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Rappels nomenclature :
-nom scientifique : famille ou genre : majuscule + italique ou soulign, pour une espce : minuscules + italique ou soulign
-nom usuel : sans majuscule et pas en italique.
Introduction :
Cest un des groupes les plus rencontrs en pathologie infectieuse. Ces bactries sont responsables de nombreuses
maladies : - bnignes : infections urinaires, diarrhes, infections de plaies
- graves : peste, fivres typhodes
Le nom dentrobactries leur a t donn parce que ces bactries sont en gnral rencontres dans le tube digestif de
lhomme ou des animaux (htes normaux ou pathologiques).
1/ GENERALITES
1-1 Dfinition
La famille des Enterobacteriaceae regroupe les bactries correspondant la dfinition suivante :
NE Nit 1
- Bacilles Nit 2
- Gram ngatif
- Oxydase ngative
- Non exigeant ou
- Fermentatif du glucose (et oxydatif) GO
- Nitrate rductase + stade NO2-
- Aro-anarobie facultatif
VF HL + gl BN
Remarque : on prendra garde quune dfinition aussi prcise puisse supporter quelques exceptions. En effet, de
rares espces peuvent tre : immobiles (certains Escherichia coli), NR (certaines souches dErwinia) et mme oxydase
+ ! (il a t rcemment dmontr que le genre Pleisiomonas appartient la famille des Enterobactriaceae)
1-2 Classification
La famille des ENTEROBACTERIACEAE comprend plus de 130 espces rpertories. Les espces les plus isoles en
bactriologie clinique reprsentent une vingtaine despces et appartiennent aux genres suivants :
- groupe PMP = Proteus, Morganella, Providencia
- groupe KESH = Klebsiella, Enterobacter, Serratia, Hafnia
- groupe SCE = Salmonella, Citrobacter, Edwarsiella
- groupe SE = Shigella, Echerichia
- groupe Yersinia.
Les principales espces connatre sont incluses dans le tableau simplifi didentification.
2/ CARACTERES BACTERIOLOGIQUES
2-1 Morphologie :
Gram : bacilles droits de taille moyenne avec polymorphisme possible et formes bipolaires
Capsule : certaines Klebsiella peuvent tre capsules (colo de type M) (mais aussi chez certains E.coli, Salmonelle,
Citrobacter).
Etat-frais : ciliature pritriche pour beaucoup dentrobactries, quelques unes sont immobiles : Klebsiella, Shigella,
Yersinia.
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2-2 Caractres culturaux
2-2.1 Conditions de culture
Les entrobactries se dveloppent rapidement en 24 heures (G= 20 40 mn) sur milieu ordinaire : elles sont non
exigeantes. Temprature optimale de croissance : 37C, plage de culture allant de 20 40C
2-4-2 LAntigne O
Comme les autres bactries gram - , la paroi des Entrobactries est recouverte d'une membrane externe. Le
feuillet externe comporte une molcule appele LPS = Lipopolysaccharide.
2-4-3 Ag capsulaires
Certaines souches possdent en plus une enveloppe polyosidique constituant une vritable capsule et donnant un aspect
muqueux (colonies M : ex Klebsiella pneumoniae, certains E.coli). Ces souches prsentent un Ag K qui masquent l'Ag O
(on le dtruit par chauffage 1 heure 60 C avant de rechercher l'Ag O).
Certaines Salmonella ( Typhi, Paratyphi C, rares Dublin ) et Citrobacter possdent des Ag de surface (Vi = Antigne de
microcapsule) polyosidiques de mme nature que les Ag K.
2-4-4 Ag flagellaires H
Il existe des souches de Salmonella et d'autres Entrobactries ( mobiles ! ) possdant un Ag H flagellaire qui est
polypeptidique. Il est souvent diphasique (2 gnes diffrents codent pour deux types de flagellines mais leur contrle
gntique fait que l'expression du gne est, pour un individu unique soit de phase 1, soit de phase 2, jamais les deux la
fois, mais dans la culture les deux types peuvent cohabiter).
2-4-5 Ag dadhrence : Ce sont les pili communs appels adhsines (ou fimbriae) de nature protique
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Microscopie des entrobactries
Polymorphisme des
Entrobactries :
colonies de type S
(rondes, lisses)
Exceptions : Exceptions :
Cas particuliers :
Cas particuliers :
Colonies pigmentes en rose/rouge
Envahissement de la glose (Proteus) pour les Yersinia
3
3
Ag H
Ag O
Les principaux antignes
des bacilles Gram - Ag K ou Vi
Organisationbiochimiqu Membrane
e de la paroi des externe
bactries Gram -
Peptidoglycane
Espace pri-
plasmique
Membrane
plasmique
Composition
du LPS :
Ag O
Ag O
Core Ag O
Core
Core
Lipide A
Lipide A
Lipide A
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3/ HABITAT/POUVOIR PATHOGENE
Les entrobactries sont trs rpandues : elles peuvent tre saprophytes, commensales ou pathognes.
3.1 Saprophytisme
La plupart des entrobactries vivent et se multiplient aussi bien chez un hte que dans lenvironnement. Les
entrobactries saprophytes sont prsentes dans le sol, les eaux et sur les vgtaux en particulier les milieux humides.
3.2 Commensalisme
Certaines espces vivent aussi bien en saprophytes quen commensales dans lintestin (do leur nom), cest le cas par
exemple de Proteus, Enterobacter, Echerichia coli. La prsence de ce dernier dans lenvironnement traduit une souillure
par les matires fcales humaines ou animales (E. coli ne survit pas longtemps dans lenvironnement).
Espces pathognes chez lhomme : On distingue les entrobactries pathognes strictes ( BPS) et les pathognes
opportunistes ( BPO), bien que la limite entre les deux dfinitions soit des fois un peu floue.
BPS : Dfinition : bactrie qui au contact de lhte normal va dclencher gnralement la maladie qui est spcifique
du germe.
- certaines entrobactries pathognes strictes sont responsables dinfections intestinales :
o Shigella
o Salmonella
o Yersinia enterocolitica
o Certains srovars dEcherichia coli
BPO : Dfinition : Ce sont des entrobactries commensales ou saprophytes qui ne dveloppent dinfection que chez
les sujets fragiliss. Elles peuvent engendrer des infections diverses : urinaires, respiratoires, abdominales
(pritonites), septicmies, mningites etc voire des chocs anaphylactiques (dus aux endotoxines = LPS).
a) Syndromes digestifs
Bactries agissant par la production d'une toxine cytotonique (toxine scrtoire : Ex Cholra)
Seule la toxine provoque des troubles, tandis que la bactrie reste localise dans la lumire intestinale. Les diffrentes
tapes sont :
1- Fixation de la bactrie sur les entrocytes
2- scrtion de la toxine dans la lumire intestinale et fixation de la toxine sur les entrocytes
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3- Pntration dune partie de la toxine dans le cytoplasme de lenterocyte, la bactrie reste lextrieur
4- Effet cytopathogne de la toxine : elle provoque une augmentation de la scrtion de NaCl puis deau et
inhibe leur rabsorption
Les signes cliniques sont donc une diarrhe aigu liquide, accompagne dune dshydratation importante avec perte
dlectrolytes.
Ces toxines provoquent les lsions cellulaires. Il en existe videmment de divers types :
- des toxines de type perforine (comme la Streptolysine O ) ou des phospholipases (lcithinases) agissant sur la
membrane plasmique ou les membranes internes.
- des toxines interfrant avec le mtabolisme (inihibition de la synthse des protines par ex.) comme les toxines
Shigella-like ou vrotoxines
- des toxines provoquant des modification du cytosquelette et pouvant provoquer ainsi un relchement des jonctions
serres, puis le dtachement des entrocytes et la diarrhe.
Tissu Pouvoir
Bactries
pouvoir dissminant
pouvoir dissminant
: capacit : capacit envahir
...conjonctif dissmin
au-del des tissus locaux
ant
Quelques exemples : Vaisseaux sanguins
Bactries agissant par la scrtion de toxines cytotoniques : souches dites entrotoxiques ou toxinognes :
Vibrio cholerae, ETEC = E. coli entrotoxinogne (=turista)
Bactries agissant par la scrtion de cytotoxines : souches invasives en gnral : Shigella, EIEC = E. coli
entroinvasif, Yersinia enterocolitica, EPEC (E.coli entreopathogne multiplication extracellulaire)
Bactries fort pouvoir dissminant : Salmonella Typhi et Paratyphi
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Les EPEC (Escherichia coli entero-pathognes) restent
localiss lextrieur des entrocytes. Ils saccrochent
Les Shigella pntrent dans les entrocytes et sy fortement aux microvillosits et scrtent des toxines qui
multiplient activement. Elles peuvent ensuite envahir induisent leur destruction, engendrant alors une gastroentrite
les tissus voisins et engendrer un syndrome .
dysentrique.
Les Salmonella sont capables de dissminer dans la circulation sanguine,
engendrant une fivre septicmique.
b) Syndromes urinaires
Fixation des UPEC sur les cellules pithliales de larbre urinaire :
E. coli est le pathogne le plus important au niveau du tractus urinaire. Il s'agit de
certains srovars O trs particuliers qui sont en cause, les UPEC = E. coli
uropathogne. Ils gagnent le rein par la voie ascendante en remontant l'urtre.
Ce sont probablement des htes normaux de la flore commensale de l'individu qui
sont en cause. Il existe trs certainement une sensibilit individuelle particulire.
D'autres bactries sont mises en cause dans ces infections du tractus urinaire,
souvent la suite de manipulations de type sondage chez des patients malades (on
parle dinfection nosocomiale).
c) La peste
C'est Yersinia pestis qui est la cause de la peste, maladie redoutable et toujours possible car de nombreux foyers persistent
dans le Monde, en particulier Madagascar ou aux USA.
Yersin isola la bactrie de cadavres de pesteux en 1894 et Simond mis en vidence le rle de la puce comme vecteur. Le
rle de rservoir des rats paraissait vident par la mortalit affectant ces animaux avant l'pidmie humaine.
Trois grandes pandmies durant l'histoire :
peste de Justinien au 6 sicle
peste noire de 1347 1352 (et persistance en Europe jusqu'en 1845) qui a dcim les populations europenne de
faon massive (entre 33 et 50 % des habitants).
Honk Kong 1894 o Yersin isola la bactrie et l'tudia. Bubons l'aine d'une personne
atteinte de la peste bubonique
La maladie prsente deux aspects possibles :
la peste bubonique : les bacilles sont injects ou dposs par une puce
vectrice. Ils se multiplient sans bruit durant un sept jours puis la maladie se
dclare de faon foudroyante, avec une forte fivre, des vomissements. On
observe un bubon, gros ganglion lymphatique de la zone de la piqre.
L'infection se gnralise par septicmie trs rapidement. Mortalit 70 % en
absence de traitement.
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la peste pulmonaire, cause par une contamination par voie arienne dclenchant une pneumonie mortelle en
absence de traitement en moins de 4 jours et qui est trs contagieuse.
La puce (Xenopsylla cheopis) s'infecte en aspirant le sang d'un rat ou d'un homme atteint
de peste. Le bacille (Yersinia pestis) se multiplie dans son estomac au point de bloquer le
tube digestif. Il est alors soit rgurgit lors d'une piqure, soit pass dans les djections qui
peuvent contaminer ensuite une lsion de grattage.
4/ IDENTIFICATION
4.1 Isolement
Non slectif : Les Entrobactries cultivent sur tous les milieux ordinaires en arobiose et anarobiose :
- milieux usuels : GO, GTS
- avec indicateur dorientation : CLED, BCP
- ainsi que sur milieux enrichis : Glose au sang, Glose chocolat enrichie...
Slectif dun groupe particulier (en fait, assurant une meilleure discrimination) :
- Salmonella et Shigella : des milieux facilitent leur recherche : on utilisera par exemple le milieu SS
(Salmonella Shigella) ou Hektoen
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On ne peut en aucun cas affirmer que les milieux utiliss "favorisent" les Salmonella : tous les bacilles gram - risquent d'y
cultiver (sauf cas particuliers) mais peuvent donner des aspects diffrents de celui des Salmonella ou Shigella. Le cas du
milieu Hektoen est particulirement intressant : il a t invent pour liminer les Proteus vulgaris saccharose + de
l'analyse ultrieure mais les Pseudomonas y cultivent trs bien (donnant des colonies vertes ou bleues) comme les E. coli
(donnant des colonies limines puisque saumon).
Remarque : de nouveaux milieux dorientation rapide ont fait leur apparition, ce sont les milieux aux substrats
chromognes: ASAP pour Salmonella, SALSA pour Salmonella/Shigella. CPSID pour les E.Coli
- Yersinia : on utilise le milieu CIN = Cefsulodine, Irgasan, Novobiocine qui doit tre incub 30C.
Galerie conseille :
5/ TRAITEMENT ET ANTIBIOGRAMME
Le traitement des diarrhes est souvent symptomatique : la diarrhe est avant tout un moyen de dfense de l'individu qui
limine ainsi le pathogne. Le grand danger est la dshydratation qui doit tre compense par eau et lectrolytes. En cas
de fivre et d'invasion, l'antibiothrapie sera trs srement ncessaire.
Les Gram - sont constamment rsistants la pnicilline G qui ne peut pas pntrer (ne franchie pas les porines)
Mais ils sont le plus souvent sensibles l'ampicilline, molcule rsultant d'une modification simple de la pnicilline G.
C'est chez les Entrobactries que les transferts de plasmides porteurs de la rsistance de multiples antibiotiques ont t
mis en vidence. La dcouverte au Japon de Shigella multirsistantes chez un malade a conduit les chercheurs trouver
des E. coli commensaux qui avaient les mmes rsistances : ils ont pu ainsi montrer que la bactrie commensale avait
transmis la pathogne les gnes de rsistance par l'intermdiaire d'un plasmide.
6/ PROPHYLAXIE
- La lutte contre les maladies d'origine digestive met en jeu la lutte contre le pril fcal (lire article)
- Un vaccin, constitu de l'antigne polyosidique Vi purifi, est utilisable pour Salmonella Typhi.. Un vaccin
vivant est parfois utilis dans les pays tropicaux pour la mme bactrie.
- La lutte contre la peste c'est d'abord la lutte contre le rat donc une amlioration des conditions d'hygine.