U.C.S.M. E.P. Ing.

Biotecnolgica Biologa celular II

TEMA N5: ARQUEAS

1. Introduccin:

Los procariontes no solo son los organismos ms antiguos, sino tambin los ms
abundantes. Aunque presentan una morfologa y una organizacin celular uniforme,
los procariontes conforman un grupo con amplia diversidad estructural y metablica,
por lo que incluye dos dominios diferentes, Bacteria y Archaea. El dominio Archaea es
de reciente creacin y se organiz con la agrupacin de organismos con similitudes en
el aspecto molecular.

Archaea se deriva de la palabra griega archaios, que significa "antiguo" o "primitivo".

Las Archaeas tienen adaptaciones que les permite habitar ambientes con condiciones
extremas. Pueden tolerar temperaturas superiores a 100 C o inferiores a 0 C,
concentraciones salinas muy superiores a las del agua del mar, pH extremos y alta
radiacin ionizante.

Muchas arqueas habitan condiciones menos extremas. Por ejemplo, las arqueas no
extremas son abundantes en el suelo y en aguas superficiales ocenicas fras cerca de
la Antrtida.

2. Caractersticas morfolgicas:

Las Archaeas son pequeas, entre dcimas y varias centenas de micrmetros de

longitud, en promedio mide de 1 a 30 m y su volumen es menor de un micrmetro
cbico. Las formas ms frecuentes son los bacilos, que pueden ser rectos, curvos,
helicoidales o con bifurcaciones, y los cocos que pueden ser esferas regulares o
irregulares, lobuladas o no.

El dominio Archaea consiste de dos grupos principales o filos: Crenarchaeota y

Euryarchaeota. Esta filogenia se basa en ARNr 16S y en la secuenciacin de genomas
completos. Se ha propuesto un tercer grupo, Korarqueota, pero sus integrantes nunca
se han cultivado y se conocen solo por secuencias 16S de rRNA obtenidas de muestras
ambientales.

Las crenarqueotas consisten principalmente de termfilas extremas, arqueas que

requieren una temperatura muy elevada o muy baja para crecer. La temperatura
ptima para muchos es mayor que 80C. La mayora son anaerobias estrictas y
acidfilas. Estas arqueas habitan ambientes muy calientes, en ocasiones muy cidos,
como aguas geotermales ricas en azufre, fuentes calientes acidas y tambin suelos con
azufre. Ejemplo: Thermus aquaticus, Termoproteus tenax, Pyrodictium abyssi,
Sulfolobus acidocaldarius y Sulfolobus solfataricus. Una especie se encuentra en las
fuentes termales sulfurosas del Parque Yellowstone a temperaturas cercanas a 80C y
valores de pH de 1 a 2, el pH del cido sulfrico concentrado. Otras habitan reas
volcnicas bajo el mar. Una especie, que se encuentra cerca de profundos respiraderos
hidrotrmicos en el lecho marino del ocano Pacfico, vive a temperaturas que van de
los 80C a los 120C.

En contraste, algunos crenarqueotas viven en ambientes muy fros (por debajo de

15C). Algunas de estas arqueas son arrastradas por las corrientes en el ocano y son
parte importante del plancton.

Ing. Cinthia Crdova Barrios

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Las euriarqueotas tambin incluyen muchas arqueas que habitan ambientes extremos.
Este grupo incluye metangenas, halfilas extremas y algunos hipertermfilas.

Las metangenas (productoras de metano) son un gran grupo diverso que habita
ambientes libres de oxgeno en aguas negras, pantanos y los aparatos digestivos de
humanos y otros animales. Son anaerobios obligados que producen gas metano a
partir de compuestos de carbono simples. Otros compuestos orgnicos como
alcoholes, cido actico o cido frmico son utilizados como receptores de electrones
por los metangenos. Por ejemplo: Methanococcus jannaschii y Methanopyrus
kandleri.

Las metangenas son importantes en el reciclaje de componentes de productos

orgnicos de organismos que habitan pantanos. Las metangenos que habitan los
aparatos digestivos de vacas y otros animales de pastoreo producen metano, que
liberan los animales. Las metangenas producen ms de 80% del metano (ms de dos
mil millones de toneladas anuales) en la atmsfera de la Tierra. El metano es un
importante gas de efecto invernadero.

Las halfilas extremas son hetertrofas que requieren de alta concentracin de sal
(NaCl); al menos 10% de cloruro de sodio para su crecimiento. Viven en soluciones de
salmuera saturadas como estanques salados. Por ejemplo: Halobacterium halobium.
Viven en ambientes naturales como el mar Muerto, el Great Salt Lake (Colorado USA),
o en estanques de evaporacin de agua salada, donde la concentracin de sal es muy
alta (5 M de NaCl).

Entre las hipertermfilas, Nanoarchaeum es un organismo anaerobio muy pequeo

(400 nm), presenta uno de los genomas ms pequeos (menos de 500,000
nucletidos). Nanoarchaeum vive fijo a otras arqueas y depende de su husped para
muchas de sus necesidades metablicas.

3. Estructura celular:

En contraste con las bacterias, las arqueas no tienen peptidoglicano en sus paredes
celulares, presentan un polisacrido similar o seudopeptidoglicano, otras poseen
paredes de protenas o glucoprotenas, por lo general formando una capa cristalina
(capa S) de simetra hexagonal, que acta como tamiz molecular y proteccin.

Aunque sus membranas plasmticas son estructuralmente similares, son

qumicamente nicas. En las membranas plasmticas de bacterias y eucariotas, cidos
grasos de cadena recta se unen a molculas de glicerol mediante enlaces ster. En
contraste, en las arqueas no se encuentran componentes de cido graso. En vez de
ello, hidrocarburos de cadena ramificada (sintetizados a partir de unidades isopreno)
se enlazan a glicerol mediante enlaces ter. La ausencia de un segundo tomo de
oxgeno electronegativo hace los enlaces ter ms fuertes que los enlaces ster. Esta
estructura de membrana nica puede contribuir a la habilidad de las arqueas para
sobrevivir y proliferar en ambientes difciles.

Mientras que las Bacterias y Eukaryas tienen D-glicerol en sus membranas, las
Archaeas tienen L-glicerol.

Al igual que en el caso de Bacteria, la membrana de Archaea tampoco contiene

colesterol.

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Los principales tipos de lpidos son los diteres de glicerol. En algunos teres las
cadenas laterales (fitanil) se unen entre s por enlaces covalentes formando una
monocapa (bifitanil), dos cabezas de glicero unidas covalentemente entre s a travs
de los cidos grasos, en lugar de la bicapa caracterstica de las membranas, siendo ms
estables y resistentes, siendo habituales por lo tanto en las hipertemfilas.
Las arqueas carecen de envoltura nuclear, de orgnulos encerrados en membranas
internas, no forman endosporas.

Usualmente presenta un cromosoma circular, cuyo DNA se encuentra asociado a

histonas. El RNA ribosmico de la subunidad pequea de los ribosomas (16 S rRNA)
tiene una estructura nica entre las posiciones 180-197 o 450-498. Los ribosomas
compuestos de dos subunidades, tienen un valor de sedimentacin de 70S. Su forma
es variable, diferente de la de los ribosomas de bacteria y eucariontes.

Presentan flagelos similares a las bacterias, que le dan movimiento natatorio a la

clula.

4. Nutricin y metabolismo:

Las arqueas son quimiolitoautotrofas, obtienen energa a partir de la oxidacin aerobia

de compuestos inorgnicos como H2, NH3, NO2, H2S, S0, S2O3, Fe2+, CO, CH4 como
dadores de electrones, y como fuente de carbono, el CO2. Alguna archaeas como
Sulfolobus crecen anaerbicamente con H2, S0 o Fe2+.

No se conocen Archaea fotosintticas, pero el gnero Halobacterium una archaea

halfila extrema usa respiracin aerobia para producir ATP. Sin embargo, tambin
llevan a cabo una forma de fotosntesis en la que capturan la energa de la luz solar
usando un pigmento prpura (bacteriorrodopsina). Este es el nico ejemplo en la
naturaleza de una fotofosforilacin sin clorofila.

Pueden ser aerobias o anaerobias, estrictas o facultativas.

5. Reproduccin:

Se reproducen por divisin celular simple o fisin binaria. Se trata de una reproduccin
asexual.

6. Importancia y aplicaciones biotecnolgicas:

Las arqueas tambin son econmicamente importantes, parte del inters en estos
organismos radica en las posibles aplicaciones tecnolgicas de sus enzimas,
extremozimas, adaptadas a altas temperaturas o condiciones extremadamente cidas.
Su alta termoestabilidad permite realizar biocatlisis con ventajas para la industria
como: incremento de la solubilidad de los sustratos polimricos, disminucin de la
viscosidad, incremento de la biodisponibilidad y aumento en la velocidad de las
reacciones

Enzimas arqueanas se han agregado a detergentes de lavandera e industriales para

aumentar su desempeo a temperaturas y niveles de pH ms elevados. Proteasas
procedentes de los gneros Desulfurococcus, Thermococcus y Pyrococcus.

Otra enzima arqueana (amilasa de Pyrococcus woesei y pululanasa de Pyrococcus

woesei) es til en la industria alimenticia para convertir el almidn de maz en

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dextrinas. Tambin tienen aplicacin en la industria, azucarera, textil y papelera

(celulasas de los gneros Thermophilum, Pyrococcus y Thermococcusnen el reciclaje
del papel)

Las enzimas del dominio Archaea pueden utilizarse con fines analticos, como es el
caso de la determinacin de glucosa en sangre. La enzima usada en esta determinacin
es la glucosa DSH de Sulfolobus solfataricus.

Una de las aplicaciones ms generalizadas es el uso de la DNA polimerasa Taq

polimerasa, obtenida del termfilo Thermus aquaticus, asi como la DNA polimerasa Pfu
de Pyrococcus furiosus y DNA polimerasa Vent de Thermococcus litoralis.

Las arqueas metanognicas son responsables de fuentes naturales de gas natural

(combustible fsil).

Las arqueas metantrofas que obtienen energa a partir de la oxidacin de metano son
de suma importancia ecolgica porque transforman el metano en CO2 y pueden ser
utilizadas en sistemas de biorremediacin.

Las arqueas oxidadoras de azufre y hierro intervienen en procesos de biolixiviacin

como el genero de Sulfolobus y Ferroplasma.

Los microbilogos sugieren que las arqueas pueden ser importantes en los ciclos
biogeoqumicos y en las cadenas alimenticias marinas. No se han identificado arqueas
patgenas.

7. Artculo cientfico

Acetilacin de protenas en arqueas, bacterias y eucariotas:

Las modificaciones postraduccionales pueden influir en muchas caractersticas

diferentes de las protenas como su plegamiento, actividad, estabilidad, antigenicidad,
localizacin intracelular e interaccin con otras protenas o con cidos nucleicos. La
fraccin de protenas modificadas postraduccionalmente y, por lo tanto, la
importancia de la modificacin postraduccional generalmente se cree que es muy
diferente para eucariotas (que tienen una fraccin elevada de protenas modificadas) y
procariotas, que se cree albergan muy pocas protenas modificadas. Para eucariotas,
se cree que la acetilacin es la modificacin covalente ms comn. Durante mucho
tiempo se pens que esto tambin sera cierto para las protenas archaeas, y as, hace
varios aos se resumi segn los resultados disponibles de que la acetilacin N-
terminal es fundamentalmente diferente en eucariotas en comparacin con arqueas y
bacterias y que la acetilacin de la protena N-terminal se suma al nmero cada vez
mayor de funciones biolgicas que combinan eucariotas y arqueas con la exclusin de
la bacteria. Por lo tanto, el presente documento tiene un doble papel, por un lado,
resume los resultados sobre la acetilacin de protenas en arqueas, y por otro lado,
tiene la esperanza de impulsar la investigacin en esta rea fascinante y
principalmente inexplorada. Explica la acetilacinvdel grupo alfa-amino del aminocido
N-terminal de las protenas y la acetilacin del grupo psilon-amino de residuos
internos de lisina.

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Produccion de lipasas y esterasas a partir de las arqueas halofilas Halobacterium sp.

NRC-1 y Haloarcula marismortui

Halobacterium sp. NRC-1 (H)

y Haloarcula marismortui

bas halo-
arqueas.
lipasa de estas haloarqueas.

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TEMA N6: VIRUS

1. Introduccin:

A finales del siglo XIX, los botnicos buscaban la causa de la enfermedad llamada
mosaico del tabaco, la cual detiene el crecimiento de esa planta y da a las hojas
infectadas un aspecto manchado, de mosaico. Descubrieron que la enfermedad poda
transmitirse a plantas sanas si se frotaban las hojas de stas con la savia de las
enfermas. En 1892, Dmitri Ivanowsky, botnico ruso, demostr que la savia era
infectiva an despus de haberla hecho pasar por filtros de porcelana lo
suficientemente finos diseados para filtrar todas las bacterias conocidas. Unos pocos
aos despus, en 1898, Martinus Beijerinck, un microbilogo alemn, obtuvo pruebas
de que el agente que causaba el mosaico del tabaco tena muchas caractersticas de un
ser vivo. Plante la hiptesis de que el agente infectivo slo podra reproducirse
dentro de una clula viva y lo llam virus, de la palabra latina virus, que quiere decir
C
estuvieran presentes en clulas vivas. El desarrollo del microscopio electrnico en la
dcada de 1930 hizo posible ver virus por primera vez.

Un virus es una diminuta partcula infecciosa consistente en un cido nucleico central

envuelta en una cubierta proteica llamada cpside. Los virus no son celulares, y no
pueden realizar actividades metablicas de manera independiente. Carecen de los
componentes necesarios para realizar la respiracin celular o para sintetizar protenas
y otras molculas. Los virus pueden reproducirse, pero solo dentro del complejo
ambiente de las clulas vivas hospedadoras las que infectan. Los virus utilizan su
informacin gentica para obligar a la clula hospedadora a multiplicar el cido
nucleico vrico. Los virus toman el control de los mecanismos de transcripcin y
traduccin de la clula hospedadora. Son parsitos intracelulares obligados, lo que
supone que solo sobreviven cuando utilizan las fuentes de la clula hospedadora.

2. Caractersticas morfolgicas:

Los virus son muy pequeos. La mayora vara en tamao desde 20 hasta 300 nm. La
forma est determinada por las subunidades de la cpside. Por lo general los cpsides
son helicoidales o polidricos, o una combinacin de ambas formas. Los virus
helicoidales, se observan como largos hilos o barras, cuya cpside es un cilindro hueco
de protenas que forman un surco en el que encaja el RNA. Los virus polidricos, son
un tanto esfricos, cuya cpside se encuentra organizada en tringulos equilteros. La
estructura poliedrica ms comn es un icosaedro. Algunos virus tienen componentes
tanto helicoidales como polidricos, presentan una cabeza polidrica unida a una cola
helicoidal (vaina).

3. Estructura celular:

Un virus consiste de cido nucleico rodeado por un recubrimiento proteico. Hasta hace
poco, los bilogos pensaban que un virus contiene cido desoxirribonucleico (ADN) o
cido ribonucleico (ARN), pero no ambos. Sin embargo, los investigadores han
secuenciado recientemente el genoma de los Mimivirus y han descrito que este gran
virus DNA tambin tiene seis RNA transferidos. Los virus tienen tpicamente cadenas
simples (ss) de DNA, cadenas dobles (ds) de DNA, ssRNA o dsRNA. El tipo de cido
nucleico es importante para clasificar los virus.

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No fabrican ribosomas, de manera que no tienen rRNA especfico, por esta razn, los
virus no pueden clasificarse en ninguno de los tres dominios.

Las cpsides consisten en subunidades protenicas, llamadas capsmeros

(antigenicidad), los cuales determinan la forma de un virus.

Algunos virus estn rodeados por una envoltura membranosa externa. Los virus
rodeados por una envoltura membranosa externa se denomina virus envueltos. La
envuelta vrica consta de fosfolpidos y protena de la membrana plasmtica de la
clula hospedadora, as como protenas diferentes producidas por el propio virus.

Algunos virus producen proyecciones protenicas que se extienden hacia afuera de la

envuelta como espculas, importantes en la interaccin del virus con la clula
hospedadora.

4. Nutricin y metabolismo:

Los virus no pueden realizar actividades metablicas de manera independiente.

Carecen de los componentes necesarios para realizar la respiracin celular o para
sintetizar protenas y otras molculas. Los virus pueden contener una mnima cantidad
de enzimas: transcriptasas y lticas.
Los virus infectan a vegetales, animales y bacterias.

5. Reproduccin:

Los dos tipos de reproduccin entre los virus son el ciclo ltico y el ciclo lisognico.

En un ciclo ltico, el virus lisa la clula hospedadora. Cuando el virus infecta una clula
hospedadora susceptible, la obliga a utilizar su maquinaria metablica para multiplicar
partculas vricas. Los virus que solo tienen ciclo ltico se describen como virulentos, lo
que significa que causan enfermedad.

En un ciclo lisognico, el genoma vrico se integra en el DNA de la clula hospedadora y

se denomina entonces provirus o profago. Cuando el DNA de la clula hospedadora se
duplica, el profago tambin lo hace. Estos virus que no siempre destruyen a sus
hospedadores se denominan virus templados. A veces los virus templados se hacen
lticos de manera espontnea.

El ciclo reproductor de los virus comienza cuando un virus se pone en contacto con
una clula hospedadora, el virus se une a receptores de la superficie de la clula
hospedadora (fijacin); el virus penetra a travs de la membrana plasmtica e inyecta
su cido nucleico en el citoplasma de la clula (penetracin); el virus degrada el cido
nucleico de la clula hospedadora y utiliza la maquinaria molecular de sta para
replicar su propio cido nucleico y sintetizar protenas (replicacin y sntesis); los
componentes vricos recin sintetizados se ensamblan para formar nuevos virus
(ensamblaje), los cuales se liberan de la clula hospedadora, por lisis de la membrana
plasmtica del hospedador por la enzimas lticas producidas por el fago (liberacin).
Una vez liberados, los nuevos virus infectan otras clulas y el proceso vuelve a
empezar. El tiempo necesario para la reproduccin vrica, desde la fijacin hasta la
liberacin de los nuevos virus, vara entre 20 minutos y ms de una hora.

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6. Importancia y aplicaciones biotecnolgicas:

Obtencin de vacunas recombinantes.

Vectores en el proceso de transgenesis.

Terapia gnica utilizando a los virus como vectores.

Los fagos pueden ser utilizados para proporcionar seguridad alimentaria y medica.

Bacterifagos para el problema creciente y cada vez ms extendido de la resistencia de

las bacterias a los antibiticos, los cientficos estn manipulando genticamente los
fagos de tal forma que las bacterias no desarrollen resistencia a ellos.

Obtencion de nanomateriales.

7. Artculo cientfico:

Production of tunable nanomaterials using hierarchically assembled bacteriophages

El bacterifago por su estructura cristalina lquida puede ser utilizado en un sistema

modelo de nanofibras para la creacin de diversas estructuras jerrquicamente
organizadas

La modificacin gentica de los pptidos funcionales del bacterifago da como

resultado estructuras que pueden utilizarse como materiales blandos y duros en la
regeneracin de tejidos, biosensores y materiales generadores de energa. Entre las
aplicaciones de nanomateriales a partir de la ingeniera de fagos destacan: (a) Matrices
de sensores colorimtricas basadas en fagos. A travs de la ingeniera gentica, en las
protenas del fago se puede disear estructuras para mostrar receptores para
productos qumicos deseados. El fago modificado resultante puede autoensamblarse
para formar pelculas delgadas colorimtricas que puede cambiar los colores tras el
enlace de las molculas diana. A travs del anlisis del color y el reconocimiento de
patrones, se puede detectar varias molculas con sensibilidad y selectivamente. (b)
Matrices generadoras de energa piezoelctrica basadas en fagos. Debido a la
disposicin de las protenas de recubrimiento no centrosimtrica que no tiene
inversin centros, el fago M13 posee propiedades piezoelctricas intrnsecas. Tras la
aplicacin de fuerzas externas, el fago y sus matrices autoensambladas pueden
generar potenciales elctricos. (c) Matrices de ingeniera de tejidos. El fago se puede
disear para mostrar pptidos de sealizacin de alta densidad (1,5 x 1013 pptidos
RGD por cm2). El fago resultante puede autoensamblarse para formar matrices de
ingeniera de tejidos para guiar el proceso de crecimiento celular de las clulas
deseadas.

gura y estable.

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