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BIOCATALIZADORES
Son biomolculas cuya funcin es
aumentar la velocidad de las reacciones
bioqumicas, actan por lo tanto como
catalizadores biolgicos.
ENZIMAS - HISTRICO
{Catlisis
ENZIMAS - HISTRICO
{James
z
z
z
Sumner (1926)
Aisl y cristalizo la ureasa;
Los Cristales eran protenas;
Postul que todas las enzimas son protenas.
{John
z
{Dcada
z
z
de 50 sc. XX
75 enzimas aisladas y cristalizadas;
evidenciaron carcter proteico.
{Actualmente
Propiedades
Por ser catalizadores biolgicos:
{ Composicin qumica especfica: son protenas
con estructura terciaria y cuaternaria.
{ Componentes del citoplasma vivo y sintetizadas
en el mismo.
{ Especficas: para cada reaccin hay una enzima
determinada.
{ Sujetas a regulacin: estn reguladas en
cantidad y funcin.
Como funcionan
{
1.- La enzima y su
sustrato
3.- Formacin de
productos
Colisiones
no productivas
Colisin
productiva
En la superficie de la enzima,
los reactivos se encuentran
en la orientacin correcta y a
una concentracin local mucho
mayor que en solucin
ASPECTOS GENERALES
{
Especificidad absoluta:
COOCH
CH
COOFumarato
(trans-)
H2O
COOHO CH
CH2
COOL-Malato
Enzima:
Fumarato hidratasa
Especfica para el
ismero trans- por
un lado y para el
L- por otro.
Especificidad de grupo:
R CO O R' + H2O
R COOH + HO R'
Esterasa
MODELO LLAVE-CERRADURA
Supone
que
la
estructura del sustrato
y la del centro activo
son complementarias,
de la misma forma que
una llave encaja en
una cerradura.
Este modelo es vlido
en muchos casos, pero
no es siempre correcto.
O
R C O R'
OR C O R'
O-
Substrato: un ster
Estado de transicin:
intermediario tetradrico,
inestable
O
-
R C O
HO R'
Productos
R P O R'
O-
CQGDSGGPV
CMGDSGGPL
CQGDSGGPL
CEGDSGGPF
CQGDSGGSW
GRGDSGGST
CQGDSGGPV
{
{
{
{
pH PTIMO
Pepsina
1,5
Tripsina
7,7
Catalasa
7,6
Arginasa
9,7
Fumarasa
7,8
Temperatura
{
ENZIMAS
INFLUENCIA DE TEMPERATURA
8 El efecto de temperatura depende:
- pH y fuerza inica del medio;
- la presencia o ausencia de ligandos.
ENZIMA
TEMPERATURA
PTIMA (C)
Pepsina
31,6
Tripsina
25,5
Urease
20,8
si variamos el pH o la temperatura, la
velocidad de la reaccin catalizada por
una enzima tambin vara.
Los valores de pH y temperatura
ptima son aquellos a los cuales se
alcanza la mxima actividad enzimtica
o la mayor velocidad de reaccin
Concentracin salina:
{
ENZIMAS ESTRUTURA
Estrutura
Enzimtica
Holoenzima
Protena
Ribozimas
Cofator
Apoenzima o
Apoprotena
RNA
Puede ser:
on inorganico
molcula orgnica
Coenzima
Union covalente
Grupo Prosttico
Cofactor:
tomo, ion o molcula que participa en el proceso
cataltico sin ser enzima ni substrato.
Los cofactores participan de dos maneras distintas:
1. A travs de una fijacin muy fuerte a la protena y salen
sin ser modificados del ciclo cataltico
2. Como un segundo substrato; salen modificados del ciclo
cataltico y por lo general requieren otra enzima para volver
al estado original.
Cofactores
{
COFACTOR Y COENZIMA
Cofactor. Cuando se
trata
de
iones
o
molculas inorgnicas.
Cofactores
Activadores que cambian la conformacin de la
enzima para formar el complejo enzima-sustrato
z pueden ser iones metlicos (no orgnico).
z de origen orgnico
{ coenzimas
ENZIMAS COFATOR
8 Algunas enzimas que contienen o necesitan
de elementos inorgnicos como cofactores
ENZIMA
PEROXIDASA
COFATOR
Fe+2 o Fe+3
CATALASA
CITOCROMO OXIDASA
Cu+2
LCOHOL
DESIDROGENASA
HEXOQUINASA
Zn+2
Mg+2
UREASA
Ni+2
ENZIMAS COENZIMAS
8 La Mayora deriva de vitaminas hidrosolubles
8 Clasificacion en:
- transportadoras de hidrgeno
- transportadoras de grupos
qumicos
8 Transportadoras de hidrgeno
Coenzima
Abreviatura Reao
Origem
catalisada
Nicotinamida adenina NAD+
Oxi-reduo Niacina ou
dinucleotdio
Nicotinamida adenina NADP+
dinucleotdio fosfato
Flavina adenina
FAD
dinucleotdio
Vitamina B3
Oxi-reduo Niacina ou
Vitamina B3
Oxi-reduo Riboflavina ou
Vitamina B2
ENZIMAS COENZIMAS
8 Transportadoras de grupos qumicos
Coenzima
Coenzima A
Abrev.
Reao catalisada Origem
Pantotenato ou
CoA-SH Transferncia de
Biotina
Piridoxal fosfato
PyF
Metilcobalamina
Tetrahidrofolato
THF
Tiamina
pirofosfato
TPP
grupo acil
Transferncia de
CO2
Transferncia de
grupo amino
Transferncia de
unidades de carbono
Transferncia de
unidades de carbono
Transferncia de
grupo aldedo
Vitamina B5
Biotina ou
Vitamina H
Piridoxina ou
Vitamina B6
Cobalamina ou
Vitamina B12
cido flico
Tiamina ou
Vitamina B1
Pantetena
H
HS
C
O
ADP
H HO H
O
O
N
C
O P O P O CH2
OOO H3C CH3
H
H
NH2
N
O
OH
Coenzima A
N
N
H
H
OH
HN
Biotina
NH
COOH
CO2
O
HO
C N
NH
Carboxibiotina
S
COOH
Tiamina pirofosfato
Flavinas: FAD, FMN
Piridoxal fosfato
Coenzimas cobamdicos
Ac. Ascrbico
NAD+, NADP+
Lipoamida
Coenzimas folnicos
Pantetenas (CoA, p.e.)
B1
B2
B6
B12
C
PP
2. Liposolubles
Naftoquinonas
-Carboxilacin
CH2 CH2OH
H3C
CH2 N
N
H3C
N
H 3C
O+
O-
OH H
H 2C C
OH H
H2C C
HO
HO
HO
OH
AH2
cido Ascrbico
(vit. C)
Pteridina
H 2N
N
N
N
N
H
N
CO OH
OH
CH2
CH2
4-amino
benzoico
C NH C H
O
COOn
c. Flico
Poliglutamato
Hemoenzimas, citocromos
Ferredoxinas
Tr.electrnico mitocondrial y fotosinttico
Redox; transporte de aminocidos
Transf.de fosfato y/o de energa
Transf.de grupos glicosdicos
Transf.de grupos sulfato
Transf.de grupos metilo
Transportador de grupos acil-
CH2
H3 C
H 3C
N
-
OOC CH2
CH
CH2
CH3
Fe++ N
CH CH2
H2 C
CH2
COO-
CH3
Citocromos
Son protenas de tamao pequeo, que operan como
transportadores monoelectrnicos debido a una transicin
Fe2+
Fe3+
Citocromo c
O P O P O P O CH2
O-
O-
NH2
O-
H
H
H
H
OH
OH
vit. A
vit. D
vit. E
Cofactores redox
Operan en procesos de transferencia electrnica, a veces
como aceptores, a veces como donadores.
- Cofactores piridnicos (NAD+, NADP+)
- Cofactores flavnicos
- Cofactores hemnicos
- Ferredoxinas
- Quinonas
- c. Ascrbico
- c. Lipoico
- Glutatin
NAD+
CONH2
+
N
O
CH2
OH
OH
O P O P O CH2
O-
O-
NH2
N
N
H
OH
OH
O
CH2
OH
OH
O
NADP+
O P O P O CH2
O-
NH2
O-
H
OH
O
-
O P O
O-
NAD+, NADP+
(Formas oxidadas)
CONH2
N
NADH, NADPH
(Formas reducidas)
H
CONH2
AH2
AH2 + NAD(P)+
A + H+
A + NAD(P)H + H+
CHO
HOH2C
OH
N
CH3
CHO
O
O P O-
HOH2C
ON
CH3
Piridoxal fosfato
ENZIMAS
{Comparacin
Caracterstica
Enzimas
Catalizadores Qumicos
alta
baja
Naturaleza de la estructura
compleja
simples
alta
baja
suaves
drstica (generalmente)
alto
moderado
catalizada
contnuo
Consumo de energa
bajo
alto
Formacin de subproductos
baja
alta
difcil/cara
simples
alta
baja
si
no
Estabilidad de preparado
baja
alta
Energa de Activacin
baja
alta
Velocidad de reaccin
alta
baja
Sensibilidad a T y pH
Condiciones de reaccin (T, P y pH)
Costo
de
obtencin
purificacin)
(aislamiento
(temperatura
{
{
{
NOMBRES PARTICULARES
{
NOMBRE SISTEMTICO
{
el sustrato preferente
el tipo de reaccin realizado
terminacin "asa
{
{
NOMBRE SISTEMTICO
{
NOMENCLATURA DE LA COMISIN
ENZIMTICA
{
NOMENCLATURA DE LA COMISIN
ENZIMTICA
{
Grupo transferido
Nombre sistemtico:
Aceptor
Nmero sistemtico
Enzyme
Comission
Grupo Subgrupo
EC 2.7.1.1
Sub-subgrupo
Enzima
{
{
{
{
{
{
Clase 1: OXIDORREDUCTASAS
{
Clase 1: OXIDORREDUCTASAS
{
Grupo 1: Oxidorreductasas
Catalizan reacciones de oxidorreduccin
Ared + Box
Aox + Bred
Clase 1: OXIDORREDUCTASAS
{
Aceptor
EC 1.1.3.4
Nombre comn:
Glucosa oxidasa
Clase 2: TRANSFERASAS
{
A-B + C
Un ejemplo es la glucoquinasa:
glucosa + ATP
A + C-B
ADP + glucosa-6-fosfato
Grupo 2: Transferasas
Catalizan reacciones de transferencia de grupo:
A-X + B
A + B-X
EC 2.7.1.1
Nomenclatura
La nomenclatura correcta, en sentido estricto,
para las transferasas es. donador:aceptor
grupotransferasa.
No obstante, suelen emplearse los nombres
tradicionales de las enzimas, como aceptor
grupotransferasa o donador grupotransferasa;
por ejemplo, la DNA metiltransferasa cataliza la
transferencia de uno o ms metilos al DNA, que
acta de aceptor.
Clase 3: HIDROLASAS
{
Grupo 3: Hidrolasas
Catalizan reacciones de hidrlisis
A-B + H2O
A-OH + H-B
Clase 4: LIASAS
{
Un ejemplo es la acetacetato
descarboxilasa, que cataliza la
reaccin:
cido acetactico
CO2 + acetona
{
Clase 4: LIASAS
{
{
{
Grupo 4: Liasas
Catalizan reacciones reversibles de adicin de un grupo a
un doble enlace:
A=B + X
COOCH
CH
COOFumarato
(trans-)
H 2O
AXB
COOHO CH
CH2
COOL-Malato
Clase 5: ISOMERASA
Grupo 5: Isomerasas
-Isomerasas cis trans modifican la configuracin geomtrica
a nivel de un doble ligadura. Los xidos reductasas
intramoleculares catalizan la interconversin de aldosas y
cetosas, oxidando un grupo CHOH y reduciendo al mismo
tiempo al C = O vecino, como la triosa fosfato isomerasa,
presente en el proceso de la gluclisis.
-Transferasas intramoleculares (o mutasas) pueden facilitar el
traspaso de grupos acilo, o fosforilo de una parte a otra de la
molcula, como la lisolecitina acil mutasa que transforma la 2
lisolecitina en 3 lisolecitina.
-oxido reductasa intramoleculares: actan realizando
inversiones muy complejas, como transformar compuestos
aldehdos en compuestos cetona, o viceversa. Estas
desarrollan una oxidorreduccin dentro de la propia molcula
sobre la que actan, quitando hidrgeno, a algunos grupos y
reduciendo otros.
Clase 5: ISOMERASA
ejemplos la fosfotriosa isomerasa y la fosfoglucosa
isomerasa
fosfoglucosa isomerasa
glucosa-6-fosfato
fructosa-6-fosfato
Precursor
Enzima /
Proceso
Producto
Gliceraldehdo - 3 - fosfato
Isomerasa
Dihidroxiacetona fosfato
Dihidroxiacetona fosfato
Isomerasa
Gliceraldehdo
- 3 - fosfato
R
Ribulosa
Isomerasa
Ribosa
Ribosa
Isomerasa
u
t
a
1
6
:
Ribulosa
B
i
o
s
n
t
e
s
i
s
Glucosa 6 - P
Isomerasa
Fructosa 6 - P
Fructosa 6 - P
Isomerasa
Isopentil difosfato
Isomerasa
Dimetilalilpirofosfato
Maleil acetoactico
Isomerasa
Succinil
acetoacetato
e
Metilmalonil CoA
Isomerasa
Gliceraldehdo - 3 - fosfato
Isomerasa
Glucosa 6 - P
d
l
c
i
d
o
Succinil CoA
v
Dihidroxiacetona
fosfato
e
g
r
a
s
o
Dimetilalilpirofosfato
Isomerasa
m
Isopentil
difosfato
Succinil acetoacetato
Isomerasa
Maleil
acetoactico
-
Dihidroxiacetona fosfato
Isomerasa
e
Gliceraldehdo
- 3 - fosfato
g
r
a
p
a
Clase 6: LIGASAS
{
Grupo 6: Ligasas
Catalizan la unin de dos grupos qumicos a expensas
de la hidrlisis de un enlace de alta energa.
A + B + ATP
A-B + ADP + Pi
O bien
C + D + ATP
- Aminoacil-tRNA sintetasas
- Glutamina sintetasa
- Carboxilasas
Un ejemplo es la piruvato carboxilasa, que cataliza la reaccin:
piruvato + CO2 + ATP
oxaloacetato + ADP + Pi
ENZIMAS CLASIFICACION
8Clasificacin de las enzimas
1. Oxido-reductasas (reacciones de oxido-reduccin por transferencia de
electrones)
1.1.actuando en CH-OH
1.2.actuando en C=O
1.3.actuando en C=O1.4.actuando en CH-NH2
1.5.actuando en CH-NH1.6.actuando en NADH, NADPH
2.Transferasas (transfieren grupos funcionales entre molculas)
2.1.grupos con un carbono
2.2.grupos aldehdo o cetona
2.3.grupos acil
2.4.grupos glicosil
2.7.grupos fosfatos
2.8.grupos conteniendo asufre
3.Hidrolasas (reacciones de hidrlisis)
3.1.steres
3.2.enlaces glicosdicos
3.4.enlaces peptdicos
3.5.otras enlaces C-N
3.6.anhdridos cidos
ENZIMAS CLASIFICACION
8Clasificacin de las enzimas
4.Liasas (catalizan el rompimiento de uniones covalentes)
4.1. =C=C=
4.2. =C=O
4.3. =C=N5.Isomerasas (transferencia de grupos dentro de la misma
molcula para formar ismeros)
5.1.racemases
6.Ligasas (catalizan reacciones de formacin de nuevas
molculas a partir de enlaces, a expensas de energa)
6.1. C-O
6.2. C-S
6.3. C-N
6.4. C-C