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UNIVERSIDAD AUTNOMA DE NAYARIT

UNIDAD ACADMICA DE CIENCIAS QUMICO


BIOLGICAS Y FARMACUTICAS
ACADEMIA DE FISIOLOGA BACTERIANA

Gua De Aprendizaje De Fisiologa Bacteriana


2017

Integrantes de la Academia Elaboraron


DRA. JACKELINE LIZZETA ARVIZU GMEZ
DRA. JACKELINE LIZZETA ARVIZU GMEZ DRA. ADELA YOLANDA BUENO DURN
DRA. ADELA YOLANDA BUENO DURN DRA. VERNICA ALEJANDRA MONDRAGN JAIMES
DRA. VERNICA ALEJANDRA MONDRAGN JAIMES
M. en C. GUADALUPE HERMINIA VENTURA RAMN
QFB. ROBERTO GONZLEZ SALAZAR

INTRODUCCIN

Tienes en tus manos la gua de aprendizaje de Fisiologa Bacteriana. Esta


gua te permitir, junto con el cronograma, programar los temas que irs
aprendiendo a lo largo del periodo. Esta gua est dividida por Unidades y por
sesiones. Al observar el cronograma, podrs saber qu tema o temas vers en
cada clase o sesin. Recuerda, que en la UAN, el proceso de enseanza-
aprendizaje est centrado en ti, es decir, t eres el responsable de tu
aprendizaje. Esta gua te servir para programar y estudiar antes de cada
sesin. Cada unidad tiene los objetivos que debers alcanzar al trmino de las
sesiones. Adems, tiene una lista de conceptos u objetos del aprendizaje que
te pueden servir de gua para estudiar e investigar acerca de la unidad en
diferentes libros o materiales de consulta. Las sesiones estn programadas
para que abarquen entre una y dos clases, segn las horas. As que es
importante que revises el cronograma para tu programacin. Seguramente,
notas la insistencia en la programacin, esto se debe a que la presente gua es
eso, una gua para que vayas abordando los temas junto con el facilitador.

Prepara y estudia con anticipacin. Das antes de iniciar una clase,


debers estudiar (investigar, leer y comprender acerca de) los objetos de
estudios o conceptos que se enlisten en esta gua para la sesin
correspondiente. Para cada sesin, aparece una pregunta problematizadora
que deberas intentar resolver ANTES de llegar a la clase. Las actividades de
aprendizaje se refieren a lo que debes hacer para aprender del tema dentro o
antes de la clase en aula. ASEGRATE que al final de la clase tengas la
pregunta problematizadora resuelta en tu portafolio, si no es as, pregunta al
facilitador. Recuerda que el profesor no te contestar la pregunta sino que te
facilitar el poder hacerlo. Tambin, RECUERDA que al finalizar la clase
debers realizar la actividad integradora. T decides si lo haces
inmediatamente despus de la clase o despus. Pero no olvides que la
actividad integradora de una sesin debes llevarla ya hecha para la siguiente
sesin. Esto asegurar que aprendas correctamente lo que veas en las sesiones
siguientes. Independientemente de los criterios de evaluacin, hacer la
actividad integradora y responder la pregunta problematizadora clase a clase,
te asegurar que aprendas lo que necesitas acerca de la FISIOLOGA
BACTERIANA. Tu aprendizaje depender de tu esfuerzo y tu trabajo. XITO! Y
no olvides llevar la gua, el cronograma y el programa a cada clase de Fisiologa
bacteriana, ellos sern tu mejor compaa en la Unidad de Aprendizaje.

UNIDAD I. ASPECTOS GENERALES BACTERIANOS


Dra. Vernica A. Mondragn Jaimes, M. en C. Guadalupe Herminia Ventura Ramn

1.1 CITOESQUELETO BACTERIANO

Objetivo de la Unidad I.
En esta unidad, comprenders y manejaras todos los elementos necesarios en
los que se sustenta la Fisiologa bacteriana.

Conceptos:
Citoesqueleto protofilamentos polimerizacin
segregacin conjugacin homologa
actina tubulina divisoma
FtsZ MreBCD ParM
FtsA CreS
Elementos:
Actina Tubulina
Protenas relacionadas a la tubulina Divisoma
Protenas relacionadas a la actina Protenas WACA
Protenas relacionadas a los filamentos
intermedios

Hrs; 2
Objetivo por sesin; Que el estudiante conozca los elementos bsicos que le
confieren la morfologa y estructura a la bacteria y sus funciones
De que le sirve al QFB estudiar esta sesin? El estudiante comprender la
relevancia e implicacin funcional del citoesqueleto bacteriano.
Pregunta problematizadora; Realiza un esquema sobre bases celulares de las
respuestas afectadas en una E. coli ParM, MreB delta.
Actividades de aprendizaje: Previo al ingreso al aula, el estudiante debi haber
ledo los temas en la bibliografa. Realizar una tabla con las funciones de cada una
de las protenas del citoesqueleto y sus funciones.
Actividad integradora: Discusin de los artculos.

Bibliografia:
1. Biologa de los Microorganismos. Brock. Madigan MT., Martinko, JM, Parker, J. Prentice Hall.
Mxico. 10 ed. 2006.
2. Matthew T. Cabeen and Christine Jacobs-Wagner.(2010).The Bacterial Cytoskeleton.Annu Rev
Genet; 44:365-92.
3. Cabeen MT, Jacobs-Wagner C. Skin and bones: the bacterial cytoskeleton, cell wall,
and cell morphogenesis. J Cell Biol. 2007 Nov 5;179(3):381-7.
4. Wickstead B and Gull K. The evolution of the cytoskeleton. J. Cell Biol. 2011. Vol. 194 No. 4 513525

1.2 SISTEMAS DE SECRECIN

Conceptos:
Sistema de secrecin I-V Fuerza protomotriz Traslocasa
Factor de virulencia

Elementos:
Membrana Fuerza protomotriz Traslocasa
Gram+, Gram-, Sistema de secrecin I-V Sistema de transporte
ABC
Chaperona Protena de membrana Flagelo
Toxina Virulencia Factor de virulencia
SSec Stat.
Hrs; 2
Objetivo por sesin; Comprender la funcin de cada uno de los SS presentes en
bacterias y las diferencias entre ellos.
De que le sirve al QFB estudiar esta sesin? Conocer los sistemas de secrecin,
permiten que el estudiante conozca el papel principal de la modulacin de las
interacciones de las bacterias con su ambiente.
Pregunta problematizadora; Cmo ocurre la secrecin de toxinas en Vibrio
cuando infecta el intestino, E. coli lo realiza de la misma forma?.
Actividades de aprendizaje: Previo al ingreso al aula, el estudiante debi haber
ledo los temas en la bibliografa. En equipos y con ayuda del profesor, se explicarn
los temas entre s. Cada equipo expondr uno de los SS a todo el grupo.
Actividad integradora: Realizarn un cuadro comparativo de los diferentes
elementos que participan en los SS. TAREA; el profesor delimitar la lectura para la
sesin siguiente.

Bibliografia:
1. Bacterial Physiology and Metabolism. Byung Hong Kim, Geoffrey Michael Gadd. Cambridge
University Press. Cambridge, New York, Melbourne, Madrid, Cape Town, Singapore, So Paulo.
2008
2. Bertha Gonzlez-Pedrajo y Georges Dreyfus. (2003). Sistemas De Secrecin De Protenas En Las
Bacterias Gram Negativas: Biognesis Flagelar Y Translocacin De Factores De Virulencia. Mensaje
Bioqumico, Vol. XXVII: 45-63.

1.3 CRECIMIENTO Y MORFOGNESIS BACTERIANAS

Conceptos:
Morfognesis Pared bacteriana Peptidoglicano Formas L

Elementos:
Morfognesis Pared bacteriana Proteinas del Peptidoglicano
citoesqueleto
cido teicoico Formas L FtsZ MreBCD
Esferoplasto Respuesta Rcs Beta-lactmicos Autolisnas
(PBS),

Hrs; 3
Objetivo por sesin; Comprender la relacin entre la disponibilidad de nutrientes
y estado metablico y como se coordinan con el crecimiento celular, replicacin y
divisin celular
De que le sirve al QFB estudiar esta sesin? Comprender la relacin de la forma
celular con la sntesis del PG, citoesqueleto y respuesta a B-lact.
Pregunta problematizadora; Explica los mecanismos que disparan la lisis de la
pared bacteriana y su nueva sntesis.
Actividades de aprendizaje: Previo al ingreso al aula, el estudiante debi haber
ledo los temas en la bibliografa. Explicacin del profesor. Trabajo en equipo sobre
los elementos implicados en cada una de las formas bacterianas.
Actividad integradora: Realizar un mapa conceptual de los temas abordados.

Bibliografia:
1. Cornell University. College of Agrirculture and life Science. Department of Microbiology.
https://micro.cornell.edu/research/epulopiscium/binary-fission-and-other-forms-reproduction-
bacteria
2. Genes IX. Benjamin Lewin. Oxford .212.
3. Collier J, Shapiro L. Spatial complexity and control of a bacterial cell cycle. Curr Opin Biotechnol.
2007 Aug;18(4):333-40.
4. Chao Jiangy , Paul D. Caccamo and Yves V. Brun Mechanisms of bacterial morphogenesis:
Evolutionary cell biology approaches provide new insights. Bioessays 2015. 37: 413425.

1.4 . REGULACIN DE LA DIVISIN CELULAR EN BACTERIAS

Conceptos:
Fisin binaria Clula Gemacin Ciclo celular Morfognesis
vegetativa

ELEMENTOS
Fisin binaria Clula Gemacin Ciclo celular Morfognesis
vegetativa
Citoesqueleto Caulobacter Bacillus sp. divisoma
sp

Objetivo por sesin; Comprender la relacin entre la disponibilidad de nutrientes


y estado metablico y como se coordinan con el crecimiento celular, replicacin y
divisin celular
Pregunta problematizadora; Realiza un esquema sobre bases moleculares de las
respuestas afectadas en una E. coli FtsZ delta.
Actividades de aprendizaje: Previo al ingreso al aula, el estudiante debi haber
ledo los temas en la bibliografa. Explicacin del profesor. Trabajo en equipo sobre
los elementos implicados en divisin celular.
Actividad integradora:
1. El estudiante realizar un anlisis comparativo entre la divisin celular
bacteriana y la mitocondrial.
2. Realiza un esquema de los pasos y distintos elementos que participan en la
morfognesis de Caulobacter sp.
Bibliografia:
1. Cornell University. College of Agrirculture and life Science. Department of Microbiology.
https://micro.cornell.edu/research/epulopiscium/binary-fission-and-other-forms-reproduction-bacteria
2. Genes IX. Benjamin Lewin. Oxford. 212.
3. Collier J1, Shapiro L. Spatial complexity and control of a bacterial cell cycle. Curr Opin Biotechnol.
2007 Aug;18(4):333-40.

1.5 BIOFILM

Elementos:
Polisacridos Matriz extracelular Biofilm Clula planctnica
Clula ssil TCS QS Dispersin
Infeccin Placa dental Catteres Resistencia
antimicrobiana
Vi homoserinlactonas Vibrio fischeri

Conceptos:
TCS Matriz extracelular Biofilm clula planctnica
QS Resistencia a
antibiticos

Objetivo por sesin; en esta sesin comprenders los mltiples factores que
intervienen en la formacin del biofilm y los cambios fenotpicos y genotpicos que
resulta de la disolucin de esta matriz.
Pregunta problematizadora; Explica las etapas de desarrollo de un biofilm y
menciona algunos de los procesos infecciosos en los que se encuentra involucrado.
Actividades de aprendizaje: Previo al ingreso al aula, el estudiante debi haber
ledo los temas en la bibliografa. Explicacin del profesor.
Actividad integradora: El estudiante investigar los mecanismos que conducen a
la formacin de la placa dental y endocarditis.

Bibliografia:

1. Mara Teresa Herrera Mendoza. El papel del biofilm en el proceso infeccioso y la


resistencia. Nova - Publicacin Cientfica VOL.2 No. 2 Enero- Diciembre 2004:1-108
2. Julio Nazar C. Biofilms bacterianos. Rev. Otorrinolaringol. Cir. Cabeza Cuello 2007; 67: 61-
72
3. Philip S Stewart, J William Costerton. Antibiotic resistance of bacteria in biofilms. THE
LANCET Vol 358 July 14, 2001
4. J. W. Costerton, Philip S. Stewart, E. P. Greenberg. Bacterial Biolms: A Common Cause
of Persistent Infections. 1999 SCIENCE VOL 284: 1318-1322
5. Susanne Haussler and Clay Fuqua. Biofilms 2012: New Discoveries and Significant Wrinkles in a
Dynamic Field. J Bacteriol. 2013 Jul; 195(13): 29472958.

1.6 a 1.8 CONJUGACIN, TRANSFORMACIN y TRANSDUCCIN

Elementos:
Genoma Plataforma Clula Plsmidos
bacteriano gentica transformada
Clula donadora Transconjugante Clula competente Replicn
Compatibilidad SI (sitios de Origen de Replicacin en
plasmdica insercin) replicacin crculo rodante
Transposones Integrones Resistencia Promotor
Plsmido F y R Clula Hfr Pili sexual Opern tra
Clonacin Transposasa Resolvasa Integrasa
Replicacin en
replicacin theta
Conceptos:
Genoma Plataforma Clula Plsmidos
bacteriano gentica transformada
Clula donadora Transconjugante Clula competente Replicn
Compatibilidad SI (sitios de Origen de Replicacin en
plasmdica insercin) replicacin crculo rodante
Transposones Integrones Resistencia Promotor
Plsmido F y R Clula Hfr Pili sexual Opern tra
Clonacin Transposasa Resolvasa Integrasa
Replicacin en
replicacin theta

Objetivo por sesin; en esta sesin comprenders los mltiples factores que
intervienen en la transferencia horizontal, su trascendencia y utilidad como
herramientas de dispersin y clonacin
Hrs; 3
Pregunta problematizadora; Explica los eventos que ocurrieron para que en el
cromosoma bacteriano, se presenten; genes de resistencia a beta-lactmicos, sitios
attC y compuestos cuaternarios de amonio.
Actividades de aprendizaje: Previo al ingreso al aula, el estudiante debi haber
ledo los temas en la bibliografa. Explicacin del profesor.
Actividad integradora: El estudiante investigar los mecanismos que explican la
presencia de los genes de la toxina eritrognica en Streptococcus y genes de
resistencia a beta-lactmicos en enterobacterias.

Bibliografia:
1. Enrique Iaez Pareja. Departamento de Microbiologa y Biotecnologa. Universidad de Granada
http://www.ugr.es/eianez/Microbiologia/index.htm.
2. Biologa de los Microorganismos. Brock. Madigan MT., Martinko, JM, Parker, J. Prentice Hall.
Mxico. 10 ed. 2006.
3. Genes IX. Benjamin Lewin. Oxford .212.

UNIDAD II. CRECIMIENTO BACTERIANO


Dra. Adela Y Bueno Durn
2.1.2 Medicin de crecimiento

Elementos:
Medio lquido Medio slido Diluciones Cuentas viables

Turbidmetro Nefelmetro Espectrofotmetro

Conceptos:
Medio lquido Medio slido Diluciones Conteo en placa

UFC NMP Peso hmedo Peso seco


Nitrgeno total Clulas viables Densidad de masa

Hrs; 2
Objetivo por sesin; Conocer los mtodos para evaluar el crecimiento a nivel
individual y a nivel poblacional
Pregunta problematizadora Durante un cultivo, si tomas una muestra durante la
fase lag a diferencia de un cultivo en la fase tarda, cmo esperaras que sera los
nmeros de bacterias y cmo lo determinaras.
Actividades de aprendizaje: previo al ingreso al aula el estudiante debi haber
ledo los temas en la bibliografa. El profesor explicara el tema. En equipo
contestaran la pregunta problematizadora
.Actividad integradora: Realizar una tabla de ventajas y desventajas del mtodo
directo. De la siguiente tabla, calcula el nmero de UFC y grafica. Calcula el tiempo
de generacin.
.Bibliografia:
1- Bacterial Physiology and Metabolism. Byung Hong Kim, Geoffrey Michael Gadd. CAMBRIDGE
UNIVERSITY PRESS

2.1.3 Ciclo de crecimiento


2.1.3.1 Crecimiento contino
2.1.3.2 Cultivos microbianos
Elementos:
Quimiostato Concentracin de
sustrato

Conceptos:
Velocidad de Tiempo de Crecimiento Clulas viables
crecimiento generacin exponencial
Vaciado en placa Recuento en Extensin es Turbidez
placa superficie
Mesfilos Termfilos Termodricos Hipertermfilos
Acidfilos Alcalfilos Aerobios Anaerobios
Aerotolerantes Microaerfilos Aw Crecimiento
continuo

Temas: fase lag, log, estacionaria, declive muerte, crecimiento continuo. Cultivo
microbiano, condiciones fsicas y qumicas del medio, cultivo en medios no
renovados.
Objetivo por sesin; Manejars las condiciones y los elementos a considerar que
afectan positiva o negativamente el cultivo y el crecimiento bacteriano.
Pregunta problematizadora; calcular tiempo de generacin por mtodo grfico. Si
tienes E. coli, Haemophillus, qu condiciones debes considerar para cultivarlos de
manera continua o en cultivos microbianos.
Actividades de aprendizaje: previo al ingreso al aula el estudiante debi haber
ledo los temas en la bibliografa. El profesor explicara el tema. En equipo
contestaran la pregunta problematizadora
Actividad integradora: Explicar el efecto que tienen los cambios en la
concentracin de nutrientes, sobre el crecimiento bacteriano. Realizar una tabla
comparativa entre las condiciones y elementos del cultivo continuo en relacin con
los cultivos microbianos
Bibliografia:
1. Biologa de los Microorganismos. Brock. Madigan MT., Martinko, JM, Parker, J. Prentice Hall.
Mxico. 10 ed. 2006.
2.- Bacterial Physiology and Metabolism. Byung Hong Kim, Geoffrey Michael Gadd. CAMBRIDGE
UNIVERSITY PRESS

2.2 Crecimiento en condiciones de estrs


Temas: factores extrnsecos que afectan el crecimiento.
Conceptos:
Mesfilos Termfilos Termodricos Hipertermfilos
Acidfilos Alcalfilos Aerobios Anaerobios
Aerotolerantes Microaerfilos Aw Oxgeno
Temperatura Turgencia Presin osmtica Halfilos
Psicrfilos, Anaerobios
facultativo
Hrs; 2
Objetivo por sesin; Conocer el crecimiento bacteriano y como controlarlo /
modificarlo (favorecerlo o inhibirlo) y como la bacteria se adecua a estas
condiciones.
Pregunta problematizadora; enliste las condiciones que proporciona la miel, a la
inhibicin del crecimiento bacteriano, y que adecuaciones puede realizar Listeria
monocytogenes para su desarrollo en alimentos en refrigeracin y superficies de
aluminio.
Actividades de aprendizaje: previo al ingreso al aula el estudiante debi haber
ledo los temas en la bibliografa. El profesor explicara el tema. En equipo
contestaran la pregunta problematizadora.
Actividad integradora: realiza un cuadro donde menciones las condiciones que
pueden contribuir a la aparicin de bacterias en alimentos mnimamente
procesados.
Bibliografia:

1- Biologa de los Microorganismos. Brock. Madigan MT., Martinko, JM, Parker, J. Prentice Hall.
Mxico. 10 ed. 2006.
2- Jay, James M., Modern Food Mirobiology. 1996, Fifth Edition
3- Frazier, W.C., Microbiologa de los Alimentos. Ed. Acribia Zaragoza Espaa. 1993.

UNIDAD III. FACTORES FISICOQUMICOS QUE AFECTAN EL


CRECIMIENTO
Dra. Adela Y Bueno Durn y Dr. Jess B. Velzquez Fernndez

Temas: factores fisicoqumicos que afectan el crecimiento.


Conceptos:
presin osmtica, aw, pH, oxgeno, temperatura, halfilos, facultativo, antibiticos
(macrlidos, quinolonas, penicilinas)x mecanismo de accin.

Hrs; 2
Objetivo por sesin; conocer los factores fisicoqumicos que afectan el crecimiento
y as como las adecuaciones bacterianas en respuesta a ellos.
Pregunta problematizadora; en el bacalao se considera que no hay crecimiento
microbiano, explique el por qu,
Actividades de aprendizaje: previo al ingreso al aula el estudiante debi haber ledo
los temas en la bibliografa. El profesor explicara el tema. En equipo contestaran la
pregunta problematizadora.
Actividades de aprendizaje: previo al ingreso al aula el estudiante debi haber
ledo los temas en la bibliografa. El profesor explicara el tema. En equipo
contestaran la pregunta problematizadora.
Actividad integradora: realiza un cuadro donde menciones que, que factores
pueden contribuir a la aparicin de bacterias y cuales bacterias consideras pueden
deteriorar un alimento enlatado (sardinas) en aceite de olivo y en salsa de jitomate.
Bibliografia:

1- Biologa de los Microorganismos. Brock. Madigan MT., Martinko, JM, Parker, J. Prentice Hall.
Mxico. 10 ed. 2006.
2- Jay, James M., Modern Food Mirobiology. 1996, Fifth Edition
3- Frazier, W.C., Microbiologa de los Alimentos. Ed. Acribia Zaragoza Espaa. 1993.

UNIDAD IV. NUTRICIN DE LOS MICRORGANISMOS


Dr. Jess B. Velzquez Fernndez

Conceptos:
Objetivo: Conocers las necesidades de materia y energa de las bacterias para su
crecimiento
Objetos del aprendizaje:

Fototrofa Metanotrfico Factores de Requerimientos


crecimiento minerales
Quimiotrofa Medio mnimo Fermentacin Respiracin
aerobia
Quimiorganotrofa Metabolismo Amoniaco Respiracin
anaerobia
Quimiolitotrofa Sulfato reductoras Vitaminas Fotosntesis
oxignica
Autotrofa Reduccin de Agua Fotosntesis
nitrato anoxignica
Ciclo del Carbono Reduccin de Fotoauttrofas Aceptores de
nitrito electrones
Heterotrofa Nitrificante Fotohetertrofas Fermentacin
lctica
Prottrofos Desnitrificante microaerfilos Fermentacin
homoetanlica
Auxtrofos Ndulos Va Ender- Fermentacin
Dudoroff propinica
Mixtrofos rhizobacteria Va Embden- Fermentacin
Meyerhoff-Parnas butanodilica
Ciclo del nitrgeno Anamox Aerobios estrictos Respiracin
aerobia
Ciclo del azufre Metanognica Fermentacin Respiracin
sintrofa anaerobia
Fotosntesis Fermentacin butanodilica Biogensico
oxignica lctica
Fotosntesis Fermentacin Simbiosis Aceptores de
anoxignica homoetanlica electrones
Biogeoqumico microaerfilos Fermentacin
propinica

Sesin 1: Clasificacin segn la fuente de energa y la de carbono (1 hr)


Objetivo: Conocers los principios generales de clasificacin de las bacterias y
adquirirs la terminologa para las siguientes sesiones

Pregunta problematizadora: Cul es la diferencia entre un organismo mixtrofo


y uno quimiolittrofo?

Actividades de aprendizaje. Exposicin magisterial de los conceptos. Exposicin


en equipo

Actividad integradora. Realiza una tabla de las diferentes clasificaciones de las


bacterias segn las fuentes de energa y de carbono. En un dibujo que contenga
tierra y agua describe dnde esperaras encontrar organismos fotoauttrofos y
dnde esperaras encontrar quimiolittrofos.

Tarea. Estudia los diferentes tipos de fermentacin en los libros de fisiologa


bacteriana.

Sesin 2: Capacidades metablicas. Fermentacin (2 hr)


Objetivo: Conocer las diferentes vas fermentativas, las condiciones en las que se
favorece y su utilidad.
Pregunta problematizadora: Todos los organismos pueden producir cido lctico
o etanol? Da ejemplos de organismos que tengan los diferentes tipos de
fermentacin. Cmo demostraras qu tipo de fermentacin ocurre en determinado
cultivo?

Actividades de aprendizaje. Exposicin de los diferentes tipos de fermentacin,


as como de las condiciones y bacterias que la llevan a cabo.

Actividad integradora. Enlista los diferentes sustratos y pruebas que permiten


identificar la fermentacin. Responde Cules seran los requerimientos para un
organismo anaerbico microaerfilo fototrfico? cules para un organismo
aerbico estricto quimiorgantrofo?

Tarea. Repasar cadena respiratoria (teora de P. Michell), reacciones y potenciales


redox (Nernst).

Sesin 3: Capacidades metablicas. Respiracin y litotrofa (2 hr)


Objetivo. Conocer los diferentes aceptores de electrones, su importancia
bioenergtica, las condiciones en las que se favorece y su utilidad.

Pregunta problematizadora: Con el par redox Arsenito/arsenato y sulfato/sulfito


cul sera el aceptor de electrones y a qu tipo de metabolismo correspondera?

Actividades d aprendizaje. Exposicin de los diferentes tipos de aceptores de


electrones y de respiracin bacteriana.

Actividad integradora. Realiza una tabla donde compares los diferentes tipos de
respiracin. En un cuadro sinptico describe los diferentes aceptores de electrones
que se pueden presentar. Cules seran las condiciones de crecimiento de
bacterias que se encuentran en las superficies de los ocanos? Cules seran las
condiciones de cultivo de bacterias que se encuentran en suelos ricos en hierro?

Tarea. Estudiar sobre la fotosntesis.

Sesin 4: Capacidades metablicas. Fotosntesis (2 hr)


Objetivo: Conocers la funcin de la fotosntesis, su importancia para el crecimiento
bacteriano y en las cadenas trficas.

Pregunta problematizadora: Cul fotosntesis es ms eficiente desde el punto de


vista energtico, la oxignica o la anoxignica? Qu tipo de bacterias realizan
fotosntesis?

Actividades de aprendizaje. Exposicin de las fases de la fotosntesis, los


diferentes tipos y los componentes celulares involucrados en el proceso.

Actividad integradora. Realiza un mapa conceptual de cada una de las


fotosntesis. Haz una tabla de los diferentes tipos de pigmento, el rango de longitud
de onda en que absorbe, las bacterias que lo usan y su hbitat. Dnde esperaras
encontrar (en la naturaleza) ese tipo de bacterias?

Tarea. Investiga los diferentes medios mnimos, su composicin y utilidad.

Sesin 5: Minerales y Ciclos biogeoqumicos (C, N, S) (3 hr)


Objetivo: Entenders la participacin de las bacterias en los ciclos naturales de los
elementos qumicos biogensicos y no biogensicos

Pregunta problematizadora: Cuntos organismos podran verse involucrados en


el ciclo del carbono. Menciona las bacterias involucradas en la fijacin del nitrgeno
para que una planta pueda asimilar nitrgeno. Define las diferencias que encuentres
entre una bacteria nitrificante y una bacteria desnitrificante en cuanto a tipo de
organismos, tipo de reacciones de oxidorreducin, condiciones fisicoqumicas y tipo
de ambiente.

Actividades de aprendizaje: Explicacin de la simbiosis planta-bacteria.


Exposicin del ciclo del carbono, nitrgeno y azufre. Discusin sobre los
requerimientos minerales de las bacterias y del efecto de otros metales sobre las
bacterias. Discusin de Artculo Nannipieri et al. 2003.

Actividad integradora. Haz un esquema de ciclo del carbono, nitrgeno y azufre.


Enlista los minerales necesarios para el cultivo bacteriano. Menciona las
caractersticas de crecimiento de bacterias de descomposicin y de dos de ellas
que se relacionen con el ciclo del azufre. Cules bacterias se encargan de la
produccin de oxgeno al ambiente de acuerdo al ciclo? Las bacterias anammox
en qu parte del ciclo del nitrgeno participan?

Tarea. Repasa los tipos de regulacin de la expresin gnica.


Contesta el siguiente cuestionario
Qu es un gen?
Qu es la transcripcin?
Qu entiendes por expresin gnica?
Cul es el dogma de la biologa molecular?

Bibliografia recomendada
Brook, Microbiologa
Bacterial Physiology and etabolism. Kim BH Gadd GM. Cambridge Uiversity Press.
2008. USA
Microbia Physiology Moat AG, Foster JW, Spector MP. 4 th ed. Wiley-Liss, Inc. NY.
2002. Canada
Microbial diversity and soil functions. Nannipieri P, Ascher J, Ceccherini T, Landi L,
Pietramellara G, Renella G. European Journal of Soil Science (2003) 54:655-670

Bibliografa complementaria
www.ugr.es/eianez/Microgiologia/12crecimiento.hm#_Toc58934314

UNIDAD V. MECANISMOS DE REGULACIN GLOBAL


Dra. Jackeline Lizatta Arvizu Gmez
(24 horas)

OBJETIVO DE LA UNIDAD: En esta unidad comprenders los diferentes


mecanismos bacterianos que permiten una respuesta fisiolgica a diferentes
estmulos de una manera individual y poblacional.

5.1Transduccin de seales en bacterias

Conceptos:
Sistema de dos Sistema de un Cinasas de Sensor cinasa
componentes componente histidina
Reguladores de Fosforilacin Fosfotransferencia Dominio recibidor
respuesta

Hrs: 3

Pregunta problematizadora: Investigar un mecanismo de transduccion de seal


(estmulo, protena sensora y regulador de respuesta).

Actividad de aprendizaje: Previo al ingreso del aula el estudiante deber haber


ledo el tema en la bibliografa. Explicacin del tema por parte del profesor.

Actividad integradora: Realizar una tabla donde se enlisten los sistemas


regulatorios de dos componentes conocidos, indicando la protena sensora, y el
regulador de respuesta de cada uno de estos, as como el estmulo al cual
responden estos sistemas. Leer sobre la respuesta estricta (stringent response) en
bacterias.

Bibliografa:

1. Genes IX. Benjamin Lewin. Oxford


2. Transcription regulation in Prokaryotes. Rolf Wagner. Oxford. 2000
3. Bacterial two component systems: structures and signaling mechanisms. Shuishu Wang. Intech open
science, 2012.
4. One component systems dominate signal transduction in prokaryotes. Luke E. Ulrich, Eugene V.
Koonin and Igor B. Zhulin. Trends Microbiol, 2005, 13(2):52-56

5.2 Respuesta estricta

Conceptos:
privacin de aminocidos (amino acid deprivation), guanosine 3,5 bis (diphosphate)
ppGpp, (p)ppGpp, aminoacyl-tRNA, protena RelA (PSI), SpoT (PSII), ATP, GTP,
GDP, GPPasa, discriminator motif GCGC.

Hrs: 3

Pregunta problematizadora: realiza un esquema de la respuesta bacteriana en


condiciones de privacin de aminocidos.

Actividad de aprendizaje: Previo al ingreso del aula el estudiante deber haber


ledo el tema en la bibliografa. Explicacin del tema por parte del profesor.
Actividad integradora: Realizacin de mapa conceptual y elaboracin de diagrama
de regulacin donde se indiquen los blancos de ppGpp. Leer sobre la respuesta a
choque trmico en bacterias.

Bibliografa:

1. Genes IX. Benjamin Lewin. Oxford


2. Transcription regulation in Prokaryotes. Rolf Wagner. Oxford. 2000
3. The ribosome, stringent factor and the bacterial stringent response. Rose-Marie jenvert, Stockholm
University 2007.
4. Shortage of nutrients in bacteria: The stringent response (1998). Tapan K. mukherjee, Arvind
Raghavan and Dipankar Chateterji. Currente Science, 75(7).

5.3 Respuesta a choque trmico

Conceptos:
Protenas de choque trmico (HSP), plegamiento proteico, chaperonas, proteasas,
32, rpoH, DnaK, DnaJ, GrpE, GroE, 24, Lon, Clp

Hrs: 3

Actividad de aprendizaje: Previo al ingreso del aula el estudiante deber haber


ledo el tema en la bibliografa. Explicacin del tema por parte del profesor.

Actividad integradora: investigar agentes o condiciones inductoras de sntesis de


protenas de choque trmico. Investigar redes regulatorias ligadas a la respuesta de
choque trmico.

Bibliografa:

1. Genes IX. Benjamin Lewin. Oxford


2. Transcription regulation in Prokaryotes. Rolf Wagner. Oxford. 2000
3. http://www.ugr.es/~eianez/Microbiologia/15regulacion.htm#_Toc62377255

4. Regulacin gentica en la respuesta al estrs calrico en Escherichia coli. Jess Ramirez


Santos, Gloria Solis Guzmn, M. Cramen Gmez Eichelmann. Revista Latinoamericana de
Microbiologa (2001). 43:51-63.

5.4 Transiciones en el estado de crecimiento

Conceptos: rpoN, rpoS, NAPs (H-NS, IHF, Fis)

Hrs: 3
Pregunta problematizadora: En base a la bibliografa, enlista las funciones de
cada uno de los reguladores.

Actividad de aprendizaje: Previo al ingreso del aula el estudiante deber haber


ledo el tema en la bibliografa. Explicacin del tema por parte del profesor.

Actividad integradora: esquematiza una curva de crecimiento bacteriano


indicando en cada fase los reguladores correspondientes.

Bibliografa:

1. Growth phase-dependent variation in protein composition of the Escherichia coli nucleoid. Taluker
Ali azam, Akira Iwata, akiko Nishimura, Susumu Ueda, Akira Ishihama. J. Bacteriol (1999). 181(20): 6361-
6370.
2. Genes IX. Benjamin Lewin. Oxford
3. Transcription regulation in Prokaryotes. Rolf Wagner. Oxford. 2000
4. Nucleoid-associated proteins and bacterial physiology. Dorman CJ. (2009). Adv Appl Microbiol. 67:47-
64.
5. Bacterial stationary phase evolution. Vinja Baun-Druina, Ana Butorac, Jasna Mrvi, Tibela Landeka
Dragiev and Vesna Stehlik-Tomas. Food Technol Biotechnol (2011). 49(1):13-23.

5.5 Respuesta a daos en la envoltura

Conceptos: estrs oxidativo, calor, radiacin UV

Hrs: 3

Pregunta problematizadora: investigar el mecanismo de sensado y/o respuesta


para algunos de los agentes de dao a envoltura.

Actividad de aprendizaje: Previo al ingreso del aula el estudiante deber haber


ledo el tema en la bibliografa. Explicacin del tema por parte del profesor.

Actividad integradora: hacer un listado completo de los mecanismos de sensado


y respuesta a los diferentes agentes de dao a envoltura celular.

Bibliografa:

1. Genes IX. Benjamin Lewin. Oxford


2. Transcription regulation in Prokaryotes. Rolf Wagner. Oxford. 2000

5.6 Redes de control global

Conceptos:
Factor de transcripcin, reguladores globales, CRP, IHF, FNR, HNS, ArcA, FIS, Lrp,
Reguln DB, nodos, autoregulacin negativa, mdulos.

Hrs: 3

Pregunta problematizadora: Los anlisis de una cepa mutante de E. coli obtenida


mediante exposicin a luz UV, mostraron un fenotipo no-mtil para dicha cepa y
niveles bajos de transcrito para genes de motilidad. Posteriores anlisis
demostraron que la cepa presenta adems un fenotipo no patognico. Qu
capacidad codificante, considera usted, puede tener el gen mutado en base al
fenotipo obtenido? Por qu? Si los niveles de transcrito de los genes de
patogenicidad fueran analizados y estos presentaran niveles bajos de mRNA, la
capacidad codificante del gen mutado propuesta por usted sera la misma?
Explique.

Actividad de aprendizaje: Previo al ingreso del aula el estudiante deber haber


ledo el tema en la bibliografa. Explicacin del tema por parte del profesor.

Actividad integradora: realice la red de regulacin de algunos de los reguladores


globales que involucre a dos condiciones.

Bibliografa:

1. Identifying global regulators in transcriptional regulatory networks in bacteria. Agustino Martinez


Antonio, Julio Collado Vides. Current Opinion in Microbiology (2003). 6(5): 482-489.
2. Genes IX. Benjamin Lewin. Oxford
3. Transcription regulation in Prokaryotes. Rolf Wagner. Oxford. 2000
4. Functional organisation of Escherichia coli transcriptional regulatory network. Agustino Martinez
Antonio, Sarath Chandra Janga, Denis Thieffry. J Mol Biol (2008). 381(1):238-247.
5. Escherichia coli trsncriptional regulatory network. A gustino Martinez Antonio. Network biology
(2011). 1(1):21-33.

5.7 Quorum sensing

Elementos:
TCS Biofilm Homoserin lactona clula planctnica
virulencia Resistencia a Vibrio fischeri Crosstalk
antibiticos
autoinductor Opern lux

Conceptos:
TCS Biofilm Homoserin lactona clula planctnica
virulencia Resistencia a Vibrio fischeri Crosstalk
antibiticos
autoinductor Opern lux
Hrs; 2
Pregunta problematizadora;. A qu se debe la bioluminiscencia de Vibrio
fischeri?
Actividades de aprendizaje: Realiza un esquema explicativo del mecanismo de
bioluminiscencia en Vibrio fischeri?
Actividad integradora: Explica una estrategia que propondras para contrarrestar
las infecciones ocasionadas por P. aeruginosa y P. syringae.

5.8 Opern Spo

Elementos:
Espora QS KinABC Opern Spo
Fosforilacin Biofilm Filamento axial Divisoma
RacA DivIVA FtsZ Factores sigma
Flipasa cido dipicolnico Protenas SASPs Citoesqueleto
bacteriano

Conceptos:
Diferenciacin celular, Clula vegetativa Clula madre
Espora Forespora Septo polar
Opern Regulacin gnica Factor sigma
Citoesqueleto bacteriano

Hrs; 2
Pregunta problematizadora;. De qu forma es posible inhibir la conversacin que
establecen la clula madre y la forespora, durante el proceso de esporulacin?
Actividades de aprendizaje: Discute con los miembros de tu equipo paso a paso,
los mecanismos del proceso de esporulacin.
Actividad integradora: Esquematiza el proceso de esporulacin, considerando
todos los elementos.

Model for the positioning of the FtsZ ring by the nucleoid occlusion and Min systems
in E. coli. (A) Temporal and spatial regulation of cell division by nucleoid occlusion.
The nucleoid occlusion protein SlmA preferentially associates with the pole-
proximal regions of the nucleoid.
At the beginning of the division cycle, the longitudinal dimensions of the nucleoid
are small, thereby placing SlmA close to midcell and blocking FtsZ ring assembly.
In the course of chromosome replication and segregation, the two nascent daughter
nucleoids move apart. As a consequence, the midcell region is cleared of SlmA,
allowing FtsZ polymerization to occur. (B) Inhibition of polar cell-division events by
the Min system. MinD, bound to the cell division inhibitor MinC, assembles on the
cytoplasmic membrane, forming a cap-like polymeric layer that prevents FtsZ ring
formation in the polar region of the cell. MinE is organized into a ring-shaped
structure that gradually displaces MinCD from the membrane. Free MinC and MinD
subunits reassemble at the opposite cell pole, thus establishing a new polar cap
and restarting the cycle. (C) Cooperation of the nucleoid occlusion and Min systems.
The combined action of SlmA and the Min system targets the FtsZ ring to midcell
and ensures that divisome formation is delayed to the final phase of the replication
cycle.

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