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Macrophotographie, microphotographie, profondeur de champ :

problmes et solutions
Rsum
La recherche dune profondeur de champ maximale est le souci permanent du mycologue
photographe qui souhaite gnralement avoir un maximum de nettet sur tous les plans de sa prise de
vue.
Dans cet article nous exposerons les phnomnes optiques lorigine de la profondeur de champ et
nous prsenterons diverses solutions pour obtenir une profondeur de champ optimale. Certaines
solutions, de nature optique, sont applicables tous les appareils de prise de vue (argentiques ou
autres). Dautres sont encore plus efficaces, mais ne sont applicables quaux images obtenues laide
dun appareil de prise de vue numrique (APN).
Mots cl : Macrophotographie, microphotographie, profondeur de champ, focale, diaphragme,
photographie numrique, traitement dimage, transforme de Fourier, FFT.
Resume
Die Erforschung der Hchstfeldtiefe ist die permanente Sorge des fotografierenden Mycologes, der berlicherweise sich
eine maximale Klarheit seiner verschiedenen Schrfen wnscht.
In diesem Artikel werden wir die optischen Phnomenen am Anfang der Feldtiefe aussetzen, und wir werden verschiedene
Lsungen vorstellen, um eine optimale Feldtiefe zu erhalten. Bestimmte Lsungen optischer Natur sind anwendbar auf alle
Gerte der Bildaufnahme (analog oder andere). Andere sind noch wirksamer, aber sind anwendbar nur auf Bilder, die mittels
einer digitalen Kamera aufgenommen wurden.

Resumen
La bsqueda de una profundidad del campo mxima es la preocupacin permanente del mycologo fotgrafo que desea
generalmente tener una mxima claridad sobre todos los planes de su toma de vista.
En el artculo que sigue expondremos los fenmenos pticos en el origen de la profundidad del campo y expondremos
distintas soluciones para obtener una profundidad de campo ptima. Algunas soluciones de naturaleza ptica son aplicables a
todos los aparatos de toma de vista (analgica u otros). Otras son an ms eficaces, pero solamente son aplicables a las
imgenes obtenidas con ayuda de una cmara digital.
Nombre clave : macrofotografa, microfotografa, profundidad del campo, distancia focal, diafragma, fotografa numrica,
tratamiento de imagen, transformacin Fourier, FFT.

Si lon examine un bon tirage photo sur papier brillant, on peut observer que seules certaines
parties de limage sont nettes. Si les objets linfini sont nets, ce sont les premiers plans qui manquent
de nettet, et si le sujet net se trouve moyenne distance, ce sont la fois les premiers et les derniers
plans qui sont flous.
Sur certaines images ralises par un photographe rompu aux techniques photographiques, on peut
aussi sapercevoir que seul le sujet principal est bien net et bien apparent.
En thorie, seuls les points situs une distance bien dtermine sont nets sur le capteur. Cependant
une certaine tolrance par rapport la convergence stricte des faisceaux lumineux dans le plan image
est acceptable, dans la mesure o lon ne peut pas distinguer le flou dans la limite de cette tolrance.
Tout tient au fait que le capteur, quil soit argentique ou numrique, est constitu dlments
juxtaposs qui ne sont pas infiniment petits. On appelle cercle de confusion la dimension dune
surface de capteur en dessous de laquelle on considre que la photo n'est plus nette (cest dire que

deux points dont la distance est infrieure au diamtre du cercle de confusion ne peuvent pas tre
distingus).
Sur un capteur argentique, on admet que ce cercle a un diamtre denviron 30 microns. Dans le cas
d'un capteur CCD, on peut estimer quil correspond la dimension d'un pixel.
Plus petit sera le diamtre du cercle de confusion, meilleure sera la dfinition de la photo.

Du point de vue de
loptique gomtrique, la
figure ci-contre prsente le
cas
lmentaire
dune
lentille simple, pour laquelle
les plans principaux sont
confondus.
Les rayons issus de A
convergent au point A1 o
est situ le capteur. Ceux
issus de B et C convergent
respectivement en B1 et C1.
Sur le capteur, limage dun
objet plac en A est donc
nette.
Par contre, comme les rayons issus de B et C convergent en avant et en arrire du capteur, ils forment
une tache lumineuse floue sur le capteur.
Cependant, si le diamtre de ces taches nexcde pas celui du cercle de confusion, ils seront vus
comme un seul point. Dans ce cas, tous les objets situs entre B et C apparaissent nets galement. Les
objets situs lextrieur du segment BC formeront sur le capteur un ensemble de taches de diamtre
suprieur au cercle de confusion, et apparatront donc flous.
Lintervalle [BC] constitue la profondeur de champ .
Modification de la profondeur de champ :
Il est facile de comprendre que si on rduit le diamtre du diaphragme, langle dincidence des rayons
extrmes passant par les bords du diaphragme diminue, et aussi, par suite, le diamtre de la tache
forme sur le capteur. Il suffit donc de diminuer louverture du diaphragme (augmenter son index 1)
jusqu ce que le diamtre de la tache soit correct.
En photo argentique, on obtient un grain dautant plus fin que le film est plus lent et que le produit
de dveloppement est peu nergique. En photo numrique, le cercle de confusion dpend videmment
de la rsolution du capteur.
Des formules existent qui permettent de calculer la profondeur de champ en fonction du cercle de
confusion, du diamtre du diaphragme, de la focale et de la distance de mise au point.

pour ceux qui sont intrigus par la suite de nombres exprimant la valeur du diaphragme, il sagit dune srie de Renart ,
progression gomtrique normalise de raison racine de 2 : un cart de une division permet de diviser par deux ou de doubler
la quantit de lumire traversant lobjectif.

A) En pratique, comment augmenter la profondeur de champ par des mthodes optiques ?


Cas de la photographie macroscopique :
Pour augmenter la profondeur de champ, on peut :
* Accepter daugmenter le diamtre du cercle de confusion, ce qui nest pas souhaitable en gnral,
* Diminuer la valeur de la focale f,
* Diminuer le diamtre de louverture du diaphragme.
Ces deux dernires solutions ne sont pas sans inconvnient.
Si lon diminue la focale, on modifie langle de champ, donc la perspective. De plus, en photo trs
rapproche, il sera souvent difficile dapporter un clairage convenable.
Si l'on diminue louverture, plusieurs inconvnients apparaissent :
Tout dabord, il faut disposer dune lumire suffisante. Si ce nest lincidence de la production de
chaleur du dispositif dclairage (penser lclairage par diodes lectroluminescentes), en
photographie argentique, il ny a pas dinconvnient majeur, puisque, sensibilit constante, il suffit
daugmenter le temps de pose ad libitum (attention, pour des temps de pose importants, il faudra tenir
compte de leffet Schwarzschild). En photographie numrique, cela devient bien plus dlicat. En effet
les capteurs lectroniques ne supportent pas les temps de pose trop longs (apparition de bruit de
fond qui dgrade la qualit de limage). La solution qui consiste augmenter la sensibilit
normale dun appareil photo numrique nest pas meilleure, car cette technique consiste seulement
introduire un amplificateur de signal qui est galement gnrateur de bruit.
Autre inconvnient apport par la fermeture du diaphragme : il nest pas possible de rduire
indfiniment le diamtre du diaphragme. Si ce diamtre devient trs faible, la qualit de limage se
dgrade par lapparition de franges dinterfrence provoques par le phnomne de diffraction. La
valeur maximale du nombre de diaphragme dpend de la focale et, dans une moindre mesure, de la
construction de lobjectif. Si un appareil photo 9 12 peut fermer jusqu f : 32, sans problme, un 24
x 36 ne dpasse gure f : 16. Plus la focale de lobjectif sera petite, moins il sera possible de fermer le
diaphragme sans dgrader les qualits de limage (la qualit optimale des objectifs est gnralement
obtenue pour une valeur de diaphragme voisine de 2 pas en dessous de la fermeture maximale).
Il faut composer entre toutes ces contraintes, et effectuer la mise au point sur le premier tiers de la
zone nette souhaite.
Cas de la photographie microscopique :
Il y a deux solutions pour effectuer une prise de vue sur microscope classique.
* La premire est la plus simple, qui consiste effectuer la prise de vue travers loculaire. Il sagit de
la photographie dune image virtuelle.
Lappareil photo est mis en position de mise au point manuelle sur linfini, et on peut laisser
lappareil en position de mesure automatique de luminosit. La mise au point seffectue par le
bouton micromtrique du microscope, avec vrification sur le dpoli ou sur lcran de contrle.

Lavantage de la photo de limage virtuelle est que lon peut photographier en mme temps le
micromtre oculaire. Linconvnient principal reste la difficult dviter les poussires (se munir
dune cartouche dazote sous pression).
La fermeture du diaphragme de lappareil de prise de vue nest pas une bonne chose car elle
risque daugmenter le nombre de poussires visible sur limage sans augmenter notablement la
profondeur de champ.
* La seconde solution consiste photographier limage relle directement issue de lobjectif du
microscope : loculaire du microscope est dmont et remplac par lappareil photo sans objectif,
une distance telle que la distance entre le foyer image de lobjectif du microscope et le capteur gale
lintervalle optique du microscope 2 (classiquement 160 mm). Il est possible videmment daugmenter
cette distance, ce qui donnera un grossissement suprieur, mais au dtriment de la rsolution et de la
qualit.
On procde diffremment selon les objets photographier :
Objets transparents clairs par-dessous : on peut rduire le diamtre du diaphragme douverture du
microscope, ce qui diminue langle dincidence des rayons extrieurs, augmentant ainsi la profondeur
de champ.
Laugmentation de la profondeur de champ laide des diaphragmes est satisfaisante, mais elle est trs
limite en raison de la perte de lumire quelle implique.3
Objets opaques clairs par-dessus : si lon peut disposer dune lumire suffisante, on pourra
improviser un diaphragme dobjectif (Nb : certains objectifs de microscopes comportent un
diaphragme intgr).
Dmonter lobjectif. Dcouper une rondelle de carton qui sinsrera facilement lintrieur de
lobjectif et dans laquelle on aura pratiqu une ouverture de quelques millimtres (par exemple 5 mm
pour un objectif 10), ce diaphragme tant plac au plus prs de lobjectif. On pourra ainsi augmenter
notablement la profondeur de champ.
En bref

Nous disposons de moyens optiques pour amliorer la profondeur de champ des prises de
vues macroscopiques et microscopiques. Cependant cette amlioration est limite quelles que
soient les caractristiques de lappareil de prise de vue. La photographie numrique permet
dobtenir des rsultats nettement suprieurs sans dgrader les qualits de limage comme nous
allons le voir maintenant.
B) Les solutions numriques
Lorsque Joseph FOURIER (1768-1830) crivait que toute fonction numrique pouvait tre
dcompose en une somme infinie de fonctions trigonomtriques, il tait probablement loin de
simaginer que sa thorie allait devenir un maillon essentiel des chanes de traitement du signal au
XXIe sicle.

La photographie microscopique avec un microscope objectif infini nest pas aborde ici, mais les problmes lis la
profondeur de champ restent les mmes.
3
Dans ce cas nous prfrons, au contraire, avoir une profondeur de champ minimale afin disoler et traiter les diffrents plans
la manire dune tomographie. Ceci pourra tre lobjet dun autre article.

La thorie de Fourier, amliore et complte par Denis Gabor (1940), puis par Jean Morlet (1970), a
conduit aux algorithmes de calcul de la FFT (Fast Fourier Transform)4 sur calculateurs numriques
(annes 1980).
Le principe :
On effectue une suite de prises de vues en dcalant la mise au point sur des plans successifs.
Un procd informatique permet dextraire les meilleures parties de chaque image et de les
rassembler en une seule image.
Le traitement mathmatique est relativement complexe. En schmatisant lextrme, on peut dire qu
chaque image on associe un spectre mathmatique constitu par un ensemble de coefficients
caractristiques. Si on effectue la transforme inverse du spectre, on peut retrouver limage dorigine.
Sur les spectres, il est possible deffectuer de nombreuses oprations (filtrage, en particulier) quil
serait impossible deffectuer sur limage origine. Ces oprations ncessitent un nombre considrable
de calculs.
Sagissant du problme de lamlioration de la profondeur de champ, les composantes chromatiques
sont tout dabord extraites et traites sparment comme trois images noir et blanc. Dans chacun des
spectres dimage les coefficients correspondant aux points les plus nets sont extraits puis combins. La
transforme inverse redonne une image synthtique constitue par lempilement des diffrents plans
filtrs.
Nous avons utilis ces logiciels leurs dbuts. Sur les machines de lpoque, cela ncessitait une
deux heures de calcul, selon la taille et le nombre des images. Sur les machines modernes, moins
dune minute suffit en gnral.
EN PRATIQUE
Matriel
Macrophoto

Microphoto

Matriel :
APN sur statif dagrandisseur, ou, la rigueur, sur
trpied lourd crmaillre.
Complments optiques ventuels
Tlcommande conseille
Blocage du miroir sur les rflex

APN ajust solidement au microscope (prise de vue de


limage relle ou virtuelle)
Tlcommande
Blocage du miroir sur les rflex

Prise de vues :
APN en position de rglage manuel
Zoom sur tlobjectif

APN en position de rglage manuel, position infini.


Zoom rgl pour un cadrage optimum

Photographie macroscopique
4

les notions de transforme de Fourier, de FFT et de transforme en ondelettes sont relativement ardues. Ces mthodes de
calcul mathmatique sont actuellement mises en uvre dans pratiquement toutes les chanes de traitement numrique du
signal, dont celui des images (compression de donnes, filtrage, etc.). Les logiciels qui nous intressent sont tous bass sur
des calculs de FFT.

En principe, la distance entre lobjet et le centre optique de lAPN reste constante et on doit ajuster la
mise au point par le dplacement du capteur par rapport au centre optique. Dans ces conditions, rien
nempche, en thorie, dobtenir une image nette de quelques millimtres linfini.
Cette condition est souvent difficile mettre en uvre en macrophotographie avec les appareils
numriques damateur : il faut sadapter selon la construction de lappareil. La mthode la plus simple,
que nous avons utilise dans lexemple, consiste dplacer lappareil de prise de vue (ce qui modifie
lgrement langle de champ).
Ainsi, on ne pourra obtenir quune profondeur de champ limite, mais gnralement suffisante, du fait
de la modification de la perspective. De plus, afin de rduire lamplitude de variation de cette
perspective, on effectuera, si possible, les prises de vue avec une focale longue.

Remarques :
On noubliera pas de dbrayer la mise au point autofocus !
En macrophotographie, vrifier que laxe de dplacement du statif correspond laxe optique de lAPN (le centre de limage
doit rester la mme position pour toutes les images).
Il est prfrable deffectuer a priori un maximum dimages. Les images inutiles seront limines avant le traitement
informatique.

Photographie microscopique
La modification de la perspective est ngligeable devant le tirage du microscope et le rglage de la
mise au point sera effectu par le bouton de mise au point micromtrique.
On reprera donc langle de rotation de la vis micromtrique qui permet de faire chevaucher les zones
de nettet (en gnral 1 ou 2 microns).
Objets transparents clairs par-dessous :
La qualit du rsultat dpend de la prparation. On pourra tre limit par la prsence, dans les
diffrents plans, dlments nets indsirables ou non (pigments, vacuoles, etc.). Limage reconstitue
de ces nombreux objets superposs risque dtre inexploitable du fait de cette superposition.
Objets opaques clairs par-dessus
La seule difficult rside dans le positionnement des clairages.
Remarques :
Une autre possibilit est dutiliser une camra vido comme nous lavons fait, avant lapparition des APN sur le
march, avec une camera vido analogique. Nous lancions une squence de prises de vues et effectuions un lent
balayage vertical partir du sujet. Aprs avoir numris la squence, nous extrayions les images utiles qui
taient traites comme ci-dessus.
Il faut noter que lon trouve des logiciels en tlchargement pour extraire automatiquement des images
lmentaires partir dun film vido numris. Une limination manuelle des images surabondantes sera
cependant ncessaire.

Traitement informatique des images


Le traitement informatique qui suit est le mme dans tous les cas.

Diffrents logiciels sont disponibles. Certains peuvent tre tlchargs sur Internet :

Tlchargement

Systme
Prix

Combinez
Helicon
http://www.hadleyweb.p http://heliconfilter.
wp.blueyonder.co.uk/
com/pages/focus_overview.
Html
Windows 9x, ME, NT,
Windows 9x, ME, NT, 2000,
2000, XP
XP
Gratuit
Evaluation 30 j. ou 115$ en
version simple
24 sec
4. 7 sec.

Temps de traitement
de lexemple (Athlon
64)
Rsultats sur
****
lexemple
Remarques :
Trs bons rsultats.

Deepfocus
http://www.
dipteristsforum. org.
uk/html/deepfocus
Toute machine compatible
Java
Gratuit
76 sec

****

Simple demploi.

Trs rapide.

Le rsultat obtenu avec nos


prises de vues na pas t
satisfaisant.

Beaucoup doptions.

Trs simple demploi.

Trs lent.

Pas d'installation.

Peu doptions.

Simple demploi avec les


options par dfaut.

Un des premiers
logiciels du genre.

Traite les fichiers 16 bits.

Trs bons rsultats.

6 Mo
Interface austre.

Diffrentes options (non


testes).
5, 7 Mo

Macros personnalisables
1, 8 Mo

Linterface de HeliconFocus semble le plus facile aborder et les commandes sont intuitives. Celui de
Combinez, plus rustique, demandera un peu de rflexion.
Combinez dispose de nombreuses possibilits, mais il faut prciser que linterface est assez austre. La
mthode dcrite ci-dessous utilise des macros prprogrammes, mais il est possible de programmer
dautres macros soi-mme.
Il est impratif que les images soient ranges dans lordre impos par le dplacement (suivre
simplement la suite des index).
NB : les macros cites ci-dessous corrigent les petits dfauts dalignement et de perspective.
Suite des commandes pour le traitement dune srie dimages avec Combinez
File / new : choisir et charger, dans l'ordre de la prise de vues, la suite d'images traiter

Avec les flches haut/bas, visionner les images charges ; presser le bouton de suppression pour liminer
de la liste les images indsirables.
Macro / : de nombreuses fonctions de traitement sont disponibles.
choisir "do stack" ou "do average and filter".
lancer la macro : l'image traite s'affiche .
save picture as : un sous-rpertoire "work" est propos.
Prciser le format de sortie ainsi que le taux de compression puis valider.

Exemples
Macrophotographie
A titre dexemple, nous avons effectu 6 prises de vue (Canon G2 + bonnette, focale 21 mm, 1/8 sec,
F 8, balance auto, lumire naturelle).
Image des plans extrmes :

Image reconstitue avec


Combinez :

Microphotographie
16 images microscopiques de poils sur feuille de tilleul (objectif x 10, clairage suprieur par Led )
Traitement par Helicon focus

Premire image (1/16)

Image reconstitue

Copies dcran :

Helicon focus

Combinez

Conclusion
Lamlioration de la profondeur de champ en photographie rapproche est la porte de
chacun. Cependant la mthode choisie, optique, numrique ou les deux conjointement,
ncessite dun peu de soin pour sa mise en uvre, afin dexploiter au mieux les qualits de
son matriel de prise de vues.
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