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BIOLOGIA II
2009
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Biologa II
Segundo Cuatrimestre-ao 2009
Coordinador de la materia
Dra. Prof. Deborah R. Tasat
Docentes Responsables de TP
Dra. Andrea Gioffr
Dra. Paola D`Atri
Dr. Martin Radrizzani
Ayudantes de Primera
Lic. Mnica Palmieri
Lic. Leonardo Storani
Ayudantes de Segunda
Marcos Bruno
Romina Chiurazzi
Sebastin Ferraro
Vernica Delfosse
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INDICE
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Inicio de las clases: Mircoles 19 de Agosto Tericos y TPs
Exmenes:
Exmenes Recuperatorios:
Fechas de Finales:
Sern establecidas por la Escuela de Ciencia y Tecnologa
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Programa Analtico de la materia
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11: Divisin Celular en eucariontes: Mitosis: Organizacin Molecular y rol Funcional
del aparato mittico. Descripcin general de la meiosis: Etapas, Formacin del Complejo
sinaptonmico, recombinacin gnica entre cromtidas homlogas (crossing-over),
separacin de homlogos y de cromtides hermanas. Consecuencias genticas de la
meiosis. Comparacin entre meiosis y mitosis.
12: Ciclo Celular: Perodos Go, G1, S, G2. Ciclinas y Factor Promotor de la
Maduracin (MPF). Factores regulatorios del ciclo celular (p21, p53, p16, etc.), cascadas
regulatorias.
14: Ncleo II. El Nuclolo. Tipos de ARN. Transcripcin y procesamiento del ARN.
Ribosomas y poli-ribosomas. Traduccin. Protenas intracelulares y de exportacin.
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Bibliografa Recomendada
A modo orientativo se citan a continuacin algunos libros de referencia. Sin embargo, se
recomienda optar por las ediciones actualizadas, en el caso de que se encuentren
disponibles
Biologa Curtis and Barnes. Ed. Panamericana, 2001 H.
Molecular Cell Biology. 4th ed. Lodish, Harvey; Berk, Arnold; Zipursky, S. Lawrence;
Matsudaira, Paul; Baltimore, David; Darnell, James E.
Bsquedas Bibliogrficas
Para buscar citas de trabajos originales publicados en revistas cientficas en ingls
mediante el uso de palabras presentes en sus ttulos o resmenes (abstracts) o el apellido
de sus autores, o libros on-line (tambin en ingls), se puede consultar la base de
publicaciones ms importante en ciencias biomdicas y biotecnologa, llamada PubMed,
a la siguiente direccin de internet:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/PubMed/
Publicaciones Peridicas
Scientific American o su edicin en espaol (Investigacin y Ciencia)
Mundo Cientfico
Ciencia Hoy
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Caractersticas generales y Rgimen de aprobacin
El curso se desarrollar en 15 semanas y comprende:
Clases Tericas de 2 horas (1 clase por semana) a dictarse los das mircoles de 15-17hs
Trabajos Prcticos de 3 horas. Los mismos se llevarn a cabo los das mircoles de
maana: 9-12hs o de noche de 18-21hs.
Exmenes parciales escritos a desarrollar. El examen final podr ser oral o escrito.
Clases Tericas
Teniendo en cuenta la imposibilidad material para desarrollar la totalidad de los temas
debido a los avances crecientes en el conocimiento en Biologa, las clases tericas estn
dedicadas bsicamente a la actualizacin de los temas fundamentales de la materia. No
obstante, la totalidad de los tpicos del Programa Analtico deben ser estudiados
utilizando la bibliografa aconsejada. Para facilitar la compresin de los contenidos
desarrollados en las clases tericas, es esencial el estudio previo de los temas a ser
dictados.
Clases Prcticas
El Trabajo Prctico es una actividad de asistencia obligatoria, por lo tanto, se exige un 80
% de asistencia. La inasistencia a los TPs implica por lo tanto la prdida de la regularidad
de la materia. Las bases conceptuales de los temas de TP son desarrolladas previamente
en las Clases Tericas o durante el desarrollo de las prcticas. El alumno deber poseer
los conocimientos tericos correspondientes al tema del da, los que sern evaluados
mediante interrogatorios orales o escritos (parcialitos).
2-Exmenes Parciales
Durante el curso lectivo se tomarn 2 (dos) exmenes parciales cada uno de los cuales se
aprobar con el 60% de la nota.
Recuperatorios de Parciales
Se podr recuperar, en las fechas previstas por la Ctedra, solamente uno de los
exmenes parciales.
3-Exmen Final
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Los alumnos que regularizan la materia, rendirn un examen final integratorio. El mismo
puede ser escrito u oral.
NOTA: Todo el material necesario ser provisto por la ctedra. Sin embargo es
obligacin del alumno contar con:
- Marcador indeleble trazo fino
- Lpices de colores y hojas blancas
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utilizar.
7. Verificar el voltaje de trabajo del instrumento antes de enchufarlo. Cuando los
instrumentos no estn siendo usados deben permanecer desenchufados.
8. Nunca pipetear lquidos con la boca. En este caso usar peras de plstico o propipetas
especiales para tal fin.
* Material de Vidrio
1. Al usar material de vidrio, verificar su condicin. Cualquier material de vidrio que est
astillado debe ser rechazado.
2. Los vidrios rotos as como todo material punzante deben ser descartados en un
recipiente apropiado. NUNCA DEJARLOS SIN IDENTIFICAR NI A LA MANO DE
UN TERCERO.
* Residuos
Consultar siempre la va de descarte de cada uno de los reactivos utilizados.
* Microscopios
Verificar siempre el estado de las lentes y recordar apagar la lmpara luego de realizada
la observacin. Siempre que use aceite de inmersin, limpiar al finalizar con el solvente
adecuado.
Al retirarse, verificar que el instrumental utilizado est apagado, en su lugar, la
mesada de trabajo debe quedar libre y limpia.
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Pipetas de precisin de volumen variable (micropipetas)
P200
50ul-200ul
P1000
200ul-1000ul
1ul= 10-3 ml
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Utilizacin:
Observar que el mbolo (push button) tiene tres posiciones. T0 (B-E), T1, primer tope (A-
C), T2 (D)
Para la carga:
1. Calibracin del V, tener mucho cuidado en no sobrepasar los lmites operativos
de cada pipeta. Colocar el tip.
2. Llevar el mbolo a la posicin de carga T1 (ver A).
3. Dentro del lquido a pipetear, liberar el mbolo lentamente hasta la posicin T0
(ver B).
4. Para la descarga:
5. Bajar el mbolo suavemente, este debe pasar por primer tope, para la descarga
total, llegar hasta el final, posicin T2 (ver C y D).
6. Finalmente, fuera del lquido dispensado, liberar el mbolo hasta T0 (ver E).
7. Descartar el tip.
T0
T1
T2
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MICROSCOPIA
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Principios Generales de ptica
Luz: Es una onda electromagntica que a partir de una fuente, se propaga en el vaco a
una velocidad de 300.000 km /seg.
La escala de medicin de las longitudes de onda es desde los nanmetros hasta
kilmetros. El espectro de luz visible se encuentra en el rango 380 nm (violeta) 750 nm
(rojo).
aire aire
i i
aire aceite de
r r
inmersin
Leyes de la refraccin
1ra. Ley: Los rayos incidente, refractado y la normal estn en el mismo plano.
2da. Ley: Cuando la luz atraviesa la superficie de separacin de dos sustancias
transparentes el cociente entre seno i/seno r es una constante y se denomina ndice de
refraccin
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Diagrama de un
Microscopio compuesto
Tipos de Microscopios:
pticos Electrnicos
Campo claro Transmisin
Contraste de fase Barrido
Interferencia
Campo oscuro
Polarizacin
Fluorescencia
Confocal
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TP#1 Microscopa
La Microscopa ptica en el estudio de las clulas eucariotas
8. Manipulacin embrionaria
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TP#2 Tcnicas cito-histolgicas
Son los procedimientos que abarcan desde la obtencin de una muestra de origen animal
o vegetal, hasta su transformacin en una preparacin adecuada para su estudio
microscpico.
La tcnica corriente para microscopa de campo claro es bsica y sirve como patrn para
casi todas las dems. La tcnica histolgica de rutina para estudiar las preparaciones con
el microscopio ptico consta de los siguientes pasos:
a. Obtencin de la muestra
c. Deshidratacin
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Tcnica Histolgica
9 OBTENCIN DE LA PIEZA
NECROPSIA: Son piezas que se obtienen de un cadver.
BIOPSIA: Son trozos de tejido que se obtienen de un sujeto con vida, con el objeto de
estudiarlos a microscopio y efectuar el diagnostico histopatolgico.
9 FIJACIN: es una operacin que tiene por objeto matar las clulas y conservarlas en
el estado en que se encontraban durante la vida.
Tipos de fijadores: formol 10-2-%, Bouin (mezcla fijadora a base de cido pcrico, formol
y cido actico).
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Coloracin Con Hematoxilina-Eosina
Pasos
1. Desparafinar el corte en xilol durante 10 minutos
2. Hidratar en alcoholes 100, 96, 70 y 50.
3. Pasaje por agua destilada
4. Coloracin con hematoxilina durante 10 minutos.
5. Viraje en agua corriente
6. Coloracin con eosina durante 3 minutos
7. Lavado rpido en agua corriente
8. Deshidratar en alcoholes 50, 70, 96 y 100
9. Aclaracin en xilol
10. Montaje con blsamo de Canad.
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Objetivo:
Frotis Sanguneo
Diferenciar clulas de la serie roja y de la serie blanca.
Materiales
Rata Wistar
Jeringa
Colorante May Grunwald-Giemsa o Hematoxilina-Eosina
Porta y cubreobjetos
Microscopio compuesto
Metodologa
A partir de la muestra de sangre se obtendrn los extendidos segn mostrar el docente a
cargo del T.P.
Dejar secar, fijar con alcohol 96% y colorear la muestra durante 5-15 min.
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La Microscopa ptica en el estudio de los microorganismos
Resea Histrica
La existencia de industrial, cuando se dieron las
microorganismos era sospechada condiciones tcnicas y sociales para el
desde mucho antes del siglo XVII, desarrollo de la ciencia de los
pero no poda demostrarse, microorganismos. El trabajo posterior
consecuencia de las limitaciones de Ferdinand Julius Cohn en la
tcnicas de la poca. En 1664, Robert observacin de microorganimos
Hooke desarroll un microscopio eucariotas y bacterias (procariotas)
compuesto y lo utiliz para observar populariz el uso de los microscopios
pulgas, esponjas, plantas y mohos en la microbiologa y sent las bases
entre otros. Su trabajo fue publicado para el comienzo de la microbiologa
en Micrographia siendo muy popular. mdica fundada por Robert Koch. La
Varios aos ms tarde, el trabajo de historia de la microbiologa, como la
Anton van Leeuwenhoek, un historia del hombre, no es una
cientfico amateur con gran coleccin de eventos de progreso
habilidad para combinar lentes y lineal, sino un entramado de carreras
obtener telescopios y microscopios, de individuos brillantes y sus ideas.
permiti la magnificacin de muestras Cada nuevo descubrimiento, se basa
ms de 200 veces, generando en un descubrimiento previo y en
imgenes de mayor claridad. Pas retorno, permite otros
meses observando a travs de su cuestionamientos. La tabla siguiente,
microscopio y envi sus resume los avances que ayudaron al
observaciones a la Royal Society of desarrollo de la prctica
London, causando sensacin. microbiolgica, entre los que se
Sorpresivamente el trabajo de estos encuentra el desarrollo de la tcnica
investigadores fue abandonado por de Gram, que realizaremos en este
casi 200 aos hasta la Revolucin TP.
Through the microscope: A look at all things small. Timothy Paustian and Gary Roberts,
University of Wisconsin-
Madison. http://www.microbiologytext.com
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AO EVENTO
Robert Hooke es el primero en utilizar el microscopio para describir la esctructura
1664 reproductiva de los mohos. Tambin acu el trmino clula a partir de la observacin
de corcho vegetal.
Anton van Leeuwenhoek, un comerciante alemn y habilidoso constructor de lentes, es el
1673
primero en describir microorganismos en detalle.
Ferdinand Julius Cohn publica un trabajo decisivo en bacterias y reciclado de los
1872
materiales. Aparece un esquema de clasificacin utilizando el nombre Bacillus.
Oscar Brefeld reporta el crecimiento de colonias fngicas a partir de esporas individuales
1872 en gelatine y el botnico alemn Joseph Schroeter crece colonias bacterianas pigmentadas
en trozos de papa.
Robert Koch desarrolla mtodos de tincin de bacterias, fotografa especimenes y
1877
preparado de registro visuales permanente en cortes histolgicos.
Koch desarrolla medio de cultivo slido y mtodos para la obtencin de cultivos puros de
1881
bacterias.
Angelina Fannie and Walther Hesse en el laboratorio de Koch desarrollan el uso de agar
1882
como medio de soporte para el cultivo en medio slido.
Hans Christian Gram desarrolla un sistema de tincin para la identificacin de bacterias.
1884
[la tincin de Gram].
1887 Primer reporte de la placa de Petri por Julius R. Petri.
M. H. McCrady establece un mtodo cuantitativo para el anlisis de muestras de agua
1915
usando el nmero ms probable .
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La Pared Bacteriana
GramNegativa
Gram Positiva
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decolorados por el disolvente orgnico peptidoglucanos y polisacridos que
utilizado y presentan la coloracin de miden entre 10 a 80 nanmetros de
contraste. Casi 75 aos despus de la espesor. En las clulas gramnegativas,
introduccin de este procedimiento tan por el contrario, la pared est formada
til se observ que las bacterias G+ y por dos capas: una interior de
G-, diferan fundamentalmente en la peptidoglucanos de solo 2 a 3
estructura de la pared. Salton nanmetros de espesor, y una capa
demostr que la pared grampositiva no exterior de lipoprotenas y
se tie, sino que presenta una barrera lipopolisacridos. Estas molculas
de permeabilidad frente a la elusin estn dispuestas en forma de una
del complejo coloranteI2 por el bicapa de unos 7 a 8 nanmetros de
alcohol. La coloracin de Gram se usa espesor similar en estructura a la
ampliamente como base para la membrana celular. De modo que, el
clasificacin de las bacterias, dado que lmite de una clula gramnegativa es
refleja una diferencia fundamental en en realidad una membrana celular
la arquitectura de la pared celular. En interna, una capa de peptidoglucanos
las clulas grampositivas, la pared esta delgada y una membrana externa.
formada por una capa homognea de
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TP# 3 Morfologa Bacteriana y Tcnica de Gram
El microscopio ptico revela dos formas principales de bacterias, organismos ms o
menos esfricos conocidos como cocos (en latn, baya) y otros cilndricos denominados
bacilos (en latn bastn). Los cocos incompletamente separados pueden aparecer en cierto
nmero de formas diferentes, dependiendo de los planos en los que se dividen: cuando
aparecen predominantemente por parejas se denominan diplococos, en cadenas,
estreptococos, y en grupos reciben el nombre de estafilococos (racimo). Los cocos
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Objetivos del Trabajo Prctico:
Metodologa
Preparacin del extendido. Los portaobjetos a utilizar deben estar limpios y
desengrasados. Se coloca una gota de solucin fisiolgica por cada colonia a analizar, y
all se emulsionar una pequea cantidad de cada colonia. En caso de trabajar con
cultivo lquido se coloca una gota del cultivo directamente sobre el portaobjeto. Se
realizar tambin un hisopado de la cavidad oral-encas y se procesar el extendido como
se indica a continuacin.
Secado de la preparacin. Se realiza colocando en posicin horizontal sobre la corriente
de aire caliente de un mechero. Puede realizarse tambin en estufa.
Fijado de la preparacin. Se efecta pasando 3 veces el lado del portaobjeto que NO
TIENE la preparacin, sobre la llama del mechero para que la misma adquiera una
temperatura de aproximadamente 80 0C.
Coloracin
1. Cubrir con VIOLETA para Gram las zonas del portaobjeto que tienen la preparacin.
Dejar 20 segundos.
2. Lavar con chorro fino de agua 10 segundos.
3. Cubrir con LUGOL para mordentar. Dejar 30 segundos.
4. Decolorar durante 10 segundos con DECOLORANTE haciendo presin en el frasco
plstico, para que salga un chorro fino que arrastre el colorante.
5. Lavar con chorro fino de agua 10 segundos.
6. Cubrir con SAFRANINA. Dejar 20 segundos.
7. Secar
8.
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Desinfeccin y Esterilizacin
Definiciones
Se dice que un objeto es estril cuando carece de todo germen viable, en este contexto,
viable significa capaz de reproducirse.
El trmino desinfeccin se suele emplear para los procedimientos que eliminan o matan
a la mayora de los microorganismos viables pero no a todos. Los desinfectantes reducen
la biocarga, es decir la cantidad de microorganismos viables.
Los procesos de esterilizacin y desinfeccin son costosos y por tanto, es de suma
importancia elegir el mtodo apropiado que cause el menor dao posible al material
correspondiente. Las consideraciones siguientes influyen en la eleccin del mtodo:
Es ms fcil esterilizar un objeto limpio que otro fsicamente sucio, una biocarga baja
constituye un requisito previo para una esterilizacin con buena relacin costo /
beneficio.
La proporcin de microorganismos muertos depende de la concentracin del agente y
del tiempo de exposicin. El nmero de microorganismos supervivientes se puede
expresar por la ecuacin:
N 1/CT
Donde N es el numero de supervivientes, C la concentracin del agente y T el tiempo de
exposicin. Si una poblacin de microorganismos es expuesta a una tcnica de
esterilizacin y el logaritmo del nmero de supervivientes se representa en funcin del
tiempo, la pendiente de la curva define la tasa de muerte.
Las curvas pueden utilizarse con el fin de predecir las condiciones necesarias para
conseguir la esterilidad
El mecanismo detallado del proceso de muerte de los microorganismos quizs vare
con la tcnica de esterilizacin empleada pero el efecto neto es similar y consiste en la
inactivacin de constituyentes esenciales de la clula (cidos nucleicos y protenas).
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destruir al microorganismo. Sin embargo, la concentracin necesaria vara con el
desinfectante, el microorganismo y el mtodo de ensayo.
Mediante la siguiente expresin es posible relacionar la concentracin de la droga
empleada y el tiempo necesario para destruir una determinada fraccin de la poblacin:
Cn t = K
Donde C es la concentracin de la droga, t es el tiempo necesario para destruir una
determinada fraccin de las clulas y n y K son constantes.
Tiempo de exposicin a un agente
pH
La concentracin de in hidrgeno influye sobre la accin bactericida al afectar tanto al
microorganismo como al agente qumico.
Temperatura
La destruccin de las bacterias por los agentes qumicos aumenta junto con la
temperatura.
Naturaleza del microorganismo
La eficacia de un agente determinado depende de las propiedades del microorganismo.
Las ms importantes son: especie, fase de cultivo, presencia de estructuras especiales
(esporas o cpsulas), etc.
Presencia de materiales extraos
La presencia de materia orgnica (suero, sangre, pus) influye sobre la actividad de
muchos desinfectantes alterando su actividad y los transforma en inertes.
Tcnicas de esterilizacin
Calor
El calor, como forma de transferir energa, es el mtodo preferido para la esterilizacin,
debido a su fcil empleo, costo, control y eficacia.
a) Calor Seco:
El mecanismo esterilizador del calor seco es bsicamente la oxidacin de los
componentes celulares. La incineracin y el uso del mechero Bunsen son ejemplos de
esterilizacin por calor seco. El instrumental de vidrio se puede esterilizar durante una
hora en una estufa de aire caliente a 160-180 C.
b) Calor hmedo:
El agente ms eficaz para la esterilizacin es el vapor de agua saturado a presin
(autoclave). La destruccin de las enzimas y membranas esta influida por la
disponibilidad de agua, que modifica los enlaces hidrgeno. El vapor a presin facilita la
penetracin del calor en el material que se quiere esterilizar. Existe una relacin directa
entre temperatura y presin de vapor. El vapor a presin tiene una temperatura superior a
100 C, lo que aumenta su capacidad de matar microorganismos.
La duracin del ciclo de la autoclave est determinada por el tiempo de actuacin ms un
margen de seguridad y se calcula por las curvas de letalidad trmica para patgenos
termo-resistentes como los clostridios.
El ciclo usual de 121 C durante 15 minutos es suficiente para matar esporas de
Clostridium botulinum con un margen adecuado de seguridad.
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Filtracin
Las soluciones termo-esterilizadas contendrn pirgenos. Esos productos termoestables
de la descomposicin de los microorganismos, capaces de inducir fiebre, resultan
indeseables en preparados como los lquidos intravenosos. Los filtros modernos son de
nitrocelulosa y actan por la atraccin electrosttica y el tamao de los poros, que
retienen los microorganismos y otras partculas.
Irradiacin
El empleo de la irradiacin gamma constituye ahora el mtodo de eleccin para
esterilizar grandes lotes de dispositivos pequeo tamao como agujas, jeringas, vas
intravenosas, catteres, guantes, etc. Aunque el costo inicial del equipo es muy alto,
permite un funcionamiento continuo y proporciona una eficiencia del 100%.
La tcnica requiere instalaciones y personal especializado. El mecanismo de muerte
consiste en la produccin de radicales libres, que son eficaces para romper los enlaces del
ADN. La irradiacin, a una dosis mayor que la necesaria para las clulas vegetativas
tambin mata las esporas. Este aumento en la dosis se debe a la falta relativa de agua en
las esporas.
Agentes qumicos
La necesidad de esterilizacin mediante sustancias qumicas gaseosas y/o lquidas ha
disminuido mucho gracias al xito de la irradiacin gamma. Sin embargo, an se utilizan
el xido de etileno (gas) y el formaldehdo (liquido). Ambos son agentes alquilantes y
matan por lesin en las protenas y cidos nucleicos.
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Desinfectantes de uso hospitalario
Grupo Ejemplos Ventajas e Inconvenientes
Halgenos Hipoclorito Econmicos, eficaces, actan por
(agentes oxidantes) liberacin de cloro libre. Activos contra
virus, bactericida.
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Crecimiento bacteriano
Introduccin
En un cultivo bacteriano homogneo el crecimiento de una poblacin bacteriana se
puede predecir a travs de la siguiente relacin:
dX/dt = X (1)
siendo dX el incremento en la masa celular (biomasa), dt es el intervalo de tiempo, X es
la cantidad de biomasa, y es la velocidad de crecimiento especfica (con unidades de
tiempo inversa -1/t-).
Si es constante, integrando la ecuacin (1), queda claro que X va aumentando de
manera exponencial con el tiempo:
ln X/X0 = t (2)
donde ln es el logaritmo natural (en base e = 2.303) y X0 cuando t = 0, por lo tanto
rearreglando la ecuacin 2 se aprecia que la biomasa final ser:
X = X0 et (3)
El crecimiento bacteriano que se comporta segn esta relacin es llamado crecimiento
exponencial o crecimiento logartmico.
De estas ecuaciones puede deducirse el tiempo de duplicacin (td) cuando X = 2Xo:
td = ln 2/ = 0.693/
Estas ecuaciones predicen el comportamiento de una poblacin bacteriana slo en la
porcin de la curva de crecimiento que no es influenciada por el crecimiento de la
poblacin (es decir la fase exponencial).
En general y en este TP en particular se trabaja con cultivos bacterianos lquidos no se
agrega ni quita nada del ambiente donde se crecen las bacterias luego de inocular las
clulas a un medio de crecimiento adecuado con una composicin mas o menos
definidas. Esto significa que estos sistemas slo permitirn la multiplicacin celular por
un perodo de tiempo limitado y en el que progresivamente se producirn cambios en el
medio original y en el ambiente, producto justamente de los productos metablicos y del
consumo de los nutrientes por efecto de la masa celular en crecimiento.
En este sentido podremos definir varias etapas en una curva de crecimiento normal, cuya
validez se extiende a cultivos de clulas eucariotas.
Fase lag: durante la cual la masa celular crece pero no aumenta el nmero de clulas.
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La fase lag es debida a los cambios rpidos en los medios de cultivo, por ejemplo si
transferimos un inculo de una poblacin en crecimiento estacionario a un medio de
cultivo fresco el tiempo que tarde en llegar a fase exponencial depender del tamao de
dicho inculo. Un inculo de volumen pequeo que es transferido a un gran volumen de
medio fresco puede resultar en la salida difusional de vitaminas, cofactores e iones que
son necesarios para muchas actividades enzimticas intracelulares. Si esta transferencia
se realiza de un medio rico a un medio pobre, resultar en consecuencia en un aumento
de la fase lag y tambin puede resultar en un crecimiento exponencial pero de menor.
Hasta aqu hemos venido hablando de masa celular que resulta proporcional al nmero
de clulas slo en la fase exponencial. La masa celular se puede medir en trminos de
peso seco, pero generalmente resulta ms prctica y til la medicin por Turbidimetra en
un espectrofotmetro o en un colormetro, ya que permite seguir el aumento de la
densidad del cultivo mientras esta creciendo.
La de eleccin es 660nm ya que se evita la absorcin de partculas coloreadas del
medio de cultivo y en consecuencia el blanco hecho con medio de cultivo sin inoculo
bacteriano es similar al blanco de agua.
Cuantificacin celular
Para tener una idea precisa del nmero de clulas viables elegimos se utiliza el mtodo
de Plaqueo en medio slido.
Se efectan diluciones que son distribuidas en el agar y luego de dejar incubando una
noche a 370C se procede a contar colonias (ver nota y figura ms abajo), cuyo nmero
resulta directamente proporcional al nmero de clulas ya que cada una de ellas proviene
de una clula individual. De este concepto deriva el trmino Unidad Formadora de
Colonia (UFC). El clculo de la concentracin de clulas viables a un tiempo dado, se
realiza como se indica:
N= nmero de colonias
UFC/ml= n x FD/Vp contabilizadas
FD=Factor de dilucin (previo al
plaqueo)
Vp= volumen plaqueado
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TP#4 Cuantificacin celular en medio slido
1. Realizar diluciones seriadas al 1/10 (ver figura) del cultivo a cuantificar, utilizando
medio LB (Vf=1ml). Tener la precaucin de homogenizar la suspensin celular antes de
pipetear.
VSv:
900L
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ESPECTROFOTOMETRIA
Transmitancia
Cuando una solucin es puesta en presencia de un haz de luz, debido a la interaccin
entre los fotones y las partculas absorbentes de la muestra, la potencia del haz se atena
de P0 a P. La transmitancia T de la solucin es por lo tanto, la fraccin de radiacin
incidente transmitida por la solucin.
T = P/P0
Absorbancia
La absorbancia de una solucin se define por la ecuacin:
A = - log10T = log P0/P
A diferencia de la transmitancia, la absorbancia de una solucin aumenta cuanto mayor
es la atenuacin del haz.
Por lo tanto T y A son conceptos que definen la cada de la potencia radiante P0, luego de
atravesar una capa de solucin de una especie absorbente de concentracin c y de b cm.
de grosor.
P0 P
Solucin absorbente de
concentracin c
Absortividad y absortividad molar
La absorbancia es directamente proporcional a la longitud b de la trayectoria a travs de
la solucin, y a la concentracin c de la especie absorbente. Estas relaciones se expresan
por
A = abc
Donde a es una constante de proporcionalidad denominada absortividad, caracterstica
para cada solucin en particular, tan invariable como el punto de fusin, de ebullicin o
los ndices de refraccin. La magnitud de a depender de las unidades utilizadas para b y
c. Frecuentemente b se expresa en centmetros y c en gramos por litro. Entonces la
absortividad tiene unidades de (g/l)-1 y cm-1. Cuando la concentracin se expresa en
moles por litro, la absortividad se denomina Absortividad molar.
A = bc
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Ley de Lambert Beer
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d) Detectores de radiacin: receptor que transforma la seal luminosa en corriente
elctrica.
e) Sistemas de procesamiento y dispositivos de lectura de las seales: voltmetro que
registra la corriente elctrica en una escala general. Normalmente en los
espectrofotmetros se pueden encontrar 2 escalas: 1) %T (transmitancia), 2) A
(absorbancia).
UV VISIBLE IR
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TP# 5 Cuantificacin del Crecimiento Celular
(Turbidimetra)
OBJETIVOS
MATERIALES
DESARROLLO
De esta manera se seguir la curva de crecimiento a lo largo del TP, midiendo la DO600 a
diferentes tiempos, en diferentes condiciones (que sern indicadas por los docentes) y se
graficar los valores de absorbancia en funcin del t.
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Preparacin de Medios de cultivo
LB-caldo LB-agar
10g triptona (o hidrolisado de casena) Al medio LB agregar 15 g de agar
5 g extracto de levadura
10g NaCl Autoclavar. Dejar enfriar (50-60 oC)
Csp 1L antes del agregado de antibiticos si es
(ajustar si es necesario a pH 7.4 con necesario, y luego del templado volcar
NaOH 1N) en placas de Petri. Dejar solidificar y
Autoclavar a 121 oC, 20 min. colocar unas h a 37 oC para eliminar el
exceso de humedad y conservar en
heladera.
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TP# 6 Cuantificacin de Protenas
Introduccin
Existen dos tipos de mtodos que pueden ser empleados para estimar la concentracin de
protenas en una muestra:
- Absorcin de luz ultravioleta (UV)
- Mtodos colorimtricos
Objetivo
Determinacin de la concentracin proteica de una muestra utilizando el mtodo
colorimtrico de Bradford.
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Materiales
Solucin madre de Albmina bovina (BSA)
Solucin cida del reactivo de color (Coomassie Blue G)
NaOH 1 M
Agua destilada
Tubos de hemlisis
Pipetas automticas
Espectrofotmetro
Metodologa
Reactivo de color:
Se disuelve 100 mg de Serva Blue G en una mezcla de 100 ml de 85% de cido fosfrico
y 50 ml de etanol 95%, despus de la completa disolucin del colorante se lleva el
volumen a 1 litro con agua.
Procedimiento:
Se realizarn previamente las diluciones correspondientes para la curva de calibrado y de
las muestras incgnitas.
1- Prender el espectrofotmetro 15 minutos antes de usarlo
2- Poner 20 l de la muestra en los tubos. Agregar 50 l de NaOH a la muestra
3- Agregar 1 ml del reactivo de color e incubar durante 5 minutos
4- Medir la absorbancia a la longitud de onda correspondiente en una cubeta de plstico
o de vidrio.
5- Obtener la curva patrn (Cc vs A595) y a partir de esta, obtener la concentracin de las
muestras incgnita.
41
Autoevaluacin
Confeccin de la curva de calibrado
1- Teniendo en cuenta que el rango de deteccin para este mtodo va de 0.2 a 20 g,
calcular las diluciones que hay que preparar a partir de una solucin madre de BSA
de 1mg/ml, para construir una curva de calibrado de al menos 5 puntos.
2- Cul es la longitud de onda a la deber leer las muestras luego de reaccionar con el
reactivo de color?
4-Usted cuenta con una solucin de albmina pura y quiere determinar su concentracin.
Se le ha acabado el Coomassie y por problemas presupuestarios no puede comprarlo por
ahora y no tiene nadie que le preste un poco. Sin embargo cuenta en el laboratorio con
un espectrofotmetro que lee hasta 280 nm, cubetas de plstico y de cuarzo.
Podr calcular la concentracin de la solucin? Qu precauciones debera tener? Podr
hacer lo mismo con una solucin mezcla de protenas?
Conclusiones
Confeccione un informe graficando la curva de calibracin y calcule la concentracin de
la muestra incgnita. Coinciden los resultados observados con los esperados?.
42
Centrifugacin
rw2
Vs = Vg
g
De esta ecuacin se puede deducir que la velocidad de sedimentacin de una partcula
puede aumentar por:
1- aumento del dimetro de la partcula (D)
2- aumento de la diferencia entre las densidades de la partcula y el fluido (1 - 2)
3- aumento de la velocidad de centrifugacin (w)
4- disminucin de la viscosidad del liquido de la suspensin
Adems aumentando el tiempo a que la partcula es sometida a la fuerza centrfuga,
mayor ser el desplazamiento de la misma desde el centro de rotacin, de acuerdo a:
Vs t = distancia recorrida
Esto se logra aumentando el tiempo de centrifugacin
A bajas velocidades de centrifugacin se podrn sedimentar clulas enteras pero
quedarn en suspensin los componentes celulares como ncleos, mitocondrias y restos
43
de membranas, a estos habr que aplicarles, segn su tamao, mayor velocidad de
centrifugacin para sedimentarlos.
44
TP # 7 Permeabilidad de las Membranas Celulares
Introduccin
Las membranas biolgicas tienen la propiedad de ser semipermeables y selectivas. Las
sustancias pueden atravesar la membrana celular por difusin pasiva o por alguno de los
mecanismos de transporte activo El transporte de las molculas depende de su peso
molecular, su carga elctrica y del coeficiente de solubilidad en lpidos. La difusin se
produce cuando existe un gradiente de concentracin, y ocurre desde el lugar de mayor
concentracin hacia el de concentracin menor.
La membrana celular mantiene un balance entre la presin osmtica de los lquidos
intracelulares e intersticiales. Las soluciones pueden ser isotnicas, hipotnicas o
hipertnicas respecto al lquido intracelular.
Objetivos
Determinacin de la hemlisis y resistencia globulares
Materiales
Ratas
Heparina
ClNa
Sacarosa
Agua destilada
Jeringas y agujas 23 G
Alcohol 96%
Gradillas con tubos de hemlisis
Centrfuga
Espectrofotmetro
Microscopio
Portaobjetos y cubreobjetos
Metodologa
Obtener sangre de una rata mediante puncin cardiaca con jeringa heparinizada.
Preparar una batera de tubos de hemlisis con distintas soluciones de ClNa (5 mL
volumen final) , como indica la tabla adjunta. Agregar 50 l de sangre suavemente en
cada tubo. Se agitan suavemente los tubos y se colocan en la gradilla en orden creciente
de concentracin. Luego de 10 minutos se centrifugan las distintas muestras (1500 rpm, 5
minutos).
45
Tabla 1:
Conclusiones
Confeccionar un informe luego de observar la turbidez, tonalidad, microscopa de los
sedimentos y lectura espectrofotomtrica correspondiente al sobrenadante cada tubo
(480nm). El mismo debe contener resultados obtenidos y conclusiones.
Autoevaluacin
1) Esquematice la estructura de la membrana plasmtica. Mencione brevemente la
funcin de cada uno de sus componentes.
2) Explique los mecanismos por los cuales son incorporados los siguientes elementos a
las clulas considerando los componentes de la membrana involucrados y el
requerimiento energtico: glucosa, Na+, agua, bacterias, hormonas esteroideas, glicerol,
Cl-, micropartculas inertes.
46
Cultivo de Tejidos
47
INFINITAS. La razn de la inmortalizacin de estas clulas en muchos casos es
desconocida generalmente estn relacionadas con la perdida espontnea o inducida de
las vas de control del ciclo celular. Las lneas celulares continuas estn formadas por
clulas que se diferencian gentica y morfolgicamente de las clulas de las cuales se
originaron. Pueden provenir de clulas derivadas de tumores o de una lnea primaria que
ha sido transformada mediante la transfeccion de oncogenes o el tratamiento con
carcinognicos. Este tipo de cultivo tiene la caracterstica de ser aneuploide, de no tener
inhibicin por contacto y de crecer de manera indefinida. Entre las lneas mas conocidas
se encuentran las HeLa, K-562, Meg-01.
Condiciones de Cultivo
Recipientes de cultivo: placas de petri, multiplacas, etc.
Sustrato: Muchas lneas celulares crecen en monocapas unidas a un soporte ms o
menos slido (vidrio, superficies plsticas, superficies tratadas con colgeno, fibronectina
o gelatina). Aquellas lneas que para proliferar necesiten adherirse se conocen como
dependientes de anclaje, las lneas que crecen en suspensin son por lo tanto
independientes de anclaje.
Fase gaseosa:
a) Oxgeno: Las necesidades de oxigeno de la mayora de los cultivos esta cubierta por la
presin atmosfrica de este gas.
b) Dixido de Carbono: Este gas es fundamental porque influye en la cantidad de CO2
disuelto el pH y la cantidad de iones HCO3-
Las reacciones que tienen lugar son:
H2O + CO2 H2CO3 H+ + HCO3- (1)
NaHCO3 Na+ + HCO3- (2)
El incremento de la concentracin del ion HCO3- desplaza la ecuacin (1) hacia la
izquierda de modo que el pH se establezca en 7.4. Cada medio tiene una concentracin
recomendada de bicarbonato y presin de CO2 para alcanzar el pH correcto.
pH y capacidad buffer: El pH ptimo de crecimiento para la mayora de los tipos
celulares es 7.4. El indicador de pH que se suele usar es rojo fenol. El medio de cultivo
debe tener capacidad buffer, a fin de evitar cambios bruscos de pH. El sistema buffer mas
utilizado es el del bicarbonato
Temperatura
48
Medio de cultivo: formado por los siguientes elementos:
1. Soluciones salinas equilibradas
2. Aminocidos
3. Vitaminas
4. Otros suplementos orgnicos de bajo peso molecular
5. Hormonas y factores de crecimiento (suero)
6. Antibiticos y antifngicos.
Algunos de los medios mas utilizados son: Medio Mnimo Esencial de Eagle (MEM);
RPMI 1640, MEM modificado (DMEM); Medio 199.
Los medios no definidos son aquellos que deben ser suplementados con suero. Alguno de
los mas empleados son: suero de ternera (calf serum, CF), fetal bovino (fetal calf serum,
FCS); suero de caballo (horse serum, HS); y suero humano (Human serum, HuS). A
pesar que la composicin del suero es conocida, los componentes presentes pueden tener
concentraciones variables que podran influir en el cultivo. El tipo de medio de cultivo y
como ser suplementado depende de los requerimientos de la lnea celular a cultivar.
Los estudios que emplean cultivos celulares abarcan gran nmero de disciplinas y
aproximaciones al estudio del fenmeno celular como: actividad intracelular, ecologa e
interacciones celulares. Dentro de las reas de estudio que ms utilizan este tipo de
tecnologa se encuentran la virologa, inmunologa y aquellas disciplinas dedicadas a la
investigacin del cncer.
49
La Fagocitosis: Resea histrica
Introduccin
Los macrfagos pulmonares clulas ingieren el material extrao
constituyen la primera lnea de que llega al pulmn mediante el
defensa del organismo evitando la proceso de fagocitosis. Muchos
entrada de una gran variedad de patgenos infectan y replican dentro
sustancias como: gases atmosfricos, de los macrfagos, interfiriendo con
partculas de polvo, aerosoles y los procesos celulares que eliminan a
microorganismos. A pesar del gran la mayora de los microorganismos.
nmero de partculas infecciosas que En el siguiente sitio de la revista
son depositadas continuamente sobre Nature, se muestran estos eventos en
las paredes alveolares del pulmn, su Listeria monocytogenes, Legionella
superficie generalmente se encuentra pneumophila y M. tuberculosis:
estril. El poder bactericida del http://www.nature.com/nrmicro/ani
pulmn se debe al potencial fagoctico mation/imp_animation/allthree_qt.m
y ltico (proteasas, elastasas, etc.) de ov
los macrfagos alveolares. Estas
50
TP # 9 Fagocitosis de partculas por macrfagos alveolares
Objetivos
Objetivo 1. Obtener una poblacin casi homognea de macrfagos alveolares
mediante lavado bronqueoalveolar (BAL)
Objetivo 2. Estudiar el fenmeno de fagocitosis in vitro a distintas temperaturas.
Objetivo 3. Cuantificacin Celular: empleo de cmara de Neubauer
Materiales
Ratas, ratones o hmsters
Anestsico
Cnulas nasofaringeas de polietileno
Jeringa
PBS y PBS libre de Ca+2 Mg+2
Material de ciruga
Tubos de centrfuga
Centrfuga de mesa
Medio de cultivo Dulbecco o RPMI 1640
Partculas de hierro
Cpsulas de Petri
Bao termostatizado o estufa a 37C
Alcohol 96%
Colorante vital azul de tripn o rojo neutro
Colorante hematoxilina
Microscopio ptico
Cmara de Neubauer
Metodologa
Obtencin de los macrfagos:
Anestesiar al animal, exponer la trquea e introducir una cnula adosada a una jeringa de
3ml que contenga PBS libre de Ca+ Mg+. Masajear suavemente la caja torxica y
recuperar la solucin. Descartar este primer lavado alveolar. Repetir el procedimiento y
guardar la solucin recuperada en un tubo de centrfuga. Repetir este procedimiento 10-
12 veces. Centrifugar el material recolectado 10 minutos a 800 x g. Descartar el
sobrenadante y resuspender el pellet en medio RPMI-1640 y contar el nmero de clulas.
Evaluar la viabilidad celular de los macrfagos alveolares obtenidos utilizando algn
colorante vital. Sembrar las clulas en cpsulas de Petri e incubar en cmara de cultivo
(37C, 5 % CO2).
Exponer los cultivos celulares a las a partculas previamente sonicadas. El
volumen a utilizar de la suspensin ser indicado por los docentes.
Incubar 1 h a 4C, 20C (T ambiente) y a 37C.
Descartar el medio, lavar las clulas con PBS y fijarlas con alcohol 96%. Teir
las clulas con hematoxilina
Observar bajo microscopio.
51
Anlisis de Resultados
- Graficar el nmero de clulas que incorporaron partculas de hierro vs las distintas
temperaturas.
Confeccionar un informe final analizando los resultados obtenidos.
Nota 2: Como consecuencia de los tiempos necesarios para el establecimiento del cultivo
de macrfagos, los alumnos recibirn las cajas de Petri conteniendo clulas extradas
previamente. Durante la prctica, se realizar un BAL en animales de laboratorio, tal como
indica el protocolo descripto. Las clulas obtenidas por los alumnos, sern utilizadas para
evaluar el rendimiento de dicho protocolo mediante la cuantificacin celular utilizando la
cmara de Neubauer.
Autoevaluacin
Objetivo 3
Materiales
-Cmara de recuento/ cmara de Neubauer/ hemocitmetro
-Microscopio
-Suspensin celular
Procedimiento:
-Realizar una dilucin de la muestra utilizando en colorante azul de trypan.
-Cargar la cmara con una micropipeta como se indica en la figura.
- .
52
Recuento Celular
Cada cuadrado del hemocitmetro (16 cuadrados menores) representa un volumen total
de 0.1 mm3 o 10-4cm3. Como 1 cm3 es aproximadamente equivalente a 1 ml, la
concentracin celular por ml (y el nmero total de clulas) se determina realizando los
siguientes clculos:
Clulas totales:
Clulas por ml x el volumen original de la muestra
53
TP # 10 Divisin Celular: Mitosis
Divisin Celular
Mitosis: La divisin mittica da lugar a dos clulas hijas que poseen copias
idnticas del genoma de la clula original. El ADN se replica antes del inicio de la
divisin celular (periodo S). El periodo entre los episodios sucesivos de divisin
celular se denomina interfase. La secuencia de acontecimientos que ocurren
durante la mitosis se ha dividido en cinco fases: profase, prometafase, metafase,
anafase y telofase.
Objetivo
54
Divisin Celular: Meiosis
Objetivo
Esquematizar las diferentes fases de la meiosis en cortes histolgicos de testculo
de rata y/o vizcacha.
55
El ADN: Resea histrica
"The instant I saw the picture, my mouth fell open and my pulse began to race"
Watson, The Double Helix (1968).
El descubrimiento de la doble
hlice fue publicado en Nature el 25 de
Abril de 1953 'A Structure for
Deoxyribonucleic Acid' by Watson, J.F.,
and Crick, F.H.C. Los autores
comprendieron que del modelo de
apareamiento de bases especfico que
proponan, se desprenda directamente
un posible mecanismo de copiado del
material gentico.
En 1962, Watson and Crick
recibieron el premio Nobel de Fisiologa
y Medicina, junto a Maurice Wilkins,
quien haba publicado junto a R. Franklin
el importante trabajo de cristalografa, en
el mismo nmero de Nature. Rosalind
Franklin, cuya fotografa di un indicio
importante a Watson, muri en 1958.
Los cientficos se preguntan si hubiese
sido distinguida con el premio si hubiera
estado viva.
56
Extraccin de ADN
Introduccin
1) Cultivo y recoleccin.
2) Lisis celular.
3) Eliminacin de los restos celulares.
4) Concentracin de ADN puro.
2-Lisis celular: Todos las clulas bacterianas estn rodeadas por una rgida pared celular.
Para liberar los componentes celulares de estas barreras, se utiliza la lisis qumica. Esta
lisis qumica, suele involucrar un agente que ataca a la pared y otro que rompe la
membrana.
3-Eliminacin del debris celular: Este proceso puede llevarse a acabo por centrifugacin,
dejando el extracto celular como un sobrenadante claro que contiene ADN; ARN; y
algunas protenas y el pellet con restos de membrana celular.
Los procedimientos estndar para eliminar los contaminantes del ADN son los
siguientes:
57
En este punto hay que hacer una importante distincin entre la purificacin de ADN
cromosmico y la purificacin de ADN plasmdico: en una preparacin de plsmido, siempre
es necesario separar el ADN plasmdico de la gran cantidad de ADN cromosmico bacteriano que
est tambin presente en las clulas. Actualmente existen varios mtodos para la
separacin de ambos tipos de ADN, basados en diferencias fsicas entre el ADN
plasmdico y al ADN cromosmico. De estas diferencias, la ms utilizada es el tamao.
Los plsmidos ms grandes son solamente el 8% del tamao del
A-Soluciones:
1- Buffer TE 10 X: EDTA Tris-HCl 100mM pH 8,0
2- Dodecil sulfato de sodio (SDS) 10%
3- Proteinasa K, 10 mg/mL
4- Cloroformo/alcohol isoamlico 24:1
5- NaCl 5M
6- Isopropanol
B- Materiales
1- Cultivo en fase exponencial E. coli DH5
58
2- Tubos eppendorf de 2 mL: 3 por grupo
3- Bao termostatizado regulado a 65 C
4- recipientes con hielo granizado
5- guantes
6- pipetas automticas
7- capilares o varillas de vidrio
Previo al inicio del protocolo: Preparar el bao a 65C, dispensar 2mL del cultivo en
los tubos eppendorf. Sellar uno de los extremos de los capilares (se usar 1 por
grupo). Poner en hielo o congelador el isopropanol. Tener preparado por cada grupo
un tubo con 200 uL de buffer TE 1X.
Procedimiento
1) Centrifugar por 2 min los tubos con clulas. Descartar el SN y eliminar las
trazas de medio en papel absorbente.
2) Resuspender el pellet en 400 uL de buffer TE, asegurndose de que no
queden grumos.
3) Agregar 50 uL de SDS 10 % y 10 uL de PK, mezclar el tubo por inversin e
incubar 20 min a 65C (la suspensin se torna transparente).
4) Agregar 100 uL de NaCl, mezclar.
5) Agregar 600 uL de Cloroformo/alcohol isoamlico. Mezclar repetidas veces por
inversin hasta tener una solucin homognea (1 fase) y blanquecina.
6) Centrifugar a 12.000xg por 10 min (se forman dos fases).
7) Transferir la fase acuosa (superior) a un nuevo tubo. Hacerlo cuidadosamente
con pipeta, evitando levantar la capa blanquecina que se encuentra en la
interfase.
8) Agregar suavemente con pipeta 400 uL de isopropanol fro (evitando que se
mezclen las fases).
9) Introducir suavemente un capilar en el tubo hasta la interfase y realizar muy
suavemente movimientos circulares en la interfase, y comenzarn a
visualizarse las hebras de ADN de color blanquecino.
10) Pese a que la idea es que por los movimientos circulares y la carga de la
varilla, el ADN se enrolle a esta; esto es difcil de lograrlo en microtubos. Por
lo tanto, luego de haber realizado esta observacin, retirar la varilla, cerrar el
tubo e invertir cabeza-cola unas 15-20 veces. De esta manera el ADN formar
una masa algo ms compacta y visible. Abrir el tubo, y con la misma varilla,
retirar el ADN, colocndolo suavemente, agitando la varilla en un tubo
conteniendo EDTA 1X.
11) Conservar a 4 C para permitir su completa resuspensin.
59
ELECTROFORESIS: Geles de Agarosa
INTRODUCCIN
Los geles pueden confeccionarse de varias formas, tamaos y porosidad, y pueden correr
horizontales los agarosa y verticales los de poliacrilamida, en un campo elctrico de
fuerza y direccin constante. La eleccin dentro de estos parmetros depende
principalmente del tamao de los fragmentos que se desean separar. Los geles de
poliacrilamida son ms efectivos para separar fragmentos pequeos de ADN (5 a 500
pb), y su poder de resolucin es extremadamente grande, pudiendo separar fragmentos
que difieren en 1 pb.
Los geles de agarosa, poseen un poder resolutivo menor respecto de los geles de
poliacrilamida, pero poseen un rango mayor de separacin. Mediante concentraciones
variables de agarosa, se pueden separar fragmentos de ADN desde 200 pb hasta
aproximadamente 50 kb de longitud.
60
Factores que afectan la tasa de migracin del ADN en geles de
agarosa
Las molculas de ADN de doble cadena, migran a travs de la matriz del gel, a tasas que
son inversamente proporcionales al nmero de pares de bases que ellas contienen. En
consecuencia, las molculas ms grandes, migran mucho ms lentamente debido a que
sufren una gran friccin y resistencia.
2) Concentracin de Agarosa
4) Voltaje aplicado
El comportamiento del ADN en geles de agarosa, a diferencia de lo que ocurre con los
geles de poliacrilamida, no esta afectado significativamente por su composicin de bases
ni por la temperatura a la cual se corre el gel.
Por lo tanto, en geles de agarosa en un campo elctrico de direccin constante, la
movilidad electrofortica de fragmentos de ADN de diferentes tamaos no cambia entre
4 C y 30 C.
61
6) Presencia de colorante intercalares:
Una vez efectuada la siembra de todas las muestras, se procede a tapar la cuba de
electroforesis y a conectar los cables correspondientes para aplicar el voltaje deseado. As
el ADN migrar hacia el nodo (rojo). El voltaje aplicado ser de 1-5V/cm (medido
como la distancia entre los electrodos). Si los electrodos se colocaron correctamente, se
formarn burbujas en el nodo y el ctodo y en unos pocos minutos el azul de
bromofenol comenzar a migrar desde el lugar de siembra.
El gel se corre, generalmente, hasta que el frente de corrida (formado por los colorantes
del loading buffer) haya migrado una distancia apropiada a travs del mismo.
La presencia de BrEt permite que el gel pueda ser examinado bajo luz U.V. en cualquier
momento durante la corrida.
En principio, la corrida puede efectuarse en presencia o en ausencia del BrEt tanto en gel
como en buffer. Si se efecta en ausencia del colorante, es necesario teir el gel una vez
finalizada la electroforesis (sumergiendo el gel en una solucin de BrEt (0.5g/ml en
buffer de corrida al 1X)
62
Geles de Agarosa: Visualizacin del ADN
NOTA: El BrEt se utiliza para la visualizacin tanto de ADN como de ARN simple o
doble cadena. No obstante, la afinidad del colorante por los cidos nucleicos de simple
cadena es menor y por lo tanto la fluorescencia impartida es ms pobre.
63
TP #12 Anlisis del ADN
Objetivo
Nota 1: El BrEt, en esta prctica se encuentra mezclado en el loading buffer para mayor
seguridad. Es de suma importancia usar guantes durante la prctica.
64
Electroforesis: Geles de Poliacrilamida
PAGE (PoliacrylAmide Gel Electrophoresis)
Introduccin
La separacin electrofortica La carga por unidad de masa difiere
de protenas ha sido introducida en de protena en protena.
los aos 1960s por Samuel Raymond. A un pH determinado y bajo
Modificaciones posteriores como la condiciones nativas, la separacin
utilizacin de SDS y un agente electrofortica de protenas est
reductor como el -mercaptoetanol determinada por el tamao y la carga
han optimizado esta tcnica, de las molculas.
convirtiendo al SDS-PAGE en una de Casi la totalidad de las electroforesis
tcnicas ms utilizadas en la de protenas analticas se realizan bajo
actualidad para estudios bioqumicos condiciones que aseguran la
y de biologa molecular. disociacin de de las protenas en sus
Bsicamente, la tcnica consiste en subunidades polipeptdicas
someter a una muestra compleja a un individuales y que minimizan su
campo elctrico que se establece entre agregacin (condiciones
un par de electrodos de platino a desnaturalizantes).
travs de una solucin acuosa. La Comnmente se emplea el detergente
muestra migrar en una matriz aninico SDS en combinacin con un
(poliacrilamida) de acuerdo a distintas agente reductor y calor para disociar
propiedades, tal como se explica a las protenas antes de su siembra en el
continuacin. gel. El polipptido desnaturalizado
Las protenas son molculas une al SDS y queda homogneamente
anfotricas, su carga neta est cargado. Como la cantidad de SDS
determinada por el pH del medio. De unido es proporcional al peso
esta manera, en una solucin con un molecular del polipptido e
pH por encima de su punto independiente de su secuencia, el
isoelctrico, la protena tiene carga complejo SDS-polipptido migra a
neta negativa y migra hacia el nodo travs del gel de poliacrilamida de
(+). Contrariamente, debajo su punto acuerdo al tamao (ver figura). Como
isoelctrico, est positivamente la distancia de migracin est
cargada y migra hacia el ctodo (-). relacionada con la masa molecular del
polipptido, entonces el SDS-PAGE
no solo separa una mezcla compleja
de protenas en bandas individuales,
sino que tambin permite estimar la
masa molecular de cada banda que
representa un polipptido.
65
Los geles son preparados utilizando armadores especiales donde se monta el
dispositivo de la figura de ms abajo. Se vuelcan las soluciones de gel separador (A)
y posterior a la polimerizacin se vuelca sobre ste, el gel concentrador (B) y se
coloca el peine que formar los lugares de siembra (wells). Una vez polimerizado el
gel, el peine se retira. Se muestra tambin una cuba donde se coloca el gel, se
siembra la muestra, se cubre con el buffer de corrida y se conecta a la fuente de
poder. Los modelos varan de acuerdo al fabricante.
Ctodo
Peine
Well/calle Compartimento
A Vidrio para buffer
posterior
Spacer
(entre los 2
vidrios)
B Vidrio
nodo
anterior
MPM 7% 10% 12 %
60 kDa >
TP # 13 Separacin de Protenas
Objetivo:
Nota:
-No es necesario trabajar en esterilidad
-Preparar con anterioridad el bao de agua y asegurarse de contar con flotadores
para tubos eppendorf.
Nota: Preparar las soluciones de cada tipo de gel sin Persulfato de Amonio,
este se agrega en el momento de utilizarlo.
65
Primero colocar el gel separador. Cubrir la superficie con etanol 96%, n-
butanol o agua.
Dejar polimerizar a temperatura ambiente (el tiempo depende de la T
ambiental).
Remover el etanol.
Agregar el gel stacking y colocar el peine.
Dejar polimerizar a temperatura ambiente unos minutos.
Colocar el gel en la cuba de corrida. Remover el peine. Agregar el buffer
de corrida hasta cubrir las calles.
Sembrar las muestras (Vmax=15ul)
3. Condiciones de corrida:
Setear la fuente de poder 50mA/150 Volt. Cortar la corrida cuando el colorante
llegue al final del gel.
Anlisis de resultados
66
Soluciones
-10X Buffer de corrida (Tris glicina) -2X Buffer de siembra (cracking buffer)
32 g Tris base Tris-Cl pH 6.8 125 mM
144 g Glycine glycerol 20%
AguaCsp/1L bromophenol blue 0.2 %
Preparar para la corrida el buffer 1X- SDS 4%
SDS 10 % B-mercaptoetanol 200 mM
67
PROBLEMAS
http://www.sciam.com/article.cfm?id=what-are-we-thinking-when
68
PRIMERA PARTE
SOLUCIONES
1) Cmo preparara:
a) 1000 ml de una solucin NaCl 0,32 M
b) 500 ml de NaCl al 0,9 %
c) Una solucin de NaCl que sea isoosmolar con una solucin de CaCl2 al 0,9
%
3) Ud. desea preparar 1000 ml de una solucin de NaCl al 0,9 % que contenga
PMSF 1 mM. El PMSF (P.M. = 174,2) es poco soluble en agua y muy soluble en etanol.
Cmo resuelve el problema?
69
c) Cuntas veces respecto de la solucin B se diluy C y D?
Problema 1.
70
SEGUNDA PARTE
71
Problema 2.
Durante los aos 50 exista un gran debate con respecto a cul de las
macromolculas era la encargada de portar la informacin gentica. Dos
macromolculas se disputaban la funcin, las protenas y los cidos nucleicos.
Con el objetivo de dilucidar ese debate, los investigadores Martha Chase y
Alfred D. Hershey realizaron el siguiente experimento.
Utilizaron unos virus capaces de infectar clulas baterianas, denominados
bacterifagos, que consisten en una cpisde proteica que engloba a una nica
molcula de ADN.
Nivel de radiactividad
Fraccin marcada Cultivo 1 Cultivo 2 Cultivo 3 Cultivo 4
Protena marcada con S35 5 2 10 4
ADN marcado con P32 87 89 95 90
72
Problema 3.
Polo -
40KDa 40KDa
22KDa 22KDa
10KDa 10KDa
5KDa 5KDa
Polo +
73
Problema 4.
74
:
75
1-Qu tipo de modificacin representa la ADP-ribosilacin?. Proponga un
mecanismo que explique el efecto observado (activacin constitutiva de la
adenilato ciclasa)Qu efecto espera en la clula?.
2-Cul de los preparados es el ms efectivo?
76
-Para este experimento podra haber utilizado otra lnea celular? Justifique.
Problema 5.
Para que los espermatozoides sean funcionales (y ser capaces de fecundar los
oocitos) luego de la liberacin del tracto reproductivo de los mamferos, se
requieren desde unas pocas a varias horas, dependiendo de la especie. A
travs del tiempo, el espermatozoide sufre una serie de eventos de maduracin
post-liberacin colectivamente conocidos como capacitacin. El pptido
promotor de la fertilizacin (FPF), la adenosina y calcitonina, presentes en el
77
plasma seminal, son molculas que promueven y regulan la capacitacin. La
evidencia actual seala a estas molculas como primeros mensajeros que
regulan la produccin de un segundo mensajero, cAMP por la adenilato ciclasa
(AC).
78
El calcio es un in que acta como segundo mensajero. Puede decr quin es
79
Material suplementario Problema 4:
1) ADP-ribosilacin
2) Leyendas de figuras
Fig1. Efectos inhibitorios de R. rhizoma sobre la ADP-ribosilacin catalizada por CT. Se agreg
1 ug de CT con las cantidades indicadas de R. rhizoma (), Taninos de RG (), gallato
epigallocatecin (), emodina () y seredina(). Los valores representan duplicados de un
experimento representativo de tres. B) Efectos de R. rhizoma en la acumulacin de fluidos en
loops del leon. Cada ratn fue inyectado con 0,1 ml de una solucin conteniendo 100 ng de CT
y las cantidades indicadas de R. rhizoma (), Taninos de RG (), gallato epigallocatecin (),
emodina ()y seredina(). El ratn fue sacrificado a las 6 horas y se determin la proporcin de
la acumulacin de fludos (mg/cm).
3) La lnea celular Caco-2 es una lnea celular inmortalizada generada a partir de clulas
epiteliales humanas de adenocarcinoma colorectal.
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