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Christine DAVID
et Vronique CARON (INRS)
ED 6131
Juillet 2012
Sommaire
Sommaire
Introduction..................................................................................................... 4
1. Rappels...................................................................................................... 6
1.1 Les cellules............................................................................................ 6
1.2 Les gnes et protines.......................................................................... 7
1.3 Les virus................................................................................................. 8
1.4 Cas particulier des Rtrovirus.............................................................. 11
Conclusion...................................................................................................... 26
Annexes.......................................................................................................... 27
> Introduction
D
dune espce et de linsrer dans une cellule dune autre espce. Les premiers
organismes gntiquement modifis (OGM) sont ainsi apparus dans les annes
soixante-dix, notamment en 1978, avec la cration dune souche dEscherichia
coli modifie par insertion dun gne humain codant pour linsuline. Les
annes suivantes ont vu lessor de nouvelles techniques accompagnant le
dveloppement de nouvelles applications.
Au-del de la recherche fondamentale, les OGM peuvent tre employs dans
le secteur mdical pour caractriser, diagnostiquer les maladies, produire des
molcules usage thrapeutique (insuline, antithrombine) ou dvelopper
des thrapies gniques. Les OGM sont galement utiliss dans le secteur agricole
pour aider les plantes lutter contre les insectes ravageurs ou pour augmenter
leur qualit nutritionnelle. Dans le cadre du dveloppement durable favorisant
les nergies renouvelables, des recherches portent sur la cration dOGM
pouvant produire des biocarburants.
Selon le Haut Conseil des biotechnologies (HCB), on dsigne par OGM
tout organisme dont le matriel gntique a t modifi autrement que
par multiplication ou recombinaison naturelle. Quel que soit lOGM, sa
cration ncessite les mmes lments : un gne dintrt (appel insert)
issu dorganismes ou de cultures cellulaires, un vhicule (appel vecteur)
introduisant ce gne vers sa nouvelle cellule cible. Les cellules donneuses et
receveuses peuvent tre dorigine microbienne, vgtale, animale ou humaine.
Quant au vecteur, il peut provenir de bactries ou de virus pouvant, lorigine,
tre pathognes pour lhomme.
>1. Rappels
Cytoplasme
Noyau
Ribosome
Mitochondrie
Gnome (ADN)
Cytoplasme
Paroi
Ribosome
Gnome (ADN)
5
ARN Polymrase
3.4 - Protine
Dans le cytoplasme
5
3
Ribosome
Cytoplasme
Cellule procaryote
Transcription
ADN
gne A
gne B
ARNm
Traduction
protine A protine B
Cellule eucaryote
Noyau
Cytoplasme
ADN
gne A
exon
intron
exon
intron
exon
Transcription
Groupes fonctionnels
ARNm.
nuclaire
htrogne
ARNm
mature
Traduction
Modification post-traductionnelle
protine A
Figure 5 - Exemple de rplication de virus ADN nu (a) et envelopp (b) dans une cellule eucaryote.
a) Virus nu
Pntration du virus
ADN viral
Transcription
Rplication
ARNm viral
ADN .
viral
Traduction
Protines .
virales
Assemblage
b) Virus envelopp
Noyau
Sortie du virus
Pntration du virus
ADN viral
Rplication
Transcription
ARNm viral
ADN .
viral
Traduction
Protines .
virales
Assemblage
Sortie du virus
3 ARN du Rtrovirus
R
U3
LTR
5
U3
autres gnes
U5
U3
U5
Provirus
LTR
LTR
Provirus intgr .
dans lADN .
de la cellule hte
Transcription
LTR (long terminal repeat) contenant les squences U3, R et U5 : impliques dans lintgration .
de lADN viral dans le gnome de la cellule hte et servant de promoteur de transcription.
3 en 5 : promoteur de transcription du provirus et activateur agissant sur les squences ADN .
U
du provirus. U3 en 3 sert parfois de promoteur de transcription du gnome cellulaire situ en aval.
R : squence rpte
U5 en 3 : rle dans la terminaison de la transcription de lARN viral
L e gne gag code pour des protines de la capside, le gne pol pour la transcriptase inverse .
et lintgrase, le gne env pour une protine de lenveloppe virale.
10
11
>2. lments
ncessaires
la production
dOGM
12 12
Gne
de rsistance
lampicilline
Gne
de rsistance
la ttracycline
Origine de rplication
du plasmide (ORI)
13 13
La machinerie de la bactrie est ensuite utilise pour rpliquer lADN viral et synthtiser
les protines servant produire de nouveaux
phages. Aprs accumulation des phages
dans la cellule, celle-ci finit par clater et librer ces phages qui vont infecter dautres
bactries.
Les phages sont utiliss en laboratoire pour
constituer des banques gnomiques ou de
protines. En effet, leur efficacit de pntration dans E. coli est bien plus grande que
celle des plasmides.
Phage
Paroi
bactrienne
Arrive
14 14
Pntration et percement
Injection de lADN
(7) Kb : kilobase correspondant 1000 bases dun acide nuclique. Les bases peuvent tre de 5 types : adnine, guanine, thymine, cytosine, uracile.
(8) Banque gnomique : fragments dADN ou ADNc conservs dans des cellules.
Exemple
Rtrovirus
oui
oui
oui
VIH 1
non
oui
(max : 5 kb)
oui
non
oui
Ad5 humain
oui
AAV 2
oui
oui
HSV 1
Canarypox virus
Rtrovirus du genre
Lentivirus
Adnovirus (ADV)
Virus associ aux
Adnovirus* (AAV)
Herps virus (HSV)
Poxvirus
15
Ces cellules pourront produire des vecteurs viraux recombinants pouvant infecter
dautres cellules. Par contre, sans le recours
aux cellules transcomplmentantes ou aux
plasmides auxiliaires, le virus dfectif ne
pourra pas se multiplier.
16
Virus
Gnes dlts
MLV
(Murine Leukemia virus)
HEK293
(cellules rnales
embryonnaires humaines)
VIH1
(Human immunodeficiency virus)
HEK293 FT
E1, E2, E3
Noyau et gnome
cellulaire avec les gnes
gag, pol, env
Gnome de vecteur .
Rtrovirus dfectif .
avec insert
Les bactries
Les souches dEscherichia coli choisies sont
gnralement issues de la souche sauvage
E. coli K 12 non pathogne pour lhomme.
Les levures
La souche la plus utilise est Saccharomyces
cerevisiae (levure du boulanger). Cette levure
trs utilise en agroalimentaire nest pas pathogne pour lhomme.
17
>3. valuation
18
19
20
(16) www.enseignementsup-recherche.gouv.fr/cid54116/principes-de-classement-et-guides-officiels-de-la-commission-de-genie-genetiquefevrier-2001.html
(17) Tropisme : affinit dun agent infectieux pour un rgne, un genre, une famille, une espce, un organe, un tissu ou un type cellulaire.
gnes codant pour des protines indispensables au cycle de multiplication, ils ne pourront pas se reconstituer et donc se propager
hors de la cellule. Ainsi, ils peuvent sintroduire
dans une cellule eucaryote, mais ne peuvent
pas propager linfection, ce qui protge le manipulateur en cas daccident (voir tableau 2).
Cependant, les vecteurs privs de leurs gnes
gag, pol, env pour les Rtrovirus, ou E1, E2,
E3 pour les Adnovirus, pourraient se recombiner avec des virus dj prsents dans les
cellules htes. Il en va de mme pour tous les
virus dlts utiliss en laboratoire.
En effet, in vitro, les vecteurs viraux dfectifs
ne se reconstituent que parce quils ont trouv dans les cellules transcomplmentantes
les protines qui leur manquent. De mme,
en cas daccident, si le virus dlt pntre
dans un organisme ayant pralablement t
contamin par un virus sauvage de la mme
espce, le virus dfectif pourrait trouver des
gnes transcomplmentants. En effet, le virus
sauvage est capable de synthtiser toutes les
protines ncessaires la fabrication du virus entier. Dans ce cas, le virus dfectif pourrait se propager chez le manipulateur.
Tableau 3 - tapes de rplication possibles selon les dltions des Rtrovirus (daprs P. Bouill).
Rplication Rtrovirus
Rtrovirus dlt
gag/pol/env
Reconnaissance du rcepteur
Entre
Transcription inverse
Translocation nuclaire
Intgration dans le gnome
Transcription du provirus
Reconnaissance du rcepteur
Entre
Transcription inverse
Translocation nuclaire
Intgration dans le gnome
Transcription du provirus
(transcription de linsert)
Epissage
Traduction
Assemblage des virions
Epissage
Traduction
Pas dassemblage des virions,
en labsence de gag, pol, env
Rtrovirus dlt
gag/pol/env/U3
Reconnaissance du rcepteur
Entre
Transcription inverse
Translocation nuclaire
Intgration dans le gnome
Pas de transcription du provirus
(transcription de linsert grce
lajout dun promoteur
en amont de linsert)
Sortie du virus
21
Dfectif
Virus de laboratoire
Naturelle
Gnome
Cellule hte
Noyau
Reconnaissance
virus-cellule
Reconstitution
de nouveaux virus
dans la cellule
Oui
Non
Oui
Non
22
Dfectif
Dfectif
Rtrovirus dlt U3
Transcomplmentante
Oui
Oui
23
24
3.5. LOGM
La classe de lOGM final est value en
fonction de chacun des lments qui le
composent : vecteur, insert et organisme
receveur. Le danger prsent par llment le
plus dangereux sera prdominant.
De plus, il faut prendre en compte les interactions entre chaque lment de lOGM. Ainsi
une cellule transcomplmentant un vecteur
dlt peut modifier le niveau du vecteur.
Lorganisme rsultant de lassemblage de
ces lments peut parfois prsenter un danger suprieur ou infrieur celui du plus
dangereux des composants du trinme.
Les questions permettant danalyser les
dangers des OGM sont reprises dans larbre
dcisionnel de lannexe 4.
Lvaluation des risques sera retranscrite
dans la Dclaration dutilisation ou demande dagrment adresser au Haut
Conseil des biotechnologies (HCB), qui donnera son avis final sur le classement et les
niveaux de confinement. Ces derniers peuvent varier selon ltape de construction
dun OGM, en fonction des risques identifis.
Ainsi, certaines tapes peuvent ncessiter
un confinement de niveau 3, tandis que pour
dautres le confinement de niveau 2 suffira.
(18) Art. R. 4421-3 du code du travail et liste des agents biologiques pathognes dfinie dans larrt du 18 juillet 1994 modifi.
Exemple de classement
LAdnovirus humain de type 5 (Ad5),
initialement de groupe de danger 2,
est utilis comme vecteur dfectif
pour la rplication. En tant que vecteur adnoviral, il est considr par
le Haut Conseil des biotechnologies
comme tant de groupe de danger 2.
Le couple vecteur Ad5-insert porteur de
squences de catgorie A, ne prsentant
25
> Conclusion
Il existe pratiquement autant de constructions dorganismes gntiquement modifis
(OGM) que dquipes de recherche. Lvaluation des dangers doit donc se faire au cas
par cas, en tenant compte des diffrents lments intervenant dans la construction
de lOGM : insert, vecteur, organisme donneur et receveur. Les arbres dcisionnels
clairent le prventeur sur les ncessaires questions permettant dvaluer les dangers
de chaque lment pris sparment.
Une fois les dangers estims, lobservation des postes de travail permettra de mettre
en vidence les expositions possibles ces dangers : par piqres/coupures avec du
matriel contamin, par inhalation de particules virales naturellement pathognes
par voie respiratoire, par contact main-bouche aprs avoir manipul des bactries
pathognes par voie digestive, etc.
Suite cette valuation de risques, les mesures de prvention techniques habituelles en
laboratoires de biologie seront appliques. Les travaux se drouleront dans une salle
technique confine respectant les dispositions de larrt du 16 juillet 2007 dfinissant
les niveaux de confinement (contraintes techniques concernant les locaux, le matriel
et les pratiques de travail). Ces dispositions pourront ventuellement tre compltes
par des mesures spcifiques prconises par le Haut Conseil des biotechnologies (HCB).
Les niveaux de confinement peuvent varier en fonction des tapes de la construction
de lOGM. Le confinement peut ainsi passer dun niveau 1 (prparation de plasmide)
un niveau 3 (prparation de vecteur), puis revenir un niveau 2 (utilisation de vecteur
dfectif) De plus, il conviendra de respecter les rgles de prvention en laboratoire
(ne pas pipeter la bouche, porter les vtements et les quipements de protection
spcifiques, travailler sous poste de scurit microbiologique en cas de production de
bioarosols) et les mesures dhygine (se laver les mains, ne pas boire ou manger sur
le lieu de travail).
Parce que les constructions dOGM sont disparates, le suivi mdical devra se faire au
cas par cas, en fonction des manipulations et des individus. Les arbres dcisionnels
aideront le mdecin du travail dans son questionnement avec le manipulateur,
afin dtablir avec lui un suivi mdical personnalis et des conduites tenir en cas
daccident.
26
Annexes
27
28
Non
Oui
Non
Le fournisseur
a-t-il indiqu le groupe
de danger ?
Oui
A-t-il t achet
dans le commerce ?
Non
Oui
Oui
A-t-il t fourni
par un autre laboratoire ?
Non
ou en cours de qualification
Oui
Non
Sagit-il/est-il issu
dorganes, dchantillons
frachement prlevs ?
*Qualifi : chantillon dans lequel on a vrifi labsence des pathognes suivants : agents responsables du Sida, des hpatites B ou C, de la leucmie lymphode T de ladulte, de la syphilis, de la maladie.
dEpstein-Barr, dinfection Cytomgalovirus, de la toxoplasmose et du paludisme (liste EFS sujette actualisation).
Oui
Connaissez-vous
le groupe de danger
de lorganisme/cellule ?
Annexe 1
29
Oui
Oui
Insert de catgorie A ou B.
Appliquer les mesures
de confinement correspondant au danger
Non
Connaissez-vous
le classement de linsert ?
Manipulation dinserts
Non
Annexe 2
30
Appliquer
les mesures
de confinement
correspondant
la classe de danger
Non
En cas daccident,
ces vecteurs ne peuvent
pas se multiplier chez
le manipulateur.
Non
Non
Oui
Oui
Manipulation de vecteurs
Non
Non
Oui
En cas daccident
ces vecteurs
ne se multiplient
pas chez le
manipulateur *.
Oui
Est-il dlt en U3 ?
Oui
Non
* Le HCB prcise que la manipulation de Lentivecteur DU3 contenant un insert de type A peut se faire dans une salle technique de niveau de confinement 2. .
Par contre si le volume de Lentivecteur prpar excde 200 mL de surnageant brut non purifi et non concentr, les manipulations se feront en laboratoire de niveau de confinement 3.
Oui
Connaissez-vous le
classement du vecteur ?
Annexe 3
31
Oui
Connaissez-vous le
classement de lOGM ?
Non
Annexe 4
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