DNA-RNA: Aspectos Generales del

Flujo de Informacin Gentica en

Bacterias
Microbiologa General
Departamento de Farmacia
 cidos Nucleicos
Dos tipos:
DNA
RNA
Molcula de la herencia
Clulas procariotas y eucariotas
DNA
Virus
DNAs, RNAs
Estructura del DNA

Lewins Genes VIII

Pentosas
Lewins Genes VIII
 Guanosina Adenosina Citidina Uridina
Nuclesido Deoxiguanosina Deoxiadenosina Deoxicitidina Deoxitimidina

Nucletido Guanilato Adelinato Citidilato Uridilato

Deoxiguanilato Deoxiadenilato Deoxicitidilato Deoxitimidilato

RNAs GMP AMP CMP TMP

GDP ADP CDP TDP
GTP ATP CTP TTP

DNAs dGMP dAMP dCMP dTMP

dGDP dADP dCDP dTDP
dGTP dATP dCTP dTTP
RNA vs DNA

ACGT
DNA: Desoxiribosa

RNA: ACGU
Ribosa
 Cromosoma de Escherichia coli

Cairns, J. The Bacterial Chromosome and its Prescott, Harley and Klein.
Manner of Replication As Seen By Microbiology. 7th Ed
Autoradiography. J. Mol. Biol., 1963, 6:
208-213
http://microbewiki.kenyon.edu/index.php/File:R._sphaeroides_circular_chromosomes.jpg

Cromosomas Mltiples en Bacterias

Rhodobacter sphaeroides
Dos cromosomas
Electroforesis de campo pulsado
Digestin enzimtica
 Otras Especies Bacterianas con Cromosomas
Mltiples

Brucella melitensis
B. suis biovar 1, B. suis biovar 2, B. suis
biovar 4, B. abortus and B. ovis
Paracoccus denitrificans
Especies de Vibrio
 Cromosomas Lineales

Especies
Borrelia burgdorferi
Streptomyces griseus
Agrobacterium tumefaciens
Cromosoma circular y cromosoma lineal
 Flujo de Informacin

DNA
Transcripcin reversa Transcripcin

RNAs
Traduccin

Protena
Otros RNAs
 Transcripcin
3 5
DNA 5 3

RNAs
3 5
5
3
5
(mRNA, tRNA, rRNA, otros)
 Nucleo
separado del
citoplasma

Procariotes Eucariotes
 Transcripcin
5 3
DNA
3 5

3 RNA polimerasa
(RNAP)

RNA Transcripto
primario
 RNA polimerasa (E. coli)

' '
+

Enzima central Subunidad sigma Holoenzima

 Gen

DNA Promotor

+1

Regin reguladora Regin codificante Terminador

RNA 5 3

Corriente arriba Corriente abajo

La secuencia de DNA que esta en sentido contrario se denomina corriente arriba

La secuencia de DNA que esta en el sentido de la transcripcin se denomina corriente abajo

 Promotor
Regin del DNA en la que se localizan las
secuencias a las que se une la RNA polimerasa
Purina en el sitio de iniciacin
Seis bases centradas en -10 con secuencia cercana
a TATAAT (T80A95T45A60A50T96)
Seis bases centradas en -35 con secuencia similar
a TTGACA (T82T84G78A65C54A45)
Secuencia espaciadora entre -35 y -10 (16-18 bp,
casualmente 15 o 20 bp)
 Promotor

TTGACA Espaciador (17pb) TATAAT

-60 -35 -10 +1

Elemento
UP

Secuencia de unin de la RNA pol

v Alta afinidad- promotores fuertes

v Baja afinidad- promotores dbiles
Elementos Localizacin Caractersticas

Pribnow box -10 TATAAT

Regin GC -35 TGACAG

Elementos UP -40 y -60 Unin

subunidades
Elementos de Corriente arriba y Unin de factores
respuesta corriente abajo de transcripcin
 Iniciacin de la Transcripcin

Formacin del complejo cerrado

RNA Polimerasa

~(-55 a +1)

Complejo abierto del promotor

~(-11 a +3)
 Complejo
~(-55 a +20)
ternario

Iniciacin abortiva Incorporacin de NTPs

sin que ocurra
desplazamiento de la
RNA polimerasa

RNAs ~20 nt
-55 +20

Complejo
ternario
Liberacin de sigma

-30 +20
 Elongacin

RNA 5 P-P-P- -OH 3

DNA 3 5

Extensin 5' a 3'

 Terminacin

1) Terminadores intrnsecos

2) Terminacin Rho dependiente

Lewins Genes IX
 Terminadores Intrnsecos
(Rho-Independiente)

DNA 5 GTCAAAAGCCTCCGGTCGGAGGCTTTTGACT
3 CAGTTTTCGGAGGCCAGCCTCCGAAAACTGA
Repeticin invertida Secuencia repetida
rica en CG de A
Terminacin Rho dependiente
 Organizacin de los Genes

En bacterias
Monocistrnico
Policistrnico
Se denomina opern opera como una misma unidad
Se produce una molcula de RNAm con la informacin para
sintetizar varias protenas
 DNA

RNA
(mRNA)
Traduccin
 Genes mRNA

DNA

1 1 2
mRNA

1 1 2

Monocistrnico Policistrnico
(Codifica 1 protena) (Codifica ms de 1 protena)
 Opern

DNA
1 2 3 mRN
A
1 2 3
 Primeros estudios en regulacin
Jacob y Monod, Francia - 1950s

E. coli

Jacob, Monod, Lwoff

Control de la Transcripcin en Bacterias

Operon lactosa (Operon lac)

 + Lactosa - Lactosa

Expresin de enzimas No hay enzimas

Utilizacin de lactosa No utiliza lactosa

Cmo se inducen los genes para la

utilizacin de lactosa?
 Opern lac

P lacI PO lacZ lacY lacA

DNA

RNA

Protena

Represor b-galactosidasa Permeasa Transacetilasa

 En Ausencia de Lactosa

P lacI PO lacZ lacY lacA

DNA
Pol

RNA

Protena
Represor

No hay expresin
 En Presencia de Lactosa

P lacI PO lacZ lacY lacA

DNA

Represor

Lactosa
 En Presencia de Lactosa

P lacI PO lacZ lacY lacA

DNA Pol

b-galactosidasa Permeasa Transacetilasa

Lactosa Si hay expresin

 Represin Catablica
Uso eficiente de fuentes de carbono - energa
Crecimiento una fuente de carbono (glucosa) - genera catabolitos represores

Niveles de cAMP
regulan expresin:
Crecimiento

Glucosa cAMP
Lactosa
Glucosa cAMP
Glucosa
Tiempo
 Represin Catablica
Uso eficiente de fuentes de carbono - energa
Crecimiento una fuente de carbono (glucosa) - genera catabolitos represores

Niveles de cAMP
regulan expresin:
Crecimiento

Glucosa cAMP
Lactosa
Glucosa cAMP
Glucosa
Tiempo
 Opern lac
Sitio de unin a CAP
P lacI PO lacZ lacY lacA
DNA

RNA

Protena

Represor b-galactosidasa Permeasa Transacetilasa

Modulacin de la Expresin de Genes por cAMP

Interaccin con otra protena: CAP

(protena activadora de catabolito)

cAMP se une a CAP

 Unin de CAP-cAMP al DNA

Sitio de unin a CAP

P lacI PO lacZ lacY lacA
DNA
 Unin de CAP-cAMP al DNA

Sitio de unin a CAP

P lacI PO lacZ lacY lacA
DNA

Unin eficiente de la RNA Pol

Activacin de transcripcin
 Unin de CAP-cAMP al DNA

Sitio de unin a CAP

P lacI PO lacZ lacY lacA
DNA

Unin eficiente de la RNAP

Activa transcripcin
Regulacin en dos niveles:
+ por cAMP-CAP
- por represor, induccin por lactosa
 Opern lac
Sitio de unin a CAP
P lacI PO lacZ lacY lacA
DNA

RNA

Protena

Represor b-galactosidasa Permeasa Transacetilasa

Interaccin con otra protena: CAP
(protena activadora de catabolito)

cAMP se une a CAP

 CAP-cAMP se une al DNA

Sitio de unin a CAP

P lacI PO lacZ lacY lacA
DNA
 CAP-cAMP se une al DNA

Sitio de unin a CAP

P lacI PO lacZ lacY lacA
DNA

Unin eficiente de la RNA Pol

Activacin de transcripcin
 CAP-cAMP se une al DNA

Sitio de unin a CAP

P lacI PO lacZ lacY lacA
DNA

Unin eficiente de la RNAP

Activa transcripcin
Regulacin en dos niveles:
+ por cAMP-CAP
- por represor, induccin por lactosa
Este es el opern que
codifica para todas
las protenas o enzimas
necesarias para la
sntesis de triptfano

Slo un RNAm que

codifica para todas
las protenas
Genes de tRNAs, rRNAs

Genes de
RNA
 En virus
DNA

1 2 3
5 3 mRNA

1 2 3
NH2 CO2

1 2 3
Factores Sigma

+ +

Gen X Gen Y
Factores Sigma Alternativos

Confieren
+ especificidad de
Factor sigma Enzima central reconocimiento
(core)

Respuestas
coordinadas
Gen X
Subunidades Alternativas
Esporulacin

Bacillus subitilis
 Fred Griffith

Prescott, Harley and Klein. Microbiology. 7th Ed

 O Avery, CM MacLeod, MJ McCarty

Prescott, Harley and Klein. Microbiology. 7th Ed