Resumen
Arqueas
Joshelin Huanca; Paulo Laya
Departamento de Biologa, Facultad de Ciencias. UNALM, Lima: Per
Generalidades
Al igual que las bacterias, son consideradas
procariotas por carecer de ncleo celular y sistema
de endomembranas, pero son diferentes a ellas, por
lo cual tienen su dominio propio.
Adems de su conocida capacidad para habitar
ambientes extremos de temperatura, salinidad y pH,
su importancia radica en la participacin en ciclos
biogeoqumicos como el de sulfuro, nitrgeno y
carbono. Por ejemplo, en sedimentos pantanosos
salados de New England, Massachusetts, se hall la
predominancia de arqueas amonio oxidadoras
respecto a las beta-proteobacterias gracias al anlisis
de los genes 16S rRNA, donde el gen amoA fue
utilizado, considerando que presentaba diferencias
entre los encontrados en arqueas y proteobacterias
(Moin et al., 2009).
Por la dificultad de aislamiento de las arqueas debido
a los rigurosos ecosistemas donde habitan, segn los
papers ledos, la oxidacin de amonio parece ser un
buen mtodo para medir la distribucin de estos
organismos (Falb et al., 2008). Ello se corrobora al
ver las arqueas amonio oxidadoras abundan en
suelos donde la proporcin carbono:nitrgeno es
menor, indicando mayor cantidad de este ltimo y su
funcin como nitrificadores del suelo , que en este
caso, fueron muestras diversas de Amrica y la
Antrtida (Bates et al., 2011).
En nuestro pas, cualquier hbitat con condiciones
extremas puede ser considerado como posible
albergador de arqueas. Por ejemplo, el gnero
Haloferax fue encontrado en las salinas solares de
Huacho, cuya importancia es la produccin de
betacaroteno (Esquerre et al., 2003). Otros ambientes
pueden ser la Cordillera de los Andes, donde el
Huascarn podra albergar psicrfilos, o aqu en
Lima los Pantanos de Villa que muy probablemente
alberguen alcalfilos. Nuestro mar tambin es un
probable hbitat de barfilos.
Aislamiento, Cultivo y Caracterizacin
Es muy complicado el aislamiento de las arqueas
porque simular las condiciones donde stas
usualmente se desarrollan es difcil, considerando las
condiciones de temperatura, pH, presin, salinidad y
anaerobiosis en muchos casos. En la bibliografa
consultada, se resalta el aislamiento de
Halobacterium tomando como referencia su
propiedad de fermentar arginina (Oren & Litchfield;
1999).
Usando muestras de Israel y Estados Unidos
(California), donde estaban los gneros
Halobacterium, Haloferax, Halorubrum,
Haloarcula, utilizaron una cromatografa de capa
fina para separar lpidos extrados de medio
enriquecidos con arginina segn el tiempo de
retencin. Usando condiciones aerobias y anaerobias
hicieron la corrida. Tomando como caracterstica que
existen 2 glicolpidos que caracterizan al gnero
Halobacterium, el S-TGD-1 (galactosa-manosa-
glucosa) y S-TeGD (galactosa-manosa-
galactofuranosa) se realiz la corrida. Se comprueba
que el S-TGD-1 es el principal glicolpido para
caracterizar a este gnero respecto a otros en
condiciones anaerobias, ya que se ubic en la parte
inferior de la cromatografa, notndose la separacin
respecto de otros lpidos (Oren & Litchfield; 1999).
Pese a ello, la secuenciacin de genes 16S rDNA
sigue siendo ideal para este tipo de caracterizaciones.
El experimento por otro lado, confirm que
Halobacterium tiene complejos requerimientos
nutricionales (necesarios entre 10 a 15 aminocidos
diferentes en su medio de crecimiento) lo cual lo
diferencia de otros gneros como Haloferax y
Haloarcula que crecen en medios inorgnicos que
contengan fuentes bsicas de carbono. Las vesculas
de gas que forma Halobacterium pueden ser vistas
ocasionalmente en medios de cultivo anaerobios,
sirviendo como otro punto de diferenciacin con
otros gneros (Oren & Litchfield; 1999).
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Viendo otras herramientas para detectar arqueas a
nivel clnico, lo ideal es simular un ambiente anxico
para cultivarlas (80% H2 y 20% CO2) y presurizar a
2 atmsferas (Dridi, B; 2012).
La utilizacin de la secuenciacin de los 16S rDNA
es bsica, sin embargo, la deteccin de gen mcrA
que codifica para formar la metil coenzima M
reductasa es muy til porque esta enzima es vital
para la produccin de metano en el intestino humano
e incluso pudo dar especies como M. smithii que
habitan en la cavidad bucal.
Tambin se han desarrollado protocolos para utilizar
el espectrmetro de masas MALDI-TOF MS como
identificador de arqueas extremfilas utilizando
perfiles nicos de protenas de cada especie y
generando una biblioteca de datos que puede ser
comparada para reportes futuros (Dridi, B; 2012).
Para el caso de metangenas, su extrema intolerancia
al oxgeno y su produccin de metano mediante la
reduccin de metanol con H2 usando acetato como
fuente carbonada (Khelaifia & Drancourt; 2013) es
primordial conocer para generarles un medio de
cultivo apropiado. Utilizando una variante del medio
de cultivo hecho por Dridi (2012), donde se le aade
una solucin de selenito/tungstato a un medio SAB
con metanol y metales traza en una determinada
concentracin. Luego, la deteccin de los
microorganismos puede ser verificada mediante
microscopa ptica, cromatografa de gases,
espectrofometra, y PCR, del cual este ltimo es el
ms utilizado por la eficiencia de la secuenciacin de
los genes 16S rDNA.
Aplicaciones
A nivel clnico, considerando la suceptibilidad/
resistencia a antimicrobianos, podemos hablar a 3
niveles: pared, DNA y protenas.
En pared no encontramos inhibidores de sntesis,
pero la Escualamina tiene la propiedad de alterar la
formacin de pared.
A nivel de DNA, las Quinolonas (ingresar por
difusin simple a las clulas) alteran su replicacin y
superenrrolamiento, y las Novobiocina son usadas
para demostrar la accin de agentes antimicrobianos
en procesos de digestin anaerobia; mientras que el
Nitrofurano (encontrado en Halobiforma y
Halogeometricum) altera su composicin porque
induce mutaciones, siendo usado para tratamientos
de infecciones intestinales.
La sntesis puede ser inhibida gracias a Sulfonamidas
(Liu et al., 2012) y Benzilpirimidinas, las cuales
inhiben la sntesis de cido flico, que como
sabemos es un cofactor importante para sintetizar
purinas y pirimidinas en procariotas (Khelaifia &
Drancourt; 2013).
Finalmente, a nivel de protenas, encontramos que el
cido Fusdico y los Fenicoles alteran la sntesis
proteica, donde el primero inhibe la elongacin de la
cadena polipeptdica al unirse a ribosom evitando su
separacin de las subnidades para hacer la sntesis;
mientras que el segundo probablemente inhiba la
unin de pptidos, bloqueando la elongacin
(Khelaifia & Drancourt; 2012).
Para enzimas industriales, por ejemplo S.
solfataricus es utilizada para producir nucletidos
carbocclicos que los usan en tratamientos de
infecciones virales e incluso el tratamiento de VIH,
ello gracias a una gamma-lactamasa, la cual produce
un sustrato primordial para bloquear la actividad
HIV (Littlechild; 2015)
Otra enzima es la aminoacilasa de T. litoralis que
tiene importancia para la produccin de compuestos
activos farmacuticos, ya que al ser sobreexpresada
en E.coli puede producir aminocidos de donde se
utiliza el nitrgeno para los farmacuticos
(Littlechild; 2011).
La alcohol deshidrogenasa de Aeropyrum pernix es
otra enzima con gran termoestabilidad y tolerancia a
altas temperaturas (90 C por 2 horas), mientras que
la serina transaminasa de S. solfataricus convierte el
piruvato y la serina en hidroxipiruvato y alanina
(Littlechild; 2011) ello mediante una combinacin
con una transquetolasa para sintetizar intermediaries
quirales de frmacos (Littlechild; 2015).
En S. tokodaii se ha encontrado una dehalogenasa
cuya aplicacin es para producir cidos halo-
carboxlicos quirales (industria qumica) y en
procesos de biorremediacin por presentar
estabilidad en ambientes salinos (Littlechild; 2015)
Otra enzima clonada en E.coli es una carboxiesterasa
de S. shibatae, que tiene preferencia por sustratos
que contengan grupos aromticos (Littlechild; 2015)
En biorremediacin, la familia Halobacteriaceae ha
sido encontrada capaz de metabolizar cido
hidroxibenzoico (Bonete et al., 2015), el cual es
utilizado en cosmtica y tiene un impacto
Resumen

contaminador en suelos. Tambin gneros de esta Khelaifia, S., & Drancourt, M. (2012).
misma familia, la cual crece en ambientes Susceptibility of archaea to antimicrobial
hipersalinos, es capaz de crecer en altas agents: applications to clinical
concentraciones de metales pesados. Como ejemplo, microbiology. Clinical Microbiology and
Haloferax puede reducir la concentracin de iones Infection, 18(9), 841-848.
Pb, Cr, Zn y Ni mediante procesos de biosorcin Littlechild, J. A. (2015). Archaeal enzymes
(Bonete et al., 2015). and applications in industrial
biocatalysts. Archaea, 2015.
Para el tratamiento de aguas residuales, posterior al Littlechild, J. A. (2011). Thermophilic
tratamiento primario, donde observamos floculacin archaeal enzymes and applications in
y degradacin anaerobia, viene el tratamiento biocatalysis. Biochemical Society
secundario, donde microorganismos aerobios Transactions, 39(1), 155-158.
continan con la degradacin y al final en el Liu, Y., Beer, L. L., & Whitman, W. B.
tratamiento terciario se realiza el removimiento del (2012). Sulfur metabolism in archaea reveals
nitrgeno y fosfatos (Bonete et al., 2015) novel processes. Environmental
microbiology, 14(10), 2632-2644.
Las perspectivas finales respecto al uso de arqueas es Moin, N. S., Nelson, K. A., Bush, A., &
que, con los progresos en los mtodos de Bernhard, A. E. (2009). Distribution and
caracterizacin y aislamiento, es posible obtener diversity of archaeal and bacterial ammonia
mayor cantidad de metabolitos aplicables para la oxidizers in salt marsh sediments. Applied
industria, adems de poder utilizarlos para el and environmental microbiology, 75(23),
tratamiento de ambientes contaminados. 7461-7468.
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