on developing a World Rice Community Portal (Output 3) and the 
extension communication elements of Output 4 will not only enhance equitable global access to 
rice scientific and extension knowledge and development of community partnerships and a 
problem‐solving framework for the same System Priorities but also contribute significantly to 
Priorities 5A, 5B, and 5D by facilitating global discussions on science and technology policies, 
improving rural access to market information, and providing an enhanced framework to 
communicate strategies for improving farmers’ livelihoods.  
 
Impact Pathways
This program formally attempts to consolidate all IRRI research and development on information 
and communication technology for rice science and extension under a single coordinated activity. 
It focuses on the integration of crop science and extension knowledge using modern informatics 
tools (Outputs 1 and 2) to harness the full power of Internet networking technology (Output 3). It 
also emphasizes capacity building by placing informatics and communication tools directly in the 
hands of crop scientists, extension agents, and farmers (Output 4) to deliver impact through two 
major pathways.  
 
The first pathway will use Internet dissemination via a World Rice Community Portal (Output 3) 
of restructured and cross‐linked information for crop science (Output 1) and extension (Output 
2), as well as pertinent informatics tools for science and extension (Output 4). The second 
pathway will catalyze direct engagement of pertinent science and extension communities using 
the power of current communications technologies, both new (Web portal, videoconferencing, 
cell phone) and traditional (radio and television). 
 
These two channels will provide complementary modes of informatics and communication 
support to enhance the capacity of the other IRRI programs to deliver sustainable productivity 

IRRI Program 6 
80
increases that will improve livelihoods and increase the food security of the poor in target 
regions, while maintaining the resource base. By promoting equitable access to research and 
extension information and technology by all IRRI stakeholders, this program will also generally 
enhance the problem‐solving capacity of the global community of NARES and ARI crop 
scientists, extension agents, policymakers, and farmers.  
 
Research Approach to Develop International Public Goods
The outputs of this program will be four globally accessible public goods: 
1. A Crop Science Information Resource. 
2. A Crop Systems Knowledge Bank (CSKB). 
3. A World Rice Community Portal. 
4. An Informatics and Communication Service for Crop Science and Extension.  
 
Elaboration of Partners’ Roles
To achieve its vision of serving as a hub for crop science and extension information, global 
community development, and capacity building, Program 6 will rely heavily on extensive global 
partnerships with other CG centers, NARES, ARIs, and private industry. CIMMYT is a key IRRI 
partner through the IRRI‐CIMMYT Alliance projects for the Crop Research Informatics 
Laboratory (CRIL) and Crop Systems Knowledge Bank and Capacity Building. Although this 
partnership will focus on comparisons and integration of information for rice, maize, and wheat, 
it is expected to form the foundation for wider crop collaboration with other IARC and ARI 
partners. 
 
Program 6 participation in the Generation Challenge Program (GCP) is particularly significant 
given the shared objective of efforts to identify, develop, and adopt suitable data standards and 
to develop an information system and network for crop genetic resources characterization, 
comparative genomics, and crop improvement. Thus, GCP technology and partnerships will 
contribute significantly to Outputs 1 and 4.  
 
Serving IRRI’s Program 5 on Rice genetic diversity and discovery: meeting the needs of future 
generations for rice genetic resources, Program 6 will collaborate with global partners within the 
IRFGC, the International Network for the Genetic Evaluation of Rice (INGER), and the Global 
Crop Diversity Trust to develop a framework to capture, store, index, analyze, and publish 
genetic and phenotypic research data. In particular, internal capacity in bioinformatics will 
continue to be complemented within currently funded projects, by expertise of ARIs from Japan 
(NIAS, Oryzabase at NIG), the United States (NCGR, Gramene at Cornell, and CSHL), and 
Europe (CIRAD), among others.  
 
Outputs 2 and 4 will build strong partnerships with Asian NARES, in particular with respect to 
the development of multilingual, in‐country installations of the CSKB. In this respect, NARES, 
such as the Philippine Rice Research Institute (PhilRice) that already have demonstrated technical 
leadership in the application of ICT for agricultural extension will be directly engaged as research 
for development collaborators. 
 
The informatics and communication opportunities embodied by this program have been 
recognized by the CGIAR through its ICT‐KM program. The IRRI team implementing the World 
Rice Community Portal in Output 3 will seek a close partnership with the ICT‐KM program team 
developing CGXchange portal technology. 

IRRI Program 6 
81
 Program Outputs
Each output requires components of strategic research, methodology development, production of 
technology, and training or capacity development. All four outputs will also contribute toward 
the evolution of a state‐of‐the‐art “institutional repository” of IRRI knowledge products that will 
serve the IRRI mission of long‐term stewardship of rice information for the global community. 
 
1. The rice component of the Crop Science Information Resource (an initiative of the IRRI‐CIMMYT 
Alliance), which is a global community‐curated repository and network of public crop science 
information resources, established by 2010. 
The Crop Science Information Resource will be a product of CRIL and will exploit emerging 
public bioinformatics standards for semantic encoding and Internet technology to consolidate 
IRRI and external online information resources into a comprehensive online “encyclopedia” 
for crop scientific research, starting with rice. This output also reflects an increasing focus on 
the curation and publication of comparative information linkages across crops within the 
scope of CRIL. 
 
Current research on conservation and use of rice genetic resources, crop improvement, and 
sustainable natural resource management is hampered by a lack of integrated scientific data 
on genetics, phenotype, adaptation, and responsiveness of rice germplasm in specified (geo‐
referenced) environments. This output will continue the integration of IRRI’s information on 
rice germplasm, expand coverage of information on rice genetic resources to collection and 
crop improvement programs of NARES partners, integrate crop‐based information with 
genomics data being collected by the International Rice Functional Genomics Consortium 
(IRFGC) and with geospatial information being published through the Consortium for 
Spatial Information, and link this information with pertinent biological data in 
complementary international public repositories.  
 
Given the increased prevalence of digital libraries and open‐access publication, a key 
component of the Crop Science Information Resource will be the evolution of the IRRI 
Library into a comprehensive online digital repository of rice literature and IRRI‐archived 
project outputs, including novel multimedia documents, richly cross‐linked to other scientific 
data within the resource. This latter activity will include the development of additional 
procedures and protocols for quality assurance and management of primary research data at 
IRRI, ensuring the availability of such data for future secondary use. 
 
2. The Crop Systems Knowledge Bank, an online resource of knowledge on cereal production for rice, 
maize, and wheat, containing rice information from IRRI’s Rice Knowledge Bank (RKB), by 2010. 
The Crop Systems Knowledge Bank (CSKB) will be a product of the Crop Systems 
Knowledge Bank and Capacity Building IRRI‐CIMMYT Alliance project. It will effectively 
disseminate knowledge of new cultivars and technologies for sustainable natural resource 
management and provide opportunities for diversification. The CSKB will disseminate 
technical knowledge to a vast and distributed population of extension workers and farmers. 
The new communication technologies to be used in the CSKB will alleviate a constraint that 
has previously slowed and limited the impact of research for development.  
 
This output represents an expansion of the successful model of translating research results 
into accessible technology provided by IRRI’s Rice Knowledge Bank. CIMMYT will expand 
this coverage of knowledge, applications, and training resources to maize and wheat and will 

IRRI Program 6 
82
 feed back new ideas and technologies to the rice knowledge component. A network of 
NARES partners, convened around the technology and the core content, will expand and 
diversify the resource by adding local knowledge and translating relevant information into 
local languages. IRRI’s Rice Knowledge Bank is already doing this and will benefit only from 
economies of scale by considering multiple crops. 
 
Content and delivery of CSKB information will be revised in light of external evaluation and 
enhanced through the inclusion of new content forms, including simulations such as the 
operation of a rice mill showing input/output relationships and expert systems capturing 
scientific advice given to farmers on crop system management and postharvest processes. 
 
3. The World Rice Community Portal—which uses Internet technology for access to information and for 
interaction on rice by supporting self‐organizing communities and multilateral communication—
operational by 2010. 
The World Rice Community Portal will take advantage of new technology and considerable 
investment by the CGIAR through the CGXchange project of the ICT‐KM program to deliver 
a novel Internet environment where individuals within the rice world can form communities 
around issues of common interest.  
 
The portal will greatly increase the effectiveness and efficiency of collaboration, both within 
the rice community and across other crops, by moving beyond the current “broadcast” 
approach of conventional Web site design to a rich environment for multilateral interactions 
among members of the world rice community. The portal will be tailored to the specific 
information needs and preferences of each individual accessing it. To support this feature, 
the portal will have an integral “Community Relationships Management” facility to assist 
individual visitors in getting in touch with one another and to help IRRI track the 
dissemination of its knowledge products to the world community. The portal will also 
support full‐community services such as RSS, Wiki’s, an expertise database, a shared 
calendar, etc.). 
 
The portal will also serve as the public rice community interface to the Crop Science 
Information Resource and the CSKB. Through these two resources, the portal will also be 
connected to other external online crop information networks to serve as a “one‐stop shop” 
for global crop science and crop systems information.  
 
The portal will eventually include innovative resources such as the Google Earth style of 
access to geo‐referenced crop information and a “virtual rice plant” for browsing the biology 
of rice. The portal will host a powerful search engine specialized for queries to crop research 
and extension information. Such queries will require innovative indexing of rice content and 
community collaboration on standards, such as a global multilingual rice thesaurus of crop 
ontology, in partnership with FAO and others. 
 
4. Phase I of the Informatics and Communication Service for Crop Science and Extension—which is a 
public research, development, and dissemination service for informatics and communication 
technology targeting agricultural scientific research and extension—completed by 2010. 
The Informatics and Communication Service for Crop Science and Extension will deploy 
informatics and communication applications to research programs and partnerships 
spanning IRRI and CIMMYT and ensure their effective use through training and consultancy. 

IRRI Program 6 
83
 The service will host research and development for databases and software useful for 
scientific data management systems (including genebank, plant‐breeding, agronomic, 
socioeconomic, and GIS data) and decision‐support tools for crop research and plant 
breeding. 
 
Communication and collaboration tools such as AccessGrid Technology and collaboration 
platforms for software and document development will also be deployed for use by IRRI and 
its partners, as will innovative informatics and communication technologies, such as the 
capture of conference presentations as digital (multimedia, Internet‐integrated) proceedings. 
 
The service will also provide a venue for general research, development, and training in 
agricultural informatics and biometrics, including technical issues relating to other outputs of 
this program. Research will also be conducted concerning the application of conventional 
(e.g., radio and television) and emerging (e.g., wireless mobile networks) informatics and 
communication technology for the dissemination of agricultural knowledge to farmers. 

IRRI Program 6 
84
  
 
 
MTP Project Logframe 
Program 6. Information and communications: convening a global rice research community 
  Outputs  Intended Users  Outcome  Impact 
Output 1  The rice component of the Crop  Rice scientists and policy makers  Within the rice science community,  Accelerated development of more 
Science Information Resource (an  at IARCs, NARES and ARIs, and in  a majority of researchers use the  focused rice research leads to 
initiative of the IRRI‐CIMMYT  the private sector  crop science information resource  sustainable productivity increases 
Alliance)—which is a global  as a primary source for publicly  that improved livelihoods and 
community‐curated repository and  available, current and easily  increased food security of the poor 
network of public crop science  accessible crop research  in target regions, while 
information resources, established  information, which enables them  maintaining the resource base. 
by 2010.  to accelerate and focus crop 
research for development.  
Output targets  • A consolidated rice germplasm information system for genetic resources, genomics, and crop improvement that is cross‐linked with indexed rice 
2007  literature and related information. 
• An informatics network of IRRI and external genomics and comparative cereal information. 
Output targets  • Community‐curated online encyclopedia of rice science.  
2008 
Output targets  • A global informatics network for rice genetic resources conservation and evaluation. 
2009  • Integrated modules for multimedia content, training and simulation within the Crop Science Information Resource. 

IRRI Program 6 

85
86
Outputs  Intended Users  Outcome  Impact 
Output 2  The Crop Systems Knowledge  National extension services  The Crop Systems Knowledge  Expanded dissemination and 
Bank, an online resource of  National scientists  Bank is the preferred source up‐to‐ accelerated adoption of new 
knowledge on cereal production  NGOs  date information on new  productive and sustainable 
for rice, maize, and wheat,  Agricultural colleges  technologies and best practices  farming practices results in 
containing rice information from  Development agencies   used by extension workers and  increased total returns to rice 
IRRI’s Rice Knowledge Bank  Farmers  other farmer intermediaries,  research and its impact on poverty.  
(RKB), by 2010.  farmers for more rapid 
dissemination and uptake of 
appropriate crop technologies. 
Output targets  • The RKB online within the Crop Systems Knowledge Bank. 
2007 
Output targets  • Integrated simulation and expert system modules within the Crop Systems Knowledge Bank. 
2008 
• A community of practice of knowledge bank users generating and sharing information on rice and other cereals. 

Output targets  • The Crop Systems Knowledge Bank accessible in multiple media formats with NARES translation into multiple local national languages, through a 
2009  variety of portals and other access points internationally. 

IRRI Program 6 
   Outputs  Intended Users  Outcome  Impact 
Output 3  The World Rice Community  Researchers  This portal is actively used to  This innovative approach to 
Portal—which uses Internet  Policy makers  build communities globally that  knowledge sharing and problem 
technology for access to  Development specialists  interact, debate, and collaborate on  solving accelerates the 
information and for interaction on  Extension workers  rice research for development and  development and uptake of the 
rice by supporting self‐organizing  Rice farmers  extension.  results of rice research for 
communities and multilateral  Processors and consumers  development. 
communication—operational by 
2010. 
Output targets  • A single entry point for IRRI web‐based information. 
2007  • A Community Relationship Management (CRM) Information System.  
• International Rice Functional Genomics Consortium (IRFGC) model community within the World Rice Community Portal. 
• Philippines Crop Systems Knowledge Bank model community within the World Rice Community Portal. 
Output targets  • A community‐curated global, multi‐lingual rice thesaurus and ontology. 
2008  • Crop Systems Knowledge Bank communities for three Southeast Asian nations within the World Rice Community Portal. 
Output targets  • Innovative query and display modules within the World Rice Community Portal for geo‐referenced and germplasm data. 
2009  • Crop Systems Knowledge Bank communities for target regions in China and India within the World Rice Community Portal. 

IRRI Program 6 

87
88
 

  Outputs  Intended Users  Outcome  Impact 

Output 4  Phase I of the Informatics and  Crop scientists   The intended users have increased  Increased application of 
Communication Service for Crop  Extension workers  capacity to benefit from  appropriate informatics and 
Science and Extension—which is a  Farmers  appropriate informatics and  communication tools leads to more 
public research, development, and  communication technology.   equitable access, rapid 
dissemination service for  development, dissemination and 
informatics and communication  adoption of rice science 
technology targeting agricultural  information and technology. 
scientific research and extension—
completed by 2010. 
• Informatics and Communications Service for Crop Science and Extension online. 
Output targets 
• Production release of IRRI‐contributed software technology to the Generation Challenge Program and continued enhancement of ICIS software for 
2007 
crop research communities. 
Output targets  • Curricula for online tutorials and workshop training resources for use of the Crop Science Information Resource and the Crop Systems Knowledge 
2008  Bank. 
• Strategy and methodology for application of AccessGrid technology to multi‐site training and scientific conferences 
Output targets  • Molecular breeding and decision‐making informatics tools for crop research. 
2009  • “Entertainment education” television series, in one Southeast Asian nation, to educate farmers about crop management “best practices”.  
• A strategy and systems for institutional data management practices for the IRRI’s research programs. 

IRRI Program 6 
Program 7
Rice policy support and impact assessment for rice research
 
Rationale
The impact of rice research on poverty reduction and environmental sustainability depends on 
conducive policies and appropriate technologies that address farmers’ livelihood needs. To 
effectively set research priorities, it is therefore necessary to understand the broad trends in 
socioeconomic and policy environments that affect the economics of rice production. This 
involves analyses of trends in rice production and consumption at the national/subnational 
levels, and shifts in comparative advantages in rice production relative to other crops across 
regions/ecosystems.  
 
Strategic assessments for agriculture and economic growth in rice‐producing regions, the 
dynamics of rural livelihoods, the nature and determinants of poverty, as well as commodity and 
market trends in increasingly globalized markets are critically important for determining 
investment priorities for rural development. Planning and prioritizing rice research also requires 
a deeper understanding of people’s access to and use of natural resources and other forms of 
capital—physical, financial, human, and social—and their interactions with government agencies, 
NGOs, and other institutions that influence their livelihood strategies. It is critically important to 
understand the changes in farmer practices that are currently taking place and drivers of such 
changes, including farmers’ knowledge and their perceptions, their criteria for technology 
choices, and how components of livelihood systems and rice technologies interact. Such an 
understanding provides the scientific basis for technology design, targeting, and delivery.  
 
Impact assessments are critically important for providing evidence of impact of past research (ex 
post) and for identifying future investment opportunities that are likely to lead to large impacts 
(ex ante). Such assessments are being increasingly sought both for ensuring accountability and 
for raising the efficiency of research investments, especially in the current context of tighter 
resource availability.  
 
The main objective of this program is to provide sound advice to policymakers, research 
managers, and donors regarding the design of agricultural interventions through policy analyses, 
livelihood studies, and impact assessments focused on rice‐based systems of Asia. Through close 
partnership with NARES, the program will also contribute to building their capacity for broader 
socioeconomic and policy analyses of the agricultural sector.  
 
Alignment with CGIAR System Priorities
This program falls under System Priority 5 (Improving policies and facilitating institutional 
innovation to support sustainable reduction of poverty and hunger). The policy support work will fall 
under 5A. Analyses of comparative advantages, trade, and domestic marketing will fall under 5B. 
The livelihood analysis and development of strategies for increasing the overall impact of 
research for development fall under 5D.  
 
Impact Pathways
The impact pathway of this program includes researchers, research managers, development 
workers, and policymakers as the main users of the knowledge and information generated. 
Outputs from impact assessment (both ex ante and ex post) contribute to the process of improved 
prioritization of research and, through this mechanism, increase the likelihood of selecting 

IRRI Program 7  89
 projects and activities with high impact potentials. Similarly, policy advice generated is expected 
to contribute to policy reforms needed for speeding up the process of impact generation and 
increasing the overall range of impact on the ultimate beneficiaries. In addition, the information 
generated from broader analyses of farmer livelihood strategies is expected to generate impact by 
contributing to improved design of rural development strategies. The major factor that may 
condition the impact of this program is the extent to which the policy advice developed and 
research priorities identified are taken up for implementation by policymakers and research 
managers. 
 
Research Approach to Develop International Public Goods
Information and knowledge are the international public goods arising from this program. The 
framework of cross‐site comparative analysis to be deployed in the program will help produce a 
global view of the drivers of change and their impacts that can be generalized across a range of 
conditions. In addition, methodological frameworks and strategies developed in the program are 
expected to have wider application for policy research and impact analysis.  
 
Elaboration of Partners’ Roles
NARES, sister CG centers, and advanced research institutes (ARIs) all have key collaborative 
roles in the program. NARES, which include both research organizations and universities, will be 
the major collaborators involved in designing and implementing the research programs that 
address specific problems relevant to them. This will involve, among others, collection and 
analysis of detailed national/subnational and farm‐level data. Key complementary inputs will be 
sought from sister CG centers (e.g., with IFPRI on policy analyses) and with ARIs (for example, 
Yale University, CIRAD, and University of Lund). Such complementary inputs include key 
concepts and models that, with suitable modifications and adaptation, can be applied to meet the 
program objectives. Key collaborators are shown in Annex 1. 
 
Program Outputs
The program has five outputs:  
1. Updated subnational/farm database and maps on socioeconomic aspects of rice production in major 
rice‐growing countries of Asia prepared by 2012. 
Analysis of long‐term trends in rice production and spatial patterns of shifts in rice 
production requires temporal data series on rice area and production at national and 
subnational levels. Similarly, farm‐level data are needed for detailed analysis of the 
economics of rice production, farmers’ livelihood strategies, technology adoption patterns, 
and technology impacts. The required aggregate and farm‐level data need to be generated to 
support these research activities of IRRI. These computer‐based databases that require 
considerable efforts to collect, compile, and validate are international public goods that are 
used by NARES, policymakers, research scholars, and managers of development projects to 
meet their own needs.  
 
The World Rice Database, which is compiled, updated, and published regularly by IRRI, is an 
important single source of information used widely by NARES and others. Similarly, the 
databases generated by IRRI through farm surveys in different rice ecosystems and countries 
are being used by research scholars and others throughout the region. While there are 
alternative suppliers of national‐level data, disaggregated data at the subnational and farm 
levels are not generally available from other sources. IRRI continues to update and provide 
such data as a public good.  

90 IRRI Program 7 
 
2. Comprehensive knowledge of changes in rural livelihood systems and interactions among technology, 
infrastructure, and institutions in major rice‐growing countries of Asia developed by 2009. 
Technology needs of farmers and the potential impact of technologies on poverty reduction 
depend on farmers’ livelihood strategies. Poor farmers are mostly engaged in a number of 
livelihood activities that include crop production, livestock rearing, and wage employment, 
which may be on the farm or outside the farm. Livelihood strategies differ among farmers 
depending on their farm size, family labor resources, human capital, financial capital, and 
access to markets, information and technologies. They also differ by gender. Livelihood 
strategies are not static but dynamic and evolve according to changes in the broader 
economic, institutional, and social contexts of farming. It is the interaction among these 
various drivers of changes in the livelihood of farmers that determines the suitability of 
various interventions (technology and policy) in generating the desired impact. Hence, a 
good understanding of farmers’ livelihood strategies and how various factors such as policy, 
infrastructure, and institutions influence changes in livelihood strategies is essential for 
underpinning technology development.  
 
3. Policy reform options based on analyses of long‐term changes in comparative advantages in rice 
production in major rice‐growing countries of Asia developed by 2012. 
The overall productivity, profitability, and sustainability of rice production depend not only 
on technology but also on policy factors. In addition to the broader macroeconomic and rural 
development policies, those related to output pricing and marketing, input pricing, and 
subsidies directly impact on the profitability and sustainability of rice farming. Some policies 
can also create a conflict between profitability and sustainability. For example, input 
subsidies such as for groundwater use, while being profitable to farmers, can result in rapid 
depletion of groundwater due to excessive use and make the system unsustainable. Advice 
based on sound analysis of the consequences of various policies is an important step in 
effecting policy reforms. Similarly, reforms in marketing setup and policies may relax the 
major constraints to the adoption and diffusion of potentially profitable technologies. 
Comparative advantages associated with the production of rice across countries and rice 
ecosystems are likely to change as economies grow, new opportunities of trading open up, 
and relative input costs change over‐time. Formulation of policy reform options to address 
these broader issues related to the rice economy is hence essential to promote long‐term 
economic viability and sustainability of rice production.  
 
4. Knowledge of potential and realized impacts of rice research on poverty reduction and sustainable 
management of natural resources generated by 2009. 
In an era of continued high levels of human hardship in the developing world, increased 
pressure on scarce natural resources, and declining public funding of agricultural research 
for development, it is important that IRRI and NARES partners have a clear understanding 
of, and be able to demonstrate, the realized and potential contribution of their research 
outputs to the Institute’s goals and CGIAR priorities. This knowledge, based on a body of 
credible evidence, can be used to help IRRI and NARES learn through critical self‐analysis to 
improve project design and implementation, to support improved decision‐making and 
management of research funds at the institutional, program, and project level, and to 
underpin continued funding. 
 

IRRI Program 7  91
 5. Strategies and policies for facilitating rapid dissemination and diffusion of improved technologies 
developed by 2009. 
To achieve impact, scaling‐up initiatives will require strategies and policies that will facilitate 
rapid dissemination and diffusion of improved technologies. Adequate knowledge of farmer 
decision‐making processes in resource management will shed light on how innovation occurs 
and what support measures are needed to stimulate local innovation processes. Recent work 
on the dissemination of improved crop and resource management technologies that require 
community action has shown that institutional, technological, social, and cultural factors 
facilitate or impede the technology diffusion process. Improved knowledge of these factors is 
needed in the design and implementation of strategies for scaling up of resource 
management technologies.

92 IRRI Program 7 
  
 
 
MTP Project Logframe 
Program 7. Rice policy support and impact assessment for rice research 
  Outputs   Intended Users  Outcome  Impact 
Output 1  Updated subnational/farm  IRRI  Data are used by researchers, policy‐ An increased understanding of 
database and maps on  NARES  makers and development agencies to  long‐term trends in, and spatial 
socioeconomic aspects of rice  Research scholars  generate improved knowledge of the  patterns of, rice production, based 
production in major rice‐growing  Policy makers  trends in rice economy and policies,  on credible socio‐economic data, 
countries of Asia prepared by 2012.  Students of agricultural  extrapolation domains of improved  will lead to more informed 
development  rice technologies, and drivers of  decision making and improved 
Staff of agricultural  change in agriculture and rural  resource allocation and 
development projects.  development.  prioritization of rice research. 
Knowledge of trends in rice and  Ultimately improved funding 
agricultural economy and drivers of  decisions will increase the 
change advanced through discussions  likelihood of agricultural and rural 
in international fora, and used in  development in the rice growing 
IRRI‐NARES bi‐lateral research  areas of Asia. 
planning meetings. 
Output targets  • Updated sub‐national database on rice area and production by rice ecosystems in Bangladesh, India and Thailand. 
2007  • Database on male migration and gendered division of labor in rice production in India, Thailand, Philippines and Vietnam. 
Output targets  • Updated sub‐national data base on rice area and production for Philippines, Indonesia, Myanmar and Vietnam.  
2008  • Subnational poverty maps for Asia and major rice growing countries of Africa.  
Output targets  • Database containing information collected from farm‐level surveys in Bangladesh and Philippines, Myanmar and China and Eastern India.  
2009  • Updated sub‐national data base on rice area and production for China. 

IRRI Program 7 

93
94
  Outputs   Intended Users  Outcome  Impact 
Output 2  Comprehensive knowledge of  Policy makers  Policy makers and research  An increased understanding of 
changes in rural livelihood  IRRI  managers use the information to  livelihood strategies will help the 
systems and interactions among  NARES  improve research prioritization,  intended users develop and 
technology, infrastructure, and  rural investment portfolios and  implement research projects and 
institutions in major rice‐growing  policies.   agricultural policies that will 
countries of Asia developed by  increase the likelihood of the 
2009.  research outputs making a 
contribution to the desired 
development goals. 
Output targets  • Assessment of broader changes in gender roles in rice production, and the welfare impact of dynamic interactions between rice technologies and 
2008  gender roles in eastern India, Philippines and Vietnam. 
• Options to improve the management of irrigation through improved knowledge of the role of social capital in irrigation systems management. 
• Understanding of drivers and patterns of changes in livelihood strategies and poverty in rural Bangladesh, Philippines, Myanmar and Eastern India, 
and interactions between rice technologies and livelihood strategies. 
Output targets  • Analysis of interactions among farm consolidation, land tenure, and input use and their impact on efficiency of rice production in major rice 
2009  ecosystems.  

IRRI Program 7 
   Outputs   Intended Users  Outcome  Impact 
Output 3  Policy reform options based on  Policy makers  Policy makers use the information  Improvements in the policy 
analyses of long‐term changes in  IRRI  to guide policy for increasing the  environment, particularly in the 
comparative advantages in rice  NARES research managers  economic efficiency of rice  areas of trade, rural development 
production in major rice‐growing  production. Research managers use  and natural resources policy, will 
countries of Asia developed by  the information for research  increase the likelihood that gains 
2012.  prioritization.  from research are not only realized 
  but are of greatest benefit to the 
targeted groups, namely poor rice 
farmers and consumers. 
Output targets  • Improved knowledge of the changes in comparative advantage in rice production among various rice ecosystems in the context of trade liberalization 
2008  and the emerging long‐term changes in input costs. 
• Policy options to reduce the trading margin and the instability in domestic rice prices in Philippines, Thailand, Indonesia and Bangladesh. 
Output targets  • Policy options developed based on the knowledge of pricing and subsidies to improve water use efficiency. 
2009  • Policy options for achieving food security based on the knowledge of tradeoff between self‐sufficiency and self‐reliance in rice production for at least 
three rice growing countries in Asia. 

IRRI Program 7 

95
96
  Outputs   Intended Users  Outcome  Impact 
Output 4  Knowledge of potential and  IRRI  IRRI and NARES use this  More informed investment 
realized impacts of rice research on  NARES  knowledge for research  decision‐making and improved 
poverty reduction and sustainable  Donors  prioritization and to support more  project design and implementation 
management of natural resources  effective project development and  increases the likelihood that 
generated by 2009.  implementation. Donors use this  research outputs reach the 
  information in deciding which  intended target groups and have a 
projects to fund.  significant payoff. As a result, the 
  livelihoods of target groups are 
improved through sustainable 
increases in productivity. 
 
Output targets  • Improved knowledge of the returns to investment in rice research for enhancing human nutrition. 
2007  • Improved knowledge of the returns to rice research in East and Southern Africa and factors that are likely to facilitate/inhibit the full potential of that 
research being realized. 
Output targets  • Strategy for institutionalizing an impact culture in rice research systems. 
2008  • Enhanced conceptual and operational framework for assessing the impact of rice research on sustainable management of natural resources for use in 
ex‐ante and ex‐post impact assessments.  
Output targets  • Enhanced capacity of NARES scientists for conducting impact assessments. 
2009 

IRRI Program 7 
   Outputs   Intended Users  Outcome  Impact 
Output 5  Strategies and policies for  NARES and community  Based on the knowledge  Technologies reach more farmers 
facilitating rapid dissemination  organizations   generated, current approaches to  faster thus increasing the total 
and diffusion of improved  technology dissemination are  returns to rice research and its 
technologies developed by 2009  refined by national extension  impact on poverty. 
systems and community/farmer 
organizations to facilitate rapid 
technology diffusion. 
Output targets  • Strategies for promoting faster uptake of technologies by men and women farmers in Bangladesh. 
2007 
Output targets  • Comprehensive understanding of farmer decision making processes on use of elite lines and improved crop and water management practices  
2008  • Analysis of facilitating factors in community‐level decision making and action to support and implement improved crop and resource management 
practices. 
• NARES scientists have capacity to undertake farmer participatory research. 
Output targets  • Knowledge of factors facilitating/constraining policy support to scale up adoption of resource management technologies. 
2009 

IRRI Program 7 

97
  

98
  

IRRI FINANCIAL PLAN

99
  
 
 
 
 
 
FINANCIAL PLAN – list of tables 
1.  IRRI Financial Requirements by CGIAR Priorities, 2007 
1a  IRRI Cost Allocation of Resources by CGIAR System Priority, 2006‐2009 
2.  IRRI‐Cost Allocation: Project Cost Summary, 2006 
  IRRI‐Cost Allocation: Project Cost Summary, 2007‐2009 
3.  IRRI Cost Allocation: Allocation of Project Cost to CGIAR Priorities, 2006 
  IRRI Cost Allocation: Allocation of Project Cost to CGIAR Priorities, 2007‐2009 
4.  IRRI Investments by CGIAR Undertakings, Activities and Sectors, 2006‐2009 
5.  IRRI Cost Allocation: Allocation of Projects Cost to CGIAR Regions, 2005‐2006 
  IRRI Cost Allocation: Allocation of Projects Cost to CGIAR Regions, 2007‐2009 
6.  IRRI Expenditures by Object, 2005‐2009 
7.  IRRI Financing: Unrestricted and Restricted Grants and Center Income 
8.  IRRI Allocation of Investor Grants and Center Income to Projects, 2006 
  IRRI Allocation of Investor Grants and Center Income to Projects, 2007 
9.  IRRI Staff Composition: Internationally and Nationally Recruited Staff, 2005‐2009 
10.  IRRI Financial Position: Currency Structure of Expenditures, 2005‐2007 
11.  IRRI Financial Position: Statements of Financial Position, December 31, 2005 and 2004 
12.  IRRI Financial Position: Statement of Activities for the Years Ended December 31, 2005 and 
2004 

100
 Table 1. IRRI Financial Requirements by CGIAR Priorities, 2007
(in $ millions)

3.  5. Policies 
Diversification  4. Integrated  and  New 
1. Sustaining  2. Genetic  and high value  NR  institutional  Development  Stand‐alone  research  PROJECT 
Center Programs Biodiversity improvement commodities management innovation activities training areas TOTALS
001.  Raising productivity in rainfed 
environments:  attacking the roots of                 ‐            6.260                  ‐            3.130           1.043                 ‐             ‐            ‐       10.434
poverty
002.  Sustaining productivity in 
intensive rice‐based systems: rice                 ‐            3.315                  ‐            4.735           1.421                 ‐             ‐            ‐         9.470
and the environment
003.  East and southern Africa: rice 
for rural incomes and an affordable                 ‐            1.052                  ‐                ‐           1.052                 ‐             ‐            ‐         2.103
urban staple
004.  Rice and human health: 
overcoming the consequences of                 ‐            1.585                  ‐                ‐           0.396                 ‐             ‐            ‐         1.981
poverty
005.  Rice genetic diversity and 
discovery: meeting the needs of the 
           1.550            3.719                  ‐                ‐               ‐                 ‐             ‐         0.930         6.198
future generations for rice genetic 
resources
006.  Information and 
communication:  convening a global             0.722            1.082                  ‐            0.902           0.722                 ‐          0.180            ‐         3.608
rice research community
007.  Rice policy support and impact 
               ‐                ‐                  ‐                ‐           3.812                 ‐          0.424            ‐         4.236
assessment for rice research

SYSTEM PRIORITY TOTALS            2.271          17.012                  ‐            8.767           8.446                 ‐          0.604         0.930       38.030

IRRI Financial Plan 

101
 Table 1a. IRRI Cost Allocation of Resources by CGIAR System Priority, 2006-2009
(in $ millions)

2006 2007 2008 2009

estimate proposal plan plan
1. Sustaining Biodiversity for current and future 
generations         1.611        2.271        2.270         2.270
A Conservation of PGR for food and Agriculture       1.340       1.910        1.910        1.910
Promoting conservation/ characterization of PGR for 
B income         0.271        0.361        0.360         0.360
C Conservation of indigenous livestock           ‐           ‐            ‐           ‐
D Conservation of aquatic animal genetic resources           ‐           ‐            ‐           ‐
2. Producing more and better food at lower cost through 
genetic improvements       17.224      17.012      17.075       17.170
A Maintaining enhancing yield of staples       8.088       7.729        7.755        7.810
B Tolerance to abiotic stresses       6.362       5.888        5.910        5.950
C Enhancing nutritional quality and safety       2.630       3.197        3.210        3.210
D Genetic enhancement of high value species       0.144       0.198        0.200        0.200
3. Reducing rural poverty through agricultural 
diversification and emerging opportunities for high 
value commodities and products            ‐            ‐            ‐             ‐
A Income increases from fruit and vegetables           ‐           ‐            ‐           ‐
B Income increases from livestock           ‐           ‐            ‐           ‐
Enhancing incomes through production of fish and 
C aquaculture            ‐            ‐            ‐             ‐
D Sustainable income from forests and trees           ‐           ‐            ‐           ‐
4. Poverty alleviation and sustainable management of 
water, land, and forest resources         8.882        8.767        8.800         8.880

A Integrated land, water, forest mgt at landscape level         2.475        2.351        2.360         2.380

B Sustaining aquatic ecosystems for food and livelihood            ‐            ‐            ‐             ‐

C Improving water productivity       2.730       2.644        2.655        2.680
Agro‐ecological intensification in low/high potential 
D areas         3.677        3.772        3.785         3.820
5. Improving policies and facilitating institutional 
innovation to support sustainable reduction of 
poverty and hunger         8.334        8.446        8.425         8.450
A Science and technology policy and institutions       1.492       1.649        1.640        1.640
Making international and domestic markets work for 
B the poor         1.403        1.448        1.440         1.440
C Rural institutions and their governance       1.456       1.043        1.050        1.060
Improving research and development options to reduce 
D rural poverty and vulnerability         3.983        4.305        4.295         4.310
Development activities           ‐           ‐            ‐           ‐
Stand‐alone training       0.511       0.604        0.600        0.600
New research areas       0.668       0.930        0.930        0.930
CENTER TOTAL     37.230     38.030      38.100      38.300

102 IRRI Financial Plan 
 Table 2. IRRI- Cost Allocation: Project Cost Summary, 2006
(in $ millions)

2006

Center Projects (estimated)

001.  Germplasm conservation, characterization, documentation and exchange                 3.200

002.  Functional genomics                 5.083

003.  Genetic enhancement for yield, grain quality, and stress resistance                 3.877

004.  Managing resources under intensive rice‐based systems                 3.830

005.  Enhancing water productivity in rice‐based production systems                 2.166

006.  Irrigated Rice Research Consortium                 0.848

007.  Genetic enhancement for improving productivity and human health in 
                7.198
fragile environments

008.  Natural resource management for rainfed lowland and upland rice 
                4.797
ecosystems

009.  Consortium for Unfavorable Rice Environments                 0.562

010.  Understanding rural livelihood systems for rice research prioritization and 
                1.608
impact assessment

011. Facilitating rice research for impact                 4.061

CENTER TOTAL               37.230

IRRI Financial Plan  103
 Table 2. IRRI- Cost Allocation: Project Cost Summary, 2007-2009
(in $ millions)

2007 2008 2009

Center Programs (proposal) (plan 1) (plan 2)

001.  Raising productivity in rainfed environments:  
              10.434               10.500               10.600
attacking the roots of poverty

002.  Sustaining productivity in intensive rice‐based 
                9.470                 9.500                 9.600
systems: rice and the environment

003.  East and southern Africa: rice for rural incomes 
                2.103                 2.100                 2.100
and an affordable urban staple

004.  Rice and human health: overcoming the 
                1.981                 2.000                 2.000
consequences of poverty
005.  Rice genetic diversity and discovery: meeting the 
needs of the future generations for rice genetic                  6.198                 6.200                 6.200
resources
006.  Information and communication:  convening a 
                3.608                 3.600                 3.600
global rice research community

007.  Rice policy support and impact assessment for rice 
                4.236                 4.200                 4.200
research

CENTER TOTAL               38.030               38.100               38.300

104 IRRI Financial Plan 
 Table 3. IRRI Cost Allocation: Allocation of Project Cost to CGIAR Priorities, 2006
(in $ millions)

2006
Project System Priorities (estimated)
1. Sustaining Biodiversity
001.  Germplasm conservation,  A Conservation of PGR for food and Agriculture            0.384
characterization, documentation and  Promoting conservation/ characterization of PGR for 
exchange B income              0.128
C Conservation of indigenous livestock

D Conservation of aquatic animal genetic resources
2. Genetic improvement
A Maintaining enhancing yield of staples            0.608
B Tolerance to abiotic stresses            0.512
C Enhancing nutritional quality and safety            0.352
D Genetic enhancement of high value species
3. Diversification and high value commodities
A Income increases from fruit and vegetables
B Income increases from livestock
Enhancing incomes through production of fish and 
C aquaculture
D Sustainable income from forests and trees
4. Integrated NR management

A Integrated land, water, forest mgt at landscape level              0.192
Sustaining aquatic ecosystems for food and 
B livelihood
C Improving water productivity            0.160
Agro‐ecological intensification in low/high potential 
D areas              0.256
5. Policies and institutional innovation
A Science and technology policy and institutions            0.064
Making international and domestic markets work for 
B the poor              0.064
C Rural institutions and their governance            0.064
Improving research and development options to 
D reduce rural poverty and vulnerability              0.192
Development activities
Stand‐alone training            0.064
New research areas            0.160
           3.200

IRRI Financial Plan  105
 Table 3. IRRI Cost Allocation: Allocation of Project Cost to CGIAR Priorities, 2006
(in $ millions)

2006
Project System Priorities (estimated)
1. Sustaining Biodiversity
002.  Functional genomics A Conservation of PGR for food and Agriculture            0.915
Promoting conservation/ characterization of PGR for 
B income              0.102
C Conservation of indigenous livestock

D Conservation of aquatic animal genetic resources
2. Genetic improvement
A Maintaining enhancing yield of staples            0.966
B Tolerance to abiotic stresses            0.915
C Enhancing nutritional quality and safety            0.864
D Genetic enhancement of high value species
3. Diversification and high value commodities
A Income increases from fruit and vegetables
B Income increases from livestock
Enhancing incomes through production of fish and 
C aquaculture
D Sustainable income from forests and trees
4. Integrated NR management

A Integrated land, water, forest mgt at landscape level              0.152
Sustaining aquatic ecosystems for food and 
B livelihood
C Improving water productivity            0.102
Agro‐ecological intensification in low/high potential 
D areas              0.203
5. Policies and institutional innovation
A Science and technology policy and institutions            0.051
Making international and domestic markets work for 
B the poor              0.051
C Rural institutions and their governance            0.051
Improving research and development options to 
D reduce rural poverty and vulnerability              0.152
Development activities
Stand‐alone training            0.051
New research areas            0.508
           5.083

106 IRRI Financial Plan 
 Table 3. IRRI Cost Allocation: Allocation of Project Cost to CGIAR Priorities, 2006
(in $ millions)

2006
Project System Priorities (estimated)
1. Sustaining Biodiversity
003.  Genetic enhancement for yield,  A Conservation of PGR for food and Agriculture
grain quality, and stress resistance Promoting conservation/ characterization of PGR for 
B income
C Conservation of indigenous livestock

D Conservation of aquatic animal genetic resources
2. Genetic improvement
A Maintaining enhancing yield of staples            1.047
B Tolerance to abiotic stresses            0.620
C Enhancing nutritional quality and safety            0.039
D Genetic enhancement of high value species
3. Diversification and high value commodities
A Income increases from fruit and vegetables
B Income increases from livestock
Enhancing incomes through production of fish and 
C aquaculture
D Sustainable income from forests and trees
4. Integrated NR management

A Integrated land, water, forest mgt at landscape level              0.349
Sustaining aquatic ecosystems for food and 
B livelihood
C Improving water productivity            0.465
Agro‐ecological intensification in low/high potential 
D areas              0.698
5. Policies and institutional innovation
A Science and technology policy and institutions
Making international and domestic markets work for 
B the poor              0.078
C Rural institutions and their governance            0.116
Improving research and development options to 
D reduce rural poverty and vulnerability              0.465
Development activities
Stand‐alone training
New research areas
           3.877

IRRI Financial Plan  107
 Table 3. IRRI Cost Allocation: Allocation of Project Cost to CGIAR Priorities, 2006
(in $ millions)

2006
Project System Priorities (estimated)
1. Sustaining Biodiversity
004.  Managing resources under  A Conservation of PGR for food and Agriculture
intensive rice‐based systems Promoting conservation/ characterization of PGR for 
B income
C Conservation of indigenous livestock

D Conservation of aquatic animal genetic resources
2. Genetic improvement
A Maintaining enhancing yield of staples            0.996
B Tolerance to abiotic stresses            0.536
C Enhancing nutritional quality and safety            0.038
D Genetic enhancement of high value species
3. Diversification and high value commodities
A Income increases from fruit and vegetables
B Income increases from livestock
Enhancing incomes through production of fish and 
C aquaculture
D Sustainable income from forests and trees
4. Integrated NR management

A Integrated land, water, forest mgt at landscape level              0.383
Sustaining aquatic ecosystems for food and 
B livelihood
C Improving water productivity            0.498
Agro‐ecological intensification in low/high potential 
D areas              0.766
5. Policies and institutional innovation
A Science and technology policy and institutions
Making international and domestic markets work for 
B the poor              0.038
C Rural institutions and their governance            0.077
Improving research and development options to 
D reduce rural poverty and vulnerability              0.498
Development activities
Stand‐alone training
New research areas
           3.830

108 IRRI Financial Plan 
 Table 3. IRRI Cost Allocation: Allocation of Project Cost to CGIAR Priorities, 2006
(in $ millions)

2006
Project System Priorities (estimated)
1. Sustaining Biodiversity
005.  Enhancing water productivity in  A Conservation of PGR for food and Agriculture
rice‐based production systems Promoting conservation/ characterization of PGR for 
B income
C Conservation of indigenous livestock

D Conservation of aquatic animal genetic resources
2. Genetic improvement
A Maintaining enhancing yield of staples            0.585
B Tolerance to abiotic stresses            0.412
C Enhancing nutritional quality and safety
D Genetic enhancement of high value species
3. Diversification and high value commodities
A Income increases from fruit and vegetables
B Income increases from livestock
Enhancing incomes through production of fish and 
C aquaculture
D Sustainable income from forests and trees
4. Integrated NR management

A Integrated land, water, forest mgt at landscape level              0.217
Sustaining aquatic ecosystems for food and 
B livelihood
C Improving water productivity            0.282
Agro‐ecological intensification in low/high potential 
D areas              0.390
5. Policies and institutional innovation
A Science and technology policy and institutions
Making international and domestic markets work for 
B the poor
C Rural institutions and their governance            0.108
Improving research and development options to 
D reduce rural poverty and vulnerability              0.172
Development activities
Stand‐alone training
New research areas
           2.166

IRRI Financial Plan  109
 Table 3. IRRI Cost Allocation: Allocation of Project Cost to CGIAR Priorities, 2006
(in $ millions)

2006
Project System Priorities (estimated)
1. Sustaining Biodiversity
006.  Irrigated Rice Research  A Conservation of PGR for food and Agriculture
Consortium Promoting conservation/ characterization of PGR for 
B income
C Conservation of indigenous livestock

D Conservation of aquatic animal genetic resources
2. Genetic improvement
A Maintaining enhancing yield of staples            0.178
B Tolerance to abiotic stresses            0.076
C Enhancing nutritional quality and safety
D Genetic enhancement of high value species
3. Diversification and high value commodities
A Income increases from fruit and vegetables
B Income increases from livestock
Enhancing incomes through production of fish and 
C aquaculture
D Sustainable income from forests and trees
4. Integrated NR management

A Integrated land, water, forest mgt at landscape level              0.068
Sustaining aquatic ecosystems for food and 
B livelihood
C Improving water productivity            0.110
Agro‐ecological intensification in low/high potential 
D areas              0.178
5. Policies and institutional innovation
A Science and technology policy and institutions            0.034
Making international and domestic markets work for 
B the poor              0.025
C Rural institutions and their governance
Improving research and development options to 
D reduce rural poverty and vulnerability              0.162
Development activities
Stand‐alone training            0.017
New research areas
           0.848

110 IRRI Financial Plan 
 Table 3. IRRI Cost Allocation: Allocation of Project Cost to CGIAR Priorities, 2006
(in $ millions)

2006
Project System Priorities (estimated)
1. Sustaining Biodiversity
007.  Genetic enhancement for  A Conservation of PGR for food and Agriculture
improving productivity and human  Promoting conservation/ characterization of PGR for 
health in fragile environments B income
C Conservation of indigenous livestock

D Conservation of aquatic animal genetic resources
2. Genetic improvement
A Maintaining enhancing yield of staples            1.655
B Tolerance to abiotic stresses            1.367
C Enhancing nutritional quality and safety            1.296
D Genetic enhancement of high value species            0.144
3. Diversification and high value commodities
A Income increases from fruit and vegetables
B Income increases from livestock
Enhancing incomes through production of fish and 
C aquaculture
D Sustainable income from forests and trees
4. Integrated NR management

A Integrated land, water, forest mgt at landscape level              0.432
Sustaining aquatic ecosystems for food and 
B livelihood
C Improving water productivity            0.432
Agro‐ecological intensification in low/high potential 
D areas              0.432
5. Policies and institutional innovation
A Science and technology policy and institutions            0.144
Making international and domestic markets work for 
B the poor              0.288
C Rural institutions and their governance            0.432
Improving research and development options to 
D reduce rural poverty and vulnerability              0.576
Development activities
Stand‐alone training
New research areas
           7.198

IRRI Financial Plan  111
 Table 3. IRRI Cost Allocation: Allocation of Project Cost to CGIAR Priorities, 2006
(in $ millions)

2006
Project System Priorities (estimated)
1. Sustaining Biodiversity
008.  Natural resource management  A Conservation of PGR for food and Agriculture
for rainfed lowland and upland rice  Promoting conservation/ characterization of PGR for 
ecosystems B income
C Conservation of indigenous livestock

D Conservation of aquatic animal genetic resources
2. Genetic improvement
A Maintaining enhancing yield of staples            1.439
B Tolerance to abiotic stresses            1.439
C Enhancing nutritional quality and safety
D Genetic enhancement of high value species
3. Diversification and high value commodities
A Income increases from fruit and vegetables
B Income increases from livestock
Enhancing incomes through production of fish and 
C aquaculture
D Sustainable income from forests and trees
4. Integrated NR management

A Integrated land, water, forest mgt at landscape level              0.480
Sustaining aquatic ecosystems for food and 
B livelihood
C Improving water productivity            0.480
Agro‐ecological intensification in low/high potential 
D areas              0.480
5. Policies and institutional innovation
A Science and technology policy and institutions
Making international and domestic markets work for 
B the poor
C Rural institutions and their governance            0.479
Improving research and development options to 
D reduce rural poverty and vulnerability
Development activities
Stand‐alone training
New research areas
           4.797

112 IRRI Financial Plan 
 Table 3. IRRI Cost Allocation: Allocation of Project Cost to CGIAR Priorities, 2006
(in $ millions)

2006
Project System Priorities (estimated)
1. Sustaining Biodiversity
009.  Consortium for Unfavorable  A Conservation of PGR for food and Agriculture
Rice Environments Promoting conservation/ characterization of PGR for 
B income
C Conservation of indigenous livestock

D Conservation of aquatic animal genetic resources
2. Genetic improvement
A Maintaining enhancing yield of staples            0.169
B Tolerance to abiotic stresses            0.169
C Enhancing nutritional quality and safety
D Genetic enhancement of high value species
3. Diversification and high value commodities
A Income increases from fruit and vegetables
B Income increases from livestock
Enhancing incomes through production of fish and 
C aquaculture
D Sustainable income from forests and trees
4. Integrated NR management

A Integrated land, water, forest mgt at landscape level              0.056
Sustaining aquatic ecosystems for food and 
B livelihood
C Improving water productivity            0.056
Agro‐ecological intensification in low/high potential 
D areas              0.056
5. Policies and institutional innovation
A Science and technology policy and institutions
Making international and domestic markets work for 
B the poor
C Rural institutions and their governance            0.056
Improving research and development options to 
D reduce rural poverty and vulnerability
Development activities
Stand‐alone training
New research areas
           0.562

IRRI Financial Plan  113
 Table 3. IRRI Cost Allocation: Allocation of Project Cost to CGIAR Priorities, 2006
(in $ millions)

2006
Project System Priorities (estimated)
1. Sustaining Biodiversity
010.  Understanding rural livelihood  A Conservation of PGR for food and Agriculture
systems for rice research  Promoting conservation/ characterization of PGR for 
prioritization and impact assessment B income
C Conservation of indigenous livestock

D Conservation of aquatic animal genetic resources
2. Genetic improvement
A Maintaining enhancing yield of staples            0.161
B Tolerance to abiotic stresses            0.113
C Enhancing nutritional quality and safety
D Genetic enhancement of high value species
3. Diversification and high value commodities
A Income increases from fruit and vegetables
B Income increases from livestock
Enhancing incomes through production of fish and 
C aquaculture
D Sustainable income from forests and trees
4. Integrated NR management

A Integrated land, water, forest mgt at landscape level              0.065
Sustaining aquatic ecosystems for food and 
B livelihood
C Improving water productivity            0.064
Agro‐ecological intensification in low/high potential 
D areas              0.096
5. Policies and institutional innovation
A Science and technology policy and institutions            0.306
Making international and domestic markets work for 
B the poor              0.209
C Rural institutions and their governance            0.032
Improving research and development options to 
D reduce rural poverty and vulnerability              0.466
Development activities
Stand‐alone training            0.096
New research areas
           1.608

114 IRRI Financial Plan 
 Table 3. IRRI Cost Allocation: Allocation of Project Cost to CGIAR Priorities, 2006
(in $ millions)

2006
Project System Priorities (estimated)
1. Sustaining Biodiversity
011. Facilitating rice research for  A Conservation of PGR for food and Agriculture            0.041
impact Promoting conservation/ characterization of PGR for 
B income              0.041
C Conservation of indigenous livestock

D Conservation of aquatic animal genetic resources
2. Genetic improvement
A Maintaining enhancing yield of staples            0.284
B Tolerance to abiotic stresses            0.203
C Enhancing nutritional quality and safety            0.041
D Genetic enhancement of high value species
3. Diversification and high value commodities
A Income increases from fruit and vegetables
B Income increases from livestock
Enhancing incomes through production of fish and 
C aquaculture
D Sustainable income from forests and trees
4. Integrated NR management

A Integrated land, water, forest mgt at landscape level              0.081
Sustaining aquatic ecosystems for food and 
B livelihood
C Improving water productivity            0.081
Agro‐ecological intensification in low/high potential 
D areas              0.122
5. Policies and institutional innovation
A Science and technology policy and institutions            0.893
Making international and domestic markets work for 
B the poor              0.650
C Rural institutions and their governance            0.041
Improving research and development options to 
D reduce rural poverty and vulnerability              1.300
Development activities
Stand‐alone training            0.283
New research areas
           4.061
CENTER TOTAL          37.230

IRRI Financial Plan  115
 Table 3. IRRI Cost Allocation: Allocation of Project Cost to CGIAR Priorities, 2007-2009
(in $ millions)

2007 2008 2009

Program System Priorities (proposal) (plan 1) (plan 2)
1. Sustaining Biodiversity
001.  Raising productivity  Conservation of PGR for food and 
in rainfed environments:   A Agriculture              ‐             ‐               ‐
attacking the roots of  Promoting conservation/ characterization of 
poverty B PGR for income              ‐             ‐               ‐
C Conservation of indigenous livestock             ‐             ‐             ‐
Conservation of aquatic animal genetic 
D resources              ‐             ‐               ‐
2. Genetic improvement             ‐             ‐             ‐
A Maintaining enhancing yield of staples         3.130          3.150          3.180
B Tolerance to abiotic stresses         3.130          3.150          3.180

C Enhancing nutritional quality and safety              ‐             ‐               ‐

D Genetic enhancement of high value species              ‐             ‐               ‐

3. Diversification and high value commodities             ‐             ‐             ‐

A Income increases from fruit and vegetables              ‐             ‐               ‐

B Income increases from livestock             ‐             ‐             ‐
Enhancing incomes through production of 
C fish and aquaculture              ‐             ‐               ‐

D Sustainable income from forests and trees              ‐             ‐               ‐

4. Integrated NR management             ‐             ‐             ‐
Integrated land, water, forest mgt at 
A landscape level          1.043          1.050           1.060
Sustaining aquatic ecosystems for food and 
B livelihood              ‐             ‐               ‐
C Improving water productivity         1.043          1.050          1.060
Agro‐ecological intensification in low/high 
D potential areas          1.043          1.050           1.060
5. Policies and institutional innovation             ‐             ‐             ‐
Science and technology policy and 
A institutions              ‐             ‐               ‐
Making international and domestic markets 
B work for the poor              ‐             ‐               ‐
C Rural institutions and their governance         1.043          1.050          1.060
Improving research and development 
options to reduce rural poverty and 
D vulnerability              ‐             ‐               ‐
Development activities             ‐             ‐             ‐
Stand‐alone training             ‐             ‐             ‐
New research areas             ‐             ‐             ‐
     10.434        10.500       10.600

116 IRRI Financial Plan 
 Table 3. IRRI Cost Allocation: Allocation of Project Cost to CGIAR Priorities, 2007-2009
(in $ millions)

2007 2008 2009

Program System Priorities (proposal) (plan 1) (plan 2)
1. Sustaining Biodiversity
002.  Sustaining  Conservation of PGR for food and 
productivity in intensive  A Agriculture              ‐             ‐               ‐
rice‐based systems: rice  Promoting conservation/ characterization of 
and the environment B PGR for income              ‐             ‐               ‐
C Conservation of indigenous livestock            ‐             ‐              ‐
Conservation of aquatic animal genetic 
D resources              ‐             ‐               ‐
2. Genetic improvement            ‐             ‐              ‐
A Maintaining enhancing yield of staples         2.368          2.375           2.400
B Tolerance to abiotic stresses         0.947          0.950           0.960

C Enhancing nutritional quality and safety              ‐             ‐               ‐

D Genetic enhancement of high value species              ‐             ‐               ‐

3. Diversification and high value commodities            ‐             ‐              ‐

A Income increases from fruit and vegetables              ‐             ‐               ‐

B Income increases from livestock            ‐             ‐              ‐
Enhancing incomes through production of 
C fish and aquaculture              ‐             ‐               ‐

D Sustainable income from forests and trees              ‐             ‐               ‐

4. Integrated NR management            ‐             ‐              ‐
Integrated land, water, forest mgt at 
A landscape level          0.947          0.950           0.960
Sustaining aquatic ecosystems for food and 
B livelihood              ‐             ‐               ‐
C Improving water productivity         1.421          1.425           1.440
Agro‐ecological intensification in low/high 
D potential areas          2.368          2.375           2.400
5. Policies and institutional innovation            ‐             ‐              ‐
Science and technology policy and 
A institutions              ‐             ‐               ‐
Making international and domestic markets 
B work for the poor              ‐             ‐               ‐
C Rural institutions and their governance            ‐             ‐              ‐
D Improving research and development 
options to reduce rural poverty and 
vulnerability          1.421          1.425           1.440
Development activities            ‐             ‐              ‐
Stand‐alone training            ‐             ‐              ‐
New research areas            ‐             ‐              ‐
       9.470          9.500          9.600

IRRI Financial Plan  117
 Table 3. IRRI Cost Allocation: Allocation of Project Cost to CGIAR Priorities, 2007-2009
(in $ millions)

2007 2008 2009

Program System Priorities (proposal) (plan 1) (plan 2)
1. Sustaining Biodiversity
003.  East and southern  Conservation of PGR for food and 
Africa: rice for rural  A Agriculture              ‐             ‐               ‐
incomes and an affordable  Promoting conservation/ characterization of 
urban staple B PGR for income              ‐             ‐               ‐
C Conservation of indigenous livestock            ‐             ‐              ‐
Conservation of aquatic animal genetic 
D resources              ‐             ‐               ‐
2. Genetic improvement            ‐             ‐              ‐
A Maintaining enhancing yield of staples         0.631          0.630           0.630
B Tolerance to abiotic stresses         0.210          0.210           0.210

C Enhancing nutritional quality and safety          0.210          0.210           0.210

D Genetic enhancement of high value species              ‐             ‐               ‐

3. Diversification and high value commodities            ‐             ‐              ‐

A Income increases from fruit and vegetables              ‐             ‐               ‐

B Income increases from livestock            ‐             ‐              ‐
Enhancing incomes through production of 
C fish and aquaculture              ‐             ‐               ‐

D Sustainable income from forests and trees              ‐             ‐               ‐

4. Integrated NR management            ‐             ‐              ‐
Integrated land, water, forest mgt at 
A landscape level              ‐             ‐               ‐
Sustaining aquatic ecosystems for food and 
B livelihood              ‐             ‐               ‐
C Improving water productivity            ‐             ‐              ‐
Agro‐ecological intensification in low/high 
D potential areas              ‐             ‐               ‐
5. Policies and institutional innovation            ‐             ‐              ‐
Science and technology policy and 
A institutions              ‐             ‐               ‐
Making international and domestic markets 
B work for the poor          0.421          0.420           0.420
C Rural institutions and their governance            ‐             ‐              ‐
Improving research and development 
options to reduce rural poverty and 
D vulnerability          0.631          0.630           0.630
Development activities            ‐             ‐              ‐
Stand‐alone training            ‐             ‐              ‐
New research areas            ‐             ‐              ‐
       2.103          2.100          2.100

118 IRRI Financial Plan 
 Table 3. IRRI Cost Allocation: Allocation of Project Cost to CGIAR Priorities, 2007-2009
(in $ millions)

2007 2008 2009

Program System Priorities (proposal) (plan 1) (plan 2)
1. Sustaining Biodiversity
004.  Rice and human  Conservation of PGR for food and 
health: overcoming the  A Agriculture              ‐             ‐               ‐
consequences of poverty Promoting conservation/ characterization of 
B PGR for income              ‐             ‐               ‐
C Conservation of indigenous livestock             ‐             ‐             ‐
Conservation of aquatic animal genetic 
D resources              ‐             ‐               ‐
2. Genetic improvement             ‐             ‐             ‐
A Maintaining enhancing yield of staples             ‐             ‐             ‐
B Tolerance to abiotic stresses             ‐             ‐             ‐

C Enhancing nutritional quality and safety          1.387          1.400           1.400

D Genetic enhancement of high value species          0.198          0.200           0.200

3. Diversification and high value commodities             ‐             ‐             ‐

A Income increases from fruit and vegetables              ‐             ‐               ‐

B Income increases from livestock             ‐             ‐             ‐
Enhancing incomes through production of 
C fish and aquaculture              ‐             ‐               ‐

D Sustainable income from forests and trees              ‐             ‐               ‐

4. Integrated NR management             ‐             ‐             ‐
Integrated land, water, forest mgt at 
A landscape level              ‐             ‐               ‐
Sustaining aquatic ecosystems for food and 
B livelihood              ‐             ‐               ‐
C Improving water productivity             ‐             ‐             ‐
Agro‐ecological intensification in low/high 
D potential areas              ‐             ‐               ‐
5. Policies and institutional innovation             ‐             ‐             ‐
Science and technology policy and 
A institutions          0.198          0.200           0.200
Making international and domestic markets 
B work for the poor              ‐             ‐               ‐
C Rural institutions and their governance             ‐             ‐             ‐
Improving research and development 
options to reduce rural poverty and 
D vulnerability          0.198          0.200           0.200
Development activities             ‐             ‐             ‐
Stand‐alone training             ‐             ‐             ‐
New research areas             ‐             ‐             ‐
       1.981          2.000         2.000

IRRI Financial Plan  119
 Table 3. IRRI Cost Allocation: Allocation of Project Cost to CGIAR Priorities, 2007-2009
(in $ millions)

2007 2008 2009

Program System Priorities (proposal) (plan 1) (plan 2)
1. Sustaining Biodiversity
005.  Rice genetic diversity  Conservation of PGR for food and 
and discovery: meeting the  A Agriculture          1.550          1.550           1.550
needs of the future  Promoting conservation/ characterization of 
generations for rice genetic  B PGR for income              ‐             ‐               ‐
resources C Conservation of indigenous livestock             ‐             ‐             ‐
Conservation of aquatic animal genetic 
D resources              ‐             ‐               ‐
2. Genetic improvement             ‐             ‐             ‐
A Maintaining enhancing yield of staples         1.240          1.240          1.240
B Tolerance to abiotic stresses         1.240          1.240          1.240

C Enhancing nutritional quality and safety          1.240          1.240           1.240

D Genetic enhancement of high value species              ‐             ‐               ‐

3. Diversification and high value commodities             ‐             ‐             ‐

A Income increases from fruit and vegetables              ‐             ‐               ‐

B Income increases from livestock             ‐             ‐             ‐
Enhancing incomes through production of 
C fish and aquaculture              ‐             ‐               ‐

D Sustainable income from forests and trees              ‐             ‐               ‐

4. Integrated NR management             ‐             ‐             ‐
Integrated land, water, forest mgt at 
A landscape level              ‐             ‐               ‐
Sustaining aquatic ecosystems for food and 
B livelihood              ‐             ‐               ‐
C Improving water productivity             ‐             ‐             ‐
Agro‐ecological intensification in low/high 
D potential areas              ‐             ‐               ‐
5. Policies and institutional innovation             ‐             ‐             ‐
Science and technology policy and 
A institutions              ‐             ‐               ‐
Making international and domestic markets 
B work for the poor              ‐             ‐               ‐
C Rural institutions and their governance             ‐             ‐             ‐
Improving research and development 
options to reduce rural poverty and 
D vulnerability              ‐             ‐               ‐
Development activities             ‐             ‐             ‐
Stand‐alone training             ‐             ‐             ‐
New research areas         0.930          0.930          0.930
       6.198          6.200         6.200

120 IRRI Financial Plan 
 Table 3. IRRI Cost Allocation: Allocation of Project Cost to CGIAR Priorities, 2007-2009
(in $ millions)

2007 2008 2009

Program System Priorities (proposal) (plan 1) (plan 2)
1. Sustaining Biodiversity
006.  Information and  Conservation of PGR for food and 
communication:   A Agriculture          0.361          0.360           0.360
convening a global rice  Promoting conservation/ characterization of 
research community B PGR for income          0.361          0.360           0.360
C Conservation of indigenous livestock             ‐             ‐             ‐
Conservation of aquatic animal genetic 
D resources              ‐             ‐               ‐
2. Genetic improvement             ‐             ‐             ‐
A Maintaining enhancing yield of staples         0.361          0.360          0.360
B Tolerance to abiotic stresses         0.361          0.360          0.360

C Enhancing nutritional quality and safety          0.361          0.360           0.360

D Genetic enhancement of high value species              ‐             ‐               ‐

3. Diversification and high value commodities             ‐             ‐             ‐

A Income increases from fruit and vegetables              ‐             ‐               ‐

B Income increases from livestock             ‐             ‐             ‐
Enhancing incomes through production of 
C fish and aquaculture              ‐             ‐               ‐

D Sustainable income from forests and trees              ‐             ‐               ‐

4. Integrated NR management             ‐             ‐             ‐
Integrated land, water, forest mgt at 
A landscape level          0.361          0.360           0.360
Sustaining aquatic ecosystems for food and 
B livelihood              ‐             ‐               ‐
C Improving water productivity         0.180          0.180          0.180
Agro‐ecological intensification in low/high 
D potential areas          0.361          0.360           0.360
5. Policies and institutional innovation             ‐             ‐             ‐
Science and technology policy and 
A institutions          0.180          0.180           0.180
Making international and domestic markets 
B work for the poor          0.180          0.180           0.180
C Rural institutions and their governance             ‐             ‐             ‐
Improving research and development 
options to reduce rural poverty and 
D vulnerability          0.361          0.360           0.360
Development activities             ‐             ‐             ‐
Stand‐alone training         0.180          0.180          0.180
New research areas             ‐             ‐             ‐
       3.608          3.600         3.600

IRRI Financial Plan  121
 Table 3. IRRI Cost Allocation: Allocation of Project Cost to CGIAR Priorities, 2007-2009
(in $ millions)

2007 2008 2009

Program System Priorities (proposal) (plan 1) (plan 2)
1. Sustaining Biodiversity
007.  Rice policy support  Conservation of PGR for food and 
and impact assessment for  A Agriculture              ‐             ‐               ‐
rice research Promoting conservation/ characterization of 
B PGR for income              ‐             ‐               ‐
C Conservation of indigenous livestock             ‐             ‐             ‐
Conservation of aquatic animal genetic 
D resources              ‐             ‐               ‐
2. Genetic improvement             ‐             ‐             ‐
A Maintaining enhancing yield of staples             ‐             ‐             ‐
B Tolerance to abiotic stresses             ‐             ‐             ‐

C Enhancing nutritional quality and safety              ‐             ‐               ‐

D Genetic enhancement of high value species              ‐             ‐               ‐

3. Diversification and high value commodities             ‐             ‐             ‐

A Income increases from fruit and vegetables              ‐             ‐               ‐

B Income increases from livestock             ‐             ‐             ‐
Enhancing incomes through production of 
C fish and aquaculture              ‐             ‐               ‐

D Sustainable income from forests and trees              ‐             ‐               ‐

4. Integrated NR management             ‐             ‐             ‐
Integrated land, water, forest mgt at 
A landscape level              ‐             ‐               ‐
Sustaining aquatic ecosystems for food and 
B livelihood              ‐             ‐               ‐
C Improving water productivity             ‐             ‐             ‐
Agro‐ecological intensification in low/high 
D potential areas              ‐             ‐               ‐
5. Policies and institutional innovation             ‐             ‐             ‐
Science and technology policy and 
A institutions          1.271          1.260           1.260
Making international and domestic markets 
B work for the poor          0.847          0.840           0.840
C Rural institutions and their governance             ‐             ‐             ‐
Improving research and development 
options to reduce rural poverty and 
D vulnerability          1.694          1.680           1.680
Development activities             ‐             ‐             ‐
Stand‐alone training         0.424          0.420          0.420
New research areas             ‐             ‐             ‐
       4.236          4.200         4.200
CENTER TOTAL       38.030        38.100        38.300

122 IRRI Financial Plan 
 Table 4. IRRI Investments by CGIAR Undertakings, Activities and Sectors , 2006-2009
(in $ millions)

2006 2007 2008 2009

(estimated) (proposal) (plan 1) (plan 2)
Increasing Productivity           20.244          20.679            20.717          20.826
    Germplasm Enhancement and Breeding           14.065           14.367            14.393           14.469
    Production Systems Development and Management
          Cropping System             6.179             6.312              6.324             6.357
Protecting the Environment            4.905             5.010              5.019            5.046
Saving Biodiversity            1.390             1.420              1.423            1.430
Improving Policies             2.638             2.695              2.700            2.714
Strengthening NARS            8.053             8.226              8.241            8.284
     Training and Professional Development             2.292             2.341              2.345             2.358
     Documentation, Publications, Information Dissemination             2.404             2.456              2.461             2.473
     Organization & Management Counselling             0.176             0.180              0.180             0.181
     Networks             3.181             3.249              3.255             3.272
CENTER TOTAL           37.230           38.030            38.100           38.300

IRRI Financial Plan  123
 Table 5. IRRI Cost Allocation: Allocation of Projects Cost to CGIAR Regions, 2005-2006
(in $ millions)

2005 2006
Project Region (actual) (estimated)

001.  Germplasm conservation,  Sub‐Saharan Africa (SSA)                0.159                0.160

characterization, documentation and  Asia                2.697                2.720
exchange Latin America and the Caribbean (LAC)                0.159                0.160
West Asia and North Africa (WANA)                0.159                0.160
               3.173               3.200

002.  Functional genomics Sub‐Saharan Africa (SSA)                0.235                0.254

Asia                3.753                4.066
Latin America and the Caribbean (LAC)                0.469                0.508
West Asia and North Africa (WANA)                0.235                0.254
               4.691               5.083

003.  Genetic enhancement for yield,  Sub‐Saharan Africa (SSA)                0.453                0.465

grain quality, and stress resistance Asia                3.018                3.102
Latin America and the Caribbean (LAC)                0.113                0.116
West Asia and North Africa (WANA)                0.189                0.194
               3.772               3.877

Sub‐Saharan Africa (SSA)                0.202                0.192

004.  Managing resources under  Asia                3.843                3.639
intensive rice‐based systems Latin America and the Caribbean (LAC)
West Asia and North Africa (WANA)
               4.045               3.830

005.  Enhancing water productivity in  Sub‐Saharan Africa (SSA)
rice‐based production systems Asia                2.048                2.101
Latin America and the Caribbean (LAC)
West Asia and North Africa (WANA)                0.063                0.065
               2.111               2.166

006.  Irrigated Rice Research Consortium Sub‐Saharan Africa (SSA)
Asia                0.661                0.848
Latin America and the Caribbean (LAC)
West Asia and North Africa (WANA)
               0.661               0.848

124 IRRI Financial Plan 
 Table 5. IRRI Cost Allocation: Allocation of Projects Cost to CGIAR Regions, 2005-2006
(in $ millions)

2005 2006
Project Region (actual) (estimated)

007.  Genetic enhancement for  Sub‐Saharan Africa (SSA)                0.623                0.720

improving productivity and human  Asia                4.984                5.758
health in fragile environments Latin America and the Caribbean (LAC)
West Asia and North Africa (WANA)                0.623                0.720
               6.230               7.198

Sub‐Saharan Africa (SSA)
008.  Natural resource management for  Asia                3.952                4.797
rainfed lowland and upland rice  Latin America and the Caribbean (LAC)
ecosystems West Asia and North Africa (WANA)
               3.952               4.797

009.  Consortium for Unfavorable Rice  Sub‐Saharan Africa (SSA)
Environments Asia                0.562                0.562
Latin America and the Caribbean (LAC)
West Asia and North Africa (WANA)
               0.562               0.562

010.  Understanding rural livelihood  Sub‐Saharan Africa (SSA)
systems for rice research prioritization  Asia                1.535                1.608
and impact assessment Latin America and the Caribbean (LAC)
West Asia and North Africa (WANA)
               1.535               1.608

011. Facilitating rice research for impact Sub‐Saharan Africa (SSA)                0.063                0.081

Asia                2.964                3.817
Latin America and the Caribbean (LAC)                0.063                0.081
West Asia and North Africa (WANA)                0.063                0.081
               3.153               4.061

Summary by Region: 2005 2006

(actual) (estimated)
Sub‐Saharan Africa (SSA)                1.734                1.872
Asia              30.016              33.018
Latin America and the Caribbean (LAC)                0.804                0.866
West Asia and North Africa (WANA)                1.331                1.474
CENTER TOTAL              33.885              37.230

IRRI Financial Plan  125
 Table 5. IRRI Cost Allocation: Allocation of Projects Cost to CGIAR Regions, 2007-2009
(in $ millions)

2007 2008 2009

Program Region (proposal) (plan 1) (plan 2)

001.  Raising productivity in  Sub‐Saharan Africa (SSA)         0.522          0.525          0.530

rainfed environments:  attacking  Asia         9.912          9.975        10.070
the roots of poverty Latin America and the Caribbean (LAC)
West Asia and North Africa (WANA)
     10.434        10.500       10.600

002.  Sustaining productivity in  Sub‐Saharan Africa (SSA)         0.474          0.475          0.480

intensive rice‐based systems: rice  Asia         8.997          9.025          9.120
and the environment Latin America and the Caribbean (LAC)
West Asia and North Africa (WANA)
       9.470          9.500         9.600

003.  East and southern Africa: rice  Sub‐Saharan Africa (SSA)         2.103          2.100          2.100

for rural incomes and an  Asia
affordable urban staple Latin America and the Caribbean (LAC)
West Asia and North Africa (WANA)
       2.103          2.100         2.100

Sub‐Saharan Africa (SSA)         0.099          0.100          0.100

004.  Rice and human health:  Asia         1.882          1.900          1.900
overcoming the consequences of  Latin America and the Caribbean (LAC)
poverty West Asia and North Africa (WANA)
       1.981          2.000         2.000

005.  Rice genetic diversity and  Sub‐Saharan Africa (SSA)         0.310          0.310          0.310

discovery: meeting the needs of  Asia         4.958          4.960          4.960
the future generations for rice  Latin America and the Caribbean (LAC)         0.620          0.620          0.620
genetic resources West Asia and North Africa (WANA)         0.310          0.310          0.310
       6.198          6.200         6.200

126 IRRI Financial Plan 
 Table 5. IRRI Cost Allocation: Allocation of Projects Cost to CGIAR Regions, 2007-2009
(in $ millions)

2007 2008 2009

Program Region (proposal) (plan 1) (plan 2)

006.  Information and  Sub‐Saharan Africa (SSA)         0.361          0.360          0.360

communication:  convening a  Asia         3.067          3.060          3.060
global rice research community Latin America and the Caribbean (LAC)         0.180          0.180          0.180
West Asia and North Africa (WANA)
       3.608          3.600         3.600

007.  Rice policy support and  Sub‐Saharan Africa (SSA)         0.424          0.420          0.420

impact assessment for rice research Asia         3.812          3.780          3.780
Latin America and the Caribbean (LAC)
West Asia and North Africa (WANA)
       4.236          4.200         4.200

Summary by Region: 2007 2008 2009

(proposal) (plan 1) (plan 2)
Sub‐Saharan Africa (SSA)         4.292          4.290          4.300
Asia       32.628        32.700        32.890
Latin America and the Caribbean (LAC)         0.800          0.800          0.800
West Asia and North Africa (WANA)         0.310          0.310          0.310
CENTER TOTAL        38.030        38.100         38.300

IRRI Financial Plan  127
 Table 6. IRRI Expenditures by Object, 2005-2009
(in $ millions)

2005 2006 2007 2008 2009

OBJECT OF EXPENDITURES (actual) (estimated) (proposal) (plan 1) (plan 2)
Personnel           13.300           15.429           15.753           16.100           16.300
Supplies and Services           11.489           13.935           15.152           15.100           15.100
Collaborators/ Partners             4.144             4.418             3.442             3.400             3.400
Operational Travel             2.906             1.398             1.488             1.400             1.400
Depreciation             2.046             2.050             2.195             2.100             2.100
CENTER TOTAL           33.885           37.230           38.030           38.100           38.300

128 IRRI Financial Plan 
 Table 7. IRRI Financing: Unrestricted and Restricted Grants and Center Income
( in $ millions )

2005 2006 2007

(actual) (estimate) (proposal)

Unrestricted Grants (US$) (US$) (US$)

Australia                   0.616                  0.563                  0.558

Canada                   0.863                  0.970                  1.011
China                   0.140                  0.140                  0.140
Denmark                   0.443                  0.480                  0.475
Germany                   0.158                  0.160                  0.158
Japan                   1.831                  1.522                  1.595
Korea                   0.150                  0.150                  0.150
Netherlands                   0.432                  0.410                  0.410
Norway                   0.303                  0.327                  0.324
Philippines                   0.097                  0.100                  0.100
Sweden                   0.509                  0.508                  0.503
Switzerland                   0.497                  0.493                  0.488
Thailand                   0.040                  0.040                  0.040
United Kingdom                   2.017                  2.199                  2.227
United States of America                   3.200                  2.720                  2.720
Vietnam                   0.015                  0.015                  0.015
World Bank                   1.550                  1.550                  1.550
subtotal                    12.861                12.347                 12.464

2005 2006 2007

(actual) (estimate) (proposal)

Attributed Grants (US$) (US$) (US$)

Canada (Africa)                   0.068                      ‐                      ‐

European Commission                   1.631                  1.763                  1.745
France                   0.142                  0.153                  0.152
India                   0.150                  0.300                  0.300
Japan                   1.100                  1.100                  1.100
Korea                   0.050                  0.050                  0.050
subtotal                      3.141                  3.366                   3.347

Total Unrestricted and Attributed                  16.002                15.713                 15.811

IRRI Financial Plan  129
 Table 7. IRRI Financing: Unrestricted and Restricted Grants and Center Income
( in $ millions )

2005 2006 2007

(actual) (estimate) (proposal)

Restricted (US$) (US$) (US$)

ADB                   0.789                  1.417                  0.993

Australia                   0.356                  0.389                   0.226
Canada                   0.038                  0.052                  0.013
European Commission                   0.299                  0.356                  0.617
FAO                      ‐                  0.009                      ‐
France                   0.330                  0.330                  0.330
Germany                   1.004                  1.077                  1.212
IDRC                   0.016                      ‐
IFAD                   0.468                  0.992                  1.963
IFA/IPI/PPI‐PPIC                   0.146                  0.160                  0.108
Iran                   0.078                  0.339                  0.300
Japan                   0.104                  0.222                  0.340
Korea                   0.598                  0.750                  0.467
Malaysia                  0.063                  0.070
Monsanto Funds                   0.090                  0.047                      ‐
Others                   0.226                  0.187                  0.600
Philippines                   0.055                  0.067                  0.032
Rockefeller Foundation                   0.830                  0.657                  0.272
Switzerland                   1.517                  1.145                  0.847
UNEP                      ‐                      ‐                  0.300
United Kingdom                   0.187                  0.107                      ‐
United States of America                   0.385                  1.451                  1.624
World Bank                   0.528                  0.630                  0.020
subtotal                      8.044                10.447                 10.334

2005 2006 2007

(actual) (estimate) (proposal)

Challenge Programs (US$) (US$) (US$)

Challenge Program ‐ Generation                   1.745                  2.040                   1.779

Challenge Program ‐ Harvest Plus                   0.493                  0.570                   0.549
Challenge Program ‐ Water and Food                   2.653                  3.094                   2.666
subtotal                      4.891                  5.704                   4.994

Total Restricted Projects                   12.935                16.151                 15.328

TOTAL CONTRIBUTIONS                    28.937                31.864                 31.139

2005 2006 2007

Summary Statement of Activity (actual) (estimate) (proposal)

Investor Grants                 28.937                31.864                 31.139

+   Center Income / Reserves, net of unrealized 
foreign exchange translation loss                     1.858                   1.800                   1.800
=   Total Revenues                 30.795                33.664                 32.939
Less:  Total Expenses                 33.885                37.230                 38.030
= Surplus (Deficit) of total revenues over expenses                  (3.090)                 (3.566)                 (5.091)

130 IRRI Financial Plan 
 Table 8. IRRI Allocation of Investor Grants and Center Income to Projects, 2006
( in $ millions )

2006
Member estimate
Project 1 Germplasm conservation, 
characterization, documentation, and  CP‐Generation                 0.474
exchange CP‐HarvestPlus                 0.161
CP‐ Water and Food                 0.121
EC                 0.425
Iran                 0.007
Japan                 0.200
Korea                 0.069
Others                 0.058
Switzerland                 0.057
USAID                 0.044
World Bank                 0.255
Unrestricted + center income                 1.329
Total Project Cost                 3.200
Project 2 Functional Genomics
Australia                 0.204
CP‐Generation                 1.224
CP‐ Water and Food                 0.144
Germany                 0.145
EC                 0.529
France                 0.015
Iran                 0.078
Japan                 0.200
Korea                 0.111
Rockefeller Foundation                 0.078
Switzerland                 0.025
USAID                 0.633
USDA                 0.091
World Bank                 0.025
Unrestricted + center income                 1.581
Total Project Cost                 5.083
Project 3 Genetic enhancement for yield, grain 
quality, and stress resistance CP‐HarvestPlus                 0.030
CP‐ Water and Food                 0.211
France                 0.076
Iran                 0.085
India                 0.300
Japan                 0.200
Korea                 0.505
Malaysia                 0.036
Philippines                 0.029
Switzerland                 0.050
World Bank                 0.038
Unrestricted + center income                 2.317
Total Project Cost                 3.877

IRRI Financial Plan  131
 Table 8. IRRI Allocation of Investor Grants and Center Income to Projects, 2006
( in $ millions )

2006
Member estimate
Project 4 Managing resources under intensive 
rice‐based productive systems ADB                 0.271
CP‐ Water and Food                 0.191
Germany                 0.281
France                 0.046
IFA,PPI‐PPIC,IPI                 0.160
Japan                 0.249
Malaysia                 0.027
Others                 0.011
Rockefeller Foundation                 0.009
Switzerland                 0.308
UK‐DFID                 0.049
World Bank                 0.126
Unrestricted + center income                 2.102
Total Project Cost                 3.830
Project 5 Enhancing water productivity in rice‐
based production systems CP‐ Water and Food                 0.467
Germany                 0.059
France                 0.030
Japan                 0.158
Korea                 0.023
Switzerland                 0.097
World Bank                 0.021
Unrestricted + center income                 1.311
Total Project Cost                 2.166
Project 6 Irrigated Rice Research Consortium
CP‐ Water and Food                 0.039
Switzerland                 0.371
World Bank                 0.007
Unrestricted + center income                 0.431
Total Project Cost                 0.848

132 IRRI Financial Plan 
 Table 8. IRRI Allocation of Investor Grants and Center Income to Projects, 2006
( in $ millions )

2006
Member estimate
Project 7 Genetic enhancement for improving 
productivity and human health in  ADB                 0.187
fragile environments Canada                 0.052
CP‐Generation                 0.342
CP‐HarvestPlus                 0.338
CP‐ Water and Food                 0.443
Germany                 0.578
EC                 0.808
France                 0.072
Japan                 0.100
Korea                 0.025
Monsanto Fund                 0.047
Others                 0.114
Rockefeller Foundation                 0.570
Switzerland                 0.051
USAID                 0.460
World Bank                 0.047
Unrestricted + center income                 2.964
Total Project Cost                 7.198
Project 8 Natural resource management for 
rainfed lowland and upland rice  CP‐ Water and Food                 1.151
ecosystems Germany                 0.014
France                 0.152
IFAD                 0.992
Japan                 0.200
Korea                 0.006
Switzerland                 0.135
UK‐DFID                 0.030
World Bank                 0.033
Unrestricted + center income                 2.084
Total Project Cost                 4.797
Project 9 Consortium for Unfavorable Rice 
environments ADB                 0.343
CP‐ Water and Food                 0.018
World Bank                 0.003
Unrestricted + center income                 0.198
Total Project Cost                 0.562

IRRI Financial Plan  133
 Table 8. IRRI Allocation of Investor Grants and Center Income to Projects, 2006
( in $ millions )

2006
Member estimate
Project 10 Understanding rural livelihood systems 
for rice research prioritization and  Australia                 0.185
impact assessment CP‐HarvestPlus                 0.041
CP‐ Water and Food                 0.108
Japan                 0.015
Others                 0.008
Philippines                 0.007
USDA                 0.039
World Bank                 0.019
Unrestricted + center income                 1.186
Total Project Cost                 1.608
Project 11 Facilitating rice research for impact
ADB                 0.616
CP‐ Water and Food                 0.201
EC                 0.357
France                 0.092
Iran                 0.169
Korea                 0.061
Others                 0.005
Philippines                 0.031
Switzerland                 0.051
UK‐DFID                 0.028
USAID                 0.184
World Bank                 0.056
Unrestricted + center income                 2.210
Total Project Cost                 4.061

Center Totals 2006

Total Restricted Financing               19.517
Total Unrestricted Financing + Center Income+ Reserves               17.713
Total Allocations               37.230

134 IRRI Financial Plan 
 Table 8. IRRI Allocation of Investor Grants and Center Income to Programs, 2007
( in $ millions )

2007
Member proposal
Program 1  Raising productivity in rainfed 
environments:  attacking the roots of  ADB          0.322
poverty Australia          0.023
Canada          0.008
CP‐Generation          0.455
CP‐HarvestPlus          0.329
CP‐ Water and Food          1.100
Germany          0.605
EC          0.606
France          0.267
IFA,PPI‐PPIC,IPI          0.032
IFAD          0.539
Iran          0.052
India          0.120
Japan          0.529
Korea          0.153
Malaysia          0.025
Others          0.294
Philippines          0.007
Rockefeller Foundation          0.163
Switzerland          0.117
UNEP          0.090
USAID          0.492
USDA          0.001
World Bank          0.004
Unrestricted + center income          4.101
Total Project Cost        10.434
Program 2 Sustaining productivity in intensive rice‐
based systems: rice and the environment ADB          0.183
Australia          0.022
CP‐Generation          0.076
CP‐ Water and Food          0.532
Germany          0.275
EC          0.125
France          0.093
IFA,PPI‐PPIC,IPI          0.065
IFAD          0.158
Iran          0.052
India          0.120
Japan          0.357
Korea          0.151
Malaysia          0.034
Others          0.083
Philippines          0.005
Switzerland          0.582
UNEP          0.180
USAID          0.015
USDA          0.001
World Bank          0.014
Unrestricted + center income          6.347
Total Project Cost          9.470

IRRI Financial Plan  135
 Table 8. IRRI Allocation of Investor Grants and Center Income to Programs, 2007
( in $ millions )

2007
Member proposal
Program 3 East and southern Africa: rice for rural 
incomes and an affordable urban staple ADB          0.049
Australia          0.002
Canada          0.003
CP‐Generation          0.126
CP‐HarvestPlus          0.110
CP‐ Water and Food          0.084
Germany          0.230
EC          0.223
France          0.030
IFA,PPI‐PPIC,IPI          0.011
Iran          0.022
India          0.060
Japan          0.099
Korea          0.076
Malaysia          0.011
Others          0.086
Philippines          0.003
Rockefeller Foundation          0.054
Switzerland          0.031
UNEP          0.030
USAID          0.130
World Bank          0.002
Unrestricted + center income          0.631
Total Project Cost          2.103
Program 4 Rice and human health: overcoming the 
consequences of poverty Canada          0.002
CP‐Generation          0.126
CP‐HarvestPlus          0.110
CP‐ Water and Food          0.053
Germany          0.102
EC          0.160
France          0.012
Japan          0.020
Others          0.066
Rockefeller Foundation          0.055
USAID          0.087
Unrestricted + center income          1.188
Total Project Cost          1.981
Program 5 Rice genetic diversity and discovery: 
meeting the needs of the future  Australia          0.151
generations for rice genetic resources CP‐Generation          0.789
CP‐ Water and Food          0.852
EC          0.945
France          0.012
Iran          0.061
Japan          0.360
Korea          0.102
USAID          0.378
USDA          0.006
Unrestricted + center income          2.542
Total Project Cost          6.198

136 IRRI Financial Plan 
 Table 8. IRRI Allocation of Investor Grants and Center Income to Programs, 2007
( in $ millions )

2007
Member proposal
Program 6 Information and communication:  
convening a global rice research  ADB          0.029
community CP‐Generation          0.207
EC          0.020
France          0.004
Iran          0.008
Japan          0.005
Korea          0.003
Others          0.071
USAID          0.014
Unrestricted + center income          3.247
Total Project Cost          3.608
Program 7 Rice policy support and impact 
assessment for rice research ADB          0.410
Australia          0.028
CP‐ Water and Food          0.045
EC          0.283
France          0.064
IFAD          1.266
Iran          0.105
Japan          0.070
Korea          0.032
Philippines          0.017
Switzerland          0.117
USAID          0.500
Unrestricted + center income          1.299
Total Project Cost          4.236

Center Totals 2007

Total Restricted Financing        18.675
Total Unrestricted Financing + Center Income+ Reserves        19.355
Total Allocations        38.030

IRRI Financial Plan  137
 Table 9: IRRI Staff Composition:
Internationally and Nationally Recruited Staff, 2005-2009
( numbers )

2005 2006 2007 2008 2009

STAFF TYPE (actual) (estimated) (proposal) (plan 1) (plan 2)

Internationally Recruited Staff (IRS) 72 76 78 78 78

Post Doctoral Fellows (PDF) 22 28 24 24 24

Nationally Recruited Staff (NRS) 790 845 841 841 841

Center Total 884 949 943 943 943

138 IRRI Financial Plan 
 Table 10. IRRI Financial Position:
Currency Structure of Expenditures, 2005-2007
(in $ millions)

2005 2006 2007

(actual) (estimated) (proposal)

Currency Amount US$ Value % Share Amount US$ Value % Share Amount US$ Value % Share

US Dollar (USD)        22.358        22.358 66%        25.030        25.030 67% 25.011 25.011 66%

Philippine Peso (PHP)      596.709        10.849 32%      632.512        11.500 31% 664.137 12.299 32%

Others (Others)          0.678 2%          0.700 2% 0.720 2%

CENTER TOTAL        33.885 100%        37.230 100% 38.030 100%

IRRI Financial Plan 

139
 Table 11. IRRI Financial Position:
Statements of Financial Position
December 31, 2005 and 2004
(in $ millions)

2005 2004
A S S E T S

CURRENT ASSETS
    Cash and cash equivalents                 21.861                 35.035 
    Short term investments                   0.039                   2.836 
    Accounts receivable 
          Donor                   6.876                   4.244 
          Employees                   0.153                   0.116 
          Other CGIAR Centers                   0.335                   0.163 
          Others                   1.807                   0.713 
    Inventories, net                   0.475                   0.382 
    Prepaid expenses                    0.253                   0.172 
          Total current assets                 31.799                 43.661 

 NON‐CURRENT ASSETS 
    Property, Plant and Equipment, net                   8.524                   9.127 
    Other Assets                 19.671                 10.196 
          Total Non‐Current Assets                 28.195                 19.323 
TOTAL ASSETS                  59.994                 62.984 

 LIABILITIES AND NET ASSETS 

 CURRENT LIABILITIES 
    Accounts payable
          Donor                   6.382                   5.068 
          Other CGIAR Centers                   0.085                   0.160 
          Others                   1.078                   0.997 
    Accruals  and provisions                   7.110                   6.122 
          Total current liabilities                 14.655                 12.347 
 NET ASSETS 
          Designated                 45.339                 48.448 
          Undesignated                         ‐                     2.189 
    Total Net Assets                 45.339                 50.637 
TOTAL LIABILITIES AND NET ASSETS                  59.994                 62.984 

140 IRRI Financial Plan 
 Table 12. IRRI Financial Position:
Statement of Activities
For the Years Ended December 31, 2005 and 2004
(in $ millions)

Unrestricted Restricted Total Total

Challenge 
Temporary 2005 2004
Programs

Revenue and Gains
   Grant Revenue                 12.861                  11.185                    4.891                  28.937                   32.636 
   Other revenue and gains                   1.858                         ‐                           ‐                      1.858                     2.540 
   Total revenue and gains                 14.719                  11.185                    4.891                  30.795                   35.176 

Expenses and Losses
   Program related expenses                 11.921                  10.679                    4.891                  27.491                   27.227 
   Management and general expenses                   7.154                    0.506                         ‐                     7.660                     7.893 
      Sub Total expenses and losses                 19.075                  11.185                    4.891                  35.151                   35.120 
   Indirect cost recovery                 (1.266)                        ‐                           ‐                    (1.266)                  (1.906)
      Total expenses and losses                 17.809                  11.185                    4.891                  33.885                   33.214 
   Net Surplus from ordinary activities                 (3.090)                        ‐                           ‐                    (3.090)                    1.962 
   Unrealized Foreign Exchange Translation Gain                 (2.295)                        ‐                           ‐                    (2.295)                    1.532 

   NET SURPLUS (DEFICIT)                  (5.385)                         ‐                            ‐                     (5.385)                    3.494 

Expenditure by Natural Classification
   Personnel                   8.153                    4.296                    0.851                  13.300                   12.917 
   Supplies and Services                   7.864                    3.801                    1.090                  12.755                   13.124 
   Collaborators/Partnership                   0.243                    1.311                    2.590                    4.144                     4.589 
   Operational Travel                   1.008                    1.538                    0.360                    2.906                     2.226 
   Depreciation                   1.807                    0.239                         ‐                      2.046                     2.264 
   Indirect cost recovery                 (1.266)                        ‐                           ‐                    (1.266)                  (1.906)
TOTAL                  17.809                   11.185                     4.891                   33.885                   33.214 

IRRI Financial Plan  141
  

142
  

IRRI ANNEX 1

143
144
Annex1. IRRI’s key collaborators and partners

IRRI Programs 
TYPE  COUNTRY  ORGANIZATION  Acronym 
1  2  3  4  5  6  7 
NARES  Bangladesh  Bangladesh Agricultural Research Institute  BARI               
    Bangladesh Fisheries Research Institute  BFRI               
    Bangladesh Institute of Development Studies  BIDS               
    Bangladesh Institute of Nuclear Agriculture  BINA               
    Bangladesh Rice Research Institute  BRRI               
    Bangladesh Water Development Board  BWBD               
    Center for Policy Dialogue   CPD               
    Local Government Engineering Department, Bangladesh  LGED               
    Rural Development Academy, Bogra  RDA               
    University of Dhaka  UD               
  Cambodia  Cambodian Agricultural Research and Development Institute  CARDI               
Provincial Department of Agriculture, Forestry and Fisheries, Prey 
    PDAFF               
Veng  and Battambang Provinces 
  China  Beijing Genomics  Institute                 
    Center for Chinese Agricultural Policy ‐ Chinese Academy of Sciences  CCAP‐CAS               
    China  National Rice Research Institute  CNRRI               
    China Agricultural University  CAU               
    China National Hybrid Rice Research and Development Center  CNHRRDC               
    Chinese Academy of Agricultural Sciences  CAAS               
    Fudan University, Shanghai  FU               
    Guangdong Academy of Agricultural Sciences  GAAS               
    Guangxi Academy of Agricultural Sciences, Nanning  GAAS‐Guangxi               
    Huazhong Agricultural University  HAU‐Huazhong               
    Hunan Agricultural University  HAU‐Hunan               
    Kaifeng Water Bureau                 

IRRI Annex 1 
 IRRI Programs 
TYPE  COUNTRY  ORGANIZATION  Acronym 
1  2  3  4  5  6  7 
    Liuyuankou Irrigation System  LIS               
    Nanjing Agricultural University  NAU               
    National Gene Research Center  NCGR               
    Northeast Agricultural University  NEAU               
    Yangzhou University   YU‐ China               
    Yunnan Academy of Agricultural Sciences   YAAS               
    Zanghe Irrigation System  ZIS               
    Zenzhou Water Bureau                 
    Zhongnan University of Economics and Law, Wuhan, China  ZUEL               
  India  Agricultural University, Patnagar                 
    Assam Agricultural University  AAU               
    Birsa Agricultural University  BAU               
    Central Rainfed Upland Rice Research Station (Hazaribagh)  CRURRS               
    Central Rice Research Institute  CRRI‐India               
    Central Soil Salinity Research Institute  CSSRI‐India               
    Chinsurah Rice Research Station, West Bengal  CRRS               
    Department of Biotechnology  DBT‐India               
    Directorate of Rice Research‐ India  DRR               
    Govind Ballabh Pant University of Agriculture and Technology  GBPUAT               
    ICAR Research Complex for North Eastern Hill Region  IRCNEHR               
    Indian Agricultural Research Institute  IARI               
    Indian Agricultural Research Institute‐Water Technology Center  IARI‐WTC               
    Indian Council of Agricultural Research  ICAR               
    Indira Gandhi Agricultural University  IGAU               
    Narendra Deva University of Agriculture and Technology  NDUAT               
    National Center for Agricultural Economics Policy Research, India  NCAP ‐ India               

IRRI Annex 1 

145
146
IRRI Programs 
TYPE  COUNTRY  ORGANIZATION  Acronym 
1  2  3  4  5  6  7 
    Orissa Agricultural University  OAU               
    Orissa University of Agricultural Technology  OUAT               
    Project Directorate of Cropping Systems Research, Meerut  PDCSR               
    Punjab Agricultural University   PAU               
    Rajendra Agricultural University, Bihar  RAU               
    Ranchi University, Jharkhand, India  RU               
    Tamil Nadu Agricultural University   TNAU               
    Tamil Nadu Rice Research Institute   TNRRI               
    University of Agricultural Sciences, Bangalore  UASB               
    University of Delhi, South Campus  UD‐Delhi               
  Indonesia  Agrobusiness Club, Jakarta                 
    Assessment Institute for Agricultural Technology  AIAT               
    Assessment Institute for Agricultural Technology, South Sumatra   AIAT‐South Sumatra               
    Bogor Agricultural University (Institut Pertanian Bogor)  IPB               
    Center for Agro‐Socioeconomic Research  CASER               
    Indonesia South Sumatra Forest Fire Management Project  SSFFMP               
IAARD  (formerly 
    Indonesian Agency for Agricultural Research and Development                
AARD) 
Indonesian Center for Agricultural Biotechnology and Genetic 
    ICABGRRD               
Resources Research and Development  
Indonesian Center for Agricultural Post Harvest Research and 
    ICAPRD               
Development 
ICFORD (formerly 
    Indonesian Center for Food Crops R & D, Bogor               
CRIFC) 
Indonesian Center  for Soils and Agro‐climate Research and 
    ICSARD               
Development 
    Indonesian Institute for Rice Research  IIRR               
  Iran  Agricultural Biotechnology Research Institute of Iran  ABRI‐Iran               
    Rice Research Institute of Iran   RRII               

IRRI Annex 1 
 IRRI Programs 
TYPE  COUNTRY  ORGANIZATION  Acronym 
1  2  3  4  5  6  7 
  Kenya  Kenya Agricultural Research Institute  KARI               
  Lao PDR  National Agriculture and Forestry Research Institute, Lao PDR  NAFRI               
    National Rice Research Program  NRRP               
    Provincial Agriculture and Forestry Offices, Sayabouri and Oudomsay  PAFO               
  Malaysia  Malaysian Agricultural Research and Development Institute  MARDI‐Malaysia               
  Mozambique  Ministry of Agriculture and Rural Development  MADER               
    National Institute for Agronomic Research  INIA‐Mozambique               
  Myanmar  Agricultural Research Department  ARD               
    Myanma Agriculture Service  MAS               
    Myanmar Rice and Paddy Traders Association  MRPTA               
  Nepal  Institute of Agricultural and Animal Sciences, Nepal  IAAS               
    Nepal Agricultural Research Council  NARC‐Nepal               
  Philippines  Bohol Irrigation System                 
Bulacan Agricultural State College (formerly Bulacan National 
    BASC (BNASC)               
Agricultural State College) 
    Bureau of Soil and Water Management  BSWM               
    Central Luzon State University  CLSU               
    Food and Nutrition Institute                 
    National Irrigation Administration, Philippines  NIA‐Philippines               
    Philippine Rice Research Institute  PhilRice               
    University of the Philippines Los Baños  UPLB               
  Taiwan  Academia Sinica                 
  Tanzania  Ministry of Agriculture, Food and Cooperatives   MAFC               
    Sokoine University of Agriculture  SUA               
  Thailand  Chiang Mai University  CMU               
    Kasetsart University  KU               
    Khon Kaen University  KKU               

IRRI Annex 1 

147
148
IRRI Programs 
TYPE  COUNTRY  ORGANIZATION  Acronym 
1  2  3  4  5  6  7 
    Ministry of Agriculture and Cooperatives, Thailand  MOAC‐Thailand               
    Prachin Buri Rice Research Center  PBRRC               
    Ubon Ratchani Rice Research Center  URRRC               
    Ubon Rice Research Center   URRC               
  Uganda  Ministry of Agriculture, Animal Industry and Fisheries  MAAIF               
  Vietnam  Agricultural Science Institute for Southern Coastal Central of Vietnam  ASISOV               
    An Giang University  AGU               
Bac Lieu Department of Agriculture, Research Institute on 
                   
Aquaculture 
    Can Tho University  CTU               
    Center for Agricultural Energy and Machinery, NLU  CEAM‐NLU               
    Cuu Long Delta Rice Research Institute  CLRRI               
    Department of Agriculture and Rural Development, Long An Province                 
    Hue University of Agriculture and Forestry  HUAF               
    Integrated Resources Mapping Centre‐Vietnam  IRMC‐Vietnam               
    National Institute for  Soils and Fertilizers, Vietnam  NISF‐Vietnam               
    Plant Protection Department  PPD               
Southern Sub‐institute of Agricultural Engineering and Post Harvest 
    SIAEP               
Technology, Ho Chi Minh City 
    Thai Nguyen University  TNU               
Thai Nguyen University of Economics and Business Administration, 
    TUEBA               
Vietnam 
    University of Agriculture and Forestry   UAF‐Vietnam               
    Vietnam Academy of Agricultural Sciences  VAAS               
    Vietnam Agricultural Science Institute   VASI               
Vietnam Institute of Agricultural Engineering and Post Harvest 
    VIAEP               
Technology, Hanoi 
ARIs  Australia  Charles Sturt University                 

IRRI Annex 1 
 IRRI Programs 
TYPE  COUNTRY  ORGANIZATION  Acronym 
1  2  3  4  5  6  7 
    Commonwealth Scientific & Industrial Research Organization  CSIRO               
    Entomology and Land and Water Divisions, CSIRO                 
    University of Adelaide   UA               
  Canada  University of Alberta  UA‐Alberta               
    University of Saskatchewan  US               
Centre de coopération internationale en recherche agronomique pour 
  France  CIRAD               
le développement 
  Germany  Christian Albrecht University  CAU‐Kiel               
    University of Freiburg  UF               
    University of Hamburg  UH‐Hamburg               
    University of Hohenheim  UH‐ Hohenheim               
  Italy  Atmospheric Pollution Institute, National Center for Research                 
  Japan  Japan International Research Center for Agricultural Sciences  JIRCAS               
    Japan Society for the Promotion of Sciences  JSPS               
    National Agricultural and Food Research Organization  NARO               
    National Institute of Agrobiological Sciences  NIAS               
    National Institute of Agro‐Environmental Sciences, Japan  NIAES‐ Japan               
    National Institute of Genetics, Japan  NIG‐Japan               
    Tokyo University  TU‐Tokyo               
  Korea, South  Pohang University of Science and Technology  POSTECH               
    Rural Development Administration   RDA               
  Netherlands  Plant Research International  PRI               
    Wageningen University   WU‐ Netherlands               
  Sweden  University of Lund  UL ‐ Sweden               
United  University of New Castle upon Tyne‐ Center for Land Use and Water 
  Newcastle‐CLUWRR               
Kingdom  Resources Research 
    University of Reading   UR‐ United Kingdom               

IRRI Annex 1 

149
150
IRRI Programs 
TYPE  COUNTRY  ORGANIZATION  Acronym 
1  2  3  4  5  6  7 
  USA  Clemson University  Clem U               
    Cold Stream Harbor Laboratory  CSHL               
    Colorado State University  CSU               
    Cornell University  CU               
    Gramene: A Comparative Mapping Resource for Grains                 
    Kansas State University  KSU               
    National Center for Genetic Resources Preservation , USA  NCGRP‐ USA               
    National Center for Genome Resources  NCGR               
    Ohio State University  OSU               
    Oregon State University  OSU‐Oregon               
    Purdue University  PU               
    The Institute for Genomics Research  TIGR               
    University of Arizona   UA‐Arizona               
    University of Arkansas  UA‐Arkansas               
    University of California‐Davis  UCD               
    University of California‐Riverside  UCR               
International    Centro Internacional de Agricultura Tropical  CIAT               
    Africa Rice Center (WARDA)  WARDA               
    Centro Internacional de Mejoramiento de Maiz y Trigo  CIMMYT               
    East and Central African Rice Research Network  ECARRN               
    International Atomic Energy Agency  IAEA               
    International Center for Agricultural Research in the Dry Areas  ICARDA               
    International Center for Biosaline Agriculture  ICBA‐UAE               
    International Center for Research in the Semi‐Arid Tropics   ICRISAT               
    International Food Policy Research Institute   IFPRI               
    International Potash Institute  IPI               

IRRI Annex 1 
 IRRI Programs 
TYPE  COUNTRY  ORGANIZATION  Acronym 
1  2  3  4  5  6  7 
    International Water Management Institute   IWMI               
Potash & Phosphate Institute/Potash and Phosphate Institute of 
    PPI/PPIC               
Canada 
    Sasakawa Global 2000 Mozambique                 
    World Agroforestry Center  ICRAF               
    WorldFish Center  WorldFish               
Private Sector  Canada  Aquifer LTD                 
  Netherlands  Nunza B. V.  NBV               
  USA  The Samuel Roberts Noble Foundation  Noble Foundation                
Challenge 
  Water and Food  CPWF               
Programs 
    Generation   GCP               
    HarvestPlus  HP               

IRRI Annex 1 

151