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155
v1
v2
INTERMEDIARIO
(FOSFATO DE
GLICERALDEHIDO)
PRODUCTO 3
(GLICEROL)
v3
v4
PRODUCTO 1
(ETANOL)
PRODUCTO 2
(CO2)
Para que los alumnos que cursan bioqumica puedan entender y aplicar ese principio a
diversos problemas de control metablico, es preciso que estn familiarizados con los llamados
balances estequiomtricos. Y adems, puedan utilizar las nociones bsicas de la fsico-qumica y
la qumica orgnica. Lamentablemente, la enseanza de la bioqumica se ha orientado, en forma
tradicional, a la memorizacin de una larga serie de compuestos orgnicos con nombres raros y
estructuras que tienen poco que ver con la experiencia cotidiana de los alumnos. Quizs por esa
razn, la bioqumica se ha vuelto una disciplina poco atractiva y difcil de comprender para
muchas generaciones de estudiantes en carreras tan diversas como las reas mdicas, las
ciencias qumicas y la ingeniera ligada a los alimentos o a la biotecnologa.
El propsito de este ensayo es utilizar un texto avanzado de bioqumica de amplia
divulgacin, como el de Voet & Voet [1], como gua. Pero, mostrando de qu forma se pueden
generar preguntas y ejercicios que motiven al estudiante para deducir la estructura de los
compuestos y la naturaleza de las reacciones que son parte de la primera va dilucidada en la
historia de la bioqumica: la gluclisis.
156
157
b)
Una vez planteado el problema de investigacin cules sern las reacciones qumicas
que transforman la glucosa en alcohol y dixido de carbono, viene el problema de cmo
investigarlo. Y de ah conviene destacar el uso de inhibidores metablicos como el yoduro de
acetato (I-CH2-COOH) que da lugar a la acumulacin de la Fructosa 1.6 Bifosfato. (F1,6BF) Esto
explica la observacin de la necesidad de aadir fosfatos al medio de fermentacin para que
ocurra el proceso. Tal resultado permite al profesor el uso de la estequiometra, para establecer
el balance de fosfatos en la primera parte de la gluclisis.
2HPO43- + C6H12O6
2-
158
O
1
2
3
HO
CH2 O
1
O
3
HO
CH
4
..
HC O H
..
5
HC OH
6
CH2 O
CH2 O
Dihidroxiacetona fosfato
CH
H
+
O
P
4
O
C
H
O
O
Fructosa-1,6-bisfosfato
5
HC OH
6
CH2 O
Gliceraldehdo-3-fosfato
O
P
G'= 23.8
kJ
mol
a) El ataque de un carbanin formado por uno de los dos hidrgenos del carbono 3 de
la DHA3F (Figura 2) que ataca al carbonilo del GA3F. Este ataque puede llevarse a
cabo por arriba o por abajo del plano del GA3F (Figuras 3 y 4). Si se genera un
carbanin con el hidrgeno abajo del plano del papel (lnea punteada en la Figura 3),
se dara lugar a la formacin de los azcares D-Tagatosa o D-Fructosa (Fig. 3).
b) Si el carbanin es formado con el hidrgeno en la DHA3F, arriba del plano del papel
(cua en la Figura 4) se dara lugar a la formacin de los azcares D-Psicosa y DSorbosa mostrados en la Fig. 4.
Sin embargo, en las clulas slo se forma la D-Fructosa. Esto indica que la protena
cataltica llamada aldolasa, que activa la reaccin de rompimiento reversible de la F1,6BF slo
tiene una forma de reaccin de las cuatro posibles mostradas en las Figuras. 3 y 4, e ilustra la
especificidad de las reacciones bioqumicas, frente a la relativa inespecificidad de las reacciones
de la qumica orgnica ordinaria. En este punto se ofrece la oportunidad de explicar:
a) Qu es una molcula quiral?
b) Cmo se establece la nomenclatura Cahn-Ingold-Prelog en R y S estructuras
quirales?
c) Qu significan las estructuras pro-quirales?
d) Cmo se producen los ismeros R o S, segn el ataque de un reactante sobre una
estructura pro-quiral (por ejemplo, DHA3F)?
e) Cmo se construyen modelos fsicos de los azcares, que representen la quiralidad
de cada tomo con substituyentes asimtricos?
f) Cmo se deduce el ataque correcto de la condensacin aldlica de las triosas, para
producir el bifosfato de fructosa?
g) Qu podemos aprender de la reaccin inversa (condensacin aldlica) sobre el
mecanismo de la ruptura de la F1,6BF en las dos triosas correspondientes?
h) Por qu y cmo la enzima regula en forma completa la quiralidad de las molculas
resultantes, en la reaccin inversa de condensacin?
i) Cmo ser el mecanismo de la enzima aldolasa que cataliza el rompimiento de la
F1,6BF en dos triosas?
159
1 CH OPO 22
3
2C O
HO C
2
3
3 -
HO
5
CH 4
OH
5
CH2OPO3
6
1
3
HO
4
OH
2OPO3
OH
C H2 OPO3
2-
C H2
OPO3
2-
CH
C2
HC
D -T a g a to sa
2-
..
2-
CH
6
C
OPO3
HO
..
O
C
H 4
CH2
HC
OH
HC
OH
C H2
CH2 1
OPO3
2-
D -F r u c to sa
Figura 3. Ataque del carbanin (RHOCH-) de la DHA3F sobre el carbonilo (R-CO) del GA3F para
generar el racemato D-Tagatosa y D-Fructosa. Ntese que el hidrgeno que ha sido eliminado (-)
en la posicin 3 de la DHA3F est abajo del plano. Slo se muestra el ataque en el cual DHAF se
aproxima por arriba para generar la D-Fructosa, pero se requiere considerar el ataque simtrico
(por abajo) para generar la D-Tagatosa.
1
2CH2 OPO3
2
3 C O
1 CH OPO 22
3
2 C
HO
..
C
3
HC
HO
5
OH
CH 4
HC OH
CH2 OPO3
2-
D-Sorbosa
OH
O
C
H 4
C
5
CH2OPO3
6
2-
1
2
C
3
HC
..
3
C
C2
2-
CH2 1
2-
O
OH
HC OH
5
OH
O
OPO3
CH2 OPO3
HC OH
CH2 OPO3
2-
D-Psicosa
Figura 4. Ataque del carbanin (RHOCH-) del FDHA sobre el carbonilo (R-CO) F3GA para
generar el racemato D-Tagatosa y D-Psicosa. Ntese que el hidrgeno que ha sido eliminado (-)
en la posicin 3 de la DHA est arriba del plano. Slo se muestra el ataque en el cual FDHA se
aproxima por arriba para generar la D-Psicosa, pero se requiere considerar el ataque por abajo del
plano del carbonilo para generar la D-Sorbosa.
160
Adenosina
O P
O
O
CH2
O
OH
OH
OH
2+
O CH2
OH
O
Mg
:O
..
OH
Glucosa
OH
ADP
+H
OH
OH
Glucosa-6-fosfato
G' = 16.7
kJ
mol
G' = 1.7
kJ
mol
O
O
P
O
O
O CH2
2+
Mg
OH
OH
H 2C
CH2 OH
O
HO
O
HO
OH
OH
OH
OH
Glucosa-6-fosfato
Fructosa-6-fosfato
O
O
H2 C
CH2 OH
O
HO
HO
OH
ATP
ADP
2+
Mg
O
O
O
O
H2 C
O
HO
OH
OH
OH
Fructosa-6-fosfato
CH2 O
O
HO
Fructosa-1,6-bisfosfato
G' = 14.2
kJ
mol
Figura 7. Fosforilacin para formar la Fructosa 1,6-Bifosfato (F 1.6 BF). Reaccin catalizada por la
Fosfofructocinasa I.
161
ADP + H3PO4
162
Go1 = 30.5 kJ/mol, para acoplar esta sntesis con la hidrlisis de otro compuesto fosforilado con
Go2 < 0, se requiere que la suma de las dos energas libres sea negativa
GoT = Go1 + Go2 < 0
Esto implica que Go2 < - 30.5 kj/mol. Y esto simplifica mucho la seleccin de candidatos
para acoplarse con la sntesis de ATP, pues basta consultar una tabla en la que estn
consignadas los valores de Go, como aparece en la Tabla I, para que podamos seleccionar al
candidato adecuado. En la nomenclatura qumica, el smbolo Go, significa el valor calculado en
el equilibrio y el G, a secas, bajo condiciones que pueden estar fuera del equilibrio. Esto puede
ocurrir en procesos dinmicos como los celulares en los cuales, los flujos bioqumicos producen
desviaciones prolongadas de las condiciones del equilibrio, debido a balances entre la
produccin y consumo de cada uno de los elementos de una cadena metablica. Pero para el fin
educativo de este escrito, por el momento podemos conformarnos con las condiciones en
equilibrio.
Por ejemplo: en la Figura 8, se muestra de manera esquemtica que el proceso de
clavar y desclavar compuestos nucleoflicos ocurre en un sitio activo que tiene un grupo RSH, es decir, en una cistena. El grupo R-SH puede ionizarse como si fuese un R-OH, generando
el nuclefilo (amante de ncleos) R-S-. Este nuclefilo puede atacar a un tomo de carbono, (un
carbonilo) R-C=O-H, que tiene una carga parcialmente positiva por el efecto electro negativo del
oxgeno. En esa figura, se indica que el carbonilo corresponde al aldehdo de la triosa. Adems,
el sitio activo de la enzima, en una posicin cercana a la cistena activa, tiene afinidad por la
coenzima NAD+ (forma oxidada) que atraer un hidrgeno del hemiacetal formado sobre la
cistena (vase Figura 8) Como el hemi-acetal es inestable, se forma un carbonilo y se libera otro
hidrgeno que sale al medio como protn. Pero da la casualidad, lograda por la evolucin
biolgica, que el NADH tiene menos afinidad por el sitio activo que el NAD+, y se presenta un
recambio que libera una coenzima reducida (NADH) al medio de reaccin, dejando el clavo de
NAD+ adentro. El otro clavo dentro del sitio, que es la triosa, debe ser eliminado por otro ataque
nucleoflico. Esa vez ser el H2PO4-, que atacar al carbonilo unido a la cistena (Figura 8) Esta
ltima reaccin regenera la configuracin original de una enzima con NAD+ y la cistena con RSH libre, lista para un nuevo ataque por otra molcula de un carbonilo.
Dicha reaccin ha permitido formar un compuesto de alta energa, el 1,3BFG (1,3 Bi
Fosfo Glicerato) cuya Go = -49.4 kJ/mol, permite acoplar la hidrlisis del fosfato en posicin 1,
con la reaccin de formacin de ATP (Go = +30.5 kJ/mol), segn se indica en la Figura 9 y en la
Tabla I. El resultado neto es una Go = -18.9 kJ/mol, la cual, siendo negativa hace factible el
acoplamiento de estas dos reacciones. Pero, examinando, la Tabla I, se puede concluir que sera
imposible acoplar la hidrlisis del 3-Fosfoglicerato (Go = -9.2 kJ/mol) con la formacin de ATP.
Si se contina el examen de la Tabla I, se puede comprobar que la hidrlisis del cido
Fosfoenolpirvico tiene un Go = -61.9 kJ/mol, de forma que esta reaccin se podra acoplar con
163
CH2OPO3
2-
CH OH
O
CH2OPO3
HO
2-
CH2OPO3
CH OH
NAD
O
CH2OPO3
O
..
Cys
C O
+
NAD
S
NADH
NADH+H
NAD
C
HO
Pi
NADH+H
NAD
CH
CH2OPO3
HO
2-
2-
C O
G'= 6.3
CH
kJ
mol
2-
CH2OPO3
1,3-bisfosfoglicerato
Gliceraldehdo-3fosfato
CH OH
C O
Cys
Cys
CH2OPO3
2-
CH OH
CH OH
..
C OH
..
2-
Reaccin Global
O
O
O
HO
Mg
CH
CH2OPO3
2-
O
:O
2+
HO
P O
P
O
CH
CH2OPO3
2-
Adenosina
2+
Mg
O
O
P
O
O
O
P O
Adenosina
G'= 7.5
Figura 9. Formacin del ATP a partir del ADP y del 1,3 Bi Fosfo Glicerato (BFG).
164
kJ
mol
El resultado neto de este proceso puede expresarse por la siguiente ecuacin qumica
C6H12O6 + 2 H3PO4 + 2 ADP + 2 NAD+
HC
CH2
OH
P
O
3-Fosfoglicerato
Mg
2+
HC
O
O
O
O
CH2
OH
2-Fosfoglicerato
G '= 4.4
kJ
mol
Figura 10. Isomerizacin entre el 3-Fosfo Glicerato (3FG) y el 2-Fosfo Glicerato (2FG).
165
C
O
..
O
..
OPO3
..
O
..
2-
Mg
2+
OH
OPO3
Mg
OPO3
2-
H2 O
C
H
2+
2-
OPO3
2-
H2O
G ' = 7.5
C
H
OH
kJ
mol
Fosfoenolpiruvato
2-Fosfoglicerato
Reaccin global
Figura 11. Reaccin catalizada por la enzima enolasa que transforma el 2-Fosfo Glicerato en
el Fosfoenolpiruvato.
2+
2+
O
C
Mg
C
CH2
:O
Mg
ATP
P O
O
O
Adenosina
K
O
C
CH2
C
CH3
G ' = 31.4
kJ
mol
CH3(HCOH)COOH + NAD
La Figura 13 ilustra esta reaccin, indicando que la parte reactiva del NADH (esquina
superior izquierda de la Figura 13) es la nicotinamida reducida, que tiene dos hidrgenos en la
posicin 4, opuesta al substituyente, R, de la citada figura. De esta manera, se puede tener un
166
(pro-R)
R
(pro-S)
O
OH
OH
NAD +
OH
167
NADHR+H+
O
2 C
l-lactato
C
HO H
1
CH3
3
O
C
C
CH3
1
HO
3
CH3
C
2 C
O
d-lactato
O
NADHS+H
f)
CH3CHO + CO2
H.
CH3CHO + NADH + H+
CH3CH2OH + NAD
CH2OH(HCOH)CH2OPO32- + NAD
168
Por lo tanto, el consumo del NADH para formar glicerol da lugar a la prdida neta de
ATP, que ha sido consumido para la fosforilacin de las hexosas. A diferencia del consumo de
NADH para formar etanol, que da lugar a una ganancia de ATP. Como, de acuerdo con la
segunda ley de la termodinmica, es preciso disipar energa para mantener activo cualquier
proceso, se puede deducir que el rendimiento mximo de glicerol debe ser inferior al 50% del
azcar suministrado porque, con un rendimiento del 50% sera equivalente a una mquina de
movimiento perpetuo, que trabajase sin disipacin de energa.
Una consecuencia de estos balances es la reorientacin de la fermentacin de las
levaduras segn se cambie el valor del pH del medio. Esto fue descubierto por Neuberg antes de
1920 y se explic como el efecto del pH sobre las deshidrogenasas: alcohlica que trabaja mejor
a pH 4 y del Fosfato de Glicerilo, que trabaja mejor a pH neutro. La Figura 15 muestra que al
elevarse el pH, desciende la produccin de etanol y asciende la de glicerol, en forma
completamente recproca.
Este fue quizs el primer ejemplo de manipulacin deliberada del metabolismo celular
para producir un producto industrial, el glicerol. Su uso como materia prima para la fabricacin de
la nitro-glicerina, justific en Alemania de principios del siglo XX, el costo de separacin del
etanol y de otros productos como el cido actico. Neuberg logr mayores rendimientos de
glicerol al aadir sulfito de sodio que atrapa al acetaldehdo e impide la produccin del etanol. De
esa forma, se forz an ms la produccin de glicerol que nunca lleg a ms del 30%.
Se podra decir que la ingeniera metablica se inici con las fermentaciones de
Neuberg, usando un inhibidor qumico (el sulfito de sodio) del proceso natural de produccin del
alcohol por las levaduras. Desde este temprano caso de manipulacin intencionada del
metabolismo celular, se utiliz el balance de materia y los conceptos fundamentales de la
termodinmica para estimar los rendimientos mximos y para explicar la naturaleza qumica del
proceso. Por lo tanto es un excelente ejemplo para justificar el uso de dichos balances en el
desarrollo de nuevos procesos bioqumicos manipulados por el ser humano.
Conclusiones
Se propone analizar la secuencia aparentemente interrumpida y catica del
razonamiento previo en funcin del propsito didctico de ensear la gluclisis de una manera
ms dinmica y atractiva que el mtodo tradicional, de tipo lineal y secuencial.
En este ensayo se ha procurado utilizar el procedimiento llamado constructivista, que
consiste en utilizar ejemplos e ilustraciones para deducir principios. Por ejemplo: se utiliz la
evidencia del uso de inhibidores (cido yodo actico y floruros) que bloquean la fermentacin y
facilitan el aislamiento de intermediarios. Y a partir de la estructura de esos intermediarios, de
dedujo la estructura qumica de los precursores (las hexosas como precursoras de las triosas).
A su vez, se utilizaron los mecanismos de la qumica orgnica, en este caso la
condensacin aldlica, para ilustrar la importancia de la estereo qumica y la lgica del
mecanismo de reaccin de la enzima clave en el rompimiento: la aldolasa, cuyo nombre proviene
precisamente de considerar la inversa de la condensacin aldlica.
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Biomasa
Glicerol
Polinmica (EtOH)
Polinmica (Biomasa)
Polinmica (Glicerol)
0.250
0.050
0.045
0.040
0.035
0.150
0.030
0.025
0.100
0.020
0.015
0.050
% Redox (Glicerol)
% Redox (EtOH)
0.200
0.010
0.005
0.000
0.000
0
pH
Figura 15. Efecto del pH sobre el patrn de produccin de etanol y glicerol en un cultivo
de Saccharomyces cerevisiae. Las curvas punteadas fueron ajustadas por medio de un
ajuste cuadrtico de los puntos experimentales. Datos de Neish y Blackwood [5].
Este inicio heterodoxo facilita mucho la comprensin del esquema de la gluclisis. Tiene
una mitad que se traduce en la transformacin de las hexosas y otra mitad de las triosas.
Adems, facilita el entendimiento de la importancia de la isomerizacin de la glucosa en fructosa,
pues de esa forma se facilita el mecanismo de rompimiento aldlico. Cosa que sera muy difcil
con el carbonilo en el extremo de la hexosa.
170
Referencias bsicas
1.
2.
3.
4.
5.
rd
Voet, D., Voet, J., (2004) Biochemistry, 3 Edition, John Wiley & Sons Inc. Hoboken, N.J. USA
nd
Nielsen, J., Villadsen, J. and Lidn G. (2003) Bioreaction Engineering Principles.2 Edition. Kluwer
Academic/Plenum Publishers, New York, USA.
Buchner, E. (1907) Cell free fermentation Nobel Lectures, Chemistry 1901-1921, Elsevier
Publishing Co. Amsterdam, Netherlands (1966). (http://www.nobel.se/cemistry/laureates).
Mrner KAH (1907)The Nobel Prize in Chemistry 1907 Nobel Lectures, Chemistry 1901-1921,
Elsevier
Publishing
Co.
Amsterdam,
Netherlands
(1966).
(http://www.nobel.se/cemistry/laureates).
Neish AC, Blackwood AC (1951) Dissimilation of glucose by yeast at poised hydrogen ion
concentrations Canad. J. Tech. 29(2): 123-129.
171
172