Klasifikasi Enzim KlasifikasiEnzim

Oxidoreductase mengkatalisis reaksi reduksioksidasi

Transferase memindah gugus fungsional
Hydrolase menyebabkan reaksi hidrolisis Hydrolase menyebabkan reaksi hidrolisis
Lyase pengurangan gugus untuk membentuk ikatan rangkap, ikatan CO,CC
atau CN
Isomerases penyusunan kembali gugus fungsional,isomerisasi
Ligase pembentukan ikatan yang berpasangan dengan hidrolisis ATP Ligase pembentukan ikatan yangberpasangan dengan hidrolisis ATP,
penggabungan 2molekul
10/21/2009 biokimiaenzim 1
RangkumanKelompokdanSubKelompok g p p
UtamaEnzim
Oksidoreduktase Oksidoreduktase Hidrolase Hidrolase Isomerase Isomerase Oksidoreduktase Oksidoreduktase
Dehidrogenase
Oksidase
Reduktase
Hidrolase Hidrolase
Esterase
Glikosidase
Peptidase
Isomerase Isomerase
Rasemase
Epimerase
Isomerase
Peroksidase
Katalase
Oksigenase
Hidroksilase
Fosfatase
Tiolase
Fosfolipase
Amidase
Mutase (tidak semua)
Liase Liase
Dekarboksilase
Deaminase
Ribonuklease
Dekarboksilase
Aldolase
Hidratase
Dehidratase
Sintase
Transferase Transferase
Transaldolase dan
transketolase
Ligase Ligase
Sintase
Liase
Asil, metil, glukosil dan
fosforiltransferase
Kinase
Fosfomutase
Ligase Ligase
Sintetase
Karboksilase
10/21/2009 biokimiaenzim 2
10/21/2009 biokimiaenzim 3
Klassifikasienzim
Perkembangannamaenzim g
1.padaawalenzimdikenal,enzimhanya
mengatalisisreaksihidrolisisikatankovalensaja g j
namaenzim:substratyangdikatalisis+ase
lipasemengatalisishidrolisislemak
amilasemengkatalisishidrolisis
amilum
l h d l proteasemengatalisishidrolisisprotein
lanjutan
2.Menekankantipereaksiyangdikatalisisnya
Contoh:
enzimdehidrogenase:mengatalisisreaksi
pelepasanhidrogen p p g
enzimtransferase:mengkatalisisreaksipemindahan
gugussehinggamakinbanyakenzimyang g g gg y y g
ditemukanketidakjelasansemakintampak
Untukmengatasi
3 International Union of Biochemistry (IUB): membagi enzim 3. InternationalUnionofBiochemistry(IUB):membagienzim
atasdasarmekanismereaksidengankerangkasistem
a.Enzimdibagimenjadi6kelasyangurutan
kelasnyatidakbolehdiubahubahdengan
masingmasingkelasmempunyai4 13
subkelas
b.Namaenzimterdiridari2bagian
t k t li i b t t pertama:mengkatalisissubstratnya
kedua:berakhirdenganakhiranase,
menyatakan tipe reaksi yang dikatalisis menyatakantipereaksiyangdikatalisis
Lanjutan
c Informasi tambahan diperlukan untuk c.Informasitambahandiperlukanuntuk
menjelaskanreaksidapatditulisdlm
tanda kurung dibagian akhir tandakurungdibagianakhir
Contoh:
L l t NAD
+
i t CO NADH H
+
Lmalat+NAD
+
piruvat+CO
2
+NADH+H
+
NamaEnzim:1.1.1.37:(Lmalat:NAD
+
oksido
d k ) li i reduktase),mengatalisis
prosesdekarboksilasi
Lanjutan
d.Setiapenzimmemp.kodeenzim(EC):terdiri
dari 4 digit: Digit pertama: kelas enzim dari4digit: Digitpertama:kelasenzim
Digitkedua:subkelas
Digitketiga:subsubkelas
Digitkeempat:untukenzim
spesifik
ik i d JikaenzimdenganEC:2.7.1.1
makaenzimtsbkelastransferaseuntuk
menstransfer fosfaf dengan alkohol sbg menstransferfosfafdenganalkoholsbg
aseptorfosfat:heksokinaseatauATP:Dheksosa6
fosfotransferaseenzimyangmengatalisis
pemindahan gugus fosfat dr ATP ke gugus hidroksil pemindahangugusfosfatdrATPkegugushidroksil
atomkarbondarimolekulglukosa
Klassifikasienzimmen.IUB
1. Oksidoreduktase:mengatalisisreaksioksidasidanreduksi
(pemindahanelektronatauionhidridaatauatoH)
2. Transferase:mengatalisisreaksipemindahangugusdari
suatu molekul donor ke molekul aseptor (metil glikosil) suatumolekuldonorkemolekulaseptor( metil, glikosil)
3. Hidrolase;mengkalisisreaksipemecahanhidrolistikCC,CO,
C O ik l i k ik hid id CN,PO,ikatanlaintertentutermasukikatanasamanhidrida
(reaksihidrolisis:transfergugusfungsionalkeair)
Lanjutan
4. Liase: mengkatalisis pemecahan CC, CO, 4.Liase:mengkatalisispemecahanC C,C O,
CN,danikatanlaindngeliminasiyangmenghasilkanikatan
rangkapdanjugapenambahanguguspdikatanrangkap
5.Isomerase:mengkatalisispemindahangeometrikatau
strukturaldalamsuatumolekultunggal(pemindahangugus
dalammolekuluntukmenghasilkanbentukbentukisomer)
6 mengkatalisis penggabungan bersama 2 molekul (pembentukan 6.mengkatalisispenggabunganbersama2molekul(pembentukan
ikatanCC,CO,CS,CNolehpasanganreaksikondensasike
pemecahanATP
Oksidoreduktase Oksidoreduktase
k l k k d d k Mengkatalisisreaksioksidasireduksi
Contoh:alkohol+NAD+oksidoreduktase(dehidrogenase,
alkohol dehidrogenase) alkoholdehidrogenase)
mengkatalisisoksidasialkoholmenjadialdehid
10/21/2009 biokimiaenzim 11
2 elektron dan 2 atom hidrogen dipindahkan dari 2elektrondan2atomhidrogendipindahkandari
alkoholuntukmenghasilkanaldehid.
2elektronpadaikatankarbonhidrogenalkohol p g
dipindahkeNAD+,yangmengalamireduksi.
NADmerupakankofaktoryangmenjebataniberbagai p y g j g
reaksioksidasireduksi.
10/21/2009 biokimiaenzim 12
Selain gugus fungsional alkohol dan aldehid Selaingugusfungsionalalkoholdanaldehid,
dehidrogenasejugabekerjapadagugus
fungsional berikut sebagai donor elektron : fungsionalberikutsebagaidonorelektron:
CH2CH2,CH2NH2 danCH=NH,sebaik
koenzim NADH NADPH FADH dan FMNH koenzimNADH,NADPH,FADH,danFMNH
10/21/2009 biokimiaenzim 13
Terdapat sub kelas dari oksidoreduktase yaitu Terdapatsubkelasdarioksidoreduktase,yaitu
oksidaseyangmemindah2elektrondari
donor ke oksigen menghasilkan hidrogen donorkeoksigenmenghasilkanhidrogen
peroksida(H2O2).
Biasanya aliran elektron dari substrat ke Biasanyaaliranelektrondarisubstratke
produkdijembataniolehkoenzimflavinatau
logam logam.
10/21/2009 biokimiaenzim 14
Sebagai contoh, Dasam amino oksidase Sebagaicontoh,D asamaminooksidase
mengkatalisisreaksi:
RCHCOO

+ O
2
RCCOO

+ H
2
O
2
R CH COO O
2
R C COO H
2
O
2
NH
2
NH
H
2
O+H
+
RCCOO

O+NH
4
+
10/21/2009 biokimiaenzim 15
NH
3
+
NAD(P)
+

OOC
H
2
C
H
2
C C COO

NH
3
H
glutamate
H
2
H
2
O
NAD(P)
+
NAD(P)H
H
H
2
O

OOC
2
C
2
C C COO

+ NH
4
+
-ketoglutarate
Glutamate Dehydrogenase
10/21/2009 biokimiaenzim 16
Sitokrom oksidase merupakan salah satu dari Sitokromoksidasemerupakansalahsatudari
sedikitenzimyanglebihbanyakmenghasilkan
H
2
O daripada H
2
O
2
dari reduksi oksigen H
2
OdaripadaH
2
O
2
darireduksioksigen.
Oksigenasemengkatalisispenggabungan
oksigen ke dalam substrat oksigenkedalamsubstrat.
10/21/2009 biokimiaenzim 17
Dengan dioksigenase kedua atom O
2
digabungkan ke DengandioksigenasekeduaatomO
2
digabungkanke
dalamproduktunggal
Denganmonooksigenase,atomoksigentunggal g g , g gg
digabungkansebagaigugushidroksildanatom
oksigenlaindireduksimenjadiairolehelektrondari
substratataudarisubstratkeduayangtidak
mengalamioksigenasi.
10/21/2009 biokimiaenzim 18
Catecholoksigenasemengkatalisisreaksireaksi g g
deoksigenase
Steroidhidroksilasemenunjukkansuatureaksi
monooksigenase di mana satu atom oksigen menjadi monooksigenasedimanasatuatomoksigenmenjadi
airdanlainnyamenjadisteroid.
PeroksidaselebihmembutuhkanH
2
O
2
dibanding
k i b i k id oksigensebagaioksidan.
NADHpeoksidasemengkatalisisreaksi:
NADH + H
+
+ H O NAD
+
+ 2H O NADH+H +H
2
O
2
NAD +2H
2
O
10/21/2009 biokimiaenzim 19
Katalase adalah enzim yang unik karena H
2
O
2
KatalaseadalahenzimyangunikkarenaH
2
O
2
berperansebagaidonormaupunaseptor.
Fungsi katalase di dalam sel untuk Fungsikatalasedidalamseluntuk
detoksifikasiH
2
O
2.
H O H O O 2H O H
2
O
2
+H
2
O
2
O
2
+2H
2
O
10/21/2009 biokimiaenzim 20
Transferase Transferase
Enzim ini berfungsi untuk memindahkan gugus Enziminiberfungsiuntukmemindahkangugus
fungsionalantaradonordanaseptor
Gugusamino,asil,fosfat,satukarbondanglikosil g , , , g
merupakanseparobagianyangdipindahkan
Aminotransferase(transaminase)memindahkangugus
aminodarisatuasamaminokeasam ketopenerima,
menghasilkanpembentukanasamaminobarudan
asam keto baru asamketobaru.
10/21/2009 biokimiaenzim 21
Ki k i k t li i Kinasemerupakanenzimyangmengkatalisis
pemindahangugus fosforilyangsecarakimiawi
labil dari ATP atau nukleosida trifosfat yang lain labildariATPataunukleosidatrifosfatyanglain
kealkoholataugugusaminopenerima.
Penerima ini dapat berupa molekul organik kecil Penerimainidapatberupamolekulorganikkecil
sepertiglukosaataumakromolekul,seperti
protein.
10/21/2009 biokimiaenzim 22
Sebagai contoh protein kinase A Sebagaicontoh,proteinkinaseA,
memindahkanfosfatdariATPkehidroksilserin
suatu enzim tertentu suatuenzimtertentu.
Bentukterfosforilasiproteinbisalebihatau
kurang aktif dibandingkan yang tidak kurangaktifdibandingkanyangtidak
terfosforilasi,tergantungdarispesiesnya.
10/21/2009 biokimiaenzim 23
Secara umum, gugus yang dipindahkan harus Secaraumum,gugusyangdipindahkanharus
diaktifkan,sehinggasecarakimiawiakan
menjadilabilsebelumpemindahandapat
terjadi.
Biasanyadiselesaikandenganmembuatester
denganATP,sepertiberikut:
ATP+ROHROADP+Pi
10/21/2009 biokimiaenzim 24
Gugus R sekarang dapat ditransfer ke penerima GugusRsekarangdapatditransferkepenerima
untukmembentuksenyawabaru.
(asamamino1)(asamketo2)(asamketo1)(asamamino2)
10/21/2009 biokimiaenzim 25
H
R
1
C COO
-
+ R
2
C COO
-
NH
3
+
O
Transaminase
H
R
1
C COO
-
+ R
2
C COO
-
O NH
3
+

COO

CH
2
COO

COO

CH
2
COO

CH
2
CH
2
C O
COO
CH
2
HC NH
3
+
CH
2
CH
2
HC NH
3
+
COO
CH
2
C O
+
+

aspartate -ketoglutarate oxaloacetate glutamate
Aminotransferase(Transaminase)
COO

COO

COO

COO

Aminotransferase (Transaminase)
10/21/2009 biokimiaenzim 26
Hidrolase Hidrolase
Kelompok enzim ini dapat dianggap sebagai Kelompokenziminidapatdianggapsebagai
kelompokkhususdaritransferasedimanagugus
donordipindahkankeair.
Reaksisecaraumumtermasukpemutusanhidrolitik
ikatanCO,CN,OP,danCS.
Pemutusanikatanpeptidamerupakancontohyang
bagusuntukreaksiini.
10/21/2009 biokimiaenzim 27
Enzim proteolitik merupakan kelas khusus dari Enzimproteolitikmerupakankelaskhususdari
hidrolaseyangdisebutpeptidase.
Fosfatasemerupakanenzimyangmemindahkan p y g
gugusfosfatdengangugushidroksildariair.
Padaproteinfosfatase,kerjanyaadalahuntuk p j y
meniadakanpengaruhdariproteinkinase.
10/21/2009 biokimiaenzim 28
10/21/2009 biokimiaenzim 29
10/21/2009 biokimiaenzim 30
Liase Liase
Liase menambahkan atau memindahkan unsurunsur Liasemenambahkanataumemindahkanunsur unsur
air,ammonia,ataukarbondioksida.
DekarboksilasememindahkanunsurCO
2
dariasam
2
keto atau atauasamamino.
DehidratasememindahkanH
2
Opadareaksi
2
p
dehidrasi.
Fumarasemerubahfumaratmenjadimalat
10/21/2009 biokimiaenzim 31
O
OO
O
RC H +CO
2
RC CO

+H
+
10/21/2009 biokimiaenzim 32
10/21/2009 biokimiaenzim 33
Isomerase Isomerase
Terdapat berbagai macam enzim yang Terdapatberbagaimacamenzimyang
mengkatalisisisomerisasidariberbagaitipe.
Termasuk interkonversi cistrans dan aldosa Termasukinterkonversicis transdanaldosa
ketosa.
Isomerase yang mengkatalisis inversi pada Isomeraseyangmengkatalisisinversipada
atomkarbonasimetriadalahepimeraseatau
rasemase
10/21/2009 biokimiaenzim 34
10/21/2009 biokimiaenzim 35
Mutase melibatkan pemindahan intramolekuler dari Mutasemelibatkanpemindahanintramolekulerdari
suatukelompoksepertifosforil.
Pemindahaninidapatterjadisecaralangsungtapi p j g g p
melibatkanenzimterfosforilasisebagaiperantara.
Fosfogliseratmutasemengkatalisiskonversi2 g g
fosfogliseratmenjadi3fosfogliserat
10/21/2009 biokimiaenzim 36
10/21/2009 biokimiaenzim 37
10/21/2009 biokimiaenzim 38
Ligase Ligase
Enzim ligase berperan dalam reaksi sintesis Enzimligaseberperandalamreaksisintesis
dimana2molekuldigabungkandenganenergi
dari ikatan fosfat berenergi tinggi dari ATP dariikatanfosfatberenergitinggidariATP.
Istilahsintetasedigunakanuntuksebagian
kelompok dari enzim ini kelompokdarienzimini.
10/21/2009 biokimiaenzim 39
Pembentukan aminoasil tRNA asil koenzim A PembentukanaminoasiltRNA,asilkoenzimA,
danglutaminsertapenambahanCO
2
pada
piruvat merupakan reaksireaksi yang piruvatmerupakanreaksi reaksiyang
dikatalisisolehligase
10/21/2009 biokimiaenzim 40
Piruvat karboksilase merupakan contoh yang Piruvatkarboksilasemerupakancontohyang
bagusdarienzimligase
Substrat bikarbonat dan piruvat diligasi atau Substratbikarbonatdanpiruvatdiligasiatau
diikatuntukmembentukasam keto4
karbon (C4) karbon(C4).
10/21/2009 biokimiaenzim 41
10/21/2009 biokimiaenzim 42