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R et R commander
Prambule
Le but du prsent document de fournir un point de dpart pour des dbutants
intresss R et surtout le package R commander.
R est un systme danalyse statistique et graphique cre par Ross Ihaka et Robert
Gentleman. R est distribu librement sous les termes de la GNU General Public
commander
Toshiharu OKAYASU
Installation de R .................................................................................................................. 5
Installation du package R
de Wilcoxon bivari
(Mdians) ........................................................................................................................... 40
R commander Personnalis .............................................................................................. 43
ANNEXE :
Menu de statistiques
Installation de R
Tlchargez R2-13.1-win.exe
(www.r-project.org/)
Double-cliquez sur R-2.13.1-win.exe
Slectionnez
la
langue
dinstallation.
Cliquez sur OK.
Slectionnez
sur
Non
et
Cliquez
sur
attendez
Suivant
la
dinstallation.
Note : Quand R se dmarre, il peut vous demander les packages manquants. Vous
allez tlchargez ou vous allez copier et coller des packages manquants dans le
fichier de library.
Quand licne de R est sur votre bureau de lordinateur, cliquez droite et
slectionnez la proprit.
Ajoutez --sdi -q
le cible
et
finition
Installation du package R
Slectionnez
le pays plus
proche, en cas
de
Madagascar,
Afrique
de
Sud
est
Slectionnez
recommand.
Rcmdr
et
Cliquez
sur
OK.
coin
de
la
fentre
Donnes > Donnes dans les packages > Lire des jeux des donnes dans les
packages
Slectionnez le package et
donnes.
Mettez le nom de jeu de
donnes
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Mettez le nom dun jeu de donnes : Par exemple< DRSP_AaG> et cliquez sur OK.
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13
Cliquez sur OK
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Exercices : vous allez changer le type de donnes pour des dautre donnes.
Recoder des variables
Quand nous voudrions compter le nombre par catgorie avec des donnes
numrique, il faut recoder des variables. Par exemple, on a besoin le nombre des
attributions par catgorie au lieu de Moyenne et Mdian.
Donnes > Grer les variables dans le jeu de donnes actif >Recoder des variables
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Donnes
recodes
seront
16
Slectionnez
Variables
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les buttons.
18
Une
case
de
Frquence
19
sur
Test
exact
de
20
Mettez le nom dun jeu de donnes : Par exemple< DRSP_HaN> et cliquez sur OK.
Si vous cliquez la case cote de Donnes, deux tableaux seront apparus. Cliquez sur
Cancel si la slection est bonne.
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Distribution de frquence
Statistiques > Rsum >Distribution de frquence
Vous peuvez compter des nombres et pourcentage de donnes en facteur et test
dajustement de Chi-Carre.
Vous
allez
dfinir
les
probabilits dhypothse. Par
dfaut R peut calculer des
probabilits en fonction de type
de donnes.
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df=Degrs
de
Libert
si
vos
variables
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30
Graphe en camembert
Graphe >Graphe en camembert
etc
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Montre ltendue
Courbe de lissage
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Graphe en 3D
Graphe >Graphe en 3D> Nuage de points en 3D
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Test de corrlation
Statistique >Rsum > Test de corrlation
Note. Cette exercice est cvec les donnes de table SDSP_AaG de SDSP final.(Access)
Bilatral.
points.
r
0,2
0,4
r
r
0, 7
1,0
0,2
0,20,2
r
0,40,4
0,7 0,7
Vrifiez
sur
la
moindres carres
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ligne
des
Comme la value de P >0,05(P=0,8718), on ne peut pas dire que cette variable ne suit
pas la distribution normale Si bien que vous utiliser le test paramtrique.
On va vrifier cette distribution avec une graphe.
Graphe>Histogramme
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Le
graphe
est
comme
distribution normale.
37
la
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Test de Welch
Test de Welch est inclus dans t-test indpendant.
Statistiques > Moyennes > T Test indpendant
va
calculer
indpendant :
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Test
Test
de Wilcoxon bivari
moyennes (Mdians)
Nous voudrions comparer la moyenne de deux groupes de FS (2008 et 2011) pour la
ralisation de dpistage du VIH en 2011.
Cette
variable
ne
se
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car les
R commander Personnalis
Vous pouvez personnaliser R commander
et le fichier Rcmdr-menus.
Rcmdr, il vaux mieux consulter cette partie quelquun qui connaisse R commander
et/ou programmation.
Rcmdr-menus qui ont dj personnalis, vous les copiez et coller dans le dossier
avec Rpertoire : MyDocement>R>win-library>2.13>Rcmdr>etc ou Programme
files>R>library>2.13>Rcmdr>etc.
Avec notre atelier du 29 aout au 2 septembre 2011, nous avons ajout les fonctions
de
Somme
des
donnes,(Statistiques
>Ajouter
>Sommes
des
transition
individuelle(Graphes
>Ajouter
>Diagramme
de
transition
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ANNEXE :
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Type de donnes
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48
Distribution T
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Distribution Chi-carre
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