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Metabolismo celular
Es el conjunto de todas las reacciones qumicas que ocurren dentro de la
clula, generalmente estas reacciones qumicas estn ligadas unas a otras y
por esto se conocen como rutas o vas metablicas.
En una va metablica generalmente la reaccin que precede es utilizada
en la que sigue.
El metabolismo se divide en dos tipos:
Anabolismo: es el conjunto de reacciones qumicas de sntesis, que a
partir de molculas simples se obtienen molculas ms complejas. Estas
reacciones son de tipo endergnicas, ya que se requiere de energa en forma
de ATP.
Catabolismo: es el conjunto de reacciones qumicas por medio del cual
se degradan o desdoblan las molculas complejas en molculas sencillas. Estas
reacciones catablicas son de tipo exergnicas, es decir que liberan energa.
Generalmente una reaccin anablica esta acoplada a una reaccin
catablica
Los seres vivos son capaces de utilizar la energa que se libera durante
la degradacin de los nutrientes para llevar a cabo reacciones de biosntesis
que requieren energa mediante reacciones metablicas acopladas, es decir,
una reaccin que necesita energa es acoplada o realizada, de manera
simultneamente o inmediatamente despus que ocurra una reaccione que
libere energa, esto es lo que se llama acoplamiento metablico.
Ejemplo: Los nutrientes que contienen energa como los carbohidratos las
grasas y las protenas son degradados por catabolismo y se obtienen productos
sencillos (CO2, H2O, amoniaco). Estas reacciones catablicas como son
exergonicas liberan energa, esta energa es captada para sintetizar unos
productos que se conocen como intermediaros energticos (ATP, NADH, FADH),
estos intermediaros son molculas que se cargan y almacenan la energa, y
estas molculas van hacia reacciones que requieren energa como son las del
anabolismo. Es decir raciones de sntesis acopladas a reacciones de
degradacin donde se utilizan intermediaros energticos.
El ATP (Adenosin TriFosfato) es el principal intermediario energtico
pero no es el nico, la clula es capaz de guardar la energa necesaria en
molculas, el principal pero no el nico es el ATP. La molcula de ATP est
formada por una adenina, una ribosa y tres grupos fosfatos, es decir, es un
nuclesido trifosfatado de la adenina.
El ATP como tiene tres grupos fosfatos son cargas altamente ionizadas y
se repelen unos con otros, por lo tanto resulta fcil separar un o dos grupos
fosfatos del resto de la molcula. Cada vez que se separa un grupo fosfato se
pueden liberar 7,3 o 7,2 kilocaloras/mol, es decir que se libera una gran
cantidad de energa, por esto el ATP es el intermediario de energa por
excelencia porque sus enlaces fosfatos almacenan una gran cantidad de
energa y es relativamente fcil separarlos.
El ADP o ATP es una coenzima que interviene en la transferencia de
energa de los procesos exergonicos a los endergonicos, es decir acta como
un intermediario energtico entre los procesos exergonicos y los procesos
endergonicos.
Podemos concluir que la sntesis del ATP es la mayor funcin de
mecanismo degradativo.
A parte del ATP existen otras molculas con caractersticas similares
como: GTP, CTP, TTP, UTP.
Respiracin Aerbica
Es un mecanismos que utiliza oxigeno como ultimo aceptor de
electrones. Usualmente se utiliza la glucosa como materia prima para obtener
energa, esta se va a metabolizar a dixido de carbono (CO2) y agua (H2O), y
a travs de ella se obtiene energa en forma de ATP. De manera que se
degrada la glucosa hasta sus componentes ms sencillos. Normalmente se usa
la glucosa porque es de rpida combustin, es decir la que podemos degradar
ms rpido.
La ruta ms eficiente para la obtencin de ATP por molcula de glucosa,
es la respiracin aerbica. La respiracin aerobia se lleva a cabo a travs de
tres fases o etapas: glucolisis o glicolisis, ciclo de krebs o ciclo del cido ctrico
o ciclo de los cidos tricarboxilicos y la fosforilacion oxidativa o cadena
respiratoria.
Fase 1
Glucolisis
La glucolisis ocurre en el citoplasma celular y consta de 9 reacciones
enzimticas, donde lo que se persigue, es que la glucosa que es una molcula
+
2
NAD
Entrada: Glucosa + 2ATP +
+
2 NAD
+
NAD
a NADH.
Fase 2
Ciclo de Krebs
Es una serie de reacciones qumicas de gran importancia que forman
parte de la respiracin celular en todas las clulas aerbicas, es decir que
utilizan oxigeno. El ciclo de krebs ocurre en la matriz mitocondrial.
Para que el ciclo de krebs ocurra el piruvato tiene que ser trasladado
hasta matriz mitocondrial, pero antes de que el piruvato entre al ciclo de
krebs, este tiene que sufrir una reaccin o transformacin.
El ciclo de krebs es considerado el uno del metabolismo, ah llega todo,
consiste en 8 reacciones enzimticas y en las clulas eucariotas este proceso
es realizado en la matriz mitocondrial en presencia de oxigeno.
ACETILACION DE PIRUATO
Despus de la glucolisis ocurre la transformacin de piruvato, esta
transformacin es conocida como acetilacin del piruvato. El piruvato una vez
obtenido en la glucolisis va a la matriz mitocondrial, antes de entrar al ciclo de
krebs el debe ser transformado en otro compuesto.
Piruvato se acetila transformndose en acetil coenzima A, mediante una
reaccin conocida como acetilacin de piruvato, esta reaccin ocurre en la
matriz mitocondrial, el compuesto acetil coenzima A es el que entra al ciclo de
krebs.
Piruvato + coenzima A +NaD* -- acetilcoenzima A + NaDH + CO2
Esta reaccin es catalizada por la enzima piruvato deshidrogenasa
El ciclo de Krebs inicia con un compuesto que se llama oxalacetato este
compuesto tiene 4 carbonos, la acetil coenzima A entra y se une al oxalacetato
para formar citrato un compuesto que tiene 6 carbonos (observamos en el
esquema, el piruvato tiene 3 carbonos se acetila pierde un carbono CO2, queda
con dos carbonos que se unen al oxalacetato haciendo los 6) y la coenzima A
sale, es como si la coenzima A fuera el que atrapa el piruvato y lo une con el
oxalacetato una vez que ella cumple esa funcin sale, a partir de all los
compuestos va sufriendo una transformacin. Ahora por que se llama ciclo del
cido ctrico o ciclo del acido tricarboxilico debido a que los compuestos tienen
3 COOH por eso se llama tricarboxilico, tiene ms de uno, se llama ciclo porque
donde comienza termina, la finalidad del clico de Krebs es degradar
completamente la glucosa, en el sentido de que el piruvato al quitarle un
carbono de la acetilacin ahora se le quita otro y luego otro de manera tal que
la glucosa queda degradada completamente en CO2, y se obtiene el compuesto
que nos interesa para la siguiente fase que es el NADH.
Si vemos el ciclo de krebs aqu obtengo un NADH aqu otro, arriba
obtengo otro, y obtengo un compuesto que se llama FADH2 un compuesto
distinto al NADH pero que cumple la misma funcin, intermediario en el
transporte de electrones, entra el acetil coa se une con oxalacetato, sale la
coenzima A, que sale para volver a unirse con otro piruvato, comienza la
reaccin, se isomerisa se oxida, pasa de citrato a isocitrato todo lo que
termina en ato (as lo dijo ella). Pasa por todas las reacciones que no se van a
estudiar, y se obtienen en el ciclo CO2 y NADH FADH y adems obtengo una
molcula de GTP (guanosin trifostafo), que luego se va transformar en ATP, ese
GTP cede sus electrones para formar ATP.
EN TODO EL PROCESO
ACETILACION+6 KREBS
DE
RESPIRACION
GLUCOLISIS+2
La fermentacin es un
proceso productor de energa donde los
compuestos orgnicos actan como donadores y aceptores de electrones, y la
nica manera de obtener ATP es por fosforilacion a nivel des substrato.
La fermentacin celular, como este proceso es anaerbico, por ende no
existe oxigeno como aceptores final de electrones, los aceptores de electrones
del NADH no es el oxgeno si no un compuesto orgnico que se reducir para
que este se vuelva a oxidar, el NADH se encuentra en pocas concentraciones
en la clula y si este se oxida se tiene que inmediatamente reducir porque se
tiene que reponer.
El proceso de fermentacin celular es un proceso catablico de oxidacin
incompleta, catablico porque es degradativo y es incompleto porque no se
termina de degradar todo el compuesto.
Dependiendo del producto que se obtiene en el proceso fermentativo, se
clasifica en: fermentacin lctica y fermentacin alcohlica.
La fermentacin lctica
Ocurre en algunas bacterias y en la clulas animales en donde se
obtiene glucosa a travs del proceso de glucolisis que se obtiene 2 molcula de
piruvato esta a su vez me genera las 2 molculas de ATP, es aqu donde el
NADH este compuesto pierde sus electrones, de manera que el compuesto
queda NAD y los electrones son cedidos en piruvato para obtener lacto o cido
lctico.
Fermentacin Alcohlica:
Ocurre en las levaduras, en donde la glucosa a travs de la glucolisis se
obtiene 2 molculas de ATP como rendimiento enrgetico y 2 molculas de
Piruvato, se obtiene 2 molculas de NADH en el proceso de Glucolisis. El
piruvato estar con una enzima conocida como piruvato descarboxilasa esta
libera CO2, caracterstica importante durante este proceso por la liberacin del
CO2 y por la formacin del producto final que es el etanol.
El piruvato con la combinacin de esta enzima (piruvato descarboxilasa)
libera el CO2, se obtiene acetaldehdo y por medio de una enzima alcohol
deshidrogenasa lo transforma en un alcohol especficamente el etanol. Por eso
cuando se fermenta alcohlicamente se da como producto una bebida
carbonatada (cerveza, algunos tipos de vino, entre otras) por eso que algunas
bebidas son gaseosas porque posee C02 disuelto.
Existen distintos tipos de fermentacin que puede ocurrir y los grupos
bacterianos que en ellos actan:
Sntesis de Protenas
Una de las principales funciones del ncleo es controlar, regular y dirigir
la sntesis de protenas.
La sntesis de protenas est explicada dentro de lo que se conoce como
dogma central de la biologa, el cual es una verdad indiscutible. Nos dice que el
ADN es la nica molcula capaz de autoduplicarse, la informacin que est
contenida en el ADN va a determinar todas las caractersticas del individuo,
esta informacin es copiada mediante un proceso llamado transcripcin del
ADN
y esa informacin trascrita es expresada en forma de un ARNm
(mensajero) el cual lleva el mensaje copiado del ADN y posteriormente es ledo
o traducido en los ribosomas y se obtiene como resultado una protena, es
decir, que toda la informacin del ADN va a ser expresada como resultado
nicamente en forma de protena, lo que constituye un dogma central.
Replicacin (duplicacin del ADN)
NUCLEONUCLEO
Traduccin (sntesis proteica)
RIBOSOMAS
Etapa 1: Transcripcin del ADN.
Ocurre en el ncleo, hay regiones de ADN que van a ser copiadas
exactamente, es decir, se copia la secuencia de las bases nitrogenadas , para
ello se separan las bandas del ADN y una de ellas que se conoce como hebra
molde va a ser copiada en forma de ARN Complementariamente; para ello
acta la ARN polimerasa(que siempre va actuar en direccin 5 1-31) hasta
donde est determinado que se va a acopiar, luego sta revisa la copia para
corregir los errores (secuencias que no significan nada) y luego se le coloca
una marca a esa banda de ARNm, conocida como una cola de poliadenina
(AAAA), posteriormente de que ese ARNm es sintetizado sale por los poros
nucleares hasta el citoplasma y se dirige hacia los ribosomas donde ser ledo
o traducido ese mensaje.
Etapa nmero 2: Traduccin del mensaje
Ocurre en los ribosomas, se lee la informacin que trae el ARNm y se
sintetiza la protena respectiva codificada en el mensaje.
Elementos que intervienen en la segunda etapa: Aminocidos, ARNt,
ribosomas, enzimas, factores proteicos de liberacin y energa en forma de ATP
o GTP.
Los ribosomas son unas sub unidades supra moleculares formadas por
dos partes, unidad mayor y unidad menor, no son orgnulos porque no tienen
membrana y son fabricados en el nuclolo, ambas sub unidades se sintetizan
de manera independiente y salen del ncleo por los poros nucleares hacia el
citoplasma. Estas sub unidades siempre se mantienen separadas y solo se
unen cuando va a ocurrir la lectura del ARNm o la traduccin del mensaje, se
identifican con nmeros, unidad 70 S, unidad 30 S o unidad 60 S unidad 40 S,
dependiendo de la especie.
En los ribosomas se identifican 3 sitios ribosomales, que son los sitios a donde
van a llegar los materiales en la sntesis de protenas, estos son sitio A, sitio P
y sitio E. En la unidad pequea del ribosoma se acopla el ARNm, luego la
unidad mayor y se ubican los 3 sitios ribosomales.
Fases de la traduccin
1) Activacin de la transferencia: En esta fase los aminocidos se van a
unir a su ARNt especfico y se consume energa por la formacin del
enlace entre el Aa y el ARNt. Esta etapa es previa, donde el ARNm ya
sali del ncleo, se presenta en el citoplasma y se disparan las seales
qumicas de que se debe hacer la lectura del ARNm. El ARNm tiene una
cola de poliadenina que lo identifica como un ARN recin sintetizado y
que va a ser ledo.
Los ARNt estn formados por una sola banda de nucletidos y tiene
forma de trbol, hay un ARNt para cada Aa, es decir, son muy especficos.
Hay codones que no codifican ningn Aa, estos codones son llamados
codones STOP o de terminacin, codifican la terminacin de la sntesis
proteica.
Hay 61 codones para 21 Aa, es decir, hay ms de un codn para cada
Aa, pero un codn solo codifica un Aa. Un Aa est codificado por ms de
un codn, pero un codn solo codifica un Aa.
Toda protena comienza por el codn AUG, que es formil metionina
(procariotas) o metionina (eucariotas).
El cdigo es universal para cualquier nivel de vida, excepto para las
mitocondrias, debido a que estas poseen su propio ADN y su propio
cdigo.
Diferencias
eucariotas:
entre
la
sntesis
de
protenas
en
procariotas