QUIMICA ORGANICA IIB

11) AMINOACIDOS, PEPTIDOS Y PROTEINAS

Aminoácidos: clasificación química. Métodos generales de síntesis.

Configuración. Racemización. Propiedades físicas. Punto isoeléctrico.
Propiedades funcionales generales: acción del calor, del ácido nitroso,
acilación, acción del anhídrido acético, etc. Obtención y estabilidad de
ésteres y haluros de aminoácidos. Propiedades químicas particulares
de algunos aminoácidos. Reacciones de caracterización: reacción de
la ninhidrina.

Péptidos: Nomenclatura. Unión peptídica: estructura y conformación.

Análisis de las estructuras primaria y secundaria. Método de Sanger y
de Edman, hidrazinólisis. Ejemplos importantes: ocitocina,
bradiquinina, TRF, ACTH, insulina. Síntesis de péptidos en solución:
grupos protectores. Introducción, estabilidad y activadores del
acoplamiento.

Proteínas: clasificación, estructura. Propiedades iónicas y estabilidad.

Métodos de fraccionamiento. Conformación y estructura espacial.
 Aminoácidos
Los aminoácidos son compuestos bifuncionales, contienen un grupo amino básico y
un grupo carboxilo ácido. Se nombran según la posición relativa de dichos grupos:

alfa -aminoácido: glicina

beta-aminoácido

gama-aminoácido: GABA

Estructura general de un -aminoácido:

Tienen valor como bloques biológicos porque pueden formar péptidos entre el NH2 de
un aminoácido y el COOH de otro mediante enlaces amida
 Nombre Abreviaturas Fórmula estructural
Aminoácidos: Aminoácidos con cadenas laterales no polares

clasificación química Glicina Gly

(G)

Alanina Ala
(A)

Valina Val
(V)

Leucina Leu
(L)

Isoleucina Ile
(I)

Metionina Met
(M)

Prolina Pro
(P)

Fenilalanina Phe
(F)

Triptofano Trp
(W)
Aminoácidos:
clasificación química Nombre Abreviaturas Fórmula estructural
Aminoácidos con cadenas laterales polares

Asparagina Asn
(N)

Glutamina Gln
(Q)

Serina Ser
(S)

Treonina Thr
(T)

Tirosina Tyr
(Y)

Cisteína Cys
(C)
Aminoácidos:
clasificación química
Nombre Abreviaturas Fórmula estructural
Aminoácidos con cadenas laterales ácidas

Acido Aspártico Asp

(D)

Acido Glutámico Glu

(E)

Aminoácidos con cadenas laterales básicas

Lisina Lys
(K)

Arginina Arg
(R)

Histidina His
(H)
 Aminoácidos: métodos generales de síntesis

Sustitución nucleofílica de ácidos alfa-carboxílicos

Síntesis de Strecker

O NH3
NH NH2 + +NH3
HCN 1. H , H2O -
CH3CH CH3CH CH3 C CN CH3 C HCOO
- H2O 2. calor
H
imina 2-aminopropanonitrilo Alanina
 Aminoácidos: métodos generales de síntesis

Alquilación de acetamidomalonato de dietilo

CO2Et + - CO2Et
1. Na EtO
H C CO2Et EtO2CCH2 C CO2Et
2. BrCH2CO2Et
HN HN

O O
+
1. H
2. calor
3. -CO2

O O
HOCCH2CHCOH
NH2

Acido (R,S)-aspártico
 Aminoácidos: métodos generales de síntesis

Gabriel-malónica: ruta inequívoca

O

- +
N K O EtO
O O Br2 O O O
O
N
EtO OEt EtO OEt O
Br O EtO

Na+EtO-

O EtO O
OEt O EtO
Cl
O O
O +
N OEt N - Na
O O
O EtO O EtO
+
1. H
2. calor
3. -CO2

HO
O
O
H2N OH
+
OH
O
OH O

Acido Aspártico
 Aminoácidos: configuración

Sólo la glicina es aquiral: H2NCH2COOH

Los carbonos  de los demás aminoácidos son centros de quiralidad: son posibles
dos enantiómeros
La naturaleza sólo utiliza el enantiómero S para la construcción de proteínas

Proyecciones de Fischer de aminoácidos naturales: similitud con los azúcares L

COOH COOH COOH COOH

H2N H H2N H H2N H HO H
CH3 CH2 CH2OH CH2OH

S-Alanina S-Serina estereoquímica similar

L-Alanina L-Serina a L-Gliceraldehído

S-Fenilalanina
L-Fenilalanina

Los métodos generales de síntesis de aminoácidos producen una mezcla racémica

(partes iguales de compuestos S y R), que debe resolverse en enantiómeros puros
 Aminoácidos: resolución

Método químico: formación de diastereómeros y su posterior separación

Los diastereómeros tienen diferentes propiedades físicas
O
+
NH3 NHCH
(CH3)2CHCHCOO- + HCOOH (CH3)2CHCHCOOH + H2O
(R,S)-Valina (R,S)-N-formilvalina

L-Brucina (B, alcaloide ópticam. activo)

MeOH, 0 ºC

O COO-+BH HB+-OOC O
S R
HCN H H NHCH
H
CH(CH3)2 CH(CH3)2
mezcla de sales diasteroisoméricas
cristalización fraccionada

hidrólisis

COO
-
COO-
+ S R
H3N H H NH3+
CH(CH3)2 CH(CH3)2
(S)-Valina (R)-Valina
 Aminoácidos: resolución

Método biológico: mediante el uso de enzimas

O O COOH COOH
(CH3CO)2O H2O
RCHCOH RCHCOH H2N C H + H C NHCOCH3
carboxi-
NH2 NHCOCH3 R R
peptidasa

mezcla R, S mezcla R, S Aminoácido S Aminoácido R

acilasa renal L-leucina

Ac2O porcina
DL-leucina N-acetil-DL-leucina +
N-acetil-D-leucina
 Aminoácidos: propiedades físicas

Los aminoácidos son sales internas ó iones dipolares, por lo que:

•Son sustancias cristalinas con puntos de fusión elevados y descomposición
•Poseen momentos dipolares grandes
•Son solubles en agua
•Poco solubles en alcoholes
•Son insolubles en solventes apróticos poco polares (benceno, cloroformo, etc.)
•En solución acuosa, la acidez y la basicidad de los grupos carboxilo y amino
resultan más bajas que lo normal
 Aminoácidos: punto isoeléctrico

Los aminoácidos existen en

forma de sal interna, ion
dipolar ó zwitterion

El punto isoeléctrico pI es el pH en el cual la concentración del ion dipolar es máxima

Es característico para cada aminoácido
Los
, aminoácidos con cadena lateral neutra tienen pKa 1 y pKa2

pI = 1/2 (pKa1 + pKa2)

Las diferencias en el pI son útiles para fines de identificación y tienen gran

importancia en el aislamiento y purificación de proteínas mediante electroforesis
 Aminoácidos: propiedades funcionales generales

Acción del calor

Los aminoácidos funden con descomposición H
R N O
Por deshidratación dan dicetopiperazinas

O N R
H

Acción del ácido nitroso

Transforma cuantitativamente cada grupo amino en N 2 (método de Van Slyke)
Valoración volumétrica de los grupos amino en aminoácidos y proteínas

O O
NaNO2
R OH + R OH + H2O + N2
H
NH2
 Aminoácidos: propiedades funcionales generales
Acilación
El grupo amino reacciona con diversos agentes acilantes (Ej. Anhidrido acético)
O O
Ac2O
R OH R OH
NH2 NHAc
Método de Schotten-Baumann (N-benzoil y p-toluensulfonil amidas)
O O
O O
- Ph Cl
OH
R O -
R
-
O R O-
+
NH3 NH2 O N
H
Ph

H+

R OH
O N
H
Ph
 Aminoácidos: obtención y estabilidad de ésteres y haluros de aminoácidos
Esterificación
Se utiliza EtOH ó MeOH anhidros, se calienta a temperatura de reflujo y se mantiene
el medio saturado con ClH (anhidro)
O O O
ClH EtOH
-
R O R OH . Cl -
R OEt .Cl-
+ + +
NH3 NH3 NH3

Los ésteres se conservan como clorhidratos, éstos son sólidos solubles en agua
Al alcalinizar la solución, la base se separa como aceite y en pocas horas da un
sólido cristalino: dicetopiperazina

O O H
- R N O
-
OH
R OEt .Cl R OEt
+
NH3 NH2 O N R
H
Reacción de aminólisis
intermolecular
 Aminoácidos: obtención y estabilidad de ésteres y haluros de aminoácidos

Preparación de haluros de acilo

Si se intenta transformar el carboxilo de un aminoácido por acción de cloruro de
tionilo, pentacloruro de fósforo, etc. se produce intensa descomposición, o bien se
obtiene sólo la dicetopiperazina
Sí es posible obtener el cloruro de ácido de una amida de un aminoácido:

O O

R OH PCl5 R Cl
O N O N
H H
Ph Ph

Este cloruro de ácido es un

nuevo agente acilante
 Aminoácidos: propiedades químicas particulares de algunos aminoácidos

Dos unidades de cisteína forman un

sulfuro:

cistina

Diagrama de dos sulfuros en la insulina

bovina
Aminoácidos: propiedades químicas particulares de algunos aminoácidos

La cistina genera cisteína por reductores fuertes

La tirosina posee propiedades de fenol: reacciona con sales de diazonio

Por fusión, el ácido glutámico se deshidrata, dando una lactama

HO O HO O

NH2 O
NH
OH
O
O

Ácido
piroglutámico
 Aminoácidos: reacciones de caracterización

Reacción de la ninhidrina

color
púrpura

Complejos de cobre
O
Las soluciones alcalinas de
aminoácidos en presencia de sales R O
cúpricas se colorean intensamente de
azul, por formación del quelato
H2 N Cu++ NH2

La formación de estos complejos O

R
también permite el aislamiento o el
dosaje de aminoácidos O
color azul