SINTESIS PROTEIN

Delayota Science Club

Januari 2011
Dogma Sentral

Aliran informasi genetik dari DNA ke Protein

Informasi (kode genetik) pada DNA akan
diekspresikan dalam bentuk protein
Kode genetik

Marshall Nirenberg
(1960)

Kode genetik tersusun atas pasangan tiga basa
nitrogen (triplet) yang melambangkan asam
amino tertentu maupun penghenti (STOP).

Degenerasi kode genetik: satu macam asam
amino dapat dikendalikan oleh beberapa kode
yang berbeda.
Proses Sintesis Protein

Sintesis protein: proses menerjemahkan kode genetik

pada DNA menjadi ciri-ciri nampak pada organisme.
Sintesis Protein pada Sel Prokariotik

Terdiri dari dua tahap yang berlangsung

tak terputus:
Transkripsi

Transkripsi merupakan proses pembentukan mRNA dari

untai DNA template (sense).

Untai DNA yang tidak ditranskripsi disebut antisense.
 Promoter Transcription unit

Tahap Transkripsi 5
3
Start point
DNA
3
5

RNA polymerase
Initiation

Inisiasi: RNA polimerase

menempel pada 5 3
3 5
promoter. RNA Template strand
Unwound tran- of DNA

Elongasi: RNA DNA script
Elongation
polimerase membuka
Rewound
untai DNA dan mulai DNA

membentuk mRNA 5
3 3 3
5
5

Terminasi: proses RNA
pembentukan mRNA transcript Termination

selesai, RNA polimerase

terlepas dari DNA. 5 3
3 5
5 3
Completed RNA transcript
Inisiasi Transkripsi

Enzim RNA polimerase menempel pada daerah

khusus pada DNA yang disebut promoter.

Promoter berupa pribnow box:
Sekuens TATATT di titik -10
Sekuens TTGACA di titik -35
Elongasi Transkripsi

RNA polimerase bergerak sepanjang DNA template
untuk membentuk mRNA.
Terminasi Transkripsi

Saat RNA polimerase mencapai terminator,

transkripsi berhenti

Dilanjutkan dengan tahap translasi.
Translasi
Amino

Translasi: pembentukan Polypeptide acids

polipeptida berdasarkan
tRNA with
kode-kode pada mRNA. amino acid
attached

Translasi melibatkan: Ribosome

 Ribosomal RNA (rRNA)

 Transport RNA (tRNA)

Ribosomes facilitate tRNA

specific coupling of tRNA Anticodon

anticodons with mRNA
codons in protein
5 Codons 3
synthesis.
mRNA
Struktur Ribosom

A ribosome has three binding sites for tRNA:

 The P site holds the tRNA that carries the growing
polypeptide chain
 The A site holds the tRNA that carries the next amino acid to
be added to the chain
 The E site is the exit site, where discharged tRNAs leave the
ribosome
Inisiasi Translasi

First, a small ribosomal subunit binds with mRNA and a
special initiator tRNA, then it moves along the mRNA
until reaches the start codon (AUG)

Proteins called initiation factors bring in the large subunit
so the initiator tRNA occupies the P site
Elongasi Translasi

mRNA bergerak sepanjang ribosom, terjadi

pembentukan polipeptida berdasarkan kode-
kode pada mRNA.
DNA strand 3 5
(template)

TRANSCRIPTION

mRNA 5 3

Codon
TRANSLATION

Protein

Amino acid
LE 17-18

Amino end
of polypeptide

E
3
mRNA
P A
Ribosome ready for site site
next aminoacyl tRNA 5
2 GTP

2 GDP

E E

P A P A

GDP
GTP

P A
Terminasi Translasi

Terminasi translasi adalah berhentinya proses

translasi. Terjadi saat tRNA mencapai STOP
kodon.
Sintesis Protein pada Sel Eukariotik

Sintesis Protein pada

sel eukariotik
berlangsung dalam
tiga tahap, yakni:
Transkripsi
RNA Processing
Translasi
Transkripsi

Transkripsi merupakan proses pembentukan messanger
RNA (mRNA) berdasarkan kode-kode genetik pada DNA
template.

Transkripsi terdiri dari 3 tahap yakni inisiasi, elongasi,
dan terminasi.

Transkripsi pada sel eukariotik melibatkan tiga macam
enzim RNA polimerase:
 RNA Polimerase I: untuk transkripsi gen kelas I yakni gen yang
mengkode pembentukan ribosomal RNA (rRNA).
 RNA Polimerase II: untuk transkripsi gen kelas II yakni semua
gen yang mengkode protein.
 RNA Polimerase III: untuk transkripsi gen kelas III yakni gen
yang mengkode pembentukan transport RNA (tRNA).
Inisiasi Transkripsi

Promoter terdiri dari:

 Sekuens TATA (-25)
 Sekuens CAAT

RNA Polimerase dan
faktor transkripsi (TFs)
menempel di promoter.

TFs berperan untuk
membuka untaian DNA.
Ada dua kelas TFs:
 basal TFs
 gene-specific-TFS
mRNA Processing

Pada sel eukariotik, hasil transkripsi

(hnRNA/pre-mRNA) tidak langsung dikeluarkan
dari nukleus untuk menjalani tahap translasi,
namun diproses terlebih dahulu di dalam inti sel.

Proses ini dapat terdiri dari:
 proses intron splicing
 penambahan 5 7-Methyl-G Cap
 penambahan poli-A tail
 modifikasi basa (tidak selalu terjadi).
 Alteration of mRNA Ends

Each end of a pre-mRNA molecule is modified in a

particular way:
 The 5 end receives a modified nucleotide cap
 The 3 end gets a poly-A tail

These modifications share several functions:
 They seem to facilitate the export of mRNA
 They protect mRNA from hydrolytic enzymes
 They help ribosomes attach to the 5 end
Splicing

hnRNA pada sel eukariotik terdiri dari dua bagian yang

letaknya berselang-seling:
 Intron: noncoding (interfering) regions
 Exon: coding regions

Splicing merupakan proses untuk menghilangkan intron
dan menyambungkan exon.

In some cases, RNA
splicing is carried out by
spliceosomes

Spliceosomes consist of
a variety of proteins and
several small nuclear
ribonucleoproteins
(snRNPs) that recognize
the splice sites

Ribozymes are catalytic
RNA molecules that
function as enzymes and
can splice RNA

This process produces
mRNA for translation
Translasi

Translasi pada sel eukariotik berlangsung di
ribosom yang terdiri dari:
Ribosom bebas (pada sitoplasma): mensintesis protein
yang akan digunakan dalam sel tersebut.
Ribosom terikat (pada retikulum endoplasma):
mensintesis protein yang akan digunakan di luar sel
tersebut.

Untuk menghasilkan protein yang fungsional,
ribosom terikat berhubungan dengan sistem
endomembran yang dapat memodifikasi protein
setelah proses translasi selesai (post-translation
modification).
Rangkuman Komparasi Bahan Genetis
Sel Eukariotik >< Sel Prokariotik
Faktor Pembeda Sel Prokariotik Sel Eukariotik
Bentuk DNA Melingkar Linear berpilin
(sirkuler) ganda
Enzim RNA Satu macam Tiga macam
polimerase
Ribosom Bebas, pada Bebas (pada
sitoplasma sitoplasma) dan
terikat (pada RE)
Rangkuman Komparasi Sintesis Protein
Sel Eukariotik >< Sel Prokariotik
Faktor Pembeda Sel Prokariotik Sel Eukariotik
Banyaknya protein Banyak Satu
tiap sintesis (polisistronik) (monosistronik)
Tahap sintesis Transkripsi Transkripsi
protein langsung translasi mRNA prosesing
translasi
Pemrosesan Tidak ada Ada
mRNA
Intron Tidak ada Ada
Kepadatan gen Tinggi rendah