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INTRODUCCIN A LA BIOQUMICA

Y EL AGUA

Facilitadora:
Eunice Molinar
Qu es la BIOQUMICA?
La bioqumica es el estudio de las molculas y las
reacciones qumicas de la vida.
Los elementos qumicos de la vida

Tabla peridica de los elementos. Los elementos importantes encontrados en las clulas vivas se
muestran a color. Los elementos en color rosa (CHNOPS) son los seis elementos ms abundantes. Los
cinco iones esenciales estn en violeta. Los elementos traza se muestran en celeste oscuro (ms comunes)
y en celeste claro (los menos comunes).
Muchas macromolculas importantes
son polmeros

A.Protenas

B.Polisacridos
Muchas macromolculas importantes son
polmeros

C. cidos nucleicos

D. Lpidos y membrana
LA CLULA
Es la unidad bsica de la vida

A. Clula procariota
LA CLULA
Animal Vegetal

La Clula Animal
https://www.youtube.com/watch?v=6fbwQGioDuI

https://www.youtube.com/watch?v=xo1anbizT4E&ebc=ANyPxKrrwBMi-wrAwUOncUo5kxEc2j-Kp99-
nxP_XkNlR2doBjyFLIhzsPufX8FaOuwBOuiWMMUqq2WCh6UARW27JOaIOIhESg
Mitocondria. Las mitocondrias son los sitios
principales de la transduccin de energa en
las clulas eucariticas. El metabolismo de
carbohidratos, cidos grasos y aminocidos
se lleva a cabo en este organelo.

Cloroplasto. Los cloroplastos son los sitios


de la fotosntesis en plantas y algas. Los
pigmentos asociados con la membrana
tilacoide capturan la energa de la luz y la
utilizan para convertir el dixido de carbono
y agua en carbohidratos.
La clula
Introduccin al
metabolismo y
bioenergtica
Qu es la Bioenergtica?
Es la disciplina que estudia los aspectos
energticos en los sistemas vivos, tanto a nivel
molecular como a nivel celular.

Interacciones moleculares
ATP como biomolcula almacenadora de
energa
Biocatalisis
Reacciones acopladas

Sigue las leyes de la termodinmica


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METABOLISMO
METABOLISMO es el conjunto de todas las reacciones qumicas que
se producen en el interior de las clulas de un organismo. Es la suma
de las reacciones celulares.

Mediante esas reacciones se transforman las molculas nutritivas


que, digeridas y transportadas por la sangre, llegan a la clula.

Los METABOLITOS son las pequeas molculas que son el producto


intermedio en la degradacin o biosntesis de las biomolculas.
El metabolismo tiene dos finalidades
principales:

1. Obtener energa qumica


2. Fabricar sus propios compuestos
Alimentos_biomolculas
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16 METABOLISMO

CATABOLISMO ANABOLISMO

Reacciones que degradan molculas Reacciones que sintetizan molculas


(GLUCOSA) (GLUCGENO)
Se libera energa que se transfiere al ATP Se requiere un aporte de energa
(formacin de ATP) (hidrlisis del ATP)

-Responsable de la degradacin de -Responsable de la sntesis de todos los


grandes molculas para obtener compuestos necesarios para la
molculas mas pequeas y energa. conservacin, crecimiento y reproduccin
celular.
-Degradan molculas pequeas para
formar productos inorgnicos.

Finalidades del metabolismo


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Anabolismo y Catabolismo

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La ruta metablica de cada organismo estn especificadas por los genes


que contiene su genoma.
Las Rutas Metablicas
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En su mayora, las reacciones metablicas estn catalizadas por
enzimas, por tanto el estudio del metabolismo no solo abarca:

- Reacciones
- Productos intermedios
- Productos finales
- Caractersticas de las enzimas relevantes

Las clulas pueden efectuar ciento de miles de reacciones. Para un


mejor estudio y comprensin, se subdivide en forma sistemtica el
metabolismo en segmentos y ramas.

El estudio del metabolismo se divide en los cuatros grupos


principales de biomolculas.
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El agua: el medio de la vida

Hidrgen
o
Oxgeno
20 Importancia del agua
El agua es el lquido ms abundante de la corteza y uno de los
pocos lquidos naturales. Es esencial en los seres vivos. El agua
es el componente ms abundante en los medios orgnicos, los
seres vivos contienen por trmino medio un 70% de agua.

El agua en los seres vivos se encuentra tanto intra- como


extracelularmente.

El agua intracelular es la que est en el interior de las clulas,


representa 2/3.

El agua extracelular es la que est baando las clulas o


circulando en forma de sangre, linfa, savia, etc.
Componente qumico predominante de los organismos
vivos.

Presenta singulares propiedades fsicas:


-Disuelve una gran cantidad de molecular
orgnicas e inorgnicas.
-Capacidad para formar enlaces de hidrgeno.
-Excelente nuclefilo.
-Es un reactivo o un producto en muchas
reacciones metablicas.
Estructura molecular del agua

El ngulo del enlace HOH en el agua es de


104.5, pero si los orbitales electrnicos apuntaran ngulo entre los enlaces covalentes
en realidad a las cuatro esquinas de un tetraedro el de una molcula de agua. Dos de los
ngulo sera de 109.5. La explicacin normal de orbitales hbridos sp3 del tomo de
esta diferencia es que existe una fuerte repulsin oxgeno participan en los enlaces
entre pares de electrones solitarios y esa repulsin covalentes con los orbitales s de los
trata de unir los enlaces covalentes, con reduccin tomos de hidrgeno. Los otros dos
del ngulo de 109.5 a 104.5 orbitales sp3 estn ocupados por pares
solitarios de electrones.

La molcula de agua (H2O) tiene forma de V y el ngulo entre los dos enlaces covalentes OH es de
104.5.
Algunas propiedades importantes del agua se deben a la forma angulada y a los enlaces intermoleculares
que puede formar.
Puentes de hidrgeno en el agua

La atraccin entre uno de los tomos de hidrgeno, ligeramente positivo, de una molcula de agua y
los pares de electrones parcialmente negativos en uno de los orbitales hbridos sp3 produce un
puente de hidrgeno

Puentes de hidrgeno entre dos molculas de


agua. Un tomo de hidrgeno parcialmente
positivo (+) de una molcula de agua atrae al
tomo de oxgeno parcialmente negativo (-) de
una segunda molcula de agua y forma un puente
de hidrgeno. Se indican las distancias entre
tomos de las dos molculas de agua en el hielo.
Los puentes de hidrgeno se representan con
lneas entrecortadas.
Puentes de hidrgeno en una
molcula de agua. Una molcula de
agua puede formar hasta cuatro
puentes de hidrgeno: el tomo de
oxgeno es aceptador de dos puentes
con dos tomos de hidrgeno y cada
grupo OH sirve como donador de un
hidrgeno.
1. Fuerza de enlace 20 kj/mol

2. Fuerza de enlace covalente 460 kj/mol

3. Propiedades relacionadas:
a. Bajo Punto de Fusin
b. Alto Punto de ebullicin
c. Calor de Evaporacin Estructura del hielo. En el hielo, las molculas de agua
d. Tensin Superficial forman una red hexagonal abierta donde cada molcula de
e. Constante Dielctrica agua forma un puente de hidrgeno con otras cuatro. La
regularidad geomtrica de estos puentes de hidrgeno
contribuye a la resistencia del cristal de hielo.
El agua es un solvente excelente
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A. Las sustancias inicas y polares se
disuelven en agua.

Las molculas que se pueden disociar y formar


iones se llaman electrolitos. Las sustancias
que se disuelven con facilidad en agua se
llaman hidrofolicas o amantes del agua.

Los tomos negativos de oxgeno en las


molculas de agua se orienten hacia los
cationes (iones con carga positiva) de los
electrlitos, y los tomos positivos de hidrgeno
se orienten hacia los aniones (tomos con
carga negativa).
A. Las sustancias inicas y polares se disuelven en agua
B. Concentraciones celulares y difusin
Isotnica: disoluciones de
igual osmomolaridad. Una
clula rodeada por una
disolucin isotnica no gana ni
pierde agua.

Hipertnica: disoluciones con


mayor osmomolaridad en el
citosol. Una clula rodeada por
una disolucin hipertnica se
encoge al salir agua.

Hipotnica: disoluciones con


menor osmomolaridad en el
citosol. Una clula rodeada
por una disolucin hipotnica
se hincha al penetrar el agua.
C. Presin osmtica
smosis: el movimiento de
agua a travs de una
membrana semipermeable
impulsado por diferencias
en la presin osmtica.
Importante en la vida de la
clula.
Las sustancias no polares son
insolubles en agua
Se dice que las molculas no polares son
hidrofobicas (que odian al agua) y a este
efecto de exclusin de sustancias no polares
por parte del agua se le llama efecto
hidrofobico. El efecto hidrofbico es
crtico para el plegamiento de las protenas
y el autoensamblaje de las membranas
biolgicas.

Cabeza
hidrofilica

Cola Las molculas que son hidroflicas e


hidrofbica
hidrofbicas a la vez, se dice que esas
molculas son anfipaticas.
D. Interacciones hidrofbicas

La asociacin de una molcula o grupo relativamente no


polar con otras molculas no polares se llama interaccin
hidrofobica.

El efecto acumulado de muchas interacciones


hidrofbicas puede ser apreciable sobre la
estabilidad de una macromolcula.
El agua es nucleoflica

El tomo de oxgeno, rico en electrones, determina


gran parte de la reactividad del agua en las
reacciones qumicas. A las sustancias ricas en
electrones se les llama nucleofilos (amantes del
ncleo) porque buscan especies con carga
positiva, o con deficiencia en electrones, llamadas
electrofilos (amantes del electrn).

Los nuclefilos pueden tener carga negativa o


contar con pares no compartidos de electrones.

Atacan a los electrfilos durante reacciones de


sustitucin o de adicin.

Los tomos nuclefilos ms comunes en biologa


son de oxgeno, nitrgeno, azufre y carbono.
Qumica cido-base
Un ion hidronio cede un protn

Salto de un protn

El agua acepta un protn y se


transforma en un ion hidronio.
cidos, bases y pH
Ionizacin del agua
La escala de pH
pH de algunos fluidos
acuosos

Para ser preciso


Constantes de disociacin de cidos dbiles

Un par cido-base conjugado consiste en un donador de protones y un aceptor de


protones.
Ecuacin de Henderson-
Hasselbalch
Ka +
HA
H + A -
A-

HA-

base conjugada
cido dbil
Ecuacin de Henderson-
Hasselbalch

La constante de equilibrio para la


disociacin de un protn de un cido
en agua se llama constante de
disociacin del acido, Ka.
Curvas de titulacin
Los valores de pKa de los cidos dbiles
se determinan por titulacin.
Ejemplo se titula una solucin de cido
actico agregando pequeas alcuotas
de una base fuerte de concentracin
conocida.

Se mide el pH de la solucin y se
grafica en funcin de la cantidad de
equivalentes molares de base fuerte
agregados durante la titulacin.

Cuando se ha titulado el cido con la


mitad de un equivalente de base, la
concentracin del cido actico no
disociado es exactamente igual a la
concentracin del anin acetato.
Curvas de titulacin del acido actico
Regin tampn: es la regin
de la curva donde existe una
mezcla en concentraciones
relativamente elevadas
del cido dbil y su base
conjugada.

Los amortiguadores (tambin


llamados disoluciones
amortiguadoras, sistemas
tampn o buffers) son
aquellas disoluciones cuya
concentracin de protones
apenas vara al aadir cidos
o bases fuertes.
Curva de titulacin del cido fosfrico
(H3PO4)
Glicina

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