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RESUMEN
No se ha presentado ninguna revisin exhaustiva sobre la bioconversin de la biomasa
lignocelulosa en hidrgeno. En este trabajo se proporciona una revisin puesta al da sobre el
desarrollo de las investigaciones recientes en materia de biotecnologa sobre la bioconversion de
biomasa lignocelulosa en -H2. Bioconversin de lignocelulsico prehidrolisado, hidrolizado de
celulosa o de hidrgeno era discuten en trminos de los microorganismos implicados y las tcticas
bioaumentacin. Para alcanzar plenamente la utilizacin de la biomasa, los enfoques integrados
compuestos por unida oscuro-photo fermentacin y la oscuridad fermentacin y
bioelectrohydrogenesis fueron esbozadas. Adems, esta revisin arroja luz sobre las perspectivas
en la conversin de biomasa lignocelulsica a hidrgeno, y en los retos cientficos y tcnicos que se
enfrentan para la lignocelulosas bioconversin.
INTRODUCCION
El hidrgeno es una alternativa prometedora a los combustibles fsiles convencionales ya que no
tiene el mismo impacto ambiental asociado con los combustibles fsiles. Una duda importante
sobre el hidrgeno como alternativa energtica limpia es cmo se produce. La Produccin de
hidrgeno por bioqumica por reacciones microbiana ha atrado la atencin mundial, debido a su
potencial como fuente inagotable de bajo costo y de energa limpia renovables. Estudios en la
produccin de biohidrgeno se han centrado en biophotolysis de agua con las algas y las
cianobacterias, foto-descomposicin de materia orgnica compuestos por bacterias fotosintticas
y fermentacin oscura de compuestos orgnicos con anaerobios. Entre estos procesos biolgicos,
la fermentacin anaerbica de hidrgeno parece ser favorable, ya que el hidrgeno puede ser
producido a tasas ms altas ya menores costos en la degradacin de desechos orgnicos
enriquecidos con diferentes carbohidratos (Kumar y Das, 2000; Chen et al, 2001;. Ginkel et al,
2001;. Fang et al, 2003;. Xing et al, 2006;. Wang et al, 2008a;. Lo et al, 2008a).
La biomasa lignocelulsica en la naturaleza es con mucho la materia prima ms abundante de la
madera dura, softwood, hierbas, y residuos agrcolas. En China, la produccin anual de desechos
de biomasa excede 0.7 mil millones de toneladas (el Abanico et al., 2006a, b; Zhang et al., 2007).
Las producciones anuales de residuos de biomasa lignocelulsicos por todo el mundo, como se
estimaba, excedan 220 mil millones de toneladas por todo el mundo, el equivalente con 60-80 mil
millones de toneladas de petrleo crudo. La biomasa lignocelulsica de ah presenta una accin de
comida atractiva, econmica para la produccin de hidrgeno.
La conversin directa de biomasa lignocelulsica en hidrgeno necesita pretratamiento para
hidrolizar el heterogneo incorporado y cristalino estructura (de Vrije et al, 2002;. Datar et al,
2007;. Ntaikou et al, 2008;. Li y Chen, 2007). En este trabajo se presenta una revisin crtica sobre
la bioconversin de la biomasa lignocelulsica en hidrgeno en trminos de hidrlisis previa y
tecnologa de hidrlisis, la tecnologa de bioconversin y la fermentacin tcticas para aumentar la
De todos los tratamientos previos, la combinacin y las tecnologas biolgicas son las ms
prometedoras. El mtodo combinado, es decir, el azufre, catalizada vapor-explosin, se prefiere
para aplicaciones industriales, aunque tiene algunas desventajas, como la destruccin de una
. Los rendimientos molares H2 de 2,84 y 3,0 mol fueron obtenido a partir de los hidrolizados que
contienen azcares de mezcla. Ren et al. (2008a, b, c) informaron que una cepa termfila de T.
thermosaccharolyticum W16 simultneamente podra fermentar la mezcla de glucosa y xilosa con
un hidrgeno rendimiento de hasta 2,37 mol H2 mol-1 sustrato. adems, la cepa W16 tiene una
alta tolerancia a prehydrolysate comn inhibidores es decir, acetato y furfural. Los rendimientos
molares H2 de 2,84 y 3,0 mol se obtuvieron a partir de los hidrolizados que contienen azcares de
mezcla. s. Ren et al. (2008a, b, c) informaron que una cepa termfila de T. thermosaccharolyticum
W16 simultneamente podra fermentar la mezcla de glucosa y xilosa con un hidrgeno
rendimiento de hasta 2,37 mol H2-1 mol de sustrato. Adems, la cepa W16 tiene una alta
tolerancia a los inhibidores de prehidrolisados comnes es decir, acetato y furfural.
3.1.3. Los microorganismos involucrados en la fermentacin de celulosa hidolizda
Hexosa es el componente predominante en los hidrolizados de celulosa. La Tabla 2 resume los
microorganismos reportados que pueden producir hidrgeno a partir de hidrolizado de celulosa.
El mayor rendimiento de H2 de aproximadamente 83% del valor terico (4 mol mol-1 hexosa) ha
sido reportado usando bacterias anaerobias termfilas (van Niel et al., 2002). Anaerobios estrictos
harbinense E., es un nuevo gnero identificado por Xing et al. (2006), que tambin revel alto
rendimiento H2. La cepa modelo, E. harbinenseYUAN, mostr especial auto-agregacin durante
capacidad cultivo con agitacin.
Rendimiento de hidrgeno y la velocidad de produccin de hidrgeno de la cepa de E. harbinense
YUAN-3T eran 2,81 mol H2-1 mol de glucosa y 27,6 mmol H2 g de clulas secas -1 h -1,
respectivamente. La propiedad de auto-agregacin de la Straine. harbinense YUAN-3 hace que
esta cepa el potencial para formar grnulos de clulas para el desarrollo de biorreactores
compactos de hidrgeno para uso industrial. El estricto Clostridia anaerbico y anaerobios
facultativos producir hidrgeno con rendimientos comparables (aproximadamente 2 mol H2-1 mol
de glucosa) (Taguchi et al, 1994;. Heyndrickx et al, 1986;. Tanisho et al, 1987;. Kumar y Das, 2000).
El rendimiento H2 <mol H2 mol-1 de glucosa se reporto para cultivos mixtos (Lin y Chang, 1999;.
Chen et al, 2001). Wang et al. (2008a) sugiri que bioaumentacin con adicin de ciertos cepas
funcionales productoras de H2 podra ser prometedora para mejorar an ms el rendimiento de
H2 cultivo mixto.
3,2. Los principales factores que afectan a la bioconversin de prehidrolizados / hidrolizados a H2
3.2.1. Inhibidores
Adems de azcares monomricos, varios compuestos txicos se derivaron de prehidrolisasos
lignocelulsicos como inhibidores de fermentacin (Mussatto y Roberto, 2004; Palmqvist y Hahn
Hgerdal, 2000a, b). Los inhibidores de la fermentacin en los prehydrolysates lignocelulsicos
estn compuestos de los siguientes tres grupos. En primer lugar, las sustancias liberadas durante
la degradacin de la hemicelulosa, incluyendo cido actico y terpenos, alcoholes, y compuestos
aromticos, cuya toxicidad se interpret como la penetracin del cido no disociado en la clula y
A pocos cultivos puros directamente puede degradar la celulosa para producir hidrgeno. Wang et
al. (2008a) inform de que Clostridium acetobutylicum X9 generado la produccin de hidrgeno y
la mxima velocidad de hidrlisis de celulosa de 6,4 mmol H2
h -1 g -1 pila seca y 68,3%, respectivamente, utilizando celulosa microcristalina como el sustrato.
Estos autores tambin demostraron que X9 puede degradar pretratados actico streamexplored
tallos de maz al hidrgeno con una tasa especfica de produccin de hidrgeno de 3,4 mmol g-1
de vapor explot tallos de maz. Levin et al. (2006) demostraron que el rendimiento de hidrgeno
de la cepa de Clostridium thermocellum 27405 podra llegar a 1,6 mol H2-1 mol de glucosa usando
fibras deslignificadas madera (DLWs).
El sistema de cultivo puro es atractivo y es el preferido para la investigacin mecanicista y
reconstruccin gentica para mejorar la tasa de hidrlisis de celulosa y el rendimiento de
hidrgeno. Sin embargo, la tcnica de la cepa aislamiento es complicado y requiere mucho tiempo.
Adems, slo una pequea fraccin de microbios puede ser cultivada.
4.1.2. Los cultivos mixtos
Recientemente, la investigacin sobre la conversin biolgica de celulosa a hidrgeno se ha
centrado en el sistema de cultivos mixtos (Lay et al, 1999;. Ginkel et al, 2001;.. Fang et al, 2002)
por sus mayores tasas de conversin de celulosa y ms amplias fuentes de carbono . Adems, el
cultivo mixto, tales como la microflora natural, lodo anaerbico digerido o compost contienen
grandes cantidades de organismos que podran servir como los recursos de microorganismos
ideales para la hidrlisis de la celulosa. tabla 3 enumera los rendimientos de hidrgeno a partir de
materiales celulsicos con cultivos mixtos. Entre ellos, el ms alto rendimiento de hidrgeno
informado que 4,55 mmol H2 g de celulosa -1 por la microflora (Liu et al., 2003).
4,2. Bioaumentacin para la degradacin de celulosa a hidrgeno
Bioaumentacin va co-cultivo o sistema de la comunidad para mejorar an ms la produccin de
H2 se estudi durante unos aos. Rara vez bioaumentacin es aplicable a la degradacin de
celulosa prctico para proceso de hidrgeno. Complementariamente funciones entre las cepas
aumentada y las cepas autctonas encuentran problemas superar como la represin que menudo
se encuentra en proceso de hidrlisis de celulosa, tales como la inestabilidad caracterstica de la
estructura, y la va mecnica complicada.
Wang et al. (2008a) reportaron fermentacin oscura de celulosa microcristalina para producir
biohidrgeno mediante co-cultivo de CFE. acetobutylicum X9 y Ethanoigenens harbinenseB49. El
rendimiento mximo de hidrgeno en la bio-aumentada co-cultivadas sistema fue de 16,2 mg g -1
H2 celulosa. B49 puede quitar rpidamente reducido de azcar producido por X9, y por lo tanto
mejora la hidrlisis de celulosa y subsiguientes tasas de produccin de hidrgeno.
sin embargo, puede causar un bajo rendimiento de hidrgeno (Zhang et al., 2003). Disminuciones
graduales en el pH durante la fermentacin inhiben la degradacin de la celulosa desde pH afecta
a la actividad de hierro que contiene la enzima cellulolase (Dabrock et al., 1992).
El pH tambin podra afectar a los mecanismos de la fermentacin, la tasa de produccin de
hidrgeno especfica y el contenido de hidrgeno en la fase gaseosa. El intervalo de pH ptimo
para el rendimiento mximo de hidrgeno o tasa especfica de produccin de hidrgeno es 5-6
(Fang et al, 2003;. Lay et al, 1999;. Lay, 2000; al Khanal et, 2004;.. Chen et al, 2001) , con algunos
otros 6.8-8 declarando (Collet et al, 2004;. Zhang et al, 2003;. Kanai et al, 2005;. Lay 2001,) o
alrededor de 4,5 para el cultivo termfilo (Shin et al, 2004.).
La mayora de los estudios revelaron que el pH final en la hidrlisis de la celulosa a los rangos de
4.0-4.8 hidrgeno independientemente del pH inicial (Liu et al, 2004;. Zhang et al, 2003;. Liu et al,
2003;. Lay, 2001; Evvyernie et al. , 2001).
La cada intensa en el nivel de pH se debe a la produccin de cidos orgnicos que debilitan la
capacidad tampn del medio (Khanal et al., 2004). El valor del pH debe estar debidamente
controlado en la produccin de biohidrgeno.
Los principales productos finales para el tratamiento previo anaerbico de aguas residuales de
duro-a-se descomponen los hidratos de carbono (celulosa) son el acetato propionato,, CO2, y
butirato (Karapinar y Fikret, 2006). Sin embargo, la produccin de propionato podra tener un
efecto adverso en la produccin de hidrgeno. El metano no se detect en la mayora de los
estudios de produccin de hidrgeno ya que el tratamiento trmico elimina productores de
metano en los lodos (Liu et al, 2004;. Lin y Lay, 2004;. Yu et al, 2002). Han y Shin (2004) probaron
metano por cultivos mesfilos en tiempos de retencin largos de reactores.
El nitrgeno es un nutriente esencial para la produccin de hidrgeno mediante fermentacin
anaerobia oscuro bajo conditions.Yokoi et al. (2002) informaron de que el ms alto nivel de
hidrgeno (2,4 mol H2-1 mol de glucosa) se puede obtener a partir de almidn en presencia de
0,1% polypepton. Pero no la produccin de hidrgeno se observ cuando las sales inorgnicas de
nitrgeno se utilizaron como fuente de nitrgeno. -Licor de maceracin de maz es un residuo del
proceso de fabricacin de almidn de maz que se puede utilizar como una fuente de nitrgeno
(Yokoi et al., 2002). Lin y Lay (2004) reportaron que la relacin C / N afecta la productividad de
hidrgeno es ms importante que la tasa de produccin de hidrgeno especfico.
La inhibicin inducida por sacridos acumulados pueden afectar al rendimiento del proceso
celulosa a hidrgeno. Ramos et al. (1986) observaron menores tasas de hidrlisis a
concentraciones ms altos de azcar. La eliminacin de los azcares solubles liberados durante la
hidrlisis deberan mejorar la eficiencia de la hidrlisis del sustrato residual.
Levin et al. (2006) llev a cabo pruebas de lotes con C. thermocellum 27405 para producir
biohidrgeno de callos hablar desechos. Los resultados mostraron que el tipo de sustrato inicial, la
concentracin de sustrato, el contenido de humedad del sustrato, la concentracin de nutriente
Aparte de la solucin biolgica de proceso de acoplamiento oscuro foto para la fermentacin sin
salida utilizacin, Liu et al. (2005) propusieron un reactor microbiano bioelectrochemically asistida
(BEAMR) basado en la modificacin de las clulas de combustible microbianas (MFC) mediante la
aplicacin de un pequeo voltaje (N200 mV en la prctica) entre el nodo y el ctodo y la
aplicacin de un ambiente anaerbico en la cmara de ctodo. En este proceso, el gas hidrgeno
se produce en el ctodo a travs de la reduccin de protones. BEAMR tambin se conoce como
clulas microbianas de electrlisis (MEC) o bioelectrohydrogenesis (Rozendal et al, 2008;. Cheng y
Logan, 2007).
En comparacin con MFC, poco se sabe acerca de las funciones de los microorganismos en l MEC.
Las bacterias que son capaces de oxidar la materia orgnica y transfieren electrones exocellularly
al nodo en un MFC mediador-MEC o menos se denominan exoelectrogens (Logan, 2007). Varios
grupos de bacterias han mostrado actividad exoelectrogenic en MFC, incluyendo -Proteobacteria
(Rhodopseudomonas, Ochrobactrum) (Xing et al, 2008;.. Zuo et al, 2008), -Proteobacteria
(Rhodoferax) (Chaudhuri y Lovley, 2003), - Proteobacteria (Shewanella y Pseudomonas) (Kim et
al, 2002;.. Rabaey et al, 2004)., -Proteobacteria (Aeromonas, Geobacter, Geopsychrobacter,
Desulfuromonas, andDesulfobulbus) (Bond et al, 2002; Bond y Lovley, 2003 ; Holmes, 2004; Pham
et al, 2003), Firmicutes (Clostridium) (Park et al, 2001), andAcidobacteria (Geothrix) (Bond y
Lovley, 2005)... Binario definido por el sistema de cultivo (es decir, formado por Clostridium
cellulolyticum y sulfurreducens Geobacter) inform Ren et al. (2007) genera electricidad a partir
de celulosa en un MFC. Sin embargo, los mecanismos moleculares y las bases para el transporte de
electrones exocelular, son poco conocidos. Se ha demostrado que clulas determinada citocromos
membrana externa y conductora de pili (o nanocables) puede jugar un papel clave en la
transferencia de electrones para algunas especies Geobacter y Shewanella (Gorby et al, 2006;..
Lovley et al, 2004; Reguera et al. , 2005). Alternativamente, algunos exoelectrogens, tales como
Pseudomonas aeruginosa (Rabaey et al., 2004) fermentans andGeothrix (Bond y Lovley, 2005)
mediadores excretan a los electrones de enlace hacia las superficies de bacterias (Rabaey et al.,
2005). Especies Shewanella Recientemente se han demostrado para utilizar flavinas como
mediadores (Canstein et al., 2008).
En cuanto a la caracterizacin de la comunidad microbiana en la biopelcula nodo de MECs, a los
autores de los mejores conocimientos, slo dos estudios realizados por Liu et al. (2008a, b) y
byWang et al. (2008b) descubrieron que Shewanella, Geobacter, Pseudomonas,
Rhodopseudomonas Desulfovibrio y estaban presentes en el nodo, de acuerdo con algunos
hallazgos de MFC (Logan y Regan, 2006). Wang et al. (2008b) revel que las especies de
Pseudomonas son los ms abundantes (43-57%) en los reactores MEC, lo que implica que debe
jugar algn papel en la operacin MEC. Sin embargo, estas cepas contribuyen mnimamente a la
recuperacin de hidrgeno en reactores MEC. Wang et al. (2008b) tambin se presume que la
operacin de MECs est bajo
completamente las condiciones anaerbicas, y por lo tanto promueve el crecimiento de bacterias
anaerobias obligadas como exoelectrogenic Geobacter y otras organizaciones no exoelectrogenic
bacterias fermentativas o metanognicas. As, la comunidad microbiana en MECs pueden ser
diferentes de los de MFC. Un trabajo reciente de Wang et al. (en prensa-b) se describe una Fe (III) reducir fermentativa bacteria Bacteroides sp. W7 que se aisl de la suspensin de nodo de un
MEC. Esto proporciona una pista sobre la posible contribucin de organismos suspendidos en la
eficiencia de MEC. Wang et al. (en prensa-c) present una nueva estrategia para la obtencin de
los consorcios nodo funcional (AFC), que tiene mayor actividad electroqumica en trminos de
densidad de potencia y Fe (III) reduccin de la eficiencia, pero ms simple composicin de la
comunidad bacteriana en comparacin con el inculo habituales (es decir lodo activado o aguas
residuales). Esta estrategia ofrece una posibilidad de simular y acelerar el inicio de MECs en 100 h,
a pesar de la fuente de inculo. El proceso de acoplamiento de la fermentacin oscura y
bioelectrohydrogenesis es una solucin de produccin de hidrgeno prometedora para
alcanzar el mximo rendimiento de H2 12 mol H2 mol-1 glucosa. Los reactores MEC se
inicia normalmente como clulas de combustible microbianas (MFC), que generalmente
contiene un nodo hecho de papel o tela de carbono, y un ctodo hecho del mismo
material con un catalizador (Liu y Logan, 2004). Para que un reactor de MFC para ser
utilizado como un MEC, el reactor debe ser modificado para excluir completamente el
oxgeno
de
la
cmara
de
ctodo
y
recoger
a
el gas H2 producido. Una membrana se utiliz para evitar la retrodifusin de
H2 producido en el ctodo a las bacterias en el nodo para alcanzar 2,9 mol
H2-1 mol de acetato de (Liu y Logan, 2004). Progreso sustancial se ha hecho
recientemente en la mejora del diseo del reactor MEC y las tasas de produccin de
hidrgeno (Cheng y Logan, 2007a;. Logan et al, 2007). Para aumentar la eficiencia de la
recogida de hidrgeno gas, un nuevo reactor MEC incluye un tubo de engarce parte
superior con un espacio de cabeza grande para la recogida de gas H2 producido en el
ctodo (Cheng y Logan, 2007a). Usando esta nueva forma de cubo MEC, los
rendimientos de hidrgeno de 2.0-3.95 mol H2 mol-1 (50 a 99% de la mxima terica) se
obtuvo utilizando cido actico, un tpico punto muerto producto de fermentacin de
glucosa
o
celulosa. Tambin
fue
mostr que el gas hidrgeno puede ser producido a partir de otros sustratos, incluyendo la
glucosa, los cidos butrico, lctico, propinico, valrico y, y la celulosa a los rendimientos
mximos estequiomtricas de 54 a 91%.
Cheng y Logan (2007b) obtenido 8,2 moles de H2 a partir de celulosa, un rendimiento de
conversin de 68% en base a un mximo terico de 12 mol H2
mol-1 sustrato. La eficiencia de energa fue de 268% respecto a la electricidad
energa necesaria, y en general, 63%. La produccin total de energa utilizando slo acetato fue del
82%. Por lo tanto, un MEC representa el nico enfoque viable y de alta eficiencia biolgica para
convertir completamente la materia orgnica a hidrgeno que no es dependiente de la luz solar
(Logan, 2007). Uno de los avances ms recientes es el desarrollo de la membrana de menos una
cmara del reactor MEC (Call y Logan, 2008), debido a que la membrana inhibe la transferencia de
protn y permite diferentes pH a desarrollar en las dos cmaras. La desventaja potencial de un
reactor de membrana que es menos
el hidrgeno puede ser usada por las bacterias, pero se encontr que las altas tasas de produccin
de hidrgeno hace hidrgeno prdidas insignificantes. Recuperaciones de hidrgeno del 78% ( 1)
a 96% ( 1) se obtuvieron utilizando una membrana menos MEC (Call y Logan, 2008). La tasa de
produccin de hidrgeno es ms de dos veces la obtenida en los estudios anteriores MEC (Cheng y
Logan, 2007a). Estos resultados sugieren que la recuperacin de hidrgeno de alta y las tasas de
produccin se pueden obtener con la nica cmara de MFC. Esta configuracin reduce el coste
experimental y permitir la formulacin de nuevo y ms sencillo de MECs.
6. Perspectivas
La celulosa es el biopolmero ms abundante en el mundo (Perlack et al., 2005). Los 1,4 millones
de toneladas secas de biomasa producida ligocellulosic N. Ren et al. / Biotechnology Advances 27
(2009) 1051-1060 1057annually en China puede ser cedido hasta 100 millones de kg de H2 (70%
de la cantidad de total de celulosa y la hemicelulosa se emplea para el clculo). En este caso, la
produccin de 1,0 kg de H2 (aproximadamente equivalente al contenido energtico de un galn
de gasolina) tomara 10,3 kg de celulosa sobre la base de un 73% de H2 recuperacin reportado
por Cheng y Logan (2007b). Esta cantidad de H2 equivalente a 500 mil millones kg de carbn
estndar, que es de alrededor de 22,4% del consumo total de carbn (2,2 millones de toneladas)
Importe en 2006 en China. Por lo tanto, bioconversin de celulosa proporciona un enfoque viable
para producir hidrgeno renovable a partir de la materia orgnica, siempre un alto sistema
eficiente proceso combinatorio se adopta.
6,2. Desafos cientficos y tcnicos
Cmo, entonces, puede biocatalizadores cumplir su promesa? Algunos mejora de la eficiencia del
proceso puede hacerse modificando el proceso de fabricacin de productos qumicos para
adaptarse a las sensibilidades del biocatalizador (por ejemplo, en trminos del pH, la temperatura,
y los disolventes). Esto ha llevado a la paradigma en los ltimos aos, que ha de preparar el
proceso para el biocatalizador disponible. La otra alternativa, que vamos a describir aqu, es el uso
de metodologas dirigidas evolucin para generar nuevos biocatalizadores para funcionar en
condiciones ms ideales del proceso y por lo tanto permitir que los procesos ms robustos.
Recientemente, con los avances en las tcnicas de ingeniera de protenas, numerosos ejemplos de
la optimizacin de los rasgos de cierta enzima (por ejemplo, la termoestabilidad, la tolerancia
hacia los disolventes orgnicos, enantioselectividad) se han dado. Esto se ha logrado por ambas
tecnologas en desarrollo nuevos para la diversificacin gnica, as como nuevos sistemas de
deteccin. As que con los mtodos para desarrollar nuevos rasgos de las enzimas disponibles, ya
no es una cuestin de cmo evolucionan pero lo que evolucionar para.
Qu es lo que diferencia a una enzima de tipo salvaje de un biocatalizador industrial til? Cul es
la funcin objetivo que debemos detectar, para permitir un proceso qumico? Lo que hace a estas
preguntas tan difcil de responder es la diferencia entre las propiedades de las enzimas que ofrece
la naturaleza y tienen las demandas de los diferentes procesos de fabricacin de productos
qumicos.
Tpicas diferencias se resumen en la Tabla I. Por otra parte, mientras que las clulas podran, desde
un punto de vista biolgico, sufren cambios bastante drsticos en su metabolismo, las condiciones
citoslicas general no cambia tanto como la de un medio de reaccin en el transcurso de un
industrial biotransformacin, donde el medio ambiente podra cambiar drsticamente durante la
conversin, por ejemplo, a partir de un sustrato 1 M hidrfobo a un producto 1 M inico. Estos
grandes cambios en trminos de hidrofobicidad o la osmolaridad de la solucin tienen que ser
tomadas en cuenta En la mayora de los casos, por lo tanto, un esfuerzo de ingeniera de protenas
no es unidimensional, sino multidimensional, y es generalmente una combinacin de aumento de
la frecuencia (incl. ms dbil sustrato y la inhibicin del producto), el alcance de sustrato
(aceptacin y selectividad) y la estabilidad (por ejemplo, , hacia disolventes, reactivos y la
temperatura) (Fig. 1). Una tolerancia de pH ms amplio, o pH ptimo diferente tambin podra ser
deseable suprimir las reacciones secundarias, tales como la hidrlisis de los reactivos. Dada la
capacidad de evolucionar caractersticas mltiples enzimas simultneamente, el nuevo paradigma
es imaginar primero el proceso qumico deseado y determinar todos los criterios que el
biocatalizador tiene que cumplir, y luego evolucionar hasta una enzima que cumple o supera estos
objetivos. Un conjunto tpico de tales objetivos para un proceso qumico se dan en la Tabla II. Este
enfoque permiten a muchos procesos qumicos ms nuevos y ms verdes en el futuro que el
enfoque clsico de colecciones de cepas de tamizaje para la de tipo salvaje enzimas o clulas
enteras biocatalizadores Qu es una "buena" biocatalizadores para la fabricacin de productos
qumicos? Contribucin gastos del biocatalizador para el proceso final fue considerado con
frecuencia prohibitivo en el pasado. Por lo tanto, adems de los parmetros tcnicos como la
actividad, la estabilidad
y la selectividad, los objetivos comerciales tienen que ser tenidos en cuenta. La contribucin de
todos estos parmetros-la tcnica, as como el comercial-en conjunto definen la barrera de
comercializacin (Fig. 2), que tiene que ser superado para representar un proceso qumico de
fabricacin factible. Aunque los parmetros comerciales son generalmente considerada cientfica y
por lo tanto puede dejarse de lado, en el caso de un proceso biocataltico estas consideraciones
econmicas se traducen en cuestiones cientficas, as Los costes de fabricacin del biocatalizador y
el biocatalizador de carga-que est determinado por la actividad intrnseca bajo condiciones de
proceso-tienen que ser tratados. A primera vista, un sustrato de relacin de catalizador (S / C) de
20 (100 gL 'de sustrato a 5 gL ~ de biocatalizador) o mejor no podra parecer difcil de obtener. Al
pensar en las enzimas como catalizadores a nivel molecular, a menudo parecen muy superiores a
los catalizadores qumicos en trminos de sus frecuencias de rotacin (TOF) y los nmeros totales
de volumen de negocios (TTN). Sin embargo, estos valores a menudo reflejan mediciones en
condiciones de velocidad inicial que descuidan fenmenos de inhibicin a concentraciones
molares de los reactivos y productos. Puesto que las enzimas son macromolculas, en
comparacin a una base de peso a peso, las enzimas a menudo comparan tambin a sus
equivalentes qumicos con respecto a la eficiencia molar. Algunas de las caractersticas que desee
para un biocatalizador buena, aunque ms bien cualitativa y discutible, se resumen en la Tabla III.
Para permitir una produccin rentable y robusta del biocatalizador, la enzima de eleccin es
preferiblemente sobreexpresa en E. coli o en otro organismo GRAS fcilmente manipulado. La
mayora de las enzimas de inters vendr de otros organismos, y mientras que en algunos casos
una enzima deseada puede tener los niveles de expresin suficientemente altas en su husped
natural clonacin, y Para permitir una produccin rentable y robusta del biocatalizador, la enzima
de eleccin es preferiblemente sobreexpresa en E. coli o en otro organismo GRAS fcilmente
manipulado. La mayora de las enzimas de inters vendr de otros organismos, y mientras que en
algunos casos una enzima deseada puede tener los niveles de expresin suficientemente altas en
su husped natural, la clonacin y sobreexpresin en E. coli hace que sea fcilmente susceptible a
las tecnologas de ingeniera de protenas. Optimizar el gen y sistema de vectores para la expresin
elevada y robusto en E. coli a menudo se requiere para permitir que tanto cribado de alto
rendimiento as como la fabricacin enzima.
Adems, el ideal rentable proceso de fabricacin biocatalizador no requiere purificacin de la
enzima. Mientras que una enzima altamente purificada permitira una carga biocatalizador bajo en
el proceso, la purificacin hasta la homogeneidad a menudo es muy laborioso y costoso.
Idealmente, las clulas de E. coli que producen la enzima de inters son lisadas, las protenas estn
opcionalmente enriquecido en el sobrenadante (por ejemplo, por tratamiento de PEI y
ultrafiltracin) y despus se prepar como formulacin lquida o liofilizada. Puesto que tal
preparacin tambin contiene otras protenas y sales aparte de la ingeniera de protenas, una alta
actividad intrnseca de la protena de inters es deseable. Si esta preparacin biocatalizador se
puede almacenar durante largos perodos de tiempo, la produccin y el uso de biocatalizador se
puede desacoplar tanto en trminos de los programas de produccin y lugares, procesos
Por lo tanto, no slo desde una perspectiva de utilizar el biocatalizador en la reaccin, sino
tambin en trminos de produccin y almacenamiento de ella, una enzima multi-rasgo optimizado
a menudo es necesario para permitir que nuevos procesos.
Otra forma de aumentar la relacin S / C de relacin es, por supuesto, para aumentar la carga de
sustrato. Los sustratos previstos para una fabricacin de productos qumicos son generalmente
hidrfobo, por lo que una carga de sustrato diana de 100 gL "ms a menudo que no excede el
lmite de solubilidad mxima de los compuestos en medios acuosos. Anteriormente, el proceso fue
adaptado al catalizador mediante el uso de bajas concentraciones de sustrato, disolventes
orgnicos que eran compatibles con el biocatalizador, la alimentacin de sustrato o la absorcin
de resina de sustrato y de producto.
Recientemente desarrollados mtodos de evolucin de protenas permiten la creacin de las
enzimas que son estables y activas en altos niveles de sustratos orgnicos y disolventes.
Alternativamente, el biocatalizador puede ser diseado para ser activo en una emulsin o sistema
de dos fases (que puede consistir en el substrato puro o con un disolvente orgnico).
Cmo crear una "buena" biocatalizador-Avances
en Ingeniera de Protenas
Al iniciar un programa de evolucin dirigida, es muy importante tener una buena comprensin de
lo que las propiedades del biocatalizador final debe poseer. Condiciones especficas para el
proceso final (tal como se representa en la Tabla II) se debe determinar en primer lugar, por ser de
las condiciones que deberan ser imitadas en el proceso de seleccin. Pocos de los rasgos
especficos que la enzima final debe poseer (actividad, selectividad, la falta de inhibicin de
sustrato / producto, etc) se fija o vinculado, y por lo tanto algunos pueden desplazarse, mientras
que otros se estn evolucionado. Por ejemplo, si el objetivo del proyecto es mejorar la actividad
de una enzima que ya tiene la enantiospecificity deseado altamente especfica, las variantes con
actividad mejorada deben ser controlados para asegurar no han perdido la enantiospecificity
deseado. Cribado para una enzima altamente activo tendr como resultado la identificacin de
enzimas activas, sino en las "visitas" no necesariamente poseen el otro caractersticas deseadas.
Aunque no todos los resultados criterios deben reflejarse en las primarias de alto rendimiento
pantalla, es importante vigilar todos los rasgos deseados en cada uno ronda de evolucin para
asegurar que la enzima final se ajuste a la objetivos finales.
Por consiguiente, podra ser beneficioso usar un sistema de seleccin secuencial (Fox et al., 2007)
que comprende una primera proyeccin pragmtico (vivo / muerto, alta / baja actividad) y una
comprobacin de segundo nivel, por ejemplo, la enantioselectividad de la biocatalizador. Escalar
hacia abajo el proceso qumico biocataltica en formato de placa de pocillos veces es ms difcil de
lo que parece a primera vista y por lo que el uso de un sistema de cribado permite niveles ms
complejo (y probablemente ms costoso y consume tiempo) ensayos a realizar en menos enzima
variantes. El impacto del desarrollo de procesos qumicos en el desarrollo del ensayo (vase el
prrafo anterior) no puede ser subestimada y es una clave para el xito a menudo pasado por alto
en el desarrollo de biocatalizadores comercialmente viable para la produccin de productos
qumicos.
Aunque varios enzimas de ingeniera se han utilizado en la sntesis orgnica en una escala
preparativa (Turner, 2003), muy pocos ejemplos han sido descritos de la creacin de una enzima
diseados especficamente para un proceso qumico a gran escala de fabricacin. Davis et al.
(2006) describen una ruta a una combinacin de un ster de hidroxinitrilo reduccin de cetona
asimtrica con una etapa de cianacin. En el primer paso, etil-4-cloroacetoacetato se reduce por
una reductasa cetona (Kred, o alcohol deshidrogenasa, ADH (Goldberg et al., 2007)). La
regeneracin del cofactor se consigue con la adicin de glucosa deshidrogenasa y glucosa (GDH).
El proceso se hizo econmicamente viable mediante la evolucin de ambas enzimas para la
actividad y la estabilidad en la presencia de 20% (w / v) de sustrato y acetato de butilo como
disolvente. Sustrato (160 g) se convirtieron en 10 h con una carga de Kred y GDH combinado de
menos de 1% (w / w). El producto se obtiene en pureza estereoqumica excelente (ee> 99,9%) y
ms de 95% de rendimiento aislado. Las mejoras de los procesos se resumen en la Figura 4.
Aqu, las implicaciones de la evolucin de la enzima en la ingeniera de procesos son
especialmente evidentes en el proceso facilitado aguas abajo. Debido al aumento de la actividad