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SPSS
En sciences de la sant
Dr. Tarek Barhoumi
Atelier 1.
SPSS
D r . Ta r e k B a r h o u m i
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Atelier 1.
SPSS
Prface :
D r . Ta r e k B a r h o u m i
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SPSS
Plan :
Les Ateliers .SPSS
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I.
Introduction
II.
III.
IV.
V.
VI.
Statistique descriptive
1. Les paramtres statistiques
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SPSS
1. La dmarche
2. Les tests statistiques usuels
3. Procdure SPSS : test.t de student
4. Procdure SPSS : test chi-deux
5. Procdure pour la corrlation de Pearson
I.
Introduction :
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SPSS
Lanalyse statistique est une tape capitale dans le domaine des sciences
de la sant. Actuellement cette tape, est de plus en plus informatise et
plusieurs logiciels sont de nos jours disponibles et, pour la plupart, trs bien
construits et trs faciles utiliser.
Notamment le logiciel EPIINFO que nous pensons que vous le connaissez
trs bien peut tre, mais nous pouvons encore citer dautres comme le logiciel
Excel, le logiciel SAS, le logiciel STATA, le logiciel SPSS .. :
Dans lensemble, tous les logiciels statistiques se valent. la longue, de
perfectionnement en perfectionnement, ils finissent par tous se ressembler !
Quatre lments vont surtout jouer dans le choix dun logiciel statistique :
1. Lapprentissage: le logiciel avec lequel on a appris le traitement des
donnes a une certaine longueur davance sur les autres (on vite de
rapprendre lutilisation dun logiciel).
2. Laccessibilit dune formation: une formation sur le logiciel est-elle
accessible dans votre rgion ou dans votre pays ? gratuite,
payante??!!
3. La maniabilit: la simplicit de lentre des donnes et des commandes
gnrales et particulires.
4. Enfin, le cot du logiciel. les logiciels gratuits ???? les versions
dessaie, les logiciels version tudiant??!!
Dans cet atelier, nous allons utiliser le logiciel SPSS sous Windows, car il
arrive premier pour tous les critres noncs ci-dessus. Aprs avoir compar
les logiciels cits plus haut, le logiciel SPSS nous semble le plus performant;
des logiciels statistiques.
II.
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Les deux derniers fichiers ne seront pas dtaills dans cet atelier
1. Fichiers de donnes :
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SPSS
Les
3. OK.
Cette procdure ouvre automatiquement la fentre Editeur de donnes dans
laquelle apparat un nouveau fichier. Le fichier, lorsque mis sous loption
affichage des donnes, se prsente cette fois sous la forme suivante:
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SPSS
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2. Fichier de rsultats :
Les fichiers de rsultats se reconnaissent par lextension .spv suivant le nom
attribu au fichier par lutilisateur. Ils apparaissent dans la fentre de rsultats
Viewer et consistent en divers rsultats d'oprations prcdentes qui ont t
sauvegards. Tant et aussi longtemps que lutilisateur na pas sauvegard le
travail effectu en sance, le fichier se nomme RSULTATS1. Au moment de
sauvegarder un fichier contenant les rsultats quil dsire conserver,
lutilisateur doit obligatoirement lui donner un nom. partir de ce moment, le
fichier peut tre manipul comme tout autre fichier, cest--dire quil peut tre
ouvert, consult, dit, nouveau sauvegard,
Mme si tout ce qui se retrouve dans le fichier rsultat est gnr
automatiquement par SPSS, il est possible d'accder ces fichiers et de les
diter, c'est--dire d'en modifier le contenu dans le but, par exemple, de
prsenter intgralement les rsultats dans le cadre d'un travail remettre ou
d'un article en production sans avoir en refaire manuellement la
prsentation, ou encore pour faire du mnage . Il est possible deffacer les
oprations inutiles ou les rsultats errons, denlever les messages derreurs
dont on a pris connaissance ou de produire une meilleure mise en page. Pour
ce faire, il s'agit de manipuler le fichier comme vous le feriez si vous tiez
dans un traitement de texte simplifi, en coupant, en collant et en ajoutant du
nouveau texte. Les capacits de SPSS en matire traitement de texte sont
toutefois limites.
Procdure pour ouvrir un fichier de rsultat
1. Cliquer fichier dans le menu principal en entte de SPSS
2. Ouvrir Rsultat (cliquez sur le nom du fichier choisi (extension .spv)
qui apparat sous cette rubrique
3. Puis cliquez sur OK.
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3.1.2
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3.1.4 : Donnes : est un menu trs important, car il permet de dfinir des
variables et dinsrer de nouvelles donnes et de nouvelles
variables si besoin. De mme il permet de scinder un fichier, de
slectionner des observations
3.1.6
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3.1.7
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3.1.8
3.1.9
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3.1.10 : Aide : fournit des indications sur les faons dutiliser les
commandes de SPSS et sur les diverses procdures statistiques.
3.2
III.
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1. Le nom de la variable
2. Le type de donnes
3. Le nombre de chiffres ou de caractres
4. Le nombre de dcimales
5. Les tiquettes descriptives de variables et de valeurs.
6. Les valeurs de la variable
7. Les valeurs manquantes dfinies par lutilisateur
8. La largeur des colonnes
9. Lalignement
10. Le niveau de mesure
a. Le nom :
Les rgles suivantes sappliquent pour les noms des variables :
admise.
Les noms de variable peuvent contenir jusqu 64 caractres
Les noms de variable ne doivent pas contenir despaces.
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soulignement,
Les mots-cls rservs ne peuvent pas tre utiliss pour les noms de
variables : Les mots-cls rservs sont les suivants : ALL, AND, BY,
b. Type de donnes :
Cette bote de dialogue rsume les rponses donner pour les colonnes :
type, largeurs et dcimales.
Dans la liste de gauche de la bote de dialogue on doit choisir entre plusieurs
possibilits :
Numrique : choisir si les rponses sont codifies de faon numrique +++
virgule : si les valeurs possdent des virgules, un signe plus ou moins, etc. :
Variable numrique dont les valeurs sont affiches avec des virgules toutes
les trois positions, le point servant de sparateur dcimal
Point: si les donnes ont des points comme sparateurs de Chiffres : Variable
numrique dont les valeurs sont affiches avec des points toutes les trois
positions, la virgule servant de sparateur dcimal.
Scientific notation : cette possibilit autorise la notation scientifique, la
plus utilise tant le E intercalaire (par exemple 123 103) : Variable
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Chaine : lentre de donnes en lettres, par exemple, le nom dune ville, dun
hpital, dun patient etc. : Variable dont les valeurs ne sont pas numriques et
ne sont donc pas utilises pour les calculs. Ces valeurs peuvent contenir
nimporte quel caractre, dans la limite de la longueur dfinie. Les majuscules
et les minuscules sont diffrencies. Ce type de variable est aussi connu sous
le nom de variable alphanumrique.
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SPSS
Remarque :
2
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Onglet Rsultats :
Afficher les commandes dans le journal : assurez-vous de
cocher dans le but d'avoir une trace des analyses que vous avez
menes en plus des rsultats de ces dernires.
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SPSS
choisir
lapparence
(forme,
4. Exercice dapplication :
1. Cration des variables :
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cardiovasculaires
IV.
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SPSS
les approprier
suffisamment pour bien les comprendre et pour voir s'il n'y aurait pas
quelques modifications leur apporter pour qu'elles puissent tre plus
facilement analyses
Le tableau de frquences est une bonne faon de prsenter les informations
que contient une base de donnes propos de tous les variables.
En effet, il indique, pour chaque variable donne, toutes les valeurs que
prend chaque variables, comme il vous permet de :
rechercher des valeurs aberrantes..
Rechercher des cellules vides?? .
Procdure pour cre un tableau de frquence :
1. Cliquez sur Analyse dans le menu principal
2. Cliquez sur Statistiques descriptives
3. Cliquez sur Effectifs
4. Slectionnez tous les variables
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5. Cliquez maintenant sur la flche situe entre les deux rectangles. Vous
verrez alors le nom de tous les variables sauter du rectangle de
droite au rectangle de gauche.
6. Cliquez sur OK
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4.
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5.
Cliquer sur OK
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Questions ???
VI.
Statistiques descriptives :
Les statistiques descriptive permettent de rsumer les donnes dune ou
plusieurs variables sous forme numrique frquences, des paramtres
statistiques et / ou sous forme des prsentation graphique box plot,
diagramme en secteur, diagramme de dispersion
1. Rsume numrique les paramtres statistiques :
Les paramtres statistiques ont pour but de rsumer, partir de quelques
nombres cls, l'essentiel de l'information relative l'observation d'une
variable quantitative.
Paramtre de tendance centrale :
Son des valeurs numriques autour desquelles les observations sont
rparties :
La moyenne
Le mode
La mdiane
Les quantiles .
Paramtres de dispersion :
Sont des valeurs numriques rsumant le plus ou moins grand talement
des observations de part et dautre de la tendance centrale :
Ltendue
La variance
Lcart type
Procdures pour mesurer des tendances centrales et de dispersion
1. Cliquez sur Analyse partir du menu dentte de SPSS
2. Cliquez sur Statistiques descriptives
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menu
graphes
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3. Exercices dapplication :
a. Faite une tude descriptive numrique et graphique pour les
variables suivantes univarie
3.2.1 Genre
3.2.2 Glycmie
3.2.3 Niveau dinstruction
b. Faite une tude descriptive numrique et graphique pour les
deux variables ensemble bivarie :
3.2.4 Genre et obsit
3.2.5 Glycmie et genre
3.2.6 TA et ge
VII.
Tests hypothses :
Permettent de dterminer la probabilit pour que la diffrences observes
soient entirement dues a des fluctuations dchantillonnages est non
des diffrences existant dans la population.
Hypothse nulle, les diffrences observes sont entirement dues a des
fluctuations dchantillonnages fait du hasard :
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1. La dmarche :
Choix du test appropri utiliser
Conditions dapplication du test
Fixation du seuil de signification
Hypothse nulle H0
Hypothse alternative H1
Calcul de la statistique du test
Interprter les rsultats : dcider si la diffrence est significative ou
qualitative
Corrlation : chercher entre deux variables quantitatives
une
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1.
2.
3.
4.
5.
6.
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1.
2.
3.
4.
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6. Exercices dapplication:
NB : pour les questions suivantes vous devrez nous prciser :
Comment vous allez vous procdez pour rpondre la
question
Puis Gnrer le tableau des rsultats et interprter
1. On voudrait savoir si la frquence de lobsit est la mme chez les
patients de sexe fminin que chez les patients de sexe masculin
2. On voudrait savoir si la glycmie varie selon le genre des patients de
ltude
3. On voudrait savoir si la cholestrolmie totale varie selon lge, et si
oui dans quel sens ?
Bonne chance
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Atelier 1.
SPSS
.......................................
.
Annexe 1.
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Annexe 2.
279
14.12.2009 Homme
08.04.1951 indpendant(e)
Mari(e)
collge
74,5
1,68
99
98
1250
17.12.2009 Homme
31.10.1948 Retrait(e)
Mari(e)
Lyce ou quivalent
72,7
1,66
99
90
21
23.11.2009
Veuf(ve)
71
1,48
112
110
non 220
229
09.12.2009 Femme
12.11.1930
Veuf(ve)
68,9
1,39
112
109
722
02.12.2009 Femme
06.03.1985 Chmeur(se)
Mari(e)
Lyce ou quivalent
49
1,58
89
71
1328
22.12.2009 Homme
28.02.1946 Retrait(e)
Mari(e)
Ecole suprieure,universit
77,7
1,7
103
99
921
09.12.2009 Femme
Ecole primaire
75
1,58
113
110
non 211
1019
11.12.2009
Homme
Lyce ou quivalent
100
1,81
116
103
45
25.11.2009
Homme
09.04.1944 Retrait(e)
Mari(e)
Ecole primaire
67
1,62
85
62
256
11.12.2009
Homme
12.07.1931 Retrait(e)
Mari(e)
Ecole primaire
69,6
1,57
92
94
730
02.12.2009 Femme
06.12.1967 Chmeur(se)
83
1,49
115
108
NP
614
26.11.2009
Mari(e)
57,1
1,51
95
688
01.12.2009 Femme
18.01.1929 Chmeur(se)
Mari(e)
93
1,45
334
15.12.2009 Femme
Veuf(ve)
78,6
928
09.12.2009 Femme
Mari(e)
71
842
07.12.2009 Homme
10.01.1934 Retrait(e)
Mari(e)
Lyce ou quivalent
904
08.12.2009 Femme
Mari(e)
25
23.11.2009
Femme
878
08.12.2009 Femme
1211
17.12.2009 Homme
Femme
Femme
Femme au foyer
237
118
237
118
NP
5,2
4,1
0,5
0,64
229
104
222
108
oui
6,4
5,5
0,93 1,14
96
223
98
non
6,8
6,5
1,06
non 213
73
211
71
non
7,5
1,53 1,16
NP
212
129
226
118
non
6,3
0,79 1,89
211
139
208
120
non
5,3
4,3
0,46 1,19
86
184
81
non
15
5,57 0,86
210
120
243
121
NP
3,8
0,58 0,79
210
92
221
114
NP
5,5
5,1
0,61
207
126
216
130
NP
5,9
7,1
1,09 0,74
206
100
214
96
NP
7,2
5,6
0,64 1,4
92
non 206
117
200
118
non
5,4
3,4
1,99
145
122
non 205
80
200
86
oui
12
4,6
1,23 1,18
1,55
117
112
non 205
94
192
90
non
8,5
4,7
0,78 0,83
1,55
106,5 102
non 205
96
185
76
NP
5,2
1,26 0,81
70,2
1,66
95
94
203
82
204
79
non
8,3
5,5
0,93 0,81
59,2
1,64
97
85
non 202
98
208
92
NP
8,2
5,1
0,93 1,08
Veuf(ve)
74,3
1,47
125
105
non 200
95
197
97
non
5,9
5,1
1,42
Veuf(ve)
Ecole suprieure,universit
48,4
1,37
94
65
non 199
96
180
76
non
6,4
0,65 2,06
Mari(e)
Ecole primaire
80,2
1,74
101
99
198
108
200
110
non
5,2
5,1
0,54 1,17