Universidad del Cauca, Departamento de Química, Laboratorio de Bioquímica Popayán, Colombia
OBJETIVOS METODOLOGIA
Determinar la concentración de proteína Se prepararon 7 soluciones diluidas de
(albúmina bovina) mediante el método de concentración 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14 ppm a Lowry. partir de 100 mL de una solución de 30 ppm. Seguidamente se realizó el método de Determinar la concentración de 3 muestras Lowry (ver Figura 1). problema a partir la construcción de una curva de calibración.
Figura 1. Diagrama de flujo.
RESULTADOS
Cuadro 1. Registro del valor de absorbancia para las muestras de trabajo.
Valor de la absorbancia Concentración (ppm) observada (750 nm) Blanco 0.26 2 0.38 4 0.56 6 0.4 8 0.41 10 0.52 12 0.41 14 0.56 MP1 0.7 MP2 0.66 MP3 0.7 Datos en rojo: datos descartados. Figura 2. Curva calibración Proteína para 5 datos. Absorbancia-Concentración (ppm).
Tabla1. Datos obtenidos curva de calibración Proteína.
x y r b a sb sa -5 8. 0.19 0.916 0.016 0.06 1.725x10 1.38x10-3 0 4 7 5 2
Significancia de la correlación. Limites de confianza de la pendiente
Ho: r =0 (b) y la ordenada (a). Para t(n-2) grados de libertad, y un nivel r n −2 0.9167 5 −2 de confianza del 95%. t= t= = 3.97 1−r2 1 − 0.9167 2 b ± t ( n −2 ) s b t(calculado)>t(tabulado); 0.0165 ±(3.18 )(1.725 x10 −5 ) 3.97>3.18 para un contraste t de dos colas, = 0.0165 ±5.4855 x10 −5 t(n-2) grados de libertad, y un nivel de confianza del 95%. Se rechaza Ho. Existe a ± t ( n −2 ) s a correlación significativa. 0.062 ±(3.18 )(1.38 x10 −3 ) = 0.062 ±4.3884 x10 −3
Cuadro 2. Concentración calculada para las muestras problema.
Concentración Muestra Absorbancia calculada (ppm) Muestra problema 1 0.44 22.9 Muestra problema 2 0.4 20.48 Muestra problema 3 0.44 22.9 Error aleatorio de las concentraciones debido a que el posterior cálculo de las calculadas (Sxo). concentraciones de las soluciones ∑( y i − yˆi ) 2 = 0,02088468 problema presenta un error aleatorio muy alto lo que a su vez genera un límite de confianza muy amplio (88.5% para MP1 y Sy = ∑ (y i − yˆ ) 2 MP3, 98.97% para MP2) por encima y por x n−2 debajo de la concentración obtenida, generando que estas concentraciones 0,02088468 obtenidas no sean confiables. Sy = = 0.0834335 La tendencia no lineal de la curva es x 5−2 debida a la precipitación de la proteína, la cual fue diferente en cada muestra, ∑( x i − x ) 2 = 400 causando lecturas variables de la absorbancia. Sy 1 ( y − y) 2 Sx o = x 1+ + 2 o Análisis método de Lowry. El fundamento b n b ∑ ( xi − x ) 2 del método de Lowry para cuantificación de proteínas esta basado en la interacción Sx o = 6,3756439 de las proteínas con el reactivo de Folin (tungstato, molibdato y fosfato) en medio alcalino (pH 10-10.5) y con Cu 2+. Es una Límite de confianza de las valoración colorimétrica cuantitativa de las concentraciones calculadas (xo). proteínas, siendo la intensidad de color Para t(n-2) grados de libertad, y un nivel de proporcional a la concentración de confianza del 95%. proteínas. Este método consta de dos etapas: x o ± t ( n −2 ) Sx o En la primera los iones Cu2+, en medio alcalino, se unen a las proteínas formando 22 .9 ± (3.18 )6,375 = 22 .9 ± 20 .27 complejos con los átomos de nitrógeno de 20 .48 ± (3.18 )6.375 = 20 .48 ± 20 .27 los enlaces peptídicos. Estos complejos 22 .9 ± (3.18 )6,375 = 22 .9 ± 20 .27 Cu2+-proteína tienen un color azul claro. Además, provocan el desdoblamiento de la estructura tridimensional de la proteína, ANALISIS DE RESULTADOS exponiéndose los residuos fenólicos de tirosina que van a participar en la segunda Análisis curva de calibración Proteína. Al etapa de la reacción. El Cu2+ se mantiene observar la tendencia de los puntos sobre la en solución alcalina en forma de su curva de calibración fácilmente se puede complejo con tartrato. concluir que no existe una tendencia lineal. En la segunda parte se da la reducción, Sin embargo al aplicar la estadística del también en medio básico, del reactivo de caso se tiene que: el coeficiente de Folin-Ciocalteau, por los grupos fenólicos correlación para los todos los datos es muy de los residuos de tirosina, presentes en la inferior (r=0.3465) al aceptado (>0.95), mayoría de las proteínas, actuando el cobre por lo que se excluyen 2 datos (los más como catalizador. El principal alejados del intervalo según prueba Q), constituyente del reactivo de Folin- para obtener un r=0.9167 el cual sigue Ciocalteau es el ácido estando muy alejado del aceptado, pero fosfomolibdotúngstico, de color amarillo, que sin embargo presenta correlación que al ser reducido por los grupos significativa. Aunque el número de datos fenólicos da lugar a un complejo de color escogido (n=5) presente significacia azul intenso. correlativa, no es una significancia ideal Cuando el reactivo de Folin es adicionado necesarios para que la movilidad de la a la proteína tratada con Cu2+ el máximo proteína en una electroforesis SDS-PAGE color se da si la reducción ocurre alrededor sea acorde con su masa molecular. de un pH 10. En este punto el reactivo, La eficiencia del DTT como reductor de solo esta reactivo por un corto periodo de puentes disulfuro que se ubican tiempo. generalmente en el interior de la proteína, Posibles explicaciones de la precipitación se debe a su estructura química que le de la proteína para nuestro caso pueden ser permite formar un anillo de seis átomos al que no se dio la reacción previa de la oxidarse. proteína en medio alcalino con iones Cu2+, en presencia de tartrato, lo que permite la precipitación de la misma. Entre otras se CONCLUSIONES pudo presentar un rearreglo en la reducción primaria del producto por lo que el No fue posible demostrar la efectividad del espectro de absorción cambia de forma método de Lowry para la cuantificación de entre 3-30 minutos. Además durante el proteína de albúmina bobina, debido a que primer minuto o más después de la adición al adicionar el reactivo de Folin a los pocos del reactivo de Folin, éste libera ácido minutos la proteína se precipitó, muy extra, lo cual podría ser resultado de la posiblemente a que el buffer no pudo disociación del fosfomolibdato, generando amortiguar un exceso de ácido generado en que el buffer no pueda cumplir su función la disociación del fosfomolibdato. y se sobrepase el punto isoelectrico de la proteína lo que a su vez la precipita. Las concentraciones obtenidas para las muestras problema presentan poca confiabilidad ya que su rango de límite de PREGUNTAS COMPLEMENTARIAS confianza en muy amplio.
Determine las concentraciones de las
muestras problema en función de la BIBLIOGRAFIA curva de calibración. BOHINSKI, Robert. BIOQUIMICA. 5 ed. Cuadro 3. Concentración calculada. Mexico: Pearson. 1991. p. 80-96 Concentración MILLER, J. N.; MILLER, J. C. Estadística Muestra calculada y Quimiometría para Química Analítica. 4 (ppm) ed. España: Prentice Hall, 2002.p. 113-124 Muestra problema 1 22.9 Muestra problema 2 20.48 LEHNINGER, A. Principles of Muestra problema 3 22.9 Biochemistry. 4 ed. New York: Worth Publishers. 2006. p.38-41 ¿Para qué se emplea el meso-1,4- LOWRY, O.; ROSEBROUGH, N; FARR, dimercapto-2,3-butanodiol? Explicar el A.; and RANDALL, R. (1951) PROTEIN fundamento químico MEASUREMENT WITH THE FOLIN PHENOL El meso-1,4-dimercapto-2,3-butanodiol o REAGENT. The Journal of the Biological. ditiotreitol (DTT) es un compuestos capaz Chemistry. 193: 265-275 de reducir los enlaces disulfuro de las proteínas (-S-S-) a grupos sulfhidrilo (- SH). Permite desplegar completamente una proteína y separar las subunidades de una proteína multimérica; ambos efectos son