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INTEGRAÇÃO DE ONTOLOGIAS:O domínio da Bioinformática e a problemática da

compatibilização terminológica

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As pesquisas em Bioinformática no Brasil vêm desenvolvendo estudos para prover um

ambiente que possa oferecer informação semântica sobre recursos científicos e
possibilitar o uso destes recursos de forma conjunta pela comunidade científica
interessada, através de consórcios entre instituições de pesquisa.Um dos aspectos que
envolvem a descrição e recuperação destes recursos e serviços está relacionado ao
desenvolvimento de uma linguagem padronizada para facilitar o entendimento dos
vocabulários, muitas vezes interdisciplinares. Este projeto de pesquisa propõe investigar
mecanismos de uso, desenvolvimento e integração de Ontologias a partir das bases
teóricas da Ciência da Informação e da Terminologia, que permitam a descrição e
recuperação dos recursos e serviços de Bioinformática, especificamente no domínio de
Genoma e Transcriptoma, visando apoiar as pesquisas nesta área no Brasil. Uma
ontologia é um conjunto de conceitos padronizados, termos e definições aceitos por uma
comunidade particular. Dentro do domínio de desenvolvimento de Ontologias, as
abordagens para a sua construção, na maioria das vezes, são específicas e limitadas. A
literatura, no âmbito da Ciência da Computação, tem privilegiado ora as ontologias
como vocabulários de domínios específicos, sem um suporte teórico, ora um conjunto
de regras e aportes teóricos, sem elementos que orientem a elaboração de vocabulários
axiomatizados. Além disto, verifica-se a existência de dois grandes problemas nas
metodologias para projeto de ontologia: a falta de explicação sistemática de como e
onde serão usadas as abordagens teóricas dentro de seu processo de elaboração; a não
existência dos estágios de integração e manutenção de ontologia no método na maioria
das metodologias.Acredita-se que o aporte teórico e metodológico existente no âmbito
da Ciência da Informação se beneficiando de estudos no escopo da Teoria da
Terminologia, Teoria do Conceito, Teoria da Classificação e Compatibilização de
Linguagens possa apresentar propostas eficazes de aplicação. Dentro desta
especificidade propõe quatro eixos de ações: 1. Identificar as bases teóricas da Ciência
da Informação e da Terminologia, no campo específico de construção e
compatibilização de ontologias, visando o compartilhamento e recuperação de
informação; 2. Identificar as Ontologias do domínio de Genoma e Transcriptoma
existentes internacionalmente e nacionalmente; 3. Identificar no Consórcio
Internacional que aspectos do projeto não estão sendo contemplados nas diversas
ontologias analisadas, visando atender as especificidades brasileiras; 4. Para os
domínios de Genoma e Transcriptma não atendidos nos consórcios investigados, propor
a modelização para o desenvolvimento deste domínio. O caminho metodológico
apresentado se apóia em dois campos de investigação: o campo empírico e o campo
teórico. O campo empírico pretende uma análise conceitual do campo de Genoma e
Transcriptoma, assim como das ontologias existentes e que possam abarcar este
domínio. No âmbito do campo teórico, e para apoiar as análises qualitativas que advém
da investigação do campo empírico, será necessário um estudo comparativo entre as
teorias apresentadas, visando apresentar eixos de investigação para a definição de
diretrizes dos dois produtos que se espera com esta investigação, ou seja: diretrizes para
a compatibilização de ontologias e diretrizes para a elaboração de ontologias de
domínios. Espera-se que este projeto venha possibilitar maior integração das
informações criando mecanismos para consolidar a participação do Brasil nos
consórcios internacionais que envolvem a pesquisa em Genoma e Transcriptoma.

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