FACULTE

DES SCIENCES DE TUNIS

Cycle prparatoire Biologie-Gologie: BG1
GENETIQUE
Cours 5

Prsent par Salwa ZEHDI

et Hajer ENNAFAA

CHAPITRE III
ORGANISATION ET EXPRESSION DES GENES
EUCARYOTES ET PROCARYOTES
(SUITE)

S. ZEHDI & H. ENNAFAA

III-5 LA TRADUCTION
Nous avons dj tudi la transcripPon qui
consiste synthPser lARNm en copiant
linformaPon contenue dans lADN.
Nous allons prsent tudier la traduc:on,
cest--dire le mcanisme par lequel lARNm
qui est une squence de nuclo:des est traduit
en protine qui est une squence dacides-
amins.
Pour toute traducPon, on a besoin dun
dicPonnaire; ce dicPonnaire, cest ici le code
gnPque. S. ZEHDI & H. ENNAFAA
III-5-1 Le code gn:que
a) Le code est 3 leLres
Dans lARNm, il ny a que 4 bases direntes A, U, G
et C, et il existe 20 acides-amins dirents qui
peuvent entrer dans la composiPon dune protine.
Comment 4 bases peuvent-elles donc coder pour 20
acides-amins?
Trois possibilits peuvent tre envisages:
1/ code 1 le`re : une base correspond un acide-
amin.
Ce systme ne pourrait alors coder que pour quatre
acides-amins (41 = 4).
S. ZEHDI & H. ENNAFAA
2/ Code 2 le`res: chaque associaPon de deux bases
correspond un acide-amin.
Ce systme ne pourrait alors coder que pour 16 acides-
amins (42 = 16).
Ce`e possibilit nest donc pas saPsfaisante non plus.
3/ Code 3 le`res: chaque associaPon de trois bases
correspond un acide-amin.
Ce systme peut coder pour 64 acides-amins (43 = 64),
ce qui est ce`e fois largement susant (puisquen
ralit, il ny a que 20 acides-amins).

S. ZEHDI & H. ENNAFAA
Cest ceLe dernire hypothse qui sest trouve
conrme : un ensemble de 3 nuclo:des, appel
codon (ou triplet), sur lARNm dnit un acide-amin.
On dispose donc de 64 codons (voir tableau Code
GnPque):
- 3 codons: UAA, UAG et UGA sont des codons stop.
- Il reste 61 codons pour dnir 20 acides-amins. Mis
part Met et Trp, cods par un seul codon, les 18
autres acides-amins sont cods par plusieurs
codons (de 2 6).

S. ZEHDI & H. ENNAFAA

S. ZEHDI & H. ENNAFAA
b) Le dchirage du code gn:que
c) Les caractris:ques du code gn:que
Le code est universel
Le code est universel, cela veut dire quil est le mme
chez tous les organismes, que ce soit un animal, une
plante, une bactrie ou mme un virus.
Cela est vrai quelques trs rares excepPons prs:
Exemples:
- Chez la paramcie, le codon UAA nest pas un codon
stop mais code pour Gln.
- Dans les mitochondries humaines, quatre codons
dirent.
etc...
S. ZEHDI & H. ENNAFAA
 Le code est dgnr
On dit que le code est dgnr car un mme acide-
amin peut tre cod par plusieurs codons dirents.
Exemples:
- la Leucine code par CUU, CUC, CUA, CUG, UUA et
UUG
- la Srine code par UCU, UCC, UCA et UCG.
On remarque travers ces deux exemples que la
dgnrescence porte plutt sur la troisime base. Ce
changement peut tre considr comme une adaptaPon
du systme pour prvenir des mutaPons pouvant
toucher ce`e troisime base.

S. ZEHDI & H. ENNAFAA

 le code est non chevauchant
par:r dun site dini:a:on, les bases sont lues
jusquau codon de terminaison par srie de trois
bases.
- En eet, il a t dmontr que la subsPtuPon dune
base par une autre entrane le changement dun seul
acide-amin. (Si le code tait avec chevauchement la
subsPtuPon dune seule base aurait modi jusqu
trois acides amins adjacents dans la protine.)
le code est non ambigu
A un codon correspond un seul et unique acide amin.

S. ZEHDI & H. ENNAFAA

III-5-2 Elments ncessaires la traduc:on
La traducPon a lieu dans le cytoplasme au niveau du
ribosome et ncessite lARNm ainsi que les ARNt qui
vont apporter les acides-amins.
a) L ARN messager: ARNm
Cest lARNm qui porte le message en provenance de
lADN : ce message indique dans quel ordre doivent
senchaner les dirents acides-amins au niveau
de la protine.
Les acides-amins ne sassemblent pas directement
sur lARNm : il y a ncessit dun adaptateur, il sagit
de lARNt.

S. ZEHDI & H. ENNAFAA
b) L ARN de transfert: ARNt
LARNt peut tre considr comme un adaptateur
entre lARNm et lacide-amin.
La molcule dARNt a la forme dune feuille de tre
consPtue de quatre Pges en double hlice et de 3
boucles simple-brin. La boucle situe au milieu de
chaque ARNt est appele boucle de lan:codon car elle
porte le triplet appel an:codon qui est
complmentaire au codon de lARNm.
La feuille de tre aplaPe ne reprsente pas la
conformaPon relle de lARNt ; celui-ci ressemble en
ralit une feuille de tre replie en forme de L :
cest la structure tridimensionnelle de lARNt.
S. ZEHDI & H. ENNAFAA
L ARN de transfert: ARNt

Structure tridimensionnelle en forme de L Forme en feuille de tre

 Les acides-amins sont xs aux ARNt par des
enzymes appels aminoacyl-ARNt synthtases.
Ces enzymes sont au nombre de 20 dans la cellule,
une pour chacun des 20 acides-amins. A chaque
acide-amin correspond une synthtase spcique
qui lunit exclusivement aux ARNt reconnaissant les
codons qui le spcient.
Les aminoacyl-ARNt synthtases possdent 2 sites
de liaison, un pour lacide-amin et lautre pour
lARNt qui lui correspond. Lacide-amin sera x
lextrmit 3 libre (CCA) de lARNt par une liaison
covalente.
S. ZEHDI & H. ENNAFAA
c) Le Ribosome
Le ribosome runit les acteurs importants de la synthse
protique, c'est--dire lARNm et les ARNt pour traduire la
squence nucloPdique de lARNm en squence dacides-
amins.
Chez tous les organismes, le ribosome est consPtu dune
pePte et dune grande sous-unit. Chacune delles est
compose dARN (lARNr) et de protines.
Chez les Procaryotes, la pePte et la grande sous-unit sont
appeles respecPvement 30S et 50S et lorsquelles
sassocient, elles forment le ribosome complet qui est une
parPcule 70S.
Chez les Eucaryotes, leurs quivalents sont appels 40S et 60S
et elles sassocient en une parPcule 80S.
S. ZEHDI & H. ENNAFAA
S. ZEHDI & H. ENNAFAA
Les principaux sites dinteracPon au niveau du ribosome sont :
Le site de liaison de lARNm qui est situ dans sa totalit
lintrieur de la pePte sous-unit.
Trois sites de liaison pour les molcules dARNt :
- le site A (pour Amino-acyl) qui permet la xaPon dun ARNt
entrant, charg dun acide-amin et dont lanPcodon
correspond au codon prsent dans le site A.
- le site P (pour PepPdyl) pour la xaPon de lARNt charg de la
chaine polypepPdique en cours de synthse.
- le site E (pour Exit ) qui conPent un ARNt qui ne porte plus
dacide-amin et qui est prt tre libr du ribosome.

S. ZEHDI & H. ENNAFAA

S. ZEHDI & H. ENNAFAA
III-5-3 Les direntes tapes de la traduc:on
Le processus de la traducPon peut tre divis en 3
tapes : lini:a:on, llonga:on et la terminaison.
En plus du ribosome, de lARNm et des ARNt, des
protines supplmentaires sont ncessaires pour la
russite complte de chaque tape, elles sont
nommes:
- Facteurs diniPaPon (IF : IniPaPon Factors)
- Facteurs dlongaPon (EF: ElongaPon Factors)
- Facteurs de terminaison (RF: Release Factors =
Facteurs de relargage).
Par souci de simplicaPon, nous ne dtaillerons pas le rle de
ces facteurs au cours des 3 tapes de la traducPon.
S. ZEHDI & H. ENNAFAA
a) Lini:a:on
Dans ce`e tape, il sagit de placer le 1er aminoacyl-
ARNt dans le site P du ribosome et de ce`e faon
dtablir le cadre de lecture correct de lARNm.
Le 1er acide-amin de tout pepPde no-synthPs est la
Mthionine, spcie par le codon AUG. Celle-ci est
insre par un ARNt spcial appel ARNt ini:ateur,
symbolis par ARNtMeti.
(Chez les bactries, un groupement formyle est ajout la
Mthionine pendant quelle est xe l ARNt iniPateur,
produisant la formyl-Mthionine)

S. ZEHDI & H. ENNAFAA
 L ARNm sassocie dabord avec la pe:te sous-unit
du ribosome.
L ARNt ini:ateur est par la suite posi:onn au
niveau du site P.
Lorsque le codon AUG est correctement align avec
lARNt ini:ateur, cela dclenche lassemblage du
ribosome complet (associaPon de la grande sous-
unit la pePte sous-unit qui est dj en place).

S. ZEHDI & H. ENNAFAA

Lini:a:on
Remarques:
Chez les Procaryotes, la rgion 5UTR (squence
prsente entre le site de dbut de transcripPon et le
site de dbut de traducPon) de lARNm est
essenPelle pour la xaPon du ribosome. En eet,
dans ce`e rgion se trouve une squence appele
squence Shine-Dalgarno: cest elle qui permet le
bon posiPonnement de la pePte sous-unit du
ribosome lors de liniPaPon.
Chez les Eucaryotes, le complexe diniPaPon (pePte
sous-unit du ribosome + ARNm + ARNt iniPateur)
sassemble au niveau de la coie en 5 de lARNm et
se dplace dans le sens 5 vers 3 jusqu ce quil
reconnaisse le codon AUG.
S. ZEHDI & H. ENNAFAA
b) Llonga:on
L ARNt iniPateur tant dj dans le site P, le site A est prt
accepter un nouvel aminoacyl-ARNt (1).
Une liaison pep:dique se forme (2) grce au transfert de la
Met sur lacide-amin prsent dans le site A.
Les ARNt prsents dans les sites A et P vont tre dplacs
vers les sites P et E respecPvement et lARNm passe travers
le ribosome : cest la transloca:on (3) qui fait que le codon
suivant est prsent posiPonn dans le site A.
le site A est libre et peut accepter laminoacyl-ARNt suivant
tandis que lARNt non charg qui`e le site E.
Ces mmes tapes (1), (2) et (3) se rptent au cours de la
progression de llongaPon.
La lecture de lARNm se fait dans le sens 5 vers 3.
S. ZEHDI & H. ENNAFAA
Llonga:on
Liaison entre deux acides-amins = liaison pep:dique

Acide-amin 1 Acide-amin 2

S. ZEHDI & H. ENNAFAA

c) La terminaison
Le cycle se poursuit jusqu ce que le codon prsent
dans le site A soit lun des 3 codons stop : UAA, UAG
ou UGA. Aucun ARNt ne reconnait ces codons. (Ce
sont les protines appeles facteurs de relargage
Release Factors qui reconnaissent les codons
stop.)
La liaison entre lARNt et la chaine polypep:dique
est hydrolyse.
Les 2 sous-units du ribosome se sparent et la
pePte sous-unit est alors prte former un
nouveau complexe diniPaPon.
S. ZEHDI & H. ENNAFAA
La terminaison


Quelques dniPons:

Transcriptome = lensemble des ARN issus de la
transcripPon du gnome.

Protome = lensemble des protines exprimes
par le matriel gnPque dun organisme.

S. ZEHDI & H. ENNAFAA

III-6 REGULATION DE LEXPRESSION DES GENES
Nous nous limiterons ltude dun exemple chez les
Procaryotes, celui de lopron lactose.
Lopron Lactose
Avec ltude de lopron lactose, Franois Jacob,
Jacques Monod et Andr Lwo ont t les premiers
scienPques dcrire un systme de rgula:on de la
transcrip:on des gnes.
Ils proposent lexistence de deux classes de gnes quils
direncient par leur foncPon : les gnes structuraux
et les gnes rgulateurs. Cest parPr de ces travaux
quest n le concept de la rgulaPon gnique. (Prix
Nobel de physiologie et mdecine en 1965).
Qu'est-ce qu'un opron ?
Pour survivre, les bactries doivent tre capables
d'ajuster rapidement leur mtabolisme aux
variaPons des condiPons environnementales.
Chez les bactries (et aussi chez les virus), les
dirents gnes impliqus dans une voie
mtabolique parPculire sont souvent runis sur
le chromosome et organiss en un groupe
appel opron.
La runion de ces gnes en une unit
foncPonnelle facilite la rgulaPon de leur
expression gnPque.
 Le regroupement de ces gnes permet ainsi
un contrle coordonn de leur expression.
Ce contrle est ralis grce des protines
rgulatrices. Celles-ci rgulent le taux de
transcripPon en se liant l'ADN au niveau de
squences spciques.
La transcripPon de lensemble des gnes
structuraux regroups en opron, donne une
seule molcule dARNm nomme ARNm
polycistronique (qui conPent linformaPon
ncessaire la synthse des direntes
protines).
Le mtabolisme du lactose :
La bactrie trouve sa source de carbone dans le
catabolisme des sucres.
Si le glucose est la source de carbone "prfre",
le lactose (qui est un -galactoside) peut
galement tre consomm par la bactrie et
mtabolis en galactose et glucose.
Les enzymes ncessaires lu:lisa:on du
lactose ne seront synth:ses quen prsence
de ce substrat.
Dans lopron lactose, on trouve les trois gnes
structuraux suivants:
- Le gne LacZ qui code pour la -galactosidase.
Ce`e enzyme va cliver la molcule de Lactose en
Glucose + Galactose.
- Le gne LacY qui code pour la Permase. Ce`e
protine membranaire permet lentre du
lactose dans la cellule.
- Le gne LacA qui code pour une Transactylase
dont le rle nest pas bien connu.
 Ces trois gnes de structure sont prcds par
une rgion responsable de la rgulaPon de leur
expression.
Ce`e rgion rgulatrice comprend le promoteur
(P) et loprateur (O).
On trouve galement en amont de lopron
lactose, le gne rgulateur LacI qui code pour
une protine rgulatrice appele Rpresseur.
Celle-ci agit en inhibant l'expression des gnes de
l'opron lactose, en se liant spciquement sur
lADN au niveau de loprateur.
 L'expression du Rpresseur est
cons:tu:ve, c'est dire qu'il est
exprim quelque soient les condiPons de
croissance de la bactrie.
Par contre, son anit pour l'oprateur
sera modie en prsence de lactose.


 Opron Lactose

at r
op oteu

r
eu
gnes de structure

om
r
gne rgulateur

pr

-galactosidase permase Transactylase

Rpresseur
Rgula:on nga:ve de la transcrip:on :
En absence de lactose, le rpresseur est sous
sa forme acPve. Il va se lier spciquement
au niveau de loprateur de lopron
l a cto s e bloquant lac c s de lARN
polymrase au site dini:a:on de la
transcrip:on.
Ainsi, il y a rgulaPon ngaPve de la
transcripPon des gnes de lopron lactose. Les
enzymes ncessaires au mtabolisme du
lactose ne sont pas synthPses car inuPles en
absence de lactose.
En absence de lactose:

pas dARNm et pas de protines

Rpresseur
Leve de l'inhibi:on de la transcrip:on :
En prsence de lactose: Le lactose va jouer le rle
dinducteur en se liant au Rpresseur pour
linac:ver. Ce`e liaison entrane un changement
conformaPonnel du Rpresseur qui perd alors son
anit pour loprateur.
Le site oprateur tant libr, lARN polymrase peut
aLeindre le site dini:a:on de la transcrip:on et
synth:ser lARNm polycistronique. La producPon
des enzymes ncessaires au mtabolisme du lactose
est donc dpendante de la prsence du substrat (le
lactose).
En prsence de Lactose