Ecología Microbiana

If I could do it all over again, and

relieve my vision in the twenty-
first century, I would be a
microbial ecologist.......

Edward O. Wilson

11/09/2006
Cátedra de Ecología Microbiana. 1
Facultad de Ciencias Exactas. UNLP

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 oikos=casa
logos= ley

Ecología:lalaciencia
Ecología: cienciaque
queexplora
exploralas
lasinterrelaciones
interrelaciones
entrelos
entre losorganismos
organismosyysu sumedio
medioambiente
ambientebiótico
bióticoyyabiótico
abiótico

Representa una nueva visión holística que reconoce la

importancia de todos los organismos vivos en el mantenimiento
del balance ecológico

EcologíaMicrobiana:
Ecología Microbiana:lalaciencia
cienciaque
queespecíficamente
específicamente
examinalas
examina lasrelaciones
relacionesentre
entrelos
losmicroorganismos
microorganismosyysusumedio
medio
ambientebiótico
ambiente bióticoyyabiótico
abiótico

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 El rápido desarrollo tecnológico que se inicio con la
revolución industrial trajo aparejado
„ Avances en las ciencias médicas, reducción de la tasa de
mortalidad Explosión demográfica

„ Producción industrial, extracción de recursos y la agricultura

intensiva Rápida disminución
de los recursos
no renovables

„ Producción de materiales Deterioro del

sintéticos medio ambiente

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 Las proyecciones de científicos y economistas
sobre crecimiento de población, consumo
contaminación.

El impacto social de la publicación del libro “Silent

Spring” de Rachel Carson

Se reconoció que los

microorganismos ocupan una
posición importante en el flujo
ordenado de los materiales y la
energía a través del ecosistema.

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 PAPEL DE LOS MICROORGANISMOS EN EL
FUNCIONAMIENTO DE LOS ECOSISTEMAS

Flujo
Flujo
de
de Algas eucarióticas
energía Productores
Productores
energía Cianobacterias
primarios
primarios Anoxifotobacterias
Bacterias quimiolitotrofas

Reciclado
Reciclado
de
de Consumidores Protozoos, Algas mixotrofas
Consumidores
nutrientes
nutrientes Bacterias (loop microbiano)

Descomponedores
Descomponedores Hongos, Bacterias

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Todos los seres vivos de la Tierra dependen de la
vida procariota
„ Miembros esenciales de la biosfera, hacen posible el
funcionamiento de los ciclos biogeoquímicos.
„ Están presentes en todos los lugares en los que
pueda existir vida.
‹ Tamaño pequeño: gran capacidad de dispersión.
‹ Variabilidad y flexibilidad metabólica: tolerar y
adaptarse a las condiciones ambientales.
‹ Plasticidad genética (transferencia horizontal de
genes): recombinar y recolectar las características
positivas.
„ Pueden integrarse a los actuales paradigmas
ecológicos
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 Si bien existen interacciones desfavorables entre la
actividad humana y los microorganismos:
enfermedad, degradación, etc.

Losmicroorganismos
Los microorganismosjuegan
jueganun
unimportante
importanterolrol en
enla
la
resoluciónde
resolución deproblemas
problemasambientales
ambientalesyyeconómicos
económicos

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 BIODEGRADACIÓN Y RECICLAJE
-Depuración de aguas residuales
-Tratamiento de residuos sólidos
Tercer tema
-Alteración microbiana de alimentos
-Biodeterioro de materiales
-Microbiología el petróleo
-Biodegradación de productos recalcitrantes

APROVECHAMIENTO ECONÓMICO Y
APLICACIONES AGRÍCOLAS
-Producción de energías alternativas renovables
-Biominería y recuperación de metales
-Obtención de alimentos y suplementos de la dieta
-Aplicaciones agrícolas (micorrizas, fertilizantes,..)
-Control biológico de plagas

CONOCIMIENTO DE MEDIOS EXTREMOS

-Obtención de productos (enzimas, antibióticos, antitumorales...)
-Investigación espacial
-Estudios sobre el origen de la vida
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Además....
Este universo de vida “invisible”
representa un vasto terreno todavía
inexplorado de conocimiento y
diversidad biológica.

No sabríamos La fotosíntesis Los seres vivos

de la vida en sería aerobia y más longevos
condiciones oxigénica no superarían
extremas los 1000 años

Sin el conocimiento de los microorganismos la

biología sería muchos más limitada
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 Los microorganismos constituyente el
principal componente de la biodiversidad
pero....

Se requerían herramientas apropiadas para

cuantificar y evaluar:
„ La diversidad (microorganismos presentes)
„ La distribución (heterogeneidad espacial y
temporal de las comunidades en su ambiente).
„ La actividad (funciones de los microorganismos)

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 Estos estudios estuvieron limitados durante
años a la microbiota que puede ser
cultivada en el laboratorio:

„ Condiciones ambientales artificiales que

solo permite el desarrollo de unos pocos
microorganismos.
„ Los resultados dependen de la habilidad,
persistencia y suerte del investigador.

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• G J Olsen, D J Lane, S J Giovannoni, N R Pace, D A Stahl.1986.
Microbial Ecology and Evolution: A Ribosomal RNA Approach.
Annu. Rev. of Microbiol., 40: 337-365
• N R Pace, D A Stahl, D J Lane, G J Olsen.1986.The Analysis of
Natural Microbial Populations by ribosomal RNA sequences.En
Advances in Microbial Ecology. Vol. 9. K.C. Marshall (Ed.).
Plenum Press, pp. 1-55.

Metodología que
liberó a la
microbiología de la
“esclavitud” del
cultivo en placa

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 Desafío del siglo XXI
Convertir estas “piezas
inanimadas de información”
(genes) en conocimiento de la
actividad celular

Integración de los estudios

tradicionales de fisiología, genética
y ecología con las modernas
genómica y proteómica.

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 If I could do it all over again, and relieve my vision in the
twenty-first century, I would be a microbial ecologist. Ten
billion bacteria live in a gram of ordinary soil, a mere pinch
held between thumb and forefinger. They represent
thousands of species, almost none of which are known to
science. Into that world I would go with the aid of modern
microscopy and molecular analysis. I would cut my way
through clonal forests sprawled across grains of sand, travel
in an imagined submarine through drops of water
proportionately the size of lakes, and track predators and
prey in order to discover new life ways and alien food webs.
All this, and I need venture no farther than ten paces
outside my laboratory building.

Edward O. Wilson. Naturalist (1994). Island Press,

Washington, p. 364
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 Los comienzos de la microbiología
„ Antony van Leeuwenhoek (1676) descubre y describe
microorganismos en su hábitat natural (gota de lluvia).
Primeros estudios en Ecología Microbiana.

„ Desde Lazzaro Spallanzani (1776) hasta Louis

Pasteur (1859) y durante las controversias por la
teoría de la generación espontánea plantearon la
existencia de microorganismos en el aire, causantes
de la putrefacción de los materiales.

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„ John Tyndall y Ferdinand Cohn (1877) comienzan los
estudios de las endosporas bacterianas, mostrando
que sobreviven en el aire, pueden diseminarse de un
ecosistema a otro, adaptándose al stress ambiental,
sobreviviendo durante largos períodos.
Profunda influencia en
el desarrollo de la
„ Robert Koch (1876) demuestra queMicrobiología.
el carbunco es
causado por un microorganismo. Aislar estudiar

„Teoría microbiana de la enfermedad.

„Técnicas de cultivo puro.
„Introduceel agar-agar como solidificante en los
medios de cultivo.
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 El período del cultivo puro
(mediados del siglo XIX-mediados del siglo XX).

Microbiólogos
Enfrascados en los cultivos puros.
No proveen información sobre la
interacción entre los
microorganismos y su entorno (ej.
Penicilina)
Biólogos
Técnicas de la macrobiología.
Dificultades metodológicas frente a
los microorganismos (tamaño,
pocos detalles morfológicos, etc.).
Consideraron a los
microorganismos como sustancias
químicas no vivas.

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 Sin embargo algunos estudios empezaron a
establecer la importancia del rol de la actividad
metabólica microbiana en los procesos ecológicos
globales.
„ Nicolas-Theodore de Saussure (1839) la
capacidad de los microorganismos del suelos de
oxidar H2. Recién se aislaron en el siglo XX.

„ Jacques Theophile Schloesing y Achille Müntz

(1879) capacidad de los microorganismos del
suelo de oxidar el amonio a nitrato.

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 Quimiolitrótofas

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 La Ecología Microbiana en el Siglo XX
„ Sergei Winogradsky (finales del siglo XIX).
‹ Aisla las bacterias nitrificantes.
‹ Desarrolla un sistema para crecimiento de las
bacterias microaerófilas y fotosintéticas del suelo
(Columna de Winogradsky).
‹ Describe la oxidación microbiana de el sulfídrico y del
ferroso, se describe la vida quimiolitrótofa.
‹ Describe la fijación del nitrógeno y la simbiosis con
plantas.
‹ Clasifica a los microorganismos del suelo: autóctonos
y zimogenos

Esconsiderado
Es consideradoelelpadre
padrede
dela
lamicrobiología
microbiologíadel
delsuelo
suelo
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„ Martinus Beijerinck (principios del siglo XX)
“La forma en que yo enfoco la microbiología….puede
exponerse brevemente como el estudio de la
ecología microbiana, es decir la relación entre las
condiciones ambientales y las formas especiales de
vida que les corresponde”

‹ Aisla agentes simbióticos y la simbiosis con plantas.

‹ Ciclo del nitrógeno y del azufre.

‹ Reconoce la ubicuidad de los microorganismos y la

influencia selectiva de las condiciones ambientales
desarrolla técnicas de enriquecimiento.
‹ Funda una escuela dedicada al estudio de la
diversidad y la fisiología bacteriana.
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„ Kluyver A., van Niel C. y Stanier R: mayor
compresión del papel de los microorganismos en
los procesos de reciclado. Fisiología Microbiana.

„ 1970: Comité de Microbiología Ambiental:

reconoce formalmente la disciplina ecología
microbiana.

„ 1977 I International Symposium on Microbial

Ecology

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 G J Olsen, D J Lane, S J Giovannoni, N R Pace, D A
Stahl.1986. Microbial Ecology and Evolution: A Ribosomal
RNA Approach. Annu. Rev. of Microbiol., 40: 337-365

N R Pace, D A Stahl, D J Lane, G J Olsen.1986.The Analysis

of Natural Microbial Populations by ribosomal RNA
sequences.En Advances in Microbial Ecology. Vol. 9. K.C.
Marshall (Ed.). Plenum Press, pp. 1-55.

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 Relación de la ecología microbiana con otras
ciencias
„ Ecología: el tratamiento de los procesos microbianos
tiende a ser rudimentario. Descomposición de materia
orgánica y el reciclado de los nutrientes minerales: “caja
negra”.
Diferencias Metodológicas.

„ Ciencias Ambientales: Biodegradación de contaminantes

(Atlas R., Bartha R.), efectos de los contaminantes sobre
los microorganismos (injuria invisible), procesos de fijación
de nitrógeno, obtención de combustible a partir de recursos
renovables.

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 „ Exploración del espacio: impulso el desarrollo de
metodología y el estudio de la vida en ambientes
extremos.

„ Microbiología de suelo, agua dulce (implicancias en la

salud humana) y marina.

„ Microbiología de alimentos: los estudios sobre procesos

de degradación y fermentación produjeron gran cantidad
de información ecológica, influencia de las variables
ambientales en los microorganismos, supervivencia en
condiciones adversas y sobre la sucesión microbiana.

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 Fuentes de Información
Antes de 1957 no había aparecido ningún libro ni revista con el título Ecología Microbiana.

Revista específicas
„ Microbial Ecology. 1974. Springer- Verlag. Nueva York.
„ Applied and Environmental Microbiology. 1976. American Society for Microbiology.
Washington DC
„ Advances in Microbial Ecology. 1977. Plenum Press, Nueva York
„ FEMS Microbiology Ecology. 1985. Elsevier Science Publishers, Amsterdam. Holanda.

Libros

„ Atlas, R.M. and Bartha R. 1998. Microbial Ecology. Fundamentals and applications (4ª
Ed). Benjamin/ Cummings Science Publishing. Menlo Park, CA.
„ Colwell R.R. and Grimes J. 2000. Nonculturable Microorganisms in the Environment.
American Society for Microbiology. ASM PRESS. Washington D.C.
„ Hurst, C.H.J. 1997. Manual Of Environmental Microbiology. American Society For
Microbiology Press. Washington D.C.
„ Madigan, M.E., Martinko, J.M. and Parker, J. 2000. (9th ed). Brock Biology of
microorganisms. Prentice Hall, Menlo Park, CA.

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