1. Gen: segmento de DNA que codifica la secuencia primaria de un producto final
que puede ser una protena o RNA. Ese DNA tiene otros segmentos o secuencias que tienen funciones reguladoras, estas secuencias reguladoras van a actuar como seales que me permiten identificar el principio y el final de un gen, es decir me van a dar el inicio y el fin de la replicacin. Y el material gentico de un organismo forma el genoma. Prcticamente todas las clulas de un organismo pluricelular, contienen el mismo material gentico.
Si nos fijamos en las clulas eucariotas, el material gentico est distribuido en
unidades llamadas cromosomas, cada uno de los cromosomas de la clula tiene una molcula de DNA, que se va a corresponder con un conjunto caracterstico de genes. Se dice que el organismo es diploide cuando contienen dos juegos completos de cromosomas, agrupados por parejas, y al nmero de cromosomas de ese conjunto genmico bsico se le llama nmero haploide. En el caso de las procariotas, tambin tienen una cantidad de DNA por clula elevado. A excepcin de que en procariotas casi siempre el cromosoma tiene una copia de cada gen, y que junto con las secuencias reguladoras de sus genes ocupan gran parte de sus DNA. En procariotas su genoma suele estar formado por 1 DNA circular. Algunos procariotas, sobre todo las bacterias, su DNA no est unido a unas protenas llamadas histonas, aunque forman complejos con protenas no histnicas. El DNA de la bacteria aparece como una acumulacin llamada nucleoide que ocupa una regin determinada en el citoplasma. Dentro de las eucariotas hay unas zonas que se transcriben (exones) y otras que no (intrones) 2. Los genomas y su variabilidad: el cromosoma bacteriano es una molcula dinmica, lo cual se refleja con la necesidad de acceder a la informacin gentica, y adems sus ciclo celular va a ser mas corto que el de las clulas eucariotas. Muchos de sus genes se localizan en ese genoma que se expresa como una unidad. Es decir van a estar funcionalmente relacionados, formando
un opern. Los mas conocidos son el de la lactosa y el triptfano. Centrndonos
en la e-coli vemos que la lactosa es la nica fuente de carbono, que gracias a la enzima galactosidasa, se hidroliza en galactosa y en glucosa. Junto a esta enzima se sintetiza la enzima galactosido permeasa, necesaria para transportar la lactosa a travs de la mb, tambin se va a transcribir la enzima tiogalactsido transacetilasa, que es necesaria para que la bacteria crezca en medios donde existan anlogos metablicos de los galactsidos. Cuando no existe lactosa en el medio, aparece un represor que impide la transcripcin de estos tres genes, en presencia de un inductor, los tres genes se transcriben y se traducen. -Genomas virales: los virus presentan 4 tipos de cidos nucleicos, un DNA monocatenario, DNA bicatenario, un RNA monocatenario y un RNA bicatenario. El material gentico vara mucho: hay genomas muy pequeos, mas grandes, estos ahorran espacio utilizando genes solapados. Al centrarnos en virus con RNA como material gentico, en concreto RNA monocatenario, se observa que a veces ese RNA, es idntico al RNA mensajero del virus. En ese caso a esa cadena de RNA se la llama cadena positiva, pero tambin puede ocurrir que ese RNA viral sea complementario al RNA mensajero, en ese caso se le llama cadena negativa. Los virus con RNA bicatenario, en general infectan a plantas, hongos y alguna bacteria. Como resumen: el genoma viral contiene pocos genes codificantes. -Viroides y priones: el viroide es una molcula pequea circular de RNA, de cadena sencilla no codificante y que tiene apareamientos intracatenarios para estabilizarse. Son patgenos y se replican dependiendo de la maquinaria de la clula husped. El prin es una partcula infecciosa de naturaleza proteica asociada a enfermedades que se presentan en el hombre, como las encefalopatas. Estos priones tienen un largo periodo de incubacin y no provocan respuesta inmune en el husped conduciendo siempre a enfermedades fatales. Su nico componente es el gen PRP que deriva de una protena normal que se encuentra en muchos eucariotas. 3. DNA de las mitocondrias
En los eucariotas se observa que el DNA codifica protenas esenciales para su
funcionamiento. Como por ejemplo los RNA ribosmicos y los RNA transferentes. Se
localiza en la matriz mitocondrial, que en la mayora de los organismos se replica en
la interfase. En el proceso de mitosis la clula hija recibe aproximadamente el mismo nmero de mitocondrias, es decir la cantidad total de DNA mitocondrial en una clula depende del nmero de mitocondrias. Las mitocondrias presentan una herencia citoplasmtica, por ese han de contener su propio sistema gentico. Adems se ha visto que en los mamferos, el espermatozoide contribuye con poco citoplasma al cigoto. Por lo tanto casi todas las mitocondrias de el embrin derivan del vulo, es decir el DNA mitocondrial es una herencia materna. Tenemos que tener en cuenta que la mayora de las protenas localizadas en la mitocondria como RNA-DNA polimerasa van a ser sintetizadas en orgnulos citoslicos, y tienen que ser transportadas al interior de la mitocondria. El DNA mitocondrial es una molcula circular, que codifica 22 RNAt y 2 RNAr que se utilizan para traducir el RNAm mitocondrial. 4. Estructura de los cromosamas de los procariotas. Cromosoma: molcula de cido nucleico que contiene la informacin gentica de la clula eucariota, los cromosomas en eucariotas est formado por molculas de DNA y protenas, a ese complejo le llaman cromatina, y la parte proteica esta formada principalmente por protenas histonas, que hay cinco tipos: H1, H2A, H2B, H3 y las histonas son protenas con elevada proporcin de aminocidos cargados positivamente (Arg y Lys). Estas protenas histonas son muy conservadoras, constantes en su evolucin. Tambin se localizan protenas no histnicas como las del ensamblaje del cromosoma. La cromatina: tiene una estructura muy compleja, con varios niveles de organizacin. El mas sencillo es la estructura de doble hlice de DNA, despus en el segundo nivel ese DNA forma complejos con las histonas, dando lugar al nucleosoma. El tercer nivel es cuando el nucleosoma se pliega y forma el solenoide; el cual est formado por 6 o 7 nucleosomas por vuelta, y forma una fibra de unos 30 nm. El cuarto nivel es cuando se forman bucles con una longitud promedio de unos 300 nm, el siguiente nivel es cuando se produce un enrollamiento denso de esas fibras anteriores para constituir la cromtida de un cromosoma. Por ltimo, dos cromtidas forman un cromosoma. 5. DNA en el ncleo eucaritico Sabemos que el cromosoma eucarotico tiene diferentes estados en su ciclo celular. Se dice que el ciclo celular son todas las actividades celulares de crecimiento y divisin. El tiempo necesario para completar un ciclo celular se llama tiempo de generacin. Si nos centramos en la vida de la clula, se puede decir que esta pasa la mayora de su vida en interfase, etapa entre dos divisiones. En este periodo la clula est muy activa, ya que sintetiza y crece. Esa fase se divide en 3: -
Fase G1: en esta etapa la clula crece, es decir se intensifica su actividad
metabsica y bioqumica. Fase s: El DNA se duplica Fase G2 se llevan a cabo los ltimos preparativos para la divisin celular, es decir estos cromosomas, que se encuentran dispersos como filamentos de cromatina, empiezan a enrollarse y a condersarse. En esta fase la clula duplica aproximadamente su tamao. Mitosis o Fase M: en esta fase la envoltura nuclear se rompe, los cromosomas se van a mover hacia los polos opuestos de la clula de forma que cada conjunto de cromosomas hijos se rodea por una nueva envoltura nuclear. Despues de la mitosis entra en el estado G1, pudiendo dividirse otra vez o cesar su divisin (fase G0 o fase de latencia)
La estructura del cromosoma cambia mucho, de manera que algunas regiones se
descondensan mas que otras, sobre todo las regiones que se estn transcribiendo. Vamos a centrarnos en los patrones de bandas que presentan los cromosomas mitticos. Existen distintos colorantes que tien selectivamente algunas regiones de los cromosomas, produciendo patrones caractersticos que son especficos de cada cromosoma. Dentro de esos patrones de banda se diferencian: -Bandas G: se producen cuando someto al cromosoma a calor suave o a protelisis, y se les tie con giemsa. Estas bandas tienen un contenido muy bajo en guanina y citosina. - Bandas R: su patrn es inverso a lo obtenido en las bandas G. Para eso al cromosoma lo trato con una solucin bsica o alcalina, que est caliente, antes de teirlos con reactivo de giemsa. Tienen un alto contenido en guanina y citosina. -Bandas C: se corresponden con las zonas de DNA ocupadas por la cromatina centromrica. -Bandas Q: Aparecen cuando se tie a los cromosomas con mostaza de quinacrina, y se les observa con luz ultra violeta. En los cromosomas eucariotas existen varios puntos de origen de replicacin. Aquellos puntos donde la DNA polimerasa inicia la sntesis de DNA. El motivo de que haya muchos orgenes de replicacin, es que asi se asegura que la totalidad de cromosoma se replique rpidamente. El centrmero del cromosoma consiste en una secuencia de DNA que actua como puente de unin de las protenas que se van a fijar al cromosoma y a el tambin se van a fijar los microtbulos durante la divisin celular Telmeros: son los extremos del cromosoma, cuya funcin va a ser estabilizar la estructura del cromosoma, que va a estar formado por secuencias con alto contenido de guanina en el extremo 3 prima de este cromosoma. La secuencia de nucletidos del extremo 3 prima tambin se encuentra en el 5 prima pero no se sita al final