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Disciplina: Monografia I
Recebido
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Por:
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Assinatura:
Porto Alegre
2015
Porto Alegre
2015
AGRADECIMENTOS
minha me, Veronika Bohusch Oliseski, que com muita determinao e fora
proporcionou tudo nossa famlia.
Ao meu pai, Doutor Silvio Luiz Rocha Oliseski, por compreender e mostrar-se feliz
pelas minhas escolhas, sempre, e por ter influenciado meu caminho at aqui.
Ao Prof. Dr. Gervasio da Silva Carvalho, por ser meu orientador, pai, av, amigo e
carrasco durante esses curtos 4 anos. Seus ensinamentos e azedumes sero levados sempre no
meu corao.
ps-doutoranda Andressa Paladini, pelas conversas, ensinamentos, ideias e amizade
de que vou lembrar sempre que estiver colorindo acompanhada de uma xcara de ch.
Thayana Tabarkiewicz, minha simbiose, por me ajudar a transformar as coisas ruins
da vida em piada.
Ao meu namorado, Tiago Corra Incio, por me trazer a paz nos dias mais tensos e por
afastar meus medos com amor.
E por ltimo, mas no menos importante, aos meus colegas de laboratrio, de aula e da
vida, que diminuem o peso dos dias, quebram a rotina cansativa e acabam sendo uma famlia,
um apoio, uma alegria.
RESUMO
Fulgoromorpha)
so
caracterizados
principalmente
por
serem
extremamente grandes e robustos, tendo pelo menos de trs a quatro vezes a massa corporal
de quaisquer outras espcies neotropicais, e se aproximam do tamanho do corpo de pequenos
lagartos, chegando a mimetiz-los. Esta famlia mostra uma notvel diversidade de
associaes simbiticas com bactrias. As relaes simbiticas nutricionais em vrias ordens
de insetos desenvolveram-se independentemente com diferentes tipos de microrganismos. Os
simbiontes tm diversos efeitos ecolgicos e evolutivos em seus hospedeiros, influenciando
aspectos de interaes ecolgicas da nutrio defesa. Estudos demonstram que as
associaes entre microrganismos e hospedeiros multicelulares so obrigatrias, sendo
cruciais em termos evolutivos, na gerao de diversidade fenotpica e na origem de fentipos
complexos capazes de colonizar novos ambientes. Tais evidncias so importantes para os
sistemas simbiticos encontrados nestes insetos. A metodologia deste estudo envolve a
utilizao de metagenmica para conhecimento dos simbiontes e a realizao de reaes em
cadeia da polimerase (PCR) para amplificao e posterior sequenciamento de fragmentos de
DNA dos hospedeiros, representados por oito espcies de Fulgora. A anlise e comparao
das topologias obtidas nos permitir observar se no gnero Fulgora houve um processo de
coevoluo com seus simbiontes.
ABSTRACT
LISTA DE ILUSTRAES
LISTA DE TABELAS
SUMRIO
1 INTRODUO..................................................................................................................... 9
1.1 SIMBIONTE.........................................................................................................................9
1.2 HISTRICO DO TXON..................................................................................................10
1.3 COEVOLUO.................................................................................................................12
2 JUSTIFICATIVA.................................................................................................................17
3 OBJETIVOS.........................................................................................................................18
3. 1 OBJETIVO GERAL..........................................................................................................18
3. 2 OBJETIVOS ESPECFICOS.............................................................................................18
4 MATERIAL E MTODOS.................................................................................................19
4.1 EXTRAO.......................................................................................................................19
4.2 REAES EM CADEIA DE POLIMERASE (PCR)........................................................19
4.3 AMPLIFICAO DE DNA DE FULGORA.....................................................................20
4.3.1 Amplificao do gene rRNA 16S.....................................................................................20
4.4 SEQUENCIAMENTO DO DNA DE FULGORA.............................................................21
4.4.1 Sequenciamento do gene 16S..........................................................................................21
4.5 ALINHAMENTO DAS SEQUNCIAS.............................................................................21
4.6 FILOGENIA.......................................................................................................................21
5 RESULTADOS ESPERADOS E PERSPECTIVAS..........................................................23
REFERNCIAS..................................................................................................................24
APNDICE A......................................................................................................................26
APNDICE B......................................................................................................................27
1 INTRODUO
1.1 SIMBIONTE
10
11
12
1.3 COEVOLUO
13
14
15
A motivao evolutiva para assimilar genes estranhos decorre do fato bvio de que as
espcies diferem em conjuntos de genes e de capacidades correspondentes. Assim, a
associao ntima entre duas linhagens pode facilmente surgir atravs da seleo natural,
atuando dentro de cada espcie para corrigir alelos que promovem a estreita associao com
as outras espcies. Embora as diferenas nas capacidades metablicas entre espcies sejam
evidentes, a genmica est fornecendo uma viso detalhada de como essas diferenas
surgiram (13). H provas esmagadoras de que existe uma associao obrigatria entre
microrganismos e hospedeiros multicelulares, sendo crucial em muitos acontecimentos
marcantes na evoluo, na gerao de diversidade fenotpica e na origem de fentipos
complexos capazes de colonizar novos ambientes. Tal evidncia abundante para os sistemas
simbiticos encontrados em insetos, em grande parte por causa dos estudos moleculares e
genmicos (13).
A metagenmica vem sendo aplicada para responder questes fundamentais da
microbiologia ambiental como: quantos so? Quem so? E fazendo o qu? Por isso, a
metagenmica representa uma importante ferramenta para estudo da ecologia microbiana e
prospeco do potencial metablico atravs da anlise da diversidade taxonmica e
localizao de genes e operons responsveis pela sntese de molculas com propriedades de
interesse biotecnolgico (12, 15, 16).
O sequenciamento do gene rRNA 16S permite a identificao de clulas, mesmo em
pequenas quantidades, o que proporciona informaes sobre a composio taxonmica da
comunidade microbiana. A construo de bibliotecas genmicas de rRNA 16S representa uma
tima ferramenta para a anlise da diversidade molecular de comunidades de microrganismos
(28).
A anlise do genoma uma ferramenta essencial para determinar as relaes
evolutivas. A sequncia completa do DNA de um organismo define a sua natureza com
preciso. Como o DNA est sujeito a mudanas aleatrias que se acumulam durante longos
perodos de tempo, o nmero de diferenas entre as sequncias de DNA de dois organismos
pode proporcionar uma direta, objetiva e quantitativa indicao da distncia evolutiva entre
eles (12).
16
17
2 JUSTIFICATIVA
18
3 OBJETIVOS
3. 1 OBJETIVO GERAL
3. 2 OBJETIVOS ESPECFICOS
19
4 MATERIAL E MTODOS
4.1 EXTRAO
Para a extrao, ser utilizado um abdome de cada um dos espcimes para a obteno
da sequncia dos simbiontes e uma perna, previamente macerada, para a obteno da
sequncia de cada espcie de Fulgora. Os abdomens dos espcimes ou a musculatura da perna
sero submergidos em soluo contendo 180l de buffer ATL e 20l de proteinase K (mistura
para lise celular) incubadas por 12 horas a 55C. Neste extrato ser posteriormente utilizado o
Qiagen DNEasy Kit (Qiagen, Inc., Valencia, CA, USA), seguindo um protocolo com os
seguintes passos: adio em cada amostra de buffer AL (lise celular), etanol 100% e
posteriormente utilizao da centrfuga em combinao com a lavagem das amostras com
buffer AW (lavagem) e buffer AE (eluio).
20
para desnaturao inicial seguidos de 3035 ciclos de 1 minuto cada a 4060C para
anelamento, 1 minuto a 72C, terminando com 7 minutos incubando a 72C. Controles
negativos sero includos em todas as reaes para a deteco de possveis contaminaes.
21
Cada gene ser sequenciado separadamente para cada combinao de primers. Todos
os dados cromatogrficos das sequncias sero revisados, editados e as fitas complementares
do DNA combinadas para a obteno de uma fita consenso utilizando-se o programa
Sequencher 4.8. A utilizao das fitas complementares (obtendo-se uma fita consenso)
permite uma maior confiabilidade nas posies nucleotdicas a serem utilizadas para o
posterior alinhamento.
4.6 FILOGENIA
22
das 8 espcies de Fulgora. A aplicao dos trs programas resultar em trs topologias de
simbiontes e trs topologias de cada cigarrinha. As topologias sero comparadas para a
obteno de uma topologia final de cada Fulgara e simbionte. Com as topologias finais ser
possvel verificar a coevoluo entre hospedeiro e seus simbiontes.
A descrio dos procedimentos de materiais e mtodos para os fulgordeos seguiu o
padro de elaborao descrito na tese de Paladini A., 2012 (17).
23
Com a realizao deste trabalho espera-se obter os sequenciamentos dos genes das oito
espcies de Fulgora, realizar o alinhamento dos genes e inferir uma filogenia. A partir disso,
ser possvel realizar a comparao com a filogenia obtida dos simbiontes mais abundantes
selecionados por metagenmica, tornando, ento, vivel a anlise da hiptese de coevoluo
entre os espcimes de Fulgora em comparao com seus simbiontes.
24
REFERNCIAS
1.
2.
Buchner P. Endosymbiosis of animals with plant microorganisms. New York, N.Y.:
Interscience;1965.
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state for successful reproduction in hematophagous arthropods. Parasitology, Cambridge,
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Experimental Botany, Oxford, v.57, p.747-754, 2006.
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Auchenorrhyncha) da coleo do Museu de Cincias e Tecnologia da PUCRS (MCTP).
Seminrio Interno de Avaliao da Iniciao Cientfica - PUCRS. FAPERGS; 2014.
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15.
Steele HL and Streit WR. Metagenomics: Advances in ecology and biotechnology.
FEMS Microbiology Letters 247, p.105-111, 2005.
16.
to
Uncultured
17.
26
APNDICE A - Cronograma
Atividades
Anlise morfolgica dos
espcimes pertencentes a
Fulgora
Seleo dos espcimes para
retirada do abdome
Jan - Abril
Mai - Ago
Set -Dez
Jan - Abril
Mai - Ago
Set - Dez
Realizao do PCR
X
Extrao de DNA
Edio de sequncias
Alinhamento de todas as
sequncias
Cladogramas comparativos
27
APNDICE B Oramento
Propsito
Kit para extrao de 250
amostras de DNA.
Sntese de fitas de
oligonucleotdeos para
utilizao no PCR.
DNA polimerase para
amplificao.
Sequenciamento na Macrogen
http://dna.macrogen.com/eng/
Desoxiribonucleotdeos
para amplificao por
PCR.
Marcador de peso.
Corante fluorescente para
cidos nucleicos para
observao dos produtos
de PCR aps eletroforese.
Reagentes de uso geral no
laboratrio, por exemplo,
lcool etlico, agarose,
TBE, ponteiras de pipetas,
microtubos de PCR,
luvas, etc.
Propsito
Reaes de purificao,
sequenciamento e leitura
do gel de sequenciamento.
TOTAL
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Servios de terceiros
Preo (R$)
1.745.00
1.500.00
1.446.00
750.00
700.00
700.00
3.000.00
Preo (R$)
20.000.00
30.000.00