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FACULTE

DES SCIENCES DE TUNIS


Cycle prparatoire Biologie-Gologie: BG1
GENETIQUE
Cours 1

Prsent par Salwa ZEHDI


et Hajer ENNAFAA
FACULTE DES SCIENCES DE TUNIS
Cycle prparatoire Biologie-Gologie: BG1
GENETIQUE

Prsent par Salwa ZEHDI
et Hajer ENNAFAA




CHAPITRE I
INTRODUCTION ET HISTORIQUE

S. ZEHDI & H. ENNAFAA


I-1 INTRODUCTION
La gn7que, tude de lhrdit, est une
discipline rcente de la biologie.
L h r d i t e s t l a t r a n s m i s s i o n d e s
caractris7ques dune espce dune gnra7on
lautre.
(Espce = groupe dtres vivants pouvant se
reproduire entre eux et dont la descendance est
ferQle)

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Lorsquon observe le monde vivant, on constate:

- Stabilit : Chaque type dtre vivant donne


naissance des tres vivants iden7ques (les
chats engendrent des chats, une graine de mas
redonnera un plant de mas etc...)

- Diversit : les individus dune mme espce


prsentent des dirences.


CeSe conQnuit travers les gnraQons des
caractres spciques dune espce est rgie par un
centre dinformaQon cellulaire: linforma7on
gn7que.
Comment linformaQon gnQque de ces
dirents organismes peut-elle tre la fois
conserve et diversie ?
Quelles sont les molcules qui portent ceSe
informaQon gnQque et comment sont-elles
organises?
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Nous apporterons des rponses ces quesQons et
plus gnralement, nous tudierons:

La structure et les proprits physicochimiques
des molcules porteuses de linforma7on
gn7que

Lorganisa7on de ceUe informa7on gn7que
chez les direntes classes dtre vivants (virus,
procaryotes et eucaryotes)

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Le fonc7onnement de ceUe informa7on gn7que
(rplica7on, transcrip7on et traduc7on)

La rgula7on du fonc7onnement de linforma7on
gn7que

et enn,
La transmission du matriel hrditaire au cours
de la reproduc7on sexue.

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I-2 HISTORIQUE:
1865: A parQr dexpriences de croisements sur des
plantes (peQts pois), Johann Gregor Mendel fonda
une thorie selon laquelle les caractres sont
dtermins par des facteurs qui se transmeUent
au l des gnra7ons ( ceSe poque on ignorait
tout des chromosomes et de la Mose).
Ses rsultats ont t ignors pendant prs de 30 ans
mais, de nos jours, il est considr comme le pre
fondateur de la gnQque.
- Les facteurs hrditaires de Mendel sont aujourdhui
appels gnes (appellaQon donne en 1909 par
Wilhelm Johannsen).
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1880 : Sur la base dobservaQons microscopiques, les
biologistes allemands Oskar Hertwig et Eduard
Strasburger dduisent que le noyau des cellules est le
sige de lhrdit.

1910: Lamricain Thomas Hunt Morgan dcouvre pour la


premire fois une drosophile mutante aux yeux blancs.
Les expriences de croisement qui suivront permeSront
de valider la thorie chromosomique de lhrdit
(thorie fonde en 1903 par lhypothse de Walter
SuSon et Theodor Boveri selon laquelle les facteurs
hrditaires sont ports par les chromosomes).
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1913 : Thomas Hunt Morgan et Alfred Sturtevant
tablissent les premires "cartes gnQques", qui
localisent les gnes le long des chromosomes de la
drosophile.
Pour ces travaux, Morgan recevra le prix Nobel de
physiologie et de mdecine en 1933.

1927 : Hermann Muller, (eq de Morgan), met au point
linducQon arQcielle de mutaQons par les rayons X chez
la drosophile.
Ce qui permeSra damliorer les cartes gnQques et de
fournir la premire esQmaQon du nombre de gnes
prsents dans un organisme.
(prix Nobel de mdecine en 1946).
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1941: George Beadle et Edward Tatum meSent
lhypothse quun gne code pour une enzyme ( un
gne correspond une enzyme).

1944 : A parQr dexpriences sur des bactries,
Oswald T. Avery, Colin MacLeod et Maclyn McCarty
dmontrent formellement que lADN est la molcule
qui porte linformaQon gnQque.

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1953 : James Watson, Francis Crick et Rosalind
Franklin lucident la structure physique de lADN : la
dsormais clbre double hlice. James Watson et
Francis Crick recevront, avec Maurice Wilkins, le prix
Nobel de mdecine pour ces travaux en 1962.
1966 : Le code gn7que est enn dchir grce
aux expriences de Marshall W. Nirenberg et Har
Gobind Khorana (Prix Nobel de mdecine en 1968).
1972 : Premire exprience de transfert de gnes et
de clonage chez la bactrie Escherichia coli.

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1978 : Dcouverte par Werber Arber, Daniel Nathans
et Hamilton Smith des enzymes de restric7on,
capables de "couper " les molcules dADN en des
sites prcis. Ce seront des ouQls-cls pour le
dveloppement du gnie gnQque.
1 983 : Kary Mullis invente la technique
damplica7on dADN par polymrisa7on en
chane : la "PCR" pour polymerase chain reac0on.
Grce la PCR, la biologie molculaire fait un
formidable bond en avant et souvre tous les
domaines de la biologie.

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Au dbut des annes 1990, la communaut scienQque
internaQonale a jet les bases du Projet gnome
humain. LobjecQf tait dobtenir, pour le dbut du
troisime millnaire, la squence complte du gnome
humain.
Les premires annes du projet ont t consacres un
travail de cartographie : tablissement de cartes
physiques. Le travail de squenage a commenc en
1998.
Une premire bauche de la squence du gnome
humain a t clbre en juin 2000 la Maison blanche.

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Une version complte et prcise 99,99% a t obtenue
en avril 2003; aujourdhui librement accessible en ligne,
la disposi7on des chercheurs du monde en7er.

Le travail didenQcaQon des gnes humains se poursuit,
mais la plupart sont dj reprs le long de ceSe squence
et caractriss.

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CHAPITRE II
ORGANISATION DES GENOMES
EUCARYOTES ET PROCARYOTES

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On peut classer les tres vivants en deux grands
groupes:
Les Procaryotes:
Bactries + Cyanophyces (algues bleues)
CaractrisQques:
Absence dun noyau organis: le matriel
gnQque baigne dans le cytoplasme (pas de
membrane nuclaire)
Division binaire
Absence de mitochondries
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Les Eucaryotes:
Tout le reste du monde vivant
CaractrisQques:
Prsence dun noyau organis: il y a
comparQmentaQon par une membrane
nuclaire
Les cellules se divisent par mitose (division
organise)
Prsence de mitochondries.

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Remarque: Les Virus sont classs part de ces
deux grandes catgories. Ils forment un groupe
part
CaractrisQques:
Organismes acellulaires (ils ne possdent ni
membrane cellulaire, ni cytoplasme, ni noyau)
Incapables de se reproduire seuls: non dous
dautoreproducQon autonome
Ils sont donc des parasites cellulaires
obligatoires (ils doivent infecter une cellule pour
pouvoir se mulQplier).
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II-1 NATURE DU MATERIEL HEREDITAIRE
De nombreux travaux ont conduit dnir la nature du matriel
hrditaire. On peut citer 3 expriences parmi les plus clbres :
Lexprience de Transforma7on bactrienne (pneumocoque) : par
Grith en 1928, complte par les expriences de Avery et ses
collaborateurs en 1944.
CeSe exprience a permis de montrer que le matriel gnQque des
bactries est form par lADN.
Lexprience sur le bactriophage T2 : par Hershey et Chase en 1952.
CeSe exprience a permis de montrer que le matriel hrditaire de ce
virus est form par lADN.
Lexprience sur le Virus de la Mosaque du tabac : par Fraenkel-Conrat
et ses collaborateurs en 1956.
CeSe exprience a permis de montrer que le matriel hrditaire de ce
virus est form par lARN. S. ZEHDI & H. ENNAFAA
Exprience 1: Sur la bactrie Streptococcus pneumoniae (le
pneumocoque).
CeSe bactrie, qui provoque la pneumonie chez lhomme, est
gnralement ltale pour la souris.
On disQngue 2 types de pneumocoques:

Type S (Smooth) : entour dune coque, pathogne (les leucocytes
ne peuvent pas phagocyter les pneumocoques S cause de leur
coque)

Type R (Rough) : mutant, dpourvu de coque, non pathogne (vu
labsence de coque, il peut tre phagocyt par les leucocytes).


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Streptococcus pneumoniae,
La varit S est mortelle si on linjecte des
souris alors que la varit R ne lest pas

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Lexprience de Grith:

- InjecQon une souris des bactries S tues par la chaleur :
la souris survit

- InjecQon une souris des bactries R vivantes :
la souris survit

Mais:

- Injec7on de S tues + R vivantes : la souris meurt
(La souris contamine con7ent des bactries S vivantes).

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n Au contact des bactries S mortes, des bactries

R se sont transformes en bactries S mortelles


bien vivantes.
Quelque chose, une informa0on de S, est
passe dans les R et les a transformes en
bactries S.
n Ce quelque chose se transmet de faon
hrditaire puisque les S ainsi formes se
reproduisent en donnant d'autres bactries S.
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En 1944: Oswald Avery, Colin MacLeod et Maclyn
McCarty (biochimistes amricains) compltent les
expriences de Grith et dmontrent que la
substance responsable de la transformaQon est
lADN.

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LADN est lagent transformant la souche R en souche virulente. Si lADN prsent dans
un extrait de cellules de souche S tues par la chaleur est dtruit (hydrolyse par une
ADNase), alors les souris auxquelles on injecte un mlange de cellules tues par la
chaleur et de cellules vivantes de la souche R ne meurent plus.
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Exprience 2 : Sur le bactriophage T2

- Cest un virus qui infecte E. coli.

- Il est consQtu de 2 parQes : la tte et la queue qui
forment lenveloppe protectrice consQtue par
lagrgaQon de molcules protiques direntes.

- LADN se trouve seulement au niveau de la tte.

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En 1952, Hershey et Chase ont ralis lexprience suivante:

- Bactries dans un milieu + isotope radioacQf du phosphore : 32P


- Bactries dans un milieu + isotope radioacQf du soufre : 35S
Les bactries vont incorporer les 2 isotopes dans leurs consQtuants
cellulaires.

- Des bactriophages sont par la suite ajouts aux bactries des 2


milieux.

Dans le 1er cas, cest seulement lADN du bactriophage qui va tre


marqu (en eet, lADN conQent du P et sera donc marqu au 32P
alors que les protines nen conQennent pas et ne seront donc pas
marqus).
Dans le 2me cas, ce sont seulement les protines du bactriophage
qui vont tre marques (en eet, les protines conQennent du S et
seront donc marques au 35S alors que lADN nen conQent pas et
ne sera donc pas marqu). S. ZEHDI & H. ENNAFAA
Un lot de bactries non marques va tre infect par les
phages du type 1 (dont lADN est marqu) et un autre lot par
les phages du type 2 (dont les protines sont marques).
Puis chaque lot est soumis une agita7on violente suivie
dune centrifuga7on.
(Remarque : lors de linfecQon, on a constat quau moins une
porQon de lenveloppe phagique reste aSache la paroi de la
bactrie. Ainsi, la suite de linfecQon, on soumet les 2 lots de
bactries une agitaQon violente de manire sparer bactries
et enveloppes phagiques qui adhrent la paroi bactrienne.)
On mesure enn la radioacQvit du culot et du surnageant :

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Les rsultats:

Pour le 1er lot (ADN marqu) : la radioacQvit se
trouve dans le culot, cest--dire dans les bactries.

Pour le 2me lot (protines marques) : la radioacQvit
se trouve dans le surnageant.

CeSe exprience montre que cest lADN qui entre
dans la cellule infecte : cest donc lADN qui est
ncessaire pour la reproducQon de parQcules virales
idenQques. Cest donc lADN qui est porteur de
linforma7on gn7que.
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Exprience 3 : Sur le virus de la mosaque du tabac (VMT)

- Ce virus se prsente sous forme de btonnet :
lenveloppe protique est forme par plus de 2000
protines idenQques qui prsentent un arrangement
hlicodal autour de la molcule dARN centrale.

- Le virus pntre dans les cellules de feuilles de tabac et
perturbe leur mtabolisme.
Les cellules infectes perdent leur chlorophylle. Les zones
contamines se prsentent comme des tches jauntres.
S. ZEHDI & H. ENNAFAA
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- On peut in vitro dissocier les protines de
lARN.

- Egalement, si on remet en prsence ARN et
protines, celles-ci vont spontanment
sassembler autour de la molcule dARN et
reconsQtuer un virion complet.

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En 1956, Fraenkel-Conrat et
ses collaborateurs ont
r a l i s l e x p r i e n c e
suivante:
- Protines pures sur
feuilles de tabac : pas
dinfecQon
- ARN pur sur feuilles de
tabac : infecQon (au niveau
des tches, on retrouve des
virions complets).
LARN du VMT conQent
d o n c l i n f o r m a Q o n
ncessaire au processus
d i n f e c Q o n e t l a
reproducQon de virions
complets. S. ZEHDI & H. ENNAFAA
Une autre exprience conrme ceSe
conclusion :
On connait 2 types de virions:
- Virion type A : produit des tches
fonces sur les feuilles
- Virion type B : produit des tches
claires sur les feuilles
ARN A + Protines B : linfecQon
produit des tches fonces
ARN B + Protines A : linfecQon
produit des tches claires
On constate que les tches
correspondent toujours celles qui
auraient t obtenues en infectant
par le virus qui a fourni lARN.
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CONCLUSION : Le matriel hrditaire est form par les
acides nucliques (ADN, ARN).
ADN (acide dsoxyribonuclique) :
- Eucaryotes
- Procaryotes
- Virus

ARN (acide ribonuclique) : certains virus

LocalisaQon:
le Noyau (ADN nuclaire),
la mitochondrie (ADN mitochondrial) et
les chloroplastes (ADN chloroplasQque)

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II-2 SRUCTURE DU MATERIEL HEREDITAIRE

- Comme nous lavons vu, le matriel hrditaire est form par


lADN et pour certains virus, par lARN.
- ADN et ARN sont des acides nucliques.
ADN : Acide DsoxyriboNuclique
ARN: Acide RiboNuclique
- Les molcules dacides nucliques sont des polymres de
nuclo7des.

II-2-1 Lunit de base : le nuclo7de

Un nuclo7de est une molcule forme de trois par7es:


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-Une base azote : Les bases azotes sont des
molcules organiques formes d'un ou deux cycles
o alternent des atomes de carbone et d'azote.

-Un sucre cinq carbones : un pentose
le dsoxyribose pour lADN.
Le ribose pour lARN.
La seule dirence entre ribose et dsoxyribose:
c'est que le dsoxyribose a un groupement OH en
moins (d'o son nom, dsoxyribose).

-Un groupement phosphate
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Les bases azotes sont de deux types
- Bases pyrimidiques : C et T pour lADN et C et U pour
lARN (dans lARN, on a U la place de T)
- Bases puriques: A et G pour lADN comme pour lARN.

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- Les atomes de carbone du pentose
sont numrots 1, 2, 3, 4 et 5.

Dans le nuclo7de:
- lacide phosphorique est aSach
au carbone 5 du pentose et la
base au carbone 1.

- L a l i a i s o n e n t r e l a c i d e
phosphorique et le pentose est
une liaison ester.

- Les bases sont lies au rsidu
pentose par une liaison covalente
entre le carbone 1 du pentose et
lazote en posiQon 1 pour les
pyrimidines et lazote en posiQon
9 pour les purines.

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Base Nucloside = Sucre + Base Nuclotide = Sucre + Base + H3PO4
Thymine Thymidine Thymidine monophosphate : TMP
Cytosine Cytidine Cytidine monophosphate : CMP
Adnine Adnosine Adnosine monophosphate : AMP
Guanine Guanosine Guanosine monophosphate : GMP
Uracile Uridine Uridine monophosphate : UMP

Remarque : pour lADN, les nucloQdes scrivent dTMP,


dCMP, dAMP, dGMP (d pour dsoxy pour indiquer que le
s u c r e e s t u n d s o x y r i b o s e : d s o x y T h y m i d i n e
mononophosphate, etc...).

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II-2-2 Structure primaire: le polynuclo7de


Les nucloQdes du polymre sont relis les uns aux autres par
des liaisons esters qui relient le 3OH dun nucloQde n au
5-P du nucloQde n+1 .
Ainsi, lacide phosphorique engage deux foncQons acides dans
des liaisons dites phosphodiesters : une foncQon ester servant
former le nucloQde, la 2me relier deux nucloQdes entre
eux.
Les deux nucloQdes situs aux extrmits du polymre
prsentent lun une foncQon 5P libre et lautre une foncQon
3OH libre.
Par conven7on, on lira toujours une chane dacide nuclique
dans le sens 5P vers 3OH.
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Lalternance phosphate-sucre constitue le squelette de la chane de
nuclotides.

Dsoxyribose et groupement phosphate sont les mmes tout au long


de la chane.

Il nen est pas de mme pour les bases: lordre dans lequel elles se
succdent, la squence en bases , est caractristique de
chaque molcule dADN.

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II-2-3 Structure secondaire de la molcule dADN: la double
hlice:
Les molcules dADN sont habituellement formes de 2 chanes (on dit aussi 2
brins) de nucloQdes alors quune molcule dARN nen comprend quune.
(on note cependant des excepQons chez certains virus).

La connaissance :

des composants chimiques de lADN (Pentose + Bases + H3PO4)


des rgles de Charga pour la composiQon des bases (A=T ; G=C ; A+G=T+C ;
A+TG+C)
ainsi que des rsultats danalyse de diracQon des rayons X sur lADN
(obtenus par Rosalind Franklin)
ont permis Watson et Crick de proposer, en 1953, un modle de structure
tridimensionnelle de la molcule dADN.
Pour ceSe dcouverte fondamentale, ils reurent le prix Nobel de physiologie
et mdecine en 1962.


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Selon ce modle, lADN est form par 2
chanes de nucloQdes enroules lune
autour de lautre en double hlice droite.

Les 2 brins sont maintenus ensemble par
des liaisons hydrogne entre les bases de
chaque brin.

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2 nm
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Selon le modle de Watson et Crick, les 2 chanes de lADN ont
deux caractrisQques : elles sont anQparallles et
complmentaires.
An7parallles : Pour que les paires de base soient face face
dans une conguraQon permeSant lassociaQon des bases
par les liaisons hydrogne, il est ncessaire que les 2
squeleSes, qui sont parallles, soient orients en sens
opposs : on dit que les 2 brins sont an7parallles.
Complmentaires : En raison de lencombrement strique
des bases, une purine est toujours apparie une pyrimidine
et vice-versa. Plus prcisment, en face de A on a toujours T
et en face de C, on a toujours G. A se lie T par 2 liaisons
hydrogne et C se lie G par 3 liaisons hyhrogne. Il rsulte
de cet appariement spcique que la squence de
nuclo7des dune chane dtermine celle de lautre.
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La base azote Adnine peut former deux
liaisons hydrogne (illustres par des pointills)
avec la base Thymine.
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La base azote Guanine peut former trois
liaisons hydrogne avec la base Cytosine.

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