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CAPTULO 2: FUNDAMENTOS QUMICOS

1- Por qu algunas reacciones, a pesar de ser energticamente


desfavorables, pueden ocurrir en las clulas? Mencione dos
ejemplos de reacciones energticamente desfavorables. Defina
qu es un enlace de alta energa. Mencione un ejemplo de una
molcula biolgica que posea este tipo de enlace.
2- Qu entiende por complementariedad molecular entre molculas
biolgicas? Concepto de complementariedad molecular. Mencione
dos tipos de macromolculas donde se manifieste este fenmeno
y explique la importancia del mismo para la funcin de dicha
molcula Qu tipo de uniones son las responsables de la
complementariedad molecular?
3- Explicar por qu muchos procesos, a pesar de ser
energticamente desfavorables (no se producen
espontneamente) igualmente ocurren en la clula. Nombre dos
procesos celulares que presenten esa caracterstica.
4- Indique cual o cuales de los siguientes enunciados son incorrectos
justifique:
a) En los sistemas biolgicos existen cuatro tipos de
interacciones no covalentes: enlace puente de hidrogeno,
enlace hidrfobos, enlaces de van der Wall y enlaces
peptdico.
b) Las hexosas glucosa y manosa pueden interconvertirse
mediante ruptura y formacin de enlace covalente
c) Los monmeros fosfolipdicos se ensamblan covalentemente
para formar la estructura de bicapa, la cual constituye la
base de todas las membranas celulares
d) El G es la medida mas til para predecir la direccin de
las reacciones qumicas en los sistemas biolgicos
e) Las reacciones de oxidacin y reduccin con un AE positivo
tiene un G negativo por lo que tienden a producirse en
forma espontnea
5- Decir si la formacin de la bicapa fosfolipdica en un medio acuoso
es termodinmicamente favorable o no y por qu Cmo estn
unidos los fosfolpidos en las membranas?
6- Por qu hay mayor complejidad en el armado de un
oligosacridos usando 4 tipos distintos de unidades, que en una
protena?
7- Por qu el aumento de la concentracin de sales como NaCl en
una solucin de molculas biolgicas puede debilitar las
interacciones inicas que las mantienen juntas? Qu tipo de
interacciones intervienen en el ensamblaje de los glucolpidos para
conformar una estructura de bicapa? Justifique su respuesta.
8- Diga si el siguiente enunciado es correcto o incorrecto: La 1 ley
de la termodinmica es aplicable a los sistemas biolgicos
Justifique.
9- Explique el significado de enlace de alta energa y d ejemplos de
un compuesto intercelular que posea este tipo de enlace.
10- Explique el mecanismo por el cual las clulas mantienen el
pH intracelular pese a las fluctuaciones de las cantidades de H+ u
OH- (que no implique transporte de membrana).
11- Explique detalladamente la importancia biolgica del
equilibrio del cido fosfrico

CAPTULO 3: ESTRUCTURA Y FUNCIN DE LAS PROTENAS

1- Con respecto a la va proteoltica mediada por ubiquitina responda:


Cules son las principales protenas degradadas por esta va?
Describa secuencialmente los pasos que llevan a la degradacin de la
protena. Mencione ejemplos donde se ejecuta esta va.
2- Describa detalladamente la estructura del motivo dedo de zinc.
Mencione en que tipo de protenas aparece Cmo se afectar la
conformacin nativa de dicho motivo cuando la protena sea sometida
a una solucin de urea o hidrocloruro de guanidina 8M? Justifique
3- La PKA es una proteincinasa que se activa ante la presencia de AMPc.
Defina sitio activo. Describa el cambio conformacional que sufre
describa la activacin de la PKA mediante el aumento de AMPc.
4- Cules son las principales caractersticas que presenta el sitio activo
de la familia de las proteincinasas? Como puede el segundo
mensajero AMPc activar a la proteincinasa A si su sitio de interaccin
se encuentra alejado del sitio activo?
5- Los animales producen anticuerpos en respuesta a los antgenos.
Describa la organizacin estructural general de los anticuerpos Qu
son las regiones determinantes de complementariedad? Qu
relacin existe entre la complementariedad molecular y la
especificidad de un anticuerpo? Qu mecanismo celular aumenta la
eficiencia del plegamiento en la conformacin nativa del anticuerpo?
6- Ejemplos de mecanismos de regulacin alostrica y no alostrica.
Describir los mtodos de separacin de protenas.
7- Defina dominio proteico. Defina el concepto de familia de protenas y
cite un ejemplo.
8- Mencione ordenadamente los distintos niveles jerrquicos de
organizacin de las protenas. Indique qu tipo de uniones qumicas
estabilizan la estructura secundaria y terciaria de una protena.
9- Qu es un motivo proteico? Menciones al menos dos motivos
presentes en las protenas e indique en que tipo de protenas se
encuentran.
10- Qu cromatografa elegira para purificar una protena presente
en una muestra biolgica sabiendo que presenta en su secuencia
lineal muchos aminocidos con carga negativa? Justifique.
11- Cul es el mecanismo mediante el cual las enzimas aceleran la
velocidad de una reaccin qumica?
12- Usted desea aislar y purificar una protena presente en una
muestra biolgica. Cul de las siguientes metodologas empleara?
Justificar
a) Centrifugacin por zonas de velocidad
b) Cristalografa de rayos X
13- Describa el fundamento de la tcnica de electroforesis en gel de
poliacrilamida con SDS. En qu consiste la cromatografa de afinidad
con anticuerpos? Cmo se realiza la elucin en este tipo de
cromatografa?
14- Cul es el mecanismo mediante el cual las enzimas aceleran la
velocidad de una reaccin qumica? Graficar la curva de velocidad de
reaccin en funcin de la concentracin de sustancia para una enzima
X que acta sobre un sustrato A con una Km de 0,5 mM y sobre un
sustrato B con una Km de 1mM.
15- La cadherina E forma parte de una familia de protenas
estrechamente relacionadas y su porcin extracelular est compuesta
por varios dominios de tipo cadherina. En relacin a esto ltimo
explique: El concepto de familia de protenas y el concepto de
dominio proteico.

CAPTULO 4: MECANISMOS GENTICOS MOLECULARES BSICOS

1- Describa maquinaria molecular que participa en replicacin del DNA.


Mecanismo que permite formacin de fragmentos de Okazaki Por
qu se forman? Que composicin qumica tienen estos fragmentos?
Donde se forman y cmo se forman?
2- Explicar detalladamente el ciclo vital de los retrovirus.
3- El virus de la rabia infecta a clulas eucariotas y para su replicacin
requiere participacin del ncleo de la clula husped. Conteste si es
verdadero o falso y justifique detalladamente la respuesta.
4- Describa el ciclo de replicacin del virus de la rabia.
5- Qu se entiende por polirribosoma? Cmo funcionan? Qu funcin
cumplen?
6- Explique opern lctico y sistema regulador NtrC/NtrB en las
bacterias. En qu metabolismo participan? A qu nivel molecular
actan? Indique por lo menos 3 diferencias entre ambos.
7- Cuntos tipos de RNA participan en el proceso de traduccin? Que
funcin cumple cada uno? Cules son sus caractersticas
estructurales?
8- Describa la estructura del tRNA y explique la importancia funcional de
las distintas secuencias de nucletidos.
9- Cmo se encuentran los genes codificantes de protenas en
procariontes y eucarionte. Realizar un esquema de la regulacin del
opern lac en presencia de lactosa y ausencia de glucosa.
10- Describir la estructura del RNAt y todas sus partes y funciones de
cada una. Mecanismo molecular de reconocimiento y activacin de un
aminocido e incorporacin en una protena en la traduccin.
11- Describa formacin de complejos de pre-iniciacin e iniciacin del
proceso de traduccin. Indique principales funciones de los factores
que lo integran. Cul es el paso requerido para la formacin de un
ribosoma 80S?
12- Iniciacin de la traduccin en eucariontes ocurre cuando la
subunidad ribosomal 40S se asocia con el factor eIF3 y finaliza con la
asociacin de la subunidad 60S. Explique las distintas etapas del
proceso.
13- Realice el esquema de la horquilla de replicacin del SV40 y
explique cada una de las protenas que participan en la replicacin
del DNA eucarionte Cules de ellas integran el replisoma? Indique la
funcin de cada protena.
14- Qu funcin cumple el complejo de iniciacin de la traduccin?
Cmo se asegura el sistema que acte una sola vez?
15- Qu es un sistema regulador de 2 componentes? Explicar cmo
se regula la sntesis de glutamina en los procariontes.
16- Cules son las etapas involucradas en la sntesis de un
polipptido? Explique particularmente y forma detallada como ocurre
la etapa de elongacin de la cadena polipeptdica.
17- Cmo se estabiliza la estructura secundaria del DNA? Que
diferencia entre el RNA y el DNA explica la gran estabilidad del DNA?
Explique porque el DNA y no el RNA es la molcula mas adecuada
para la preservacin y la transmisin de los caracteres hereditarios
Cmo puede deducir experimentalmente la desnaturalizacin del
DNA?
18- Qu es un pre-RNAm o un RNAm inmaduro? Explique con detalle
porqu estas molculas no pueden salir del ncleo Cul sera la
consecuencia biolgica de que un pre-RNAm saliera al citoplasma?
19- Explique las modificaciones postraduccionales que pueden
producirse en las protenas Cul es su importancia biolgica?
20- Cules son los diferentes mtodos para desnaturalizar el DNA?
Defina Temperatura de Fusin (Tm) Qu la modifica y qu afecta?
Cul es el mecanismo de replicacin celular q utilice esta propiedad
de desnaturalizar el DNA? Desarrolle la tcnica elegida.
21- La concentracin de fosfato libre afecta la transcripcin de algunos
genes de E. Coli. Describa el mecanismo molecular de esta
regulacin.
22- Con respecto al Opern Lac Cmo es su comportamiento: en
ausencia y presencia de lactosa y en presencia de glucosa y lactosa?
Realice un grfico.
23- Se conocen 20 isoformas de la fibronectina, debido a:
a) Expresin de 20 genes distintos generando 20 RNAm funcionales
distintos.
b) Expresin de 1 nico gen en 20 isoformas distintas en distintas
especies.
c) Expresin de 1 nico gen en una nica especie que genera por
procesamiento diferencial 20 molculas de RNAm distintas.

CAPTULO 5: BIOMEMBRANAS Y ARQUITECTURA CELULAR

1- Importancia funcional y estructural de los fosfolpidos en membrana.


2- Describa las distintas protenas que se asocian a la bicapa lipdica en
membranas plasmticas. Modo de interaccin y caractersticas
estructurales de cada una
3- La microscopa de contraste de fase se utiliza para: a) observar
clulas vivas no teidas y para monitorizar movimiento celular. b)
observar la ultraestructura celular. c) localizar protenas especficas
en secciones de tejido fijado.
4- Asimetra en la composicin lipdica de las membranas biolgicas.
Mecanismo. Funcionalidad.
5- Unir los temas que se relacionan entre ambas columnas. Explique en
no ms de 3 renglones el enunciado 3 con la tcnica que le
corresponde de la segunda columna.
a) visualizar clulas vivas no
teidas f) microscopa de transmisin
b) visualizar la ultraestructura g) centrifugacin por
celular gradiente de concentracin
c) cuantificar la cantidad de h) uso de detergentes no
determinados fosfolpidos inicos
de membrana i) resistencia al uso de
d) aislar protenas integrales fosfolipasas
de membrana j) microscopa de
e) separar orgnulos interferencia de fases
6- Cmo se comporta la membrana frente a un medio isotnico,
hipotnico e hipertnico? Por qu?
7- Indique cul/es de los siguientes enunciados referidos a
"Biomembranas y arquitectura celular" es/son incorrecto. Justifique:
a) La mayora de los lpidos y muchas protenas de las biomembranas
tienen movilidad lateral.
b) Los fosfolpidos con cadenas de cidos grasos cortas forman
bicapas menos fluidas.
c) Las protenas de membrana ancladas a lpidos slo se encuentran
en la cara citoslica de la membrana.
d) La velocidad de difusin de una protena en la membrana
plasmtica de clulas intactas es menor que la de la misma
protena insertada en una bicapa artificial.
e) Los canales inicos se clasifican como protenas ancladas a lpidos
segn su asociacin con la bicapa lipdica.
f) Para extraer de la membrana una protena que funciona como
canal inico es necesario variar la fuerza inica del medio.
g) Los Rafts lipdicos son microdominios de membrana ricos en
colesterol y esfingolipidos.
8- Explicar el experimento que se realizo para verificar que los
fosfolpidos tienen movimiento horizontal en la membrana.
9- Explique detalladamente de qu factores depende la fluidez de las
membranas biolgicas.
10- Qu tcnica se utiliza para purificar y separar clulas? Explicar
detalladamente
11- Cul de los microscopios se debe usar para visualizar estructuras
subcelulares en clulas vivas? Justifique su respuesta.
12- Explicar cmo los componentes lipdicos en las membranas
influyen en las propiedades fsicas de la misma.
13- Explicar en qu consiste la asimetra en la composicin lipdica de
las membranas biolgicas Qu mecanismos contribuyen a la
distribucin asimtrica de los lpidos en las membranas biolgicas?
Cul es la implicancia funcional de la distribucin asimtrica de los
lpidos en las membranas biolgicas?
14- La asimetra de la bicapa lipdica de las membranas biolgicas,
esencial para sus funciones se debe a:
a) Sntesis vectorial de lpidos en RE y golgi
b) Ausencia de flip flop espontneo
c) Presencia de flipasas especficas
d) Ninguna
e) Todas

CAPTULO 6: INTEGRACIN DE CLULAS EN TEJIDOS

1- En los procesos inflamatorios se produce extravasacin de leucocitos.


Explique.
2- Describa detalladamente la organizacin extra e intracelular de las
uniones adherentes.
3- Qu es la lmina basal? Nombre los 4 componentes que la
conforman Cmo es la lmina basal del epitelio pulmonar alveolar?
4- A qu protena y/o estructura intracelular se unen las integrinas? Un
ejemplo de unin celular que contiene integrinas es:
a) Hemidesmosomas c) Unin adherente
b) Unin GAP d) Unin estrecha
5- Como pueden las molculas de la ECM controlar eventos
intracelulares sino pueden atravesar la membrana plasmtica? Por
qu las alteraciones del colgeno tipo IV producen trastornos en el
rin y no en el tejido seo?
6- Las plaquetas interaccionan con la matriz extracelular a travs de
integrinas. Explique su implicancia en la formacin del cogulo
sanguneo.
7- Describir detalladamente las uniones de hendidura (GAP), localizacin
y funcin.
8- Estructura cadherinas clsicas y desmosmicas a que estructuras se
conecta cada una de estas protenas. En que tipo de unin celular
participan y cual es su funcin y ubicacin Qu afeccin causara en
la piel si se agrega al tejido anticuerpos antidesmocolina y
antidesmoglena?
9- Respecto de la adhesin clula-matriz fundamente las causas por las
cuales las clulas hematopoyticas proliferan y se diferencian en la
mdula sea.
10- Describir estructura, ubicacin y composicin de las uniones
estrechas u oclusivas o comunicantes. Qu sucede si se altera la
composicin o actividad de las uniones del epitelio intestinal por
accin de una toxina bacteriana. Cul es la razn por la cual las
uniones estrechas contribuyen a mantener la polaridad (apical-
basolateral) de las clulas epiteliales? Qu alteraciones produciran
en el funcionamiento de intestino de un individuo al que se le
incorporan anticuerpos antiocludina y anticlaudina?
11- Qu tipo de protena son las integrinas segn su interaccin con
la membrana plasmtica? Estructura de la integrina Por qu las
integrinas funcionan como receptores de adhesin? Indique dnde se
ubican las integrinas en una clula epitelial y mencione dos molculas
con las que interactan.
12- Estructura y funcin de la laminina en la MEC.
13- Cmo se obtiene un cultivo celular primario? Explique cules son
las diferentes etapas en el establecimiento de un cultivo celular
primario.
14- Explique detalladamente qu es y cmo se elabora un HIBRIDOMA.
15- Mencione los 3 tipos de molculas. ms abundantes de la matriz
extracelular de los tejidos animales e indique la funcin principal que
cumple cada una de ellas. Qu tipo de unin celular conecta la MEC
con los filamentos intermedios de las clulas epiteliales. Describa su
estructura y su ubicacin dentro de la clula.
16- Describa la estructura de una cadherina clsica, indicando a qu
estructuras se conecta cada uno de los dominios de esta protena.
En qu tipo de unin celular participan la cadherinas clsicas y cual
es la funcin y ubicacin de este tipo de unin celular? Describa la
estructura de una cadherina desmosmica indicando a qu
estructuras se conecta cada uno de los dominios de esta protena En
qu tipo de unin celular participan las cadherinas desmosmicas y
cual es su funcin y ubicacin de este tipo de uniones celulares?

CAPTULO 7: TRANSPORTE DE IONES Y MOLCULAS PEQUEAS A


TRAVS DE LAS MEMBRANAS CELULARES

1- Mencione cules son las caractersticas del transporte mediado por


las acuaporinas en cuanto a: mecanismo de transporte, requerimiento
energtico y transporte a favor/contra el gradiente. Explique qu
sucede con los ovocitos de rana que normalmente no expresan
acuaporinas al ser inyectados en el RNAm que codifica acuaporina-1.
2- Habitualmente la concentracin de glucosa en el exterior de la clula
es mayor que en el interior. Debido a ello ingresa a la misma
mediante difusin facilitada en la que participan los transportadores
de tipo GLUT. Indique los desplazamientos que tendr la glucosa
cuando la concentracin intracelular es mayor que la extracelular.
Justifique su respuesta.
3- Describa transporte de Glucosa, explicar tipo de transporte y el
transportador que se utiliza En que clulas se encuentra?
4- Cmo ocurre el transporte transcelular de Glucosa? En que clulas
ocurre y qu caractersticas tienen los transportadores involucrados?
5- Esquematice como se realiza el transporte transepitelial de glucosa
desde la luz intestinal hacia la sangre, ubicando las diferentes
protenas que intervienen Qu sucede a largo plazo con dicho
transporte si se inhibe la bomba de sodio y potasio? Qu funcin
cumplen las uniones estrechas en este proceso?
6- Mencione cules son los 4 tipos de bombas impulsadas por ATP
Cual/es de ellas transporta protones? Mencione algn ejemplo
Cual/es de ellas funciona/n impulsando la sntesis de ATP A qu
grupo pertenece la bomba de calcio ubicada en la membrana del RS
de las clulas musculares? El movimiento de Calcio mediado por esta
bomba es hacia adentro del RS o hacia el citosol? Justifique su
respuesta.
7- Al estudiar una molcula transportadora usted comprueba que la
misma aparece temporalmente unida a la molcula transportada.
Durante el transporte normal no hay gasto de energa. Al agregar una
molcula similar a la que es transportada normalmente, se inhibe el
transporte. Un incremento en la concentracin de la molcula
transportada normalmente aumenta la velocidad del transporte.
e) Qu tipo de transporte es el descrito?
f) Cmo se denomina genricamente a la molcula inhibida?
8- Potencial de membrana en reposo: Qu es, por qu ocurre y qu
canales participan?
9- El transportador de glucosa GLUT 1 tiene una Km de 1,5 mM para la
D-glucosa y 30 mM para la D-galactosa. Si la concentracin de ambos
azucares es de 5 mM Como ser la velocidad de transporte de
glucosa con respecto a la de galactosa, considerando que la Vmax es
la misma para las dos? (Justifique)
g) Mas lenta
h) Igual
i) Mas rpida
10- En un laboratorio se aisl y purific una protena de membrana
transportadora de azucares para luego insertarla en un liposoma y
caracterizarla funcionalmente. Los estudios arrojaron los siguientes
resultados:
j) El Transporte presenta una velocidad mxima
k) No depende de hidrlisis de ATP
l) Transporta tanto glucosa como fructosa, siendo la Km para
glucosa mucho menor que para fructosa
De que tipo de transportador podra tratarse? Como se denomina el
mecanismo de transporte por el que opera esta protena? Qu
monosacrido transporta esta protena con mayor afinidad? Como
hara para aislar esta protena transportada de la membrana
plasmtica? Justifique
11- Cmo las clulas estomacales mantienen un pH citoslico neutro
y produce jugo gstrico cido?
12- Esquematizar el transporte transepitelial de glucosa desde la luz
intestinal hacia la sangre Qu sucede a largo plazo si se inhibe la
actividad de la bomba Na/K? Qu funcin cumplen las uniones
oclusivas?
13- Explique detalladamente cmo participan los diferentes
transportadores que intervienen en la acidificacin de la luz
estomacal por parte de las clulas parietales del recubrimiento
gstrico. Realice un esquema.
14- Habitualmente la concentracin de glucosa en el exterior de la
clula es mayor que en el interior. Debido a ello ingresa a la misma
mediante difusin facilitada en la que participan los transportadores
de tipo GLUT. Indique los desplazamientos que tendr la glucosa
cuando la concentracin intracelular es mayor que la extracelular.
Justifique su respuesta.
15- Explique cmo las clulas parietales acidifican el contenido
gstrico mientras mantienen el pH citoslico neutro. Mencione las
caractersticas de cada transportador involucrado.
16- Mecanismo molecular del pasaje de glucosa y aminocidos de la
luz del intestino a la sangre.
17- Con respecto a la salida de potasio de las clulas animales
responda: Qu tipo de transportador est involucrado en este
proceso? Cul es el mecanismo de transporte involucrado? El
transporte se realiza a favor o en contra del gradiente de
concentracin? El transporte est acoplado a la hidrlisis de ATP?
18- Nombrar diferencias entre cotransportadores y unitransportadores.
19- Mecanismo de transporte de glucosa en clulas no absortivas, y
explicar el tipo de transporte. Mecanismo de transporte de glucosa en
clulas absortivas, y explicar el tipo de transporte.
20- Explique porqu el potencial de membrana en las clulas animales
depende en gran medida de los canales de potasio en reposo. Por
qu se considera a estos canales no regulados? Cul es el
mecanismo de selectividad de estos canales?
21- Mencione las cuatro clases de protenas transportadoras de
membrana impulsadas por ATP. Para cada clase de un ejemplo
indicando ubicacin celular y funcin. Explicar detalladamente la
Ca2+/ATPasa. La absorcin intestinal de glucosa requiere de alguna
de estas protenas transportadoras impulsadas por ATP? Explique en
no ms de tres renglones.
22- Qu tipo de bomba es la Na/K ATPasa? Caracterice el tipo de
transporte mediado por esta protena Cul es la importancia
biolgica de este transportador?
23- En un liposoma se pone dentro 150 mM [Na+], 5 mM [K+] y por
fuera [Na+] 5mM y [K+] 150 mM. Si se inserta una bomba K+/Na+ con
la misma orientacin que en la clula Qu sucede?
24- Indique que tipo de transportadores son los que intervienen en el
ingreso de la glucosa en las clulas no absortivas (la mayora de las
clulas de los mamferos). Indique cul es el mecanismo de
transporte en este caso y sus requerimientos energticos. Describa
las caractersticas de este tipo de transporte en lo que se refiere a la
velocidad, la especificidad y la saturabilidad. Justifique.

CAPTULO 9: TCNICAS DE GENTICA MOLECULAR Y GENMICA

1- Mencionar qu tipo de vector empleara en la construccin de una


genoteca. Fundamente su eleccin. Mencione los fragmentos que
integran dicho vector, describiendo la funcin de cada uno de ellos.
Cmo separa los distintos fragmentos de DNA obtenidos? Que
mtodo empleara para secuenciar dichos fragmentos? Mencione las
principales caractersticas del DNA que permiten la aplicacin de este
mtodo.
2- Como se logran animales con mutacin KnockOut. Cual es la
diferencia entre un animal knockout y uno transgnico
3- Cual es el fundamento del anlisis de micromatrices de DNA? Cual
es la utilidad de este tipo de estudio?
4- Qu es una molcula vector de DNA. b) Cules son los componentes
bsicos de un vector plasmdico. c) cules son las principales
diferencias entre vector plasmdico y vector de expresin.
5- Aplicacin de pruebas de compatibilidad funcional en levaduras. Que
tipo de vector se utiliza y por qu.
6- Que tipos de vectores se utiliza en E. coli para la produccin de
grandes
cantidades de protenas a partir de genes clonados? Cul es la
principal desventaja de este tipo de sistema y como se supera dicha
limitacin?
7- Cules son los principales fragmentos que conforman un vector de
expresin? Cual es la funcin de cada uno de esos fragmentos? Cul
es la utilidad de este tipo de vectores?
8- Explique el mecanismo del empaquetamiento de DNA en el
bacterifago
9- Qu es una genoteca? Cmo se construye una genoteca de
levadura?
10- Decidir entre los siguientes tres mtodos cual elegira para
inactivar funcionalmente un gen sin alterar su secuencia. Justificar la
eleccin y porque no eligi las otras:
m) transfeccin de clulas con una construccin interruptora.
n) transfeccin de clulas con un RNAi.
o) uso de un agente mutagnico.
11- Qu es, cmo se disea y con qu fines se utilizan las sondas de
oligonucletidos?
12- Para estudiar la funcin de un gen, una estrategia clsica es
causar su inactivacin y luego estudiar el fenotipo mutante. Este tipo
de estrategia, desarrollada inicialmente en levaduras, permiti el
desarrollo de tcnicas para el estudio de genes en eucariontes
superiores. Explique en forma detallada la estrategia que permite la
inactivacin de un gen normal reemplazando su secuencia con otras
secuencias; Qu tipo de animal se obtiene y cual es su utilidad?
Qu otras estrategias conoce para inactivar la expresin de un gen
en clulas eucariontes? Enuncie sus fundamentos.
13- Explique el mtodo de terminacin de cadena o mtodo didesoxi
que permite secuenciar fragmentos de DNA. Qu longitud (en
nmero de NTD) debera secuenciar si quisiera conocer la secuencia
para la sntesis de una sonda? Justifique.
14- Qu tipo de vector plasmdico suele utilizarse en el estudio de
secuencias gnicas de levaduras? Justifique Como puede analizarse
una genoteca de levaduras?
15- Describir las partes del vector lanzadera y sus funciones.
Aplicacin del vector lanzadera. Diferencias con el vector de
expresin.
16- Realizar un esquema de la secuencia interruptora para un gen
knockout y explicar cmo diferenciar la recombinacin homologa de
la no homologa.
17- Explique detalladamente los pasos que permiten la obtencin de
un animal transgnico.
18- Vector para Genoteca, que fragmentos lo componen. Como se
separan los fragmentos de DNA obtenidos y que mtodo empleara
para secuenciar esos fragmentos.
19- Qu tipo de alelos permite la obtencin de un ratn transgnico y
porque? Cmo se insertan esos genes en la clula? Qu tipo de
clulas utiliza para la obtencin de estos animales?
20- Con respecto a la transfeccin transitoria responda: En qu tipo
de clulas se lleva a cabo y por qu? Cules son las principales
caractersticas del plsmido utilizado, indicando su funcin? Cul es
la principal diferencia de la transfeccin transitoria con respecto a la
transfeccin estable o transformacin?
21- Cul es el mtodo de inactivacin permanente de genes en
clulas eucariontes superiores? Qu tipo de construccin
interruptora utiliza y por qu? Sobre qu tipo de clulas trabaja?
22- Cual es la construccin sustitutiva empleada en las clulas madre
embrionarias (ES) a travs de la cual la recombinacin homologa y no
homloga posibilita la obtencin de ratones knockout. Justifique.
23- Para la obtencin de ratones knockout hay q realizar los siguientes
pasos: a) obtencin de clulas ES knockout embrionarias b) seleccin
de las clulas recombinadas buscadas c) insercin de las clulas en
un embrin normal. En cul de los 3 pasos anteriores ocurre una
recombinacin homologa y/o no homologa? Justificar detallando los
pasos de como sucede.
24- Explique las diferencias entre fragmentos de a) un vector que
permite clonar fragmentos aislados de DNA; b) un vector que permita
expresar protena funcional que complementa una mutacin recesiva;
c) un vector que permita producir grandes cantidades de protenas.
25- Explique la utilidad de los ratones LoxP-Cre.
26- Los mtodos que se mencionan a continuacin corresponden a
tcnicas empleadas para la inactivacin de genes especficos en
clulas eucariontes: Ratones Knockout y RNA de interferencia.
Explique con fundamentos.
27- Los vectores plasmdicos contienen un gen de seleccin (gen de
resistencia a ampicilina), secuencias de origen de replicacin (ORI) y
un fragmento poliligador. Especficamente para los vectores
plasmdicos de expresin responda: Cul es la principal aplicacin de
este tipo de vectores? Adems de los fragmentos descritos, qu otro
fragmento presenta y por qu? Cmo se controla la expresin del
fragmento citado por usted?

CAPTULO 10: ESTRUCTURA MOLECULAR DE GENES Y


CROMOSOMAS

1- Tipo de secuencias que pueden encontrarse dentro de una molcula


de DNA cromosmico eucarionte. Describa secuencias
correspondientes a retrotransposones virales con LTR. Qu regiones
eucariontes hay dentro de la secuencia y que funcin cumple cada
una de ellas.
2- Tipo de secuencias que pueden encontrarse dentro de una molcula
de DNA cromosmico eucarionte. Explicar los genes duplicados.
3- Explique cmo se empaqueta la cromatina para formar un
cromosoma metafsico. Indique que protenas contribuyen a dicha
condensacin y por qu Cual es la importancia de la enzima
telomerasa en la condensacin de la informacin gentica?
4- Explique cmo se encuentra organizado el DNA no codificante o no
codificador. Dentro de estas secuencias, explique que es el DNA
altamente repetitivo de secuencia simple, qu tipos conoce, dnde se
encuentra localizado en el cromosoma y cul es su utilidad.
5- Qu es una unidad de transcripcin? Qu tipos conoce y qu
diferencias existen entre ellos?
6- Qu son los transposones? Tipos y descripcin de los
retrotransposones Qu es un retrotransposn? Explique como se
genera el DNA retroviral a partir del RNA genmico retroviral
7- Explique el mtodo de transposicin de un transposn de DNA Qu
elementos participan?
8- Qu es el ensayo de huellas digitales genticas? Dar un ejemplo de
aplicacin.
9- Describir los DNA codificantes y dar un ejemplo de cada uno, describir
los DNA satlites y explicar dnde se encuentran y para que sirven.
Describir detalladamente el mtodo fingerprinting.
10- Mediante tcnicas de ingeniera gentica usted logra insertar un
intrn en un elemento transponible que esta estudiando. Si luego de
la trasposicin el intrn tambin es transpuesto a que tipo de
transposicin pertenece el que esta estudiando?
11- Explique el mecanismo de ensamblaje de la envoltura nuclear
durante la telofase.
12- Defina DNA no codificador, indique que porcin del genoma ocupa
y cite 3 ejemplos de DNA de este tipo.
13- Cuando el DNA de eucariontes se tratan con DNasas, algunos
genes son resistentes a esta degradacin Qu clase de genes no
son afectados por la DNasa: Los que se transcriben activamente o
los que no se transcriben? Justifique.
14- Explique qu es el DNA satlite y cul es su utilidad diagnstica.
15- Describa detalladamente el mecanismo por el cual la enzima
telomerasa mantiene la longitud de los telmeros. Explique por
qu es necesaria la accin de esta enzima para la correcta longitud
de los telmeros. Mencione en qu clulas se expresa e indique
cul es su importancia biolgica.
16- Cules son los distintos niveles de empaquetamiento de DNA
que se pueden alcanzar en metafase? Describir la estructura del
nucleosoma y modificaciones nucleosomales que controlan la
condensacin y descondensacin.

CAPTULO 11: CONTROL TRANSCRIPCIONAL DE LA EXPRESIN


GNICA

1- Realice el esquema de un gen eucarionte indicando las regiones


necesarias para la expresin de una protena funcional. Explique de
cada una de ellas la funcin. Explique en forma detallada el
mecanismo molecular propuesto para la activacin de la transcripcin
de genes en clulas eucariotas.
2- La molcula UME6 es un factor transcripcional con actividad
represora Cul es la composicin qumica y dominios funcionales del
factor? Describa el mecansmo molecular propuesto para este factor
en el control de transcripcin en levaduras.
3- El factor de activacin de la transcripcin GAL4 presenta dominios
funcionales Cules son estos dominios y la funcin de ellos?
Mencione los diferentes motivos presentes en uno de esos dominios y
sus estructuras. Describir como mximo en 5 renglones el mecanismo
molecular de la activacin de la expresin de genes por GAL4. Al
fusionar los dominios C-terminal y N-terminal de un factor activador
de la transcripcin, se observa que las protenas truncadas inducen la
expresin de genes. Por qu?
4- Esquematice un gen eucarionte indicando todas las posibles regiones
de control de la expresin. Explique el mecanismo molecular por el
cual un factor activador activa la transcripcin.
5- Qu son qumicamente los represores de la transcripcin? Cmo
actan? D 2 ejemplos de represores.
6- Realice un esquema de un gen eucarionte indicando todas las
regiones necesarias para la expresin de una protena funcional,
explique la funcin de cada una de ellas. Explique el mecanismo
molecular por el cual un factor activador activa la transcripcin.
7- La mutacin dirigida sobre el dominio de unin a ligando (DBD) del
receptor nuclear a una hormona esteroide provoco la expresin
constitutiva de un grupo de protenas Cual es la conformacin que
presentan los factores de transcripcin de la superfamilia de
receptores esteroides? Describa el mecanismo mediante el cual el
receptor nuclear controla la expresin gnica Por que la mutacin
del DBD provoca la expresin constitutiva de un grupo de protenas?
8- Con respecto a los factores de transcripcin que funcionan como
represores responda Cuntos dominios funcionales presenta y cual
es la funcin de cada uno de los dominios? Describa el mecanismo
molecular por el cual reprime la transcripcin Como puede
incrementar las opciones de control gnico los factores
heterodimricos?
9- Menciones cuales son los dominios de los factores de transcripcin.
Como acta el activador Gcn4?
10- Con respecto al factor de transcripcin TFIID: Es un factor de
transcripcin general o especfico? Se trata de una protena
monomrica o multimrica? Qu actividad/es requerido/s para
realizar la transcripcin se encuentra/n relacionado/s con este factor?
11- Explique por qu tanto la DNA polimerasa I como la III son
necesarias para la replicacin de DNA.
12- Represores en eucariontes: Indique composicin qumica y
estructural Cul es su funcin y mecanismo? Cite ejemplos.
13- Funcin en el control transcripcional de la expresin gnica del
amplificosoma.
14- Explique los mecanismos moleculares de la activacin de la
transcripcin de un gen que posee un promotor TATA.
15- Para qu sirven los complejos generales de transcripcin? Cmo
se ensambla el complejo de preiniciacin de la polimerasa II?
16- Explique el modelo de desacetilacin de las histonas en genes
especficos dirigidas por represores.
17- El factor de activacin Gcn5 presenta dominio de activacin con
actividad de remodelacin de la cromatina e Histona Acetilasa.
Explique los mecanismos moleculares donde estaran involucrados
ambas actividades.
18- La expresin de genes eucariontes ocurre gracias a un mecanismo
molecular que involucra factores de transcripcin activadores y
coactivadores que permiten el pasaje de la cromatina desde su
estadio de 30 nm al estadio perlas de collar de 11 nm. Explique en
forma detallada como ocurre este proceso.
19- Qu se entiende como promotor? Todos los siguientes elementos
pueden actuar como promotores excepto uno. Justifique.
a) Caja TATA
b) Elemento iniciador
c) Islas CpG
d) Amplificador
20- En el siguiente esquema se muestra la estructura general de un
gen eucarionte. Indique sobre el mismo a que corresponde cada una
de las regiones. Mencione cules forman parte de la regin de control
y cules de la regin codificante. Explique cul es la funcin de cada
regin y con qu tipo de protena interacciona durante su funcin.

CAPTULO 12: CONTROL GNICO POSTRANSCRIPCIONAL Y


TRANSPORTE NUCLEAR

1- Explique detalladamente como es el proceso de importacin y


exportacin en el ncleo y como se mantiene el gradiente.
2- Describa detalladamente los niveles de control postranscripcional de
genes codificadores de protenas. Dar un ejemplo de un mecanismo
regulador postranscripcional para cada uno de dichos niveles y
explique en que consiste cada uno.
3- Describir la va de transporte de las mRNP, un mtodo de
degradacin de mRNA y explicar los requisitos para que el mRNA
salga del ncleo
4- Mecanismo de incorporacin al ncleo de protenas carga
mencionando protenas importantes q participan en el proceso. b)
como se mantiene la unidireccionalidad de este proceso.
5- Mencionar mecanismos de regulacin postranscripcional que opere a
nivel del ncleo y citoplasma. Explique en 3 renglones en qu
consiste cada uno de ellos.
6- Protenas que translocan al ncleo Dnde se sintetizan? Que
protenas las pliegan? Sufren modificaciones postraduccionales
(propias del REG)? Explique el mecanismo de translocacin de
importinas al ncleo.
7- Explique todos los procesos de eliminacin que sufren las
protenas sintetizadas o plegadas de manera incorrecta.
8- Explique detalladamente el mecanismo de corte y empalme de RNA
Por qu es considerado un mecanismo regulatorio de la expresin
gnica?

CAPTULO 13: SEALIZACIN EN LA SUPERFICIE CELULAR

1- Explicar la va de sealizacin desde la superficie celular,


dependiente de IP3/DAG que regula concentracin de calcio
intracelular.
2- Se ha descubierto un receptor acoplado a una protena G trimrica.
Para saber si este receptor activa a la adenililciclasa o a la fosfolipasa
C, se decide realizar un experimento en el cual se introduce en la
clula un inhibidor de la proteincinasa A (PKA) y, ante la estimulacin
del receptor, no se produce la respuesta esperada. En base a estos
datos diga a cul enzima activa el receptor analizado.
3- Se ha descubierto un receptor acoplado a una protena G trimrica.
Para saber si este receptor activa a la adenililciclasa o a la fosfolipasa
C, se decide realizar un experimento en el cual se introduce en la
clula un inhibidor de la IP3 y, ante la estimulacin del receptor, se
obtiene negativo como resultado. En base a estos datos indique qu
efector est activo y cmo es el mecanismo normal.
4- Ordene los siguientes pasos referidos al mecanismo de accin de una
molcula seal hidrosoluble
a) Activacin de la Fosfolipasa C
b) Activacin de una Protena C
c) Aumento de la concentracin citoplasmtica de IP3
d) Fosforilacin de la protena especificas
e) La molcula seal interacta con una protena transmembrana
f) Respuesta celular
g) Sale calcio del retculo endoplasmtico
5- Qu son las protenas G, qu tipos conoce? Explique el mecanismo
de activacin de las protenas G.
6- Describir detalladamente el mecanismo de activacin e inactivacin
de la adenililciclasa. Explicar cmo est compuesto el receptor y la
protena G involucrada. Describir el mecanismo de inhibicin de la
misma.
7- Definir primer y segundo mensajeros y dar ejemplos. Qu protenas
conservadas participan en la transduccin de seales y cual es su
funcin? Explicar la va de expresin de genes CRE.
8- Indique si las siguientes molculas son primeros mensajeros,
segundos mensajeros o efectores: AMPc, Ca2+, GH, adrenalina, DAG,
xido ntrico, adenililciclasa, MAP cinasa, fosfolipasa C.
9- Explique detalladamente la regulacin de la actividad de los
receptores -adrenrgicos.

CAPTULO 14: VAS DE SEALIZACIN QUE CONTROLAN LA


ACTIVIDAD GNICA

1- Describa la cascada de cinasas que transmiten seales corriente


abajo desde la protena Ras a la MAP cinasa.
2- Describir los receptores para citocinas y que diferencias presentan
estos con los receptores tirosincinasas. Va JAK-STAT, a partir de que
el ligando se une al receptor. Describir un mecanismo de regulacin.
3- Describa la va de sealizacin que activa el factor NF-B. Qu
mecanismos participan en la translocacin de ese factor desde el
citosol hacia el ncleo? Sobre que tipo de genes acta? Explique el
mecanismo por el cual activa la transcripcin del gen. Cules son los
principales estmulos que desencadenan dicha va. Mediante que
mecanismo se mantiene inactivo el NF-B en las clulas sin estimular.
4- Esquematizar el mecanismo de activacin de la protena Ras cuando
se une un factor de crecimiento a un RTK. Describir detalladamente el
mecanismo por el cual Ras activa la cascada de MAPK Cmo influye
en la regulacin del ciclo celular?
5- Qu otras vas aparte de STAT se activan con la Epo unida a su
receptor? Indique dos formas de finalizar una va de transduccin en
protenas G.
6- Describa estructura general y mecanismo de activacin de los
receptores RTK. Cul es la diferencia con los receptores para
citosina? Cmo se activa Ras luego de la estimulacin de un RTK
mediada por la unin de un factor de crecimiento? Describa la
cascada de cinasas que transmite seales corriente abajo desde la
protena Ras activada a la MAPK.
7- A qu tipo de receptores se encuentra asociada la liberacin de
inositol 1,4,5-trifosfato (IP3) como segundo mensajero? Describa los
mecanismos que promueven dicha liberacin. Qu consecuencias
tiene la liberacin al citosol celular de IP3?
8- Explique cmo se realiza reclutamiento y activacin completa de la
PKB en las vas PI-3 cinasa Cmo se modula negativamente la
sealizacin de la va PI-3 cinasa?
9- Qu son las citocinas? Mencione un ejemplo. Describa la estructura
del receptor para citocina. Describa la va de sealizacin JAK/STAT
luego de la fijacin del ligando a un receptor para citocina. Explique al
menos, un mecanismo especfico para la finalizacin de la
transduccin de la seal del receptor para Eritropoyetina.
10- Describa la estructura de los receptores para TGF y el mecanismo
de activacin de los mismos. Describa la participacin de los
diferentes factores de transcripcin Smad en la va de sealizacin
del TGF.
11- La alteracin de la va de sealizacin del TGF puede estar
involucrada en distintos tipos de cncer. Explique.
12- Describa detalladamente la regulacin de la relajacin arterial en
respuesta a acetilcolina.

CAPTULO 16: MOVIMIENTO DE PROTENAS EN LAS MEMBRANAS


Y ORGNULOS

1- Describa las principales etapas del proceso de biosntesis de las


protenas que presentan oligosacridos N-ligados Dnde se lleva a
cabo este proceso? Cules son las principales funciones de estos
oligosacridos agregados a las glicoprotenas?
2- Explique detalladamente los pasos para la translocacin de una
protena a travs de la membrana del retculo endoplsmico.
3- Describa las mutaciones recesivas autosmicas posibles que causan
el ensamblaje defectuoso de los peroxisomas.
4- Menciones todas las posibles modificaciones postraduccionales que
puede sufrir una protena de secrecin.
5- Explicar biosntesis de protenas que poseen oligosacridos N-ligados
incluyendo compartimientos subcelulares donde se lleva a cabo,
caractersticas de la secuencia de direccionamiento, caractersticas
del precursor sacardico que se agrega o en que compartimiento se
agrega dicho oligosacridos Cul es la importancia biolgica de la
glicosilacin de protenas?
6- Mencione 4 protenas que participen del plegado y/o modificacin de
las protenas de secrecin. Indique 2 de ellas que modifiquen
covalentemente a la protena sustrato.
7- Mencionar y detallar protenas que interactan con las Hac-1, y
funcin de esta va.
8- Describa el control de la PDI en la formacin de enlaces disulfuro.
9- Describa detalladamente tres diferencias entre mecanismo de ingreso
de protenas en la matriz mitocondrial y entrada de protenas en
matriz de peroxisoma.
10- La clula posee procesos de verificacin de errores que eliminan
protenas citoslicas sintetizadas o plegadas de manera incorrecta.
Describa los procesos que controlan el plegamiento y degradacin de
estas protenas celulares.
11- Explique el triple aporte de energa necesario para incorporar
protenas a la matriz mitocondrial.
12- Las clulas de mamfero y de levaduras responden a la
acumulacin de protenas desplegadas aumentando la transcripcin
de ciertos genes. Describa detalladamente el mecanismo molecular
que desencadena el aumento de la transcripcin, indicando dnde se
lleva a cabo este proceso.
13- El receptor de LDL es una protena de transmembrana de paso
nico. Describa las caractersticas y localizacin de las secuencias de
sealizacin que dirigen el movimiento de esta protena y su
insercin. Justifique su respuesta
14- Indique V o F:
a) La reestructuracin de los enlaces disulfuro en la cara luminal del
RE se forma con la protena Ero-1 reducida.
b) Las protenas que siguen la va del peroxisoma realizan
translocacin cotraduccional.
c) Las protenas de la matriz del peroxisoma ingresan plegadas a
dicho compartimiento.
d) Las protenas de la va del peroxisoma se glucosilan en la cara
citoslica de la membrana del peroxisoma.
e) La translocacin de protenas a la matriz mitocondrial necesita
solo el aporte de ATP de las protenas chaperonas Hsc70 (Explicar
detalladamente cmo se genera la fuerza necesaria para el
desplazamiento)

CAPTULO 17: TRNSITO VESICULAR, SECRECIN Y ENDOCITOSIS

1- Explique detalladamente el mecanismo de formacin de COPII.


2- La especificidad de fusin de vesculas involucra a procesos
diferentes y secuenciales. Describa el primero de los dos procesos y
su regulacin por Protenas interruptoras GTPasas.
3- Cual es el destino de las vesculas celulares recubiertas por
protenas de la familia Sec? Cual es la funcin de este tipo de
cubierta? Explique porque la incubacin de extractos celulares con un
derivado no hidrolizable de GTP impide la formacin de vesculas
recubiertas con las protenas de la familia Sec. Justifique
4- Describa el trnsito de las enzimas lisosmicas solubles desde la red
del trans-Golgi al endosoma tardo y explique detalladamente los
mecanismos moleculares que involucra.
5- Disee un experimento que le permita estudiar in vivo el trnsito
vesicular desde el RE al Golgi.
6- Cul es la seal que dirige las enzimas lisosmicas a los lisosomas?
Donde se forma dicha seal y donde se encuentra su receptor? Qu
tipo de vesculas transportan dichas enzimas a sus compartimientos
de destino? Cmo y cuando se activan las enzimas lisosmicas?
7- Explicar detalladamente el mecanismo de transitocis.
8- Explique detalladamente cmo se transporta el hierro unido a
transferrina a travs de las clulas.
9- Qu tipo de vesculas recubiertas se conocen? Mencione en qu va
de trnsito vesicular est involucrada cada una de ellas.
10- Explique detalladamente el mecanismo por el cual los anticuerpos
de la leche materna llegan a la sangre del recin nacido. Mencione en
cada paso las molculas intervinientes.
11- La insulina es una protena que se libera en el torrente sanguneo
e induce varias respuestas metablicas. En qu compartimiento
comienza la sntesis de la insulina? Enumere (en orden) los distintos
compartimientos que atraviesa esta protena hasta el momento de su
secrecin. Explique DETALLADAMENTE todas las modificaciones
postraduccionales que sufre, indicando en qu compartimiento se
producen. Indique qu tipo/s de cubierta/s proteica/s intervienen en el
transporte de la insulina desde el comienzo de su sntesis hasta su
secrecin.
12- La albmina es una protena de exportacin. En qu
compartimiento comienza la sntesis de la insulina? Enumere (en
orden) los distintos compartimientos que atraviesa esta protena
hasta el momento de su secrecin. Explique DETALLADAMENTE todas
las modificaciones postraduccionales que sufre, indicando en qu
compartimiento se producen. Indique qu tipo/s de cubierta/s
proteica/s intervienen en el transporte de la albmina desde el
comienzo de su sntesis hasta su secrecin.
13- Qu elementos intervienen en el proceso de gemacin de una
vescula cubierta de clatrina y cul es la funcin de cada uno de ellos?
(explique detalladamente). Explique por qu en la incubacin de
extractos celulares con un derivado no hidrolizable de GTP provoca
acumulacin de brotes de vesculas recubiertas de clatrina con
cuellos excesivamente largos. Menciones las diferentes rutas de
trnsito intracelular que involucran vesculas recubiertas con clatrina.
14- Por qu las personas que cuyas clulas no poseen actividad de
NacGlc fosfotranferasa carecen de mltiples enzimas en sus
lisosomas? En qu compartimiento se localiza dicha enzima?
15- Explicar en no ms de 7 renglones el proceso de fusin vesicular
mediante protenas v-SNARE y t-SNARE.
16- Describa detalladamente el proceso de ingreso a la clula del
receptor LDL y su ligando, y cmo el ligando se libera una vez
ingresado.
17- Mencione las diferencias existentes entre la secrecin constitutiva
y la secrecin regulada.
18- Qu elementos intervienen en el proceso de gemacin de una
vescula y cul es la funcin de cada uno de ellos?
19- Describa de manera ordenada los pasos de la va de ingreso de
LDL y su posterior degradacin en las clulas Qu tipo de vescula
esta involucrada en el transporte de LDL dentro de la clula?
20- Protenas solubles residentes en RE presentan una secuencia KDEL
en extremo C-terminal. Describa la importancia de esta secuencia en
el trnsito de protenas.
21- Con respecto al trnsito vesicular en las etapas iniciales de la va
secretoria describa detalladamente el transporte antergrado y
retrgrado que se establece entre el RE y las cisternas del Golgi.
22- Ciertas protenas integrales de membrana del RE son reclutadas
especficamente para el transporte hacia el Golgi. Mencionar vescula
utilizada. Entre qu molculas o segmentos de molculas se produce
el reconocimiento de estas protenas reclutadas? Mencionar protenas
que participan en el ensamblaje de la cubierta. Explicar dicho proceso
de ensamblaje.
23- Marcar la/s afirmacion/es incorrecta/s y justificarlas:
p) La secuencia KDEL es una secuencia que dirige las enzimas
lisosmicas desde la red trans Golgi a los lisosomas.
q) Las protenas que van al lisosoma tienen una secuencia hidrfoba
que las lleva al lisosoma.
r) Las unin de las protenas v-SNARE y t-SNARE acercan las
membranas de la vescula y la clula diana para su fusin.
s) Las enzimas q van a la membrana del peroxisoma utilizan la va
secretoria.
t) La partcula de reconocimiento de seal es una protena integral
de la membrana del RER.
u) El receptor de LDL es una protena transmembrana del Golgi para
las partculas LDL que permite su transporte hacia los endosomas
tardos.
v) La va secretoria puede estudiarse mediante el uso de la GFP.
w) En la hipercolesterolemia familiar, la enzima limitante de la va de
sntesis del colesterol no se inhibe a pesar del aumento de LDL.
x) La transitosis es un mecanismo que sirve para clasificar las
enzimas lisosomales.
y) La sntesis de enzimas lisosomales comienza en los ribosomas
libres.
z) Las enzimas lisosomales nacientes presentan unas secuencia de
sealizacin en su extremo N-terminal que las dirige hacia el RE.
aa) Una segunda secuencia de sealizacin hidrfoba dirige las
protenas solubles a los lisosomas.
bb) Las protenas que van al lisosoma tienen una secuencia de
sealizacin que las lleva al RE
cc)Las protenas de cubierta vesicular deben ser removidas para que
una vescula se fusione con su membrana diana.
dd) El receptor de LDL es una protena transmembrana del trans
Golgi que incorpora la lipoprotena y la enva a los endosomas.

CAPTULO 19: MICROFILAMENTOS Y FILAMENTOS


INTERMEDIOS
1- Los queratinocitos pueden presentar movimientos ameboideos.
Explique mecanismo del fenmeno especificando distintas molculas
involucradas.
2- Explicar y mencionar diferencias entre la polimerizacin in vivo e in
vitro de la actina.
3- Disee un experimento utilizando fragmentos de miosina S1 y un ME
para observar la polaridad de los filamentos de actina.
4- Explique por qu ratones transgnicos que expresan una isoforma de
queratina mutante presentan importantes anomalas cutneas.
Mencione en qu circunstancias la clula puede inducir el desamblaje
de los filamentos intermedios Cmo lo hace y por qu?
5- Elija la o las opciones incorrectas acerca de los filamentos
intermedios:
a) No se asocian con protenas motoras.
b) El ensamblaje de las subunidades requiere de GTP.
c) El tipo de protena que los forma se clasifica segn cada tipo
celular.
d) Son fijos, no se desensamblan nunca.
e) Los neurofilamentos tienen como papel regular el dimetro del
axn.
6- Explique los pasos del ensamblaje de Actina G en Actina F. Respecto
de la Actina F, explique la funcin de las protenas profilina, gelsolina
y miosina.
7- Explique detalladamente cmo la clula controla el ensamblaje y
desensamblaje de los filamentos de actina y la remodelacin de los
filamentos de actina.
8- Explique qu papel cumplen la profilina y la timosina 4 en la
regulacin de la polimerizacin de actina.
9- Cules son los principales grupos de protenas formadoras de
Filamentos Intermedios y cual es su distribucin en los tejidos?
Explique por qu la integridad estructural de la queratina es esencial
para que la epidermis resista la abrasin.
10- Explique la dinmica (a nivel molecular) del citoesqueleto de
actina en el movimiento ameboide.
11- Locomocin celular: Explicar detalladamente la formacin del
borde conductor.
12- Cuales son las diferencias entre los extremos de actina?
Caractersticas del crecimiento de los filamentos de actina Con que
experimento se dieron a conocer las caractersticas?
13- Mencione protenas que se fijan a filamentos de actina y controlan
su longitud. Describa mecanismo de accin y funcin fisiolgica.
14- Explique por qu mecanismo los factores de crecimiento
promueven formacin de filopodios, lamelipodios y fibras de estrs.
15- Explique detalladamente el proceso por el cual se produce la
extensin de la membrana plasmtica en el borde director.
16- Mecanismo de regulacin de contraccin de msculo liso y
msculo esqueltico.
17- Base molecular del transporte de vesculas sobre los filamentos de
actina.
18- Describa la participacin de los filamentos intermedios en la
organizacin del sarcmero.
19- Describa y analice las diferencias en la organizacin de la actina
en los haces contrctiles versus los no contrctiles de las clulas no
musculares.
20- Explicacin a nivel molecular sobre la regulacin del msculo liso
por un mecanismo dependiente de miosina.
21- Cul es la base molecular por la cual las vesculas intracelulares
son transportadas sobre filamentos de actina?
22- Describa el fundamento bioqumico por el cual los filamentos de
actina se organizan en haces o retculos.

CAPTULO 20: MICROTBULOS

1- Explique los eventos moleculares que involucran los microtbulos


durante la ANAFASE A y B.
2- Describa la estructura de la cinesina y la dineina e indique la funcin
de cada una de ellas.
3- Explicar polimerizacin e inestabilidad dinmica de microtbulos.
4- Qu son las protenas asociadas a microtbulos (MAPs)? Cmo se
clasifican segn su funcin? Elija una de ellas y explique su
mecanismo de accin. Mencione los dominios ms importantes de
estas protenas y su correspondiente funcin.
5- Qu es el MTOC? Cmo est compuesto? Diferencias entre el MTOC
en interfase y en mitosis.
6- Mencione al menos dos protenas motoras de microtbulos. Describa
para cada una de ellas su estructura, su funcin y la polaridad de su
movimiento. Indique qu tipos de filamentos son las lminas
nucleares y cul es su funcin.
7- Unos apndices de la membrana tienen como funcin la movilidad
celular y contienen microtbulos: Qu son esos apndices? Describa
la estructura de esos apndices. Cmo se genera la fuerza necesaria
para el desplazamiento?
8- Mencione dos protenas motoras de los microtbulos y describa su
estructura. Indique para cada una de ellas cul es la polaridad del
desplazamiento y cul es la funcin que cumple. El desplazamiento
de la protena motora depende de energa? Explique en no ms de
tres renglones.
9- Cules son las protenas motoras de los microtbulos? Explique
cmo estas protenas contribuyen a la captura y estabilizacin de los
microtbulos durante la metafase mittica.
10- Explicar la polimerizacin de actina in vitro. Explique el concepto
de concentracin crtica y cul es su importancia en la dinmica de
crecimiento del filamento de actina.
11- Indique V o F:
ee) La vida media de los microtbulos del huso mittico es
mayor que la de los microtbulos citoslicos.
ff) El movimiento de cilios y flagelos no dependen de ninguna
protena motora.
gg) Los microtbulos metafsicos se estabilizan solo por la dinena.
12- Marcar la estructura asociada a filamentos intermedios y
simultneamente a MAP(protenas asociada a los microtbulos):
hh) Filamentos q rodean al ncleo
ii) Desmosoma
jj) Hemidesmosoma
kk)Neurofilamentos de los axones
ll) Slo a, b y c correctas
mm) Ninguna correcta

CAPTULO 21: REGULACIN DEL CICLO CELULAR EUCARIONTE

1- Explicar brevemente el control del ciclo celular.


2- Explicar el aumento y cada de la actividad del MPF durante el ciclo de
divisin celular.
3- Explique la importancia del punto de control del DNA daado en el
ciclo de divisin celular. Describa detalladamente como participa la
proteincinasa ATM o ATR en este punto de control.
4- El pasaje por tres transiciones crticas del ciclo celular involucra la
degradacin de protenas marcando de ese modo la irreversibilidad
del proceso. Menciones cuales son las 3 transiciones citadas
anteriormente. Indique cuales son las 3 protenas del ciclo celular que
sufren protelisis en cada caso. Describa como se produce la reaccin
proteoltica en cada caso.
5- Describa los mecanismos moleculares en donde participa APC
(complejo promotor de la anafase) Qu importancia tiene su
activacin secuencial para la clula?
6- Por qu los complejos de prerreplicacion se ensamblan durante la
fase G1 temprana? Por qu la activacin de los complejos de
prerreplicacion se activan solo una vez sobre la fase S? Cmo se
activa la ciclina-CDK de fase S?
7- Describa los cambios en la estructura tridimensional que regulan la
actividad de cinasa de la CDK2 humana. Indique especficamente la
etapa del ciclo celular en la que participa, describiendo
detalladamente los procesos moleculares que estimulan la
transcripcin del gen CDK2 y su subunidad reguladora. Esquematice.
8- Explique DETALLADAMENTE la activacin del factor promotor de la
mitosis (MPF).
9- Explique qu son los puntos de control del ciclo celular. Describa
detalladamente el punto de control del ensamblaje del huso,
indicando en qu momento del ciclo celular opera dicho punto de
control. Mencione que posibles consecuencias tendra para la clula
una falla en este punto de control.
10- Explique cmo las siguientes mutaciones que se encuentran en
algunas clulas cancerosas llevan a una omisin en los puntos de
control: sobreexpresin de ciclina D y prdida de funcin de Rb.
11- Explique al menos 3 mecanismos que regulen la actividad de
cinasa de las cinasas dependientes de ciclinas.
12- Describa el mecanismo mediante el cual se inactiva y luego se
activa el complejo CDK-ciclina de fase S.
13- Sustratos de MPF, como acta esa fosforilacin para que la mitosis
siga adelante.
14- Describa el mecanismo mediante el cual el APC promueve la
separacin de las cromtidas hermanas en anafase.
15- Realizar un grafico del curso temporal de la expresin de los genes
de respuesta temprana y respuesta retardada en clulas detenidas en
Go, despus del agregado de suero. Decir cmo vara la expresin de
esos genes si al suero se le agrega un inhibidor de sntesis proteico.
16- Defina punto de restriccin. Explique detalladamente cmo se
regula el pasaje a travs del punto de restriccin en las clulas de los
mamferos. Esquematice cmo se produce el pasaje a travs del
punto de restriccin, indicando claramente todas las protenas
involucradas.
17- Justifique detalladamente la siguiente afirmacin referida a la
regulacin del ciclo celular: "La expresin regulada de 2 clases de
genes hace retornar a una clula en Go al ciclo celular".
18- Justifique detalladamente la siguiente afirmacin referida a la
regulacin del ciclo celular: "El pasaje a travs del punto de
restriccin depende de la fosforilacin de la protena Rb supresora de
tumores"
19- Indique Verdadero o Falso. Justifique:
nn) La actividad del complejo mittico de mamferos no es regulada
por fosforilacin y desfosforilacin como ocurre en S. Pombe.
oo) La iniciacin de la replicacin del DNA ocurre varias veces en cada
origen de replicacin durante el perodo S.
pp) Los complejos ciclina-CDK, compuestos por una subunidad ciclina
reguladora y una cinasa dependiente de ciclina catalizadora,
regulan el progreso de una clula a travs del ciclo de divisin
celular.
qq) El MPF es una proteincinasa que requiere una ciclina mittica para
su activacin.
rr) El punto de restriccin del ciclo celular es la alineacin de los
cromosomas en el huso mittico.
ss) Los factores de transcripcin promueven la proliferacin de un
cultivo celular.
tt) El punto de restriccin del ciclo celular es la separacin de
cromtidas hermanas.
uu) Las desfosforilacin de las lminas A, B y C produce la
despolimerizacin de los filamentos de lmina.
vv) Los puntos de control irreversibles del ciclo celular son aquellos
donde existe degradacin de protenas por poliubiquitinacin.
ww) La protena Rb fosforilada se une a los E2F y los convierte en
factores no activos.
xx) La finalizacin de mitosis requiere el aumento de ciclinas para la
activacin del MPF.
yy) La fosforilacin de Rb por el complejo CDK-ciclina secuestra al E2F
para inactivar la transcripcin de genes.
zz) Una vez que todos los cromosomas se han unido a los
microtbulos del huso, el factor de especificidad Cdc20 dirige el
APC a la poliubicuitinizacin de la securina.
aaa) Los niveles de ciclina mittica y la actividad cinasa del factor
promotor de la mitosis (MPF) varan en forma inversa en el ciclo de
divisin celular.
bbb) El APC es dirigido por Cdc20 a poliubicuitinar la securina, la
cual como consecuencia es degradada por el proteasoma.
ccc) EL APC fosforila a los MPF y los hace inactivo.
ddd) El punto de control del DNA daado, para reparar la lesin se
utiliza p53, Chk1 y ATM/R.
eee) La ciclina mittica del S. pombe no se regula por
fosforilacin y desfosforilacin.
fff) La mutacin con prdida de funcin en la protena p16 provoca la
detencin del ciclo en fase S.
ggg) La p27 inhibe a la ciclina A/CDK2.
hhh) La fosforilacin de la Y15 y la T161 controlan la expresin de
la MPF.

CAPTULO 23: CNCER

1- El cromosoma Filadelfia es resultado de la translocacin


cromosmica. Explique qu consecuencias puede conllevar.
2- Explique el mecanismo por el cual los rayos UV producen alteracin
del DNA Cul es el mecanismo de reparacin?
3- Explique cul es el proceso por el cual la desaminacin de la 5-
metilcitosina puede originar una mutacin puntual del DNA.
4- La oncoprotena TRK quimrica es la fusin de un dominio de la
tropomiosina y un segmento del receptor TKR. Qu es una
oncoprotena? Va de sealizacin involucrada y qu tipo de
alteracin del DNA se puede haber producido.
5- Reparacin del DNA por escisin de un nucletido. Qu tipo de de
errores corrige. Explique.
6- Explique la obtencin del oncogen rasD con clulas 3T3.
7- Describa el mecanismo de reparacin del DNA que se utiliza para
corregir el apareamiento incorrecto entre G y T.
8- El papilomavirus humano (HPV) existe en dos formas: una benigna y
otra que puede inducir cncer. Qu tipo de genoma posee el HPV?
Qu tipo de CICLO DE REPLICACIN tienen las formas benignas y
malignas? Con respecto a estas ltimas, describa el ciclo de
replicacin. Explique DETALLADAMENTE el mecanismo molecular por
el cual el HPV induce la transformacin de las clulas a cancerosas.
9- Explique molecularmente por qu el HPV representa un riesgo de
contraer cncer.
10- Con respecto a las roturas de doble hlice en el DNA Cules
pueden ser las causas? Tipo celular en donde se generan y
consecuencias. Describir los mtodos de reparacin.
11- Explicar el proceso de desaminacin de citosina. Qu genera este
proceso.
12- La protena PTEN es una protena supresora de tumores. Explique
detalladamente cmo acta.
13- Experimento del gen mutante RAS en carcinoma vesicular
humano.
14- Cuales son los fundamentos moleculares por el cual el virus del
papiloma humano produce cncer?
15- El benzopireno y aflatoxina, carcingenos de humo de cigarrillo y
granos mohosos, pueden producir cncer de pulmn e hgado
respectivamente, por dao del DNA. Explique Qu mecanismos
puede utilizar la clula para repararlo?
16- Mecanismo de reparacin del DNA a partir de una mutacin
puntual en la cual la metil-citosina se convierte en timina.
17- Con respecto a las roturas de doble hlice en el DNA: a) Cules
pueden ser las causas?; b) Tipo celular en donde se generan y
consecuencias. Describir los mtodos de reparacin.
18- Explique la anomala cromosmica del linfoma de Burkitt Cul es
la consecuencia biolgica?
19- El virus SFFV (virus productor de focos esplnico) puede producir
eritroleucemia. Explique.
20- Explique detalladamente la funcin correctora de la DNA
polimerasa.
21- Explique en la va de sealizacin del TGF los puntos en los que
se han detectado mutaciones y cul es la consecuencia.
22- La p53 es una protena oncosupresora. Explique detalladamente
en qu circunstancias puede encontrarse alterada su funcin y cules
son las consecuencias.
23- Dos sistemas reparan el DNA daado de doble hlice. Uno se
encuentra frecuentemente alterado en mujeres con susceptibilidad al
cncer de mama. Explique.
24- El carcinoma de colon se ha encontrado una alteracin gnica por
la cual un receptor RTK de membrana se localiza en citosol y es
constitutivamente activo. Explique.
25- La alteracin de la va de sealizacin del TGF puede estar
involucrada en distintos tipos de cncer. Explique.
26- Explicar el papel de la telomerasa en clulas cancerosas.
27- Cul es la relacin de p53 en el punto de control del dao del
DNA en el ciclo celular? Por qu una mutacin en el alelo de la
protena p53 es dominante negativa?
28- Cules son las propiedades celulares fundamentales que se
alteran en la carcinognesis? Indique en cada caso el mecanismo.
29- En el cncer hereditario de mama se encuentra mutada la BRCA-1.
Describa el mecanismo en el que se encuentra involucrada dicha
protena.
30- En el cncer colorrectal no polipsico hereditario existe una
mutacin con prdida de funcin heredada en un alelo del gen que
codifica MLH1 o del MDSH2. Explique el mecanismo detalladamente
en el que participan. Justifique su relacin con el cncer y con la va
de sealizacin del TGFB.
31- Cules son las propiedades fundamentales que se alteran en al
carcinognesis?
32- Describa la reparacin de roturas bicatenarias por recorreccin de
segmentos no homlogos Cul es la importancia funcional?

APOPTOSIS

1- Describir la cascada de la caspasas.


2- Explique en forma detallada el proceso de apoptosis que se activa por la
va extrnseca e indique su relacin con la va intrnseca.
3- Explicar detalladamente va intrnseca o mitocondrial de la apoptosis.
Describir los factores que la desencadenan.
4- Explique la secuencia de eventos que conducen a la degradacin del
DNA (etapa final de la Apoptosis) por activacin de la va intrnseca.
Indique adems qu causas activa esta va.
5- Describa los mecanismos que participan en la va apopttica activada a
partir de FasL o TNF.
6- Cmo ocurre la apoptosis por cada de factores trpicos? Explicar hasta
la activacin de la caspasa 9.
7- Explique cmo la interaccin del ligando FasL con el receptor de muerte
activa la caspasa 9 (va mitocondrial) Cules son las consecuencias de
activacin de esta caspasa inicial? Explique los eventos bioqumicos
tempranos.
8- Cmo se activan las caspasas iniciadoras? Qu eventos morfolgicos y
bioqumicos se producen luego de la activacin de estas caspasas?
9- Explicar la va intrnseca de la apoptosis, cmo se activa, mecanismo, a
qu seales responde y control.
10- Explique cmo el dao en el DNA puede activar la va mitocondrial o
va intrnseca. Mencione por lo menos dos eventos celulares tempranos
desencadenados por la activacin de las caspasas iniciadoras
11- Activacin de caspasas por va ligando receptor.
12- Mencione al menos dos eventos bioqumicos tardos que ocurren en
una clula despus de que se activa la caspasa 3.
13- Explique detalladamente como la cada de factores de supervivencia
como IL3 activan la caspasa iniciadora 9.
14- Secuencia de eventos que conducen a la degradacin del DNA en una
clula donde se ha activado la apoptosis por la activacin de los
receptores de muerte. Indique en dicha secuencia donde las protenas
Hsp 70/27 podran actuar para rescatar a las clulas de la muerte.
15- Mencionar 4 sucesos que induzcan el dao en el DNA. Cmo se
forma el Apoptosoma y qu desencadena su formacin?
16- Cmo se desencadena la va intrnseca por medio de IL-3?

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