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ENZIMAS
Integrantes:
ENZIMAS Seminario 1
NDICE
1.
INTRODUCCIN.........
......pg. 03
2.
OBJETIVOS
...........
..............pg. 03
3. MARCO TERICO
3.1.
DEFINICION
ENZIMA.pg. 04
DE
3.2.
CINTICA
ENZIMTICA...pg. 05
3.3.
REACCIONES
ENZIMTICAS....pg. 10
3.4.
COMPETICIN
ENZIMTICA...pg. 17
3.5.
ENZIMAS
LISOSOMALES....pg. 22
3.6.
ENZIMAS
...pg. 24
CITOPLASMTICAS..
3.7.
ENZIMAS
....pg. 31
Medicina Humana
Pgina 2
NUCLEARES.
ENZIMAS Seminario 1
4.
CONCLUSIONES
..pg. 38
5.
BIBLIOGRAFA...
..pg. 39
INTRODUCCIN
La vida de diferentes seres unicelulares o pluricelulares dependen de una
serie compleja de reacciones qumicas perfectamente ordenadas, este
orden es debido a que esas reacciones qumicas estn catalizadas
por protenas denominadas enzimas, cuyas propiedades permiten
modular las velocidades de estas reacciones.
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molculas de ARN catalizadoras, o ribozimas, la mayora de enzimas son
protenas.
ENZIMAS
Uno de los primeros nombres aplicados a lo que ahora llamamos enzimas fue
fermento; sin embargo, hubo que esperar hasta 1926 para obtener la primera
enzima cristalizada, la ureasa, demostrndose que era una protena cataltica.
En los primeros aos de 1980 los bilogos descubrieron que, adems de las
protenas ciertas molculas de ARN, llamadas ribozimas, tienen tambin
actividad cataltica.
Como sucede con todos los catalizadores, las enzimas tienen las siguientes
propiedades:
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ENZIMAS Seminario 1
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ENZIMAS Seminario 1
CINTICA ENZIMTICA
La palabra cintica es de origen griego (Kinetikos, significa movimiento).
Aplicada a las reacciones qumicas, la cintica concierne a las velocidades de
reaccin y la manera en que esas velocidades estn influidas por varios
factores, pero especialmente por la concentracin del sustrato, de los productos
y de los inhibidores. Aqu nos centraremos, mayoritariamente, en los efectos de
la concentracin del sustrato en la cintica de las reacciones catalizadas
enzimticamente.
La mayora de las enzimas siguen la cintica de Michaelis-Menten
A CINTICA DE MICHAELIS-MENTEN:
Desde hace mucho tiempo se sabe que la velocidad de una reaccin catalizada
enzimticamente, aumenta con la concentracin de sustrato, pero de tal forma,
que cada incremento adicional de sustrato, da como resultado un aumento
menor de la velocidad de reaccin. De manera ms precisa, se puede observar
experimentalmente que la relacin entre la velocidad inicial de reaccin v y
la concentracin de sustrato [S] es una hiprbole.
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Una propiedad importante de esta relacin hiperblica es que a medida que [S]
tiende hacia el infinito, v tiende hacia un valor mximo, que depende del
nmero de molculas enzimticas y, por tanto, slo puede incrementarse
aadiendo ms enzima.
La incapacidad para aumentar la velocidad de reaccin ms all de un valor
finito mximo a concentraciones de sustrato cada vez ms altas, se llama
saturacin. sta es una caracterstica fundamental de las reacciones catalizadas
enzimticamente. Las reacciones catalizadas siempre llegan a saturacin a
concentraciones altas de sustrato, mientras que esto no ocurre en las
reacciones no catalizadas. Gran parte de nuestra comprensin de la relacin
hiperblica entre [S] y v se debe a los trabajos pioneros de dos enzimlogos
alemanes, Leonor Michaelis y Maud Menten. En 1913, postularon una teora
general de la accin enzimtica, que ha resultado ser la base para el anlisis
cuantitativo de casi todos los aspectos de la cintica enzimtica. Para entender
su enfoque, se considera una de las posibles reacciones catalizadas
enzimticamente ms simples, en la cual un nico sustrato S se convierte en un
nico producto P.
S
P
(enzima)
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podremos escribir:
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independiente de la variacin de la [S], volvindose casi constante. sta
constituye la regin de orden cero de la representacin de Michaelis-Menten
.Mientras la concentracin de sustrato sea mucho mayor que el valor de Km, la
velocidad no se ve afectada por los cambios en la concentracin de sustrato,
permaneciendo
casi constante, con valores prximos a Vmax.
Por tanto, el lmite superior de Vmax se determina por:
1) El tiempo necesario para la reaccin cataltica real ms la liberacin
subsiguiente del producto desde la superficie de cada molcula de
enzima.
2) El nmero de molculas presentes. Debido a que la velocidad real de la
reaccin es limitada, la nica manera de que la Vmax pueda aumentar es
incrementando la concentracin de la enzima. De hecho, Vmax es
linealmente proporcional a la cantidad de enzima presente, como se
muestra en la Figura :6.9
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su abreviatura Km) en honor al enzimlogo que dilucid su significado.
La Figura 6.8 ilustra el significado deVmax y de Km.
ECUACION
DE (Limitaciones
HILL: (LIMITACIONES
DEL
MODELO DE
B) B)
ECUACION
DE HILL:
del modelo de
Michaelis-Menten)
MICHAELIS-MENTEN)
Describe la conducta de enzimas que
muestran unin cooperativa de sustrato.
Ciertas enzimas y otras protenas que
enlazan ligandos, como la hemoglobina,
no muestran la cintica clsica de
saturacin de Michaelis-Menten. Cuando
[S] se grafica contra v, la curva de
saturacin es sigmoide.
Esto indica, por lo general, el enlace
cooperativo
del
sustrato
a
sitios
mltiples. Para la cintica de saturacin
del sustrato sigmoide estn invalidados
los mtodos de graficas de la concentracin del sustrato que produce la
mitad de la velocidad mxima anteriormente descrita (no se producen
rectas). Para evaluar la curva sigmoide de la cintica de saturacin se
emplea una representacin de la ecuacin de Hill, originalmente derivada
para describir el enlace cooperativo de molculas de oxigeno de la
hemoglobina. Escrita de forma lineal la ecuacin de Hill es:
[ S ] log k '
log
Vi
=n log
Vmax Vi
Donde k: constante compleja. La
ecuacin afirma que cuando [S] es baja
comparada con k, la velocidad de
reaccin aumenta a la ensima potencia
de [S].
Un grfico de Iog v/( Vmx - v) contra log[S] da una lnea recta, donde la
pendiente de la lnea n es el coeficiente de HilI, y un parmetro emprico
cuyo valor est en funcin del nmero, la clase y la fuerza de las
interacciones de los sitios de unin a sustrato mltiples sobre la enzima.
Cuando n = 1, todos los sitios de unin se comportan de manera
independiente, y se observa conducta cintica de Michaelis-Menten
simple. Si n es de ms de 1, se dice que la enzima muestra cooperacin
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positiva. La unin de sustrato a un sitio aumenta entonces la afinidad de
los sitios restantes para unin a sulfato adicional. Mientras mayor es el
valor para n, ms alto es el grado de cooperacin, y ms sigmoideo ser
el grfico de v contra [S].
Una perpendicular trazada desde el punto donde el trmino y Iog V 1/
(Vrnlix - v) es cero interseca el eje x en una concentracin de sustrato
llamada S50, la concentracin de sustrato que da por resultado la mitad
de la velocidad mxima.
REACCIONES ENZIMTICAS
Las enzimas son sustancias con cualidades altamente catalizadoras.
Incrementan la velocidad de reaccin catalizada en 10 15 o ms veces. Para
comprender cmo funcionan los mecanismos de la catlisis enzimtica es
necesario observar el desarrollo de una reaccin no catalizada.
A. Reaccin no catalizada
A modo de ejemplo tornaremos una reaccin del tipo A + B = C + D. Los
reactivos A y B se encuentran en una solucin acuosa, rodeados por una capa
de molculas de agua (capa de hidrato), y se desplazan en sentidos aleatorios
segn el desplazamiento del calor.
Se produce una reaccin si y slo si ambos reactivos chocan en la
direccin adecuada y necesaria para generar una reaccin, algo poco probable
y, por ende, extremadamente inusual. Antes de transformarse en los productos
C + D, el complejo ternario A-B debe superar un estado Intermedio. Para que
esto se produzca es necesario, a su vez, que exista una fuerte energa de
activacin E. Esto ocurre con menor frecuencia an, ya que slo algunos
complejos ternarios A-B liberan la suficiente cantidad de energa como para
alcanzar este estado intermedio.
Dentro de una solucin lquida, la mayor parte de la energa de activacin
es utilizada para disolver la capa de hidrato entre A y B. Sin embargo, los
desplazamientos de carga y otros procesos qumicos de los reactivos,
contribuyen tambin a disminuir el efecto de dicha energa. Estas limitaciones,
junto a la falta de catalizadores, generan que la transformacin se produzca
nicamente en ocasiones excepcionales y que la velocidad de reaccin (v) sea
mnima, incluso cuando la transformacin es termodinmicamente posible.
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2. Velocidad de reaccin:
Para que las molculas reaccionen,
deben contener suficiente energa como
para superar la barrera de energa del
estado de transicin. En ausencia de una
enzima, slo una pequea proporcin de una
poblacin de molculas puede poseer esa
energa suficiente como para alcanzar el
estado de transicin entre el reactante y el
producto. La velocidad de la reaccin viene
determinada por el nmero de dichas
molculas energizadas. En general, cuanto
menor sea la energa libre de activacin,
mayor es el nmero de molculas con
energa suficiente para atravesar el estado
de transicin y, por tanto, ms rpida es la
velocidad de la reaccin.
NOTA:
La enzima no cambia la energa libre de los reactantes ni de los
productos , por consiguiente, no cambia el equilibrio de la reaccin.
Sin embargo, acelera la velocidad con la cual se alcanza el equilibrio.
1. Sitios activos:
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Las molculas enzimticas contienen
una bolsa o hendidura especial denominada
sitio activo; que viene a ser una mquina
molecular
compleja
que
emplea
mecanismos qumicos diversos para facilitar
la conversin del sustrato en producto. En el
sitio
activo ocurren la unin, activacin y
transformacin qumica del sustrato. Los
sustratos son acercados estrechamente uno a
otro en la alineacin ptima con los cofactores,
grupos prostticos y cadenas laterales de
aminocidos que se encargan de catalizar su transformacin qumica en
productos.
Adems de unirse con el sustrato, el sitio activo contiene un conjunto
particular de cadenas laterales de aminocidos que influyen en el sustrato y
disminuyen la energa de activacin de la reaccin. La catlisis es aumentada
ms por la capacidad del sitio activo para proteger sustratos contra agua y
generar un ambiente cuya polaridad, hidrofobicidad, acidez o alcalinidad puede
diferir de manera notoria de la que hay en el citoplasma circundante.
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enzimticamente, puede involucrar a uno o ms recursos de activacin del
sustrato. Los mecanismos ms comunes son los siguientes:
1. El cambio en la conformacin enzimtica, inducida por la unin del inicial
sustrato al sitio activo, no slo causa una mejor complementariedad y un ajuste
ms estrecho enzima-sustrato, sino que tambin deforma uno o ms de sus
enlaces, debilitando as dichos enlaces, hacindolos ms susceptible al ataque
cataltico.
2. La enzima tambin puede aceptar o donar protones, formando de ese modo
enlaces covalentes temporales entre la enzima y su sustrato; incrementando,
por tanto, la reactividad qumica del sustrato. El mecanismo necesita que el
sustrato tenga una regin que sea electropositiva (deficiente en electrones) o
electronegativa (rica en electrones) y que el sitio activo de la enzima tenga uno
o ms grupos de polaridad opuesta. Esto da cuenta de la importancia de los
aminocidos cargados en la qumica del sitio activo, lo cual, a su vez, explica
por qu la actividad de la enzima suele ser tan dependiente del pH.
- El acontecimiento cataltico.
La secuencia de acontecimientos que tienen lugar en el sitio en un
tiempo lo suficientemente corto para permitir que en el sitio activo de una sola
molcula enzimtica ocurran cientos, o incluso miles, de tales reacciones por
segundo. Tomando como ejemplo a la sacarasa se siguen estos pasos:
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sustrato en su sitio activo, crea una regin de concentracin local alta de
sustrato. Este ambiente tambin orienta las molculas de sustrato de manera
espacial en una posicin ideal para que interacten, lo que origina aumentos del
ndice de al menos mil veces. Por el contrario, cuando los reactivos estn en una
solucin, son libres para tener movimientos de traslacin y rotacin, incluso los
que tienen energa suficiente no siempre llegan a una colisin que conduzca a la
formacin de un complejo en estado de transicin. Las enzimas disminuyen la
entropa de sus sustratos.
Catlisis cido-bsica
Los grupos funcionales ionizables de cadenas laterales aminoacilo y
(cuando estn presentes) de grupos prostticos, contribuyen a la catlisis al
interactuar como cidos o bases. La catlisis cido-bsica puede ser
especfica o general; por especfica se alude a protones (H 3O+) o iones (OH).
En la catlisis especfica para cido o especfica para base, el ndice de reaccin
es sensible a cambios de la concentracin de protones, pero independiente de
las concentraciones de otros cidos (donadores de protn) o bases (aceptores
de protn) presentes en solucin o en el sitio activo. Se dice que las reacciones
cuyos ndices muestran capacidad de respuesta a todos los cidos o bases
presentes, estn sujetas a catlisis por cido general o por base general.
Catlisis por tensin
Las enzimas que catalizan reacciones lticas que comprenden la rotura
de un enlace covalente tpicamente se unen a sus sustratos en una
conformacin muy desfavorable para el enlace que sufrir la divisin. En
muchos casos, la conformacin cambia tanto que mejora el ajuste
complementario entre la enzima y los reactivos (un ajuste inducido) y los grupos
reactivos apropiados de la enzima se mueven a su sitio. Conforme ocurren estos
cambios en la conformacin, se realiza un trabajo mecnico, lo que permite a la
enzima ejercer una fuerza fsica en ciertos enlaces dentro de una molcula de
sustrato. La tensin resultante estira o deforma el enlace al cual se dirige;
esto lo debilita y lo hace ms vulnerable a divisin. Esto tiene el efecto de
desestabilizar el sustrato, lo que hace que adopte el estado de transicin en el
que se alivia la tensin
Catlisis covalente
El proceso de catlisis covalente comprende la formacin de un enlace
covalente entre la enzima y uno o ms sustratos. La enzima modificada despus
se convierte en un reactivo. La catlisis covalente introduce una nueva va de
reaccin cuya energa de activacin es ms baja (y, por ende, es ms rpida)
que la va de reaccin en solucin homognea. La catlisis covalente se observa
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con particular frecuencia entre enzimas que catalizan reacciones de
transferencia de grupo. La catlisis covalente a menudo sigue un
mecanismo de pingpong: uno en donde el primer sustrato es unido y su
producto se libera antes de la unin del segundo sustrato.
COMPETENCIA ENZIMATICA
Hemos asumido que las nicas sustancias en las clulas capaces de alterar la
actividad de las enzimas son sus sustratos. Muchas de estas sustancias actan
inhibiendo la actividad enzimtica, reduciendo o incluso anulando la velocidad
de reaccin con el sustrato deseado.
La inhibicin enzimtica es importante por dos razones: la principal es que esta
inhibicin acta como un mecanismo de control en las clulas.
Es importante tambin en la accin de drogas y toxinas, dado que estas inhiben
enzimas especficas.
REGULACIN ENZIMTICA:
El papel de las enzimas en la funcin celular no es que acte a altas
velocidades, las velocidades de las reacciones catalizadas enzimticamente y
rutas bioqumicas deben ser regularizadas, una de la capacidad de la clula es
contralar las actividades de la enzima con especificidad y precisin.
Entre los variados mecanismos de regularizacin, como los cambios en la
concentracin de sustrato, alteracin del pH y la presencia de inhibidores. Tal
como se desprende de la ecuacin de Michaelis-Menten, los incrementos de la
concentracin de sustrato tienden a traer un aumento de velocidad en la
reaccin, por el contrario los incrementos de la concentracin de producto
reduce la velocidad a la cual el sustrato se convierte en el producto.
En la mayora de las rutas enzimticas se regulan mediante otros pasos, entre
los ms importantes tenemos la regulacin alostricay la modificacin
covalente.
INHIBIDORES ENZIMTICOS:
Son molculas que pueden unirse con una enzima y disminuir su actividad. La
clula depende de inhibidores para regular la actividad de muchas de sus
enzimas; estos pueden ser de dos tipos reversibles o irreversibles y los
reversibles a su vez en competitivos o no competitivos.
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Los inhibidores irreversibles son los que se unen con gran firmeza a una
enzima, a menudo mediante la formacin de un enlace covalente con alguno de
sus
residuos
de
aminocidos.
Varios
gases
nerviosos,
como
el
diisopropilfosfofluoridato y los pesticidas organofosforados, actan como
inhibidores irreversibles de la acetilcolinesterasa, una enzima que tiene un
papel crucial en la destruccin de la acetilcolina el neurotransmisor encargado
de producir la contraccin muscular.
Con la inhibicin de esta enzima, el musculo se estimula en forma continua y
permanece en estado de contraccin constante.
Un inhibidor irreversible se une a la enzima covalentemente, provocando una
perdida irrevocable de la actividad cataltica los inhibidores irreversibles se
caracterizan por ser txicos para las clulas. As tenemos a los iones de
metales pesados, los agentes alquilantes y los gases txicos nerviosos.
Estas sustancias se unen de manera irreversible ala acetilcolinesterasa (es una
enzima fundamental para la transmisin del el impulso nervioso); al momento
de inhibirse la actividad de la acetilcolinesterasa se produce la parlisis rpida
de las funciones vitales (la nutricin, reproduccin y la relacin) provocando la
muerte.
Uno de los gases nerviosos es el di-.isopropilofluorofosfato, el cual se une
covalentemente al grupo hidroxilo de una cerina del sitio activo de la enzima, a
la cual inactiva permanentemente. Muchas toxinas naturales son inhibidores
enzimticos irreversibles
Tal es el caso del alcaloide fisostigmina, un componente del haba de calabar,
esta inhibe irreversiblemente a la acetilcolinesterasa el antibitico penicilina es
un inhibidor irreversible de la serina enzimas involucradas en la sntesis de la
pared celular bacteriana; por este motivo la penicilina es eficaz contra las
infecciones bacterianas.
Los inhibidores competitivos son inhibidores reversibles que compiten con
un sustrato por el acceso a sitio activo de una enzima. Como los sustratos
tienen una estructura complementaria con el sitio activo que los unen, los
inhibidores competitivos deben parecerse al sustrato para competir por el
mismo sitio de unin, pero difieren de tal manera que les impide transformarse
en el producto. El anlisis de los tipos de molculas que pueden competir con el
sustrato por un sitio de unin en la enzima proporciona informacin sobre la
estructura del sitio activo y la naturaleza de la interaccin entre el sustrato
natural y su enzima.
Es la base de la actividad de mltiples frmacos de uso frecuente, la enzima
convertidora de angiotensina ECA es una enzima proteoltica que acta sobre
un pptido de diez residuos (angiotensina I) para producir un pptido de ocho
residuos (angiotensina II). El nivel alto de angiotensina II es un factor de riesgo
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mayor para la elevacin de la presin sangunea. Despus se comenz a
investigar compuestos que pudieran inhibir la ECA. Algunos estudios haban
demostrado que el veneno de un crtalo contena inhibidores de enzimas
proteolticas y se encontr que uno de estos componentes es un pptido
llamado teprtido era un inhibidor competitivo potente de la ECA. Los esfuerzos
posteriores desarrollaron un compuesto llamado captprilo que se convirti en
el primer antihipertensivo til que actuaba mediante la unin con la enzima
convertidora de la angiotensina
La efectividad de un inhibidor competitivo depende de su actividad relativa con
la enzima. Al margen de lo anterior, la inhibicin competitiva puede superar si el
ndice de sustrato/inhibidor es bastante grande.
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LA REGULACIN ALOSTRICA
Es
nico
el
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dependiendo de si tiene una molcula efectora unida a ella o no. El efector se
une a la enzima debido a la presencia de la superficie de sta de un sitio
alostrico (regulador) que es distinto del sitio activo en el cual tienen lugar el
evento cataltico. Por eso en toda enzima alostrica hay un sitio activo al que se
le une el sustrato y un sitio alostrico que se le une el efector.
El efector puede ser un inhibidor alostrico o un activador alostrico,
dependiendo del efecto que ejerza cuando se una al sitio alostrico de la
enzima, es decir dependiendo de si la forma compleja es el estado de baja
afinidad o alta afinidad en la enzima. La unin entre el inhibidor alostrico
cambia el equilibrio entre las dos formas de la enzima para favorecer el estado
de baja afinidad. La unin del activador alostrico, cambia el equilibrio a favor
del estado de alta afinidad. En cada caso la unin estabiliza la enzima en una
de sus dos formas, incrementando o disminuyendo de ese modo la probabilidad
de unin al sustrato.
La mayora de las enzimas alostricas son protenas grandes, multimricas y
con un sitio activo o un sitio alostrico en cada subunidad. Estos sitios activos y
los sitios alostricos estn normalmente en diferentes subunidades de la
protena, a las que denominan subunidades catalticas y subunidades
reguladoras. Esto es que la unin de las molculas efectoras a los sitios
alostricos, no solo afecta a la forma de subunidades reguladoras sino tambin
a las catalticas.
ENZIMAS LISOSOMALES
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ENZIMAS Seminario 1
1.-LOS LISOSOMAS.
Son un grupo de organoides intracitoplasmticos que contienen una variedad de
enzimas hidrolticas, cuya funcin principal es la digestin de material
intracelular o proveniente del exterior.
Los lisosomas se distinguen de otros organoides por su morfologa y por las
funciones que desempean:
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ENZIMAS Seminario 1
ocurrido esto las enzimas son capaces de degradar varias biomolculas de la
luz. Estn contenidas en dos subgrupos de grnulos de neutrfilos. El primero,
el granulo especifico, contiene lisozima, colagenasa, protena que se une a
vitamina B12, gelatinasa, y protenas bactericidas conocidas como defensinas.
El segundo, el granulo azurofilo, contiene a la beta-glucuronidasa, elastasa,
entre otras. Los grnulos especficos se fusionan y descargan su contenido ms
rpido que los grnulos azurofilos. Poco despus de la fagocitosis, los grnulos
lisosomales se fusionan con la membrana de vesculas fagocticas y descargan
su contenido hacia ellas. Este proceso es crucial para las defensas normales del
husped. En algunos casos, los constituyentes lisosomales pueden ser liberados
de forma extracelular y median algunos aspectos de inflamacin y lesintisular.
Las enzimas lisosmicas son principalmente hidrolasas cidas. Entre ellas se
encuentran:
ENZIMAS
FUNCIN
Ribonucleasa
Nucleotidiltransferasas
Esterasa
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Lipasa
Fosfolipasas A1 y A2
Fosfatasa cida (varios tipos)
Fosfoprotena-fosfatasa
Fosfodiesterasa (exonucleasa)
Fosfolipasa C
Desoxirribonucleasa II
Arilsulfatasa A y B
Lisozima (muramidasa)
Neuraminidasa
Glucosidasa
Glucosidasa
Galactosidasa
Glucuronidasa
Hialuronidasa
ster
Carboxipeptidasa
Catepsina A
Carboxipeptidasa cida
Dipeptidasa
Catepsina B1 y B2
Catepsina C
Catepsina D
Catepsina E
Renina
Colagenasa
Activador del plasmingeno
Pirofosfatasa
Arilfosfatasa
Fosfamidasa
ENZIMAS CITOPLASMATICAS
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ENZIMAS Seminario 1
2. FOSFOGLUCO ISOMERASA
Llamada anteriormente glucosa 6 fosfato isomerasa o tambin glucocinasa que
es muy abundante en el hgado.
La glucocinasa es inhibida por la FRUCTOSA-6-FOSFATO en vez de GLUCOSA-6FOSFATO como en el caso de la hexocinasa.
Es una enzima que cataliza la isomerizacin de una aldosa, la GLUCOSA-6FOSFATO en una cetosa, la FRUCTOSA-6-FOSFATO; la reaccin se lleva a cabo
en cinco pasos para los cuales la enzima necesita abrir el anillo de la glucosa,
para hacer la isomerizacin y posteriormente cerrarlo convirtindola
en fructosa-6-fosfato.
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ENZIMAS Seminario 1
2.- Un cido, presumiblemente el grupo e-amino de una lisina de la
enzima, cataliza la apertura del anillo.
3.- Una base, presumiblemente el carboxilato de un cido glutmico de la
enzima, retira el protn cido del C2 del azcar para formar un
intermediario cis-enediolato (este protn es cido porque ocupa una
posicin
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ENZIMAS Seminario 1
4. ALDOLASA
El nombre completo de la enzima es fructosa-1,6-bifosfato aldolasa.
La aldolasa cataliza la
transformacin
de
la
FRUCTOSA-1,6-BISFOSFATO
en gliceraldehdo-3-fosfato y dihidroxiacetona-3-fosfato.
5.
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ENZIMAS Seminario 1
David Trenthan propuso un mecanismo enzimtico de la GAPDH.
Paso 1. El GAP se une a la enzima.
Paso 2. El grupo sulfhidrilo del sitio activo forma un tiohemiacetal con el
sustrato.
Paso 3. El NAD+ oxida el tiohemiacetal a un tioster.
Paso 4. El Pi se une a la enzima
Paso 5. Y ataca al tioster, formando el producto acil fosfato, 1,3-BPG, que se
disocia de la enzima seguida por el reemplazo del NADH recientemente formado
por un NAD+, y regenera por consiguiente la enzima activa.
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ENZIMAS Seminario 1
7. FOSFOGLICERATO CINASA:
produccin del primer ATP
En esta reaccin se produce ATP junto con 3fosfoglicerato(3PG) catalizada por la enzima
fosfogliceratocinasa (PGK). (Ntese que esta
enzima se llama cinasa porque la reaccin
inversa es la transferencia del grupo fosforilo
desde el ATP hasta 3PG).
A pesar de que la reaccin de la GAPDH es
endergnica, la naturaleza fuertemente
exergnica de la transferencia de un
grupo fosforilo desde el 1,3-BPG hasta el ADP
hace favorable la sntesis global de NADH y el
ATP a partir de GAP, P i, NAD+ y ADP. Esta
produccin de ATP, que no involucra al O 2, es
un ejemplo de fosforilacin a nivel de sustrato.
La oxidacin subsecuente del NADH producido
en esta reaccin por el O2
genera
ATP
adicional por medio de la fosforilacin
oxidativa.
8. FOFOGLICERATO MUTASA
En esta reaccin el 3PG se convierten 2-fosfoglicerato (2PG) por medio
de la enzima fosfogliceratomutasa (PGM)
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9. ENOLASA: formacin del segundo intermediario de alta energa
En esta reaccin de la gluclisis, el 2 PG se deshidrata a fosfoenolpiruvato
(PEP) es una reaccin catalizada por la enolasa:
10.
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ENZIMAS Seminario 1
+
NAD
lactato +
+
NAD
ALCOHOL DESHIDROGENASA
La enzima alcohol deshidrogenasa (ADH) fue descubierta a mediados de los
aos 1960, estas enzimas son un grupo de siete enzimas que estn presentes
en muchos organismos y facilitan la interconversin entre alcoholes y aldehdos
o cetonas con la reduccin de NAD a NADH. La reaccin catalizada es:
Alcohol + NAD+
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ENZIMAS Seminario 1
ENZIMAS NUCLEARES
Las enzima nucleares son aquellas que se ubican en el ncleo de la clula y la
mayora de ella tiene funciones relacionadas con los procesos de transcripcin,
transcripcin y traduccin, es decir, las del dogma central de la biologa.
Enzimas enlazadas a cromatina:
RNA polimerasa II
RNA polimerasa III
DNA polimerasa
Trifosfatasa de nuclesido
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oligomrica (protena cuaternaria), estructurndose en un complejo formado por
varias subunidades. Las subunidades comunes ms grandes son dos: la B, que
funciona como centro activo; y la B', que es la subunidad de unin al ADN. La
subunidad B porta el dominio carboxiterminal que es funcionalmente importante.
Est formado por una larga cola de 52 repeticiones del heptapptido YSPTSPS
con residuos fosforilables. El resto de subunidades de la ARN polimerasa son ms
pequeas y participan en la unin a todos las protenas que intervienen en la
transcripcin. Algunas de estas subunidades son comunes y otras especficas de
cada ARN polimerasa. Cada ARN polimerasa tiene una localizacin caracterstica.
As, la I se encuentra en el nucleolo, la II y la III en el nucleoplasma y la
mitocondrial
en
la
mitocondria.
ARN POLIMERASA I
Enzima oligomrica, primera de su clase,
que se ubica a nivel del nuclolo. La ARN
polimerasa (pol I), es la enzima que se
encarga
de
transferirlos
genes
ribosomales 5.8S, 18S y 28S(ARNr). Los
genes ribosomales, son los que codifican
para ARNr que, al ensamblarsecon
protenas
de
la
celula
eucariota,
conforman
la
ribosoma,
organelo
responsable de la traduccin del ARN
mensajero y sntesis o formacin de
protenas celulares.
La RNA polimerasa se mantiene unida al organizador nucleolar durante la
mitosis (metafase y anafase), durante este periodo no hay sntesis de ARN de
manera que esta enzima puede mantenerse en un estado inactivo.
ARN POLIMERASA II
ARN polimerasa II es una enzima localizada en el nucleoplasma. Esta polimerasa
es el tipo ms estudiado, siendo su estructura tridimensional dilucidada por
Roger Kornberg.
La ARN polimerasa II transcribe la gran mayora de los genes que codifican para
protenas celulares, al igual que algunos genes denominados pequeos
ARNnucleares o pARNn. Estos ltimos son pequeos ARN que conforman el
complejo de procesamiento necesario para madurar un ARN pre mensajero a
ARN mensajero maduro que luego sern transportados posteriormente del
ncleo al citoplasma.
La subunidad funcional del ARN polimerasa II es capaz de catalizar la sntesis de
ARN pero es incapaz por si sola de inducir da manera especfica la transcripcin
de un gen, para ello es necesaria la presencia de factores accesorios (protenas)
denominados factores generales de transcripcin o GTF, estos se dividen en
fracciones A,B y D(los ms importantes) y E,H,F; estos factores le dan a la
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enzima en mencin la posibilidad de reconocer e iniciar de manera especfica la
transcripcin de los pARNn.
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HELICASA
Las helicasas son unas enzimas protenas
que pertenecen al grupo de los motores
moleculares. Utilizan energa qumica
almacenada
en
los
nuclesidostrifosfatos,
fundamentalmente ATP, para romper
puentes de hidrgeno entre bases y
separar la doble hlice de ADN en hebras
simples, lo cual le es permitido gracias a
la polaridad que las caracteriza, la cual
va de 5 a 3 siguiendo el sentido de la
direccin de la horquilla de replicacin.
Despus del paso de las ADN helicasas el
ADN
monocatenario
queda
ya
formado,
originndose
monocatenarias, la cadena principal y la cadena rezagada.
cadenas
Inmediatamente despus que las cadenas han sido separadas aparecen unas
protenas de unin a las monocadenasconocidad como SSB por sus siglas en
ingles, las cuales completan la accin de separacin.
Estas enzimas son esenciales para la mayora de los procesos en los que las
enzimas necesitan acceder a las bases del ADN.
ADN POLIMERASA
La DNA polimerasa es una enzima que
cataliza la sntesis de ADN a partir de
desoxirribonucletidos y de una molcula de
ADN plantilla o molde que es la que ser
"copiada", es por eso que se las conoce como
enzimas creadoras de ADN.
Tanto las procariotas como las eucariotas
poseen mltiples actividades para la ADN
polimerasa, sin embargo solo una posee la
funcin de replicasa, las otras tienen papeles
auxiliares en la replicacin y/o participan en la
reparacin del ADN.
Las que poseen la actividad replicadora, su accin sinttica, consiste en alargar
una cadena de ADN aadiendo nucletidos uno a uno a un extremo 3-OH a la
cadena en crecimiento, de modo que la cadena sinttica se forma en direccin 5
a 3. Los precursores de la sntesis de ADN son nuclesidostrifosfato, que en la
reaccin pierden los dos grupos fosfatos terminales y son ellos los que
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proporcionan la energa para la sntesis, tal que permite el acoplamiento de
1000 bases nitrogenadas en un segundo.
Sin embargo para que la accin de la ADN polimerasa se inicie, hace falta algo
que le indique donde inicia o donde se encuentra aquel 3-OH, y dicha labor la
cumple el cebador, formado a partir de un ARN pequeo de 10 bases
nitrogenadas, dicha funcin se aprecia fundamentalmente en la cadena
rezagada, donde la sntesis es discontinua.
En cada horquilla de replicacin, la DNA polimerasa y otras enzimas sintetizan
dos nuevas cadenas de DNA que son complementarias respecto a las 2 cadenas
originales.
ADN LIGASA
Es un enzima de tipo ligasa, tambin
llamada enzima ligadora de polinucletidos,
cuya funcin principal es completar la
unin de la sntesis del ADN en la cadena
rezagada.
Recordemos que la cadena rezagada est
formada de manera discontinua y esos
espacios es los que se encarga de
completar o ligar esta enzima. Para ello, su
funcin
es
catalizar
un enlace
fosfodister entre el grupo 3'-hidroxilo
extremo de una de las cadenas de ADN y el
grupo 5'-difosfato del extremo de la otra
cadena de ADN. Para llevar a cabo esta
reaccin, la clula necesita energa porque se trata de una reaccin
termodinmicamente desfavorable, es decir, no es una reaccin que sucede de
manera espontnea.
Para formar los dos enlaces fosfodister covalentes entre ambos extremos de
las dos cadenas, la ADN ligasa cataliza una reaccin junto con el ATP que sigue
3 pasos:
1-Adenizacin de un residuo en el centro activo de la enzima liberando
fosfato.
2- Transferencia del AMP hacia el fosfato 5 'del donante originando la
formacin de un enlace pirofosfato.
3-Formacin de un enlace fosfodister entre el fosfato 5 'del donante y el
hidroxilo 3' del aceptor.
Finalmente, como resultado neto, se completa la cadena rezagada y la
replicacin del ADN en sus 2 cadenas est terminada.
La accin de las diferentes enzimas y molculas mencionadas se aprecia mejor
en la siguiente imagen.
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la
hidrlisis
de
nuclesidostrifosfatos
RIBONUCLEASAS
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Las ribonucleasaabreviada comnmente
como RNasa, es una enzima (nucleasa)
que
cataliza
la hidrlisis de ARN en
componentes
ms
pequeos.
Las
ribonucleasas
son
extremadamente
comunes, lo que resulta en periodos de
vida muy cortos para cualquier ARN en
un ambiente no protegido.
Como todas las nucleasas, estas
enzimas se dividen en dos clases
generales, las exonucleasas y las
endonucleasas.
Las
endonucleasas
cortan enlaces especficos dentro de las
molculas de ARN, generando fragmentos discretos. Estn implicadas en las
reacciones de corte, en la que las secuencias maduras se separa de las
secuencias flanqueantes. En cambio las exonucleasas eliminan residuos uno a
uno, desde un extremo de la molculas, liberando mononucletidos; las
exonucleasas estn implicadas en reacciones de ajuste.
Las ribonucleasa T1 y la ribonucleasa pancretica son dos ribonucleasas de gran
importancia prctica aunque sus funciones fisiolgicas se desconoces.
Las RNasas juegan un rol crtico en muchos procesos biolgicos, incluyendo
la angiognesis y
la
auto-incompatibilidad
de
las plantas con flores (angiospermas).
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BIBLIOGRAFIA
BIOLOGA
MOLECULAR
DEL
Panamericana, 5ta edicin, 2008.
Medicina Humana
GEN,
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James
D.Watson,
Editorial