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Rev.R.Acad.Cienc.Exact.Fs.Nat.

(Esp)
Vol. 97, N. 2, pp 203-222, 2003
IV Programa de Promocin de la Cultura Cientfica y Tecnolgica

DOBLE HLICE, GENES Y CROMOSOMAS


LUIS FRANCO VERA *

* Universidad de Valencia. Departamento de Bioqumica. Facultad de Biolgicas. Burjasoto 46100 Valencia

INTRODUCCIN fenmenos biolgicos. Por otra parte, esa dimensin


lgica que observamos en la naturaleza favorece la
El ttulo de la presente contribucin sigue un orden capacidad de asombro que, lejos de constituir una
lgico. Tendremos ocasin de ver cmo el DNA, con actitud acientfica, proporciona al investigador un sus-
su conocida estructura en doble hlice, es el compo- trato que, con frecuencia, dispara su creatividad y dota
nente fundamental de los genes y cmo stos se a toda persona culta interesada por la naturaleza de
encuentran localizados en los cromosomas. Parece unas armas sumamente tiles para adentrarse en su
lgico, a simple vista, que un discurso intelectual se comprensin.
remonte desde lo ms sencillo a lo ms complejo. Pero
no coincide el orden lgico con el cronolgico: hist-
ricamente se elabor primero el concepto de gen an GENES
dentro del siglo XIX, luego se descubrieron experi-
mentalmente los cromosomas en los albores del siglo Es imposible hablar de los genes sin mencionar a
XX y la propuesta de la doble hlice como modelo Gregor Mendel (figura 1). Era un fraile agustino, que
estructural del DNA data de slo unos 50 aos. Por pas casi toda su vida en el monasterio de Brno, en la
otro lado, como es frecuente en el desarrollo de una actual repblica Checa. Tena una gran aficin por las
ciencia experimental, el avance en el conocimiento de Ciencias Naturales e intent varias veces, sin xito,
los objetos de nuestra consideracin, genes, cromoso- dedicarse a la docencia universitaria. Tuvo que confor-
mas y doble hlice, ha sufrido innumerables idas y marse con experimentar en un rincn del jardn de su
venidas hasta llegar a su estado actual. Por ese motivo, monasterio. Pero esas circunstancias resultaron provi-
aunque el orden de este captulo corresponda ms o denciales. Dotado de una singular capacidad de obser-
menos con el cronolgico, ser preciso dar numerosos vacin, de un rigor poco frecuente y de una insaciable
saltos, hacia atrs o hacia adelante en el tiempo, para curiosidad, logr que el tranquilo ambiente que le
llegar a un compromiso entre la lgica y la cronologa rodeaba, lejos del ajetreo de las ciudades universitarias
histrica. de su poca, se convirtiera en el caldo de cultivo ideal
para uno de los grandes descubrimientos de la ciencia
No deja de tener inters ese esfuerzo por com- moderna. Mendel se dedic a observar cmo se here-
prender la lgica de un proceso biolgico, especial- daban los caracteres, color y aspecto de las semillas,
mente lo que Lehninger llamaba la lgica molecular color y forma de las flores, de plantas de guisante.
de la vida. No hay que ver en esta actitud un intento de Lleg as a establecer, en un prodigio de rigor inte-
juzgar a la naturaleza reducindola a unas categoras lectual las leyes de la herencia biolgica que llevan su
antropocntricas. Pero no cabe duda de que, de esa nombre. Pero, en el contexto del presente captulo, lo
manera, se logra un conocimiento ms profundo de los que interesa es que a Mendel se debe la primera for-
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y Boveri postulan la teora cromosmica de la


herencia. Estos autores encontraron que los cromo-
somas, partculas visibles al microscopio en clulas en
divisin, posean unas propiedades que los hacan
aptos para ser portadores de la informacin gentica
que, precisamente al dividirse una clula, deba pasar a
las clulas hijas.

Naturalmente, la comparacin de los resultados de


Sutton y Boveri con los de Mendel inmediatamente
sugera que los genes, esas partculas materiales postu-
ladas por el fraile agustino, estaban contenidas en los
cromosomas. Era el primer avance en el esfuerzo mul-
tidisciplinario que ha conseguido hacer de la investi-
gacin en esta lnea tema uno de los temas de mayor
inters actual. En el caso presente, se dio la conjuncin
de los aportaciones genticas con las citolgicas y
quedaba abierta la puerta para la entrada de las aporta-
ciones bioqumicas que contemplaremos en el
siguiente apartado.

Pero antes es preciso, con la idea expuesta en la


Figura 1. Gregor Mendel (1822-1884).
introduccin, hacer un apunte lgico. Los genes, si son
responsables de la herencia biolgica, han de contener
mulacin del concepto de gen, como factor parti- unas instrucciones que, al ser ejecutadas, den lugar a
culado responsable de la herencia de un carcter. los diversos caracteres fenotpicos, u observables.
Segn esa primitiva concepcin, un gen sera respon- Pero es un hecho de experiencia primaria que esos
sable del color amarillo de las semillas de guisante, caracteres son propios de las especies y que se trans-
otro del color verde, otro de su aspecto rugoso, etc. En miten a la descendencia de acuerdo con unas leyes
esa definicin originaria, de 1866, hay un detalle que precisas, las leyes de Mendel. Naturalmente, cuando
resulta de la mxima importancia. Un gen es un una clula se divide en dos, cada una de las clulas
factor particulado, es decir, no se trata de una abs- resultantes debe heredar la misma informacin. Eso
traccin, ni de algo ideal que slo tenga cabida en la significa que el material que constituya los genes debe
mente del investigador. No; los genes son partculas dividirse, replicarse diremos dentro de poco en el len-
materiales y, por lo tanto, susceptibles de ser estu- guaje tcnico, de modo que donde haba una ins-
diados por los mtodos de las ciencias empricas. truccin pase a haber dos copias de la misma que
Podemos llegar a conocer la composicin qumica de puedan repartirse entre las clulas hijas. Es preciso,
los genes, podemos analizarlos, podemos sinteti- adems, que la clula haga la copia de la informacin
zarlos... con la mayor fidelidad posible. De otro modo, si se
admitieran errores, podra resultar bien informacin
Admitiendo la definicin de Mendel, esas metas no sin sentido, incapaz de ser ejecutada por la clula, bien
eran sueos irrealizables. No obstante, hubo que informacin alterada, que diera lugar a la ejecucin de
esperar. Hubo que esperar, primero porque los resul- una orden distinta de la presente en el gen de la clula
tados de Mendel se publicaron en una oscura revista y madre. Estas alteraciones mutaciones en la infor-
pasaron inadvertidos para sus contemporneos; en macin gentica se dan de hecho. Aunque sea un
segundo trmino, porque estaban fuera del alcance de fenmeno que ocurra con escasa frecuencia, tienen
la ciencia de la poca. El redescubrimiento de las gran importancia. Es cierto que la mayor parte de las
investigaciones de Mendel se produce en los umbrales veces son perjudiciales, incluso letales, para las
del siglo XX, en el mismo ao, 1900, en el que Sutton clulas, pero tambin es cierto que son las mutaciones
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las que permiten la variacin del contenido infor- de los productos de los genes como protenas fue poco
mativo de los organismos, un proceso clave para hacer a poco ganando terreno. En paralelo, los bioqumicos
posible la evolucin biolgica. En resumen, pues, la fueron avanzando en el desciframiento de la estructura
lgica nos dice que el material del que estn com- de las protenas. A finales del siglo XIX se saba que
puestos los genes ha de ser capaz de replicarse con las protenas estaban formadas por aminocidos y se
fidelidad, pero al mismo tiempo debe admitir las muta- haban caracterizado casi todos ellos, aunque la
ciones, los errores en la replicacin. estructura de la metionina, el ltimo de los amino-
cidos proteicos en ser descubierto, no se describira
hasta 1935. Ya en 1902 Fischer y Hofmeister haban
LOS GENES Y SUS PRODUCTOS propuesto que los aminocidos proteicos, que poseen
en su estructura un grupo carboxilo y un grupo amino,
Los genes contienen instrucciones que han de eje- se unen entre s a travs de enlaces peptdicos, amidas
cutarse. Al fin y al cabo esto es algo a lo que estamos secundarias, que pueden dar lugar a polipptidos,
acostumbrados en la vida ordinaria. No es cierto que cadenas que resultan de la unin de un nmero grande
todos los das vemos numerossimas instrucciones? de aminocidos. Las protenas son, pues, polipptidos,
Por ejemplo, quin no ha recibido uno de esos sobres polmeros lineales de aminocidos, cuyo orden de
preparados para una apertura fcil, en los que aparece encadenamiento constituye la denominada estructura
la instruccin: cortar por la lnea de puntos? Pero primaria.
est claro que la instruccin no basta. Es preciso leerla,
entenderla. Y es preciso ejecutarla, bien sea rasgando a A mediados del siglo XX, la aplicacin de mtodos
mano, bien empleando unas tijeras. Una vez ms, la fsicos, especialmente difraccin de rayos X, al estudio
lgica nos dice que no basta con que existan los genes; de la estructura de protenas permiti estudiar el modo
se precisa una maquinaria capaz de entender sus ins- con que las cadenas polipeptdicas se organizan en el
trucciones y de ejecutar las rdenes que contienen. Los espacio. As pues, y propiciados por el mtodo de la
bilogos pronto se dieron cuenta de estos requeri- Biologa Molecular que naci con vocacin inte-
mientos, de modo que en esa conjuncin de Gentica y gradora y estructuralista, aparecieron en escena los
Citologa que permiti localizar los genes en los cro- conceptos de estructuras secundaria y terciaria2, que
mosomas, la Bioqumica tena que aportar datos para aadan al puramente qumico de estructura primaria
resolver dos cuestiones. No bastaba con contestar la una dimensin espacial.
pregunta cul es la naturaleza molecular de los
genes?, sino que era menester despejar tambin el Es precisamente en esa poca cuando surge una
interrogante: qu naturaleza molecular tienen los pro- nueva definicin de gen, como consecuencia del
ductos de los genes? avance sobre la estructura y funcin de protenas.
Concretamente, ese nuevo avance se data en 1945,
Durante los primeros aos del siglo XX se fueron pero haba sido precedido de importante descubri-
acumulando datos que ponan de manifiesto la impor- mientos en la dcada anterior. En el transcurso de
tancia de las protenas en todos los procesos celulares. estudios de gentica bioqumica otra vez aparece en
En efecto, se fue comprobando que las protenas no escena la multidisciplinariedad Ephrussi y sus cola-
slo desempean funciones estructurales o de reserva, boradores estudiaron la sntesis de los pigmentos ocu-
sino que participan en todos los aspectos de la lares de Drosophila melanogaster, que tiene lugar a
dinmica celular. Protenas son las enzimas1, los anti- partir del triptfano. Algunos mutantes de Drosophila
cuerpos, muchos reguladores, receptores, transporta- se caracterizan por tener ojos con una pigmentacin
dores de molculas dentro de la clula o entre distintas diferente de la normal (figura 2). Pareca evidente que
partes de un organismo, etc. Por ello, la identificacin en dichos mutantes fallaba de alguna manera la ruta de

1 Desde hace aos se sabe que algunas enzimas, las ribozimas, estn constituidas por RNA pero, aunque en los primeros estados de la evolu-
cin biolgica las ribozimas fueran muy importantes, en la actualidad representan una nfima parte de las enzimas.
2 El lector interesado puede encontrar las descripciones de estos niveles estructurales de las cadenas polipeptdicas, as como del de estruc-
tura cuaternaria al que se aludir ms adelante, en cualquiera de los excelentes textos de Bioqumica que existen en la actualidad.
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compuestas por ms de un tipo de cadenas polipept-


dicas. La hemoglobina, que se encarga del transporte
de oxgeno en los vertebrados (figura 3) constituye un
caso paradigmtico de estas protenas. En su estructura
cuaternaria, participan dos tipos de cadenas, y , que
difieren en su estructura primaria y son producto de
dos genes diferentes. As pues, es menester precisar
an ms la hiptesis de Beadle y Tatum, de manera que
quede formulada como: un gen, una cadena polipep-
tdica.

El conocimiento de la naturaleza de sus productos


nos ha permitido avanzar en el concepto de gen. Pero
an no se ha comentado nada sobre la naturaleza de los
genes. En realidad, as se encontraba histricamente la
ciencia a mediados de la dcada de 1940. Una cosa era
Figura 2. Ejemplares de Drosophila melanogaster. A: Cepa sal- evidente: si los genes estn contenidos en los cromo-
vaje (Oregon R); B: Mutante white; C: Mutante sepia. Cortesa somas, su naturaleza molecular deba corresponder
del Departamento de Gentica de la Universidad de Valencia
(Estudi General).
con alguno de los componentes de los cromosomas. O,
si se quiere, de la cromatina, nombre que recibe el
material gentico en el ncleo en interfase3.
biosntesis que conduce al pigmento normal y, en su
lugar, se acumulaba otro diferente. Con estos antece-
dentes, y teniendo en cuenta que cada etapa de una ruta
DOBLE HLICE
metablica est catalizada por una enzima, Beadle y
Tatum concluyeron en 1945 que las enzimas eran los EL DNA, MATERIAL GENTICO
productos de los genes, de modo que la diversidad de
enzimas de una clula, que es responsable en gran Los primeros anlisis bioqumicos pusieron de
medida de la diversidad de sus funciones, sera conse- manifiesto que la cromatina est constituida por pro-
cuencia de la diversidad de genes. La hiptesis de tenas y un cido nucleico, el cido desoxirribonu-
Beadle y Tatum se plasm en una clebre frase: un cleico (DNA). Los cidos nucleicos son polmeros
gen, una enzima. Con ella se quera significar que la formados por nucletidos, que, a su vez, estn consti-
informacin contenida en los genes se traduca, funda- tuidos por una pentosa ribosa en el cido ribonu-
mentalmente, en la sntesis de enzimas. Pero hay otras cleico (RNA) y dexosirribosa en el DNA, una base
protenas que no son de naturaleza enzimtica y tienen nitrogenada y fosfato. Hay dos tipos de bases nitroge-
tambin un papel decisivo en la dinmica celular, por nadas, las pricas y las pirimidnicas. Son purinas la
lo que el adverbio fundamentalmente que aparece adenina (A) y la guanina (G), que se encuentran tanto
ms arriba deja abierta la funcin de los genes de en el RNA como en el DNA. Las pirimidinas son: la
modo que, sin faltar al espritu de Beadle y Tatum, su citosina (C), presente en ambos cidos nucleicos, el
hiptesis se podra enunciar: un gen, una protena. uracilo (U), caracterstico del RNA y la timina (T), que
tpicamente se halla en el DNA.
Durante los aos 40, contina avanzando la
Bioqumica en el estudio de las protenas y se van acu- La estructura covalente de los cidos nucleicos
mulando datos que indican que muchas protenas estn (figura 4) se estaba investigando ya en los aos 404.

3 En el ciclo celular se pueden definir varias fases. La mitosis, que coincide con el momento de divisin celular, se caracteriza por la conden-
sacin del material gentico en forma de cromosomas. El resto del ciclo celular, que media entre dos divisiones sucesivas y ocupa la mayor
parte del tiempo, se denomina genricamente interfase. Se subdivide en varias etapas y es el periodo de mxima actividad metablica y genti-
ca de la clula.
4 Fue Todd quien, en 1951, describi la estructura covalente de las cadenas de polidesoxirribonucletidos que se recoge en la figura 4.
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Figura 3. Estructura de la hemoglobina humana, mostrando su estructura cuaternaria, fomada por dos subunidades (azul) y otras
dos (amarillo). En la parte A slo se representa esquemticamente el esqueleto polipeptdico para mostrar la estructura secundaria
(hlices ). En la parte B se representan todos los tomos de las cadenas. Ambas figuras estn construidas con el programa RasMol.

Pero exista la idea generalizada de que el DNA era un on elementary analysis conforms very closely to the
mero componente estructural de la cromatina y de los theoretical values of pure deoxyribose nucleic acid
cromosomas, de modo que seran las protenas cromo- () If we are right, then it means that nucleic acids
somales las portadoras de la informacin gentica y, are not merely structurally important but functionally
active substances in determining the biochemical
por tanto, las constitutivas de los genes. Esa idea se
activities and specific characteristics of the cells ()
basaba en una consideracin apriorstica: el hecho de But today it takes a lot of well documented evidence
que slo hubiera 4 desoxirribonucletidos y, sin to convince anyone that the sodium salt of deoxyri-
embargo, 20 aminocidos, daba la impresin de que bonucleic acid, protein free, could possibly be
las protenas admitiran un mayor grado de variabi- endowed with such biologically active and specific
lidad estructural que el DNA, algo que pareca impor- properties and that is the evidence we are now trying
tante para explicar la variabilidad de los genes. to get. It is lots of fun to blow bubbles but it is wiser
to prick them yourself before someone else tries to
Sin embargo, en 1943 ocurre un acontecimiento
trascendental. Avery, McLeod y McCarthy, estudiando
la transformacin gentica de Streptococcus pneu- EL DESCUBRIMIENTO DE LA
moniae comenzaron a sospechar que era el DNA el ESTRUCTURA DEL DNA
portador de la informacin. As se lo contaba el propio
Avery a su hermano en una carta fechada el 13 de Avery era consciente de las dificultades que iban a
mayo de 1943: encontrar para convencer a la comunidad cientfica de
su descubrimiento, pero lograron acumular las pruebas
But at last perhaps we have it. The active suficientes y un ao ms tarde publicaron sus resul-
substance is not digested by crystalline trypsin or tados. Con todo, fueron recibidos con escepticismo y
chymotrypsin, it does not lose activity when treated
pocos cientficos aceptaron la revolucionaria idea.
with crystalline ribonuclease polysaccharides can
be removed Lipids can be extracted without
Entre los convencidos estaban todos los investigadores
impairing biological activity () When extracts () que algo ms tarde se embarcaron en la aventura de
are further fractionated by the dropwise addition of dilucidar la estructura espacial del DNA. Cupo a
absolute ethyl alcohol an interesting thing occurs James Watson y a Francis Crick la gloria de llevar a
() There separates out a fibrous substance (which) buen puerto esa aventura, inaugurando la era de la
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datos indicaba claramente que el DNA posea una


estructura helicoidal, lo que llev a algunos autores a
proponer una estructura en la que tres cadenas de poli-
desoxirribonucletidos se enrollaban entre s, de modo
que los fosfatos quedaran prximos al eje de la
estructura y las bases se orientaran hacia fuera. Otros
investigadores haban propuesto tambin diferentes
modelos basados en la organizacin helicoidal. Pero
ninguno de ellos era satisfactorio. Watson y Crick, a
base de construir modelos moleculares, encontraron
una posible explicacin para los resultados de
Chargaff. El anillo de timina poda unirse con el de
adenina formando puentes de hidrgeno. Lo mismo
ocurra con las bases guanina y citosina (figura 5). Si
eso ocurra en el DNA, y dos cadenas se entrelazaban
de modo que se unieran mediante esos puentes de
hidrgeno entre las bases, quedaban justificadas las
reglas de Chargaff. Ms an, el par A-T tena unas
dimensiones prcticamente idnticas que las del par G-
C. Esto era de la mxima importancia. Si el DNA estu-
viera formado por dos cadenas, la separacin entre los
esqueletos desoxirribosa-fosfato de ambas sera cons-
tante, independiente de la naturaleza del par de bases.
Watson y Crick, trabajando otra vez con modelos
moleculares, llegaron a una estructura que satisfaca
todos los requisitos estructurales y era compatible con
todos los datos experimentales. Acababa de nacer la
Figura 4. Estructura covalente de una cadena de cido nucleico. doble hlice (figura 6).
La cadena representada corresponde a un segmento de RNA,
ya que la pentosa es ribosa. Las cadenas de DNA tienen una
organizacin covalente similar, pero la ribosa est sustituida
Watson y Crick publicaron esquemticamente la
por desoxirribosa, cuya estructura resulta al eliminar el tomo estructura propuesta en un breve artculo, que ocupaba
de oxgeno representado en rojo. una sola pgina, pero que abri un horizonte insospe-
chado para la Biologa y an para toda la ciencia
Biologa moderna. Watson y Crick no hicieron experi- moderna. La estructura postulada en ese artculo
mentos; se basaron en los resultados de otros. Pero corresponde a lo que actualmente se denomina
tuvieron el mrito indiscutible de ver en esos resul- estructura B del DNA, y es en realidad una estructura
tados lo que sus propios autores no haban visto. arquetpica, ya que, en realidad, el DNA, manteniendo
su organizacin helicoidal bicatenaria, presenta una
Fueron decisivos, por ejemplo, los resultados obte- cierta microheterogeneidad estructural, de forma que
nidos por Chargaff, que haba determinado que en el parmetros tales como paso de rosca, inclinacin de
DNA la proporcin de adenina era aproximadamente los pares de bases con respecto al eje de la hlice,
igual a la de timina y la de guanina igual a la de ngulo de giro de un par de bases con respecto al
citosina. Tambin fueron fundamentales los datos siguiente, etc. no son constantes a lo largo de la doble
logrados con difraccin de rayos X de fibras de DNA hlice, sino que dependen de la secuencia de bases
en el laboratorio de Wilkins. La interpretacin de esos concreta de cada tramo5.

5 En general, se puede decir que la estructura del DNA oscila entre la del la forma B y la de la forma A, descrita inicialmente como carac-
terstica del DNA en medios de menor polaridad que el acuoso. Caso especial es el de la estructura Z, presente slo en regiones muy concre-
tas del genoma, que difiere en la configuracin de algunos enlaces glicosdicos y en el sentido de giro de las cadenas.
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Y es que la Biologa Molecular, emergente an en


aquellos aos, haba nacido con esa mentalidad que
contempla la estructura a la luz de la funcin y vice-
versa. Lo que quiz falt a los predecesores de Watson
y Crick fue tener en cuenta que la estructura que se
postulara para el DNA tena que dar cuenta de su
funcin que, como se ha comentado, implica la repli-
cacin. Efectivamente, poco despus de la publicacin
del artculo que venimos comentando, Watson y Crick,
en la misma revista, Nature, publicaron otro con el cla-
rificador ttulo Genetic implications of the structure
of deoxyribonucleic acid, en el que postulaban que, al
ser las dos cadenas del DNA complementarias en su
secuencia, si se separaban, podra construirse sobre el
molde de cada una de las cadenas antiguas, otra nueva,
por yuxtaposicin de nucletidos complementarios.
De este modo resultaran dos molculas hijas, cada una
con una cadena antigua y otra complementaria recin
construida, que seran idnticas a la molcula parental.
No es necesario aadir ya es de dominio pblico
que el tiempo dio la razn a Watson y Crick.

La estructura del DNA permite, pues, la replicacin


y, con ella, la constancia hereditaria en la divisin
celular. Pero no hay que olvidar que no basta que la
informacin se transmita a las clulas hijas, puesto que

Figura 5. Dos cadenas antiparalelas de polidesoxirribonu-


cletidos pueden interaccionar entre s por puentes de
hidrgeno (no mostrados) entre adenina y timina o entre
guanina y citosina. Advirtase que las dimensiones del par A-T
son iguales a las del par G-C, lo que permite que los esquele-
tos de desoxirribosa-fosfato (en el exterior), presenten una
separacin uniforme.

LA FUNCIONALIDAD DE LA DOBLE
HLICE: UN NUEVO CONCEPTO DE GEN

Se quedara muy corto quien pensara que el artculo


de Watson y Crick slo abordaba una cuestin estruc-
tural. Cerca del final del artculo, los autores decan
textualmente:

It has not escaped our notice that the specific


pairing we have postulated immediately suggests a Figura 6. La doble hlice, con los parmetros propuestos por
possible copying mechanism for the genetic material. Watson y Crick, que corresponden a la estructura B del DNA.
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su funcin es la de expresarse para dar lugar a las pro-


tenas, los productos gnicos y ejecutores de la infor-
macin. Nuevamente la consideracin de la funcin
biolgica permiti a Crick postular que en el flujo de
informacin desde el DNA a las protenas el RNA des-
empeaba un papel intermediario. La organizacin
covalente del RNA es similar a la del DNA, pero en su
estructura se dan algunas importantes diferencias
(figura 4). En primer lugar, la pentosa es ribosa,
aunque el hidroxilo extra en 2 no participa en la con-
catenacin de nucletidos. En segundo lugar, salvo Figura 7. Esquema del metabolismo informativo, que muestra
cmo la informacin gentica fluye del DNA a las protenas a
excepciones, no existe timina en el RNA y esa base travs del RNA. La flecha rosa, de RNA a DNA, corresponde al
est sustituida por el uracilo. Y, finalmente, el rasgo proceso de retrotranscripcin, que constituye una excepcin al
estructural ms sobresaliente es que el RNA es mono- dogma central.
catenario. El hecho de que el uracilo pueda formar
enlaces de hidrgeno especficos con la adenina, generales sigue siendo, por supuesto, vlido. El escla-
sugiere inmediatamente un mecanismo para la trans- recimiento de este flujo de informacin permiti rede-
misin de la informacin desde el DNA al RNA. Crick finir el concepto de gen. Antes de formarse una
postul que la informacin contenida en un gen, poda protena, la informacin contenida en su gen debe
emplearse para determinar la secuencia de un RNA si transcribirse para dar lugar a un RNA mensajero
una de las cadenas del DNA actuaba como molde. El (mRNA), es decir, el producto inmediato de los genes
ensamblamiento de nucletidos ocurrira de modo es un RNA. Ms an, existen algunos tipos de RNA,
parecido al de la replicacin, con dos salvedades: la ya como el ribosomal (rRNA) o el de transferencia
indicada que slo se copia a RNA la informacin de (tRNA), que desempean funciones auxiliares en la
una de las cadenas del DNA y el hecho de que en los traduccin, aunque ellos mismos no se traduzcan.
ribonucletidos a incorporar a la cadena el uracilo ocu- Tambin pueden llamarse genes las unidades informa-
para el lugar de la timina. Este proceso recibi el tivas del DNA que dan lugar a esas molculas de RNA,
nombre grfico de transcripcin. con lo que se echa de ver que la definicin de un gen
como la unidad de informacin que dirige la sntesis de
Los idiomas que emplean un alfabeto distinto del una cadena polipeptdica, se queda corta. Despus de
nuestro presentan una dificultad adicional para com- la elaboracin del dogma central, el aforismo: un
prender un texto escrito. Cuando, por ejemplo, vemos gen, una cadena polipeptdica, pas a ser: un gen, un
la palabra rusa , si no conocemos el alfabeto RNA.
cirlico, ni siquiera sabremos qu letras contiene.
Transcribir esa palabra es volverla a escribir utilizando Los sucesivos avances en la comprensin del meca-
el equivalente latino de cada signo cirlico. As resulta nismo de la transcripcin pusieron de manifiesto que la
el vocablo Spasibo, pero es necesario traducirlo para mayora de los genes eucariticos poseen secuencias
comprender su significado: gracias. Por eso, se internas, denominadas intrones, que, aunque se trans-
propuso el nombre de traduccin para el proceso criben, no se traducen. La transcripcin, en estos
mediante el cual la informacin pasaba del RNA a las numerosos casos, da lugar a una molcula primaria
protenas. Quedaba as completo el esquema del flujo que ha de procesarse para llegar al mRNA maduro. El
de informacin en las clulas (figura 7) que constituye procesamiento implica algunas modificaciones en los
lo que se pas a denominar el dogma central de la extremos del transcrito primario, que hacen posible la
Biologa Molecular. Aunque aos ms tarde se demos- exportacin del mRNA desde el ncleo al citoplasma,
trara que el dogma admite excepciones6, en lneas pero fundamentalmente supone la eliminacin de los

6 Los retrovirus, como el causante del SIDA, contienen RNA como material gentico. Al introducirse en la clula husped, el RNA se copia
para formar DNA, que se integra posteriormente en el genoma de la clula infectada. Este proceso de flujo de informacin de RNA a DNA
se denomina retrotranscripcin.
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Figura 8. Esquema de un gen de un eucariota superior, que muestra la presencia de intrones dentro de la regin codificante y el
procesamiento del transcrito primario de DNA para eliminar dichos intrones y aadir otras secuencias antes de producir el mRNA
maduro.

intrones (figura 8). Y es en este contexto donde surge XIX. Aunque con las imperfecciones propias de la
una complicacin adicional, que obligar, una vez poca, Miescher haba conseguido aislar en 1884 unas
ms, a reconsiderar la definicin de gen. En algunos abundantes protenas nucleares que denomin his-
casos, pueden darse formas alternativas de procesa- tonas. Pasado el tiempo se comprobara que las his-
miento, con lo que de un transcrito primario pueden tonas contienen una elevada proporcin de los
surgir diferentes mensajeros y, por tanto, diferentes aminocidos bsicos lisina y arginina, mientras que su
protenas. Llegados a este punto, se puede ver que, contenido en aminocidos cidos es sumamente bajo.
aunque se haya precisado notablemente el concepto de
gen, resulta realmente difcil expresar ese concepto en En 1950 Edgar y Ellen Stedman formularon una
un aforismo breve. sugerente hiptesis sobre el papel de las histonas.
Puesto que ya se saba, tras los experimentos de Avery,
que el DNA era el portador de la informacin gentica,
CROMOSOMAS los Stedman propusieron que las histonas, protenas
bsicas y, por tanto, capaces de unirse fuertemente al
LAS HISTONAS DNA, seran represores especficos de los genes. La
hiptesis tena el atractivo de que ofreca una expli-
Por aproximaciones sucesivas, se ha revisado hasta cacin para la diferenciacin que se observa en orga-
este momento el concepto de gen. Se ha contemplado nismos pluricelulares. En efecto, aunque todas las
la estructura de la doble hlice, lo que nos ha per- clulas somticas de un organismo poseen el mismo
mitido, en funcin del principio antes aludido, esbozar DNA y, por tanto, los mismos genes el conjunto
su funcin. Tambin se ha comentado que el DNA, el de genes expresados por cada lnea celular es dife-
material con contenido informativo de los cromo- rente. Si las histonas, que pueden interaccionar con
somas, est acompaado en ellos por protenas. Puede gran afinidad con el DNA, se unieran especficamente
ser el momento de preguntarse, qu naturaleza tienen a ciertos genes, stos quedaran reprimidos, mientras
esas protenas?, qu funcin desempean? La res- que los desprovistos de histonas podran expresar su
puesta a la primera pregunta se conoca desde el siglo funcin. Naturalmente, esto implicaba que las his-
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hiptesis de los Stedman. Las histonas pasaron a con-


siderarse como protenas estructurales de la cromatina
pero con una importante precisin: si estaban tan con-
servadas sera porque su papel en la organizacin de la
cromatina era crtico.

De esta manera se inici una apasionante carrera


para descubrir la estructura de la cromatina. El pro-
blema no era fcil. Para hacerse una idea de su comple-
jidad, basta con tener en cuenta que los 6 pg de DNA
de una clula somtica humana tienen una longitud
cercana a 2 m. Estas asombrosas dimensiones son con-
secuencia de los parmetros estructurales de la doble
hlice: un dimetro aproximado de 2 nm y una sepa-
Figura 9. Estructura esquemtica de las histonas internas,
que forman parte de la partcula ncleo. En los cuatro casos, racin entre cada par de bases de unos 0,34 nm a lo
las regiones N-terminales, desestructuradas en disolucin, se largo del eje de la hlice. Era evidente que el DNA
representan como lneas en zigzag y el resto de las molculas tena que enrollarse y superenrollarse para caber
se esquematiza como una elipse. Los nmeros que aparecen
en ella indican la extensin (en residuos de aminocidos) de las dentro de un ncleo, que puede tener un dimetro de
regiones estructuradas en las histonas humanas, aunque no se unos 10 m.
trate estrictamente de regiones globulares (vase el texto).
Los primeros datos vinieron de la mano de la
tonas, al unirse en unas clulas con determinados microscopa electrnica. Al observar cromatina a baja
genes y en otras con otros diferentes, deban ser espe- fuerza inica, se apreciaban unas fibras de un dimetro
cficas de especie y de tejido. aproximado de 10 nm. Al ser un dimetro superior al
de la doble hlice, pareca obvio que el DNA, al inter-
La hiptesis result ser falsa, pero tuvo la virtud de accionar con las histonas, adoptara una organizacin
orientar el inters de los investigadores hacia unas pro- ms compacta. La difraccin de rayos X de cromatina
tenas que, aunque conocidas desde haca ms de en las mismas condiciones en que se observaban las
sesenta aos, haban recibido escasa atencin. De esa fibras de 10 nm indic que exista una organizacin
manera, en poco ms de una dcada se consiguieron helicoidal superpuesta a la del DNA. Un error de inter-
caracterizar las histonas. En todos los eucariotas slo pretacin hizo suponer que la cromatina se organizaba
existen cinco clases de histonas denominadas H1, como una superhlice continua con un paso de rosca
H2A, H2B, H3 y H47. Por otro lado, las histonas cons- de 11 nm y un dimetro de 10 nm. Este modelo, plan-
tituyen un caso llamativo de conservatividad evo- teado en 1968, tuvo una aceptacin general y rpida.
lutiva. La estructura primaria de las histonas H4
aisladas de embrin de guisante y de timo de ternera se El papel de las histonas en el mantenimiento de esta
determin en 1968 y, para asombro de los cientficos, estructura nunca lleg a definirse con precisin. Con
se comprob que ambas poseen 102 aminocidos de todo, tambin haba consenso en una cuestin. Al ana-
los que 100 son idnticos y slo hay variaciones lizar la estructura primaria de las histonas H2A, H2B,
adems conservativas8 en los dos restantes. H3 y H4 se observaba un rasgo comn: mientras que el
Evidentemente, esa conservatividad que ms tarde tercio N-terminal posee una notable abundancia de
se confirmara, en mayor o menor grado, para el resto aminocidos bsicos y una casi total ausencia de ami-
de las histonas implic el definitivo abandono de la nocidos apolares, los dos tercios restantes de las

7 En algunos tipos celulares, como los eritrocitos nucleados de aves, la histona H1 est parcialmente sustituida por la H5, que presenta unas
caractersticas muy similares. Por otro lado, aunque el nmero de clases de histonas sea tan reducido, en casi todas las clases existen diferen-
tes variantes, que difieren muy poco entre s.
8 Variaciones conservativas son aqullas en las que un aminocido est sustituido por otro de similares propiedades qumicas. En el caso pre-
sente las dos variaciones son: lisina por arguinina y valina por isoleucina.
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Figura 10. Representacin esquemtica de un filamento de nucleosomas (inicialmente denominados cuerpos ). En la parte A se
muestra que los nicos sitios accesibles a la nucleasa de micrococo (MNasa) son los espaciadores internucleosomales. Como conse-
cuencia, la digestin de cromatina con esa enzima y la posterior desproteinizacin, da lugar a fragmentos de DNA cuyos tamaos,
aproximadamente, son mltiplos del correspondiente a un mononucleosoma. En la parte B se observa con ms detalle la organizacin
nucleosomal y se describe su estequiometra.

molculas contienen aminocidos polares y apolares globulares. La hiptesis, tambin admitida sin dis-
en la proporcin comnmente encontrada en las pro- cusin, se refleja en la figura 9. Y aunque, como queda
tenas globulares. Pareca evidente que las regiones N- dicho, el papel estructural de las histonas en el mante-
terminales seran incapaces de adquirir estructura nimiento de la superhlice no se definiera claramente,
organizada, mientras que el resto de la molcula podra algo pareca claro: seran las colas N-terminales las
adoptar una estructura terciaria tpica de las protenas regiones prioritarias de unin al DNA, mientras que
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los dominios globulares podran originar interacciones ellas se lleg a conocer su composicin y a tener una
histona-histona, que afianzaran la organizacin de la idea global de su estructura. Hubo tambin un cambio
cromatina. de denominacin y se acu el trmino nucleosoma,
que se ha conservado hasta nuestros das, para
designar a esas partculas bsicas en la organizacin de
EL DESCUBRIMIENTO DEL la cromatina. Un nucleosoma consta de una partcula
NUCLEOSOMA ncleo y un DNA espaciador que, ms o menos, coin-
cidiran, respectivamente, con las cuentas del collar y
As las cosas, en 1973 ocurre un hecho trascen- el hilo que las separa. Mientras que el DNA espaciador
dental. Donald y Ada Olins volvieron a observar fibras es de longitud variable, la partcula ncleo tiene una
de cromatina a baja fuerza inica empleando procedi- absoluta constancia en todas las especies. Consta de un
mientos experimentales que minimizaban la alteracin octmero formado por dos copias de cada una de las
de la muestra. En esas condiciones detectaron la pre- histonas H2A, H2B, H3 y H4 y 147 pares de bases de
sencia de unas partculas globulares de unos 10 nm de DNA (figura 10). El DNA se enrolla alrededor del
dimetro, separadas por un material filamentoso ms octmero, formando casi dos vueltas de superhlice a
fino. Era algo as como un collar de cuentas, y de ese izquierdas. Este era el motivo superhelicoidal
modo grfico lo designaron al presentar sus resultados detectado en los primitivos experimentos de difraccin
en un congreso de Biologa Celular, que tuvo lugar en de rayos X, cuyo error consisti en pensar que el espa-
Miami en 1973. Con un juego de palabras slo com- ciado de 11 nm era el paso de rosca de la superhlice,
prensible en el original ingls, denominaron a las cuando en realidad corresponde al dimetro de la par-
cuentas del collar cuerpos , porque eran nuevos en tcula ncleo, ya que el paso de rosca medio del DNA
el campo de las nucleohistonas9. Los resultados, en su a su alrededor es de slo 2,8 nm.
forma definitiva, se publicaron en 197410. Ese mismo
ao, otros dos investigadores, Hewish y Burgoyne, El grupo de Aaron Klug en Cambridge, heredero de
fragmentaron cromatina de hgado de rata por la tradicin estructuralista del famoso laboratorio
digestin con una nucleasa endgena. Al separar por Cavendish que determin los parmetros de la doble
electroforesis el DNA obtenido de los fragmentos apa- hlice, consigui pronto cristalizar partculas ncleo.
recan unas molculas discretas, cuyos tamaos eran Pero no pudieron estudiar su estructura con resolucin
mltiplos del de la ms pequea. Los resultados cua- aceptable porque los cristales eran inestables y se des-
draban perfectamente con los de la observacin truan al someterlos a radiacin X. Se lleg as a 1991
microscpica. Si la cromatina estaba constituida por sin conseguir bajar la resolucin de 7 . Mientras que
una serie regular de cuentas, los cuerpos en los que este nivel de resolucin permita determinar las dimen-
se encontraran presentes las histonas, separadas por el siones de la partcula ncleo y trazar algunos detalles
hilo del collar, el DNA desnudo, slo ste sera acce- de la organizacin del DNA y de las histonas, era abso-
sible a las nucleasas. Dependiendo del sitio de corte, se lutamente insuficiente para decidir la estructura ter-
obtendran fragmentos de cromatina formados por un ciaria exacta de las histonas y, menos an, para
nmero entero de cuerpos (figura 10). localizar en el espacio todos sus aminocidos. Con
todo, fue decisivo para que Klug recibiera el premio
A pesar de la resistencia inicial11, la aplastante evi- Nobel de Qumica en 1982.
dencia experimental acab por convencer a los ms
escpticos y se produjo de esa manera la primera gran Pero en 1991 se inicia una nueva revolucin en el
revolucin en el estudio de la estructura de la cro- estudio de la estructura de la cromatina. Unos aos
matina. Los cuerpos fueron objeto de numerossimas antes, el grupo de Moudrianakis haba conseguido
investigaciones en los aos subsiguientes. Gracias a aislar y cristalizar octmeros de histonas a partir de

9 La pronunciacin en ingls del nombre de la letra griega coincide con la de la palabra new y con la de la primera slaba de la palabra
nucleohistone.
10 Olins, A. L. y Olins, D. E. (1974) Science 183, 330-332.
11 La historia del descubrimiento de los cuerpos est excelentemente recogida en el libro de van Holde que se cita en la bibliografa.
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modelo entonces vigente para la estructura de las his-


tonas (figura 9), los dominios C-terminales de las his-
tonas no eran, estrictamente hablando, globulares. Se
organizaban con un motivo estructural, desconocido
hasta entonces y que se comenz a denominar histone
fold (figura 12). Lo esencial de este motivo es la pre-
sencia de una hlice larga flanqueada por dos cortas,
que estn separadas la central por dos lazos que con-
tienen algunos residuos en estructura . Pero una
histona aislada no es capaz de adoptar el histone fold.
Se requiere siempre, como ocurre en el octmero, la
presencia de otra histona complementaria: H2A se
puede complementar con H2B y H3 con H4. Surge
entonces la organizacin del tetrmero (H3-H4)2 o de
los dmeros H2A-H2B por interdigitacin de los
Figura 11. A: estructura de un octmero de histonas. El color correspondientes histone folds, formando un motivo
de los tomos de las histonas internas sigue el mismo cdigo que Moudrianakis, de una manera sumamente grfica,
que en la figura 9. En el tetrmero central (H3-H4)2, las cade-
nas laterales de lisina y arginina, cuyos extremos poseen carga denomin apretn de manos (figura 12). Los amino-
positiva a pH fisiolgico, se han dibujado en rojo. La figura cidos en estructura son esenciales para la interaccin
est construida a partir de los datos de Arents et al. (1991). B: por puentes de hidrgeno entre las dos histonas de
estructura de una partcula ncleo, dibujada a partir de los
datos de Luger et al. (1997). Se observa que la organizacin cada par.
del octmero de histonas es similar cuando est aislado y
cuando est incorporado a la partcula ncleo y que los Por otro lado, aunque el DNA no estuviera presente
aminocidos bsicos, especialmente en el tetrmero central,
marcan la trayectoria del DNA. En las dos partes de la figura la en la muestra objeto de la investigacin no olvi-
orientacin es la misma, con el eje pseudobinario de simetra demos que se estaba llevando a cabo con octmeros
perpendicular al plano del papel y en el centro de las partcu- aislados, no era difcil vislumbrar su posible trayec-
las. El eje de la superhlice de DNA est en el plano del papel,
de izquierda a derecha. La figura est construida con el pro-
grama RasMol.

partculas ncleo. Estos cristales s eran suficiente-


mente estables y se pudo determinar su estructura con
una resolucin de 3,1 . Evidentemente, al hacer del
octmero el objeto del estudio, la observacin directa
quedaba restringida a las histonas y, adems, no a la
totalidad de sus molculas. Las colas N-terminales
son, como se haba supuesto correctamente, dema-
siado flexibles como para que adopten una estructura
organizada y esto implica que esas regiones no ocupen
posiciones invariables en los cristales, o lo que es lo
mismo, que la difraccin de rayos X no aporte ninguna
informacin sobre ellas.

Pero, a pesar de esta limitacin, la informacin Figura 12. Estructura de las histonas internas en el octmero,
obtenida por el grupo de Moudrianakis fue extraordi- segn los datos de Arents et al. (1991). Para mayor claridad,
slo se ha representado la mitad de un octmero, en la que
nariamente valiosa. En primer lugar, se observ que el aparece una copia de cada una de las histonas internas, con el
octmero presenta una organizacin tripartita, en la mismo cdigo de colores que en la figura 9. Se observa el his-
que un tetrmero (H3-H4)2 ocupa una posicin central, tone fold y el motivo del apretn de manos (vase el texto).
La figura est construida con el programa RasMol a partir de
flanqueado por dos dmeros H2A-H2B (figura 11A). los datos de Arents et al. (1991). La lnea horizontal de puntos
Ms llamativa fue la observacin de que, en contra del indica el recorrido del eje pseudobinario de simetra.
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cretos por donde van a pasar los fosfatos del DNA


cuando ste se ensamble sobre las histonas.

En 1997, el grupo de Richmond, un autor que haba


trabajado previamente en el equipo de Klug, consigui
el xito que tanto haba tardado en llegar: describir la
estructura de la partcula ncleo por difraccin de
rayos X con una resolucin a nivel atmico. Para
lograr ese xito tuvieron que concurrir varios factores
determinantes. En primer lugar, no emplearon nucleo-
somas naturales, sino reconstituidos in vitro. Hay que
advertir que, como se saba desde tiempo atrs, el
proceso de reconstitucin mantiene fielmente la
estructura del nucleosoma. Hoy conocemos la causa:
Figura 13. Estructura de la partcula ncleo. Se muestra slo la precisa organizacin del octmero descubierta por
el esqueleto de las histonas internas, para poner de manifiesto
que se conservan los motivos estructurales presentes en el Moudrianakis hace que las histonas, tras mezclarlas en
octmero aislado (figura 12). El DNA se representa en color las condiciones adecuadas, adopten espontneamente
rosa. La orientacin es tal que el eje de su superhlice est cen- la estructura correcta y que al aadir el DNA ste se
trado y es perpendicular al plano del papel. El eje pseudobina-
rio de simetra est contenido en el plano, de abajo hacia arri- limite a recorrer la trayectoria que aqullas le marcan.
ba. La figura est construida con el programa RasMol a partir En los experimentos de Richmond, las histonas
de los datos de Luger et al. (1997). empleadas en la reconstitucin eran histonas recombi-
nantes, producidas por tcnicas de Biologa Molecular
toria alrededor de las histonas. En la figura 11A se en una bacteria. De esta manera, se evitaba la pequea,
puede observar una especie de rampa helicoidal que pero importante, heterogeneidad que presentan las his-
recorre la superficie del octmero, con unas dimen- tonas en los nucleosomas naturales, en virtud de sus
siones ms o menos concordantes con las predichas modificaciones post-traduccionales (vase ms ade-
por las observaciones de la partcula ncleo a baja lante) y de la limitada variabilidad de las histonas per-
resolucin. Ms an, la disposicin de aminocidos tenecientes a una misma clase. Por otro lado, el DNA
bsicos en esas rampas parece seguir la impronta de era tambin artificial, de secuencia nica, precisa-
los fosfatos de las dos cadenas de una doble hlice y mente de una que se adapta especialmente bien a la
Moudrianakis se atrevi a predecir su recorrido. formacin de la superhlice que el nucleosoma exige.
Finalmente, desde un punto de vista instrumental, el
La figura 11 posee una gran belleza intrnseca, no grupo de Richmond no utiliz radiacin X de una
slo por razones de ndole esttica, sino porque fuente convencional, sino la procedente de un sin-
muestra una sorprendente y maravillosa organizacin. crotrn. La mayor energa de los rayos X asociados al
La conservatividad de las histonas est en funcin de sincrotrn permiti obtener los datos suficientes para
su papel estructural, que no es otro que el de servir de llegar a una resolucin a 2.7 .
base a la estructura del nucleosoma. Pero, para ello, se
requiere que los residuos que forman el histone fold, El examen de las imgenes conseguidas permite
sin necesidad de ser idnticos, exhiban propiedades obtener conclusiones importantes: la primera, es que la
que permitan la adquisicin de ese apretn de manos al organizacin de las histonas descrita para el octmero
que antes se aluda. Y, por otro lado, se precisa que los aislado, sigue siendo vlida en la partcula ncleo
residuos bsicos queden dispuestos por supuesto en (figura 13). En segundo lugar, el recorrido del DNA
la superficie del octmero en virtud del efecto hidro- queda perfectamente esclarecido. Como se sospechaba
fbico12 no en cualquier lugar, sino en los sitios con- desde los resultados obtenidos a resoluciones ms

12 Debido a que la mayor parte de las protenas celulares se encuentran en un entorno acuoso, los aminocidos con cadena lateral apolar tien-
den a situarse en la regin interna de las protenas globulares, mientras que los polares quedan en la superficie interaccionando con el agua.
Este principio de organizacin, gobernado por razones de tipo entrpico, recibe el nombre de efecto hidrofbico.
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en el estudio de la disposicin de estas colas, sigue


habiendo numerosos interrogantes sobre su dispo-
sicin estructural en la cromatina. Tambin siguen
existiendo interrogantes sobre la localizacin exacta
de la histona H1, que interacciona con 20 pares de
bases del DNA espaciador, aunque se han planteado
algunas posibilidades en los ltimos aos.

DEL FILAMENTO DE NUCLEOSOMAS AL


Figura 14. Estructura de la partcula ncleo en la que se mues- CROMOSOMA
tran todas las posiciones atmicas determinadas por Luger et
al. (1997). La parte A de la figura es equivalente a la figura 13 Con las incertidumbres que se acaban de men-
en orientacin y permite la observacin de la cara plana del
nucleosoma. En la parte B los ejes de la superhlice (z) y cionar, se puede decir que el nivel primario13 de orga-
pseudobinario (y) estn en el plano del papel. Las figuras per- nizacin de la cromatina, el filamento de nucleosomas,
miten observar cmo las colas N-terminales de las histonas se conoce con bastante precisin. Pero es evidente que
salen de la partcula ncleo por los huecos que dejan los sur-
cos del DNA (representado en blanco). la cromatina ha de adoptar una conformacin mucho
ms compacta si tiene que empaquetarse en un ncleo.
La investigacin de los niveles superiores de organi-
bajas, la superhlice no es regular. Finalmente, los zacin de la cromatina se inici casi en paralelo al
nuevos resultados aportaron datos valiosos para estudio de la estructura nucleosomal, pero es forzoso
aclarar algunas cuestiones referentes a las histonas, reconocer que los avances ha sido mucho menos satis-
que por el anlisis del octmero haban quedado sin factorios. Los primeros datos se obtuvieron tambin
respuesta. La presencia del DNA permite que queden por observaciones al microscopio electrnico. Si a baja
ms residuos de las histonas en posiciones fijas y, por fuerza inica la cromatina adopta el aspecto de un
tanto, que se pueda dilucidar la localizacin de ms del collar de cuentas, cuando la concentracin salina
80% de los tomos de las histonas. La cuestin es sin- supera un cierto nivel (del orden de 80 mM) se pueden
gularmente importante en el caso de las colas N-termi- apreciar fibras de unos 30 nm de dimetro. El primer
nales. Aunque slo se puedan observar parcialmente, modelo para explicar la estructura de esa fibra data de
se puede ver, en algunos casos, que salen del octmero 1977 y es el denominado solenoide, segn el cual los
a travs de los surcos del DNA, pero no estn interac- nucleosomas se dispondran de forma que los ejes de
cionando con ste, sino que se proyectan hacia fuera su superhlice adoptaran, a su vez, una trayectoria
(figura 14). Por otro lado, las colas de H4 interac- helicoidal. Los nucleosomas, entre 6 y 8 por vuelta de
cionan electrostticamente con la superficie de la par- solenoide, quedaran con sus caras planas ms o menos
tcula ncleo vecina en el cristal. Al posible paralelas al eje de la fibra. Pero como ha advertido
significado de esta observacin se har referencia ms recientemente Daban, la compactacin que se lograra
tarde. de esa manera es insuficiente para justificar la que
debe tener lugar en el interior del ncleo. En efecto, la
Tanto los resultados del grupo de Moudrianakis concentracin de DNA en un ncleo eucaritico oscila
como los de Richmond ponen de manifiesto que, para entre 0,12 y 0,20 g/ml y la que se puede lograr con los
la organizacin del nucleosoma, no son esenciales las modelos clsicos para la fibra de 30 nm vara entre
colas N-terminales de las histonas, ya que sus lugares 0,04 y 0,19 g/ml, insuficiente para explicar la compac-
de interaccin con el DNA se localizan en los tacin real del DNA. Por ese motivo, este autor ha pro-
dominios estructurados de los dos tercios C-termi- puesto un nuevo modelo, el solenoide interdigitado,
nales. Aunque mediante otras tcnicas se ha avanzado que permite una organizacin ms compacta. En este

13 Por analoga con los niveles estructurales de las protenas, se ha propuesto recientemente designar a la organizacin de los nucleosomas a
lo largo del DNA como nivel estructural primario de la cromatina. El nivel secundario estara constituido por la fibra de 30 nm y el nivel ter-
ciario por las fibras ms gruesas que se observan en los ncleos.
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modelo, el contacto entre nucleosomas tambin se En la figura 8 se indica que antes de la regin trans-
produce a travs de sus caras planas. Es a este nivel crita de un gen se encuentra el promotor. En l se
donde la observacin de que las colas de H4 pueden ensambla la RNA polimerasa II junto con otras nume-
interaccionar con las superficies de los nucleosomas rosas protenas que forman el denominado complejo
cobra especial inters. Si esa interaccin se da real- de preiniciacin, como paso previo a la transcripcin.
mente en la fibra de 30 nm, la adquisicin de esta Pero el promotor contiene tambin numerosas
estructura y, por tanto, la compactacin de la cro- secuencias que resultan esenciales para la regulacin
matina exigira que los extremos N-terminales de de la transcripcin. Y es que la transcripcin no ocurre
H4 mantuvieran inalterada su carga positiva, situacin de una forma indiscriminada, sino que para la
que, como se ver ms adelante, puede perderse en expresin de cada gen existen un aqu y un ahora pre-
determinadas circunstancias. Finalmente, hay que cisos. Con estas palabras se quiere indicar que existe
tener en cuenta que la fibra de 30 nm an debe com- un doble nivel de regulacin en la transcripcin euca-
pactarse ms, pero lo que se conoce de esos niveles ritica, especialmente en los organismos pluricelu-
superiores apenas sobrepasa el nivel de las conjeturas. lares. Por un lado, cada lnea celular tiene una
caracterstica batera de genes que se expresan y otros
muchos genes que permanecen silenciados durante
FUNCIONALIDAD DE LOS GENES toda la vida del organismo. Como se ha comentado
anteriormente, esta expresin gnica diferencial en
Hasta aqu, la descripcin de la estructura de la cro- cada lnea celular, el aqu que se acaba de mencionar,
matina. El panorama puede parecer un tanto esttico; hace posible la diferenciacin celular. Pero, adems,
acaso hemos olvidado ese principio, varias veces dentro de la serie de genes que se pueden expresar en
repetido, de que la estructura ha de contemplarse en una clula dada, cada uno tiene un momento, un ahora,
relacin con la funcin? No; lo que ocurre es que, his- en el que su producto es necesario.
tricamente se procedi ms o menos del modo aqu
relatado y hubo momentos en que, en cierto modo, se Comentar, aunque slo fuera en lneas generales,
oscureci ese principio clarificador. Un principio que, los intrincados mecanismos de regulacin transcrip-
como se ha visto, facilit a Watson y a Crick el estable- cional excedera en mucho los lmites tolerables para
cimiento de la estructura de la doble hlice y que, esta exposicin. Para seguir su hilo argumental basta
cuando se soslaya, aunque slo sea metodolgica- con mencionar que los precisos circuitos de regulacin
mente, obliga a que la investigacin d innecesarios exigen la presencia de numerosas protenas factores
rodeos. Y la cromatina no es simplemente una transcripcionales se suelen denominar genrica-
estructura, sino una estructura que debe permitir la mente que, o bien reconocen esas secuencias espec-
actividad nuclear: replicacin, transcripcin, repa- ficas del promotor, o bien interaccionan con otros
racin del DNA, recombinacin, etc. factores o con la propia maquinaria basal de trans-
Por limitarse a uno de esos procesos, que es por cripcin: la RNA polimerasa y otras protenas aso-
otro lado el que ms est clarificando las relaciones ciadas. Dentro de todos esos factores existen
estructura-funcin en la cromatina, vale la pena cen- activadores, represores, coactivadores, correpresores,
trarse en la transcripcin. En eucariotas existen tres adaptadores..., cuyo mismo nombre da idea bastante
tipos de RNA polimerasas, las enzimas que catalizan la precisa de su funcin.
sntesis de RNA ensamblando ribonucletidos sobre la
cadena molde. De ellas, la RNA polimerasa II se Si se considera la enorme diversidad de factores
encarga de transcribir los genes estructurales, es decir, requeridos para la transcripcin y la amplia distri-
aquellos que codifican protenas y, por tanto, esta poli- bucin de sus secuencias diana en el promotor y an en
merasa se encarga de formar el mRNA, mientras que otras regiones distales del DNA (figura 15) parece evi-
las polimerasas I y III se ocupan de la sntesis de rRNA dente que la organizacin de las histonas en nucleo-
y tRNA. La transcripcin catalizada por la RNA poli- somas y en estructuras de orden superior supone una
merasa II es, sin duda, la que ms atencin ha recibido seria dificultad para el ensamblamiento de todos esos
y a ella se circunscriben los comentarios finales de este complejos. Efectivamente, hasta hace unos 10 aos, de
artculo. esa manera se solan considerar las histonas: simple-
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Figura 15. Representacin esquemtica de la interrelacin de diversos factores en la transcripcin regulada en eucariotas.

mente como un obstculo para las funciones nucleares,


como la transcripcin. Aproximadamente desde 1992
comenz a imponerse otra forma de enfocar la
cuestin. No es que la organizacin de la cromatina ya
no se considere un obstculo, sino que el papel de las
histonas se contempla de una forma mucho ms
dinmica. Que la cromatina obstaculiza la trascripcin
resulta evidente, por ejemplo, al observar la figura 16.
En ella se representa la interaccin de la RNA poli-
merasa II de levadura, cuya estructura tridimensional
se ha resuelto en 2001, con el DNA en el complejo de
preiniciacin. Se puede ver cmo el DNA se introduce
por una especie de tnel formado por varias de las
cadenas polipeptdicas de la enzima. Pero el tnel tiene
las dimensiones justas para que quepa la doble hlice;
si en ese lugar existiera un nucleosoma, habida cuenta
de sus dimensiones, la unin de la RNA polimerasa
sera imposible. Entre otras razones, sta es la causa de
un hecho constatado ya en 1987: en un nucleosoma no
se puede iniciar la transcripcin.
Figura 16. Tamaos relativos de un nucleosoma y de la RNA
polimerasa. Como ejemplo de sta ltima, se ha tomado la
RNA polimerasa II de levadura. Se representa slo la estructura
LAS HISTONAS: MUCHO MS QUE global de la molcula, sin detallar la posicin de sus sub-
unidades, y el inicio del dominio C-terminal (CTD). El contorno
PROTENAS ESTRUCTURALES del nucleosoma se representa en una orientacin como la de
la figura 14 B. Los crculos de trazos sealados como DNA indi-
can las dimensiones de una seccin transversal de la doble
ste es el momento de presentar el papel dinmico hlice. En el nucleosoma, est dibujado por la trayectoria de
de las histonas. Como se ha visto al considerar la una de las vueltas de superhlice; en la polimerasa indica la
estructura del nucleosoma, las colas N-terminales de posicin en que quedara el DNA en el complejo de preini-
ciacin. Se observa claramente que es imposible formar este
las histonas se proyectan hacia fuera. Esas colas son el complejo cuando hay un nucleosoma sobre la caja TATA (vase
lugar de numerosas reacciones de modificacin cova- la figura 15).
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lente: acetilacin, fosforilacin y metilacin. La aceti- nmero de residuos modificables, el nmero de combi-
lacin puede afectar a 26 residuos de lisina por nucle- naciones es virtualmente ilimitado y es evidente que
osoma y tiene unas consecuencias qumicas no todas ellas son significativas funcionalmente. Pero
importantes: se pierde la carga positiva que posee la se van obteniendo datos que indican claramente el
cadena lateral del aminocido. La fosforilacin y la mensaje que encierran algunos de estos cdigos. Por
metilacin son ms limitadas en cuanto al nmero de ejemplo, la fosforilacin del residuo 10 de serina de la
aminocidos potencialmente modificables. histona H3, seguida de la acetilacin de las lisinas 9 y
14 constituye una seal para la transcripcin. Por el
De esas modificaciones, la acetilacin es la mejor contrario, cuando la fosforilacin de la serina 10 va
estudiada. Especialmente, los ltimos 7 aos han sido seguida de una nueva fosforilacin en la serina 28, se
testigos de increbles avances, como consecuencia de interpreta esa modificacin como una seal para la
la clonacin de los genes que codifican los dos tipos de condensacin mittica, en la que la cromatina per-
enzimas implicadas en el proceso: las histona acetil- manece totalmente inactiva.
transferasas (HAT) y las histona desacetilasas
(HDAC). Las primeras catalizan la entrada de grupos Pero an se plantean dos problemas. Por un lado
acetilo en las histonas a partir de acetil-coenzimaA, el hay que saber cmo se lee el cdigo de las modifica-
donador universal de acetato. Las segundas catalizan ciones de las histonas. Por otra parte, es preciso deter-
la eliminacin hidroltica del resto acetilo, lo que minar de qu manera se dirige la precisa combinacin
permite que la acetilacin de histonas sea un proceso de modificaciones al lugar adecuado. En el caso de que
reversible. Las consecuencias de esta modificacin son el cdigo signifique transcripcin, estos dos pro-
de dos tipos. Por un lado, se admite actualmente que la blemas se concretan en las preguntas siguientes:
reduccin de carga positiva inherente a la acetilacin,
altera las interacciones de las colas de algunas histonas Teniendo en cuenta que una determinada
de un nucleosoma no con el DNA, como se pens al sealizacin sobre una histona depende de las
principio, sino con el nucleosoma vecino. As, la aceti- actividades relativas de las enzimas capaces de
lacin de esas histonas impide la adquisicin de estruc- introducir o eliminar la correspondiente modifi-
turas de orden superior. Una funcin de la acetilacin cacin, cmo se reclutan las enzimas ade-
de histonas es, pues, controlar la compactacin de la cuadas sobre el gen diana en el momento
cromatina. En realidad, se vena sospechando ese correcto?
papel desde el descubrimiento de la acetilacin de his- Qu factores proteicos reconocen el
tonas en 1964, pero ha sido ahora cuando se han com- cdigo? Cmo actan para que los nucleo-
prendido las causas moleculares de ese proceso. somas que existen sobre el gen dejen de impedir
el ensamblamiento del complejo de preini-
Pero hay un segundo modo de accin de la aceti- ciacin y el posterior avance de la RNA poli-
lacin de histonas. La introduccin de grupos acetilo merasa?
en determinados residuos de lisina constituye una
seal que permite o impide la interaccin de determi- Honradamente, hay que advertir que, aunque se han
nados factores con las histonas a travs de sus colas N- dado pasos de gigante para resolver estos problemas en
terminales, accesibles en los nucleosomas. Esta los ltimos 10 aos, son an muy numerosos los inte-
posibilidad haba sido propuesta en 1988 por Peter rrogantes planteados. Por slo citar un ejemplo, se
Loidl, el primero que habl del posible papel seali- puede mencionar el caso de la activacin del gen
zador de la acetilacin de histonas. Recientemente, la MAT2A en hepatocitos de rata. Este gen codifica la
hiptesis de Loidl ha sido ampliada por Strahl y Allis subunidad cataltica de una de las isoenzimas de la
para incluir las otras modificaciones comentadas: fos- metionina adenosiltransferasa. La enzima es clave en
forilacin y metilacin. Segn esa idea, cada combi- el metabolismo de la metionina y, teniendo en cuenta
nacin de acetilaciones, metilaciones y fosforilaciones que el producto de la reaccin que cataliza, la S-adeno-
en los diversos residuos de una histona, constituye un silmetionina es el donador universal de grupos metilo,
cdigo, que significa una precisa funcin de la cro- la reaccin resulta clave en el contexto de las metila-
matina en esa regin. Evidentemente, dado el elevado ciones biolgicas.
Luis Franco Vera Rev.R.Acad.Cienc.Exact.Fs.Nat. (Esp), 2003; 97 221

Adems del gen mencionado, tambin codifica una la acetilacin de histonas ni la transcripcin se dan
subunidad cataltica de la metionina adenosiltrans- cuando se inhibe la actividad de protena quinasa del
ferasa el gen MAT1A. Ambos productos gnicos son receptor de HGF o cuando se inhiben algunas otras
homlogos, pero dan lugar a isoenzimas con distintas quinasas de la cascada. Por otro lado, en presencia de
propiedades cinticas. MAT1A se expresa en hgado, y metil-tioadenosina un producto secundario del
las propiedades de las isoenzimas resultantes se metabolismo de S-adenosilmetionina, que acta como
adaptan perfectamente a las necesidades metablicas inhibidor de la metilacin de protenas no se
de este rgano. Por el contrario, MAT2A se expresa en produce la transcripcin de MAT2A estimulada por
tejidos extrahepticos, pero tambin en el hgado HGF, pero sigue teniendo lugar la acetilacin de his-
cuando ste se encuentra en rpido crecimiento, como tonas. En su conjunto, estos resultados recientes
ocurre en el hgado fetal, en el hgado en regeneracin muestran que el reclutamiento de histona acetiltransfe-
despus de una hepatectoma parcial, o en un hepato- rasas sobre el promotor de MAT2A, requisito previo a
carcinoma. la expresin del gen, est regulado por una ruta de
transduccin de seales, concretamente por una
As pues, en un cultivo primario de hepatocitos14 el cascada de fosforilacin. Adems, ponen de manifiesto
gen MAT1A se expresa pero MAT2A, no. De acuerdo que la acetilacin de histonas es necesaria, pero no
con las ideas expuestas antes, las histonas de los nucle- suficiente para la transcripcin. Dicho de otra manera,
osomas del promotor de este ltimo gen se encuentran los resultados que se acaban de mencionar los pri-
hipoacetiladas. La situacin es paralela a la que ocurre meros que muestran la relacin de la acetilacin de
en el hgado intacto. Pues bien, es posible inducir la histonas con una cascada de fosforilacin responden
divisin celular en el cultivo primario aadiendo al parcialmente a la primera de las preguntas planteadas
medio el factor de crecimiento heptico (HGF, del ms arriba.
ingls hepatic growth factor). HGF es una protena que
no penetra en la clula, pero que interacciona con un En cuanto a la segunda cuestin, hace 10 aos que
receptor de su membrana e inicia una ruta de seali- se detect la existencia de los denominados complejos
zacin intracelular que da lugar, entre otras cosas, al de remodelacin de la cromatina. Estos complejos,
inicio de la divisin celular. Los mecanismos generales presentes en todos los eucariotas, estn formados por
por los que opera esa transduccin de seales se han la unin de un nmero variable de protenas y son
descrito ya en otro volumen de este Programa de capaces de alterar la estructura de la cromatina utili-
Promocin de la Cultura Cientfica. Baste ahora zando la energa procedente de la hidrlisis del ATP.
recordar que implican cascadas de fosforilacin en las Esa alteracin puede ser simplemente un desliza-
que una protena quinasa una enzima que puede miento de los nucleosomas, que deja as libre el DNA
catalizar la fosforilacin de una protena a expensas sobre el que ha de ensamblarse el complejo de preini-
del ATP pasa a su estado activo al ser fosforilada por ciacin. En otros casos, la remodelacin puede
otra quinasa y, de ese modo se hace capaz de fosforilar implicar un cambio de la estructura nucleosomal que
a la siguiente enzima de la cascada. permita la interaccin del DNA con factores proteicos.
En cualquier caso, la estabilidad del nucleosoma, tanto
En el caso presente, el receptor de HGF adquiere en lo que se refiere a las interacciones histona-DNA
actividad de protena quinasa al interaccionar con su como histona-histona, implica que el proceso de remo-
ligando. La transduccin de esa seal a travs de una delacin consuma energa.
cascada de fosforilacin, llega hasta el ncleo y se
activa la expresin de MAT2A. De hecho, a los 90 min Finalmente, queda latente la pregunta que se ha
de adicin de HGF ya se observa la presencia del apuntado a lo largo de las lneas precedentes: cmo se
mRNA de MAT2A. Pero antes, ya a los 30 min, se lee el cdigo que las modificaciones covalentes intro-
puede detectar un incremento en la acetilacin de las ducen en las histonas? Aunque una respuesta completa
histonas en los nucleosomas del promotor del gen. Ni requerir an ms esfuerzo por parte de los investiga-

14 Es posible aislar hepatocitos a partir de hgado de rata. Estas clulas, pueden mantenerse vivas en cultivo durante ms de 24 h, pero no
tienen capacidad de reproducirse. Un cultivo con estas caractersticas recibe el nombre de cultivo primario.
222 Luis Franco Vera Rev.R.Acad.Cienc.Exact.Fs.Nat. (Esp), 2003; 97

dores, se sabe que hay diferentes dominios en los fac- nucleosomal core histone octamer at 3.1 resolu-
tores proteicos capaces de reconocer los distintos tion: a tripartite protein assembly and a left-handed
motivos, acetil-lisina, grupos metilo, etc., que se intro- superhelix Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 88, 10148-
ducen en las histonas. La presencia de esos dominios 10152.
en enzimas de modificacin, componentes de los com- 2. DABAN, J. R. (2000) Physical constraints in the con-
plejos de remodelacin, etc. hace posible que las dife- densation of eukaryotic chromosomes. Local con-
centration of DNA versus linear packing ratio in hig-
rentes modificaciones de las histonas y, en su caso, la
her order chromatin structures Biochemistry 39,
remodelacin de la cromatina, procedan de un modo
3861-3866.
secuencial.
3. DABAN, J. R. Y BERMDEZ, A. (1998) Interdigitated
solenoid model for compact chromatin fibers
Biochemistry 37, 4299-4304.
CONSIDERACIN FINAL 4. LUGER, K., MDER, A. W., RICHMOND, R. K.,
SARGENT, D. F. Y RICHMOND, T. J. (1997) Crystal
Desde el descubrimiento del gen hasta nuestros structure of the nucleosome core particle at 2.8
das han transcurrido casi 140 aos. Los hallazgos resolution Nature 389, 251-260.
sobre su naturaleza, organizacin y funcionamiento 5. MUNICIO A. M (2000) Medicamentos viejos para
han aumentado de forma exponencial hasta constituir, enfermedades nuevas, en Horizontes Culturales
en los ltimos aos, uno de los temas favoritos de la (Real Academia de Ciencias), pp. 53-79. Espasa,
investigacin en Biologa Molecular. Algunos de esos Madrid.
avances se han resumido en las lneas precedentes que, 6. STRAHL, B. D. Y ALLIS, C. D. (2000) The language
inevitablemente, constituyen una exposicin excesiva- of covalent histone modification Nature 403, 41-45.
mente resumida de los logros obtenidos. Pero, como 7. VAN HOLDE, K. E. (1989) Chromatin. Springer-
ocurre siempre en la investigacin cientfica, si los Verlag, New York.
logros han crecido de modo exponencial, tambin lo 8. WATSON, J. D. Y CRICK, F. H. C. (1953) Nature 171,
han hecho los nuevos interrogantes que han planteado. 737-738.
Lejos de resultar frustrante, esta situacin constituye
9. WATSON, J. D. Y CRICK, F. H. C. (1953) Genetic
un acicate para los investigadores: la contemplacin de implications of the structure of deoxyribonucleic
un amplio panorama abierto frente a nosotros siempre acid Nature 171, 964-967.
es un ilusionante motivo para seguir adelante.
10. WOODCOCK, C. L. Y DIMITROV, S. (2001) Higher
order structure of chromatin and chromosomes
Curr. Opin. Genet. Develop. 11, 130-135.
BIBLIOGRAFA 11. ZHANG, Y Y REINBERG, D. (2001) Transcription
regulation by histone methylation: interplay between
1. ARENTS, G., BURLINGAME, R. W., WANG, B. C., different covalent modifications of the core histone
LOVE, W. E., Y MOUDRIANAKIS, E. N. (1991) The tails Genes & Develop. 15, 2343-2360.

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