Dives User Guide V 3

Verso 3.
0
GUIA DO USURIO
2015
Como citar este Guia:
RODRIGUES, W.C., 2015. DivEs - Diversidade de Espcies v3.0 - Guia do Usurio.
Entomologistas do Brasil. 33p. Disponvel em: <http://dives.ebras.bio.br>.
Este guia est protegido pela lei de direitos autorais, 9.610 de 19 de fevereiro de
1998.
A distribuio deste guia baseada na Creative Commons License, para

maiores detalhes acesse o link abaixo:
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/3.0/br/
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Atualizado em: 1 de junho de 2015

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Verso: 3.1.0.1258
DivEs Diversidade de Espcies v3.0 Guia do Usurio 2015
Sumrio
1 Introduo ............................................................................................................... 6
2 O Que H de Novo Nesta Verso (3.1) ..................................................................... 7
2.1 Verso 3.0 ................................................................................................................ 7
3 Registro do Programa .............................................................................................. 8
4 Criando um Novo Arquivo de Dados ....................................................................... 9
5 Abrindo um Arquivo de Dados ................................................................................ 9
6 Salvando Arquivos de Dados ................................................................................. 10
7 Importando Arquivo .............................................................................................. 10
7.1 Comma Separated Values (CSV) ............................................................................ 11
7.2 Arquivo do Excel (xls) ............................................................................................ 12
8 Exportando Dados ................................................................................................. 12
8.1 Planilha do Microsoft Excel: .............................................................................. 13
8.2 Exportar para Pgina WEB: .................................................................................. 13
8.3 Comma Separated Value (CSV): ............................................................................ 13
8.4 Portable Document File (PDF): ............................................................................. 13
9 Editando um Arquivo de Dados ............................................................................ 13
10 Alterando os Nomes das Espcies e Levantamentos ............................................. 14
11 Editando os Valores Indivduos das Espcies/Txon ........................................... 14
12 Realizando Clculos ............................................................................................... 14
12.1 Estatstica Bsica dos Dados ................................................................................. 15
13 Configuraes do Programa (Preferncias) ........................................................... 16
13.1 Configurao Geral ................................................................................................ 16
13.2 Configurao dos Grficos ..................................................................................... 16
13.3 Configuraes Rpidas ...........................................................................................17
14 Grficos ...................................................................................................................17
15 Janela de Grficos .................................................................................................. 18
16 ndices Utilizados Pelo Software ........................................................................... 19
17 Diversidade ............................................................................................................ 19
17.1 Diversidade de Shanon-Wiener ............................................................................. 19
17.2 Diversidade de Simpson ........................................................................................ 20
17.3 Diversidade de Margalef ........................................................................................ 20
17.4 Diversidade de Gleason ......................................................................................... 20
17.5 Diversidade de Menhinick ..................................................................................... 20
17.6 Diversidade de McIntosh ....................................................................................... 21
17.7 Diversidade de Brillouin ........................................................................................ 21
17.8 Diversidade Total ................................................................................................... 22
18 Dominncia............................................................................................................ 22
18.1 Dominncia de Berger-Parker ............................................................................... 22
18.2 Dominncia de Simpson ........................................................................................ 22
3
19 Equitabilidade........................................................................................................ 22
Pgina
19.1 Equitabilidade J (Pielou) ....................................................................................... 22

19.2 Equitabilidade ED.................................................................................................. 23
19.3 Equitabilidade Hill (Modificado) .......................................................................... 23

19.4 Equitabilidade E (eH') ........................................................................................... 23
19.5 Equitabilidade de McIntosh .................................................................................. 24
20 Rarefao ............................................................................................................... 24
21 Riqueza de Espcies Jackknife 1 Ordem .............................................................. 24
22 Teste T para Diversidade ....................................................................................... 25
22.1 Diversidade de Simpson ........................................................................................ 26
22.2 Diversidade de Shanon-Wiener ............................................................................. 26
23 Script Calculadora ................................................................................................. 26
24 Notificar Erros ....................................................................................................... 28
25 Feedback ................................................................................................................ 28
26 Atualizao do Software ........................................................................................ 29
27 Auditoria ................................................................................................................ 30
28 Referncias ............................................................................................................ 32
4
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ndices de Figuras
Figura 1. Tela principal do programa. .................................................................................... 6
Figura 2. Formulrio de registro do software DivEsDiversidade de Espcies v3.0. ........... 8
Figura 3. Registro do software DivEsDiversidade de Espcies v3.0. .................................. 8
Figura 4. Aba Incio, painis Arquivo e Matiz de Dados. ....................................................... 9
Figura 5. Grade da Matriz de Dados. ...................................................................................... 9
Figura 6. Caixa de dilogo para manipulao do arquivo do programa. ............................. 10
Figura 7. Caixa de dilogo para salvar um arquivo como. ................................................... 10
Figura 8. Modelo de arquivo CSV a ser criado em uma planilha eletrnica. ........................ 11
Figura 9. Ferramenta de importao, que permite importar arquivos CSV e xls. ............... 12
Figura 10. Ferramenta de importao atravs da rea de transferncia.............................. 12
Figura 11. Formato de uma planilha do Excel que pode ser importada pelo DivEs............. 12
Figura 12. Opes de exportao de dados da matriz. ......................................................... 13
Figura 13. Caixas de dilogo para alterar os dados referentes ao cabealho da grade (nome
da espcie ou amostra). ........................................................................................................ 14
Figura 14. Grade de dados com informaes de indivduos por espcie/levantamento. ..... 14
Figura 15. Aba de ndices divididos por categoria. ............................................................... 15
Figura 16. Estatstica bsica dos dados. ............................................................................... 15
Figura 17. Grficos das mdias da estatstica bsica dos dados. .......................................... 16
Figura 18. A. Configurao Geral do software e B. Configurao dos Grficos do software. 17
Figura 19. Painel de configuraes para alterao rpida dos parmetros Base logartmica e
delimitador CSV. ...................................................................................................................17
Figura 20. Aba de grficos com as opes divididas por painis. ........................................ 18
Figura 21. Janela de grfico. ................................................................................................. 18
Figura 22. Aba dos ndices oferecidos pelo programa. ........................................................ 19
Figura 23. Aba Ferramentas. ................................................................................................ 25
Figura 24. Janela para comparao dos ndices de diversidade. ......................................... 25
Figura 25. Script Calculadora em duas etapas. Uma sem clculo e outra com clculo de
logaritmo na base 10. ............................................................................................................ 27
Figura 26. Formulrio de envio de erros do programa. ....................................................... 28
Figura 27. Tela de envio de Feedback para o desenvolvedor do programa DivEs. .............. 29
Figura 28. Campo assunto com os textos disponveis. ......................................................... 29
Figura 29. Ferramenta interna de atualizao do software. ................................................ 30
Figura 30. Painel de Ferramentas, com o painel de Auditoria. ........................................... 30
Figura 31. Janela de auditoria dos dados de um arquivo gerado. ........................................ 31
Figura 32. Ferramenta de auditoria rpida, que permite avaliar o contedo da grade,
prevenindo erros de clculos e no programa. ...................................................................... 31
5
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1 Introduo
D
ivEs - Diversidade de Espcies um software elaborado para calcular ndices de
diversidade, riqueza e dominncia de espcies, podendo ser utilizado em diversos
campos das reas biolgicas, agrrias e etc.
Este software permite a criao, edio e clculos dos dados referentes diversidade
de espcies estudadas. Os clculos aqui apresentados so retirados de diversas
bibliografias, listadas neste guia.
Os clculos realizados aqui foram testados excessivamente, proporcionando assim
uma maior preciso possvel. Os testes foram realizados com dados de artigos publicados
em peridicos cientficos, trabalhos publicados em eventos, teses de doutorado, relatrio
de atividades, etc.
Este guia tem por objetivo elucidar as questes relacionadas ao funcionamento do
software e sobre aspectos relacionados aos ndices utilizados.
A arquitetura do software segue a mesma adotada pela Microsoft no Sistema
operacional Windows, com atalhos, menus e barras de ferramentas, facilitando a utilizao
do software (Figura 1).
Figura 1. Tela principal do programa.

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2 O Que H de Novo Nesta Verso (3.0.7)

1. Adicionado o formulrio de importao de arquivos Excel e CSV.
2. Adicionada a Script Calculadora para clculos cientficos.
3. Melhoria no sistema de Auditoria;
4. Correes de Bugs
a. Digitao de letras na matriz de dados;
b. Erro no processamento de clculos.
2.1 Verso 3.0.7

1. Implementao da Script Calculadora;
2. Formulrio de Importao de arquivos;
3. Melhoria no sistema de Auditoria.
2.1.1 Verso 3.0
1. Interface totalmente redesenhada - Totalmente reescrito em Visual Basic.Net;

2. Novos ndices;
3. Diversidade de Brillouin
4. Equitabilidade E
5. Equitabilidade U (McIntosh)
6. Rarefao
7. Compatvel com Windows Vista, 7, 8 e 8.1
8. Novos grficos e opes de grficos;
9. Clculo para comparao de diversidades (Shanon e Simpson);
10. Nova ferramenta de atualizao do software;
11. Nova ferramenta de feedback;
12. Nova ferramenta de envio de erros;
13. Nova ferramenta de registro de gerao de nmero de srie automtico do
software; e
14. Sistema de registro automtico
7
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3 Registro do Programa
Nesta nova verso, o nmero de srie gerado e enviado automaticamente para o
usurio, desde que o mesmo indique um e-mail vlido no formulrio de Registro (Figura
2).
Figura 2. Formulrio de registro do software DivEsDiversidade de Espcies v3.0.
O registro deve ser realizado informando os dados enviados para o e-mail de

registro (Figura 3).
Figura 3. Registro do software DivEsDiversidade de Espcies v3.0.

8
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4 Criando um Novo Arquivo de Dados

Para criar um novo arquivo, basta acessar a barra de ferramentas, Aba Incio e
clicar no cone Novo (Figura 4), no painel Arquivo em seguida acessar o painel Matriz
de Dados.
Figura 4. Aba Incio, painis Arquivo e Matiz de Dados.
Ao acessar o painel matriz de dados o usurio deve inserir os dados referentes aos
nmero de levantamentos/amostras e o nmero de espcies/gnero/famlia. Em seguida
clicar em Criar. Aps clicar aparecer uma grade (Figura 5)
Figura 5. Grade da Matriz de Dados.
A partir deste momento basta inserir os valores inteiros em cada clula, sendo
permitido deixar clulas em branco.
5 Abrindo um Arquivo de Dados

O arquivo de dados do programa DivEs, possui extenso prpria: de3.
Para abrir um arquivo clique na Aba Arquivo, boto Abrir. Outro caminho atravs do
menu inicial (DivEs) (Figura 6) cone correspondente ou atravs do os 5 (cinco) ltimos
arquivos recentemente acessados.
Outra forma de abrir uma arvuido atravs do cone abrir no menu inicial (DivEs).
Ou dando um clique nico ou duplo (dendendo da configurao) no arquivo com extenso
de3.
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Pgina
Figura 6. Caixa de dilogo para manipulao do arquivo do programa.
6 Salvando Arquivos de Dados

Existem duas formas de salvar o arquivo, uma atravs da Barra de Ferramenras,
Aba Incio, Painel Arquivo e cone Salvar (Figura 4). A outra forma atravs do menu inicial
(DivEs) (Figura 4). Neste menu, encontram-se duas opes Salvar e Salvar como.... A primeira
salva o arquivo j existente ou abre a caixa de dilogo para salvar um arquivo ainda no salvo. A
segunda permite salvar o arquivo em local e/ou nome diferentes (Figura 7).
Figura 7. Caixa de dilogo para salvar um arquivo como.

10
7 Importando Arquivo
Pgina
A importao possui uma ferramenta exclusiva, que permite importar atravs da

abertura de um arquivo CSV ou XLS, como tambm atravs da rea de transferncia

(Figura 9 e Figura 10).
Aps abrir arquivo a ser importado ou colar os dados copiados de uma planilha
eletrnica, o usurio deve clicar em Importar. Um novo arquivo ser criado na tela
principal do programa.
Atravs da ferramenta de importao o usurio poder editar os dados, inserir ou
excluir linhas e colunas, alm de ser possvel renomear os nome das linhas e colunas, antes
mesmo de importar para a tela principal.
Ao copiar dados de uma planilha eletrnica, lembre-se que somente os valores
numricos devem ser copiados e lembre tambm de mensurar o tamanho da matriz, pois o
software solicitar o nmero de colunas e linhas a serem criadas.
7.1 Comma Separated Values (CSV)

possvel importar arquivos no formato CSV (Comma Separated Values), gerados
em qualquer programa externo, desde que o delimitador seja o ponto e vrgula (;).
No especificar os valores das colunas ou das linhas, pois isso gera um erro no
programa. Veja os modelos de arquivos na Figura 8.
Planilha eletrnica
Bloco de Notas
Figura 8. Modelo de arquivo CSV a ser criado em uma planilha eletrnica.
O processo de importao foi otimizado, eliminando erros anteriormente ocorridos,

com a associao dos dados a uma base dados, o que no permitia a edio da grade.
11
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Figura 9. Ferramenta de importao, que permite importar arquivos CSV e xls.
Figura 10. Ferramenta de importao atravs da rea de transferncia.
7.2 Arquivo do Excel (xls)

O software permite a importao de planilhas do Microsoft Excel, onde o formato
do arquivo deve ser xls (planilhas 97-2003), como a primeira a linha, contendo a descrio
das colunas e todas as linhas com valores numricos. Ressaltando que no deve ser incluso
na primeira coluna nome de espcies, que poder ser feito posteriormente atravs do
DivEs (vide Alterando os Nomes das Espcies e Levantamentos).
Figura 11. Formato de uma planilha do Excel que pode ser importada pelo DivEs.
8 Exportando Dados
12
Existe duas formas de exportao dos dados, uma travs do menu inicial (DivEs),
boto Exportar, onde surgiro quatro opes conforme segue abaixo. A segunda forma
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atravs da Aba Incio, painel Exportar (Figura 12).

Figura 12. Opes de exportao de dados da matriz.
8.1 Planilha do Microsoft Excel:

Exporta os dados do arquivo para o formato do Excel (xls 1997-2003), preservando
a formatao das colunas e linhas.
8.2 Exportar para Pgina WEB:

Exporta os dados do arquivo para o formato da WEB (htm ou html).
8.3 Comma Separated Value (CSV):

Exporta os dados do arquivo de dados para o formato no formato CSV, separado
por vrgula ou ponto e vrgula. O tipo de delimitador (vrgula ou ponto e vrgula) pode ser
configurado nas configuraes do programa.
8.4 Portable Document File (PDF):

Exporta os dados do arquivo de dados para o formato de PDF, mantendo a
formatao da grade de dados.
9 Editando um Arquivo de Dados

Para alterar os dados do nmero de espcies e de amostras realizadas, altere o valor
nos campo N de espcies e N de levantamentos, em seguida clique no Criar . Caso os
valores atribudos sejam menores que o nmero de espcie/ levantamento, o programa
exibir um aviso, que os dados sero excludos caso a confirmao seja realizada. Por
exemplo: se o arquivo possui 5 (cinco) espcies no campo nmero de espcies alterado
para 3 (trs), os dados das duas ltimas espcies sero excludos em todos os
levantamentos. A mesma regra se aplica para os nmeros de levantamentos.
13
A excluso de linhas e colunas tambm altera o nmero de espcies ou

levantamentos, respectivamente.
Pgina
10 Alterando os Nomes das Espcies e Levantamentos

Ao criar as linhas de espcies e colunas de levantamentos, o programa atribui o nome
espcie <i> para cada espcie e Amostra <i> para cada levantamento especificado, onde i o
nmero da coluna. Para alterar estes dados e torn-los mais entendveis para o usurio, basta clicar
duplo na linha para alterar o nome da espcie e clicar duplo na coluna para alterar o nome do
levantamento (Figura 13).
Figura 13. Caixas de dilogo para alterar os dados referentes ao cabealho da grade
(nome da espcie ou amostra).
11 Editando os Valores Indivduos das Espcies/Txon

Para alterar os valores referentes ao nmero de indivduos de cada espcie, basta selecionar
o campo desejado e digitar (entrar) com o valor desejado diretamente na grade de dados ( Figura
14).
Figura 14. Grade de dados com informaes de indivduos por espcie/levantamento.
12 Realizando Clculos
Para realizar os clculos basta criar ou abrir um arquivo de dados existente, edit-lo, se for o
caso, e por fim escolher o tipo de clculo a ser realizado no menu ndices ou na barra de ferramentas
na Aba ndices (Figura 15).
Note que os clculos de diversidade que envolvem base logartmica, tem que haver o prvio
ajuste das configuraes do programa quanto a base a ser utilizada pelo programa. Duas opes so
oferecidas pelo programa: Base 2 e Base 10 (Padro).
Para alterar a base Log o usurio dever acessar as configuraes do programa. Para maiores
detalhes veja o tpico Configuraes do Programa.
14
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Figura 15. Aba de ndices divididos por categoria.
12.1 Estatstica Bsica dos Dados

O software oferece a estatstica bsica do arquivo de dados (Figura 16). Os itens analisado
so:
Considerando o nmero de indivduos de cada espcie;
Mdia aritmtica
Desvio padro das espcies
Soma
Considerando o nmero de levantamentos e espcies;
Mdia aritmtica
Somatrio x
Somatrio x
Desvio Padro
Varincia
Coeficiente de Variao
Erro Padro da Mdia: s(x)
15
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Figura 16. Estatstica bsica dos dados.

O software ainda permite gerar um grfico com as mdias por levantamento

(Figura 17).
Estes parmetros estatsticos permitem que o usurio faa uma avaliao superficial e geral
dos dados de seus levantamentos, possibilitando direciona-lo para uma anlise estatstica mais
apurada e auxiliando na interpretao dos dados de riqueza, diversidade e dominncia das espcies
analisadas nos arquivos.
Figura 17. Grficos das mdias da estatstica bsica dos dados.
13 Configuraes do Programa (Preferncias)

O programa oferece uma srie de configuraes que sero explanadas a seguir:
13.1 Configurao Geral

Na aba geral (Figura 18). O usurio poder alterar as seguintes configuraes:
Base logartmica (padro 10);
Delimitador do arquivo CSV (padro vrgula);
Estilo do Ribbon (barra de ferramentas) (padro Office 2010);
Envio de Erros;
Associao do arquivo de3.
13.2 Configurao dos Grficos

Permite alterar as seguintes opes (Figura 11):
Fonte dos grficos (padro Times New Roman, Regular, 12 pt)
Cores das sries (padro Azul, Vermelho e Verde);
Tipo de grficos (Padro Column)
16
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A B
Figura 18. A. Configurao Geral do software e B. Configurao dos Grficos do

software.
13.3 Configuraes Rpidas

possvel alterar algumas configuraes de modo rpido, atravs da barra de ferramentas,
Aba Ferramentas, Painel Configuraes. Neste local possvel alterar a base do logaritmo e o
delimitador do arquivo CSV (Figura 18). Estas alteraes refletem nas configuraes do programa e
alteram os valores na tela da Figura 19.
Figura 19. Painel de configuraes para alterao rpida dos parmetros Base
logartmica e delimitador CSV.
14 Grficos
O programa permite a criao de grficos em 2D e 3D. As opes de grficos podem ser
acessadas atravs das preferncias do programa e consultadas neste manual no item Configuraes
do Programa - Grficos. Os grficos a serem exibidos pelo programa so relacionados aos clculos
dos ndices do programa (Figura 9).
Na barra de ferramentas, Aba Grficos, encontra-se a opes para gerar o grfico referente
ao ndice desejado (Figura 20). So 17 ndices. Veja o tpico (ndices Utilizados Pelo Software).
17
Pgina
Figura 20. Aba de grficos com as opes divididas por painis.
15 Janela de Grficos
Depois de gerado o grfico possvel alterar a sua formatao, sem alterar as
configuraes gerais do programa.
Nesta janela possvel alterar as seguintes configuraes: Cor da coluna; Ttulo do
Eixo Y; Ttulo do Eixo X; Ttulo do Grfico; Cor do fundo do grfico; Gradiente do fundo;
Gradiente da(s) coluna(s); Tipo do Grfico (para alguns ndices no possvel); Grfico
3D; Espessura da Borda; Exibio dos valores e Fonte o Grfico.
Figura 21. Janela de grfico.
possvel ainda exportar o grfico para os seguintes formatos: Jpg; Bmp; Png; Wmf,
Gif; Tiff, Emf. As configuraes para cada tipo automtica, mas preserva a qualidade da
imagem final, permitindo o envio para publicao sem a preocupao de alter-los suas
caractersticas de qualidade grfica no futuro.
18
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16 ndices Utilizados Pelo Software

Ao todo so 17 ndices de diversidade, dominncia, equidade, riqueza e rarefao de espcies.
Diversidade
o Diversidade de Shanon-Wiener
o Diversidade de Simpson
o Diversidade de Margalef
o Diversidade de Gleason
o Diversidade de Menhinick
o Diversidade de McIntosh
o Diversidade de Brillouin
o Diversidade Total
Dominncia
o Dominncia de Berger-Parker
o Dominncia de Simpson
o Equitabilidade (Equidade)
o Equitabilidade J (Pielou)
o Equitabilidade ED (Simpson)
o Equitabilidade de Hill (Modificado)
o Equitabilidade E (eH')
o Equitabilidade de McIntosh
Riqueza
o Jackknife 1Ordem
Rarefao
o ndice de Rarefao de Espcies
Os ndices so acessados atravs da barra de ferramentas, aba ndices. (Figura 22).
Figura 22. Aba dos ndices oferecidos pelo programa.
17 Diversidade
17.1 Diversidade de Shanon-Wiener

19
Este ndice foi proposto por SHANON (1948), e possui uma vantagem em relao aos ndices
Pgina
de Margalef, Gleason e Menhinick, pois apropriado para amostras aleatrias de espcies de uma
comunidade ou sub-comunidade ou sub-comunidade de interesse, e estimado atravs da seguinte
equao:

= log
=1
Onde: pi a proporo da espcie em relao ao nmero total de espcimes encontrados
nos levantamentos realizados, Logb = logaritmo na base b (2 ou 10).
17.2 Diversidade de Simpson

Este ndice foi proposto por SIMPSON (1949), e possui uma vantagem em relao aos
ndices de Margalef, Gleason e Menhinick, pois no somente considera o nmero de
espcies (s) e o total de nmeros de indivduos (N), mas tambm a proporo do total de
ocorrncia de cada espcies. A diversidade de Simpson estimada atravs da seguinte
equao:
=1 (1)
= 1
( 1)
Onde: ni o nmero de indivduos de cada espcie; N o nmero de indivduos.
17.3 Diversidade de Margalef

Este ndice foi proposto por MARGALEF (1951), citado por MARGALEF (1958) e
BROWER et al. (1997). um ndice simples de diversidade considerando somente o nmero
de espcies (s-1) e o logaritmo (base 10 ou natural) do nmero total de indivduos. O ndice
de diversidade de Margalef (D ou ) estimado atravs da seguinte equao:
1
=
log
Onde: s o nmero de espcies amostradas; N o nmero total de indivduos em todas as
espcies; Logb = logaritmo na base b (2 ou 10).
O ndice de Margalef muito prximo dos ndices de Gleason e Menhinick.
17.4 Diversidade de Gleason

Este ndice foi proposto por GLEASON (1922), citado BROWER et al. (1997). um
ndice simples de diversidade considerando somente o nmero de espcies (s) e o
logaritmo (base 10 ou natural) do nmero total de indivduos. O ndice de diversidade de
Gleason (Dg) estimado atravs da seguinte equao:

=
log
O ndice de Gleason muito prximo dos ndices de Margalef e Menhinick.
17.5 Diversidade de Menhinick

20
Este ndice foi proposto por MENHINICK (1964). um ndice simples de diversidade
Pgina
considerando somente o nmero de espcies (s) e a raiz quadrada do nmero total de

indivduos. O ndice de diversidade de Menhinick (Db) estimado atravs da seguinte

equao:

=

O ndice de Menhinick muito prximo dos ndices de Margalef e Gleason.
17.6 Diversidade de McIntosh

Este ndice foi proposto por MCINTOSH (1967). um ndice simples mais complexo
que os ndices Margalef, Gleason e Menhinick, pois considera nmero total de indivduos
(N) e a o valor U, que o raiz quadrada do somatrio dos indivduos ao quadrado de cada
espcies. O ndice de diversidade de McIntosh (D) estimado atravs das seguintes
equaes:

=

Onde: N o nmero total de indivduos da(s) amostra(s); e U calculado com segue:

= 2
=1
Onde: ni o nmero de indivduos pertencente a isima espcie.
17.7 Diversidade de Brillouin

Este ndice foi proposto por BRILLOUIN (1962) e recomendado quando a
aleatoriedade da amostra no pode ser garantida, como durante amostragens de insetos
com armadilhas luminosas, ou se a comunidade foi totalmente identificada, com todos os
indivduos contados, o ndice de Brillouin a forma apropriada a ser utilizada (DUTRA
1995, citando vrios autores).
Entretanto, a maior dificuldade encontrada para a utilizao do ndice de Brillouin
est na obteno do logaritmo natural (ln) do fatorial de valores acima de 69, j que o
clculo deste valor o limite da maioria das calculadoras e microcomputadores.
O ndice de Brillouin usado em vez do ndice de Shannon quando a diversidade de
amostras no aleatrias ou colees est sendo estimado. Por exemplo, peixes coletados usando a
luz produzir amostras tendenciosas uma vez que nem todos os peixes so atrados pela luz. O ndice
de Brillouin aqui utilizado para calcular a diversidade de peixes recolhidos por engrenagens, que
utilizam a luz para a pesca (KHAN 2006).
ln ! =1 ln !
=

Onde: ln o logaritmo natural; N! = fatorial do nmero total de indivduos da amostra; n =
21
nmero de indivduos da espcie.

Pgina
17.8 Diversidade Total

Estima a diversidade total de uma regio e poder ser estimada como uma funo
da variao de espcies SV(i) (COUTERON & PLISSIER 2004). estimada pela equao
seguinte:

= [ (1 )]
=1
Onde: wi peso dado funo, que expressa a importncia que se quer dar a espcie i na
quantificao global da diversidade regional; pi a frequncia relativa.
1
=

18 Dominncia
18.1 Dominncia de Berger-Parker

Este ndice de dominncia foi proposto por BERGER & PARKER (1970). um ndice
simples quando comparado com o ndice de dominncia de Simpson, porm eficiente.
Considera a maior proporo da espcie com maior nmero de indivduos. calculada
atravs da seguinte equao:

=

Onde: Nmax o nmero de indivduos da espcie mais abundante e NT o nmero total de
indivduos na amostra.
18.2 Dominncia de Simpson

Determinada em funo do ndice de diversidade de Simpson (SIMPSON 1949).
determinada pela equao:
=1 (1)
= 1 ( )
( 1)
Onde: ni o nmero de indivduos de cada espcies; N o nmero de indivduos.
19 Equitabilidade
19.1 Equitabilidade J (Pielou)

Equitabilidade se refere distribuio dos indivduos entre as espcies, sendo
proporcional diversidade e inversamente proporcional a dominncia. A medida de
Equitabilidade ou Equidade, compara a diversidade de Shanon-Wiener com a distribuio
22
das espcies observadas que maximiza a diversidade. Este ndice obtido atravs da
equao:
Pgina

=

Onde H o ndice de Shanon-Wiener e Hmax dado pela seguinte expresso:
= log
Onde s o nmero de espcies amostradas; Logb = logaritmo na base b (2 ou 10).
Antes de utilizar este ndice deve-se considerar dois pontos importantes:
Todas as amostras so provenientes do mesmo ambiente e;
A amostragem foi suficiente para conter amostras de todas as espcies?
19.2 Equitabilidade ED
Equitabilidade se refere distribuio dos indivduos entre as espcies, sendo
proporcional diversidade e inversamente proporcional a dominncia. A medida de
Equitabilidade ou Equidade compara a diversidade de Simpson com a distribuio das
espcies observadas que maximiza a diversidade. Este ndice obtido atravs da equao:

=

Onde: Ds = ndice de diversidade de Simpson e Dmax obtido pela seguinte equao:
1
= ( )( )
1
Onde: s o nmero de espcies e N o nmero total de indivduos da amostra.
19.3 Equitabilidade Hill (Modificado)

um ndice de equitabilidade, que se refere distribuio da abunncia das
espcies, ou seja, a maneira pela qual a abundncia das espcies, ou seja, a maneira pela
qual a abundncia (por exemplo, nmero de indivduos) est distribuda entre as espcies
numa amostra so igualmente abundantes, o ndice de equitabilidade deve assumir o valor
mximo e decresce tendendo a zero, medida que as abundncias relativas das espcies
divergem dessa igualdade.
Ele tem como parmetro os ndices de Simpsom e Shanon (URAMOTO et al. 2005).
(1 )
= [ ]
1
Onde: Ds = ndice de diversidade de Simpson e H ndice de diversidade de Sahnon-Wiener

e igual 2,718282...
19.4 Equitabilidade E (eH')

a proporo que o valor de espcie-equivalente representa em relao ao nmero de
espcies da comunidade, foi proposto por BUZAS & GIBSON ( 1969).

23
( )=
e = logaritmo natural (e = 2,7182828), H = diversidade de Shanon-Wiener; S= nmeros

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de espcies por levantamento.

19.5 Equitabilidade de McIntosh

A equitabilidade de McIntosh pode ser calculada a partir de uma variao da
frmula da diversidade do mesmo ndice, portanto pode ser calculada atravs da equao:

=

Onde: N o nmero total de indivduos; S = nmero total de espcies da
amostra/levantamento.

= 2
=1
Onde: ni o nmero de indivduos pertencente a isima espcie.
20 Rarefao
Segundo BARROS (2007) Em comparaes de comunidades, o nmero de espcies
por nmero de indivduos amostrados uma medida bastante til. Entretanto,
frequentemente a comparao de comunidades baseada em diferentes tamanhos
amostrais, que, por sua vez, iro dificultar concluses. Como comparar, por exemplo, uma
comunidade em que foram observadas nove espcies numa amostra d e 23 indivduos
com uma segunda onde foram observadas seis espcies numa amostra de 13 indivduos?
Para lidar com este problema uma soluo proposta a tcnica de Rarefao, que consiste
em calcular o nmero esperado de espcies em cada amostra para um tamanho de amostra
padro. O nmero esperado de espcies obtido pela equao:

(

)
() = [1 ]
=1
( )
Onde E(S) o nmero esperado de espcies em uma amostragem aleatria, S o nmero
total de espcies registradas, N o nmero total de indivduos registrados, Ni o nmero
de indivduos da espcie i, e n o tamanho padronizado da amostra escolhido.
!
O termo () calculado como: !()!
A rarefao deve ser usada apenas para amostras obtidas com mtodos
padronizados, e em habitats iguais ou similares. Outra restrio que as curvas no podem
ser extrapoladas para alm do nmero de indivduos (N) na maior amostra BARROS (2007).
21 Riqueza de Espcies Jackknife 1 Ordem

Estima a riqueza de espcies de uma comunidade. A experincia sugere que este seja um
24
bom estimador de riqueza de espcie.

1
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= + 1 ( )

Onde: Sobs= nmero de espcies observadas; s1 = o nmero de espcie que est presente
em somente um agrupamento (espcie de um agrupamento) e f = o nmero de
agrupamento que contm isima espcie de um agrupamento.
22 Teste T para Diversidade

O programa apresenta uma nova comparao paras diversidade de Shanon e
Simpson, trata-se do Teste t-Student adaptado para comparar estes ndices, aos pares de
amostra. Esta comparao permite avaliar se h diferena significativa entre dois ndices
de diversidade. possvel encontrar a opo para calculo de comparao de diversidades
na aba Ferramentas, Painel Estatstica (Figura 23)
Aps a seleo da opo desejada do clculo, que fica na barra de ferramentas da
janela (Figura 24), o usurio deve selecionar as amostras em par, selecionar o nvel de
significncia e clicar no boto calcular.
Figura 23. Aba Ferramentas.
25
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Figura 24. Janela para comparao dos ndices de diversidade.

22.1 Diversidade de Simpson

Sendo Ds1 e Ds2 diversidade de levantamentos diferentes, podemos testar a hiptese
mula que duas amostras vm de mesmas agregaes tendo a mesma diversidade (BROWER
et al 1997). A comparao com a tabela de t feita com grau de liberdade =
O valor de t obtido atravs da seguinte equao:
|1 2 |
=
12 + 22
Onde: Ds1 e Ds2 so as diversidade de Simpson calculadas para cada levantamento; s 1 e

s2 so as varincias da diversidades, obtidas atravs da equao:
2
4 [=1 3 (=1 2 ) ]
=

Onde: pi frequncia relativa de cada espcie e N= nmero total de indivduos.
22.2 Diversidade de Shanon-Wiener

Segundo BROWER et al. (1997), para comparar a diversidade de Shannon de duas
coleo de dados ou dois levantamentos ou amostras (H1 e H2), necessrio calcular a
varincia para cada diversidade, assim como feito para a diversidade de Simpson, mas
com a seguinte equao:
( log )2
log 2
2 =
2
Onde: ni nmero de espcies de cada espcie; Logb = logaritmo na base b (2 ou 10); N o
nmero total de indivduos nos dois levantamentos.
O valor de t obtido pela seguinte equao
|1 2 |
=
12 + 22
Onde: H1 e H2 so as diversidade de Shanon-Winer calucladas, e s1 e s2 so as varincia
das diversidade.
Para comparao com a tabela do teste t-student o grau de liberdade em valor

arredondado dado pela seguinte equao:
2 2 2
( 1
+ 2
)
= 2 2
2 2
( 1
) ( 2
)
1 + 2
23 Script Calculadora
26
A Script Calculadora do software permite a realizao de clculos baseando-se nas

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operaes aritmticas bsicas, assim como em clculos de fatorial, trigonomtricos de

ngulo em radiano e grau. Permite ainda realizar arredondamentos e truncamentos. Nsta

verso as operaes matemticas possveis esto na lista abaixo.
%=Divide dois nmeros e retorna apenas o floor()=Arredondamento para o inferior mais

restante. prximo.
*=Permite a multiplicao entre dois nmeros. log10()=Retorna o logaritmo de base 10 de um
\=Permite a diviso de dois nmeros retornando nmero especificado.
inteiros. log2()=Retorna (o logaritmo natural de e base) de
^=Permite a exponenciao de um nmero. um nmero especificado como o de um nmero
+=Permite a soma (adio) entre dois nmeros. especificado em uma base.
-=Permite a subtrao entre dois nmeros. pi()=Retorna o valor de PI.
asin()=Retorna o ngulo (radiano) cuja o seno o round()=Arredondamento para o mais prximo.
nmero especificado. sin()=Retorna o seno de um ngulo (radiano)
atan()=Retorna o ngulo (radiano) cuja tangente especificado.
o nmero especificado. sind()=Retorna o seno de um ngulo (em grau)
ceiling()=Arredondamento par ao superior mais especificado.
prximo. sinh()=Retorna o seno hiperblico do ngulo
cos()=Retorna o cosseno do ngulo (radiano) (radiano) especificado.
especificado. sqrt()=Retorna a raiz quadrada de um nmero
cosd()=Retorna o cosseno do ngulo (em grau) especificado.
especificado. tan()=Retorna a tangente de um ngulo
cosh()=Retorna o cosseno hiperblico do ngulo (radiano) especificado.
(radiano) especificado. tand()=Retorna a tangente de um ngulo (em
exp()=Retorna e (a base dos logaritmos naturais) grau) especificado.
elevado potncia especificada. tanh()=Retorna a tangente hiperblica do ngulo
fatorial()=Retorna o fatorial de um nmero (radiano) especificado.
especificado. truncate()=Calcula a parte integral.
Para realizar um clculo, basta digitar a operao, para obter o resultado, que pode
ser copiado, bastando clicar com o boto esquerdo do mouse sobre o campo.
O acesso a lista de operadores pode ser feita atravs da lista de expresses
disponvel no formulrio, alm das expresses e a descrio individual possvel inseri-la
apenas clicando com o boto esquerdo do mouse na expresso desejada (Figura 25).
Figura 25. Script Calculadora em duas etapas. Uma sem clculo e outra com clculo
de logaritmo na base 10.
27
Alm da calculadora interna possvel acessar a calculadora do Windows atravs

Pgina
do Aba Ferramentas (Figura 23).

24 Notificar Erros
O sistema de erros do software permite armazenar qualquer erro que por ventura
possa ocorrem no momento da execuo do mesmo. Este sistema de erro possibilita o
usurio enviar atravs de e-mail (acionado manualmente) para o autor. Quando algum
erro ocorrer ser exibida a mensagem pertinente ao erro. No Aba Ferramentas, Painel
Enviar Erros est habilitada, para visualizar os erros ocorridos e as data, clique na
opo, para exibir a janela Enviar Erros do Programa (Figura 16).
Os erros submetidos ajudaro a corrigi-los de forma que nas prximas verses estes
no mais ocorram.
necessria uma conexo com a Internet e desbloqueio do software, caso exista
firewall. O programa envia para o seguinte endereo dives@ebras.bio.br e para o e-mail
informado nas configuraes ou na tela.
Figura 26. Formulrio de envio de erros do programa.
25 Feedback
O programa conta com a nova ferramenta, que permitir a correo de possveis
erros, no exibidos ou receber sugestes para melhorias do software. A janela (Figura 27)
ainda permite enviar um arquivo anexo, no formato imagem: jpg, gif, png. E formato texto:
doc, docx, rtf, pdf, nestes ltimos formatos possvel alm de listar textualmente o usurio
pode acrescer vrias imagens.
O usurio deve selecionar o assunto (Figura 28), para melhor ser atendido e ter
uma resposta mais precisa.
28
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Figura 27. Tela de envio de Feedback para o desenvolvedor do programa DivEs.
Figura 28. Campo assunto com os textos disponveis.
26 Atualizao do Software
O software recebeu uma ferramenta de atualizao (Figura 29) o que permite que
periodicamente o usurio verifique se h nova verso, nessa verso inicial (3.0), a
ferramenta ter seu funcionamento ativado manualmente, mas em verses futuras a
verificao ser automtica.
A cada nova verso liberada para download o usurio poder receber a verso mais
atualizada de forma simples, sem a necessidade de ter que acessar o site do programa.
Caso a verso, menor, por exemplo, 3.0.6.450 (zero menor verso) seja mantida
um novo registro no ser necessrio, mas caso a verso maior, neste caso, 3 ou a menor
for alterada, um novo registro necessrio.
29
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Figura 29. Ferramenta interna de atualizao do software.
27 Auditoria
O software conta com uma ferramenta de auditoria dos dados, que pode ser
acessada atravs da Aba Ferramentas, Painel Auditoria (Figura 30), basta ter um arquivo
aberto e selecionar a ferramenta.
Figura 30. Painel de Ferramentas, com o painel de Auditoria.
A ferramenta de auditoria permite uma anlise dos dados, apontando possveis

inconsistncias e assinalando as espcies que esto sem valores ou com valores no
numricos (Figura 31) ou simplesmente apontando inconsistncias nos dados sem
especificar qual(ais) espcie(s) est(o) com dado(s) problemtico(s) (Figura 32). Neste
ultimo caso o aviso (Figura 31) ser exibida toda vez que uma anlise tentar ser feita ou
mesmo quando se tentar gerar um grfico, com software.
30
O principal objetivo desta ferramenta minimizar erro gerados, com a execuo de

clculo em arquivos inconsistentes gerados pelo usurio e minimizando os avisos de bugs
Pgina
(falso positivo), que tem ocorrido, devido a m insero de dados pelo usurio.
Figura 31. Janela de auditoria dos dados de um arquivo gerado.
Figura 32. Ferramenta de auditoria rpida, que permite avaliar o contedo da grade,
prevenindo erros de clculos e no programa.
31
Pgina
28 Referncias
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DivEs - Diversidade de Espcies v3.0

Copyright 2004-2015, W.C. Rodrigues
Atualizado em: 1 de junho de 2015

33
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Verso 3.

A distribuio deste guia baseada na Creative Commons License, para

Creative Commons Licence DivEs - Site

Atualizado em: 1 de junho de 2015

19.1 Equitabilidade J (Pielou) ....................................................................................... 22

19.3 Equitabilidade Hill (Modificado) .......................................................................... 23

Figura 1. Tela principal do programa.

2 O Que H de Novo Nesta Verso (3.0.7)

2.1 Verso 3.0.7

2.1.1 Verso 3.0

1. Interface totalmente redesenhada - Totalmente reescrito em Visual Basic.Net;

Figura 2. Formulrio de registro do software DivEsDiversidade de Espcies v3.0.

O registro deve ser realizado informando os dados enviados para o e-mail de

Figura 3. Registro do software DivEsDiversidade de Espcies v3.0.

4 Criando um Novo Arquivo de Dados

Figura 4. Aba Incio, painis Arquivo e Matiz de Dados.

Figura 5. Grade da Matriz de Dados.

5 Abrindo um Arquivo de Dados

Figura 6. Caixa de dilogo para manipulao do arquivo do programa.

6 Salvando Arquivos de Dados

Figura 7. Caixa de dilogo para salvar um arquivo como.

A importao possui uma ferramenta exclusiva, que permite importar atravs da

abertura de um arquivo CSV ou XLS, como tambm atravs da rea de transferncia

7.1 Comma Separated Values (CSV)

Figura 8. Modelo de arquivo CSV a ser criado em uma planilha eletrnica.

O processo de importao foi otimizado, eliminando erros anteriormente ocorridos,

Figura 9. Ferramenta de importao, que permite importar arquivos CSV e xls.

Figura 10. Ferramenta de importao atravs da rea de transferncia.

7.2 Arquivo do Excel (xls)

atravs da Aba Incio, painel Exportar (Figura 12).

Figura 12. Opes de exportao de dados da matriz.

8.1 Planilha do Microsoft Excel:

8.2 Exportar para Pgina WEB:

8.3 Comma Separated Value (CSV):

8.4 Portable Document File (PDF):

9 Editando um Arquivo de Dados

A excluso de linhas e colunas tambm altera o nmero de espcies ou

10 Alterando os Nomes das Espcies e Levantamentos

11 Editando os Valores Indivduos das Espcies/Txon

Figura 14. Grade de dados com informaes de indivduos por espcie/levantamento.

Figura 15. Aba de ndices divididos por categoria.

12.1 Estatstica Bsica dos Dados

Figura 16. Estatstica bsica dos dados.

O software ainda permite gerar um grfico com as mdias por levantamento

Figura 17. Grficos das mdias da estatstica bsica dos dados.

13 Configuraes do Programa (Preferncias)

13.1 Configurao Geral

13.2 Configurao dos Grficos

Figura 18. A. Configurao Geral do software e B. Configurao dos Grficos do

13.3 Configuraes Rpidas

Figura 20. Aba de grficos com as opes divididas por painis.

Figura 21. Janela de grfico.

16 ndices Utilizados Pelo Software

Figura 22. Aba dos ndices oferecidos pelo programa.

17.1 Diversidade de Shanon-Wiener

17.2 Diversidade de Simpson

17.3 Diversidade de Margalef

17.4 Diversidade de Gleason

17.5 Diversidade de Menhinick

considerando somente o nmero de espcies (s) e a raiz quadrada do nmero total de

indivduos. O ndice de diversidade de Menhinick (Db) estimado atravs da seguinte

17.6 Diversidade de McIntosh

Onde: ni o nmero de indivduos pertencente a isima espcie.