LA EVOLUCIN DEL CITOESQUELETO

El citoesqueleto es un sistema de filamentos intracelulares cruciales para la forma de la clula, divisin, y la funcin en los tres
dominios de la vida. Los citoesqueletos simples de procariotas muestran sorprendente plasticidad en la composicin, con ninguna
de las protenas del ncleo de filamento de formacin conservadas en todos los linajes. En contraste, la funcin del citoesqueleto
eucariota ha sido enormemente elaborado por la adicin de protenas accesorias y la amplia duplicacin de genes y la
especializacin. Gran parte de esta complejidad evolucionaron antes de que el ltimo ancestro comn de los eucariotas. La
distribucin de los filamentos del citoesqueleto pone restricciones en la lnea procariota probable que hizo este salto de
eukaryogenesis.

Introduccin
La opinin de que el citoesqueleto era una caracterstica nica de los eucariotas fue anulada drsticamente hace unos 20 aos por
el descubrimiento de que las bacterias poseen homlogos de ambos tubulina (de Boer et al., 1992; Raychaudhuri y Park, 1992;.
Mukherjee et al, 1993) y actina (Bork et al., 1992).

Desde entonces, una combinacin de la bioinformtica, datos estructurales y de imgenes de clulas avanzada ha consolidado la
idea de que ambas bacterias y arqueas tienen citoesqueletos activas y dinmicas. Sin embargo, como ha surgido ms informacin
sobre la funcin de filamentos procariticas y la distribucin de los componentes del citoesqueleto, ha quedado claro que no hay
una relacin simple entre los citoesqueletos de procariotas y eucariotas.
Por otra parte, existe una gran diversidad en la composicin y funcin entre citoesqueletos en diferentes lneas de procariotas y
eucariotas.
Al igual que los microfilamentos de actina basada en eucariotas y microtbulos de tubulina basada, varios de los filamentos del
citoesqueleto bacteriano son intrnsecamente "cytomotive" (Lwe y Amos, 2009); es decir, los filamentos s puede actuar como
motores lineales impulsados por la cintica de polimerizacin / despolimerizacin. En eucariotas, esta actividad ha sido
enormemente aumentada por la evolucin de mltiples clases de motores, as como una coleccin de nucleadores, agentes de corte,
factores de unin de punta-y (de) polimerasas. Otros filamentos del citoesqueleto parecen ser ms estructural en funcin, que
proporciona resistencia a la fuerza externa o actuar como un andamio. Tales filamentos pueden todava ser dinmico en las clulas
sin ser intrnsecamente cytomotive. El ms estudiado de cerca de estos son los filamentos intermedios de las clulas animales, pero
una protena de la bacteria, crescentin, tambin construye estructuras filamentlike intermedias que funcionan en la determinacin
de la forma celular.
En esta revisin, se discuten las relaciones entre los componentes principales de las bacterias, arqueas y eucariotas citoesqueletos.
Comparamos la funcin de filamentos en estos tres grupos y tambin interrogar a la distribucin de los componentes clave en todo
el rbol de la vida. Por ltimo, se analiza lo que se puede inferir con respecto a los orgenes de los componentes del citoesqueleto y
discutir los medios para que el citoesqueleto procariota sencilla podra haber evolucionado en el complejo sistema de filamentos,
motores y protenas accesorias que es caracterstico de la clula eucariota.

Filamentos I: protenas relacionadas con tubulina

Microtbulos eucariotas se construyen a partir protofilamentos resultantes de la polimerizacin de heterodmeros de - y -
tubulina. La mayora de los microtbulos se componen de 13 protofilamentos que interactan lateralmente para formar un tubo
hueco. Los heterodmeros aadidos al final, ms de los microtbulos contienen GTP en ambas subunidades.
La posterior hidrlisis del GTP unido a la subunidad estimula un cambio conformacional en el heterodmero que es resistido por
la geometra de los microtbulos, atrapando as energa en la red .Esta diferencia en la energa libre de GTP y polmeros PIB
determinada es la causa de la inestabilidad dinmica de los microtbulos-mediante el cual la presencia de GTP no hidrolizado en el
extremo positivo de los microtbulos promueve la polimerizacin adicional, pero la prdida de la tapa induce una rpida
despolimerizacin
La primera evidencia de un homlogo bacteriano de la tubulina vino con el hallazgo de que FtsZ, una protena de divisin celular
esencial de Escherichia coli, atado y GTP hidrolizado y posee una secuencia de siete residuo conservado casi idntica a una N-
terminal motivo de la firma de la tubulina
Alineaciones posteriores demostraron que las similitudes entre secuencias de FtsZ y tubulina extenderse ms all del motivo de la
firma de la tubulina
. Sin embargo, la tubulina y FtsZ son muy divergentes en la secuencia primaria, compartiendo solamente 10% de identidad en
comparacin con> 40% entre las secuencias de la mayora de FtsZ
. A pesar de baja similitud de secuencias, la determinacin de las estructuras cristalinas de la tubulina y FtsZ revel protenas con
pliegues idnticos cerca
A diferencia de la tubulina, FtsZ no montar en los microtbulos, pero s formar una serie de otras estructuras in vitro utilizando
interacciones laterales entre protofilamentos .
In vivo, FtsZ forma una dinmica "anillo Z" entre las clulas hijas posibles durante la citocinesis.
Este anillo acta como un andamio para la contratacin del "divisome", que contrae gradualmente a dividir la celda.
Este sistema de la citocinesis era claramente un xito evolutivo porque FtsZ es a la vez ampliamente distribuida y altamente
conservada.
Su presencia en la mayora de los linajes de las bacterias es indicativo de que sea una protena antigua. Incluso se ha sugerido que
una sobre-representacin de aminocidos con simples rutas biosintticas en posiciones conservadas de FtsZ podra ser evidencia de
que la protena es anterior a la finalizacin del cdigo estndar de 20 aminocidos en s.
FtsZ tambin est codificada por muchos genomas archaeal, pero no es ubicuo en procariotas. Ms notablemente, FtsZ son
totalmente ausente de uno de los principales clados de arqueas-con la posible excepcin de un gen-FtsZ como muy divergentes en
solfataricus Sulfolobus probablemente adquiridos por transferencia horizontal de genes . FtsZ tambin est ausente de al menos
una euryarchaeon secuenciado , as como los grupos bacterianos clamidias, Planctomycetes, y algunos Mycoplasmataceae.
En el Crenarchaeota, divisin FtsZindependent es posible gracias a una maquinaria de citocinesis alternativa proporcionada por
ESCRT-III
Protenas ESCRT-III se conservan entre arqueas y eucariotas, y las protenas eucariotas de esta forma dinmica complejos polmeros
que tienen un papel en los acontecimientos de escisin de la membrana, incluyendo la abscisin celular durante la citocinesis . En
contraste con la falta de FtsZ en Crenarchaeota, el repertorio en Euryarchaeota ha sido duplicada para formar tres familias
monofilticos (FtsZ1, 2, y 3), con FtsZ3 siendo el ms divergente y menos ampliamente distribuida .

FtsZ es el homlogo tubulina ms comn en procariotas. Sin embargo, hay al menos otras cuatro familias de protenas-tubulina
como en las bacterias, la mayora de ellos con una distribucin restringida. Varios plsmidos de Bacillus codifican protenas-tubulina
similares, que son muy divergentes en secuencia entre s y tambin de FtsZ y tubulins Estas protenas incluyen Tubz y RepX, que
juegan un papel importante en la estabilidad de los plsmidos que las codifican. Monomrico Tubz tiene una estructura muy similar
a / -tubulina (Ni et al., 2010), pero los filamentos de formas helicoidales diestro que consta de dos protofilamentos .
Una excepcin a la baja el nivel de conservacin de secuencia entre las protenas del citoesqueleto procariotas y eucariotas son
BtubA y B, que se encuentra en el Verrucomicrobia Prosthecobacter. Estas protenas son mucho ms similares en secuencia a
tubulinas eucariticas que son FtsZ, Tubz, o RepX. Esta alta similitud en la secuencia, su restriccin a Prosthecobacter, y los anlisis
filogenticos de FtsZ / tubulina sugieren todo firmemente que BtubA / B fueron adquiridos por transferencia horizontal de genes de
un eucariota y no son descendientes de bacteriana FtsZ / Tubz (). Es probable que BtubA es un homlogo de -tubulina y BtubB de
-tubulina, pero el linaje eucariota que actu como el donante para estas protenas no se conoce. Ellos conservan la capacidad de
formar protofilamentos (no microtbulos), tanto in vitro como in vivo (Sontag et al, 2005;.. Sontag et al, 2009), y su expresin
continuada y conservacin funcional sugiere que son de algn beneficio para Prosthecobacter las clulas. Sin embargo, no se han
desplazado al citoesqueleto-tubulina como nativo en estos organismos, sino coexistir con FtsZ convencional (Pilhofer et al., 2007b).
Muchos eucariotas poseen genes FtsZ de origen procariota heredada de los antepasados endosymbiotic de mitocondrias y
cloroplastos. Posteriormente, estos genes han pasado de los genomas organellar al ncleo, pero sus orgenes son an evidentes en
filogenias FtsZ, donde el grupo con secuencias de cualquiera -proteobacterias o cianobacterias .los grupos de bacterias que dieron
origen a las mitocondrias y cloroplastos, respectivamente). Estos eucariota funcin FtsZs en la divisin de las mitocondrias y
cloroplastos mediante la formacin de un anillo de divisin con sorprendente similitud con la que se encuentra en bacterias .
Redundancia de esta maquinaria de divisin basada en FtsZ con el aparato de la fisin dynamin eucaritico puede proporcionar un
mecanismo para mltiples prdidas independientes de mitocondrial FtsZ desde la raz eucariota (Osteryoung y Nunnari, 2.003;
Praefcke y McMahon, 2004). En contraste, los genes del cloroplasto FtsZ son ms ampliamente conservadas.
Muy recientemente, la familia-FtsZ tubulina se ha ampliado an ms por la identificacin de dos nuevas familias de protenas FtsZ
como en procariotas llamada-FtsZl1 y FtsZl2 . Ambas de estas familias son divergentes de la tubulina, FtsZ, u otras familias
previamente identificadas. Una de las nuevas familias, FtsZl2 se encuentra slo en proteobacterias, pero la familia FtsZl1 tiene una
distribucin mucho ms amplia que incluye varios grupos de bacterias y Euryarchaeota. La funcin de FtsZl1 y FtsZl2 es desconocida.
Es posible que no forman FtsZ / filamentos-tubulina como, dada su divergencia estructural predicho de otros miembros de la
superfamilia.

Los filamentos II: la superfamilia de actina

La actina es una protena formadora de filamento eucariota ubicua. Los filamentos de actina (tambin llamados microfilamentos o
F-actina) constan de dos polmeros protofilamento de la herida juntos en una hlice diestro (Fig. 1). La hidrlisis de ATP por actina
causa un cambio mucho menos dramtico en la estabilidad del polmero que es visto por la hidrlisis de GTP en microtbulos. Como
resultado, la actina pura muestra poca inestabilidad dinmica in vitro (Mitchison, 1992), sino ms bien se somete a "treadmilling" a
travs de la adicin de subunidades ATPbound polarizada. In vivo, la actina es mucho ms dinmica que in vitro debido a la presencia
de agentes de factores, agentes filamentsevering, y taponado / estabilizante de unin de monmeros.
Actina eucariota es un miembro de una superfamilia grande y diverso de ATPasas que incluye chaperonas Hsp70 y varias clases de
azcar / alcohol de azcar quinasas (Flaherty et al., 1991;. Bork et al, 1992), as como las protenas relacionadas con actina-eucariotas
(ARP; Frankel y Mooseker, 1996; Schafer y Schroer, 1999). Tambin se identificaron como miembros de esta superfamilia de varias
otras protenas bacterianas, incluyendo MreB, FtsA, y ParM (Bork et al., 1992). Desde la identificacin inicial, la superfamilia de
protenas actina como en bacterias ha demostrado ser muy complejo, que abarca ms de 20 clases de protenas (Derman et al.,
2009).
El homlogo procaritico ms comn de actina es MreB. En cuanto a la tubulina / FtsZ, actina y MreB son muy divergentes en la
secuencia primaria, pero tienen estructuras similares (Fig. 1), basada en el "actina veces" que une la superfamilia (Kabsch y Holmes,
1995). En formas MreB vitro asambleas de dos protofilamentos que son similares en estructura a la F-actina, pero carecen del giro
helicoidal (van den Ent et al, 2001;.. Esue et al, 2005). La funcin conservada de MreB bacteriana (y protenas estrechamente
relacionadas como Mbl y MreBH) parece estar en el mantenimiento de la forma celular (Jones et al, 2001;. Graumann, 2007;
Margolin, 2009). MreB filamentos forman una hlice por debajo de la membrana celular e influyen en la posicin de la sntesis de la
pared celular (Fig 2 A;. Jones et al., 2001; Daniel y Errington, 2003). En consonancia con esta funcin, MreB generalmente se conserva
slo entre las bacterias en forma de varilla, pero ausente de cocos esfricos. Debido a linajes bacterianos en forma de vara existentes
son probablemente ms antiguo, se ha sugerido que las formas por cocos se han derivado de ellos varias veces por la prdida de
MreB y genes asociados (Margolin, 2009). Sin embargo, la correlacin entre la forma procariotas y MreB no es estricta: algunos
cocos an poseen MreB y hay bacterias en forma de bastn que carecen MreB (Margolin, 2009). ParM (anteriormente STBA) es un
homlogo de la actina bacteriana plsmido transmitidas con un papel de formacin de filamentos. ParM slo es 20% idntica a
MreB, que es comparable al grado de conservacin entre la actina y, o bien ParM o MreB. No obstante, ParM rene polmeros
retorcidos in vitro que son muy reminiscencia de F-actina (van den Ent et al., 2002), pero con un lugar de giro a derechas zurdo
(Orlova et al., 2007). La energa de polimerizacin de ParM se utiliza en la segregacin del plsmido R1 (y otras que contienen el
opern parMRC) empujando plsmido recin sintetizado a los polos de la clula (Garner et al., 2007; Salje y Lowe, 2008). Hasta la
fecha, los homlogos PARM inequvocas estn restringidas a un grupo cercano de -proteobacterias, las enterobacterias. Es
probable que los genes anotados "Parm" en los genomas de Firmicutes, -proteobacterias y cianobacterias representan otras clases
de protenas actina como bacterianas, en lugar de verdaderos ortlogos PARM. En apoyo de esta interpretacin, "ParM" codificada
en el plsmido acciones Staphylococcus aureus pSK41 slo el 19% de identidad con -proteobacterial secuencias PARM y parece
estar ms relacionada estructuralmente con las protenas actina como arqueas (Popp et al., 2010). Tanto MreB y FtsA se limitan casi
exclusivamente a bacterias (Fig. 3). Ejemplos claros de MreB tambin se encuentran en euryarchea de los gneros Methanopyrus,
Methanobrevibacter y Methanothermobacter (Yutin et al., 2009). Dada su distribucin limitada y estrecha similitud con secuencias
bacterianas, estos son muy probablemente el resultado de la transferencia horizontal de genes de bacterias. Sin embargo, no puede
descartarse por completo que son genes raros pero muy conservadas de ascendencia lineal. Varias otras secuencias arqueas se han
identificado como posibles ortlogos MreB utilizando el "grupo de arqueas de grupos ortlogos" tcnica (Makarova et al., 2007,
2010). Estas secuencias tienen una afinidad ms cerca de las secuencias de Hsp70 que a MreB a partir de bacterias o Methanopyrus
y su agrupacin en arCOG04656 puede ser un artefacto de la tcnica. Estas secuencias no se consideran como miembros verdadera
MreB la presente memoria (Fig. 3).
Existen varios otros miembros de la superfamilia de actina en las bacterias en particular: MamK, que se requieren para la
organizacin magnetosoma en Magnetospirillium (. Komeili et al, 2006; Pradel et al., 2006); AlfA, que est implicado en el plsmido
segregacin en Bacillus subtilis en una manera similar a ParM (Becker et al., 2006); y Ta0583 del euryarchaeon Thermoplasma
acidophilum (. Roeben et al, 2006; Hara et al., 2007). Estas protenas tienen ya sea una distribucin filogentica limitada o sus familias
todava tienen que estar bien delimitados (Derman et al, 2009;.. Yutin et al, 2009).
(. Hara et al, 2007) La posibilidad de que Ta0583 podra ser el homlogo procariota ms cercano a la actina eucariota no ha recibido
el apoyo de los anlisis posteriores (Yutin et al, 2009;. Ettema et al., 2011). Sin embargo, recientemente una familia-actina como
arqueas se ha descrito que es monofiltico con la actina eucariota y protenas relacionadas con la actina (Yutin et al, 2009;.. Ettema
et al, 2011). Esta familia de protenas, denominado "crenactin," tiene una localizacin en clulas Pyrobaculum muy similar a MreB
en bacterias (Figura 2 B;.. Ettema et al, 2011), pero est ms estrechamente relacionado con la actina eucariota que a MreB o ParM.
Las posibles implicaciones de esta familia se discuten ms adelante.

Los filamentos III: filamentos intermedios

Filamentos intermedios eucariotas (IFS) son diferentes a los microtbulos y microfilamentos en la estructura, la bioqumica y la
distribucin filogentica. A diferencia de actina y tubulina, que son protenas globulares que forman protofilamentos polarizadas, SI
protenas son dmeros que se superponen para formar cables no polarizados extendidos. Hay muchos tipos de protenas SI en los
vertebrados, la mayora de las cuales se pueden agrupar en cinco clases: (1) tipo I queratinas (cidos); (2) tipo II queratinas (bsicas);
(3) vimentina y desmina; Protenas (4) -internexina y neurofilamentos; y (5) las lminas (Fuchs y Weber, 1994). Las lminas estn
tambin presentes en protostomes, lo que sugiere que todo el IF familias de protenas se derivan de una nica secuencia de lamin
como en el ancestro metazoan comn (Weber et al., 1989;. Dodemont et al., 1994; Bovenschulte et al, 1995). Es significativo, sin
embargo, eucariota SI slo se han encontrado protenas sin ambigedades en los animales y sus familiares, lo que sugiere que son
una innovacin especfica a este linaje y no est presente en el ltimo ancestro comn eucariotas (LECA (Erber et al., 1998); vase
la figura . 3).
La bacteria Caulobacter crescentus codifica una protena con una disposicin prevista de enrollado de las bobinas similar a la de los
animales lamin A (Ausmees et al., 2003). Esta protena, Cres o crescentin, forma filamentos helicoidales que son necesarios para las
formas celulares vibrioid o helicoidales adoptadas por Caulobacter. Aunque crescentin fue descrito originalmente slo como la
funcin "-SI como" y predijo estructura secundaria de la protena a menudo se ha interpretado como una evidencia de que las
bacterias poseen homlogos antiguos de FI eucariotas. Sin embargo, hay varios argumentos en contra de esta interpretacin. En
primer lugar, Cres tiene una distribucin muy restringida (Fig. 3); Hasta la fecha, slo se ha encontrado en Caulobacter. Dada esta
gama restringida, si la lmina A y crescentin son verdaderamente homloga, entonces lo ms probable es Cres representan una
transferencia lateral de un gen eucariota para Caulobacter en lugar de un verdadero homlogo bacteriana. En segundo lugar, los
homlogos identificables de eucariota SI protenas se limitan a metazoos (o posiblemente holozoa; Fig. 3) y no siempre han estado
presentes en la herencia vertical LECA-excluye de procariotas.
En tercer lugar, las similitudes en arquitectura protena predicha (en este caso, las posiciones de espiral de la bobina) no son
equivalentes a veces homologa. En la actualidad, no es posible comparar eucariota SI protenas y crescentin para pruebas de
homologa veces, ya que no hay representantes de cualquiera de la familia para la que se han determinado las estructuras completas.
Adems, aunque ortlogos de crescentin no han sido identificados fuera de Caulobacter, existe evidencia de que Cres es un miembro
de una familia ms grande de protenas bacterianas (Bagchi et al., 2008). Todas estas protenas se prev que contienen largos tramos
de enrollado de las bobinas, pero la gran mayora no tienen similitud arquitectnica sorprendente con lamina A (u otro vertebrado
SI protenas). Por lo tanto, la distribucin de las regiones de doble arrollamiento en crescentin y lmina A es ms probable que un
ejemplo de la convergencia que un reflejo de ascendencia compartida.

Filamentos IV: protenas WACA

Los procariotas tienen cuarta clase de protenas formadores de hilos conocidos como Walker A citoesqueleto ATPasa (WACA; Michie
y Lowe, 2006). Protenas WACA son una familia diversa de ATPasas (Koonin, 1993), que son en s mismas parte de la extremadamente
grande superclase de protenas P-bucle que incluye protenas de reconocimiento de seal de partculas, Rho / Ras GTPasas y motores
del citoesqueleto (Leipe et al., 2002). El WACA mente es una ATPasa activa (de Boer et al., 1991) que forma filamentos dinmicos
alrededor de la periferia de la clula en E. coli e inhibe la formacin del anillo Z (Pichoff y Lutkenhaus, 2001;. Shih et al, 2003). En
Bacillus subtilis, la mente es esttica asociada con los polos de la clula (Marston et al., 1998; Marston y Errington, 1999), por lo que
es claro si la polimerizacin dinmica es una caracterstica conservado evolutivamente de la biologa mente. Secuencias de la mente
son encontrados en muchos grupos de bacterias (Fig. 3) y hay ortlogos putativos identificados en Euryarchaeota (Leipe et al., 2002).
Sin embargo, las diferencias entre las familias procariotas WACA an no se han resuelto por completo, por lo que es en la actualidad
no est claro si estas secuencias arqueas son monofiltico con la mente bacteriana. Incluso si no estrictos ortlogos mente, ejemplos
de protenas WACA s parecen estar presentes tanto en Euryarcheaota y Crenarchaeota (Makarova et al., 2010).
Varias otras protenas bacterianas WACA se han descrito. Par, PARF, y Soj todos juegan un papel en la segregacin de ADN por
mecanismos diferentes (Pogliano, 2008; Lwe y Amos, 2009), lo que demuestra una aparente versatilidad de este sistema para la
segregacin. Es quizs sorprendente, por lo tanto, que no hay filamentos WACA eucariotas. El pliegue de la mente y Soj es
lejanamente relacionado con el de septins eucariotas (Cordell y Lowe, 2001;. Leonard et al, 2005; Lwe y Amos, 2009), pero esto
muy probablemente refleja la relacin distante que comparten todos los GTPasas P-loop (Leipe et al., 2002). Hay, sin embargo, los
genes Mente de ascendencia bacteriana en Viridiplantae (plantas de algas verdes y tierra) y algunos stramenopiles (Fig. 3), que
desempean un papel en la divisin de plstidos (Marrison et al., 1999; Colletti et al., 2000; Kanamaru et al., 2000). Es de destacar
que todos los eucariotas que poseen genes presentes tambin codifican FtsZ endosymbiont derivados.

Divisin procariotas: un problema comn con muchas soluciones

Si hay un tema general que atraviesa la evolucin del citoesqueleto procariota, que parece ser la siguiente: plasticidad. Cada una de
las principales familias de protenas de filamentos de formacin cytomotive consta de varios paralogues, que a menudo son tan
divergentes entre s, ya que son de homlogos eucariotas. Algunas de las clases-como FtsA (del MreB / actina superfamilia) o las-
FtsZ como recientemente identificados familias pueden no formar filamentos en vivo en absoluto. Sin embargo, entre aquellas
familias que polimerizan, interacciones laterales en el filamento de ncleo parecen ser bastante maleable en escalas de tiempo
evolutivas sin interrumpir la polimerizacin (por ejemplo, filamentos MreB rectas, contra ParM torsin zurdo y diestro actina).
Tambin hay plasticidad en la funcin biolgica de las que se utilizan filamentos-FtsZ y MreB estn implicados en la divisin celular
y la morfologa, mientras que sus homlogos Tubz y ParM juegan un papel en el plsmido segregacin. El resultado es que los
procariotas utilizan diferentes sistemas para resolver problemas comunes. En las bacterias, la segregacin de ADN activo se puede
lograr por lo menos tres tipos de maquinaria de segregacin (Ebersbach y Gerdes, 2005; Hayes y Barilla, 2006). Sistemas de tipo I
utilizan protenas WACA, como Par y Soj. Sistemas de tipo II se basan en el Parm homlogo actina. Sistemas de tipo III son los de
Bacillus que utilizan homlogos-tubulina similares, tales como Tubz y RepX. En un notable ejemplo de la convergencia aparente,
tanto ParM (tipo II) y Tubz (tipo III) forman filamentos helicoidales similares que probablemente actan para impulsar adems
plsmidos (van den Ent et al, 2002;.. Aylett et al, 2010). Sin embargo, es de tipo I sistemas que son con mucho el ms amplia
propagacin en bacterias. Es interesante, entonces, que los filamentos a base de protenas WACA no se han conservado en
eucariotas, y no puede ser ampliamente utilizado en la segregacin cromosmica en arqueas (Bernander, 2000; Makarova et al.,
2010). Significativamente, ninguna de las familias de protenas del citoesqueleto es ubicuo a todos los procariotas, o incluso uno de
los dos dominios de la vida procariotas. El papel de FtsZ en la citocinesis parece ser la funcin de presin ms selectivo para la
retencin (Erickson, 2007), pero incluso esta protena se ha perdido de varios linajes de bacterias y todo el clado crenarchaeota.
Eukaryogenesis: familias y especializacin
A pesar de estar basado en filamentos homlogas, el citoesqueleto eucariota no es simplemente una versin ms extensa de la
procariota (Fig. 2 C). El complejo citoesqueleto eucariota se basa realmente en un conjunto ms pequeo de filamentos de
automocin ancestrales que el de los procariotas. Con la notable excepcin de la prokaryote- como maquinarias divisin asociados
con algunos plastidios, slo uno paralogue de una protena de la familia MreB / cranactin y una protena FtsZ / Tubz parece haber
fundado el citoesqueleto eucariota. Sin embargo, esta pequea seleccin ha sido objeto de varias rondas de duplicacin de genes y
la especializacin de este conjunto ancestral.
Los heterodmeros de y tubulina constituyen la gran mayora de la tubulina en las clulas eucariotas. Ellos son suficientes para
la produccin de los microtbulos in vitro, y es muy probable que ellos fueron los primeros tipos de evolucionar desde el nico
ancestro proto-tubulina. Sin embargo, no son los nicos tubulins ancestrales. Los anlisis sugieren que la familia tubulina abarca al
menos seis clases, nombradas , , , , e y , con otros dos tipos divergentes ( y ) que se encuentran en algunos organismos
(Vaughan et al., 2000; Dutcher, 2003). -tubulina juega un papel esencial en la nucleacin de microtbulos (a travs de la accin del
complejo anillo conservada -tubulina) y es, como y -, ubicuo a todos los eucariotas. En contraste, y tubulina tener papeles
centriolares (Dutcher y Trabuco, 1998; Chang y Stearns., 2000; Ruiz et al, 2000) y se conservan en casi todos los organismos que
construyen centriolos / cuerpos basales y ausente de organismos que han perdido cilios / flagelos (Hodges et al., 2010). Al menos
cinco de las clases de tubulina (, , , y ) se remonta al ltimo ancestro comn eucariotas comn (Fig. 3). Todos los tipos de
tubulina estn ms estrechamente relacionados entre s que a FtsZ / Tubz (Vaughan et al., 2000; Dutcher, 2003), lo que implica que
todos ellos descienden de un proto-tubulina comn por la duplicacin de genes.
Tanto la duplicacin y la especializacin en clases funcionalmente distintas deben haber ocurrido antes de la LECA. Hay
sorprendentes paralelismos entre la evolucin proto-eucariota de tubulinas y la de actina. Las protenas ms similares en secuencia
a la actina convencional son el ARP. Las ARP cubren al menos ocho grandes familias (Sehring et al., 2007) que se encuentra slo en
los eucariotas. Cuatro familias ARP (ARP4, 5, 6 sptimos, y 8/9) no estn asociados con la actina citoplasmtica, pero son protenas
nucleares implicadas en remodelacin de la cromatina (Chen y Shen, 2007; Dion et al., 2010). El resto de las familias-ARP1, 2, 3, y
10/11-tener un papel importante en la modificacin o ampliacin de la funcin de actina citoplasmtica. ARP1 es una parte integral
del complejo dynactin, que une el citoesqueleto de actina y tubulina a base de (Schroer, 2004). Levadura Arp10p y metazoos Arp11
(ARP10 / 11 miembros de la familia) tambin forman parte del complejo dynactin (Eckley y Schroer, 2003; Clark y Rose, 2006). En
contraste, un complejo de siete subunidades formadas alrededor de un heterodmero de ARP2 y ARP3 es un importante nucleador
F-actina en la mayora de los eucariotas (Pollard y Beltzner, 2002; Goley y Welch, 2006). La nica ARP que aparece para formar
filamentos es Arp1p (Schafer et al., 1994; Bingham y Schroer, 1999). Estos filamentos son mucho ms cortas que las observadas para
la actina, pero tienen morfologa similar.
En cuanto a la tubulina, no haba una sola protena-actina como en el proto-eucariota que evolucion en mltiples formas paralogous
antes de la LECA. De este modo, tanto la actina y tubulina citoesqueleto basado en inventaron independientemente complejos que
contienen formas divergentes de subunidades de filamentos que se especializan para la nucleacin (Arp2 / 3 y tubulina complejos
anillo). Sin embargo, en el caso del citoesqueleto de actina basada, este complejo de nucleacin parece ser prescindible en algunas
circunstancias porque orthologues de ARP2 y ARP3 se han perdido varias veces a travs de eucariotas (Fig 3;., Tenga en cuenta que
los organismos siempre pierden tanto, como sera esperado para un complejo). Charla cruzada entre los microtbulos y
microfilamentos a travs de la compleja dynactin tambin se ha perdido varias veces, como puede verse a partir de la distribucin
de ARP1.
La historia de estas familias principales del citoesqueleto eucariota tambin muestra cierto grado de plasticidad, pero es bastante
diferente de la observada en procariotas. Los parlogos eucariotas eran, en su mayor parte, presente en la LECA. Aunque existen
tipos divergentes raras (por ejemplo y tubulina), no tienen el mismo nivel de divergencia de tipos de ncleo como se ve para las
protenas procariotas divergentes. Por otra parte, su funcin biolgica parece ms esttico. La divergencia entre la distribucin de
las familias en los eucariotas existentes es en gran parte un producto de la prdida de la funcin (por ejemplo, prdida de la compleja
dynactin y ARP1; prdida de centriolos y / e tubulina).

Motores del citoesqueleto

Los procariotas utilizan la capacidad del automvil intrnseca de los filamentos del citoesqueleto para hacer el trabajo. Las clulas
eucariotas tambin utilizan la energa de polimerizacin / despolimerizacin (McIntosh et al., 2010). Sin embargo, en eucariotas la
dinmica intrnseca de los filamentos ha sido aumentada por la adicin del citoesqueleto motores dyneins, kinesins, y myosins-que
se derivan la energa de hidrlisis de ATP para realizar diversas tareas celulares. Cada uno de estos motores es una superfamilia que
contiene mltiples clases de protenas especializadas.
Kinesins y myosins comparten una estructura similar veces, lo que sugiere que tienen una ascendencia comn (Kull et al., 1996,
1998). Esto es bastante sorprendente, dado que ahora actan exclusivamente en microtbulos y F-actina, respectivamente, y
presenta una especie de enigma en trminos de biologa celular evolutiva.
Slo es plausible para motores a evolucionar despus de los filamentos en los que actan han sido establecidas. Como se ha
comentado anteriormente, los filamentos hechos de tubulina / FtsZ y homlogos de actina / MreB ya estaban bien establecidos en
procariotas antes de la aparicin de los eucariotas, aunque ambas clases de motor evolucionaron ms tarde en el proto-eucariota.
Esto requiere que: (1) un nico "ur-kinesin-miosina" originalmente entr en ambos filamentos de actina basada en tubulinand y slo
ms tarde se especializ en familias separadas; (2) un motor evolucionado para un tipo de filamento y posteriormente desarroll
una capacidad de moverse por el otro; o (3) familias tanto de motor evolucionaron independientemente de la misma familia de
NTPases. Las grandes diferencias en la estructura y la secuencia entre la tubulina / FtsZ y filamentos de actina / MreB sugieren que
el ltimo escenario es ms plausible, aunque menos parsimoniosa. Tambin hay un precedente para esto porque esta familia de
NTPases P-loop tambin dio lugar a muchas GTPasas-eucariotas especfica (incluyendo Arf, Ras / Rab, Rho / Ran, y G familias de
protenas; Leipe et al., 2002).
Dyneins tienen una estructura muy diferente a la de myosins y kinesins. El ncleo del complejo dinena es la dinena cadena pesada
(DHC), que es un miembro de otra superclase grande y diverso de NTPases, AAA + protenas (una familia incluyendo ATPasas
asociados a diversas actividades celulares). DHCS contiene seis dominios AAA + que forman un anillo hexameric intramolecular
(Sams et al., 1998; King, 2000;. Burgess et al, 2003), lo que implica que DHCS originalmente evolucion por cualquiera de
duplicacin de dominio intragnicos o fusin de genes que codifican AAA + protenas. Debido a que todas las clases de DHC tienen
la misma estructura, esta duplicacin se produjo antes de la creacin de parlogos funcionales. La superfamilia dinena es tambin
diferente de kinesins y myosins en que todos menos uno de los nueve clases estn asociados con uno especfico orgnulo-cilio. Slo
citoplasmtica dinena 1 tiene un papel conservado fuera del cilio; las otras familias de ser el motor retrgrado de transporte
intraflagellar (por razones histricas conocidas como dinena citoplasmtica 2) y siete familias de dyneins integradas en axonemas
mviles.
Dado su papel central en la clula eucariota, fue sorprendente encontrar a partir de anlisis genmicos posteriores de repertorios
motores que ninguna de las familias es ubicua a todos los eucariotas. De hecho, la miosina o dinena superfamilias se han perdido
en su totalidad a partir de algunos linajes (ver figura 3;.. Lawrence et al, 2001;. Matsuzaki et al, 2004; Richards y Cavalier-Smith,
2005; Wickstead y Gull, 2007). (. Wickstead y Gull, 2006; Wickstead et al, 2010) Hasta la fecha, kinesins estn codificadas por todos
los genomas secuenciados, pero el repertorio en cada linaje pueden ser muy diferentes -por ejemplo, Entamoeba histolytica codifica
slo los miembros de kinesin-5, - 14 y -15 familias (y ningn dinena en absoluto), mientras que el apicomplexan Theileria parva
codifica kinesin-8 y -13.

El axonema
Una de las estructuras icnicas del citoesqueleto eucariota es el axonema-cannicamente, nueve dobletes de microtbulos
radialmente colocados alrededor de un aparato central que contiene dos microtbulos singlete (Haimo y Rosenbaum, 1981). El
axonema es la estructura alrededor de la cual se forman todos los cilios y flagelos eucariotas. La evolucin de los flagelos / cilios
forma parte de una revisin de esta serie de Carvalho-Santos et al. (2011) y no se discutir en detalle aqu. Sin embargo, el axonema
representa una importante innovacin del citoesqueleto y aspectos de su evolucin son muy pertinentes a la aparicin del
citoesqueleto en el proto-eucariota.
Desde su distribucin en los organismos existentes, es claro que el axonema evolucion antes de que el ltimo ancestro comn de
los eucariotas. Desde entonces, se ha perdido de forma independiente a partir de mltiples linajes eucariotas (en particular, de
muchos linajes de plantas, hongos y amebas). Estas prdidas estn estrechamente correlacionadas con las prdidas de quinesina y
dinena familias ancestrales. El axonema evolucion a partir de los microtbulos del citoplasma (Cavalier-Smith, 1978, 1982, 2006).
Por lo general, se infiere a la primera axonema como las estructuras eran salientes basadas en microtbulos del cuerpo de la clula
con una funcin exclusivamente sensorial, similar a la inmovilidad ciliar se encuentra en muchos tipos de clulas animales
diferenciados (Rosenbaum y Witman, 2002; Jkely y Arendt, 2006; Satir et al., 2007). Axonemal la motilidad, por lo tanto, slo se
plantea ms tarde con la evolucin de las clases especializadas de dinena axonemal. Si se supone que la dinena citoplsmica 1
evolucion antes de las otras clases, a continuacin, las filogenias dinena apoyan esta hiptesis, lo que sugiere la evolucin del
transporte intraflagellar (IFT) antes de dinena axonemal (Wilkes et al, 2008;. Hartman y Smith, 2009). Este enraizamiento tambin
es consistente con la evolucin de la proto-cilio como un orgnulo mviles, pero donde el movimiento se bas originalmente en
deslizndose impulsada por la maquinaria IFT (Mitchell, 2004, 2007). Sin embargo, enraizamiento de DHC filogenias con el pariente
eucariota ms cercano de dinena, midasin (Garbarino y Gibbons, 2002; Iyer et al., 2004), sugiere que los microtbulos deslizamiento
fue mucho ms cerca del origen de la evolucin ciliar, emergiendo ante la maquinaria especializada para IFT (Wickstead y Gull, 2011).
Esto implica que el proto-cilio no evolucion a partir de un saliente immotile, pero desde un citoplasmtica mviles
haz de microtbulos anloga a los axostyles de oxymonads (Grimstone y Cleveland, 1965; McIntosh, 1973), es de suponer que se
monta de manera-IFT independiente al igual que algunos axonemas hoy (Witman, 2003; Briggs et al., 2004).

La revolucin proto-eucariota
Uno de los resultados ms sorprendentes de nuestra creciente capacidad para investigar las caractersticas de la LECA ha sido cmo
gran parte de la complejidad biolgica de las clulas existentes se remonta a esta clula ancestral. El LECA posea gran parte de la
complejidad ya visto en el replisoma (Liu et al., 2009), el spliceosome (Collins y Penny, 2005), y el sistema de endoctica (Dacks et
al., 2009), as como los mecanismos necesarios para la meiosis y bacterivora (Ramesh et al., 2005) (Cavalier-Smith, 2002b;. Yutin et
al, 2009). Por otra parte, el anlisis comparativo del genoma de la vida libre excavar Naegleria gruberi identific grupos 4,000
protenas que probablemente estaban presentes en la LECA (Fritz-Laylin et al., 2010).
Este modelo de "complejidad temprana" de la evolucin eucariota se refleja en el citoesqueleto (Fig. 2 D). En algn lugar en el
espacio evolutiva entre procariotas y el LECA, solo proto-tubulina y molculas proto-actina diversificado en mltiples formas
especializadas. Tres clases de motores surgi de manera independiente, y evolucionaron para incluir al menos nueve clases de
dinena, once clases de cinesina, y tres clases de miosina (Richards y Cavalier-Smith, 2005; Wickstead y Gull, 2007;. Wickstead et al,
2010). Adems de estos, el axonema form, con 100-200 protenas asociadas (Avidor-Reiss et al., 2004; Pazour et al, 2005;.
Broadhead et al., 2006), muchos de los cuales no tienen ortlogos procariotas. Entre los procariotas y el LECA, se produjo una
revolucin en la biologa del citoesqueleto. Esta complejidad no puede haber aparecido completamente formado, pero surgieron
por elaboraciones paso a paso de la estructura celular (y repertorio gentico). Sin embargo, el gran nmero de formas intermedias
ms simples que deben haber existido parece haber dejado descendencia. Esta es tal vez porque una gran parte de estos cambios
se produjo en un tiempo relativamente corto, con una sola innovacin creando un paisaje favorable para la evolucin de la prxima
(Cavalier-Smith, 2006). Por otra parte, todos los descendientes de estas formas intermedias han sido simplemente fuera competido
por la llegada de la LECA, con su endosimbiosis mitocondrial, endomembrana sistema, y el citoesqueleto sofisticado. Lo que est
claro es que desde este LECA compleja, la diversificacin en muchos linajes eucariotas ha sido a menudo no va acompaada de la
adicin de nuevas clases, sino por la prdida de los ancestrales. Algunas de estas prdidas estn asociados con la prdida de las
estructuras o funciones (tales como la motilidad axonemal) especficas, pero parece que hay una notable flexibilidad en el repertorio
precisa de muchos de estos antiguos familias que se requiere para la funcin de clula eucariota.
A pesar de que se construyen a partir de protenas homlogas, las funciones de filamentos procariotas y eucariotas no son
ampliamente homloga. En eucariotas, la segregacin de ADN se realiza de forma ubicua por el citoesqueleto basado-tubulina,
mientras que la citocinesis implica actina-miosina. En contraste, la mayora citocinesis procariota se basa en el homlogo FtsZ
tubulina, mientras que la actina-como, protenas de tubulina como, o WACA pueden ser utilizados para la segregacin de ADN. Esto
sugiere que un cambio debe haber ocurrido en la funcin del citoesqueleto en el proto-eucariota (Lwe y Amos, 2009). Sin embargo,
con varias formas divergentes que ocurre en ambas familias de filamento, y cada vez ms pruebas de plasticidad en funcin del
citoesqueleto procariota, esta vez no fue una transicin tan dramtico como podra parecer a primera vista.
FtsZ y tubulina estn muy conservadas protenas que estn restringidas en secuencia, sin embargo, son muy divergentes entre s
(Erickson, 2007). Debido a que este es el caso, cmo FtsZ (o un homlogo procariota de la misma) evolucionan hacia tubulina
eucariota? Se ha sugerido que tubulinas eucariotas evolucionaron a partir de una secuencia Tubz similar (Cavalier-Smith, 2010). Este
escenario tiene mucho de recomendable. Dado que las funciones Tubz en la segregacin de ADN, hay una transicin evolutiva
plausible el desarrollo de la mitosis a base de tubulina de los eucariotas. Por otra parte, Tubz y FtsZ coexisten en las clulas
bacterianas, lo que significa que una funcin tubulinlike podra evolucionar para un descendiente de Tubz sin la prdida de la funcin
celular basada en la escisin de FtsZ. Alternativamente, un FtsZ redundante, ya sea como resultado de la duplicacin de genes o la
evolucin de la citocinesis basado en actina, podra haber proporcionado la relajacin necesaria de la secuencia de restricciones
tales que FtsZ podra evolucionar hacia tubulina eucariota (Doolittle, 1995; Erickson, 2007). Curiosamente, el aumento en el tamao
celular que acompa eukaryogenesis puede haber sido uno de los factores que favorecen la sustitucin de la citocinesis a base de
FtsZ con un sistema basado en actina. Hasta la fecha, ningn anillo Z ha descrito que es mucho mayor que 1 m de dimetro. Incluso
muy grandes bacterias requieren slo estos pequeos anillos Z para la divisin porque forman nuevas clulas por gemacin
pequeas endosporas (Angert y Losick, 1998; Robinow y Angert, 1998). Esto ha llevado a la sugerencia tentativa de que puede haber
un dimetro mximo ms all del cual el anillo Z no puede funcionar de manera eficiente (Erickson, 2007).

Orgenes eucariotas
Junto a los muchos genes que parecen haber surgido especficamente durante la revolucin proto-eucariota, genomas eucariotas
contienen una mezcla de genes con ascendencia archaeal aparente y genes de origen bacteriano (Koonin, 2010). Los genes de origen
bacteriano aparente son ms numerosos (Esser et al., 2004; Rivera y Lago, 2004;. Makarova y otros, 2005). Debido a que todos los
eucariotas existentes son descendientes de un nico ancestro que ya contena el endosimbion mitocondrial, esto proporciona una
buena fuente candidato para muchos de los genes de origen bacteriano (aunque las afinidades filogenticas de estos genes son en
realidad ms bien mezclada y no slo desde el - proteobacterias; Koonin, 2010). En contraste, la mayor parte de la maquinaria para
la replicacin, transcripcin y traduccin parece ser fundamentalmente archaeal, o ms bien archaeal-like (Ribeiro y Golding, 1998;
Rivera et al, 1998;.. Yutin et al, 2008), lo que sugiere que la genoma nuclear eucariota se origin ya sea desde dentro de Archaea o
desde un grupo hermano de ella.
El citoesqueleto eucariota ms probable evolucion desde el host archaeal-como que un endosimbion bacteriana. Si asumimos que
la mitocondria fue adquirida por un proceso de fagocitosis como en un proto-eucariota, a continuacin, la estrecha asociacin entre
los sistemas de actina y endomembrana en eucariotas sugiere fuertemente que un citoesqueleto de actina primitiva estaba ya en
existencia (y por lo tanto el citoesqueleto de actina es en host y no derivados endosymbiont). Un origen Tal fagoctica proporciona
un mecanismo biolgicamente plausible para la adquisicin de las mitocondrias durante eukaryogenesis (Cavalier-Smith, 2002b;
Yutin et al., 2009), aunque la presencia de procariotas que viven en otros procariotas demuestra que la fagocitosis no es
necesariamente un requisito previo para la adquisicin (von Dohlen et al., 2001). El origen de la tubulina es menos clara. Sin
embargo, los filamentos al menos inicialmente FtsZ / Tubz del entrante -proteobacteria habran quedado atrapados en el "lado
equivocado" de tanto el fagosoma y las membranas bacterianas. Esto hara que no estn disponibles para las funciones de ADN o
de orgnulos movimientos en el host hasta que la transferencia de genes al genoma husped y traduccin posterior en el citoplasma
de acogida.
El hecho de que varias lneas eucariotas tambin todava poseen FtsZ mitocondrial identificable con funciones en la divisin orgnulo
sugiere que FtsZ del endosymbiont se vio limitado por una funcin conservada y no evolucion directamente en tubulina
citoplasmtica. Estudios filogentico apoyan de diversas maneras el origen de la pieza-arqueas como del genoma eucariota desde
dentro Crenarchaeota (Cox et al, 2008;.. Foster et al, 2009), Euryarchaeota o basal para cualquiera clado (Pisani et al., 2007) (Yutin
et al, 2008;.. Kelly et al, 2010). Alternativamente, tanto arqueas y eucariotas podran derivarse de una lnea extinta "neomuran"
(Brown y Doolittle, 1997; Cavalier-Smith, 2002a). Si ambos actina eucariota y tubulina se derivan de un host-arqueas como lugar de
la endosimbion, entonces, qu nos dice esto acerca de la posicin filogentica de los proto-eucariota? Debido FtsZ (y todos los
otros homlogos de tubulina identificados) faltan Crenarchaeota (Fig. 3), esto excluira un origen de los eucariotas desde dentro de
este grupo (los "eocytes"; Lago, 1988). Por el contrario, la protena crenactin archaeal recientemente identificado, que es
monofiltico con eucariotas actina / ARP y es el homlogo ms cercano existente de la actina eucariota, est ausente de
Euryarchaeota (Yutin et al., 2009). (.. Barns et al, 1996; Elkins et al, 2008) Teniendo en cuenta estos datos, la presencia de ambos
crenactin y FtsZ en Korarcheota, arqueas que parecen ser ni Euryarchaeota ni Crenarchaeota profundas ramificado., Es
particularmente interesante (ver figura 3 ). Cabe destacar que la korarchaeon secuenciado tambin contiene componentes clave de
ARN polimerasas eucariotas (Koonin et al., 2007) y las histonas (Bell y Negro, 2010). Tales inferencias ASED sobre la distribucin son
de ninguna manera definitiva (cabe destacar que la korarchaeon secuenciado carece ESCRT-III [Makarova et al., 2010], que se
encuentra en eucariotas). Sin embargo, ellos apoyan a una raz para los eucariotas ya sea incrustadas en una lnea archaeal basales,
o como una clula neomuran antes. En los ltimos 20 aos nuestro modelo de la evolucin del citoesqueleto ha cambiado en gran
medida. El citoesqueleto procariota se ha demostrado no slo existe, sino que es dinmica y diversa.
Sorprendentemente, tambin ha resultado ser prescindible, al menos en sus formas cannicas. Durante eukaryogenesis una enorme
cantidad de complejidad fue construido antes de que el LECA, pero la composicin en los organismos individuales existentes muestra
una flexibilidad notable. Como los datos ms biolgicos son recogidos y se hace posible analizar las secuencias de una mayor gama
de genomas, parece probable que ms sorpresas surgirn. Para procariotas, puede ser que todava algunos de los jugadores tienen
que ser parte de la etapa.