Las proteínas son moléculas extremadamente complejas con el fin de mantener la
multiplicidad de sus funciones. Las proteínas son las macromoléculas más abundantes y están presentes en todas las células. A su vez son los instrumentos moleculares con los cuales se expresa la información genética. Todas las proteínas están constituidas por 20 aminoácidos unidos de forma covalente. Como las células pueden producir diferentes proteínas combinando estos aminoácidos es que se pueden formar productos tan diversos como enzimas, hormonas, anticuerpos, transportadores, fibras musculares y mas. Así como también hay una gran variedad de ellas, lo que varia es en tamaño desde péptidos pequeños hasta polímeros enormes. Por lo que: Las proteínas presentan una gran diversidad en cuanto a sus funciones biológicas. CARACTERISTICAS DE LAS PROTEINAS Las proteínas son biomoléculas orgánicas formadas por C, H, O, N y en menor medida P y S y otros elementos (Fe,Cu, Mg,…). Son polímeros no ramificados de aminoácidos (aa) que se unen mediante enlaces peptídicos. Son las moléculas orgánicas más abundantes en los seres vivos. Su importancia radica en la variedad de funciones diferentes que pueden desempeñar. Sus pesos moleculares son muy elevados y mediante hidrolisis acida dan una serie de compuestos organicos sencillos de bajo peso molecular llamados aminoácidos. El nitrógeno representa entre un 12 y 19% de la molécula.
DIVERSIDAD FUNCIONAL DE LAS PROTEINAS
CATALISIS ENZIMATICA – CATALISIS – FUNCION ENZIMATICA: Variación en la velocidad de una reacción química producida por la presencia de un catalizador que en este caso seria la enzima (proteína) Las proteínas cuya función es enzimática son las más especializadas y numerosas. Actúan como biocatalizadores acelerando las reacciones químicas del metabolismo. En su función como enzimas, las proteínas hacen uso de su propiedad de poder interaccionar, en forma específica, con muy diversas moléculas. A las substancias que se transforman por medio de una reacción enzimática se les llama substratos. Los substratos reconocen un sitio específico en la superficie de la proteína que se denomina sitio activo. Al ligarse los sustrato a sus sitios activos en la proteína, quedan orientados de tal manera que se favorece la ruptura y/o formación de determinadas uniones químicas, se estabilizan los estados de transición al mismo tiempo que se reduce la energía de activación. Esto facilita la reacción e incrementa su velocidad varios órdenes de magnitud. Las enzimas tienen una gran especificidad, por ejemplo catalizan la transformación de sólo un substrato o grupo funcional, pudiendo discriminar entre dos enantiomorfos (grupos funcionales donde los radicales de sus carbonos asimétricos se disponen al contrario) Normalmente el nombre de una enzima se forma con el nombre de la reacción que cataliza o el nombre del sustrato que transforman, terminando el nombre en "asa". Por ejemplo: • a las enzimas que transfieren un átomo de oxígeno a un metabolito se les denomina oxigenasas, • a las que transfieren un residuo de ácido glucurónico del ácido UDP glucurónico a un metabolito o xenobiótico, se le conoce como UDP glucuronil transferasa, • a las enzimas que catalizan la adición de una de las cuatro bases a una molécula de ADN en formación se le denomina ADN sintetasa o ADN polimerasa, las que hidrolizan el ADN se le llama ADNasa, etc. TRANSPORTE: Las proteínas realizan funciones de transporte porque son componentes fundamentales de las membranas plasmáticas. algunas proteínas que se encuentran allí transportan sustancias como iones, glucosa. Ejemplos de ello son la hemoglobina y la mioglobina, proteínas transportadoras del oxígeno en la sangre en los organismos vertebrados y en los músculos respectivamente. En los invertebrados, la función de proteínas como la hemoglobina que transporta el oxígeno la realizas la hemocianina. Otros ejemplos de proteínas cuya función es el transporte son citocromos que transportan electrones e lipoproteínas que transportan lípidos por la sangre. MOVIMIENTO: La contracción de los músculos través de la miosina y actina es una función de las proteínas contráctiles que facilitan el movimiento de las células constituyendo las miofibrillas que son responsables de la contracción de los músculos. En la función contráctil de las proteínas también está implicada la dineina que está relacionada con el movimiento de cilios y flagelos. PROTECCION INMUNE: Las proteínas crean anticuerpos y regulan factores contra agentes extraños o infecciones. Toxinas bacterianas, como venenos de serpientes o la del botulismo son proteínas generadas con funciones defensivas. Las mucinas protegen las mucosas y tienen efecto germicida. El fibrinógeno y la trombina contribuyen a la formación coágulos de sangre para evitar las hemorragias. Las inmunoglobulinas actúan como anticuerpos ante posibles antígenos. SOPORTE: hay algunas proteínas que sirven de soporte o protección a ciertas estructuras celulares La función de resistencia o función estructural de las proteínas también es de gran importancia ya que las proteínas forman tejidos de sostén y relleno que confieren elasticidad y resistencia a órganos y tejidos. Ejemplo de ello es el colágeno del tejido conjuntivo fibroso, reticulina y elastina del tejido conjuntivo elástico. Con este tipo de proteínas se forma la estructura del organismo. RECEPTORA: algunas proteínas funcionan como receptores hormonales y son aquellas proteínas que se encuentran en las membranas REGULADORA: algunas proteínas son hormonas que regulan la actividad fisiológica del organismo. Eje: la hormona de crecimiento, porque activa la proteína de membranas y ejercen su función sobre ellas FUNCION HOMEOSTATICA: Las proteínas funcionan como amortiguadores, manteniendo en diversos medios tanto el pH interno como el equilibrio osmótico. AMINOÁCIDOS Ademas de proporcionar las unidades monomero a partir de las cuales se sintetizan las cadenas polipeptidicas largas de proteinas, los l-α-aminoacidos y sus derivados participan en funciones celulares tan diversas como la transmision nerviosa y la biosintesis de porfirinas, purinas, pirimidinas y urea. Los polímeros cortos de aminoacidos llamados péptidos desempeñan funciones importantes en el sistema neuroendocrino como hormonas, factores liberadores de hormona, neuromoduladores o neurotransmisores.
Los a-aminoacidos todos tienen un grupo carboxilo y un grupo amino unidos al
mismo átomo de carbono. La diferencia la encontramos en sus cadenas laterales o en sus grupos R, que varían en estructura, tamaño y carga eléctrica; lo que influye en la solubilidad del agua de los aminoácidos. En todos los aminácidos execpto en la glicina, el carbono alfa está unido a cuatro grupo diferentes, el grupo A, grupo C, grupo R y el átomo de hidrógeno; por lo tanto este carbono recibe el nombre de CENTRO QUIRAL Esterqueoisomería de los aminoácidos La esteroisomería nos habla que los aminoácidos representan la misma parte en el espacio pero tienen una formula molecular diferente. En ella vamos a tener dos subdivisiones: CONFORMACIONAL: es la que es diferente por rotación de ciertos enlaces. CONFIGURACIONAL: que la estructura es completamente diferente. Esta última a su vez se divide en geométrica y en óptica: todas las moléculas con un centro quiral son ópticamente activas, porque hacen girar el plano de la luz plarizada. Las moléculas ópticamente activas son las que pueden ser Enantiomeros o Diasteroisómeros Los enantiomeros: son aquellos compuestos no superponibles pero que si poseen una imagen especular (en espejo) Los diasteroisomeros: son compuestos que no son ni superponibles ni especulares. CLASIFICACIÓN DE LOS AMINOÁCIDOS SEGÚN SU GRUPO R La clasificación según su grupo R se basa en la polaridad de ellos o en la tendencia a interaccionar con el agua a pH biológico. Por lo tanto se dividen en 5 grupos: Apolares, Aromáticos, Polares sin carga, Polares cargados positivamente y Polares cargados negativamente. 1. Apolares, son aquel grupo de aminoácidos que su cadena lateral no tiene carga. 1. Alifáticos, en este caso su cadena lateral carece de enlaces dobles conjugados. 1. Glicina (R=H) No tiene isomería óptica ya que tiene dos enlaces del Cα con Hidrógeno. Es uno de los aminoácidos que más flexibilidad proporciona a las proteinas, ya que al tener una cadena lateral pequeña, no obstaculiza el movimiento de los aminoácidos que lo flanquean. 2. Alanina (R=CH3) Es un aminoácido apolar y no puede participar en ningún mecanismo catalítico por lo que tiene una función meramente estructural. 3. Valina (R=CH2-(CH3)2) También su función es estructural. 4. Leucina (R=CH2-CH-(CH3)2) 5. Isoleucina (R=CH3H-CH2-CH3) Es un isómero de la leucina con una cadena lateral igual pero los átomos se distribuyen de otra forma. Pero presenta un segundo carbono asimétrico, siempre en configuración S. 6. Metionina (R=CH2-CH2-S-CH3) Es un tioéter que incluye un átomo de azufre en la cadena lateral. Aunque es apolar, el átomo de azufre aparece ocasionalmente implicado en reacciones bioquímicas en algunas enzimas, ya que tiene un electro que puede actuar como agente nucleofílico.
Esquema 2: Aminoácidos apolares
2. Aromáticos, y en este, su cadena lateral tiene enlaces conjugados. Son
responsables de la absorbancia a 280nm, típica de las proteínas. Se encuentran en hibridación sp2. Las nubes π de los anillos aromáticos pueden actuar como aceptores de puentes de hidrógeno o formar interacciones con grupos cargados positivamente. 1. Fenilalanina (R=CH2-Benceno) 2. Tirosina (R=CH2-Benceno-OH) 3. Triptófano (R=C(CH-NH)-Benceno
Esquema 3: Aminoácidos aromáticos
2. Polares, son aquellos que su cadena lateral tiene carga.
1. Sin carga. Son aminoácidos que carecen de carga, en principio, pero tienen posibilidades de tener asimetría en la distribución de las cargas, por la presencia de un átomo de O ó N. 1. Serina (R=CH2OH). Es un alcohol y forma parte esencial del centro catalítico de muchas enzimas. 2. Treonina (R=CH(OH)-CH3). También es un alcohol. Presenta un segundo centrol quiral, en el carbono β al igual que la isoleucina. 3. Cisteina (R=CH2-SH). Es un tiol y su función es similar a la serina, aunque éste pierde el -H del -SH con mayor facilidad que la serina. También tiene una función estructural importante ya que puede formar puentes disulfuro (-S- S-) con otras regiones de la proteína o con otras subunidades. Normalmente las proteínas que presentan estos puentes disulfuro son extracelulares.
4. Prolina (R*=CH2-CH2-CH2-NH2-). En este caso la cadena lateral termina
uniéndose por su extremo con el grupo amino del carbono alfa. Lo cual le otorga rigidez además de no poder doner hidrógenos cuando está en un enlace con otro aminoácido.
5. Asparagina (R=CH2-C(NH2)=O). Es la amida del ácido aspártico.
6. Glutamina (R=CH2-CH2-C(NH2)=O). Es la amida del ácido glutámico.
Esquema 4: Aminoácidos sin carga
2. Con carga. Son aminoácidos con un grupo ácido o básico extra en su
cadena lateral. 1. Aspartato (R=CH2-COO–). Tiene un grupo ácido y a pH neutro está fuertemente ionizado.
2. Glutamato (R=CH2-CH2-COO–). Tiene un grupo ácido y a pH neutro está
fuertemente ionizado. Junto al Aspartato actúan en mecanismos de catálisis ácido/base.
Esquema 4: Aminoácidos con carga
3. Lisina (R=CH2-CH2-CH2-CH2-NH3+). Grupo amino. Captan hidrógenos y
se cargan positivamente a pH neutro (también arginina e histidina). 4. Arginina (R=CH2-CH2-CH2-C(NH2)=NH2). Grupo guanidino. 5. Histidina (R=CH2-C(NH-CH=N)-CH). Grupo imizadol. Por su pK próximo a 7 es el catalizador ácido-base por excelencia en las enzimas.