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Protena globular
Rosario A. Muoz-Clares
Alanina
Tirosina
Leucina
Serina
Prolina
Rosario A. Muoz-Clares
Alanina
Tirosina
Leucina
Serina
Prolina
Adenina
Citosina
NuclePdos
cido
nucleico
Adenina
Guanina
Timina
Residuos de azcares
Manosa
Polisacrido
Glucosa
Galactosa
Fructosa
Glucosa
Rosario A. Muoz-Clares
IDEA
CENTRAL
La
funcin
de
una
molcula
depende
de
su
estructura
Por
tanto,
para
comprender
a
fondo
o
poder
manipular
su
funcin,
se
necesita
conocer
su
estructura.
Glicina
Gly
L-Leucina
Leu
L-Alanina
Ala
L-Me'onina
Met
L-Valina
Val
L-Isoleucina
Ile
Rosario A. Muoz-Clares
L-Prolina
Pro
Rosario A. Muoz-Clares
AMINOCIDOS
CON
CADENAS
LATERALES
AROMTICAS
L-Fenilalanina
Phe
L-Tirosina
Tyr
L-Triptofano
Trp
Rosario A. Muoz-Clares
L-Serina
Ser
L-Tirosina
Tyr
L-Treonina
Thr
L-Asparagina
Asn
L-Cistena
Cys
L-Glutamina
Gln
Rosario A. Muoz-Clares
L-Aspartato
Asp
L-Glutamato
Glu
Rosario A. Muoz-Clares
H
L-His'dina
His
L-Lisina
Lys
L-Arginina
Arg
Rosario A. Muoz-Clares
Tamao
Los
-aminocidos
estn
aqu
ordenados
de
acuerdo
al
tamao
de
su
cadena
lateral
(de
menor
a
mayor).
Rosario A. Muoz-Clares
AcCvidad
pCca
Todos
los
-aminocidos
presentes
en
las
protenas,
excepto
la
Gly,
Cenen
al
menos
un
carbono
asimtrico
con
cuatro
disCntos
susCtuyentes
y
por
tanto
son
compuestos
quirales
con
acCvidad
pCca.
Todos
ellos
son
levgiros
(L).
Rosario A. Muoz-Clares
Rosario A. Muoz-Clares
Fluorescencia
Los
-aminocidos
aromCcos
uorescen
cuando
son
excitados
con
luz
de
una
determinada
longitud
de
onda.
Rosario A. Muoz-Clares
Fluorescencia
Los
-
aminocidos
aromCcos
uorescen
cuando
son
excitados
con
luz
de
una
determinada
longitud
de
onda.
Rosario A. Muoz-Clares
ENLACE COVALENTE
Los tomos unidos por
este enlace comparten
electrones para lograr
configuraciones
electrnicas estables.
En el enlace covalente
sencillo se comparte un
par de electrones de
valencia, en el doble dos
pares de electrones y en
triple tres pares.
Rosario A. Muoz-Clares
Rosario A. Muoz-Clares
Rosario A. Muoz-Clares
Cistena
Puente
disulfuro
Cistena
Cistena
Puente
disulfuro
Cistena
ENLACE INICO
U =
Kq1q2
Dr
Rosario A. Muoz-Clares
-AMINOCIDOS
Forma
no
inica
(no
existe)
Forma
zwiterinica
(existe
a
pH
siolgico)
Rosario A. Muoz-Clares
pH
HA
H+
+
A-
cido
Ka =
Base conjugada
+
-
[H ][A ]
[HA]
HA
H+
+
A-
pKa
=
-logKa
=
log(1/Ka)
ECUACIN DE HENDERSON-HASSELBACH
Ka
=
[H+][A-]/[HA]
logKa
=
log
[H+]
+
log([A-]/[HA)
pH
=
-log[H+]
pKa
=
-log
Ka
pH
=
pKa
+
log([A-]/[AH])
Rosario A. Muoz-Clares
SIGNIFICADO DE LA ECUACIN DE
HENDERSON-HASSELBACH
pH = pKa + log([A-]/[AH])
La ecuacin de Henderson-Hasselbach nos sirve para:
Determinar la proporcin de la especies cidas y bsicas
(protonadas y desprotonadas, respectivamente) a un
determinado valor de pH conociendo el pKa del par cido-base.
Determinar el pKa de un determinado par cido-base midiendo
los cambios de pH que ocurren cuando se aade a una solucin
acuosa de este compuesto una base o un cido fuerte.
Conocer el pH de una solucin acuosa de un par cido-base si
conocemos su pKa y la concentracin relativa de las especies
cida y bsica.
Rosario A. Muoz-Clares
SIGNIFICADO DE LA ECUACIN DE
HENDERSON-HASSELBACH
pH = pKa + log([A-]/[AH])
Intervalos
de
pH
en
los
que
el
aminocido
se
comporta
como
un
amor'guador
de
pH
A
valores
de
pH
por
debajo
del
pI
los
aminocidos
Cenen
carga
neta
posiCva,
mientras
que
a
valores
de
pH
por
encima
del
pI
Cenen
carga
neta
negaCva.
Rosario A. Muoz-Clares
pK2
+
pKR
=
7.6
pI
=
2
Rosario A. Muoz-Clares
pI =
pK1
+
pKR
=
3.2
2
Rosario A. Muoz-Clares
pKa
versus
pI
pKa
pI
Es
el
valor
de
pH
al
que
la
carga
neta
de
la
molcula
es
cero.
Conocindolo
podemos
saber
la
carga
neta
de
una
molcula
a
un
determinado
pH
y
por
tanto
conocer
la
tendencia
de
una
molcula
a
moverse
en
un
campo
elctrico
o
a
interaccionar
con
otras
molculas
cargadas.
Aplica
para
una
molcula
que
posee
al
menos
dos
pares
cido-base,
como
es
el
caso
de
los
aminocidos.
Rosario A. Muoz-Clares
L-Glutamato
Glu
L-Lisina
Lys
L-His'dina
His
L-Arginina
Arg
Rosario A. Muoz-Clares
Rosario A. Muoz-Clares
PUENTE DE HIDRGENO
Un puente de hidrgeno es la interaccin
electrosttica atractiva entre un tomo de
hidrgeno y un par de electrones no compartido
de un tomo de la misma molcula o de una
molcula cercana.
El tomo de hidrgeno debe poseer una carga
residual positiva por lo que debe estar enlazado
covalentemente a un tomo muy electronegativo.
No se dan cuando el hidrgeno est enlazado a un
tomo poco electronegativo, como el carbono.
Rosario A. Muoz-Clares
PUENTE DE HIDRGENO
Se requieren tres tomos para este enlace:
tomo de hidrgeno.
tomo unido por enlace covalente con el tomo de
hidrgeno y que sea ms electronegativo que ste.
Se le llama tomo donador del hidrgeno.
tomo que posee al menos un orbital con un par de
electrones no compartidos. Se une al tomo de
hidrgeno por atraccin electrosttica. Se le llama
tomo aceptor del hidrgeno.
Rosario A. Muoz-Clares
PUENTE DE HIDRGENO
Rosario A. Muoz-Clares
H
O
P
Puente de hidrgeno
fuerte
Puente de hidrgeno
dbil
O
Rosario A. Muoz-Clares
PUENTES DE HIDRGENO
C
N
H
O
Aceptores del H
Donadores del H
H
Donadores del H
H
N
O
H
Aceptores del H
Rosario A. Muoz-Clares
L-Aspartato
Asp
L-Treonina
Thr
L-Cistena
Cys
L-Glutamato
Glu
L-Tirosina
Tyr
L-Triptofano
Trp
+
H
L-Tirosina
Tyr
L-Asparagina
Asn
L-Glutamina
Gln
L-Lisina
Lys
L-His'dina
His
L-Arginina
Arg
Rosario A. Muoz-Clares
H
C
N
H
H
Grupo dador de hidrgeno del
triptfano
H2
C
H2
C
O
C
O
Forma protnica
del cido aspartico
o glutmico
C
N
H
H2
C
H
Puede servir como dador de hidrgeno
O
C
Forma ionizada
Puede servir como del cido aspartico
aceptor de hidrgeno o glutmico
Asparagina o glutamina
Rosario A. Muoz-Clares
MOLCULA DE AGUA
El
agua
es
un
compuesto
altamente
polar
debido
a
su
geometra
y
composicin
electrnica.
Una
molcula
de
agua
puede
formar
cuatro
puentes
de
hidrgeno,
actuando
como
donador
en
dos
y
como
aceptor
en
otros
dos.
Rosario A. Muoz-Clares
Puente de hidrgeno
0.177 nm
Enlace covalente
0.0965 nm
El
puente
de
hidrgeno
es
ms
largo
y
mucho
ms
dbil
que
el
enlace
covalente
entre
el
tomo
de
oxgeno
y
el
de
hidrgeno.
Rosario A. Muoz-Clares
Rosario A. Muoz-Clares
INTERACCIONES HIDROFBICAS
Los grupos y molculas apolares no son solubles en
agua porque no pueden interaccionar con ella.
Debido a esto surgen entre ellos las llamadas
interacciones hidrofbicas.
Las interacciones hidrofbicas se producen por la
tendencia de estos grupos o molculas a juntarse
para minimizar sus contactos con el agua.
No ocurren en disolventes polares que no sean agua.
Rosario A. Muoz-Clares
INTERACCIONES HIDROFBICAS
Los grupos y molculas apolares no son solubles en
agua porque no pueden interaccionar con ella.
Debido a esto surgen entre ellos las llamadas
interacciones hidrofbicas.
Las interacciones hidrofbicas se producen por la
tendencia de estos grupos o molculas a juntarse
para minimizar sus contactos con el agua.
No ocurren en disolventes polares que no sean agua.
INTERACCIONES HIDROFBICAS
Los grupos o molculas apolares al no poder
formar puentes de hidrgeno con el agua, ni
establecer interacciones electrostticas, no
compensan la prdida de los puentes de hidrgeno
que el agua forma consigo misma cuando se
introducen en ella. Esto desestabiliza al sistema.
El agua compensa esta prdida formando una red
estable de puentes de hidrgeno alrededor de los
grupos apolares (como una jaula).
Rosario A. Muoz-Clares
INTERACCIONES HIDROFBICAS
Las molculas de agua que
participan en esta red de puentes de
hidrgeno estn muy ordenadas, a
diferencia de lo que ocurre con las
molculas del agua bulto.
Esto supone una prdida de
entropa del sistema, que se
minimiza si la superficie de contacto
grupo apolar-agua es mnima, es
decir si los grupos apolares se
renen.
Entre los grupos hidrofbicos que
se mantienen de esta forma unidos
se dice que existen interacciones
hidrofbicas, aunque la atraccin
es realmente la consecuencia de la
repulsin del agua hacia ellas.
Rosario A. Muoz-Clares
L-Me'onina
Met
L-Isoleucina
Ile
MOLCULAS ANFIPTICAS
Rosario A. Muoz-Clares
L-Arginina
Arg
Rosario A. Muoz-Clares
Rosario A. Muoz-Clares
+
+
H 3C
H 3C
H 3C
Rosario A. Muoz-Clares
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