Transcripcin

Gen: incluye secuencia de DNA que se llama promotor (por ej: caja TATA)
No todos los genes son protenas, si no se traduce, puede ser un RNAr.
Si se traduce es un RNAm.
RNA MENSAJERO:
Las bacterias sintetizan una molcula de RNA con informacin para obtener
ms de una protena, el mensajero se llama POLICISTRNICO. En cambio, en
humanos, si hablamos del mensajero, siempre va a tener la informacin para
una sola protena, lo que se denomina como MONOCISTRNICO.

ESTRUCTURA DE UN GEN:
En nosotros
(eucariontes)
secuencia de
DNA que
contiene
exones, la
informacin de
stos se ver
reflejada en un
RNA maduro,
sin importar
qu tipo de
RNA es (rRNA,
mRNA, etc).
Los intrones
son secuencias
que no se van a expresar en el RNA maduro, sern eliminados en el
procesamiento de la molcula de RNA.

Tipos de RNA:
mRNA: RNA mensajero, codifica para las protenas.
tRNA: RNA de transferencia, participa en la sntesis de protenas
(transporta a los a).
rRNA: RNA ribosomal, forma parte de la estructura de los ribosomas.
snRNA: RNAs nucleares pequeos, intervienen en el procesamiento de
los intrones (splicing) formando las snRNP.
RNA de interferencia: acta bloqueando la expresin de ciertos genes,
acoplndose con el ARN mensajero maduro en el ribosoma, e impidiendo
el proceso de traduccin.
Secuencia codificadora: tiene ro arriba (hacia el extremo 5) un promotor.
Caractersticas del promotor: (ej caja TATA), aqu se une la enzima que realizar
la transcripcin. Se unen los factores de transcripcin generales.
Al regulador se van a unir protenas, que se llamarn factores de transcripcin
especficos.

Protena RNA Polimerasa:

abre la doble hebra y forma
una burbuja de
transcripcin. (en
bacterias), en humanos,
la actividad helicasa se
encuentra en los factores
de transcripcin generales.
La direccin de la
transcripcin siempre es de
5 a 3. (respecto del
transcrito nuevo)
Los RNA NO NECESITAN
PARTIDORES. (sntesis de
novo)

Sustratos: ATP, CTP, GTP y UTP.

Hebra codificante
Hebra molde
Transcrito de RNA

Lo primero que se genera se llama transcrito primario/inmaduro, si el transcrito

es un RNAm, se suele llamar PRE-RNAm.

Direccin de transcripcin en un cromosoma bacteriano:

Los genes no estn continuos en las dos hebras

TIPOS DE RNA POLIMERASA:

RNA Polimerasa en bacterias: existe un slo tipo de RNA pol que sintetiza
todas las especies de RNA.

Exn RNA maduro

Intrn eliminar

Trabajo de snRNA + protenas asociadas

Alfa amanitina: producida por un hongo txico. La persona puede fallecer por
fallos hepticos o renales. Si no hay RNAm se afectan principalmente el hgado
y el rin.

La RNA polimerasa no requiere de partidores para el inicio de la sntesis

de RNA.
La transcripcin empieza de novo en secuencias especficas al principio
de los genes.

PROMOTORES EN PROCARIONTES:
En bacterias:
1. Caja TATA o secuencia
-10 (ro arriba)
2. Secuencia -35 (TTGACA)
Ambas son zonas de los
promotores que son
frecuentes en muchos
genes
de bacterias.

PROMOTORES EN EUCARIONTES:

La nica diferencia con la caja TATA de procariontes, es que en las eucariontes

se encuentra ms lejos, vale decir 25 a 30 nt ro arriba del inicio de la
transcripcin. (-25 al -30). Aqu se une la TBP (protena que se une a la caja
TATA), pertenece a un factor general de transcripcin.
Caja CAAT y GC: Situadas al menos
100 pb ro arriba (-100) de la secuencia
TATA.

TRANSCRIPCIN EN EUCARIONTES:
Existen regiones
promotoras igual que en
procariontes.
Existen adems los
ENHANCER (O
INTENSIFICADORAS) que no
tienen actividad promotora por
s mismas, pero que pueden
estimular la transcripcin y
pueden actuar sobre
considerables distancias de
varios
kilobases del sitio de inicio de
la transcripcin.
Intensificador + protena
activadora
Inhibidoras (silenciosas) + protena inhibidora
Para que ocurra la transcripcin slo es necesario como mnimo la RNA
polimerasa y los factores generales. Si se quiere aumentar la transcripcin, se
utilizan las protenas activadoras y los enhancers.
SE REQUIEREN PROTENAS AUXILIARES, LOS FACTORES DE
TRANSCRIPCIN: para una transcripcin eficiente de todos los genes de
eucariontes.
Los factores de transcripcin no se unen a la polimerasa directamente,
sino al ADN antes de la transcripcin, actuando como reguladores
positivos.
Hay F. Transcripcin generales (TFII factores de transcripcin
generales que apoyan la funcin de la polimerasa ll) y especficos para
regular la expresin gnica.

TFIID su subunidad TBP se une a

la caja
TATA. As se posibilita la unin de
TFIIB.

TFIIB posiciona a la polimerasa en el

sitio de inicio de la transcripcin.
TFIIH, cuando ingresa posee la actividad
helicasa (abre el DNA, usa ATP) adems
fosforila a la RNA pol II y la libera desde el
promotor.
RNA Polimerasa ll + grupo fosfato =
avanza haciendo transcripcin.
CTD: Dominio carboxilo terminal, significa
que en la zona o CTD de la RNA polimerasa
ll va a existir la fosforilacin.

UTP, ATP, CTP, GTP = sustrato de las

enzimas
Se produce el desensamblaje de los factores
generales de transcripcin.
La transcripcin procede hasta que la
polimerasa lee una secuencia de trmino del
RNA, en ese minuto, la polimerasa libera el
transcrito, ella se libera del molde, y el
molde vuelve a interactuar con la hebra
codificante.

Ejemplo del mecanismo: atraer a

las acetilasas de las histonas. (se
elimina carga +)

MODIFICACIONES DE LOS TRANSCRITOS:

En el extremo 5 (del mensajero) se agrega CAP (Casquete o 7-metil
guanosina), que es un nucletido modificado. Lo protege de las exonucleasas.

En el extremo
3 se agrega
una cola poliA (aprox 200
nucletidos)
que sirve para
la proteccin
por
exonucleasas,
adems de
participar y
facilitar el
transporte del
mRNA al
citoplasma, y
tambin se
involucra en
permitir la traduccin.

Corte y empalme (SPLICING):

se conservan los exones, y los
intrones son cortados
(eliminados)
Zona de intrones para ser
cortados: en el extremo 5 del
intrn debe hallarse una
secuencia GU, hacia la zona 3
una secuencia AG, y en la zona
medial un punto de ramificacin
(CTRAYY), donde R representa
una purina y Y una pirimidina.
El reconocimiento lo hacen los
RNA nucleares pequeos +
protenas asociadas.
snRNA + prot = snRNP

Todo esto forma el

espliceosoma.
U4: Inhibe U6 hasta que se
encuentra bien posicionado
reconociendo la zona de corte.
U6: corta y forma enlaces
fosfodister.
Catlisis: actividad enzimtica
que corta intrones y une
exones.

Mecanismo de procesamiento:
U1 forma pares de bases con el
extremo del empalme 5.
U2 reconoce el punto de
ramificacin, pero con la ayuda de
BBP (protena que se une al punto de
ramificacin) y U2AF (factor auxiliar
de U2).

Una vez que U2 lleg,

las protenas auxiliares
se liberan del sistema.
Luego en conjunto se
unen U4, U6 y U5. Lo
que se produce es
desde el punto de
ramificacin es un
ataque al enlace
fosfodister y las
ribonucleoprotenas con
actividad enzimtica
van a cortar el enlace
fosfodister. Cuando se
corta el enlace, se
forma un intermediario
en forma de lazo, es
decir, exn liberado del
intrn, y el intrn se
encuentra enlazado con
el punto de ramificacin. Todava permanece unido al exn siguiente por el
extremo 3. Lo que sigue es romper ese enlace fosfodister, liberar el intrn y
los exones dejarlos como una entidad contigua.
Los intrones se van a degradar
recicladas.

y las ribonucleoprotenas sern

SPLICING ALTERNATIVO:
De un transcrito podemos obtener
distintos mensajeros porque del
transcrito inmaduro se elige cual
exn va a permanecer (variabilidad).
Puedo obtener 4 versiones de una
misma protena (ej: alfa o beta
tubulina)
Ej de quines sufren procesamiento
alternativo: Actina, Miosina,
Tropomiosina y Troponina. Se tienen distintas versiones de las mismas
protenas ya que existen distintos tipos de tejidos musculares.