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GENETICA BACTERIANA

Mutaciones
Transferencia de material gentico
de un microorganismo a otro

Procesos que producen cambios en la


informacin gentica de un microorganismo.
Estos pueden tener como consecuencia un
cambio en su fenotipo (cambios
morfolgicos, estructurales o funcionales)
y adaptacin a distintos ambientes.

Recombinacin gentica
Transposicin

Estos procesos permiten el anlisis de la


estructura gnica de un organismo y de su
funcionalidad y tienen importancia y uso
para la construccin de nuevos organismos
con aplicaciones prcticas.

Mutaciones
Transferencia de material gentico
de un organismo a otro

Procesos que producen cambios en la


informacin gentica de un organismo
y pueden tener como consecuencia un
cambio en su fenotipo y adaptacin a
distintos ambientes.

Recombinacin gentica
Transposicin

Estos procesos permiten el anlisis de la


estructura gnica de un organismo y de su
funcionalidad y tienen importancia y uso
para la construccin de nuevos organismos
con aplicaciones prcticas.

Mutacin en bacterias

Gen silvestre: secuencia de un gen en las bacterias aisladas en su hbitat natural


Mutacin: cambio heredable en la secuencia de bases del genoma de un organismo.
Mutante: la cepa que lleva ese tipo de cambio (proviene de una cepa silvestre). Se
denominan de acuerdo a si se hace referencia al gen mutado (genotipo) o al fenotipo alterado.

Genotipo: dado por la secuencia de nucletidos en el ADN


Gen: minscula e itlica, ej.: el gen hisC, genes exo (mutante hisC o cepa hisC-)

Fenotipo: dado por las propiedades observables o detectables del organismo


Protena o camino metablico: His (cepa His-, cepa Exo-, mutante His).
The role of Mesorhizobium loti surface polysaccharides on
the nodulation process is not yet fully understood. In this
article, we describe the nodulation phenotype of mutants
affected in the synthesis of lipopolysaccharide (LPS) and
(1,2) cyclic glucan. M. loti lps2 mutant produces LPS
with reduced amount of O-antigen, whereas M. loti lps1
mutant produces LPS totally devoid of O-antigen. Both
genes are clustered in the chromosome. Based on amino
acid sequence homology, LPS sugar composition, and enzymatic
activity, we concluded that lps 2 codes for an enzyme
involved in the transformation of dTDP-glucose into dTDPrhamnose,
the sugar donor of rhamnose for the synthesis of
O-antigen. On the other hand, lps1 codes for a glucosyltransferase
involved in the biosynthesis of the O-antigen.
Although LPS mutants elicited normal nodules, both show
reduced competitiveness compared with the wild type. M.
loti (1-2) cyclic glucan synthase (cgs) mutant induces
white, empty, ineffective pseudonodules in Lotus tenuis.
Cgs mutant induces normal root hair curling but is unable
to induce the formation of infection threads. M. loti cgs
mutant was more sensitive to deoxycholate and displayed

Cmo se producen las mutantes?

Bacteria sensible a antibitico

Se hace crecer en un medio con antibitico


Se aslan colonias que poseen una resistencia a la
droga (heredable).
Las mutaciones se indujeron a causa del antibitico?

Medio con antibitico


Colonia proveniente de
bacteria sensible a antibitico

Colonias resistentes a antibitico

En general la mutacin es un evento que ocurre al azar y no est


relacionado con una adaptacin especfica al medio ambiente.

Todas las
replicas en
medio selectivo
son iguales

Luria y Delbruck (1943): investigaron el origen de la mutacin que le confiere a E. coli


resistencia al fago T1

B
1

20

20 erlenmeyers(1ml/erlenmeyer)
conteniendo 103 clulas /ml

Cada uno se plaquea en una placa con fago T1


0,2 ml / placa

10 ml conteniendo
103 clulas/ml

Se crecen hasta alcanzar 109 clulas/ml

Se plaquean 20 placas que contienen el fago,


0,2 ml de cultivo / placa.

Tasa de mutacin para un determinado fenotipo: La probabilidad de que una clula mute a un
determinado fenotipo cada vez que la misma se divide.

a=

m
d

m
N2 N1

Si se hace en cultivo lquido hay que hacer


correcciones en base a clculos estadsticos
porque el nmero de eventos de mutacin
nmero de mutantes

a= tasa de mutacin
m= nmero de mutaciones surgidas en el cultivo
en el tiempo t
d= nmero de divisiones ocurridas en ese tiempo t
N= nmero de clulas

Se aplica esta aproximacin

M/N
Pendiente= a

tiempo
Se debe trabajar con cultivos densos en fermentador

La tasa de mutacin se saca experimentalmente


y depende del tamao del gen, secuencia del gen,
secuencia de aa y estructura tridimensional del
producto del gen que se est mutando y si el fenotipo
depende de un solo gen o de varios.
Tasa de mutacin espontnea para cada gen: 10-6-10-10
Auxotrofa aa

resist Ab

Puntuales: Sustitucin de pares de bases: transiciones Pu:Py


transversiones Pu:Py

Pu:Py
Py:Pu

Microinserciones

Mutaciones
Microdeleciones

Mutaciones debidas a cambio de muchos pares de bases (genes enteros): inserciones


deleciones
inversiones
Translocaciones
duplicaciones

Pu: A y G
Py: T y C

Consecuencias de las mutaciones puntuales


En zona codificante:

UAC
Codn de tirosina

Sustitucin de pares de bases: El


cambio fenotpico depende de que
cambio de nucletido tuvo lugar y
donde exactamente ocurre la mutacin
en el gen.

CAC
Codn de
Histidina

UAG
codn de
terminacin

UAU
codn de
tirosina

Protena defectuosa
Protena incompleta Protena normal
Mutacin de contrasentido Mutacin sin sentido Mutacin silenciosa

Mutaciones por desfase: Por insercin


o delecin (que no sea mltiplo de 3)
se origina un desfase en el marco de
lectura. La traduccin resulta alterada.

En zona no codificante:
En zona promotora: inactivacin o conversin de un promotor inducible en promotor constitutivo.

10

Por errores en la replicacin: los errores ocurren


Espontneas

con alta frecuencia pero


existen mecanismos de
correccin muy eficientes

Por alteracin espontnea de ciertos nucletidos


que lleva a un apareamiento equivocado
Tautomerismo, prdida de amino.

Mutaciones

Mutgenos qumicos y fsicos


Provocadas

Para aislar una mutante:

Mutgenos biolgicos: mutagnesis por transposn

Mutagnesis dirigida: Tecnologa de ADN


recombinante.

Hay que tratar de aumentar la tasa de mutacin


Hay que buscar un mtodo eficiente de seleccin

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Tautomerismo

T- - - A
T- - - G

TA

CG

forma
enol

Forma tautomrica

Se comporta como

A* (imino)

G* (enol)

C* (imino)

T* (enol)

12

Prdida de NH2

5% de las citosinas estn metiladas

C - - -G
MeC - - -G
Tanto C como MeC pueden perder el NH2

C
MeC

U
T- - -A

MeCG

TA

Hot Spots

13

Por errores en la replicacin: ocurre con alta frecuencia


Ocurrir
naturalmente

Existen mecanismos de
correccin

Por alteracin espontnea de ciertos nucletidos


que lleva a un apareamiento equivocado
Tautomerismo, Hot Spots.

Mutaciones

Mutgenos qumicos y fsicos


Provocadas

Para aislar una mutante:

Mutgenos biolgicos: mutagnesis por transposn

Mutagnesis dirigida: Tecnologa de ADN


recombinante.

Hay que tratar de aumentar la tasa de mutacin


Hay que buscar un mtodo eficiente de seleccin

14

15

Por errores en la replicacin: ocurre con alta frecuencia


Ocurrir
naturalmente

Existen mecanismos de
correccin

Por alteracin espontnea de ciertos nucletidos


que lleva a un apareamiento equivocado
Tautomerismo, Hot Spots.

Mutaciones

Mutgenos qumicos y fsicos


Provocadas

Para aislar una mutante:

Mutgenos biolgicos: mutagnesis por transposn

Mutagnesis dirigida: Tecnologa de ADN


recombinante.

Hay que tratar de aumentar la tasa de mutacin


Hay que buscar un mtodo eficiente de seleccin

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Hipoxantina (APAREA CON CITOCINA)


Uracilo (APAREA CON ADENINA)
(la transforma en comp.
que se aparea con A)

y deleciones

In vivo e in vitro
salvo NTG que
actua solo in vivo

mutaciones puntuales por errores en apareamiento

Bloqueo de emparejamiento de bases

aflatoxina

distorcin, error por reparacin

Anlogo de base

T(forma enol) (aparea con G)

BU

BU (forma enol)

BU - - - G

Ms frecuentemente

AT

GC

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Sistemas de reparacin
Mecanismos de reparacin general
Actividad correctora de la ADN polimerasa III durante la replicacin (mutD)
(exo 3 5). Frecuencia baja pero no nula. Innovaciones presin selectiva
evolucin

Reparacin de mismatch dependiente de metilo:


Reconocen cambios en la estructura del ADN debido a un apareo indebido
(pequeas distorsiones en la hlice). Participan los genes mutS, mut L y
mut H.
El gen dam (codifica para una enzima que metila Adenina dentro de determinada
secuencia despus de la replicacin, la nueva hebra esta temporalmente
no metilada). Entonces cuando el dao y la formacin de mismatch ocurre
durante la replicacin puede ser corregido correctamente porque el sistema
reconoce cual es la hebra nueva.

Genes mut: genes mutadores

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Mecanismos que reconocen distorsiones grandes en la hlice. Principalmente daos por UV, NTG,
especies reactivas de oxgeno

Reparacin por escisin


Reparacin recombinatoria
Reparacin por mecanismo de SOS (mutagnico)

Reparacin por escisin-resntesis

Reparacin recombinatoria

1) Helicasa (uvrA y uvrB)


2) Se une uvrC y se forma
la endonucleasa
3) Corta x nmero de nt a
izquierda y derecha del
dmero
4) DNA polimerasa I rellena sobre
molde
5) ligasa

1) DNA polimerasa III salta y


deja hueco
2) Se produce recombinacin
entre cadenas por accin
de RecA

Intervienes los productos de los genes uvrA, uvrB, uvrC, uvrD y


DNA polimerasa. Son inducibles por dao al ADN

prereplicativo

posreplicativo

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Reparacin por mecanismo de emergencia (SOS) (propenso a error)


Por accin de mutgenos
o por stress ambiental

Dao al ADN
grande

Se induce el sistema de SOS


(normalmente reprimido por LexA)

Clula normal: nivel basal de LexA (represor de lexA, y de recA, uvrA, B, C, y umuDC (reguln SOS).
La represin no es total entonces hay niveles basales de estas enzimas y por lo tanto hay reparacin
por recombinacin y por escisin.
Clula daada: muy afectada la replicacin. Muchas zonas del cromosoma como simple cadena sin
reparar. RecA reconoce estas zonas y se activa a una forma que induce la autoprotelisis de LexA.
Deja de haber represor, aumenta reparacin por mayor cantidad de RecA y de UvrA, B y C pero
aumenta expresin de umuDC. UmuDC permite la replicacin sobre DNA daado (bypass replicativo)
pero metiendo errores. La clula sigue viable pero adquiere mltiples mutaciones.

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Mecanismos de reparacin especficos para determinado tipo de mutacin


Dao por Deaminacin:

Actan DNA glicosilasas especficas reconocen (hipoxantina, uracilo).


Rompen entre el azcar y la base alterada. Luego actan las AP endonucleasas que
cortan en el esqueleto azcar-fosfato y finalmente acta la ADN polimerasa I rellenando.

(Deaminacin espontnea de C)
Deaminacin por cido nitroso)

Desaminacin de citocinas metiladas

C
MeC

Uracil-glicosilasa

T- - -A

MeCG

No se saca con una glicosilasa

Hot spot

TA

(sobre las T en mismatch con G en el contexto de determinada


secuencia acta otro sistema reparacin llamado VSP (very
short patch. Repara en favor de la hebra que tiene la G

Dao por alquilacin: (metil guanina por metanosulfonato de etilo)

glicosilasas especficas,
AP endonucleasas y la ADN pol I

Dao por especies reactivas de oxgeno: Formacin de 8-oxo G. Aparea con A en lugar de C
Paricipan los genes mutM, mut T y mutY.
mut M codifica para una glicosilasa especfica para 8-oxo G.
mutY codifica para una glicosilasa especfica para A.
mutT inhibe la formacin de 8-oxo G.
Tambin en dao al ADN por especies reactivas de oxgeno
acta el sistema de reparacin por escisin (mecanismo general)

Dao por Radiacin UV (formacin de dmeros de timina). Fotoreactivacin: ocurre en presencia de


la luz. Acta una Fotoliasa que separa las bases unidas
Tambin hay N-glicosilasas especficas para dmeros de timina

21

Por errores en la replicacin: ocurre con alta frecuencia


Existen mecanismos de
correccin

Ocurrir
naturalmente

Por alteracin espontnea de ciertos nucletidos


que lleva a un apareamiento equivocado
Tautomerismo, Hot Spots.

Mutaciones

Mutgenos qumicos y fsicos


Provocadas

Mutgenos biolgicos: mutagnesis


por transposn

Para aislar una mutante:

Genes
mutadores

Mutagnesis dirigida: Tecnologa de ADN


recombinante.

Hay que tratar de aumentar la tasa de mutacin


Hay que buscar un mtodo eficiente de seleccin

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Mutacin adaptativa ?
Existen algunos ejemplos
Mutacin adaptativa o de fase estacionaria: se forma durante la exposicin a las condiciones selectivas y no est presente de antes.
Ocurre por hipermutacin (induccin de SOS sin reparacin de errores)

Mutantes lacZ (no pueden crecer en lactosa porque est mutada la -galactosidasa, mutacin por desfase).
Despus de un tiempo en medio mnimo con lactosa empiezan a aparecer colonias de revertantes

Mecanismo:
Tasa de mutacin general regulada por el ambiente

Stress
(ambiente adverso o ayuno exhaustivo)
Amplificacin adaptativa
Hipermutacin por induccin del sistema SOS
El ambiente provoca la hipermutacin y el aumento de probabilidad de adaptarse a ese ambiente adverso

23

Reversiones
Una revertante es una cepa en la que se restaur el fenotipo silvestre que se haba perdido.

Se vuelve a la secuencia original: revertante verdadera

Revertante de un mismo sitio

Secuencia que al traducir da el mismo aa

Mutacin en el mismo gen: corrigen el marco


de lectura.
Mutacin en otro gen que restaura el fenotipo
silvestre produciendo la misma protena.
Ej. : mutacin en genes de tRNA. Supresora informacional

Revertantes
Tambin pueden
ocurrir naturalmente
o ser provocadas

Revertantes de segundo sitio o


mutaciones supresoras

Supresoras por sobrexpresin


Supresoras por interaccin

Mutacin que produce una va metablica


alternativa que permite el mismo fenotipo. Supresora
por bypass

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Supresora informacional

Tambin supresora informacional de desfase

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Por errores en la replicacin: ocurre con alta frecuencia


Ocurrir
naturalmente

Existen mecanismos de
correccin

Por alteracin espontnea de ciertos nucletidos


que lleva a un apareamiento equivocado
Tautomerismo, Hot Spots.

Mutaciones

Mutgenos qumicos y fsicos


Provocadas

Para aislar una mutante:


Hay que tratar de aumentar la tasa de mutacin
Hay que buscar un mtodo eficiente de seleccin

Mutgenos biolgicos: mutagnesis por transposn

Mutagnesis dirigida: Tecnologa de ADN


recombinante.

26

Aislamiento de mutantes
1) Deteccin por Rastreo o Screening
Observacin cambios en fenotipo
Ej.: mucosas y no mucosas

a) Directo

mutagnesis

plaqueo

b) Por replica en placa

mutagnesis

plaqueo

Repique y
ordenamiento

Replica

Ej.: mutante sensible a antibitico


c/Ab

mutante en motilidad

Medio con menor % de agar

27

2) Seleccin

a) Seleccin positiva: La mutacin proporciona una ventaja para el crecimiento


bajo ciertas condiciones ambientales.
Ej.: resistencia a un antibitico.
mutagnesis

s/Ab

c/Ab

b) Seleccin negativa: La mutacin causa una desventaja:


Ej.: mutante auxotr
Enriquecimiento (penicilina, incorporacin de precursor metablico radioactivo)
Se repite el proceso
varias veces
Agrego al medio
penicilina

mutagnesis

Medio completo

Medio en el que no puede


crecer la mutante buscada
Ej.: sin aminocido

Las bacterias no mutadas, que


pueden crecer, se lisan

Medio completo

Repique y
ordenamiento
Replica
Aumenta la cantidad de
mutantes obtenidas,
por eso se llama
seleccin

Medio sin aminocido

Mutantes leaky

Mutantes letales

Mutantes condicionales

28

Mutagnesis y carcinognesis: Test de Ames


Uso de cepas bacterianas mutantes para identificar sustancias potencialmente
carcinognicas.
Se usa mutantes auxotrficas, puntuales (S. typhimurium, auxtrofa para histidina;,
E. coli, auxtrofa para triptofano).
La mutante auxtrofa no puede crecer en un medio carente del nutriente para el cual
es auxotrfica, si revierte entonces crece.
Una sustancia con capacidad mutagnica incrementa la frecuencia de reversin en la
mutante puntual.

Control

Disco de papel

Placa con bacterias


auxotrficas para
histidina

Medio con concentracin muy baja de histidina

Disco de papel
Con sustancia a ensayar
activada

29

Mutaciones
Transferencia de material gentico
de un organismo a otro

Procesos que producen cambios en la


informacin gentica de un organismo
y pueden tener como consecuencia un
cambio en su fenotipo y adaptacin a
distintos ambientes.

Recombinacin gentica
Transposicin

Estos procesos permiten el anlisis de la


estructura gnica de un organismo y tienen
importancia y uso para la construccin de
nuevos organismos con aplicaciones
prcticas.

30

Existen 3 formas de transferencia de ADN a una bacteria

TRANSFORMACION

TRANSDUCCION

CONJUGACION

Exogenote: Replicacin, dilucin, degradacin o recombinacin

31

Mutaciones
Transferencia de material gentico
de un organismo a otro

Procesos que producen cambios en la


informacin gentica de un organismo
y pueden tener como consecuencia un
cambio en su fenotipo y adaptacin a
distintos ambientes.

Recombinacin gentica
Transposicin

Estos procesos permiten el anlisis de la


estructura gnica de un organismo y tienen
importancia y uso para la construccin de
nuevos organismos con aplicaciones
prcticas.

32

Recombinacin: proceso por el que, en parte o por completo, las


molculas de ADN de dos fuentes distintas se intercambian o juntan
en una unidad. La informacin gentica se ve redistribuida

RECOMBINACION GENERAL
U HOMOLOGA

RECOMBINACION SITIO ESPECIFICA


O NO HOMLOGA

-Recombinacin sitio especfica ilegitima


-Recombinacin sitio especfica legtima

Entre fragmentos iguales o muy similares

RecA

Resolvasas
Transposasas
Integrasas
Invertasas y ms..

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RECOMBINACION GENERAL U HOMOLOGA

Intercambio de
cadenas homlogas
Modelo de
Holliday o de
invasion de
doble cadena

Isomerizacin

Dos cortes en cs
En el mismo lugar

Entrecruzamiento de
Extremos libres

Apareamiento con
Secuencia complementaria
Y formacin de heteroduplex

Resolucin

Secuencias homlogas (95-100%, 100pb mnimo)


RecA
Sinapsis
Heteroduplex
Estructura de Holliday
Endonucleasas, ligasas, polimerasas
Migracion de ramificacion

Parches

Empalmes
(recombinacin verdadera)

34

Las dos cadenas de


una de las molculas
de ADN se cortan y los
extremos 5se degradan

Uno de los extremos 3


invade la otra molcula
de ADN y encuentra su
secuencia complementaria

La ADN polimerasa
Desplaza y rellena
Ligacin

Modelo de reparacin de ruptura de


doble cadena

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Enzimas que participan en la recombinacin homloga:


RecBCD: nucleasa se une a extremos de doble cadena.

Reconoce una secuencia determinada que determina


donde se va a formar un extremo 3 que va a constitur la hebra invasora. Helicasa

RecA: Se une al extremo 3de la cadena invasora, lo fuerza a adoptar la conformacin de una hlice y permite que se meta
en la doble hlice de la otra molcula de ADN formando una hlice triple en la cual tiene lugar el apareamiento de
la hebra invasora con su complementaria.

RuvA, RuvB: involucradas en la migracin de la ramificacin.


RuvC: resuelve la estructura de Holliday

36

37

Consecuencias de la recombinacin homloga


Mutacin complementacin
Para que aparezca un nuevo fenotipo a
raz de la recombinacin homloga, las
dos cadenas que se intercambian deben
tener alguna diferencia

Integracin al cromosoma

La recombinacin entre dos regiones de una


misma molcula de ADN que presentan
similitud puede ser la causa de:
Deleciones
Inversiones

empalme

38

Mutaciones
Transferencia de material gentico
de un organismo a otro

Procesos que producen cambios en la


informacin gentica de un organismo
y pueden tener como consecuencia un
cambio en su fenotipo y adaptacin a
distintos ambientes.

Recombinacin gentica
Transposicin

Estos procesos permiten el anlisis de la


estructura gnica de un organismo y tienen
importancia y uso para la construccin de
nuevos organismos con aplicaciones
prcticas.

39

Existen 3 formas de transferencia de ADN a una bacteria

TRANSFORMACION

TRANSDUCCION

CONJUGACION

40

PLASMIDOS
Elementos genticos, doble cadena, generalmente circulares,
que se replican en forma independiente del cromosoma del
hospedador

No llevan genes que codifiquen para funciones esenciales. Estn relacionados con la capacidad
evolutiva o adaptativa de las bacterias
Se conocen miles de tipos diferentes
Se encuentran en la mayora de las bacterias
Tamao entre 1000- 106 pb
Plsmido tpico: circular, bicatenario, 0,2-0,4% del ADN cromosmico

41

Forma superenrollada. Con rotura en una cadena da crculo abierto. Con rotura en las dos
cadenas da forma lineal.
Los plsmidos se replican a partir de un origen de replicacin.
En forma similar al
cromosoma bacteriano.
Replicacin theta

En crculo rodante

42

Los genes necesarios para la replicacin pertenecen en su mayora al hospedador (DNA


Polimerasas, ligasas, helicasas, primasas) pero el plsmido lleva informacin:
Para algunas de las enzimas necesarias para la iniciacin de la replicacin (esto determinar si
es de amplio o estrecho rango de husped y que tipo de replicacin sigue).
Para el control temporal de la iniciacin de la replicacin determinando el nmero de copias
por clula. Plsmidos de alto y bajo nmero de copias.
Para la regulacin de la particin de los plsmidos entre las clulas hijas en la divisin celular
Puede determinar su capacidad de compartir la clula con otros tipos de plsmidos:
incompatibilidad.

43

Nmero de copias:
Es caracterstico del plsmido
Bajo nmero de copias (1-3)
Alto nmero de copias (10-100)
RepA, RNA

Curacin:
Los plsmidos se pueden eliminar de la clula hospedadora por distintos tratamientos:
colorantes de acridina, detergentes, elevada temperatura, electroporacin. Ocurre una dilucin
del plsmido en la divisin celular.

Particin:
La segregacin de los plsmidos en las dos clulas hijas, para plsmidos de bajo
nmero de copias est regulada (sitios par).

Incompatibilidad:
Plsmidos distintos pero estrechamente relacionados no pueden permanecer juntos en forma
estable en una misma clula. Los plsmidos que no pueden coexistir forman parte del mismo
grupos de incompatibilidad. Los plsmidos que pertenecen al mismo grupo de incompatibilidad comparten el mecanismo de regulacin de nmero de copias o el mecanismo de particin.
Hay numerosos grupos de incompatibilidad

44

Incompatibilidad

Diferente grupo de
incompatibilidad

Mismo grupo de
incompatibilidad

45

Hay distintos tipos de plsmidos en cuanto a genes extra que contienen y que le confieren al
hospedador un cierto fenotipo o una cierta capacidad.

46

Naturales

PLASMIDOS
Obtenidos por tecnologa de ADN recombinante

Replicativos

Amplio o estrecho
rango de husped

PLASMIDOS
Suicidas

47

Existen 3 formas de transferencia de ADN a una bacteria

TRANSFORMACION

TRANSDUCCION

CONJUGACION

48

Transformacin

Lisis bacteriana
Extruccin de ADN por T4SS

Proceso por el cual el ADN libre


se incorpora en una clula
receptora y lleva a cabo un cambio
gentico heredable.

Porque?
Nutricin
Adaptacin
reparacin

No todas las bacterias son transformables naturalmente.


Ejemplos de bacterias transformables naturalmente o naturalmente competentes: Bacillus,
Streptococcus, Haemophilus, Neisseria, Azotobacter, Pseudomonas

Clula competente: clula capaz de tomar


una molcula de ADN y ser
transformada.
La competencia natural depende de la especie, de la fase de crecimiento, del pH, etc.
Algunas especies presentan el 100% de las clulas en una cultivo competentes al final
de la fase exponencial (10-15) (Streptococcus pneumoniae) y otras un 1-20 % de
clulas competentes y solo en fase Estacionaria (Bacillus subtilis)
En el proceso de transformacin natural intervienen protenas de membrana que
asocian ADN, autolisinas de pared celular, nucleasas.

49

Desarrollo de la competencia
Observado para Streptococcus pneumoniae, Bacillus subtilis (G+)
A medida que la clula crece, secreta al medio un pptido. Existen protenas sensoras en la membrana celular
que sensan la concentracin del pptido. Cuando el pptido llega a determinada concentracin, esto es sensado
por las protenas sensoras (mecanismo de quorum sensing) que transmiten la seal a una protena reguladora
(sistema de regulacin de dos componentes) que a su vez activa la transcripcin de varios genes entre los que
se encuentran aquellos que codifican para la maquinaria necesaria para la captacin del ADN exgeno, su
entrada y recombinacin (protenas unidoras del ADN cd, endonucleasas, exonucleasas, autolisinas de la pared,
canales de membrana, protenas protectoras contra la degradacin de la cadena simple que entra, protenas
necesarias para la recombinacin.

Slo se puede transformar naturalmente con ADN doble cadena lineal.


Transformacin natural es poco eficiente con plsmidos
El ADN se une como doble cadena
pero al citoplasma solo entra como
simple cadena

La captacin de ADN es inespecfica


salvo para Neisseria y Haemophilus en
los que se reconoce una secuencia de
11 pb.

50

Gram (+)

En la transformacin natural, entre el ADN simple cadena


(exogenote) y el cromosoma bacteriano ocurre una recombinacin
homloga no recproca

51

Se puede inducir el estado de competencia: mecanismo de transformacin distinto al que


ocurre en clulas naturalmente competentes.
Ej.: Tratamiento con Cl2Ca y shock trmico (E. coli).
Electroporacin (distintas bacterias)

En el caso de competencia inducida se puede transformar con


plsmidos

Plsmidio replicable
Transformacin
con plsmidos

Complementacin o introduccin de un gen nuevo


Complementacin

Plsmido no replicable (suicida)

recombinacin
mutacin

Retomar al hablar de conjugacin

52

Se debe tener un mtodo de


seleccin
-

Eficiencia de
= nmero de colonias
Transformacin
g ADN

53

Existen 3 formas de transferencia de ADN a una bacteria

TRANSFORMACION

TRANSDUCCION

CONJUGACION

54

Transduccin
Infeccin ltica y lisognica

55

Generalizada
Transduccin
Especializada

56

Formacin de fago transductor para transduccin generalizada


Fagos transductores:
Fago P1 y P22

Fago
transductor

57

Transduccin generalizada

Seleccin en
Determinado
medio

Recombinacin
Homloga
(RecA)

58

Transduccin especializada
Formacin de fago transductor con fago atemperado
Fago lambda

Clula
lisognica

Recombinacin sitio
especfica legtima

59

Transduccin especializada

60

Existen 3 formas de transferencia de ADN a una bacteria

TRANSFORMACION

TRANSDUCCION

CONJUGACION

61

Conjugacin

62

Plsmidos conjugativos (F en E. coli)


Conjugacin en G (-)
4 etapas:
1) formacin del par receptor-donor
2)Preparacin para la transferencia
del ADN.
3)Transferencia del ADN.
4) Formacin de una rplica funcional
en el aceptor.

Transconjugante

Conjugacin en G(+): produccin por parte de clulas


aceptoras de feromonas que inducen en la superficie de las
clulas donadoras la acumulacin de sustancias de agregacin que
median la unin entre los dos tipos celulares (Enterococcus)

63

(60 genes, 100kb)

Plsmido autotransferible o conjugativo (F):


llevan genes que permiten el contacto efectivo
y lleva la informacin necesaria para la
transferencia
Plsmido movilizable o transferible:
lleva parte de la informacin necesaria para la
transferencia y necesita de la ayuda de un
plsmido autotransferible para transferirse
(indispensable: origen de transferencia oriT).
Plsmido no transferible: no tiene los
genes necesarios para el efectivo
contacto ni para la transferencia del
ADN.

64

PLASMIDOS

Conjugacin
Cl2Ca

Transformacin
inducida

Electroporacin

Autotransferibles (conjugativos y transferibles)

PLASMIDOS
Transferibles o movilizables
(necesito la presencia de otro autotransferible)
Conjugacn biparental y
triparental

Donacin

65

Conjugacin triparental

66

Conjugacin
(como en transformacin
con plsmidos)

Plsmido replicable

Complementacin o introduccin de gen nuevo


Complementacin

Plsmido no replicable
(suicida)

recombinacin
mutacin

Tecnologa de ADN recombinante

67

Conjugacin
Medio de contraseleccin apropiado para seleccionar clulas
aceptoras (con la nueva informacin) y no las dadoras
Complementacin
A-

Cm r
Cepa Aceptora

A
A

Vector Amp r
Replicativo
Vector de expresin

Cepa dadora con funciones


de conjugacin
Conjugacin biparental

68

Conjugacin
Medio de contraseleccin apropiado para seleccionar clulas
aceptoras (con la nueva informacin) y no las dadoras
Complementacin
A-

Cm r
Aceptora

A
A

Vector Amp r
Replicativo

Medio c/Amp y c/ Cm
Crece aceptora con plsmido

Cepa dadora con funciones


de conjugacin

69

Mutacin
E. coli (no crece en sacarosa)

Rhizobium

+
Crece en medio
Mnimo (MM)
con sacarosa

A-

Gm
Cepa dadora con funciones
de conjugacin
Vector suicida en cepa aceptora
Ampr

70

Mutacin
E. coli (no crece en sacarosa)

Rhizobium

+
Crece en medio
Mnimo (MM)
con sacarosa

A-

Gm

Cepa dadora con funciones


de conjugacin
Vector suicida en cepa aceptora
Ampr

MM sacarosa
c/ Gm
Gmr Ampr

Un evento de recombinacin

Gmr Amps
2 eventos de recombinacin

Si en lugar de conjugacin, introduzco el plsmido por transformacin,


no se requiere usar un medio que no permita crecer E. coli

71

Integracin
delecin

Un evento de recombinacin

Gmr Ampr

Doble evento de recombinacin

Gms Amps

Gmr Amps

72

Movilizacin del cromosoma


El plsmido F se puede integrar al cromosoma (episoma) y es capaz de transferir una
porcin del cromosoma a una clula aceptora: Conduccin y sexduccin
F+: plsmido F no integrado (donadora)
F-: no tiene plsmido F (receptora)
Hfr: clulas que tienen el plsmido F integrado al cromosoma (conduccin)
F: Ocasionalmente el plsmido F integrado se puede escindir del cromosoma y existe la posibilidad de que se incorporen
al mismo genes cromosmicos adyacentes (donador si no perdi ninguno de los genes necesarios para el proceso)
(Sexduccin)

73

La integracin del plsmido F al


cromosoma es a travs de las
Secuencias de Insercin, IS,
que se encuentran tanto en el
plsmido como en determinados
lugares del cromosoma.
Recombinacin homloga

74

75

Existen diferentes secuencias de insercin y para cada tipo existen distintos sitios
en el cromosoma donde se pueden integrar, o sea se pueden tener diferentes cepas Hfr.

Como se detecta si hubo o


no transferencia de ADN
cromosmico y
recombinacin

76

Mediante el uso de una variedad de cepas Hfr se pudo determinar en E. coli la disposicin (ubicacin relativa
y orientacin de un gran nmero de genes cromosmicos

Conjugacin de:
Hfr a+ b+ c+ d+ e+ Strs
X
F- a- b- c- d- e- Strr

Producto de conjugacin
(Se corta la conjugacion a distintos tiempos
por agitacin)

Plaqueo en medio con estreptomicina


y todos los aa menos:

Tambin se puede utilizar


la transduccin generalizada
Para mapear el genoma de E. coli

77

78

Mutaciones
Transferencia de material gentico
de un organismo a otro

Procesos que producen cambios en la


informacin gentica de un organismo
y pueden tener como consecuencia un
cambio en su fenotipo y adaptacin a
distintos ambientes.

Recombinacin gentica
Transposicin

Estos procesos permiten el anlisis de la


estructura gnica de un organismo y tienen
importancia y uso para la construccin de
nuevos organismos con aplicaciones
prcticas.

79

Recombinacin: proceso por el que, en parte o por completo, las


molculas de ADN de dos fuentes distintas se intercambian o juntan
en una unidad. La informacin gentica se ve redistribuida

RECOMBINACION GENERAL
U HOMOLOGA

RECOMBINACION SITIO ESPECIFICA


O NO HOMLOGA

-Recombinacin sitio especfica ilegitima


-Recombinacin sitio especfica legtima

Entre fragmentos iguales o muy similares

RecA

Resolvasas
Integrasas
Transposasas
Invertasas y ms..

80

RECOMBINACION NO HOMLOGA
Recombinacin sitio especfica legtima
Recombinacin sitio especfica ilegtima

81

Integrasas (Integracin de fago)

Recombinacin sitio especfico


legtima

Resolvasa (una etapa de la transposicin replicativa )


Invertasas (inversin)

Integrasas
Invertasas

82

Mutaciones
Transferencia de material gentico
de un organismo a otro

Procesos que producen cambios en la


informacin gentica de un organismo
y pueden tener como consecuencia un
cambio en su fenotipo y adaptacin a
distintos ambientes.

Recombinacin gentica
Transposicin

Estos procesos permiten el anlisis de la


estructura gnica de un organismo y tienen
importancia y uso para la construccin de
nuevos organismos con aplicaciones
prcticas.

83

Recombinacin sitio especfico ilegtima


Transposasas
Transposicin
El ADN de bacterias, virus y clulas eucariotas contienen elementos que se pueden
mover de un lugar a otro del mismo
El movimiento se llama transposicin.
Secuencias de insercin
Transposones compuestos
Transposones no compuestos
Fago Mu

84

IR

Secuencias de insercin

Transposones compuestos

Tn5, Tn9, Tn10

IR

Transposasa

E.coli contiene distintos IS,


algunos estan repetidos.
se los encuentra tanto en cromosoma
como en los plsmidos

Transposones no compuestos

Tn3

85

8-38 pb

Reconocimiento del
blanco:

Transposasa
Target: 3-12 pb
No es especfica respecto de la
secuencia del husped. Es caracterstico
el nmero de bases duplicadas para
cada transposn.
Algunos transposones saltan
preferentemente a regiones con
determinado enrollamiento o grado
de metilacin.

Conservativo (Tn5 y IS)

Mecanismo de transposicin

compuesto

Replicativo (Tn3, Fago Mu) (hay un intermediario)


No compuesto

86

Transposicin replicativa

Transposicin conservativa

Transposicin
(Transposasas)
Recombinacin sitio
especfica ilegtima

Recombinacin
sitio especfica
legtima
(Resolvasas)

IS y transposones compuestos

Tn3 y fago Mu

87

Consecuencias de la transposicin
Mutagnesis: Se utilizan transposones para mutagenizar. La resistencia a antibiticos
para la cual codifican es til para seleccionar las mutantes. Se utilizan como portadores
del transposn, plsmidos suicidas. Se utilizan transposones modificados: miniTn5 (no
codifica para la transposasa).

Induccin de la expresin: por secuencias promotoras que contiene y que quedan


rio arriba de algn gen.

Rearreglos: por insercin de transposones compuestos


(deleciones e inversiones, nuevos transposones)

88

Mutagenesis generalizada por transposicin


Rhizobium

E. Coli (no crece en sacarosa)

+
Crece en
MM sacarosa

Vector (suicida en rhizobium) AmpR

con Tn5 (Kmr)

Medio selectivo c/ Km
(MM Sac Km)
Plsmido suicida, selecciono
Evento de transposicin

La transposasa del transposn es inactiva y va otra copia intacta en el plsmido fuera del transposn

89

Consecuencias de la transposicin
Mutagnesis: Se utilizan transposones para mutagenizar. La resistencia a antibiticos
para la cual codifican es til para seleccionar las mutantes. Se utilizan como portadores
del transposn, plsmidos suicidas. Se utilizan transposones modificados: miniTn5 (no
codifica para la transposasa).

Induccin de la expresin: por secuencias promotoras que contiene y que quedan


rio arriba de algn gen.

Rearreglos: por insercin de transposones compuestos


(deleciones e inversiones, nuevos transposones)

90

Rearreglos

Delecin

Creacin de un nuevo transposn

Inversin

Out-side end transposition


(transposicin externa)
In-side end transposition
(transposicin interna)

91

Thomas D. Brock and Michael T. Madigan. Biologa de los


Microorganismos
Prescot, Harley and Klein. Microbiology
Snyder and Champness. Molecular genetics of bacteria

92

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