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Agrcola
Escuela superior de
Agricultura del valle
del Fuerte
Materia:
Bioqumica Agrcola
Alumna:
1-6
CONTENIDOS TEMATICOS
UNIDAD I.
1. Bases moleculares de la funcin celular
1.1. Introduccin. Panormica de la Bioqumica Agrcola.
1.1.1. Concepto de la bioqumica agrcola.
1.1.2. Objetivos de la bioqumica.
1.1.3. Relacin con otras ciencias y como se divide para su estudio.
1.1.4. Aplicaciones de la bioqumica.
1.2. Lgica molecular de los organismos vivos.
1.2.1. Caractersticas que identifican a la materia viva.
1.2.2. Elementos qumicos de la materia viva.
1.2.2.1. Origen de as biomolecular.
1.2.2.2. Organizacin y estructura.
1.2.2.3. Divisin de los elementos qumicos de la materia viva.
1.3. Dependiendo de su abundancia.
1.3.1. Propiedades fsicas y qumicas de los bioelementos.
Horas tales de la unidad: 10 horas.
2. Componentes moleculares de la clula.
2.1. El agua: propiedades y capacidad disolvente de las biomoleculas.
2.1.1. Introduccin.
2.1.2. Importancia del agua.
2.1.3. Papel del agua en los procesos biolgicos
2.1.3.1. Estructura y propiedades del agua.
2.2 Disociacin del agua.
2.2.1. Escala del pH
2.2.2. cidos y bases dbiles
2.2.3. Amortiguadores
2.3. Funciones del agua
2.4. Membrana y pared celular.
UNIDAD III
3. Las protenas y sus funciones biolgicas.
3.1. Introduccin.
3.2. Aminocidos.
3.2.1. Definicin de aminocidos
3.2.2. Clasificacin de aminocidos.
3.2.3. Propiedades fisicoqumicas de los aminocidos.
3.3. Protenas
3.3.1. Definicin de protenas
3.3.2. Importancia y funciones biolgicas de las protenas.
3.3.3. Composicin de las protenas.
3.3.4. Formacin de enlaces peptdicos.
3.3.5. Niveles estructurales.
3.3.6. Clasificacin de las protenas
3.3.7. Cambios en la conformacin de las protenas y agentes
Desnaturalizantes.
UNIDAD IV
4. Enzimas.
4.1. Definicin e importancia.
4.2. Nomenclatura.
4.3. Mecanismos de accin.
4.4. Mecanismos de regulacin.
4.5. Factores que afectan la actividad.
UNIDAD V.
5. Lpidos.
5.1. Definicin e importancia
5.2. Clasificacin.
5.3. Nomenclatura.
5.4. Estructuras.
5.5. Propiedades qumicas y fsicas.
5.6. Origen e importancia.
5.7. Funciones.
5.8. Lipoprotenas y Membranas.
UNIDAD VI.
6. Carbohidratos.
6.1. Definicin e importancia
6.2. Clasificacin
6.3. Funciones de carbohidratos
6.4. Propiedades fisicoqumicas.
6.5. Representaciones qumicas de monosacridos.
6.6. Carbohidratos importantes.
6.6.1. Glucosa.
6.6.2. Glucgeno.
6.6.3. Almidones.
6.6.4. Celulosa.
6.6.5. Quitina.
UNIDAD VII
7. cidos Nucleicos
7.1. Definicin e importancia
7.2. Composicin y localizacin
7.3. Estructuras qumicas.
7.4. Formacin de nucletidos y nomenclatura
7.5. Propiedades fsicas y qumicas del DNA y RNA.
7.6. Nucletidos ms importantes (AMP, ADP, ATP).
7.7. Formacin de polinucleotidos y estructura de cidos nucleicos
7.8. Modelo de Watson y Crick.
Horas totales de la unidad: 30 Horas.
UNIDAD VIII
8. Sistemas energticos en los seres vivos.
8.1.1.-Respiracion
8.1.1. Resumen histrico.
8.1.2. Estructuras Mitocondriales.
8.1.3. Tipos de reacciones.
8.1.4. Importancia del ciclo de Krebs.
8.1.5. Tipos de respiracin (aerbica y anaerbica).
8.1.6. Factores que afectan la respiracin.
8.1.7. Funciones del ATP e importancia.
8.1.8. Cociente Respiratorio.
8.1.9. Respiracin de rganos separados de la planta
8.1.10. Fermentacin
8.1.10.1. Lactancia.
8.1.10.2. Alcohlica.
8.1.11. Quimiosntesis.
8.1.12. Fotorrespiracion
Primer parcial
Personajes de la bioqumica:
Carl Wilhelm Scheele
(1742-1786) Qumico sueco que naci el 9 de diciembre de 1742 en Stralsund,
Pomerania, Suecia. En 1770 aisl el cido tartrico, despus en 1774 descubri el
cloro, reconoci el manganeso como metal, estudio la oxidacin del mercurio, del
hierro y del cobre. En 1777 public Observaciones qumicas y experimentos
sobre el aire y el fuego, donde expuso su idea de que la atmsfera se constitua
de dos gases, uno inerte y otro comburente (oxgeno) que l llamaba aire fuego.
Otros descubrimientos de Scheele fueron la glicerina, el sulfuro de hidrgeno, el
tungsteno, el cido lctico, adems de ampliar los conocimientos sobre otros
cidos orgnicos.
Jns Jacob Berzelius
(1779-1848) Qumico sueco a quien se debe el desarrollo de la teora atmica.
Sus numerosos trabajos de investigacin, los cuales sentaron las bases
estructurales de la qumica moderna. Descubri los elementos Cerio, Selenio y
Torio, aisl el calcio, el silicio y el circonio y estudio los compuestos de flor, pero
lo ms trascendental de este hombre, fue usar mtodos de anlisis cuantitativo.
Fue el primer cientfico en usar smbolos y frmulas qumicas como sistema de
anotacin. Por su labor tan importante sus bigrafos de han llamado el Newton de
la Qumica.
Friedrich Whler
(Eschersheim, actual Alemania, 1800-Gotinga, id., 1882) Qumico alemn.
Discpulo de L. Gmelin y de J. Berzelius, ense desde 1836 en la Universidad de
Gotinga. Su nombre est unido sobre todo a la sntesis de la urea (1828), que tuvo
una gran repercusin en el desarrollo de la qumica en el siglo XIX, al echar por
tierra la teora que defenda que los compuestos orgnicos no pueden ser
preparados mediante procesos de sntesis. Conjuntamente con Liebig, llev a
cabo investigaciones sobre el cido rico y sus derivados.
Membrana biolgica:
Las membranas biolgicas son superficies delgadas y flexibles, que separan a las
clulas y a compartimentos dela clula de su medio. Todas las membranas poseen
una composicin comn, pero pueden tener propiedades diferentes. Las
membranas son abundantes en fosfolpidos, los cuales forman una doble bicapa
en medio acuoso. Adems contienen protenas, que junto con los lpidos pueden
difundirse dentro de la membrana, y as obteniendo propiedades de mosaico
fluido. Las membranas son asimtricas, tanto la carexterna como la interna
poseen protenas y propiedades diferentes
Importancia biolgica
- separan un medio del exterior
- regulan el trfico celular
- divide el espacio interno
- organiza secuencias de reacciones
- participa en la conservacin de energa biolgico
- importante en la comunicacin intracelular
Estructura
La membrana se concibe como una estructura dinmica. El modelo que es
aceptado hoy en da se conoce como "mosaico fluido", que consiste en una bicapa
lipdica complementada con una gran variedad de protenas . La bicapa se
mantiene unida por enlaces no covalentes.
Esta estructura general se presenta tambin en todo el sistema endomembranas
(membranas de los orgnulos del interior de la clula), como retculo
endoplasmtico, aparato de Golgi, envoltura nuclear, mitocondria y los plastos.
-Bcapa lipdica: las bicapas lipdicas son estructuras laminares con una serie de
caracteristicas que las hacen idneas para actuar como membranas biolgicas:
Funciones
La principal funcin de la membrana es la de mantener el entorno intracelular
diferenciado del entorno. Esto gracias a la naturaleza aislante de la bicapa lipdica
en medio acuoso y a las funciones de transporte que desempean las protenas.
Algunos esteroides como el colesterol, realizan un importante papel en la
regulacin de las propiedades fisico-qumicas de la membrana regulando su
resistencia y fluidez.
3. Carga: las molculas con carga y los iones no pueden pasar. Sin embargo
algnas sustancias con carga pueden pasar por los canales proteicos o con la
ayuda de una protena transportadora.
Tambin influyen las protenas de tipo:
Canales: son protenas que forman canales llenos de agua por donde pasan las
molculas polares que no lo pueden hacer de forma normal.
Transportadoras: son protenas que se unen a la sustancia en un lado de la
membrana y la liberan en el otro lado.
Segundo parcial
Hidrocarburos
Hidrocarburos: Son compuestos orgnicos formados solamente por carbono e
hidrgeno.
Podemos clasificarlos en: Alcanos, Alquenos y Alquinos.
Alcanos: En ellos todos los enlaces Carbono-Carbono (C-C) son simples.
Alquenos: En ellos hay al menos un enlace doble.
Alquinos: En ellos hay al menos un enlace triple.
Tambin se conoce como qumica del carbono porque este elemento est
presente en todas sus molculas.
Hay una serie de elementos que forman parte principalmente de estos
compuestos: Carbono (C), Hidrgeno (H), Oxgeno (O), Nitrgeno (N).
El carbono (C) tiene 4 electrones en la capa de valencia. Por tanto va a formar
siempre 4 enlaces covalentes.
Los enlaces pueden ser: simples, dobles y triples.
El carbono puede unirse con otros carbonos formando de esta manera cadenas de
compuestos carbonados.
El hidrgeno solo tiene un electrn formando un enlace covalente simple.
Los compuestos orgnicos se representan mediante una frmula que puede
ser emprica, molecular y estructural.
Emprica: Con/En la emprica se expresa la proporcin en la que estn los
distintos elementos.
Molecular: Indica el nmero de tomos totales del compuesto.
Estructural: Indica todos los enlaces que existen en la molcula.
Sueo de Kekul
NIGHTFLYER/WIKIMEDIA
Grupos funcionales
El grupo funcional es un tomo o conjunto de tomos unidos a una cadena carbonada,
representada en la frmula general por R para los compuestos alifticos y
como Ar(radicales arlicos) para los compuestos aromticos. Los grupos funcionales son
responsables de la reactividad y propiedades qumicas de los compuestos orgnicos.
La combinacin de los nombres de los grupos funcionales con los nombres de
los alcanos de los que derivan brinda una nomenclatura sistemtica poderosa para
denominar a los compuestos orgnicos.
Los grupos funcionales se asocian siempre con enlaces covalentes, al resto de la
molcula. Cuando el grupo de tomos se asocia con el resto de la molcula primeramente
mediante fuerzas inicas, se denomina ms apropiadamente al grupo como un ion
poliatmico o ion complejo.
Que es un aminocido?
Sntesis proteica
Se conoce como sntesis de protenas al proceso por el cual se componen
nuevas protenas a partir de los veinte aminocidos esenciales. En este proceso,
se transcribe el ADN en ARN. La sntesis de protenas se realiza en los ribosomas
situados en el citoplasma celular.
En el proceso de sntesis, los aminocidos son transportados por ARN de
transferencia correspondiente para cada aminocido hasta el ARN mensajero
donde se unen en la posicin adecuada para formar las nuevas protenas.
Al finalizar la sntesis de una protena, se libera el ARN mensajero y puede
volver a ser ledo, incluso antes de que la sntesis de una protena termine, ya
puede comenzar la siguiente, por lo cual, el mismo ARN mensajero puede
utilizarse por varios ribosomas al mismo tiempo.
Tercer parcial
Carbohidratos:
Los carbohidratos, tambin llamados hidratos de carbono, azcares o glcidos,
estn formados por C, H y O.
Los Carbohidratos son principalmente compuestos energticos utilizados como
combustible celular para realizar sus funciones. Los carbohidratos pueden tambin
formar sustancias de reserva y almacenarse para cuando la clula los necesite, ya
sea como almidn en los vegetales o como glucgeno en los animales. Los
hidratos de carbono sirven como material combustible o energtico inmediato,
como donantes de energa para la termognesis y para el rendimiento en el
trabajo.
De acuerdo con sus estructuras se clasifican en:
MONOSACARIDOS:
Los monosacridos o azcares simples son los glcidos ms sencillos, que no se
hidrolizan, es decir, que no se descomponen para dar otros compuestos,
conteniendo de tres a seis tomos de carbono. Su frmula es (CH2O)n donde n
3.
DISACRIDOS:
Estn formados por la unin de dos monosacrido iguales o distintos. Los
disacridos ms comunes son:
* Sacarosa: Formada por la unin de una glucosa y una fructosa.
* Lactosa: Formada por la unin de una glucosa y una galactosa.
* Maltosa: Formada por la unin de dos glucosas.
La formula de los disacridos es C12H22O11. El enlace covalente entre dos
monosacridos provoca la eliminacin de un tomo de hidrgeno de uno de los
monosacridos y de un grupo hidroxilo del otro monosacrido.
POLISACRIDOS:
Los polisacridos son biomolculas formadas por la unin de una gran cantidad de
monosacridos. Se encuadran entre los glcidos, y cumplen funciones diversas,
sobre todo de reserva energtica y estructural.
Homopolisacridos. Son polisacridos que son polmeros de un solo
monosacrido.
Heteropolisacrido. Son los que tienen ms de una clase de monosacridos
Importancia mdica
Celulosa. La celulosa ocupa el 50% de carbono orgnico en toda la biosfera, la
Conceptos:
Lpidos:
Los lpidos son biomolculas orgnicas formadas bsicamente por carbono e
hidrgeno y generalmente, en menor proporcin, tambin oxgeno. Adems
ocasionalmente pueden contener tambin fsforo, nitrgeno y azufre .
Es un grupo de sustancias muy heterogneas que slo tienen en comn estas dos
caractersticas:
Son insolubles en agua
Son solubles en disolventes orgnicos, como ter, cloroformo, benceno, etc.
Los lpidos tambin pueden clasificarse segn su consistencia a temperatura
ambiente:
Aceite: cuando la grasa es lquida (aceite de oliva)
Grasa: cuando la grasa es slida (manteca de cerdo).
cidos grasos
Los cidos grasos son los componentes caractersticos de muchos lpidos y rara
vez se encuentran libres en las clulas. Son molculas formadas por una larga
Esterificacin
Se denomina esterificacin al proceso por el cual se sintetiza un ster. Un ster es
un compuesto derivado formalmente de la reaccin qumica entre un cido
carboxlico y un alcohol.
Comnmente cuando se habla de steres se hace alusin a los steres de cidos
carboxlicos, substancias cuya estructura es R-COOR', donde R y R' son grupos
alquilo. Sin embargo, se pueden formar en principio steres de prcticamente
todos los oxicidos inorgnicos. Por ejemplo los steres carbnicos derivan del
cido carbnico y los steres fosfricos, de gran importancia en Bioqumica,
derivan del cido fosfrico.
ster
ster carbnico
ster fosfrico
Ceras:
Las ceras son steres de los cidos grasos con alcoholes de peso molecular
elevado, es decir, son molculas que se obtienen por esterificacin, reaccin
qumica entre un cido carboxlico y un alcohol, que en el caso de las ceras se
produce entre un cido graso y un alcohol monovalente lineal de cadena larga.
Son sustancias altamente insolubles en medios acuosos y a temperatura ambiente
se presentan slidas y duras. En los animales la podemos encontrar en la
superficie del cuerpo, piel, plumas, etc. En vegetales las ceras recubren en la
epidermis de frutos, tallos, junto con la cutcula o la suberina, que evitan la prdida
de agua por evaporacin en las plantas. Otro ejemplo es la cera de abeja,
constituida por un alcohol (C30H61OH) y cido palmtico ((CH3(CH2)14COOH)).
Organismos que forman plancton son ricos en ceras, por esta razn, animales
marinos de regiones fras, cuyo alimento principal es el plancton, acumulan ceras
como principal reserva energtica
Fosfolpidos:
Estn formados por cadenas de cidos grasos unidos a un glicerol que contiene
un grupo fosfato en su carbono. Este fosfato generalmente contiene otro grupo
polar que frecuentemente contiene un tomo de nitrgeno con carga elctrica
positiva presentando as caractersticas anfipticas. Al derivarse de la glicerina
reciben el nombre de fosfoglicridos y al producirse de la esfingosina adquieren el
nombre de esfingolpidos.
Acilgliceridos:
Son lpidos simples formados por la esterificacin de una, dos o tres molculas de
cidos grasos con una molcula de glicerina tambin llamada glicerol. Reciben as
mismo el nombre de glicridos o grasas simples. Segn el nmero de cidos
grasos que sustituirn a los hidrgenos correspondientes a los grupos oxhidrilo de
la molcula. Se distinguen tres tipos de estos lpidos: los monos glicridos, que
contienen una molcula de cido graso, los di glicridos, con dos molculas de
cidos grasos, los triglicridos, con tres molculas de cidos grasos. Los
Acilgliceridos al reaccionar con las bases fuertes dan lugar a reacciones de
saponificacin en la que se producen molculas de jabn.
Estructuras:
Glucgeno:
Funciones de la vitamina A, E y K.
Vitamina A
Dos tipos diferentes de vitamina A se encuentran en la alimentacin. La vitamina A
preformada se encuentra en productos de origen animal como carne de res,
pescado, aves de corral y productos lcteos. El otro tipo, provitamina A, se
encuentra en alimentos de origen vegetal, como frutas y verduras. El tipo ms
comn de provitamina A es el betacaroteno.
La vitamina A tambin est disponible en suplementos dietticos, generalmente en
forma de acetato de retinilo o palmitato de retinilo (vitamina A preformada),
betacaroteno (provitamina A) o una combinacin de vitamina A preformada y
provitamina A.
Funciones
La vitamina A ayuda a la formacin y al mantenimiento de dientes, tejidos blandos
y seos, membranas mucosas y piel sanos. Se conoce tambin como retinol, ya
que produce los pigmentos en la retina del ojo.
Esta vitamina favorece la buena visin, especialmente ante la luz tenue. Tambin
se puede requerir para la reproduccin y la lactancia.
El retinol es una forma activa de vitamina A y se encuentra en los hgados de
animales, la leche entera y algunos alimentos fortificados.
Los carotenoides son tintes (pigmentos) de color oscuro que se encuentran en
alimentos de origen vegetal y que pueden transformarse en una forma de vitamina
A. Hay ms de 500 carotenoides conocidos y uno de ellos es el betacaroteno.
Fuentes alimenticias
La vitamina A proviene de fuentes animales como los huevos, la carne, la leche, el
queso, la crema de leche, el hgado, el rin y el aceite de hgado de bacalao y de
hipogloso. Sin embargo, todas estas fuentes, a excepcin de la leche descremada
fortificada con vitamina A, tienen un alto contenido de grasa saturada y colesterol.
Las fuentes de betacaroteno abarcan:
Vitamina E
Es una vitamina liposoluble.
Funciones
La vitamina E es un antioxidante que protege el tejido corporal del dao causado
por sustancias llamadas radicales libres. Estos radicales pueden daar clulas,
tejidos y rganos, y se cree que juegan un papel en ciertas afecciones
relacionadas con el envejecimiento.
El cuerpo tambin necesita vitamina E para ayudar a mantener el sistema
inmunitario fuerte frente a virus y bacterias.
La vitamina E tambin es importante en la formacin de glbulos rojos y ayuda al
cuerpo a utilizar la vitamina K. Tambin ayuda a dilatar los vasos sanguneos y a
impedir que la sangre se coagule dentro de ellos.
Las clulas usan la vitamina E para interactuar entre s y llevar a cabo muchas
funciones importantes.
An no se sabe si la vitamina E puede prevenir el cncer, la cardiopata, la
demencia, la enfermedad heptica y el accidente cerebrovascular.
Fuentes alimenticias
La mejor manera de obtener los requerimientos diarios de vitamina E es
consumiendo fuentes alimenticias. La vitamina E se encuentra en los siguientes
alimentos:
Vitamina K
La vitamina K se conoce como la vitamina de la coagulacin, porque sin ella la
sangre no coagulara. Algunos estudios sugieren que ayuda a mantener los
huesos fuertes en los ancianos.
Fuentes alimenticias
La mejor manera de obtener los requerimientos diarios de vitamina K es
consumiendo fuentes alimenticias. La vitamina K se encuentra en los siguientes
alimentos:
Hortalizas de hoja verde, como la col, la espinaca, las hojas de nabos, la col
rizada, la acelga, las hojas de mostaza, el perejil, la lechuga romana y la
lechuga de hoja verde.
Funcin de citoquininas:
Las citoquininas o citocininas constituyen un grupo de hormonas vegetales que
promueven la divisin y la diferenciacin celular.
Su nombre proviene del trmino citokinesis que se refiere al proceso de divisin
celular, el cual podra ser considerado como el segundo proceso madre de todos
los procesos fisiolgicos en los vegetales, ya que a este proceso le antecede en
importancia la diferenciacin celular, la cual se encarga de dar origen a la
formacin de cada uno de los rganos de cualquier vegetal.
Mediante este proceso (el ms primordial del reino vegetal) predominantemente
citocinnico, las clulas vegetales son transformadas en otro tipo de clulas
especficas para formar un rgano en particular, ya sean races, hojas, flores o
frutos, ya que cada uno tiene diferentes tipos de clulas. Estos eventos, no se
realizan de manera exclusiva por las citocininas, desde luego, sino que estas
hormonas son las encargadas de causar el efecto diferenciacin celular, de dar la
orden y de dirigir el proceso, en el cual intervienen otras sustancias con las que
las citocininas realizan esta tarea conjuntamente. Sin las citocininas,
probablemente no habra diferenciacin de rganos vegetales
Funcin de los gilberilinas:
La giberelina es una fitohormona. Se producen en la zona apical, frutos y
semillas.
Sus funciones son:
Cuarto parcial
ACIDOS NUCLEICOS
Existen dos tipos de cidos nucleicos: ADN (cido desoxirribonucleico) y ARN (cido
ribonucleico), que se diferencian:
por las bases nitrogenadas: adenina, guanina, citosina y timina, en el ADN; adenina,
guanina, citosina y uracilo, en el ARN;
ESTRUCTURA DE ADN