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El citoplasma
Alrededor del 80% del citoplasma es agua, el otro quinto es protena, lpido, cido nucleico, carbohidrato, iones
inorgnicos y otros compuestos de bajo peso molecular. El citoplasma es el medio para la actividad enzimtica y contiene
los ribosomas. Otras estructuras subcelulares que pueden estar presentes son los cuerpos de inclusin (grnulos de
almacenamiento hechos de compuestos tales como el poli-b-hidroxibutirato asociado a la membrana o polifosfato
citoplsmico), carboxisomas (sitios de fijacin de CO2) y magnetosomas. El magnetosoma se encuentra en las bacterias
magnetotcticas, como Magnetospirillum y se cree que jugar algn papel en la biomineralizacin.
Aunque las bacterias y Archaea carecen de organelos verdaderos, algunas especies han desarrollado configuraciones
membranous para ayudar a algunos procesos bioqumicos. Las cianobacterias, como Anabaena, llevan a cabo la
fotosntesis oxigenada en las membranas tilacoides, que estn revestidas con ficobilisomas. Las bacterias verdes de
azufre, como el Chlorobium, realizan la fotosntesis anoxignica en los clorosomas. A diferencia de las membranas
tilacoides, stas estn separadas de la membrana celular. Otro mtodo de fotosntesis anoxignica utiliza sistemas
esfricos o lamelares unidos a la membrana celular (por ejemplo, Bacterias prpuras tales como Rhodopseudomonas).
El principal inconveniente en el estudio de la estructura fina de procariotas es el mtodo utilizado para ver esos objetos
pequeos. La microscopa electrnica (EM) nos ha proporcionado muchos de los detalles dados aqu y en otros textos,
pero los mtodos speros usados para fijar y desarrollar las muestras son propensos a la generacin de artefactos. Un
ejemplo de esto es el mesosoma, una pequea vescula que se ve en muchas preparaciones EM, a menudo se ve en
ciernes desde la membrana celular. Es posible que stos tengan una de las funciones propuestas en la divisin celular,
sntesis de la pared celular o resolucin cromosmica, pero parece ms probable que los mesosomas se creen durante
el proceso de secado y fijacin EM.
Material genmico
El (los) cromosoma (s) bacteriano (s) se encuentran a menudo en un rea de la clula, normalmente cerca de la
membrana citoplasmtica (Seccin F2). Los cromosomas estn fuertemente superenrollados y estn asociados con
cromatina, protenas muy parecidas a las encontradas en eucariotas pero carentes de histonas bsicas. En cambio, se
piensa que la cromatina de Archaea es muy parecida a la de los microorganismos eucariotas. El material nuclear
apretadamente empaquetado se denomina nucleide en procariotas y se complementa con plsmidos que flotan libres
en el citoplasma.
El tamao de algunos plsmidos se aproxima al de los cromosomas y la distincin entre los dos es a veces esotrica. Sin
embargo, el complemento cromosmico de una clula procariota siempre es haploide y el nmero de copias del plsmido
(Seccin F11) suele ser ms de uno.
El periplasma
Las bacterias Gram-negativas tienen una segunda bicapa fosfolipdica (la membrana externa) que encierra la membrana
citoplasmtica. Se piensa que un periplasma, el espacio entre las membranas externa y citoplasmtica, es acuoso pero
tiene un contenido de agua mucho ms bajo que el citoplasma. Un examen del contenido total estimado de protena
sugiere que el periplasma puede incluso tener un estado similar al gel. Es el sitio de varias reacciones importantes,
tomando un papel importante en la generacin de ATP, deteccin ambiental, desnitrificacin y muchas otras vas
metablicas que interactan directamente con la cadena de transporte de electrones (Seccin E2). Se ha mantenido el
debate sobre la existencia de ambientes similares en las bacterias Gram-positivas, con sugerencias recientes de que
existe un estrato similar al gel fuera de la membrana celular Gram-positiva, pero no est limitado por otra membrana.
La pared celular
Las clulas procariotas son fuertes en comparacin con las clulas eucariotas individuales. La base de su fuerza
proviene de la pared celular, que est presente en todos los procariotas aparte de la bacteria Mycoplasma y el
termoplasma Archaeal. Las bacterias estn cubiertas en un compuesto semirigido llamado peptidoglicano (seccin C8)
en la mayora de los casos, con la excepcin de la clamidia. En estas bacterias la rigidez de la pared celular es
proporcionada por protenas de membrana ricas en cistena interconectadas con enlaces disulfuro. Las Archaea tienen
una variedad mucho mayor en la composicin de la pared externa, pero tienen un Ortholog bacteriano en pseudomurein.
Endosporas
Un pequeo nmero de gneros bacterianos, ms significativamente Clostridium y Bacillus, son capaces de formar
esporas dentro del citoplasma en respuesta a la inanicin celular. Estas endosporas han demostrado ser capaces de
sobrevivir a la desecacin durante siglos y su formacin se discute en detalle en la Seccin C9. La capacidad de las
endosporas para sobrevivir al calor, la radiacin y los desinfectantes qumicos unidos a la naturaleza patognica de
algunos miembros de Clostridium y Bacillus han conducido a los procedimientos de esterilizacin eficaces (Seccin C3)
desarrollados para la bacteriologa y la medicina.
Caractersticas externas
Todos los procariontes secretan una cubierta de polisacridos o polipptidos a veces conocidos como la cpsula del limo
(Figura 3). El tamao real y la composicin de este glicoclisis varan con el estado metablico del organismo. En
muchos patgenos es la primera lnea de defensa contra el reconocimiento del anfitrin. La cpsula de limo tambin
puede ayudar a la clula a resistir el secado y ayuda en la unin de clulas. La interaccin del glicoclix con otras
bacterias de la misma o de diferentes especies ayuda a formar biofilms tales como la placa en los dientes y los filamentos
bacterianos a veces vistos en ambientes acuticos. Una estructura ms ordenada tambin est presente en algunas
bacterias y arqueas. Una capa S de glicoprotena cristalina puede formar una malla que rodea a la clula y se ha ligado a
la unin, la formacin de biofilm y la repulsin de las defensas del husped.
La motilidad bacteriana es a menudo proporcionada por la rotacin de flagelos, largos filamentos que se extienden fuera
del glicoclisis. Estas son estructuras muy complejas, cuya composicin y papel en la quimiotaxis se discuten ms
adelante en la Seccin C10. Despus de una tincin adecuada, stas a menudo parecen ser la caracterstica dominante
de clulas tales como las de Salmonella (Figura 3).
Prokaryotes tambin se recubren con otros apndices finos
del pelo-como que se clasifican generalmente como fimbriae.
Existen actualmente siete tipos diferentes conocidos,
identificados en base a su composicin proteica, longitud y
dimetro. A menudo se ven como filamentos rotos que rodean
a la clula en micrografas electrnicas, lo que sugiere que
son frgiles y dispensables. Algunos son factores de
patogenicidad, pero se cree que la mayora funciona en el
apego. Ms finas an son las fibrillas que recubren la
superficie de bacterias como Streptococcus.
Las limitaciones del microscopio electrnico hacen difcil decir
si estas son
Un tipo separado de capa peluda o un artefacto del secado
del glicoclice. Las estructuras filamentosas ms grandes
fuera de la clula son el pili sexual generado por las bacterias F + antes de la transduccin (Seccin F8).
SISTEMATICA PROCARIOTA
Clasificacin y taxonoma La identificacin es la colocacin de nuevos aislamientos en el marco
La clasificacin es un mtodo de organizacin de la informacin. Los taxonmico, normalmente al nivel de gnero y especie. Sin embargo,
microorganismos pueden clasificarse en sus propiedades de la definicin de especie es todava menos clara en los procariotas que
crecimiento (por ejemplo quimiolitotrfico, denitrifier), pero se clasifican en los eucariotas superiores.
formalmente usando el sistema de Linnaean. La clasificacin completa Filogenia de procariotas
de un microorganismo es su taxonoma. Los microorganismos pueden La relacin evolutiva entre un microorganismo y entre taxones es su
ser identificados nicamente por el uso de sus nombres de gnero y filogenia. La dependencia de las secuencias de ADN para elucidar
especie. estas relaciones ha llevado a la aparicin de la filogentica. La
Identificacin de procariotas taxonoma de las bacterias y arqueas refleja en su mayor parte su
filogenia
Clasificacin y taxonoma
Con la llegada de los mtodos moleculares, la distincin entre identificacin, clasificacin y relaciones evolutivas se ha
desdibujado. En bacteriologa, una clasificacin es simplemente un mtodo de organizar la informacin. Esta
organizacin puede tener un significado subyacente, o ningn significado en absoluto. Podemos optar por clasificar las
bacterias en el color de sus colonias cuando se crecen en placas de agar, una clasificacin que dara prominencia a las
pocas bacterias de color amarillo y rojo, mientras que la mayora se clasificara en un grupo de blanco a crema formas de
colonias. En la microbiologa temprana, los organismos se clasificaron de acuerdo con su forma, con la forma de bacilo
(ahora tambin llamada una varilla) que forma el grupo ms grande, y cocci, filamentos, y as sucesivamente los ms
pequeos. Es importante subrayar que las clasificaciones eran arbitrarias; Sin embargo, todava tienen un uso hoy. Los
microbilogos clasifican los organismos segn sus propiedades de crecimiento (anaerobios, quimiolitotrficos,
metilotrficos, etc., Secciones C2 y D1).
El principal medio de clasificacin en microbiologa,
al igual que el resto de la biologa, es el sistema de
Linnaean. Se trata de un sistema jerrquico, con
divisiones principales secuencialmente separadas
hasta las especies de nivel ms bajo (Figura 1).
Una clasificacin completa de Escherichia coli es Prokaryota (dominio), Bacteria (reino), Proteobacteria (phylum), l-
proteobacteria (clase), Enterobacteriales (orden), Enterobacteriaceae (familia), Escherichia (gnero) y coli (especie).
Cada uno de estos niveles se describe como un taxn (taxa plural). Este sistema de clasificacin permite a los bilogos
una identificacin nica en todos los dominios y reinos nicamente usando el gnero y la especie apropiados.
El nombre completo de E. coli es su taxonoma, y el sistema de Linnaean es una clasificacin taxonmica.
En este texto se usan los nombres de dominio y reino correctos para denotar tanto a las Archaea como a las Bacterias
(procariotas). Un poco ms viejos sistemas dan nombres del reino como Eubacteria (bacterias verdaderas) y
Archaeabacteria, que de muchas maneras es ligeramente ms descriptivo.
Identificacin de procariotas
Con una taxonoma para los procariotas en su lugar, el microbilogo ahora puede comenzar a colocar organismos dentro
de este marco, usando la taxonoma para describir e identificar especies.
Cuando se purifica por primera vez, se describe un organismo como un aislado y generalmente se le da un nmero que
ayuda a distinguirlo de otros en el laboratorio. Los aislados pueden ser genticamente idnticos, pero han sido tomados
de sus ambientes naturales en pocas separadas o localizaciones geogrficas.
Normalmente no es controvertido colocar una nueva bacteria en un gnero apropiado, por lo que este aislado puede
llegar a ser, por ejemplo, la cepa NCIMB 8944 de Paracoccus. El concepto de especie es ms difcil de aplicar a las
bacterias y Archaea que en el reino animal debido a la enorme Diversidad, por lo que la definicin de subespecie de
biovar se aplica a veces a organismos de la misma especie con propiedades ligeramente diferentes; Por ejemplo, el
organismo de peste, Yersinia pestis, se divide en biovares, incluyendo Orientalis y Mediaevalis. Las diferencias entre
cepas de la misma especie a veces se definen por subespecies, por ejemplo, el patgeno de la planta Pectobacterium
carotovorum tiene subespecies incluyendo atroseptica y carotovorum. En este caso la subespecie define miembros de la
misma especie que causan patologas vegetales diferentes. En la investigacin microbiolgica, el problema de la
definicin de la especie significa que siempre es mejor dejar el cdigo del aislamiento original en su lugar al escribir sobre
un organismo, de modo que su historia en varios laboratorios puede ser rastreada.
Aunque la definicin de los taxones bacterianos y arcaicos individuales hasta el nivel del gnero ha ganado consenso
entre los microbilogos, todava no hay acuerdo sobre lo que constituye la unidad fundamental de la diversidad biolgica,
la especie. La definicin de especies en un gnero (por ejemplo, compartiendo menos de un cierto porcentaje de
homologa de ADN) no necesariamente es vlida en otro, un problema particularmente cierto en taxones dominados por
patgenos humanos (Seccin B2). Si no podemos definir de manera adecuada y consistente una especie, entonces la
identificacin hasta el nivel de la especie se vuelve problemtica. Los mtodos utilizados para la identificacin procariota,
que es la forma en que asignamos una clasificacin a nuestro nuevo aislado, se exploran ms en la Seccin B2.
Filogenia de procariotas
La filogenia es una descripcin de las relaciones evolutivas entre y entre taxones.
En la microbiologa hay una fuerte dependencia de la secuencia de ADN en lugar de la morfologa (como se ve en las
plantas y los animales) como datos para la filogenia y por lo tanto se refiere normalmente como filogentica. La
clasificacin de Bacteria y Archaea en su mayor parte refleja su filogenia tal como la entendemos actualmente. Hay, por
supuesto, siempre espacio para el debate en cualquier sistema y un discurso animado contina sobre la posicin
filogentica o taxonmica exacta de muchas especies o gneros.
DIVISIN CELULAR
Fisin binaria endosporas. Al comienzo del desarrollo de las esporas, el ADN se
La capacidad de muchos procariotas para duplicar aproximadamente mueve hacia el eje central de la clula y se convierte en fuertemente
en biomasa, antes de dividir, significa que es fcil modelar el en espiral, que es seguido rpidamente por la separacin del ADN y la
crecimiento matemticamente. Las cuatro etapas de la fisin binaria formacin de protoplastos. La clula madre envuelve el protoplasto
Se caracterizan por: crecimiento y replicacin; FtsK construccin del para hacer una sntesis de forespore y capa comienza. Una corteza
anillo y separacin cromosmica; Constriccin y septacin del anillo primordial se forma mientras el citoplasma de la clula madre se
FtsK; Y separacin celular. La divisin celular debe ir acompaada de deshidrata cada vez ms. La sntesis de la corteza y la capa de
la eficiente dispersin de al menos dos genomas completos entre las esporas se completa y la espora madura se hace cada vez ms
clulas madre y las clulas hijas, que se logra mediante la replicacin resistente al calor, los productos qumicos y la radiacin. Finalmente la
y la recombinacin especfica del sitio. espora se libera, ya que lo que queda de la clula madre sufre
Esporulacin autolisis. Cuando la espora alcanza un ambiente adecuado, el proceso
Las bacterias Gram-positivas, como Bacillus subtilis, se diferencian se invierte con la activacin de la espora seguido de germinacin slo
para formar clulas en reposo dentro del citoplasma conocido como unos minutos ms tarde.
Fisin binaria
La mayora de las bacterias y las clulas de Archaea acumulan la biomasa hasta que se alcanza un volumen crtico
cuando se dividen en dos clulas hijas idnticas. Esta divisin se produce en un solo plano de simetra. Hasta cierto
punto, la divisin dicta la simplicidad en la forma de las clulas (Seccin C2) y la prevalencia de nmeros de clulas de
2n cuando las clulas aparecen en cadenas o grupos. El enlace de la fisin binaria con los clculos de crecimiento
celular se discute en la seccin D1. El proceso de divisin celular se describe en la Figura 1 y se puede dividir en cuatro
etapas: crecimiento y replicacin; FtsK construccin del anillo y separacin cromosmica; Constriccin y septacin del
anillo FtsK; Y finalmente la separacin celular. El proceso es poco conocido, implicando muchas protenas y un sistema
de control extremadamente eficiente. Un papel central es desempeado por FtsK, un anlogo estructural y funcional de
las tubulinas eucariticas. FtsK recibi el nombre de los mutantes filamentosos sensibles a la temperatura que se
reconocieron por primera vez en E. coli. A algunas temperaturas, los mutantes no pudieron formar tabiques y se
convirtieron en largos filamentos multinucleados, un fenmeno observado en algunos lactobacilos de tipo salvaje y en
Streptomyces.
Durante el proceso de replicacin cromosmica, los monmeros FtsK
comienzan a moverse a un punto a medio camino entre los dos extremos de
la clula. No est claro cmo sucede esto, pero se han identificado
inhibidores (las protenas MinC, D y E) en los polos que impiden el inicio de
la separacin no deseada. Las protenas FtsK forman un anillo y es cierto
que en este punto se reclutan otras protenas a la localidad para tratar con
los eventos de recombinacin especficos del sitio (Seccin F9) que deben
tener lugar para permitir la separacin de los dos cromosomas replicados.
La formacin de un tabique comienza con la constriccin del anillo FtsK a
travs del ancho de la clula y el septo forma completamente, de modo que
la clula hija se convierte en separada (Figura 1). Hay indudablemente
muchos otros mecanismos que gobiernan el acto de divisin celular, ya que
todo el contenido de la clula, incluyendo ribosomas, protenas, lpidos,
membrana celular, pared celular y cualquier material extra-cromosmico
tambin debe dividirse entre las dos clulas, como Ambas clulas hijas son
inmediatamente y completamente funcionales. Es notable que este proceso
se repita cada 40 minutos por E. coli. La universalidad de FtsK-como
protenas a travs de las bacterias y Archaea sugiere que este es un
evolutivamente conservado, mecanismo fundamental para la vida unicelular.
Esporulacin
La formacin de endosporas es un mecanismo de
supervivencia practicado por los gneros Bacterianos Gram-
positivos (Seccin C8), el mejor estudiado de los cuales es
Bacillus subtilis. Puede considerarse como un caso
especializado de divisin celular, siendo algunos de los
mecanismos similares y realizados por ortlogos de protenas
(por ejemplo, la protena de esporulacin SpoIIIE es muy
similar a FtsK). La espora y la clula vegetativa tienen
propiedades muy diferentes, esbozadas en la Tabla 1.