Análisis conformacional de moléculas orgánicas

OCW 2013 J. Martnez y C.
Iriondo
TEMA 6. ANLISIS CONFORMACIONAL
Conformacin en molculas orgnicas acclicas.

Conformacin en molculas orgnicas cclicas.
Conformacin en heterociclos de seis miembros: Efecto
anomrico.
INTRODUCCIN
La Estereoqumica es la rama de la Qumica que se ocupa de los

aspectos tridimensionales de las molculas y de su reactividad. No se puede
entender la Qumica Orgnica sin tener en cuenta la Estereoqumica. Los
sistemas biolgicos son muy selectivos y a menudo discriminan molculas
con diferencias estereoqumicas muy pequeas.
El anlisis conformacional forma parte del estudio espacial de las

molculas, esto es, de la Estereoqumica.
Representacin espacial de la molcula de hexano Alanina
1
Tema 6. Anlisis conformacional
CONSTITUCIN, CONFIGURACIN Y CONFORMACIN
Se denominan ismeros a compuestos con la misma frmula

emprica pero diferente estructura.
Los ismeros constitucionales difieren en su secuencia de enlace,

presentan diferente conectividad. Un compuesto de frmula molecular
C4H10O puede presentar diferentes constituciones:
Los ismeros configuracionales tienen la misma conectividad pero

difieren en la disposicin espacial de los tomos. El 1,2-ciclobutanodiol (A)
puede presentar dos ismeros configuracionales segn si los dos grupos OH
estn hacia el mismo lado (B) o lados opuestos (C)
Los Ismeros conformacionales tienen la misma constitucin,

igual configuracin, pero difieren espacialmente en que se pasa de un
ismero a otro por simple rotacin de un enlace. Las diversas formas que
adquieren las molculas como resultado de la rotacin en torno a un enlace
sencillo, se llaman conformaciones y cada una de ellas constituye un
confrmero.
2
OCW 2013 J. Martnez y C. Iriondo
Una de las representaciones ms utilizadas del carbono tetradrico es

la llamada representacin en perspectiva:
As, en el caso del cloroetano podemos representar los distintos

confrmeros en perspectiva de la forma siguiente:
Los ismeros configuracionales y los conformacionales son

estereoismeros. Los estereoismeros tienen la misma conectividad pero
difieren en la orientacin de alguno de sus tomos en el espacio. Presentan
a menudo diferencias considerables en sus propiedades fsicas, qumicas y
biolgicas.
3
6.1 CONFORMACIN EN MOLCULAS ORGNICAS

ACCLICAS
6.1.1 Representacin de las molculas orgnicas
Existen diversas formas de representar en el plano las molculas.
A. Representacin en Perspectiva o Caballete
B. Proyeccin de Newman
En una proyeccin de Newman se representan dos tomos de carbono

contiguos en una molcula dentro de un crculo. En la parte delantera se
sita el tomo de carbono que se ve de frente y por detrs del crculo el
tomo de carbono solapado. Del centro de crculo salen por delante y por
detrs los tres sustituyentes de cada carbono
Carbono
H H H H posterior
H H H H H
C C C
Carbono
f rontal
H H H H H
H H H H
C.- Representacin de Fischer
En la representacin de Fischer un tomo de carbono tetradrico se

encuentra representado por el centro de una cruz y los sustituyentes se
colocan en los extremos de forma que los trazos verticales indican que los
enlaces van dirigidos hacia atrs del plano del papel y los horizontales hacia
delante. La cadena principal se dispone de forma vertical.
4
As, el cido 2-aminopropanoico podemos representarlo:
Si el compuesto presenta diferentes tomos de carbono, la cadena

carbonada se dibuja en vertical con los sustituyentes de cada carbono en
horizontal manteniendo siempre la norma de que los enlaces verticales van
hacia detrs del plano y los horizontales hacia delante.
6.1.2 Conformaciones del Etano
El enlace que une los tomos de carbono en el etano es

cilndricamente simtrico y permite la libre rotacin alrededor del mismo.
La rotacin alrededor del enlace CC interconvierte las diferentes
conformaciones del etano. El estudio de su comportamiento termodinmico y
cintico se denomina Anlisis Conformacional.
H H
HH
H H H H
60 60
H H H H H
H H
H H
H
Alternada Eclipsada Alternada
La primera figura representa a la molcula de etano donde los tomos

de hidrgeno se encuentran lo ms alejados posible con una interaccin
mnima entre ellos. Se denomina conformacin alternada.
5
La segunda proviene de haber realizado un giro de 60 al enlace CC

y donde los tomos de hidrgeno se encuentran de forma eclipsada.
De nuevo un giro de 60 al enlace CC nos conduce a una

conformacin alternada.
La energa potencial de la molcula es mnima para la conformacin

alternada, va aumentando con la rotacin y alcanza un mximo con la
conformacin eclipsada. La diferencia energtica o barrera de energa a
superar para pasar de una conformacin a otra es del orden de 3 kcal (ver
dibujo).
La mayora de las molculas de etano existen naturalmente en la

conformacin ms estable. Como la barrera de energa no es muy alta a
temperatura ambiente el nmero de colisiones con energa suficiente es
bastante grande de modo que la interconversin de confrmeros es rpida.
La energa requerida para rotar la molcula en torno al enlace CC se debe
a la tensin torsional.
6
El diagrama anterior representa los cambios de energa al pasar de

una conformacin a otra durante la rotacin del enlace simple CC.
Cuando se reemplazan los hidrgenos del etano por otros tomos o

grupos irn cambiando los niveles energticos de las conformaciones y su
estudio habr de realizarse para cada caso.
6.1.3 Conformaciones del propano
En el caso de la molcula de propano si representamos las

proyecciones de Newman segn uno de los enlace C C y vamos rotando el
enlace nos encontramos al igual que en el caso del etano con conformaciones
eclipsadas y alternadas.
H CH3 H CH3 H CH3
H H H
H H H H H H
H H H
ET ET ET
Ea = 3,4 kcal/mol
CH3 CH3 CH3 CH3

H H H H H H H H
H H H H H H H H
H H H H
0 60 120 180 240 300 360

ngulo de torsin
La barrera de energa entre una forma alternada y una eclipsada es

mayor que en el caso del etano (3,4 kcal mol-1) ya que el grupo metilo es ms
grande que el hidrgeno y las interacciones son mayores. Las
conformaciones alternadas son ms estables que las eclipsadas.
7
6.1.4 Conformaciones del n-Butano
Si nos fijamos en el enlace central CC podremos considerar al butano

a la hora de representarlo en Newman como una molcula similar a la de
etano en la que se han reemplazado dos tomos de hidrgeno por dos grupos
metilo.
Al igual que en el etano las conformaciones alternadas tienen menor

energa y son ms estables que las eclipsadas:
CH3 H CH3 CH3 H3C CH3 CH3

H H H3C H H CH3
H H
H H H H H H H H H H
CH3 H
CH3 H H
Anti Gauche Gauche
De todas las conformaciones alternadas aquella que tiene los dos

grupos metilo en posicin lo ms opuesto posible (ngulo diedro 180) se
denomina conformacin anti y es la ms estable. Las otras dos
conformaciones alternadas son de energa similar entre ellas y se
denominan conformaciones gauche donde los grupos metilo se encuentran
formando un ngulo diedro de 60 uno de otro. Existen dos conformaciones
de este tipo segn la rotacin alrededor del enlace CC.
De las tres conformaciones eclipsadas destacamos en primer lugar

aquella donde se encuentran eclipsados los dos grupos metilo que genera
mayor interaccin y por tanto menor estabilidad. Las otras dos
conformaciones eclipsadas presentan menor contenido energtico y son algo
ms estables. Ver el diagrama energtico.
8
H CH3 H3C CH3 H CH3
H H CH3
H H H H H
CH3 H H
E
Ea2 = 3,6 kcal Ea3 = 3,8 kcal
Ea1 = 3,8 kcal mol-1 mol-1
mol-1
0,9 kcal mol-1
CH3 CH3 CH3 CH3

H H H3C H H CH3 H H
H H H H H H H H
CH3 H H CH3
0 60 120 180 240 300 360

ngulo de torsin
impedimento
estrico
H
H H H
H C C H
C C
H H
H H
Conformacin totalmente eclipsada del butano
Las colisiones proporcionan la energa necesaria para superar la

barrera de la energa de activacin.
Interaccin Costo de energa

Kcal/mol KJ/mol
H H eclipsada 1,0 4
H CH3 eclipsada 1,4 6
CH3 CH3 eclipsada 2,6 11
CH3 CH3 gauche 0,9 3,8
9
6.2 CONFORMACIN EN MOLCULAS ORGNICAS

CCLICAS
Los cicloalcanos estn sometidos a una tensin de anillo llamada

Tensin de Bayer debido a la estructura cclica que presentan. Dicha tensin
es el resultado de tres factores:
- Tensin de Enlace
- Eclipsamiento de tomos y enlaces
- Tensin Estrica
A. La Tensin de Enlace en cicloalcanos es debida a la diferencia en el

solapamiento de los orbitales respecto a un alcano acclico. Cuanto ms
cercano es el valor del ngulo CCC al tetradrico (109,5) mayor ser el
solapamiento y menor la tensin de enlace.
ciclopropano ciclobutano ciclopentano ciclohexano
Esta tensin de enlace se puede medir calculando los calores de

formacin de los compuestos. El valor de dicha energa est directamente
relacionado con la estabilidad del compuesto.
El ciclohexano no presenta prcticamente tensin. El ciclopentano es

alrededor de 6 Kcal/mol menos estable que si no tuviera tensin. Los ciclos
grandes tambin presentan tensin de anillo debido a un ngulo de enlace
grande.
B. El eclipsamiento de tomos genera inestabilidad. Se comprueba que la

forma eclipsada del etano es unas 3 Kcal/mol menos estable que la
alternada.
10
C. El efecto estrico se debe a la interaccin de los tomos a travs del

espacio. Para evitar que la interaccin entre los tomos sea elevada, la
molcula adquiere una conformacin preferente, esto es la ms estable. Para
reducir las tensiones y conseguir as estabilidad, la conformacin preferente
ser aquella en la que los grupos voluminosos se alejan lo ms posible unos
de otros.
6.2.1 CONFORMACIN EN CICLOS DE TRES, CUATRO Y CINCO

TOMOS DE CARBONO
Ciclopropano
La desviacin del ngulo de enlace del anillo de tres miembros

respecto al ngulo correspondiente a una hibridacin sp3 es grande, por lo
que el ciclopropano presenta una tensin angular muy alta.
115
H H
C
1,510
60
H C C H
H 1,089 H
11
H
H
C H
H
H H ngulo
109,5 104 interorbital
C C
H H
H
H
C
H
H
Ciclobutano: Conformacin mariposa
La molcula presenta una estructura ligeramente alabeada. Los

enlaces CC estn menos curvados y su reactividad es menor que en el caso
del ciclopropano. La interconversin entre las distintas conformaciones es
rpida.
12
Ciclopentano: Conformacin sobre
El ciclopentano si fuera plano presentara una tensin por

eclipsamiento alta, debido a diez interacciones HH eclipsadas por lo que se
produce un plegamiento en el anillo. El plegamiento libera tensin torsional.
El ciclopentano no presenta la reactividad de los anillos de tres y cuatro
miembros.
H
104,4
H
1,113
1,546 106,0
6.2.2 ANLISIS CONFORMACIONAL DE CICLOHEXANOS
Ciclohexano: Conformacin silla
Si el ciclohexano presentara una estructura plana le correspondera

un ngulo de enlace de 120. Un carbono con hibridacin sp3 y sin tensin
presenta un ngulo tetradrico de 109,5, lo que hace que el ciclohexano
adquiera una conformacin no plana y ms estable: Conformacin silla.
13
El ciclohexano en conformacin silla presenta 6 tomos de hidrgeno

axiales y 6 hidrgenos ecuatoriales. Los hidrgenos axiales estn dirigidos
hacia arriba y hacia abajo del anillo, mientras que los hidrgenos
ecuatoriales se dirigen hacia fuera del anillo.
El ciclohexano en conformacin silla es susceptible de modificar su

conformacin por otra silla de igual estabilidad. A este fenmeno se le
denomina interconversin de dos formas silla.
Fijndose detenidamente en la interconversin se observa que el

enlace CH axial pasa a ser ecuatorial y viceversa, el ecuatorial pasa a ser
axial.
14
Conformacin bote
El paso de una conformacin silla a otra silla transcurre a travs de

una conformacin bote, siendo esta conformacin ms inestable que las
sillas.
H H H H
H H H H

Bote
H H H H
Bote torcido
15
Niveles energticos de los confrmeros del ciclohexano:
Si observamos una conformacin silla del ciclohexano de forma que el

tomo C-2 solapa al C-3 y el tomo C-6 solapa al C-5 podemos dibujar una
proyeccin de Newman del ciclohexano:
H H
H H H
6 H 4 4
H H H H
5
H 6,5 2,3
2 3 H
1 H H H
1
H H H
H H
16
6.2.3 CICLOHEXANOS SUSTITUIDOS
Si consideramos el metilciclohexano podemos proponer dos

estructuras que lo representen segn si el grupo metilo se encuentra en
posicin axial o ecuatorial.
Si el sustituyente diferente al hidrgeno se encuentra en posicin

axial se producen interacciones con los hidrgenos en posicin 3 y 5 del
anillo por proximidad espacial. Si se encuentra en posicin ecuatorial el
sustituyente va dirigido hacia fuera del anillo y las interacciones son
menores. Tal como era de esperar se encuentra que la conformacin con el
sustituyente en ecuatorial es alrededor de 1,8 kcal ms estable que si el
sustituyente se encuentra en posicin axial. As se dice que un sustituyente
en posicin axial presenta una interaccin 1,3-diaxial que lo hace menos
estable que en posicin ecuatorial.
En la siguiente figura se representan el Newman las dos

conformaciones de un ciclohexano sustituido tanto con el sustituyente en
posicin ecuatorial como en axial.
17
H H
H
H
Y
H H H
H Y H
H
H
H H H
H H
H Y
H Y
H H
H H
H H
H H
H H
Sustituyente Y
en posicin ecuatorial Sustituyente Y
en posicin axial
Ciclohexanos disustituidos
Si tenemos un ciclohexano dimetilsustituido podemos encontrarnos

con diferentes posibilidades:
A. 1,1-dimetilciclohexano
B. 1,2-dimetilciclohexano
C. 1,3-dimetilciclohexano
D. 1,4-dimetilciclohexano
En el caso A un grupo metilo se encontrar en posicin axial y el otro en

ecuatorial por lo que las dos conformaciones posibles sern igual de estables.
18
En cada uno de los casos restantes podemos representar dos

estructuras diferentes segn si los dos metilos se encuentran en cis (dirigidos
hacia el mismo lado del plano) o en trans (dirigidos hacia lados opuestos).
En B el ismero cis debe tener los dos metilos hacia el mismo lado del
plano central por lo que un metilo ser axial y el otro ecuatorial.
El ismero trans es el que tiene los dos metilos hacia lados opuestos por
lo que presentar los dos metilos en posicin axial o los dos en ecuatorial. La
conformacin que presente los dos en ecuatorial es mas estable que en axial
por lo tanto podremos decir que el ismero trans-1,2-dimetilciclohexano es
ms estable que el ismero cis-1,2 dimetilciclohexano.
En el caso del 1,3-dimetilciclohexano podemos representar:
H
CH3
H
CH3 CH3
H H
H
H3C ms estable
H CH3 CH3
cis-1,3-
19
CH3
H H
CH3 H
H CH3
misma estabilidad
CH3
H3C
H CH3 H
trans-1,3-
Se concluye que el ismero cis, que presenta los dos sustituyentes en

ecuatorial, es ms estable que el trans, que siempre tendr un metilo en
axial y otro en ecuatorial.
En el caso D, 1,4-dimetilciclohexano tendremos:
H H
H H
CH3 H3C
H H
CH3 CH3 misma estabilidad
cis-1,4- CH3 CH3
H CH3
CH3 H
CH3 H
H3C H
H CH3 ms estable
trans-1,4- H CH3
En este caso el ismero trans es ms estable por disponer los dos

metilos en ecuatorial.
Cuando se trata de ciclohexanos disustituidos con grupos diferentes el

ismero ms estable ser el que tenga el grupo ms voluminoso en
ecuatorial
20
H3C CH3
CH3
C
CH3 CH3
H
CH3 CH3
H CH3
H H
ms estable
Finalmente, en el caso de ciclohexanos polisustituidos que presenten

sustituyentes diferentes la conformacin preferente ser la que tenga el
mayor nmero de grupos voluminosos en posicin ecuatorial.
6.3 CONFORMACIN EN HETEROCICLOS DE SEIS

MIEMBROS: EFECTO ANOMRICO
Algunos de los heterociclos de cinco y seis miembros ms comunes en

los procesos biolgicos son:
A. Heterociclos oxigenados:
O O
O O
Furano Tetrahidrof urano Pirano Tetrahidropirano
B. Heterociclos nitrogenados:
21
Cuando se trata de heterociclos totalmente hidrogenados de cinco y

seis miembros como el tetrahidrofurano y el tetrahidropirano, la
conformacin ms estable que presentan es similar a la del ciclopentano y
ciclohexano respectivamente, es decir, conformacin sobre o conformacin
silla.
Los azcares de 5 y 6 tomos de carbono adquieren una estructura

cclica cuando se forma una unin hemiacetlica por reaccin del carbonilo
(aldehdo o cetona del azcar) con un grupo hidroxilo.
La reaccin de formacin del hemiacetal podemos esquematizarla de

la forma:
O OH
C + HO-R' C OR'
R H R H
Aldehdo Alcohol Hemiacetal
Para su estudio, los azcares se representan mediante estructuras

lineales siguiendo las normas de las proyecciones de Fischer.
As, a modo de ejemplo, la ribosa, la glucosa y la fructosa las podemos

representar:
22
Al formarse el hemiacetal la molcula adquiere una disposicin

curvada en la que la funcin aldehdo de la aldosa en el carbono 1 se ubica
prxima al hidroxilo del carbono 5, producindose la adicin al doble enlace
del carbonilo generando el hemiacetal cclico de seis miembros (anillo
piransido).
Lo mismo ocurre con las cetosas, pero en este caso la unin

hemiacetlica se da entre el carbono 2 y el carbono 5 formndose un anillo
de cinco miembros. (anillo furansido).
Forma piranosa Forma furanosa
23
Se utilizan diferentes formas de representar la estructura de la

glucosa en forma cclica:
OH
H C OH
CH2OH OH
H C OH O OH
O O O
HO C H OH HO
HO
H C OH OH OH H OH HO OH
OH OH
H C
OH
CH2OH
Anmeros
Se denominan anmeros a los ismeros de los monosacridos de ms

de 5 tomos de carbono que han desarrollado una unin hemiacetlica lo que
les ha permitido tomar una estructura cclica y determinar 2 diferentes
posiciones para el grupo hidroxilo ( o ) en el nuevo centro creado.
El anillo de piranosa debe ser similar al del ciclohexano y existir en

conformacin silla en preferencia a la de bote torcido para reducir al mnimo
las tensiones torsionales. El anlisis de rayos X demuestra que estas
suposiciones son correctas.
24
H OH Trans
H O
HO
HO H
H OH
CHO
H OH
H OH -D-glucopiranosa
HO H
Centro anomrico
H OH
H OH Cis
H OH
OH O
CH2OH HO
HO OH
H H
H H
-D-glucopiranosa
Los dos anmeros son designados anmeros alfa () o beta (), de

acuerdo con la relacin configuracional entre el centro anomrico y el tomo
de referencia anomrico. El centro anomrico est en el carbono
hemiacetlico y es el carbono anomrico C-1, que se une a travs del oxigeno
al C-5, que se une al oxgeno hemicetlico.
Hay sin embargo dos posibles conformaciones silla para un mismo

anmero de la D-(+)-glucopiranosa.
As, Para la -D-(+)-glucopiranosa hay dos posibles conformaciones.

Ser ms estable aquella que presenta los grupos ms voluminosos en
ecuatorial (A).
25
Qu sucede para la -D-(+)-glucosa? En este caso la conformacin

ms estable es aquella en la que el OH en el carbono anomrico est en axial
y los grupos voluminosos en ecuatorial (A).
Es interesante observar que de todas las D-aldohexosas, solo la -D-

(+)-glucopiranosa puede asumir una conformacin en la que cada uno de sus
grupos grandes puede ocupar una posicin ecuatorial. Esto concuerda con el
hecho de que la -D-(+)-glucopiranosa sea el azcar de mayor presencia en
la naturaleza.
26

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TEMA 6. ANLISIS CONFORMACIONAL

Conformacin en molculas orgnicas acclicas.

La Estereoqumica es la rama de la Qumica que se ocupa de los

El anlisis conformacional forma parte del estudio espacial de las

Representacin espacial de la molcula de hexano Alanina

CONSTITUCIN, CONFIGURACIN Y CONFORMACIN

Se denominan ismeros a compuestos con la misma frmula

Los ismeros constitucionales difieren en su secuencia de enlace,

Los ismeros configuracionales tienen la misma conectividad pero

Los Ismeros conformacionales tienen la misma constitucin,

Una de las representaciones ms utilizadas del carbono tetradrico es

As, en el caso del cloroetano podemos representar los distintos

Los ismeros configuracionales y los conformacionales son

6.1 CONFORMACIN EN MOLCULAS ORGNICAS

6.1.1 Representacin de las molculas orgnicas

Existen diversas formas de representar en el plano las molculas.

A. Representacin en Perspectiva o Caballete

En una proyeccin de Newman se representan dos tomos de carbono

C.- Representacin de Fischer

En la representacin de Fischer un tomo de carbono tetradrico se

As, el cido 2-aminopropanoico podemos representarlo:

Si el compuesto presenta diferentes tomos de carbono, la cadena

6.1.2 Conformaciones del Etano

El enlace que une los tomos de carbono en el etano es

La primera figura representa a la molcula de etano donde los tomos

La segunda proviene de haber realizado un giro de 60 al enlace CC

De nuevo un giro de 60 al enlace CC nos conduce a una

La energa potencial de la molcula es mnima para la conformacin

La mayora de las molculas de etano existen naturalmente en la

El diagrama anterior representa los cambios de energa al pasar de

Cuando se reemplazan los hidrgenos del etano por otros tomos o

6.1.3 Conformaciones del propano

En el caso de la molcula de propano si representamos las

H CH3 H CH3 H CH3

CH3 CH3 CH3 CH3

0 60 120 180 240 300 360

La barrera de energa entre una forma alternada y una eclipsada es

6.1.4 Conformaciones del n-Butano

Si nos fijamos en el enlace central CC podremos considerar al butano

Al igual que en el etano las conformaciones alternadas tienen menor

CH3 H CH3 CH3 H3C CH3 CH3

De todas las conformaciones alternadas aquella que tiene los dos

De las tres conformaciones eclipsadas destacamos en primer lugar

H CH3 H3C CH3 H CH3

CH3 CH3 CH3 CH3

0 60 120 180 240 300 360

Las colisiones proporcionan la energa necesaria para superar la

Interaccin Costo de energa

6.2 CONFORMACIN EN MOLCULAS ORGNICAS

Los cicloalcanos estn sometidos a una tensin de anillo llamada

- Eclipsamiento de tomos y enlaces

A. La Tensin de Enlace en cicloalcanos es debida a la diferencia en el

ciclopropano ciclobutano ciclopentano ciclohexano

Esta tensin de enlace se puede medir calculando los calores de

El ciclohexano no presenta prcticamente tensin. El ciclopentano es

B. El eclipsamiento de tomos genera inestabilidad. Se comprueba que la

C. El efecto estrico se debe a la interaccin de los tomos a travs del

6.2.1 CONFORMACIN EN CICLOS DE TRES, CUATRO Y CINCO

La desviacin del ngulo de enlace del anillo de tres miembros

Ciclobutano: Conformacin mariposa

La molcula presenta una estructura ligeramente alabeada. Los

Ciclopentano: Conformacin sobre