Cycle prparatoire Biologie-Gologie: BG1 GENETIQUE Cours 2
Prsent par Salwa ZEHDI
et Hajer ENNAFAA
CHAPITRE II ORGANISATION DES GENOMES EUCARYOTES ET PROCARYOTES (SUITE)
S. ZEHDI & H. ENNAFAA
II-3 PROPRIETES PHYSICO-CHIMIQUES DE LADN
II-3-1 Charge lectrique Les acides nucliques sont des polyanions. Une charge lectrique ngaEve est associe c h a q u e g r o u p e m e n t p h o s p h a t e d u polynucloTde. Soumis un champ lectrique, les acides nucliques sont aVrs par lanode (ple posiTf- lectrophorse).
S. ZEHDI & H. ENNAFAA II-3-2 AbsorpEon de la lumire UV Les htrocycles des bases absorbent les ultraviolets et prsentent un maximum dabsorpEon 260nm. Il est ainsi possible de quanTer la concentraTon en bases, donc la concentraTon en acides nucliques dune soluTon en mesurant sa DO 260nm ( laide dun spectrophotomtre).
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III-3-3 DnaturaEon, renaturaEon et hybridaEon molculaire - Eet de la temprature : Dans la double hlice, A est appari T par 2 liaisons hydrogne (A = T) et G C par 3 liaisons (G C). Aux tempratures biologiques, ces liaisons, bien que trs labiles, assurent une grande stabilit la double hlice.
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Une lvaEon de la temprature provoque la sparaEon des deux brins par rupture des liaisons H pour des tempratures comprises entre 60C et 95C : on dit que lADN est dnatur. C e f e d n a t u r a T o n s e e c t u e u n e temprature dautant plus leve que le contenu en paires GC est lev.
S. ZEHDI & H. ENNAFAA S. ZEHDI & H. ENNAFAA - La dnaturaEon peut tre suivie au spectrophotomtre 260nm car lappariTon de molcules simple-brin dmasque les htrocycles des bases, ce qui entrane une augmentaEon de la DO de la soluTon: Cest leet hyperchrome. - On appelle T de fusion = Tm (m pour melTng ), la temprature pour laquelle 50% des chaines dADN ont t spares (elle correspond au point dinexion de la courbe). S. ZEHDI & H. ENNAFAA S. ZEHDI & H. ENNAFAA S. ZEHDI & H. ENNAFAA Si, la suite du chauage: on refroidit brusquement la soluTon, lADN reste dnatur. Si, au contraire, le refroidissement est lent, la structure secondaire se reforme par complmentarit des deux brins : cest la renaturaEon. Dans ces condiTons, il est possible dobtenir des molcules bicatnaires stables parTr de brins prsentant des squences complmentaires : cest lhybridaEon molculaire. Homoduplex : molcule obtenue par lassociaTon de deux brins dADN de mme origine. Htroduplex : molcule obtenue par lassociaTon de deux brins dADN dorigine dirente. On peut aussi obtenir des hybrides ADN/ARN car la base A peut sapparier U.
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S. ZEHDI & H. ENNAFAA - Eet du PH : Une courte exposiEon de lADN pH acide ou alcalin entrane une dnaturaTon parTelle (sparaTon prfrenTelle des rgions riches en A = T et mainTen de la structure double- brin dans les rgions riches en G C). LexposiEon prolonge de lADN pH acide ou alcalin provoque sa dnaturaTon en monobrins.
S. ZEHDI & H. ENNAFAA II-4 STRUCTURE DES CHROMOSOMES II-4-1 Eucaryotes Chez les Eucaryotes, la plus grande parTe de lADN est localis dans les chromosomes qui se trouvent lintrieur du noyau (ADN nuclaire). Le nombre de chromosomes par cellule est une caractrisTque de lespce. Chaque chromosome est form par une trs longue molcule dADN double-brin linaire. S. ZEHDI & H. ENNAFAA Cet ADN est en fait associ des protines (Histones et non-histones) et lensemble forme un complexe appel chromaEne. Les Histones, dont la structure est trs conserve travers tous les organismes Eucaryotes, ont un rle important dans la d t e r m i n a T o n d e l a s t r u c t u r e d e s chromosomes.
S. ZEHDI & H. ENNAFAA Lunit fondamentale de la chromaTne est le nuclosome qui conTent 146pb dADN enroul deux fois autour dun octamre dhistones (2 sous-units de chacune des 4 histones suivantes : H2A, H2B, H3 et H4). Cefe structure rpte donne un aspect de collier de perles la chromaTne.
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LE NUCLEOSOME
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Les nuclosomes peuvent sassocier en structures dordre suprieur qui augmentent la condensaTon de lADN: Grce aux histones H1 qui stabilisent le nuclosome, le collier de perles peut former une super hlice: la bre 30nm . Celle-ci sorganise son tour en boucles de 300nm de longueur. Enn, cefe organisaTon en boucles senroule encore en une spirale plus ou moins resserre de 700nm de diamtre. S. ZEHDI & H. ENNAFAA S. ZEHDI & H. ENNAFAA Lorsque des chromosomes interphasiques sont colors chimiquement , on peut observer que la chromaTne nest pas homogne et se prsente sous deux formes direntes: Lune, faiblement colore, appele euchromaEne, est forme par de la chromaEne peu condense et correspond aux rgions qui conEennent les gnes frquemment exprims par la cellule. L a u t r e , f o r t e m e n t c o l o r e , a p p e l e htrochromaEne, est forme par de la chromaEne trs condense.
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Au niveau de lhtrochromaEne, on peut disTnguer :
lhtrochromaTne facultaTve correspond aux
rgions qui conTennent des gnes qui ne sont pas exprims par la cellule. Sa parTcularit est dtre rversible, cest--dire quelle peut passer un tat euchromaTque (gnes qui sexpriment) selon le type cellulaire ou le stade de dveloppement de lorganisme. lhtrochromaTne consTtuTve, pauvre en gnes, riche en squences dADN rptes. Elle est condense en permanence dans tous les types cellulaires. On la trouve principalement autour des centromres et des tlomres. S. ZEHDI & H. ENNAFAA REMARQUE: Comme nous lavons dj vu, chez les Eucaryotes, on trouve de lADN dans les mitochondries (ADN mitochondrial) et les chloroplastes (ADN chloroplasEque): Dans les deux cas, il est praTquement nu (dpourvu de protines), double-brin et circulaire.
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II-4-2 Procaryotes Chez les Procaryotes, l ADN baigne dans le cytoplasme o il consTtue lunique chromosome. D ans ce chromosome, lADN est trs faiblement associ des protines ( nu ), double-brin et circulaire.
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Escherichia coli clate par un choc osmotique. L'ADN de la bactrie s'est rpandu autour. Le fil jaune correspond une seule molcule d'ADN en forme de boucle. Notez l'chelle: une portion d'ADN d'environ la moiti de la longueur de la cellule correspond environ 5000 paires de bases. S. ZEHDI & H. ENNAFAA REMARQUE: Chez les Procaryotes, on trouve parfois des plasmides : ce sont molcules dADN double- brin, circulaires, de peTte taille, cytoplasmiques qui se trouvent ct du chromosome. Les plasmides se rpliquent de faon autonome.