"El rol de lo infinitamente pequeño es infinitamente grande"

L. Pasteur
1. Fundamentación
La Fisiología Bacteriana, rama de la Microbiología, estudia las propiedades físicas y
químicas de organismos procariotas como bacterias presentes en la biosfera, su diversidad
metabólica, su ecología y evolución. La presencia de microfósiles bacterianos ha sido
detectada en rocas sedimentarias de casi 4.000 millones de años de antigüedad. Sus
descendientes, contribuyendo a configurar la atmósfera de nuestro planeta, han evolucionado
en los organismos que conocemos hoy. Así, los procariotas han colonizado y contribuido a
definir todo ecosistema presente sobre la Tierra, evolucionando para ello una gran diversidad
de aspectos metabólicos. Nuestra biosfera puede ser vista en este contexto como un gran
organismo en que sus componentes están integralmente conectados, y se adaptan. Los
procariotas participan en el ciclo biogeoquímico de los elementos, transformando compuestos
inorgánicos en orgánicos y descomponiendo y reciclando tanto residuos orgánicos naturales
como aquellos producidos por las tecnologías desarrolladas por la humanidad. Esta ha
convivido y sufrido la acción de estos organismos, pero también utilizado y modificado su
inmensa capacidad metabólica para producir o perfeccionar productos destinados al
mejoramiento de nuestra calidad de vida, en lo que ahora denominamos procesos
biotecnológicos. Como ejemplos podemos citar la producción, desde mucho antes del registro
escrito, de alimentos incluyendo quesos, embutidos, yogures, vinos, cervezas y otras bebidas
fermentadas. Y es de la comprensión del metabolismo de procariotas que hemos obtenido,
mucho mas recientemente, los distintos antibióticos que nos han permitido enfrentar con
resultados quizás demasiado optimistas las numerosas plagas y enfermedades bacterianas que
nos han acosado desde tiempos inmemoriales. Y es del conocimiento de la fisiología de estos
organismos que hemos podido desarrollar procedimientos para la manipulación de genes y el
clonado molecular en lo que hemos llamado metodología del ADN recombinante, origen de
una nueva revolución biotecnológica de proporciones incalculables cuyos beneficios ya
comenzamos a recibir.
Fisiología Bacteriana está inserta en el Ciclo de Formación Superior de la Carrera de
Licenciatura en Biotecnología. Es dictada por docentes del Departamento de Microbiología
durante el primer cuatrimestre del cuarto año de dicha Carrera. Como correlación vertical,
requiere de los conocimientos brindados por las materias Biología Especial, Química
Biológica (y las correspondientes correlativas a las mismas), siendo asimismo necesarios
conocimientos de Inglés e Informática. Como correlación horizontal, es sumamente útil el
abordaje simultáneo de las materias Epistemología y Metodología de la investigación
científica y tecnológica, así como de Biofísica y de Procesos Biotecnológicos.

2. Objetivos
El objetivo general de la materia Fisiología Bacteriana es proporcionar al estudiante
los conocimientos, habilidades y actitudes que le permitan la comprensión, aislamiento, y
estudio de organismos procariotas que definen nuestra biosfera, así como el de su diversidad
fisiológica y metabólica, ecología y evolución. Ello no solo le permitirá entender la
contribución de estos microorganismos a la formación de una biosfera que responde a
estímulos, se adapta, crece o se reduce en forma global, sino el de evaluar las inmensas
potencialidades biotecnológicas que los mismos nos presentan.
 Para ello el estudiante ha de ser provisto de los conocimientos necesarios para
entender la evolución y presencia bacteriana en los distintos ecosistemas, así como sus
interacciones a nivel individual y colectivo con el medio biótico y abiótico (objetivos de
conocimiento). El estudio y análisis de trabajos originales contribuirá a generar en el mismo
la capacidad de abstracción y formulación de hipótesis, así como de diseñar los vehículos
teóricos y experimentales para su corroboración (objetivos de actitudes). Del desarrollo de las
actividades de laboratorio se espera la destreza en técnicas habituales de Microbiología
dirigidas al manejo adecuado del material microbiológico, la seguridad en el laboratorio y
ambiental, y al enriquecimiento, aislamiento, identificación y caracterización de bacterias
provenientes de distintas fuentes (objetivos de habilidades). Esto último es asimismo de
extrema importancia ya que los habilitará competente y responsablemente en la resolución de
problemas imprevistos durante su actividad profesional.

3. Contenidos
3.1. Programa de la materia:
Unidad 1: Introducción al mundo de las bacterias.
Hitos históricos en el descubrimiento del mundo de los microorganismos. El siglo XIX: La
Edad de Oro de la Microbiología. Refutación de teorías sobre la generación espontánea.
Identificación del rol de las bacterias en las enfermedades y en las transformaciones químicas.
Desarrollo de los métodos y medios de cultivo modernos. Las "balas mágicas": quimioterapia
y antibióticos. Contribución del estudio de la fisiología bacteriana al desarrollo de la
Biotecnología y la Ingeniería Genética.
Unidad 2: Clasificación de los microorganismos.
Evolución de los microorganismos. Células procariotas y eucariotas. Taxonomía, sistemática y
nomenclatura bacteriana. Contribución de los métodos basados en estudios moleculares:
hibridización de ácidos nucleicos y secuenciación de macromoléculas. Definición de "especie"
bacteriana. Arboles filogenéticos basados en la comparación de secuencias de ARN
ribosomales: Bacterias, Arqueas y Eucariotas. Su correlación con la biología de estos
organismos. La secuencia de genomas bacterianos completos. Conclusiones y controversias.
Unidad 3: Estructura celular bacteriana.
Microscopía óptica y electrónica. Estructura de células procariotas. Citoplasma. Nucleoide.
Membrana celular. Apéndices de superficie: pili y flagelos. Polisacáridos de superficie.
Cápsula. Pared bacteriana. Estructura del peptidoglicano o mureína. Diferencias basadas en la
estructura de la pared: bacterias Gram-positivas y Gram-negativas. Membrana externa de
bacterias Gram-negativas. Biosíntesis de la mureína y antibióticos que la afectan. El ciclo
celular bacteriano. División celular. Replicación del ADN. Consideraciones morfológicas y
bioquímicas. Esporas bacterianas. Composición y función. Mecanismo de la esporulación:
Bacillus subtilis como paradigma de diferenciación celular. Otros ejemplos de diferenciación
celular en bacterias: actinomicetos, rizobios y cianobacterias.
Unidad 4: Nutrición bacteriana.
Nutrientes utilizados por la célula bacteriana. Fuentes de carbono, nitrógeno, azufre. La
relación de las bacterias con el oxígeno. Medios sintéticos, complejos, diferenciales,
selectivos, y de enriquecimiento. Gradientes electroquímicos: su generación y funciones.
Transporte de solutos al interior celular. Difusión simple y facilitada. Transportes primarios y
secundarios. Transporte de azúcares: sistema de las fosfotransferasas.
Unidad 5: Crecimiento bacteriano.
Crecimiento celular y poblacional. Cultivos puros y mixtos. Fases del crecimiento. Curvas de
crecimiento: sus estadios. Velocidad, rendimiento y tiempo de generación bacterianos.
Cultivos continuos: el quimiostato. Efecto de factores ambientales sobre el crecimiento:
temperatura, pH, nutrientes, actividad del agua. Control del crecimiento bacteriano. Métodos
físicos y químicos: ventajas e inconvenientes. Esterilización, Pasteurización y Tyndalización.
Control químico del crecimiento bacteriano: antisépticos y desinfectantes. Poder bactericida,
bacteriostático y bacteriolítico. Antibióticos y sus distintos mecanismos de acción. Evolución
de la resistencia a los mismos.
Unidad 6: Metabolismo bacteriano.
La diversidad metabólica bacteriana. Fuentes de energía y de carbono. Principales rutas de
degradación de la glucosa a piruvato en bacterias: EMP y ED. Fermentaciones bacterianas.
Rutas anfibólicas y anapleróticas. Respiraciones aeróbicas y anaeróbicas. Cadenas de
transportadores de electrones en bacterias. Distintas oxidasas terminales. Metabolismos
autotróficos y heterotróficos. Distintos metabolismos de fijación autotrófica de dióxido de
carbono. Bacterias fotosintetizadoras. Fotosíntesis oxigénica y anoxigénica. Quimiolitotrofos:
obtención de energía a partir de compuestos inorgánicos. Metabolismos asimilativos y
desasimilativos del azufre y del nitrógeno en bacterias. Metanotrofos y metilotrofos.
Unidad 7: Regulación del metabolismo bacteriano.
Coordinación de las vías metabólicas en bacterias. Regulación de la utilización del carbono y
del nitrógeno. Represión catabólica en bacterias. Regulación del metabolismo primario y
secundario. Redes de sistemas regulatorios. Sistemas de transducción de señales de dos
componentes. Regulación del metabolismo aeróbico/anaeróbico en bacterias facultativas.
Osmoregulación. Quimiotaxis.
Unidad 8: Ecología bacteriana.
Las bacterias en la biosfera. Distintos habitats acuáticos y terrestres. Extremófilos.
Participación bacteriana en los ciclos biogeoquímicos del carbono, nitrógeno, azufre, hierro.
Comensalismo, mutualismo, parasitismo, antagonismo. Distintas formas de mutualismo entre
bacterias, plantas y animales. Métodos para el estudio de la ecología bacteriana. Métodos de
enriquecimiento y aislamiento. La columna de Winogradsky. Estudio, identificación y
cuantificación de especies bacterianas en ecosistemas: cultivo, amplificación, clonado y
secuenciación de ARN ribosomales.
Unidad 9: Utilización biotecnológica de los microorganismos.
Microorganismos utilizados en procesos industriales. Aislamiento y caracterización de
antibióticos. Producción de vitaminas y aminoácidos. Producción de enzimas. Producción de
bebidas alcohólicas. Las bacterias lácticas en la producción de alimentos. Uso de
microorganismos para el tratamiento de desechos sólidos y líquidos. Biorremediación.

4. Experiencias de aprendizaje
4.1. Clases grupales, seminarios de discusión de trabajos originales, resolución de
problemas.
Mediante estas experiencias se buscará la integración de las unidades mencionadas en el
Programa arriba detallado. Los contenidos conceptuales, basados en referencias bibliográficas
que incluyen tanto textos como separatas de revisiones y artículos originales accesibles, serán
tratados en clases grupales en la Facultad indicadas en el cronograma detallado mas abajo. El
docente proporcionará el material en forma coordinada y previa a las clases, actuando en las
mismas de modo interactivo, proponiendo la reflexión y discusión crítica de los contenidos
estudiados.
Los Seminarios de actualización, también indicados en el cronograma, serán realizados
analizando artículos originales clásicos y fundamentales en la Microbiología, así como otros
utilizados para introducir periódicamente los más recientes adelantos a nivel conceptual y
metodológico. La resolución de problemas estará basada en una guía confeccionada ad hoc,
utilizando datos extraídos de resultados experimentales de artículos originales. Estas
actividades se realizarán en la Facultad auxiliadas por un docente y en grupos de
aproximadamente 12 alumnos.
Los tipos de actividades mencionadas arriba fomentan el diálogo directo y retroalimentador
entre educador y educando, el cual es introducido a la lectura y análisis crítico de las hipótesis
originales y resultados obtenidos. Asimismo, el análisis de los métodos e instrumental
originalmente utilizados le permiten rediscutir el diseño de experimentos en base a tecnologías
actuales, las cuales podrían responder interrogantes no contestados oportunamente. De esta
forma, los alumnos se ejercitan en el análisis crítico de los trabajos científicos, planteando
dudas y correlacionando observaciones e hipótesis con otros aspectos de esta materia o
materias correlativas, proceso fundamental para cualquier área en la cual elijan desempeñarse
en su actividad futura.
Los contenidos y conceptos a ser incorporados y asimilados por el estudiante al finalizar el
cursado mediante estas actividades son:
a. Las bacterias, su evolución y ubicación entre los seres vivos;
b. Estructura celular bacteriana y sus funciones;
c. Metabolismo, nutrición y crecimiento bacterianos;
d. Las bacterias y su rol en la formación de la biosfera;
e. Utilización de las bacterias con propósitos biotecnológicos.
4.2. Experiencias de laboratorio
Para los objetivos de habilidades planteados se realizarán experiencias de laboratorio, el
núcleo experimental del curso. Se proporcionarán guías de trabajos prácticos al comienzo del
cursado, constando cada experiencia constará de cinco sesiones de 6 horas según cronograma
adjunto, incluyendo discusión del protocolo y diseño del experimento. Se realizarán en la sala
de trabajos prácticos de la Facultad, en grupos de no aproximadamente 12 alumnos, los cuales
realizarán el trabajo experimental en forma individual y la discusión de resultados en forma
conjunta. Mediante estas experiencias se intenta que el alumno adquiera habilidades prácticas
sobre los siguientes puntos, los cuales serán abordados en orden secuencial:
a. Uso y cuidados del microscopio óptico;
b. Preparación correcta de extendidos y coloraciones para la observación microscópica;
c. Uso adecuado de técnicas asépticas e instrumental para manipular y cultivar
microorganismos;
d. Diseño y preparación de medios de cultivo;
e. Realización adecuada de pruebas metabólicas;
f. Estimación de la diversidad bacteriana presente en muestras biológicas;
g. Selección de métodos y fuentes adecuadas para enriquecer materiales biológicos en
bacterias con características fisiológicas deseadas;
h. Estimación del número de bacterias vivas, su masa celular, sus parámetros de crecimiento y
la acción de antimicrobianos en cultivos puros.
5. Evaluación y acreditación
Para aprobar la materia el estudiante deberá manifestar un nivel superior para formular y
verificar hipótesis, recolectar y analizar datos, discutir y presentar resultados de laboratorio,
así como evidenciar habilidades para practicar procedimientos microbiológicos seguros y los
procedimientos adecuados para procesar o desechar el material biológico obtenido del medio
ambiente. Esto se realizará mediante:
a. La asistencia y aprobación de los trabajos prácticos, así como del informe de los resultados
obtenidos en las experiencias de laboratorio;
b. La aprobación de un examen escrito de suficiencia de contenidos parciales, el cual implica
la resolución de problemas e interpretación de resultados de artículos originales. En general,
los problemas presentados son de resolución abierta, admitiendo diferentes estrategias de
interpretación. Esto coloca al alumno ante una serie de posibilidades que requieren no solo el
conocimiento del tema sino un análisis crítico de las posibles interpretaciones, las cuales
pueden variar entre las más directas, o más económicas, o más elaboradas, o combinaciones de
ellas.
La idea general es complementar las actividades prácticas mediante las evaluaciones arriba
mencionadas, y de este modo contribuir a ponderar el rendimiento del alumno de manera
continua;
c. La aprobación de un examen final oral integrativo.

6. Bibliografía principal
Bibliografía general
1) Brock. Biology of Microorganisms. Eds. Madigan-Martinko-Stahl-Clark, últimas ediciones
(Benjamin Cummings editor).
2) The physiology and biochemistry of prokaryotes. D. White, Oxford University Press.
3) Structural and functional relationships in prokaryotes. L. Barton, Springer Science Press
4) Escherichia coli and Salmonella, Cellular and Molecular Biology (últimas ediciones), F.
Neidhardt (Editor), ASM Press.
5) Artículos y revisiones en revistas científicas de publicación periódica.