CÓDIGO:
PROCESO DE GESTIÓN ACADÉMICA
Competencia a evaluar
Competencia
Manejo de la información
Planificación y diseño de la investigación
Toma y procesamiento de datos
Análisis de datos
Actitud citica y reflexiva y trabajo en colaborativo
Comunicación de los resultados
Toma y procesamiento de datos
Análisis de datos
Rubrica de evaluación (Criterios de evaluación para los informes de laboratorio)
Excelente
(5 - 4,5)
Realiza informes con
normas de IEEE, tiene en
cuenta las referencias,
hace esquemas, coloca
evidencias de consulta,
realiza análisis
explicando resultados a la
luz de la teoría y sus
conclusiones son
concordantes con los
objetivos y las
discusiones previas.
VERSIÓN: 1
Guía de Laboratorio de Química General
Filogenia: Bases y secuencias de aminoácidos;
comparación entre especies y generación de
árboles filogenéticos entre especies zoológicas
y botánicas.
Guía de laboratorio No. 3
Procesos de
pensamiento
Razonamiento analítico y Capacidad para formular hipótesis.
sintético.
Uso de las tecnologías de la
información y comunicación.
Procesos de pensamiento lógico
matemático.
Cumple
Sobresaliente
satisfactoriamente
(4,4 - 3,8)
(3,7 – 3,0)
Realiza los informes, Realiza el informe
haciendo análisis superficialmente, haciendo
incipientes, sus análisis muy simples, sin
conclusiones no son conclusiones o sin
coherentes con los correspondencia con los
objetivos, se observa análisis y los objetivos,
que consulta, pero no además sin seguir las
utiliza normas de IEEE normas de IEEE. No
completamente. presenta evidencias.
FECHA: Febrero 2019
Desempeños
Capacidad para realizar búsqueda de
información en bases de datos.
Capacidad para diseñar una Metodología de
investigación.
Capacidad para procesar resultados en
formatos (tablas, gráficas, etc.
Capacidad para interpretar datos.
Capacidad para reflexionar de manera crítica y
trabajar colaborativamente.
Identifica relaciones causales y deduce
conclusiones lógicas.
Cumple
No cumple (0,9 –
insatisfactoriamente
0,0)
(2,9 – 1,0)
No realiza el informe No asiste a las clases,
según la norma, sin asiste a clase pero no
evidencias no realiza entrega actividades, sin
análisis de resultados, y referencias.
emite conclusiones que
no son coherentes con los
objetivos ni con las
discusiones previas.
1
Objetivos
Objetivo General.

Esta guía pretende que los estudiantes de Medicina veterinaria observen, estudien, expliquen, analicen, e
investiguen acerca de cómo las Bases nitrogenadas, y secuencias de aminoácidos son una importante
herramienta moderna para la comparación entre especies y la generación de árboles filogenéticos basados en
caracteres moleculares.

Objetivos Específicos

1. Conocer y entender la importancia y las vías por medio de las cuales se transmite la información genética
entre especies (ADN, tipos de ADN, RNA, tipos de RNA, localización, bases nitrogenadas, proteínas
asociadas a los procesos de transmisión de información, que es un gen, un codón, que son aminoácidos
y cuáles son los aminoácidos que se unen en polipéptidos.
2. Aprender las características taxonómicas de las especies a analizar.
3. Generar árboles filogenéticos que muestren relaciones y distancias de parentesco entre especies
utilizando la herramienta computacional MEGA 7.0

1. Componente ambiental
Comprender que como resultado cotidiano del trabajo en laboratorio se generan procesos los cuales
obligatoriamente generan aspectos ambientales fruto de las actividades, productos y servicios que en el
laboratorio se generan, y los cuales están ligados a impactos ambientales que deben aprender a controlarse o
eliminarse por medio de la planificación.

2. Bases conceptuales y teóricas

El ácido desoxirribonucleico, abreviado como ADN, es un ácido nucleico que contiene las instrucciones
genéticas usadas en el desarrollo y funcionamiento de todos los organismos vivos conocidos y algunos virus, y
es responsable de su transmisión hereditaria. La función principal de la molécula de ADN es el almacenamiento
a largo plazo de información.

Figura 1. ADN: Organización y estructura 1.

1
De KES47 - File:Chromosome zh.svg, CC BY 3.0, https://commons.wikimedia.org/w/index.php?curid=10794389.
2
Desde el punto de vista químico, el ADN es un polímero de nucleótidos, es decir, un polinucleótido, y cada
nucleótido, a su vez, está formado por un azúcar (la desoxirribosa), una base nitrogenada (que puede ser adenina
→A, timina →T, citosina o guanina →G) y un grupo fosfato que actúa como enganche de cada vagón con el
siguiente. Para que la información que contiene el ADN pueda ser utilizada por la maquinaria celular, debe
copiarse en primer lugar en unos trenes de nucleótidos, más cortos y con unas unidades diferentes, llamados
ARN. Las moléculas de ARN se copian exactamente del ADN mediante un proceso denominado transcripción.

Las secuencias de ADN que constituyen la unidad fundamental, física y funcional de la herencia se denominan
genes. Cada gen contiene una parte que se transcribe a ARN y otra que se encarga de definir cuándo y dónde
deben expresarse.

Los aminoácidos esenciales son aquellos que el propio organismo no puede sintetizar por sí mismo. Esto implica
que la única fuente de estos aminoácidos en esos organismos es la ingesta directa a través de la dieta . Las rutas
para la obtención de los aminoácidos esenciales suelen ser largas y energéticamente costosas.

Figura 2. Dos cadenas de nucleótidos y sus componentes 2.

La replicación del ADN es el proceso por el cual se obtienen copias o réplicas idénticas de una molécula de
ADN. La replicación es fundamental para la transferencia de la información genética de una generación a la
siguiente y, por ende, es la base de la herencia. El mecanismo consiste esencialmente en la separación de las
dos hebras de la doble hélice, las cuales sirven de molde para la posterior síntesis de cadenas complementarias
a cada una de ellas, que llevará por nombre ARNm. El resultado final son dos moléculas idénticas a la original.

2
De derivative work: Jfreyreg (talk)DNA_chemical_structure_es.svg: Miguelsierra - DNA_chemical_structure_es.svg, CC BY-SA 3.0,
https://commons.wikimedia.org/w/index.php?curid=4479859
3
La información genética, en el ARNm, se escribe a partir de cuatro letras, que corresponden a las bases
nitrogenadas (A, C, G y U), las cuales van agrupadas de dos en dos: adenina con uracilo y citosina con guanina.
El orgánulo celular que sintetiza las proteínas a partir de aminoácidos con la información contenida en el ARNm,
leyendo los codones, es el ribosoma.

Figura N°3. Lectura de los codones de bases y su traducción a aminoácidos.

2. La filogenética computacional: es la aplicación de algoritmos computacionales, en métodos y programas

de análisis filogenético. El objetivo es construir un árbol filogenético que representa una hipótesis evolutiva de
un conjunto de genes, especies u otros taxones. Por ejemplo, estás técnicas han sido usadas para explorar el
árbol de la familia de los homínidos1 y las relaciones entre los genes específicos compartidos por muchos tipos
de organismos.

La filogenética tradicional usaba datos morfológicos obtenidos mediante la medición y cuantificación de las
propiedades fenotípicas de los organismos representativos, mientras que los más recientes campos en
filogenética molecular usan secuencias de nucleótidos que codifican genes o secuencias de aminoácidos que
forman proteínas como bases de la clasificación.

4
Figura 4. Replicación del ADN3.

Materiales, equipos y reactivos

Proporcionado por el alumno:

 Laptop con el programa gratuito descargado e instalado: “Molecular Evolutionary Genetics Analysis”
MEGA version 7.0 y los ejemplos descargados. http://www.megasoftware.net/home
 Guía
 Cuaderno de apuntes

PROCEDIMIENTO
a. Indicaciones previas
Además de descargar el programa mencionado, el estudiante deberá buscar la información taxonómica,
biológica y descriptiva de los géneros o especies de algas, cianobacterias, protozoos, hepáticas, plantas y
zoológicas a analizar (con foto), las cuales son:
1. Synechocystis 15. Coenobita sp.
2. Odontella 16. Lithodes aequispina
3. Porphyra 17. Paralithodes camtschatica
4. Cyanophora 18. Ellasochirus tenuimanus
5. Euglena 19. Labidochirus splendescens
6. Marchantia 20. Pagurus sp.
7. Pinus 21. Drosophila sp.
8. Nicotiana 22. Homo sapiens
9. 23. Chimpazee
10. 24. Bonobo
11. Zea 25. Gorilla
12. Oryza 26. Orangután
13. Artemia salina 27. Sumatran gibbon
14. Clibanarius vittatus

3
This work has been released into the public domain by its author, LadyofHats. This applies worldwide.
5
b. Procedimiento
Se abrirán sólo los siguientes archivos de la carpeta ejemplos:

 Chloroplast_Martin
 Crab_rRNA
 Distance_Data.meg
 Drosophila_Adh

1. Abra el archivo que tiene la información del grupo a analizar

2. Analice los porcentajes de aminoácidos o de bases nitrogenadas que se mantienen idénticas en cada
muestra entre diferentes géneros o especies (según corresponda), y menciones cuales son los más
cercanos y los más distantes.

3. Construya un árbol filogenético basado en la cadena de información de aminoácidos o de bases

nitrogenadas homologas entre especies, mediante la metodología de máximo parecido4 5

4
Jones D.T., Taylor W.R., and Thornton J.M. (1992). The rapid generation of mutation data matrices from protein sequences.
Computer Applications in the Biosciences 8: 275-282.
5
2. Kumar S., Stecher G., and Tamura K. (2016). MEGA7: Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 7.0 for bigger
datasets.Molecular Biology and Evolution 33:1870-1874.
6
Resultados
1. Ordene en un cuadro los porcentajes de aminoácidos o de bases nitrogenadas que son similares entre
especies o géneros.
2. Dibuje los cladogramas generados en la práctica.

PLANTEAMIENTO DE UN PROBLEMA:
Diseñe un planteamiento de problema asociado al tema revisado.

HIPOTESIS:
Diseñe una posible hipótesis que resuelva el problema anteriormente planteado.

Análisis
De cada caso exponga diferencias y similitudes encontradas entre grupos cercanos o lejanos filogenéticamente,
basados tanto en el análisis de datos como en la literatura revisada.

Conclusiones
Genere sus conclusiones acerca de las relaciones de cercanía o lejanía que diferentes especies o géneros (según
corresponda).

Referencias
Jones D.T., Taylor W.R., and Thornton J.M. (1992). The rapid generation of mutation data matrices from protein
sequences. Computer Applications in the Biosciences 8: 275-282.

Kumar S., Stecher G., and Tamura K. (2016). MEGA7: Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 7.0
for bigger datasets.Molecular Biology and Evolution 33:1870-1874.

ELABORÓ Y/O MODIFICÓ REVISÓ APROBÓ

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Ramón Barros A. Juan Paulo Salcedo F. Juan Paulo Salcedo F.
Docente Jefe de área Coordinador