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Mutaciones
Transferencia de material gentico
de un microorganismo a otro
Recombinacin gentica
Transposicin
Mutaciones
Transferencia de material gentico
de un organismo a otro
Recombinacin gentica
Transposicin
Mutacin en bacterias
Todas las
replicas en
medio selectivo
son iguales
B
1
20
20 erlenmeyers(1ml/erlenmeyer)
conteniendo 103 clulas /ml
10 ml conteniendo
103 clulas/ml
Tasa de mutacin para un determinado fenotipo: La probabilidad de que una clula mute a un
determinado fenotipo cada vez que la misma se divide.
a=
m
d
m
N2 N1
a= tasa de mutacin
m= nmero de mutaciones surgidas en el cultivo
en el tiempo t
d= nmero de divisiones ocurridas en ese tiempo t
N= nmero de clulas
M/N
Pendiente= a
tiempo
Se debe trabajar con cultivos densos en fermentador
resist Ab
Pu:Py
Py:Pu
Microinserciones
Mutaciones
Microdeleciones
Pu: A y G
Py: T y C
UAC
Codn de tirosina
CAC
Codn de
Histidina
UAG
codn de
terminacin
UAU
codn de
tirosina
Protena defectuosa
Protena incompleta Protena normal
Mutacin de contrasentido Mutacin sin sentido Mutacin silenciosa
En zona no codificante:
En zona promotora: inactivacin o conversin de un promotor inducible en promotor constitutivo.
10
Mutaciones
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Tautomerismo
T- - - A
T- - - G
TA
CG
forma
enol
Forma tautomrica
Se comporta como
A* (imino)
G* (enol)
C* (imino)
T* (enol)
12
Prdida de NH2
C - - -G
MeC - - -G
Tanto C como MeC pueden perder el NH2
C
MeC
U
T- - -A
MeCG
TA
Hot Spots
13
Existen mecanismos de
correccin
Mutaciones
14
15
Existen mecanismos de
correccin
Mutaciones
16
y deleciones
In vivo e in vitro
salvo NTG que
actua solo in vivo
aflatoxina
Anlogo de base
BU
BU (forma enol)
BU - - - G
Ms frecuentemente
AT
GC
17
Sistemas de reparacin
Mecanismos de reparacin general
Actividad correctora de la ADN polimerasa III durante la replicacin (mutD)
(exo 3 5). Frecuencia baja pero no nula. Innovaciones presin selectiva
evolucin
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Mecanismos que reconocen distorsiones grandes en la hlice. Principalmente daos por UV, NTG,
especies reactivas de oxgeno
Reparacin recombinatoria
prereplicativo
posreplicativo
19
Dao al ADN
grande
Clula normal: nivel basal de LexA (represor de lexA, y de recA, uvrA, B, C, y umuDC (reguln SOS).
La represin no es total entonces hay niveles basales de estas enzimas y por lo tanto hay reparacin
por recombinacin y por escisin.
Clula daada: muy afectada la replicacin. Muchas zonas del cromosoma como simple cadena sin
reparar. RecA reconoce estas zonas y se activa a una forma que induce la autoprotelisis de LexA.
Deja de haber represor, aumenta reparacin por mayor cantidad de RecA y de UvrA, B y C pero
aumenta expresin de umuDC. UmuDC permite la replicacin sobre DNA daado (bypass replicativo)
pero metiendo errores. La clula sigue viable pero adquiere mltiples mutaciones.
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(Deaminacin espontnea de C)
Deaminacin por cido nitroso)
C
MeC
Uracil-glicosilasa
T- - -A
MeCG
Hot spot
TA
glicosilasas especficas,
AP endonucleasas y la ADN pol I
Dao por especies reactivas de oxgeno: Formacin de 8-oxo G. Aparea con A en lugar de C
Paricipan los genes mutM, mut T y mutY.
mut M codifica para una glicosilasa especfica para 8-oxo G.
mutY codifica para una glicosilasa especfica para A.
mutT inhibe la formacin de 8-oxo G.
Tambin en dao al ADN por especies reactivas de oxgeno
acta el sistema de reparacin por escisin (mecanismo general)
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Ocurrir
naturalmente
Mutaciones
Genes
mutadores
22
Mutacin adaptativa ?
Existen algunos ejemplos
Mutacin adaptativa o de fase estacionaria: se forma durante la exposicin a las condiciones selectivas y no est presente de antes.
Ocurre por hipermutacin (induccin de SOS sin reparacin de errores)
Mutantes lacZ (no pueden crecer en lactosa porque est mutada la -galactosidasa, mutacin por desfase).
Despus de un tiempo en medio mnimo con lactosa empiezan a aparecer colonias de revertantes
Mecanismo:
Tasa de mutacin general regulada por el ambiente
Stress
(ambiente adverso o ayuno exhaustivo)
Amplificacin adaptativa
Hipermutacin por induccin del sistema SOS
El ambiente provoca la hipermutacin y el aumento de probabilidad de adaptarse a ese ambiente adverso
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Reversiones
Una revertante es una cepa en la que se restaur el fenotipo silvestre que se haba perdido.
Revertantes
Tambin pueden
ocurrir naturalmente
o ser provocadas
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Supresora informacional
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Existen mecanismos de
correccin
Mutaciones
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Aislamiento de mutantes
1) Deteccin por Rastreo o Screening
Observacin cambios en fenotipo
Ej.: mucosas y no mucosas
a) Directo
mutagnesis
plaqueo
mutagnesis
plaqueo
Repique y
ordenamiento
Replica
mutante en motilidad
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2) Seleccin
s/Ab
c/Ab
mutagnesis
Medio completo
Medio completo
Repique y
ordenamiento
Replica
Aumenta la cantidad de
mutantes obtenidas,
por eso se llama
seleccin
Mutantes leaky
Mutantes letales
Mutantes condicionales
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Control
Disco de papel
Disco de papel
Con sustancia a ensayar
activada
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Mutaciones
Transferencia de material gentico
de un organismo a otro
Recombinacin gentica
Transposicin
30
TRANSFORMACION
TRANSDUCCION
CONJUGACION
31
Mutaciones
Transferencia de material gentico
de un organismo a otro
Recombinacin gentica
Transposicin
32
RECOMBINACION GENERAL
U HOMOLOGA
RecA
Resolvasas
Transposasas
Integrasas
Invertasas y ms..
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Intercambio de
cadenas homlogas
Modelo de
Holliday o de
invasion de
doble cadena
Isomerizacin
Dos cortes en cs
En el mismo lugar
Entrecruzamiento de
Extremos libres
Apareamiento con
Secuencia complementaria
Y formacin de heteroduplex
Resolucin
Parches
Empalmes
(recombinacin verdadera)
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La ADN polimerasa
Desplaza y rellena
Ligacin
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RecA: Se une al extremo 3de la cadena invasora, lo fuerza a adoptar la conformacin de una hlice y permite que se meta
en la doble hlice de la otra molcula de ADN formando una hlice triple en la cual tiene lugar el apareamiento de
la hebra invasora con su complementaria.
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37
Integracin al cromosoma
empalme
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Mutaciones
Transferencia de material gentico
de un organismo a otro
Recombinacin gentica
Transposicin
39
TRANSFORMACION
TRANSDUCCION
CONJUGACION
40
PLASMIDOS
Elementos genticos, doble cadena, generalmente circulares,
que se replican en forma independiente del cromosoma del
hospedador
No llevan genes que codifiquen para funciones esenciales. Estn relacionados con la capacidad
evolutiva o adaptativa de las bacterias
Se conocen miles de tipos diferentes
Se encuentran en la mayora de las bacterias
Tamao entre 1000- 106 pb
Plsmido tpico: circular, bicatenario, 0,2-0,4% del ADN cromosmico
41
Forma superenrollada. Con rotura en una cadena da crculo abierto. Con rotura en las dos
cadenas da forma lineal.
Los plsmidos se replican a partir de un origen de replicacin.
En forma similar al
cromosoma bacteriano.
Replicacin theta
En crculo rodante
42
43
Nmero de copias:
Es caracterstico del plsmido
Bajo nmero de copias (1-3)
Alto nmero de copias (10-100)
RepA, RNA
Curacin:
Los plsmidos se pueden eliminar de la clula hospedadora por distintos tratamientos:
colorantes de acridina, detergentes, elevada temperatura, electroporacin. Ocurre una dilucin
del plsmido en la divisin celular.
Particin:
La segregacin de los plsmidos en las dos clulas hijas, para plsmidos de bajo
nmero de copias est regulada (sitios par).
Incompatibilidad:
Plsmidos distintos pero estrechamente relacionados no pueden permanecer juntos en forma
estable en una misma clula. Los plsmidos que no pueden coexistir forman parte del mismo
grupos de incompatibilidad. Los plsmidos que pertenecen al mismo grupo de incompatibilidad comparten el mecanismo de regulacin de nmero de copias o el mecanismo de particin.
Hay numerosos grupos de incompatibilidad
44
Incompatibilidad
Diferente grupo de
incompatibilidad
Mismo grupo de
incompatibilidad
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Hay distintos tipos de plsmidos en cuanto a genes extra que contienen y que le confieren al
hospedador un cierto fenotipo o una cierta capacidad.
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Naturales
PLASMIDOS
Obtenidos por tecnologa de ADN recombinante
Replicativos
Amplio o estrecho
rango de husped
PLASMIDOS
Suicidas
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TRANSFORMACION
TRANSDUCCION
CONJUGACION
48
Transformacin
Lisis bacteriana
Extruccin de ADN por T4SS
Porque?
Nutricin
Adaptacin
reparacin
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Desarrollo de la competencia
Observado para Streptococcus pneumoniae, Bacillus subtilis (G+)
A medida que la clula crece, secreta al medio un pptido. Existen protenas sensoras en la membrana celular
que sensan la concentracin del pptido. Cuando el pptido llega a determinada concentracin, esto es sensado
por las protenas sensoras (mecanismo de quorum sensing) que transmiten la seal a una protena reguladora
(sistema de regulacin de dos componentes) que a su vez activa la transcripcin de varios genes entre los que
se encuentran aquellos que codifican para la maquinaria necesaria para la captacin del ADN exgeno, su
entrada y recombinacin (protenas unidoras del ADN cd, endonucleasas, exonucleasas, autolisinas de la pared,
canales de membrana, protenas protectoras contra la degradacin de la cadena simple que entra, protenas
necesarias para la recombinacin.
50
Gram (+)
51
Plsmidio replicable
Transformacin
con plsmidos
recombinacin
mutacin
52
Eficiencia de
= nmero de colonias
Transformacin
g ADN
53
TRANSFORMACION
TRANSDUCCION
CONJUGACION
54
Transduccin
Infeccin ltica y lisognica
55
Generalizada
Transduccin
Especializada
56
Fago
transductor
57
Transduccin generalizada
Seleccin en
Determinado
medio
Recombinacin
Homloga
(RecA)
58
Transduccin especializada
Formacin de fago transductor con fago atemperado
Fago lambda
Clula
lisognica
Recombinacin sitio
especfica legtima
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Transduccin especializada
60
TRANSFORMACION
TRANSDUCCION
CONJUGACION
61
Conjugacin
62
Transconjugante
63
64
PLASMIDOS
Conjugacin
Cl2Ca
Transformacin
inducida
Electroporacin
PLASMIDOS
Transferibles o movilizables
(necesito la presencia de otro autotransferible)
Conjugacn biparental y
triparental
Donacin
65
Conjugacin triparental
66
Conjugacin
(como en transformacin
con plsmidos)
Plsmido replicable
Plsmido no replicable
(suicida)
recombinacin
mutacin
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Conjugacin
Medio de contraseleccin apropiado para seleccionar clulas
aceptoras (con la nueva informacin) y no las dadoras
Complementacin
A-
Cm r
Cepa Aceptora
A
A
Vector Amp r
Replicativo
Vector de expresin
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Conjugacin
Medio de contraseleccin apropiado para seleccionar clulas
aceptoras (con la nueva informacin) y no las dadoras
Complementacin
A-
Cm r
Aceptora
A
A
Vector Amp r
Replicativo
Medio c/Amp y c/ Cm
Crece aceptora con plsmido
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Mutacin
E. coli (no crece en sacarosa)
Rhizobium
+
Crece en medio
Mnimo (MM)
con sacarosa
A-
Gm
Cepa dadora con funciones
de conjugacin
Vector suicida en cepa aceptora
Ampr
70
Mutacin
E. coli (no crece en sacarosa)
Rhizobium
+
Crece en medio
Mnimo (MM)
con sacarosa
A-
Gm
MM sacarosa
c/ Gm
Gmr Ampr
Un evento de recombinacin
Gmr Amps
2 eventos de recombinacin
71
Integracin
delecin
Un evento de recombinacin
Gmr Ampr
Gms Amps
Gmr Amps
72
73
74
75
Existen diferentes secuencias de insercin y para cada tipo existen distintos sitios
en el cromosoma donde se pueden integrar, o sea se pueden tener diferentes cepas Hfr.
76
Mediante el uso de una variedad de cepas Hfr se pudo determinar en E. coli la disposicin (ubicacin relativa
y orientacin de un gran nmero de genes cromosmicos
Conjugacin de:
Hfr a+ b+ c+ d+ e+ Strs
X
F- a- b- c- d- e- Strr
Producto de conjugacin
(Se corta la conjugacion a distintos tiempos
por agitacin)
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78
Mutaciones
Transferencia de material gentico
de un organismo a otro
Recombinacin gentica
Transposicin
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RECOMBINACION GENERAL
U HOMOLOGA
RecA
Resolvasas
Integrasas
Transposasas
Invertasas y ms..
80
RECOMBINACION NO HOMLOGA
Recombinacin sitio especfica legtima
Recombinacin sitio especfica ilegtima
81
Integrasas
Invertasas
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Mutaciones
Transferencia de material gentico
de un organismo a otro
Recombinacin gentica
Transposicin
83
84
IR
Secuencias de insercin
Transposones compuestos
IR
Transposasa
Transposones no compuestos
Tn3
85
8-38 pb
Reconocimiento del
blanco:
Transposasa
Target: 3-12 pb
No es especfica respecto de la
secuencia del husped. Es caracterstico
el nmero de bases duplicadas para
cada transposn.
Algunos transposones saltan
preferentemente a regiones con
determinado enrollamiento o grado
de metilacin.
Mecanismo de transposicin
compuesto
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Transposicin replicativa
Transposicin conservativa
Transposicin
(Transposasas)
Recombinacin sitio
especfica ilegtima
Recombinacin
sitio especfica
legtima
(Resolvasas)
IS y transposones compuestos
Tn3 y fago Mu
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Consecuencias de la transposicin
Mutagnesis: Se utilizan transposones para mutagenizar. La resistencia a antibiticos
para la cual codifican es til para seleccionar las mutantes. Se utilizan como portadores
del transposn, plsmidos suicidas. Se utilizan transposones modificados: miniTn5 (no
codifica para la transposasa).
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+
Crece en
MM sacarosa
Medio selectivo c/ Km
(MM Sac Km)
Plsmido suicida, selecciono
Evento de transposicin
La transposasa del transposn es inactiva y va otra copia intacta en el plsmido fuera del transposn
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Consecuencias de la transposicin
Mutagnesis: Se utilizan transposones para mutagenizar. La resistencia a antibiticos
para la cual codifican es til para seleccionar las mutantes. Se utilizan como portadores
del transposn, plsmidos suicidas. Se utilizan transposones modificados: miniTn5 (no
codifica para la transposasa).
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Rearreglos
Delecin
Inversin
91
92