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Urocultivo
Introduccin.
La infeccin urinaria (IU) es una de las infecciones ms frecuentes, que puede afectar tanto a
pacientes internados, como ambulatorios. Esta patologa se presenta en nios y adultos, alcanzando
su mayor prevalencia en las mujeres, aunque aumenta su incidencia en hombres mayores de 45 aos
y en cualquier enfermo con factores urolgicos predisponentes.
En pediatra, la IU tiene una connotacin muy especial, puesto que es un factor desencadenante de
cicatrices renales que pueden conducir a insuficiencia renal. El riesgo de formacin de dichas
cicatrices en nios con tracto urinario estructuralmente normal tiene que ver con:
1. el primer episodio de pielonefritis antes de los 3 aos.
2. reflujo vesicoureteral de grados IV o V, conjuntamente con bacteriuria.
3. retardo en la instauracin de la antibiticoterapia despus de establecida la pielonefritis.
Por lo tanto, el subdiagnstico o la demora en el diagnstico de una IU en un nio puede ser
determinante del futuro de su funcin renal. Por otra parte, el sobrediagnstico induce a la
utilizacin de procedimientos diagnsticos invasivos, como la cistouretrografa. Dentro de este
contexto, el microbilogo debe evitar pasar por alto la documentacin de una IU, sin que esto
signifique "fabricar" esta patologa mediante la interpretacin errnea de un cultivo contaminado.
En efecto, como se detallar ms adelante, el procesamiento del urocultivo exige el conocimiento
previo de ciertos datos concernientes a la muestra y al paciente. Por otra parte, el informe final de
un resultado correcto no puede llevarse a cabo sin un anlisis exhaustivo, el cual demanda la
transferencia e integracin de conceptos clnicos, epidemiolgicos y microbiolgicos previamente
adquiridos y debidamente actualizados. En este sentido, vale la pena recordar la clasificacin de las
situaciones fisiopatolgicas ms frecuentes de la IU (fig 1).
Cuando el cultivo de orina se realiza aplicando tcnicas no invasivas para la toma de la muestra,
como el chorro medio, presenta problemas de interpretacin en cuanto al desarrollo microbiano.
Esto es as porque la orina debe atravesar la uretra colonizada, perdiendo as su condicin de
esterilidad que le asegura la vejiga en condiciones normales. De hecho, estudios cuantitativos,
realizados desde hace varias dcadas, indican que los recuentos de unidades formadoras de colonias
por mililitro (UFC/ml) a partir de muestras de orina, son normalmente mayores cuando las bacterias
estn produciendo IU que cuando se trata de colonizantes o contaminantes de la zona periuretral
arrastrados por la orina. Es importante enfatizar entonces, que el estudio para descartar o
documentar una bacteriuria significativa, debera, al menos, incluir el cultivo semicuantitativo de la
orina, como as tambin el anlisis del sedimento y eventualmente la realizacin de coloraciones
especficas, como Gram y Ziehl-Neelsen.
Recoleccin de la Muestra.
1.- Nios y adultos que controlan esfnteres: La muestra de eleccin es el chorro medio
miccional. El tiempo de retencin deseado es de, por lo menos, 3 horas.
Mujeres: se debe higienizar la zona genital con agua y jabn, de adelante hacia atrs, secar con
toalla limpia, y se debe colocar un tapn vaginal (torunda de gasa o algodn.) Se elimina el primer
chorro (10 ml) y se recolecta en frasco estril la fraccin siguiente (10-20 ml). Se recomienda orinar
separando los labios mayores.
Hombres: se debe retraer el prepucio e higienizar el glande y surco balanoprepucial con agua y
jabn, y secar con toalla limpia. Se elimina el primer chorro (10 ml) y se recolecta en frasco estril
la fraccin siguiente (10-20 ml). Se desaconseja el uso de antispticos, ya que pueden afectar el
resultado del urocultivo, provocando un descenso en el recuento de colonias.
2.- Nios y adultos que no controlan esfnteres: Nunca utilizar bolsas colectoras para el estudio
de urocultivo.
Existen, al menos, tres alternativas. Recordar que la mayora de estas muestras no cumplen con el
tiempo de retencin deseado. Se recomienda alguno de los siguientes procedimientos:
A. Al acecho: el mtodo se aplica con los lactantes y es similar al descrito para los pacientes
que controlan esfnteres. La dificultad estriba en que se desconoce cul ser el momento en
que se va a producir la miccin. El operador deber esperar entonces a que la misma se
produzca y recoger en un frasco estril lo que seguramente ser la porcin media del
chorro miccional.
B. Puncin suprapbica: este procedimiento deber ser efectuado por mdicos entrenados.
En principio, se reserva para casos especiales, como neonatos graves, pacientes cuyos
urocultivos previos presenten resultados conflictivos, sospecha de microorganismos de
difcil desarrollo, etc. Primeramente se verifica que el paciente presente globo vesical
palpable, se desinfecta zona pubiana con alcohol yodado y se deja actuar 1 min., se limpia
con alcohol 70% y se punza con aguja adecuada en la zona ubicada 1 o 2 cm encima del
pubis. Se aspira la orina y se vuelca en frasco estril.
C. Cateterizacin: se utiliza en pacientes en los que habitualmente se practica el cateterismo
intermitente (enfermos con vejiga neurognica). En algunos centros lo utilizan para
lactantes en lugar de la toma al acecho, ya que presenta la ventaja de ser una toma ms
rpida y confiable cuando se realiza por personal entrenado. Sin embargo, presenta el riesgo
de producir el ascenso de los microorganismos desde la uretra a la vejiga y generar as una
IU iatrognica. Para efectuar este mtodo se desinfecta la zona perineal, se introduce la
sonda por la uretra y se recoge la porcin media del chorro de orina que sale por la sonda.
Del mismo modo pueden obtenerse muestras a partir de ureterostomas, nefrostomas o
vesicostomas. La diferencia puede radicar en que los catteres a utilizar podran ser de
menor dimetro. En estos casos, se deja fluir la orina retenida en la boca del conducto, se
limpia la misma con un hisopo humedecido en alcohol, se introduce el catter en el
conducto y se permite el drenaje de la orina al exterior. La parte media del chorro se recoge
en un recipiente estril.
3.- Enfermos sondados: Nunca tomar la orina que fluye del extremo distal de una sonda que no es
nueva (recin colocada).
A. Puncin de la sonda: este procedimiento se utiliza en aquellos enfermos con sonda
permanente en los que no es posible retirar o reemplazar la sonda. Se obtura la sonda con
una pinza "ad hoc". Se espera unos minutos, se desinfecta la parte externa de la sonda en la
zona proximal con alcohol yodado y se punza la sonda con aguja y jeringa estril. Se vuelca
el contenido en forma asptica en un frasco estril.
B. Recoleccin a travs de una sonda estril recin colocada: se recoge directamente la
orina que fluye por el extremo distal de la sonda nueva en un frasco estril. Si se trata de un
recambio de sonda, es importante considerar la posibilidad que se produzca la resuspensin
de bacterias de la zona uretral en la orina vesical. Esto puede resultar en la presencia
transitoria de bacterias en la orina y dar lugar a cultivos falsamente positivos. En estos
casos, es recomendable una nueva muestra por puncin de la sonda al da siguiente.
Conservacin de la muestra.
Una vez obtenida la muestra y el cuestionario respondido, la marcha del urocultivo comienza y
sigue estos pasos:
Sedimento.
El sedimento de orina, realizado con una muestra correctamente recolectada, es una herramienta
fundamental para la interpretacin del urocultivo. Sin embargo, su sensibilidad y especificidad
depende de ciertos factores, como el tipo de muestra, el tiempo de retencin, el sexo y la edad del
paciente y la presencia de otras patologas.
Se considera que un sedimento de orina no es normal cuando una gota del centrifugado de 10 ml
(10 min. a 2.000 rpm) contiene ms de 5 leucocitos por campo de 400X. Con respecto a los adultos,
tanto en las mujeres como en los hombres mayores de 45 aos, el sedimento pierde sensibilidad y
especificidad, con respecto a los menores de 45 aos. Es decir, entre los mayores hay ms pacientes
con sedimento patolgico (ms de 5 leucocitos/cpo de 400X) sin Bacteriuria y ms pacientes con
Bacteriuria Significativa (BS) y sedimento normal.
En el caso de los pacientes peditricos, existe una buena correlacin entre la observacin "entre
porta y cubreobjetos" y los recuentos en cmara de Neubauer. Sin embargo, tanto la sensibilidad,
como el valor predictivo negativo en esta poblacin, son extremadamente bajos. Distintos autores
afirman que, la especificidad y el valor predictivo positivo son lo suficientemente satisfactorios
como para considerar al sedimento un complemento til del urocultivo en los nios.
Finalmente, la presencia de un sedimento patolgico resulta de suma utilidad para adoptar una
conducta racional en la interpretacin del cultivo.
Coloracin de Gram.
Es bien conocido que la presencia de 1 microorganismo/cpo de 1000X en la coloracin de Gram de
una gota de orina se correlaciona con un cultivo de ms de 105 UFC/ml. Sin embargo, este
procedimiento carece de sensibilidad, puesto que se est trabajando en el lmite de deteccin del
microscopio ptico (1000X) y del mtodo, ya que la observacin de una sola bacteria se
correlaciona con recuentos >105. Adems de lo tedioso que resulta recorrer muchos campos antes
de descartar una muestra como negativa, actualmente se sabe que muchas infecciones vesicales
cursan con recuentos 1000 UFC/ml (ver ms adelante). Por otra parte, la presencia de grmenes
contaminantes no puede inferirse en todos los casos mediante esta metodologa. No obstante, la
coloracin de Gram constituye un buen control de calidad del sedimento y del cultivo. Adems,
puede ser de utilidad para la documentacin rpida de BS, con la consiguiente orientacin adicional
sobre el tipo de microorganismo involucrado en algunos casos particulares de pacientes
sintomticos o de alto riesgo, en los que el mdico quiera adoptar una teraputica antimicrobiana
precoz. Finalmente, hay indicaciones claras para la realizacin de una coloracin de Gram de la
orina:
1. Pacientes que estn recibiendo antibiticos.
2. Pacientes que presentan sedimento patolgico con cultivos negativos, para verificar la
presencia de microorganismos exigentes. En este sentido, debe realizarse adems una
coloracin de Ziehl-Neelsen del sedimento de la orina.
3. Pacientes con sepsis de punto de partida urinario
Cultivo
Siembra: La siembra debe realizarse de la orina sin centrifugar con un ansa calibrada, lo que
permitir obtener una estimacin semicuantitativa del desarrollo microbiano. Existen numerosos
medios de cultivo para sembrar una muestra de orina. La eleccin del medio de cultivo debe
contemplar la relacin costo-beneficio, de modo de elegir la opcin que permita la recuperacin de
la mayora de los patgenos con el menor costo posible. Para tal fin, el microbilogo debe tener en
cuenta cierta informacin bsica:
1. El 70-80% de los urocultivos enviados al laboratorio resultan "negativos".
2. El 85-90% de las IU son producidas por enterobacterias.
3. De los grmenes gram-positivos, los que se aslan con mayor frecuencia son
enterococos y estafilococos.
4. El medio CLDE permite el desarrollo de bacilos gram-negativos, estafilococos
y enterococos. Los medios de Levine, EMB o MacConkey permiten
Si bien esta tabla resulta ilustrativa, es muy probable que el microbilogo no cuente con los datos de
los sntomas del paciente en la mayora de los casos. Afortunadamente, en ciertos grupos de
pacientes, existe una correlacin aceptable entre los sntomas y la presencia de reaccin
inflamatoria en el sedimento de orina. Por lo tanto, el microbilogo podra inferir la presencia de
sntomas en base al sedimento de orina, slo a los fines de adoptar un criterio de informe, y asumir
para s el trmino de bacteriuria significativa (BS) en lugar del de infeccin urinaria. De este modo,
se puede reformular la tabla 4 y adoptar un criterio de informe en base a la propuesta de la tabla 5.
En dicha tabla, la mencin de BS sugiere que el informe debera incluir el recuento, el nombre de la
especie y el antibiograma. El hecho de informar al mdico estos tres elementos, expresa claramente
que para el microbilogo, desde el punto de vista del laboratorio, el hallazgo es significativo. Es
necesario enfatizar, que los criterios de informe son difciles de unificar y que algunos casos
particulares pueden escapar a la propuesta de la tabla 5. Esta propuesta puede extenderse a las
muestras tomadas por sonda.
Tabla 5.
Sin embargo, debe recordarse que virtualmente cualquier recuento es significativo cuando se trata
de bacilos gram-negativos aislados de una puncin suprapbica. Para los cocos gram-positivos,
especialmente estafilococos, se habla de recuentos mayores de 103, puesto que stos podran ser
contaminantes adquiridos de piel durante el procedimiento de la puncin. En el caso de los
pacientes peditricos, resulta imperioso establecer los criterios de interpretacin en base al tipo de
muestra y al sexo. Como se muestra en la tabla 6, las posibilidades de padecer IU varan en este
sentido. Con respecto a la puncin suprapbica, se sugiere el mismo criterio que para los adultos.
Tabla 6.
B. Cultivo polimicrobiano.
Cuando se habla de cultivo polimicrobiano de orina, se hace referencia a la presencia de 2 o ms
grmenes, habitualmente dos, en recuentos mayores de 105 UFC/ml y en proporciones similares. El
predominio de un germen en una muestra en una proporcin del 90% debe asumirse como
monomicrobiano.
La IU mixta, producida por 2 o ms grmenes, es extremadamente infrecuente (<0,3%) en pacientes
ambulatorios no sondados. El microbilogo debe saber que el informe de una IU mixta infiere
inexorablemente la presencia de un factor urolgico predisponente. Por otra parte, esta infeccin es
ms prevalente en los pacientes internados sondados y en algunos enfermos con determinadas
patologas que afectan el tracto urinario. Por lo tanto, toda IU polimicrobiana, debera documentarse
con, por lo menos, 2 muestras. La ausencia de reaccin inflamatoria siempre debera despertar la
sospecha de una probable contaminacin.
Resumiendo, la IU polimicrobiana significativa puede ser asumida como tal, con bajo margen de
error, si se documenta una mezcla con ms de 105 UFC/ml de 2 o ms grmenes en igual
proporcin, en 2 muestras de orina correctamente recolectadas, las cuales deberan mostrar adems
un sedimento francamente patolgico.
Identificacin
1. Antibiograma
Una vez que se ha determinado que un cultivo es significativo, el microbilogo debe realizar el
antibiograma. Para tal fin, resulta suficiente en la mayora de los casos, el ensayo de difusin con
discos en agar (mtodo de Kirby- Bauer). Si bien los detalles tcnicos de este mtodo pueden
encontrarse en una variedad de libros de texto, la eleccin de los discos no es una prctica sencilla.
La tabla 7 muestra una lista de antibiticos sugeridos para ensayar slo con fines teraputicos. Por
lo tanto, la tabla no incluye ciertas drogas tiles para la vigilancia de algunos mecanismos de
resistencia de importancia clnica, ni para la bsqueda de resistencia asociada, ni para la sospecha
de determinadas especies por el antibiotipo.
El microbilogo debe recordar que lo importante es ensayar e informar los antibiticos de eleccin
para el tratamiento de la IU y los que sean apropiados para las distintas especies (no informar un
antibitico frente a una especie que es naturalmente resistente al mismo). Finalmente, se debe
considerar el precio y la toxicidad de la droga. Es decir, tratar de informar la droga ms barata y
menos txica, cuando esto sea posible.
En base a estas consideraciones se dise la tabla 7.
Tabla 7.
Aspectos Microbiologicos.
Consideraciones generales
Como se mencion anteriormente, la IU es una dolencia que puede afectar a varones y mujeres de
todas las edades. Se dice que cualquier mujer va a sufrir un episodio de IU en algn momento de su
vida. Por el contrario, la prevalencia de IU en hombres menores de 45 aos sin factores urolgicos
predisponentes es inferior al 1%. Sin embargo, en los hombres mayores de 65 aos, la incidencia de
IU es similar a la de las mujeres (alrededor del 25%). Esto se debe al desarrollo de factores
urolgicos condicionante. Por otra parte, vale la pena mencionar a una poblacin especial: los
pacientes con trasplante renal. Un estudio realizado en el CEMIC por Bantar y col., mostr una
incidencia de IU en los primeros 6 meses postrasplante del 41%, siendo Enterococcus faecalis y
Enterobacter cloacae las especies ms prevalentes. El 15% de estos enfermos desarroll
bacteriemia a partir del foco urinario.
Para el anlisis de la prevalencia comparativa de los diferentes microorganismos asociados a IU
ambulatoria, es necesario considerar el sexo, la edad y eventualmente algunos factores adicionales,
como enfermedad de base o factores urolgicos condicionantes. La figura 2 muestra la prevalencia
comparativa de los agentes causales del primer episodio de IU en mujeres ambulatorias
discriminadas en mayores y menores de
45 aos en un estudio realizado C. Bantar a lo largo de 2 aos. Si bien Escherichia coli fue el
microorganismo ms frecuentemente aislado en ambas poblaciones, se observaron diferencias
significativas en la prevalencia de Staphylococcus saprophyticus en las menores y de E. faecalis en
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Consideraciones particulares
1. Staphylococcus saprophyticus: es el segundo microrganismo causante de IU en mujeres jvenes.
El microbilogo debe estar alerta para no descartarlo como contaminante cuando se encuentra en
recuentos bajos, ya que si no se identifica a nivel de especie puede confundirse con cualquiera de
las otras especies de Staphylococcus coagulasa-negativa contaminantes de piel. S. saprophyticus es
resistente a novobiocina. Si bien existen varias especies de estafilococos con estas caractersticas,
ellas son infrecuentemente aisladas de materiales clnicos, especialmente de orina. Ellas se
diferencian de S. saprophyticus por las pruebas de ureasa, fermentacin de xilosa y sacarosa. S.
saprophyticus es xilosa (), sacarosa (+) y ureasa (+).
2. Proteus mirabilis: puede ser tan frecuente como E. coli en nios mayores. En hombres adultos
tambin aumenta su prevalencia y se asocia a complicaciones urolitisicas debido a su capacidad de
hidrolizar la urea, aumentando el pH y favoreciendo as, la formacin de clculos de estruvita y
apatita. Por otra parte, existen evidencias de su capacidad de colonizar el tracto urinario y la
superficie de los catteres mediante su propiedad conocida como "swarming".
3. Klebsiella pneumoniae: suele ser ms prevalente en las recurrencias que en los primeros
episodios de IU.
4. Providencia spp. y Morganella morganii: se aslan frecuentemente de pacientes con sonda de
larga permanencia y con tratamiento antibitico previo.
5. Pseudomonas aeruginosa, Enterobacter cloacae y Klebsiella spp.: se aslan frecuentemente de
pacientes internados, sondados, o con algn otro factor urolgico predisponente, como insuficiencia
o trasplante renal, o enfermos sometidos a instrumentacin del tracto urinario.
6. Enterococos: se aslan de pacientes internados, de pacientes ambulatorios mayores de 60 aos
(sobre todo hombres), de pacientes con trasplante renal y en el 10% de nios con una patologa de
base predisponente.
7. Haemophilus spp.: ha sido aislado ocasionalmente de hombres adultos y algunos nios con
alteraciones de las vas urinarias.
8. Gardnerella vaginalis, Streptococcus agalactiae y Ureaplasma urealyticum: han sido
identificados como agentes etiolgicos de IU en ambos sexos, pero con mayor prevalencia en
mujeres embarazadas. Sin embargo, es necesario aclarar que G. vaginalis y U. urealyticum suelen
encontrarse en recuentos bajos, tal como lo demuestran los estudios realizados por Fairley y col.
con muestras obtenidas por puncin suprapbica.
9. Corynebacterium urealyticum: es un reconocido patgeno del tracto urinario, que debido a su
intensa actividad uresica, es capaz de alcalinizar rpidamente la orina produciendo la precipitacin
de cristales de fosfato amnico magnsico, con posterior formacin de clculos y su eventual
incrustacin en la vejiga. Aunque este hecho ocurre generalmente en pacientes mayores de 65 aos,
se ha observado tambin en adultos jvenes y an en nios con anomalas del tracto urinario. C.
urealyticum es una bacteria de desarrollo lento (48-72h), cuya morfologa responde a las
caractersticas generales del gnero, aunque a veces adopta formas cocoides. Es ureasa + (a los
pocos minutos de incubacin) y glucosa negativa (-). Es caracterstica su multirresistencia a los
antimicrobianos.
10. levaduras: pueden existir como saprfitas en genitales externos y zona periuretral. No obstante,
su presencia en la orina, independientemente del recuento, siempre requiere una minuciosa
evaluacin clnico-microbiolgica para determinar su significacin clnica. Las levaduras son
frecuentes en IU hospitalaria, principalmente en enfermos sondados, en pacientes diabticos y en
personas que reciben antibiticos o drogas inmunosupresoras. Candida albicans es la especie ms
frecuentemente aislada, pero otras especies de Candida y otras levaduras han sido descritas.
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PARTE PRCTICA.
Los alumnos debern llevar una (1) muestra de orina por comisin siguiendo los criterios de
recoleccin de muestra antes descriptos. Se proceder a la siembra de placas de agar CLDE y agar
chocolate para la recuperacin de la mayor cantidad de microorganismos. Asimismo se realizara
una observacin directa al microscopio del sedimento de la muestra centrifugada.
Materiales.
Siembra placas de agar:
a)
b)
c)
d)
e)
Sembrar las distintas placas de agar en estras con las muestras de orina centrifugadas y sin
centrifugar, incubar en estufa a 37C durante 24 a 48 hs. Retirar y observar la formacin de colonias
y los posibles metabolismos realizadas por estas.
Observacin directa al microscopio.
Se tomara una pequea carga del sedimento obtenido de la centrifugacin de la orina, se los
colocara en un portaobjeto, agregar un cubreobjetos y observar al microscopio ptico con el lente de
40X.
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