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ENZIMAS
Daltons.
A poluio
exacerbadamente
devido
do
ambiente
liberao
est
crescendo
indiscriminada
de
esforos
de
pesquisa
tm
sido
dedicados
ao
20 20 20 20 20 20 20
01 03 05 07 09 11 13
N de Enzimas
1940
1618
1267
1115
3527
3029
5127
4582
8919
8154
7611
6912
6056
esta
terminologia
(-ase)
tenha
simplificado
fosfato,
acil,
carboxil
Quinases
Transaminases)
2.1.grupos com um carbono
2.2.grupos aldedo ou cetona
2.3.grupos acil
2.4.grupos glicosil
2.7.grupos fosfatos
2.8.grupos contendo enxofre
3.Hidrolases (reaes de hidrlise de ligao covalente)
3.1.steres
3.2.ligaes glicosdicas
3.4.ligaes peptdicas
3.5.ligaes C-N no peptdicas
3.6.anidridos cidos
4.Liases (catalisam a quebra de ligaes covalentes e a
remoo de molculas de gua, amnia e gs carbnico
Dehidratases e Descarboxilases)
4.1. =C=C=
4.2. =C=O
4.3. =C=N5.Isomerases (reaes de interconverso entre ismeros
ticos ou geomtricos)
5.1.racemases e epimerases
6.Ligases (catalisam reaes de formao de novas
molculas a partir da ligao entre duas pr-existentes,
sempre s custas de energia - Sintetases)
6.1. C-O
6.2. C-S
6.3. C-N
6.4. C-C
Como pode ser visto na Tabela 3.1, cada classe divide-se, por
sua vez, em subclasses, tambm numeradas. As subclasses
definem em que tipo de grupo as enzimas atuam. Por exemplo,
um determinado grupo de enzimas pode pertencer subclasse
EC 2.1, que engloba "enzimas que transferem grupos
funcionais contendo um carbono". As subclasses dividem-se
ainda em sub-subclasses; continuando com o mesmo exemplo,
existe a classe EC 2.1.1, que engloba as metiltransferases, ou
seja, enzimas que transferem um grupo metila. Finalmente,
cada enzima recebe um quarto dgito especfico reao que
catalisa, como por exemplo EC 2.1.1.1 (nicotinamida N5
propriedades
termodinmicas
de
reagentes
projetar
analisar
sistemas
reativos
de
forma
especficos,
podendo
catalisar
reaes
similares
transformando-o
em
produto
da
reao.
ltimas
normalmente
so
molculas
orgnicas
Figura 3.2. Enzima inativa (apoenzima) se une ao cofator noproteico formando um complexo cataliticamente ativo chamado
holoenzima.
Um exemplo ilustrativo da participao de cofatores o caso
que envolve a enzima glicose isomerase do Bacillus coagulans
que requer o cofator cobalto para sua atividade mxima na
isomerizao de glicose em frutose. J a glicose isomerase de
outros organismos pode catalisar essa mesma reao sem a
presena de cobalto (vide Tabela 3.2). importante citar que
enzimas com o mesmo nome, mas obtidas de diferentes
microrganismos tem, frequentemente, diferentes sequncias de
aminocidos (estrutura primria) e apresentam propriedades e
atividades catalticas diferentes.
Tabela 3.2: Algumas enzimas que contm ou requerem ons
metlicos como cofatores.
Cofator
Ca2+
Enzima
-amilase (pncreas porcino), colagenase, lipase e
nuclease
Co2+
Glicose
isomerase
(Bacillus
coagulans)
(precisa
2+
Cu2+(Cu+)
Fe2+ ou Fe3+
Mg2+
Mn2+
Na+
Zn
2+
tambm de Mg )
Galactose oxidase, Tirosinase
Catalase, Citocromos e Peroxidase
Desoxirribonuclease (pncreas bovino)
Arginase
ATPase da membrana plasmtica (tambm precisa de
K+ e Mg2+)
lcool
desidrogenase,
fosfatase
alcalina
carboxipeptidase
sofisticadas
como
cristalografia
de
raios-X,
10
V=
-dS dP
=
dt
dt
(1)
realizados
em
reatores
bem
misturados
visando
uma
dP
dS
V t 0
dt t 0
dt t 0
(2)
13
14
Vmax S
Km S
(3)
onde:
V max = E0
(4)
enzima E:
k1
S + E ES
k 1
(5)
k2
ES
P+ E
(6)
Km
k 1 S E
k1
ES
Constante de dissociao
(7)
V=
dP
=k 2 ES
dt
(8)
16
Km
k 1 S E
k1
ES Henri, Michaelis e Menten assumiram que a
ES
E S
Km
V
k ES
2
E o E ES
(11)
onde:
Eo = concentrao total de enzima (ou inicial)
E = concentrao de enzima livre
ES = concentrao de enzima complexada
17
E S
V
Km
E
S
Eo
E
K m Substituindo a equao 10 na equao 11
k2
V
k2 S
Eo
Km S
(13)
ou, melhor ainda:
V Vmax
S
Km S
(14)
com
sucesso
cintica
de
muitas
reaes
18
V S
dS
max
dt
Km S
(15)
com S(0) = S0
para se obter:
( SS )
0
(16)
m
V Vmax Vmax S
(Lineweaver-Burk)
(17)
K
S
1 1
m
V Vmax Vmax S
(Hanes-Woolf)
(18)
19
V Vm ax K m
V
S
(Eadie-Hofstee)
(19)
fornece
valores
diferentes
desses
parmetros
20
21
enzima-substrato
inativos.
Inibidores
no-
23
resduos
de
cistena.
A Figura
3.7
mostra
24
Ia
Ib
IIa
IIb
Tipo
Descrio
Resultado
Totalmente
Aumento no valor
competitivo
substrato
aparente de Km
Parcialmente
competitivo
No-competitivo
No-competitivo
III
Inibidor misto
Aumento no valor
aparente de Km
No muda Km,
diminui Vmax
No muda Km,
diminui Vmax
Afeta Km e Vmax
inibidores
competitivos
conhecidos,
chamados
25
porque
muitos
moduladores
da
atividade
26
27
E+ S ES K s
E+ I EI K i
Etapa lenta: ES E+ P k
(20)
(21)
(22)
E+ ES+ EI =E 0
(23)
k E 0 S
S K s 1 I K i
(24)
K app
m K s 1
K i
(25)
28
EI + S EIS K s
ES+ I EIS K i
(26)
(27)
29
S k E 0 1 I K i
S Ks
(28)
Vmappax
Na
presena
de
um
kE
1 I Ki
inibidor
(29)
no-competitivo,
nenhuma
competitivas
no-competitivas
so
de
fcil
cintica
enzimtica.
Em
uma
inibio
parcialmente
EI + S EIS K is
(30)
ES+ I EIS K si
(31)
30
(32)
Tipo
Ia
Competitivo
Ib
IIa
IIb
Ib e IIa
V max
Parcialmente
competitivo
V max
1+ I / K i
V max
1+ I / K i
No-competitivo
Parcialmente
competitivo
Misto
1
K s ( 1+ I / K i )
1+ I K s / K i K is
K s ( 1+ I / K i )
1
Ks
V max +k Eo /K i
1+ I K s / K i K s
V max
1
Ks
1+ I K s / K i K is
K s ( 1+ I / K i )
EIS EI + P k i
(33)
31
Vmappax S
S K app
m
(34)
app
app
Com parmetros aparentes Vmax e K max que dependem da
32
33
3.6.1 O efeito do pH
As protenas, como visto anteriormente no item 2.3 da Unidade
2, so construdas a partir de aminocidos. Estas estruturas
bioqumicas possuem grupos bsicos, neutros e cidos.
Consequentemente, a enzima intacta pode conter ambos os
grupos carregados positiva ou negativamente a um dado pH.
Deste modo, grupos ionizveis so, muitas vezes, parte do stio
ativo, visto que a ao cataltica de cidos e bases est ligada a
vrios mecanismos enzimticos. Alm disso, variaes do pH
podem alterar a estrutura tridimensional das enzimas.
34
V =k 2 E
(25 a)
k 2= A eE / RT
(25 b)
36
d [ E ]
=k d E
dt
[ E ] =[ E0 ] ek
(26 a)ou
(26 b)
kd = Ad e
(27)
V = A eE / RT E 0 ek t
a
(28)
mtodos
disponveis
para
melhoramento
da
estabilidade da enzima:
1. Adicionar compostos estabilizantes para a armazenagem;
1. Modificao qumica da protena solvel;
2. Imobilizao da protena fora ou dentro de um slido
insolvel ou matriz.
Aditivos qumicos que podem estabilizar as protenas incluem
substratos, solventes orgnicos e sais. Desde que o stio ativo
de uma enzima possa ser ao menos sua regio estvel, a
presena do substrato pode estabilizar a enzima segurando
algumas das protenas na forma de complexos enzimasubstrato.
Uma importante ferramenta em bioqumica proteica a
modificao qumica de protenas, que tambm aplicada com
sucesso para melhorar a estabilidade da enzima. Uma das
estratgias de modificao qumica envolve a adio ou
modificao de grupos R de certos resduos de aminocidos.
purificao
da
mesma.
Alm
disso,
da
enzima.
Pelo
fato
das
enzimas
serem
39
Para
isso,
geralmente
utilizam-se
materiais
empregam-se
suportes
inorgnicos
como
para
conseguir
uma
atividade
cataltica
S (molL-1)
1/V (Lminmol-1)
1/S (Lmol-1)
177
4,110-3
5649,71
243,90
173
9,510-4
5780,34
1052,63
125
5,210-4
8000
1923,07
106
1,0310-4
9433,96
9708,73
80
4,910-5
12500
20408,16
67
1,0610-5
14925,37
94339,62
43
5,110-6
23255,81
196078,43
42
15000
1/v
10000
5000
0
0
1
K 1
1
m
V Vmax S Vmax
como
Y a X b
43
V (molL-1min-1) 106
Sem inibidor
Com 10-5 M de inibidor
56
37
71
47
88
61
129
103
149
125
V (molL-1min-1)
1/VSI
10
Com 10-5 M
-1
S (molL ) Sem inibidor
1/S (Lmol-1)
de inibidor
3,310-4
56
37
3030,30
510-4
71
47
2000
6,710-4
88
61
1492,53
1,6510-3
129
103
606,06
2,2110-3
149
125
452,48
1/VCI
-1
(Lminmol )
Sem inibidor
(Lminmol-1)
Com 10-5 M de
17857,14
14084,50
11363,63
7751,93
6711,40
inibidor
27027,02
21276,59
16393,44
9708,73
8000
E.
Ollis,
D.
F.,
Biochemical
Engineering
46